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文檔簡介
1、Western Blot詳解(原理、分類、試劑、步驟及問題解答)Western免疫印跡(Western Blot )是將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,然 后利用抗體進行檢測。對已知表達蛋白,可用相應抗體作為一抗進行 檢測,對新基因的表達產(chǎn)物,可通過融合部分的抗體檢測。本文主要通過以下幾個方面來詳細地介紹一下Western Blot技術:一、 原理二、 分類i.放射白顯影ii.底物化學發(fā)光ECLECFiv.底物DAB呈色三、 主要試劑四、 主要步驟五、 實驗常見的問題指南1.參考書推薦2.針對樣品的常見問題3.抗體4.濾紙、膠和膜的問題5. Marker的相關疑問6.染色的選擇7.參照的疑問8.緩沖液配方的
2、常見問題9.條件的摸索10.方法的介紹11.結果分析一、 原理與Southern或Northern雜交方法類似,但Western Blot采用 的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色” 用標記的二抗。經(jīng)過PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例 如硝酸纖維素薄膜)上,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能 保持電泳分離的多肽類型及其生物學活性不變。 以固相載體上的蛋白 質(zhì)或多肽作為抗原,與對應的抗體起免疫反應,再與酶或同位素標記 的第二抗體起反應,經(jīng)過底物顯色或放射白顯影以檢測電泳分離的特 異性目的基因表達的蛋白成分。該技術也廣泛應用于檢測蛋白水平的 表達。二、
3、分類現(xiàn)常用的有底物化學發(fā)光ECL和底物DAB呈色,體同水平和實驗條 件的是用第一種方法,目前發(fā)表文章通常是用底物化學發(fā)光ECL。只要買現(xiàn)成的試劑盒就行,操作也比較簡單,原理如下(二抗用HRP標記):反應底物為過氧化物+魯米諾,如遇到HRP,即發(fā)光,可使 膠片曝光,就可洗出條帶。三、主要試劑1、 丙烯酰胺和N, N-亞甲雙丙烯酰胺,應以溫熱(以利于溶解雙丙 稀酰胺)的去離子水配制含有29%(w/v)丙稀酰胺和1%(w/v)N , N-亞 甲雙丙烯酰胺儲存液丙稀酰胺29g , N , N-亞甲叉雙丙稀酰胺1g ,加H2O至100ml。)儲于棕色瓶,4 C避光保存。嚴格核實PH不得超過7.0,因可以
4、發(fā)生脫氨基反應是光催化或堿催化的。使用期不得超過兩個月,隔幾個月須重新配制。如有沉淀,可以過濾。2、 十二烷基硫酸鈉SDS溶液:10%(w/v)0.1gSDS , 1mlH2O去離子 水配制,室溫保存。3、 分離膠緩沖液:1.5mmol/LTris-HCL(pH8.8):18.15gTris和48ml1mol/LHCL混合,加水稀釋到100ml終體積。過濾后40C保存。4、 濃縮膠緩沖液:0.5mmol/LTris-HCL(pH6.8):6.05gTris溶于40mlH2O中,用約48ml 1mol/L HCL調(diào)至pH6.8加水稀釋到100ml終體積。過濾后40C保存。這兩種緩沖液必須使用Tr
5、is堿制備,再 用HCL調(diào)節(jié)PH值,而不用Tris.CL。5、TEMED原溶液N, N , NN四甲基乙二胺催化過硫酸鉉形成白 由基而加速兩種丙稀酰胺的聚合。PH太低時,聚合反應受到抑制。10%(w/v)過硫酸胺溶液。提供兩種丙稀酰胺聚合所必須的白由基。去離子水配制數(shù)ml,臨用前配制.6、SDS-PAGE加樣緩沖液:pH6.8 0.5mol/L Tris緩沖液8ml,甘油6.4ml,10%SDS 12.8ml,筑基乙醇3.2ml, 0.05%漠酚藍1.6ml, H2O 32ml混勻備用。按1:1或1:2比例與蛋白質(zhì)樣品混合,在沸水終煮 3min 混勻后再上樣,一般為 20-25ul,總蛋白量
6、100四。7、Tris-甘氨酸電泳緩沖液:30.3gTris , 188g甘氨酸,10gSDS,用 蒸館水溶解至1000ml,得0.25mol/LTris-1.92mol/L甘氨酸電極緩沖 液。臨用前稀釋10倍。8、 轉(zhuǎn)移緩沖液:配制1L轉(zhuǎn)移緩沖液,需稱取2.9g甘氨酸、5.8gTris堿、0.37gSDS,并加入200ml甲醇,加水至總量1L。9、麗春紅染液儲存液: 麗春紅S2g三氯乙酸30g磺基水楊酸30g加水至100ml用時上述儲存液稀釋10倍即成麗春紅S使用液。使 用后應予以廢棄。10、 脫脂奶粉5%(w/v)。11、NaN3 0.02%疊氮鈉(有毒,戴手套操作),溶于磷酸緩沖鹽溶 液
7、(PBS)。12、Tris緩沖鹽溶液(TBS):20mmol/LTris/HCL(pH7.5), 500mmol/LnaCl。13、Tween20(15)鼠抗人-MMP-9(16)鼠抗人-TIMP-1。14、 過氧化物酶標記的第二抗體。15、NBT(溶于70%二甲基甲酰胺,75mg/ml)。16、BCIP(溶于100%二甲基甲酰胺,50mg/ml)。17、100mmol/LTris-HCL(pH9.5)。18、100mmol/L NaCl。19、50mmol/LTris-HCL(pH7.5) , 5mmol/L EDTA。(可以參看分子克隆)四、主要步驟 主要包括以下4個基本步驟1.樣品制備原
8、始樣品可為細胞、組織、培養(yǎng)上清、免疫沉淀或親和純化的蛋白,以下為定性檢測目的蛋白時細胞樣品的處理方法,其余的樣品制備方 法參閱相關文獻。1.培養(yǎng)細胞或藥物處理。2.棄培養(yǎng)基,用1X PBS漂洗細胞2次,去盡殘留培養(yǎng)基。3.加入1X SDS樣品緩沖液(6-well plate, 100 /w或75 cm2plate,500-1000 W瓶),舌【J落細胞,轉(zhuǎn)移到Ep管。注意:冰上操作。4.超聲1015秒剪切DNA以減低樣品粘性。5.煮沸樣品5 minutes。6.離心12000g, 5 min ,取上清。乙 電泳分離:上樣15 M20 M至SDS-PAGE膠(10 cm x 10 cm)電泳。如
9、要定量檢測某蛋白的表達水平,應用RIPA裂解液(1 ml per 107cells/ 100 mm dish/ 150 cm2flask)裂解細胞,收集裂解液至離心管中,在振蕩器上混勻415min , 14000g離心15min ( 4C),棄沉淀,用 Bradford法或其它蛋白質(zhì)測定方法測定上清中蛋白濃度以 調(diào)整上樣體積和上樣量,進行 Western雜交時還需設置內(nèi)或外參照,通常用beta-actin。注意:一般上樣2030昭已足夠,如待檢蛋白為低豐度蛋白,可加 大上樣量至100四,但電泳條帶易拖尾,可制備亞細胞組份或采用更 敏感的檢測方法。2.電泳分離(參照SDS-PAGE電泳方法)3.
10、轉(zhuǎn)膜雜交膜的選擇是決定Western blot成敗的重要環(huán)節(jié)。應根據(jù)雜交方 案、被轉(zhuǎn)移蛋白的特性以及分子大小等因素,選擇合適材質(zhì)、孔徑和 規(guī)格的雜交膜。用于Western blot的膜主要有兩種:硝酸纖維素膜(NC)和PVDF膜。NC膜是蛋白印跡實驗的標準固相支持物,在低離子轉(zhuǎn) 移緩沖液的環(huán)境下,大多數(shù)帶負電荷的蛋白質(zhì)會與膜發(fā)生疏水作用而 高親和力的結合在一起,但在非離子型的去污劑作用下,結合的蛋白 還可以被洗脫下來。根據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大小,選擇不同孔徑的NC膜。因為隨著膜孔徑的不斷減小,膜對低分子量蛋白的結合就越 牢固。通常用0.45叩和0.2叩兩種規(guī)格的NC膜。大于20kD的蛋 白可用
11、0.45 gm的膜,小于20kD的蛋白就要用0.2叩的膜了,如用0.45 的膜就會發(fā)生flowthrough”的現(xiàn)象。PVDF膜靈敏度、分辨率和蛋白親和力比常規(guī)的膜要高,非常適合于低分子量蛋白的檢測。但PVDF膜在使用之前必需用純甲醇浸泡飽和1-5秒鐘。蛋白質(zhì)常用的轉(zhuǎn)移方法主要有兩種: 槽式濕轉(zhuǎn)和半干轉(zhuǎn)移。前者操作 容易,轉(zhuǎn)移效率高;而后者適用于大膠的蛋白轉(zhuǎn)移,所用緩沖液少。以下為槽式濕轉(zhuǎn)的操作步驟。1.將膠浸于轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10min。注意:如檢測小分子蛋白,可省略此步,因小分子蛋白容易擴散出膠。2.依據(jù)膠的大小剪取膜和濾紙6片,放入轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10min。如用PVDF膜需用純甲醇浸泡
12、飽和3-5秒鐘。3.裝配轉(zhuǎn)移三明治:海綿?3層濾紙?膠?膜?3層濾紙?海綿,每層 放好后,用試管趕去氣泡。切記:膠放于負極面(黑色面)。4.將轉(zhuǎn)移槽置于冰浴中,放入三明治(黑色面對黑色面),加轉(zhuǎn)移緩沖液,插上電極,100V , 1h(電流約為0.3A)。注意:應再次 檢查三明治和電極是否裝配正確,電源是否接通。5.轉(zhuǎn)膜結束后,切斷電源,取出雜交膜4.免疫雜交與顯色1.用25 ml TBS洗膜5min ,室溫,搖動。2.置膜于25 ml封閉緩沖液中1h,室溫,搖動3.15ml TBS/T洗3次(5 min/T)4.加入合適稀釋度的一抗,室溫孵育1-2h或4C過夜,緩慢搖動。5.15 ml TBS
13、/T洗3次(5 min/T)。6.加入合適稀釋度的堿性磷酸酶(AP)或辣根過氧化酶(HRP)標 記的二抗,室溫孵育1h,緩慢搖動。乙15 ml TBS/T洗3次(5 min/T)。8.15 ml TBS洗1次。9.蛋白檢測(顯色法或發(fā)光法,按相應試劑說明操作)。注意事項:1.操作中戴手套,不要用手觸膜。2.PVDF膜在甲醇中浸泡時間不要超過5秒。3.如檢測小于20kD的蛋白應用0.2叩的膜,并可省略轉(zhuǎn)移時的平 衡步驟。4.某些抗原和抗體可被Tween-20洗脫,此時可用1.0% BSA代替Tween-20。5.關于封閉劑的選擇:5%脫脂奶/TBS or PBS:能和某些抗原相互 作用,掩蓋抗體
14、結合能力;0.33% BSA in PBS:低的內(nèi)源性交叉反 應性。6.如用0.1% Tween 20、0.02% NaN3in PBS or TBS作封閉劑和 抗體稀釋液,抗體檢測后可進行蛋白染色。如要同時檢測大分子量和小分子蛋白,最好用梯度膠分離蛋白。五、實驗常見的問題指南根據(jù)問題的類型主要分成以下幾類(以下資料權作參考,請勿盲目模仿?。?1.參考書推薦A.對初學者看什么資料比較好?解答:抗體技術實驗指南和Antibodies (a laboratory manual , wrote by EdHarlow , david lane )兩本書不錯。2.針對樣品的常見問題B.做線粒體膜UCP
15、2蛋白的Western Blot(以下簡寫成WesternBlot),提取線粒體后凍存(未加蛋白酶抑制劑),用的博士德的一 抗,開始還有點痕跡,現(xiàn)在越來越差,上樣量已加到120四,換了個santa cloz的一抗仍不行。是什么原因?蛋白酶抑制劑單加PMSF行嗎? 解答:懷疑是樣品問題,可能是:1,樣品不能反復凍融;2,樣品未 加蛋白酶抑制劑。同時,建議檢查Western Blot過程,提高一抗?jié)?度。對于加蛋白酶抑制劑來說,一般加PMSF就可以了,最好能多 加幾中種蛋白酶抑制劑。E.同一蛋白樣品能同時進行兩種因子的Western Blot檢測嗎? 解答:當然可以,有的甚至可以同時測幾十種樣品。
16、F.如果目標蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,操作需要注意什么? 解答:如果是膜蛋白和胞漿蛋白,所用的去垢劑就要溫和得多,這時 最好加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。G.我的樣品的蛋白含量很低,每微升不到1微克,但是在轉(zhuǎn)膜時經(jīng) 常會發(fā)現(xiàn)只有一部分蛋白轉(zhuǎn)到了膜上,就是在轉(zhuǎn)膜后染膠發(fā)現(xiàn)有的孔 所有的蛋白條帶都在,只是顏色變淡了,有什么辦法可以解決?解答:你可以加大上樣量,沒有問題,還有轉(zhuǎn)移時你可以用減少電流 延長時間,多加5 10%甲醇。H.想分離的蛋白是分子量260kd的,SDS-PAGE電泳的分離膠濃度 多大合適?積層膠的濃度又該用多少?這么大分子量的蛋白容易作Western Blot嗎?解答:260k
17、d的蛋白不好做,分離膠用6%, Stacking Gel 3.5 %I.如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量?如果需要加大上樣量使原來弱的條帶能看清楚。解答:可以濃縮樣品,也可以根據(jù)你的目標分子量透析掉一部分小分 子蛋白。一般地,超載30%是不會有問題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5mm的comb。J.蛋白變性后可以存放多久?解答:80 C,一兩年沒有問題。最關鍵兩條:不要被蛋白酶水解 掉;不要被細菌消化掉(也是被酶水解了)。K.我所測定的蛋白分子量是105KD, 按理說分離膠應當采用7.5%,但我所查資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11 %的
18、配方,不知為 何?解答:上述您提到的兩種凝膠均可以使用, 因為105 KD的蛋白在上 述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),但需注意條帶位置。L.接下來我準備采用DAB顯色技術,二抗是生物素化的多克隆抗體, 三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作 調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說脫脂奶粉會影響親 和素生物素的生成, 是嗎?解答:不能使用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含生物素,用B S A代替 應該好一點.M.還有一問題,一般一次上樣的蛋白總量是多少,跟目的蛋白的表達量有關系嗎?解答:Western Blot一般上樣30 100微克不等,結果跟目的蛋白 的豐度、上樣量、一二抗的量
19、和撫育時間都有關系,也與顯色時間長 短有關。開始摸條件時,為了拿到陽性結果,各個步驟都可以量多一 點時間長一點,當然背景也就出來了。要拿到好的結果,如果抗體好 的話比較容易,抗體不好的話就需要反復地試了,當然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行。所以拿到好的結果不容易。N.做組織樣品的western的時候,處理樣品有什么訣竅嗎?還有,您用過大牛血清做封閉劑嗎?濃度如何?效果是不是比BSA好一點?解答:必須進行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,離心 要充分,膜蛋白需用更劇 烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分 步抽提(超速離心) 。還有一點就是組織中的蛋白酶活性更強,需要注
20、意抑制蛋白酶的活性(加入PMS F和蛋白酶抑制劑cocktail),封閉劑一般5%脫脂奶粉較常用。如果一抗為多克隆抗體,使用BSA也是不錯的選擇。O.您是否可以介紹一下大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?解答:做200kd蛋白的Western Blot時要注意,分離膠最好選擇7% 的;剝膠時要小心;轉(zhuǎn)移時間需要相應延長;要做分子量參照(否則 出現(xiàn)雜帶不知道如何分析)。P.有什么方法可以提高上樣量?解答:可以濃縮樣品;增大上樣體積來增大上樣量。Q.我要檢測的目的蛋白是分子量大概為42kd的膜蛋白,膜蛋白提取 可不可以不用到超速離心機,有沒有直接用低溫高速離心機就可以的 提到膜
21、蛋白的方法,42kd的蛋白分子量算不算大?解答:如是需要提取膜蛋白,(而不是只需要提取膜蛋白),可以用Ripa buffer提取膜蛋白和胞漿蛋白,用這個做Western Blot就可以 了。如果是非要只提取膜蛋白就要用到超速離心機。42kd不算大, 也不算小,所以,可以按照一般的轉(zhuǎn)移方法實施。R.蛋白的上樣量有沒有什么具體的要求?解答: 上樣量要根據(jù)實驗的要求來定,如果要求是定量和半定量的WesternBlot則上樣量要均等,如果只是要定性,則沒有太大的關 系,盡量多上就行了,但是不要超過0.3四/mm2。S.一抗,二抗的比例是否重要?解答:比較重要,調(diào)整好一抗,二抗的比例,可以去掉部分非特異
22、的 本底。3.抗體 做細胞信號傳導, 要做磷酸化某因子WesternBlot ,其二抗有何要 求?解答:對二抗無要求,要看你實驗條件來選擇,一般推薦用HRP標 記的二抗。U.同一公司的另外抗體用這個稀釋度做出來效果很好,所以沒做預試,怕費時間,用什么樣的稀釋度比較好呢?我用的ELL+plus試劑 盒顯色。轉(zhuǎn)膜過夜, 一抗孵育也是過夜的, 若封閉也過夜的話就要四 天才看的到結果了。解答:不同抗體,即使是同一公司的抗體,其最佳的抗體稀釋度也是 不一樣的,需要你實驗摸索。我覺得轉(zhuǎn)膜過夜好像沒有必要吧,轉(zhuǎn)膜 的目的也就是將蛋白轉(zhuǎn)到膜上就行啦, 何必浪費時間呢。至于具體的 轉(zhuǎn)膜時間,還要看你的目的蛋白分
23、子量的大小;轉(zhuǎn)膜的設備,是半干 式,還是濕式。一抗當然可以過夜,如果你想所短Western Blot時間的話,可以增高一抗的孵育溫度,我們實驗室一般37度,兩小時就足夠了;你可以參照抗體說明書。至于一抗和二抗得稀釋度,你可 以一抗1:1500 ;二抗1: 20000試試。另外建議你洗膜時,多洗幾 次,最好是在封閉;一抗和二抗后至少是5x5min ,跑一張好膜不容 易,多盡點心吧,這樣不會浪費你的時間,只會節(jié)省你的時間!V.免疫組化和Western Blot可以用同一種抗體嗎?解答:免疫組化時抗體識別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表位是線性的,而有的屬于構象型;線性表位不受蛋白變
24、 性的影響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構象型表位由于受蛋白空 間結構限制,煮后變性會消失。如果你所用的抗體識別的是蛋白上連 續(xù)的幾個氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時用于免疫組 化和Western ,而如果抗體識別構象形表位,則只能用于免疫組化。一般抗體說明書上都有注明此種抗體識別的氨基酸區(qū)間。(限于單抗)W. Western Blot中抗體的重復應用問題解答:抗體工作溶液一般不主張儲存反復使用,但是如抗體比較珍貴, 可反復使用2 3次。稀釋后應在2 3天內(nèi)使用,4度保存,避免反 復凍融。4.濾紙、膠和膜的問題X. NC膜 PVDF膜尼龍膜怎樣鑒別?解答:尼龍膜是較理想的核酸固相支持
25、物,有多種類型;硝酸纖維素膜是目前應用最廣的一種固相支持物,價格最便宜;PVDF膜介于二者之間。就結合能力而言:尼龍膜結合DNA和RNA能力可達480 - 600g/cm2,可結合短至10bp的核酸片段;硝酸纖維素膜結合DNA和RNA能力可達80 100四/cm2,對于200bp的核酸片段結合能力不 強;PVDF膜結合DNA和RNA能力可達125 300四/cm2。就溫度適應性而言:尼龍膜經(jīng)烘烤或紫外線照射后,核酸中的部分密 嚏堿基可與膜上的正電荷結合;硝酸纖維素膜依靠疏水性相互作用結 合DNA,結合不牢固;PVDF膜結合牢固,耐高溫,特別適合于蛋白印跡。就韌性而言:尼龍膜較強;硝酸纖維素膜較
26、脆,易破碎;PVDF膜較 強。就重復性而言:尼龍膜可反復用于分子雜交,雜交后,探針分子可經(jīng) 堿變性被洗脫下來;硝酸纖維素膜不能重復使用;PVDF膜可以重復 使用。Y.在做Western Blot時,PBDF膜用甲醇浸泡的目的?解答:PVDF膜用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基 團,使它更容易跟帶負電的蛋白質(zhì)結合, 做小分子的蛋白轉(zhuǎn)移時多加 甲醇也是這個目的。乙檢測磷酸化的JNK和非磷酸化的JNK可以在同一張膜上嗎? 解答:可以。AA.轉(zhuǎn)膜后經(jīng)麗春紅染色的條帶,為什么大蛋白分子的一端(即點樣 空的一側)的轉(zhuǎn)膜好象不是很好,為什么?解答:這是正常的,大分子的蛋白轉(zhuǎn)移的慢,你延長轉(zhuǎn)移時間
27、和電流,大分子一端就會好的多,但是小分子的就有可能會變淡。BB.我想問您裂解細胞用三去污裂解法,還是用上樣緩沖液?解答:用上樣緩沖液,這樣有幾個好處,可以提取總蛋白,同時又可 以讓磷酸化酶失活。CC.采用tank system有什么講究?解答:建議低電壓,長時間,(一般tank System用衡壓好點),如28V 14 16hrs。DD.做HSP WESTEN定量,同樣的抗體免疫組化能做出,而WESTEN卻不能?解答:這多半是抗體的問題,要看抗體的說明,是否能做WesternBlot和IHC。EE.膜一般要如何處理?解答:一般用甲醇泡泡就可以了。FF.如果是6 X8轉(zhuǎn)印膜,要加多少一抗?解答:
28、一抗的稀釋度是有說明的,根據(jù)你的一抗看看就知道了,但是 那么大的膜孵育體積一般最少為3 5ml。GG.上下槽緩沖液有何要求,怎樣才能達到最佳效果。解答:無要求。HH.跑電泳的時候配的膠總是“縮”是什么原因呢?是有的成分不對 嗎?解答:沒什么問題,就是你膠里的水分被蒸發(fā)了。過夜時拿保鮮膜包 起來,在里面加點水保持濕度就可以了。如果過夜,膠里的水分被蒸 發(fā),采用保鮮膜包上也可以;也可能母液(30%聚丙酰胺)有問題, 你可以重新配制一份觀察;能夠替換的試劑,盡量換一下,選用好的試劑,避免找問題麻煩。脫色液中甲醇的含量太高也會造成膠縮。II.膜、濾紙、膠大小有何講究?解答:如果是用的是半干轉(zhuǎn),順序為:
29、陰極一濾紙一膠一膜一 濾紙。濾紙的長寬分別比膠小1 2mm,而膜的長寬分別比膠大1 -2mm。絕對禁忌:上下兩層濾紙因為過大而相互接觸,這樣會短 路,電流不會通過膠和濾紙。JJ.蛋白質(zhì)的分子量跨度很大,如要分離小21KD ,中至66KD,大至170KD,可以一次做好嗎?解答:這么廣的分布不好轉(zhuǎn)移,一般建議:21kd和66kd可以一起轉(zhuǎn),12 %SDS-PAge ,濕轉(zhuǎn)36V , 3 5hrs就可以了, 可以根據(jù)你實 驗室的經(jīng)驗調(diào)節(jié);170kd用7%SDS page , 48V 10hrs 16hrs。KK.不能很好地將大分子量蛋白轉(zhuǎn)移到膜上,轉(zhuǎn)移效率低怎么樣解決?解答:可以考慮:轉(zhuǎn)移緩沖液中加
30、入20%甲醇(是指終濃度)(優(yōu)化 的轉(zhuǎn)移緩沖液,可以參考蛋白質(zhì)技術手冊),因為甲醇可降低蛋 白質(zhì)洗脫效率,但可增加蛋白質(zhì)和NC膜的結合能力,甲醇可以防止 凝膠變形,甲醇對高分子量蛋白質(zhì)可延長轉(zhuǎn)移時間; 轉(zhuǎn)移緩沖液加入 終濃度0.1%SDS ,也是為了增加轉(zhuǎn)移效率;用優(yōu)質(zhì)的轉(zhuǎn)移膜,或使 用小孔徑的NC膜(0.2微米);使用戊二醛交聯(lián);低濃度膠,如低至6%。太大時還可以考慮用瓊脂糖膠;提高轉(zhuǎn)移電壓/電流;增加 轉(zhuǎn)移時間。LL.如何選擇最合適的蛋白雜交膜?解答:蛋白質(zhì)印跡雜交是分子生物學實驗中極為常用的一門技術。選擇質(zhì)量上層、合乎要求、方便適用的雜交膜是決定這項實驗成敗的重 要環(huán)節(jié)。根據(jù)雜交方案、被
31、轉(zhuǎn)移生物大分子的特性以及分子大小等等 因素,我們要量體裁衣,從雜交膜的材質(zhì)、孔徑和規(guī)格上都要做出合 理的選擇。硝酸纖維素膜:硝酸纖維素膜是蛋白印跡實驗的標準固相支持物。在低離子轉(zhuǎn)移緩沖液的環(huán)境下,大多數(shù)帶負電荷的蛋白質(zhì)會與硝酸纖維 素膜發(fā)生疏水作用而高親和力的結合在一起,雖然這其中的機制還不是十分清楚,但由于硝酸纖維素膜的這個特性,而且易于封閉非特異 性結合,從而得到了廣泛的應用。在非離子型的去污劑作用下,結合 的蛋白還可以被洗脫下來。根據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大小,要選擇不 同孔徑的硝酸纖維素膜。因為隨著膜孔徑的不斷減小,膜對低分子量 蛋白的結合就越牢固。但是膜孔徑如果小于0.1mm,蛋白的轉(zhuǎn)移
32、就很難進行了。因此,我們通常用0.45叩 和0.2叩 兩種規(guī)格的硝酸纖 維素膜。大于20kD的蛋白就可以用0.45叩 的膜,小于20kD的蛋 白就要用0.2叩的膜了,如果用0.45頃的膜就會發(fā)生“Blowthro昭h的現(xiàn)象。從膜的質(zhì)地上來看,最重要的指標就是單位面積上能夠結合 的蛋白的量。硝酸纖維素膜的結合能力主要與膜的硝酸纖維素的純度 有關,市場上有些硝酸纖維素膜通常會還有大量的醋酸纖維素,因而降低了蛋白的結合量。S&S公司采用的是100%純度的硝酸纖維素, 保證了最大的蛋白結合量,可達80-150昭/cm2。由于100%的純度, 因而也大大減少了非特異性的結合, 降低雜交背景,無需
33、高嚴謹度的 洗脫步驟。其次,膜的強度和韌性也是需要考慮的因素。常規(guī)的硝酸 纖維素膜比較脆,漂洗一兩次就會破損,不能反復使用。PVDF轉(zhuǎn)移膜:PVDF是一種高強度、耐腐蝕的物質(zhì),通常是用來制 造水管的。PVDF膜可以結合蛋白質(zhì),而且可以分離小片段的蛋白質(zhì), 最初是將它用于蛋白質(zhì)的序列測定,因為硝酸纖維素膜在Edman試劑中會降解,所以就尋找了PDVF作為替代品,雖然PDVF膜結合 蛋白的效率沒有硝酸纖維素膜高,但由于它的穩(wěn)定、耐腐蝕使它成為 蛋白測序理想的用品,一直沿用至今。PVDF膜與硝酸纖維素膜一樣, 可以進行各種染色和化學發(fā)光檢測,也有很廣的適用范圍。這種PVDF膜,靈敏度、分辨率和蛋白親
34、和力在精細工藝下比常規(guī)的膜都 要高,非常適合于低分子量蛋白的檢測。但PVDF膜在使用之前必 需用純甲醇進行浸泡飽和1-5秒鐘。離子交換型轉(zhuǎn)移膜:硝酸纖維素和PVDF膜是靠疏水作用結合蛋白 的,還有一類膜是根據(jù)離子交換的方式結合生物大分子的。由DEAE(二乙氨乙基)修飾的纖維素制成的DEAE陰離子交換膜同樣可以 作為蛋白質(zhì)印跡的固相支持物。DEAE可以有效的結合陰離子基團, 包括那些高于其等電點的蛋白質(zhì)。在pH10以下,DEAE基團都能帶 電荷,在低離子強度的轉(zhuǎn)移液中結合蛋白分子。其最適的pH環(huán)境為5-7。DEAE膜可以用于蛋白多糖、病毒、酶以及血紅蛋白的研究。這種0.45孔徑的DEAE膜,除了
35、可以做Western Blotting夕卜,還可以用于核酸結合研究。還有一種離子交換型膜是愈甲基(CM)修飾的纖維素膜,它可以結合蛋白和多肽分子,以及其他的一些帶正電荷的樣品,最適結合pH范圍在4-7。結合的多肽分子可以從CM膜上洗脫下來,用于氨基酸 系列分析或微測序。5. Marker的相關疑問MM.我用的是可視marker (BIO_RAD ),但是電泳總跑不全8條帶, 請問什么原因?怎樣改善?膠用過8%, 10%, 12%,都是這樣。marker是新買的。解答:一般來說,是小分子量Marker跑走了,增加膠濃度或減少電 泳時間試試看。當然梯度膠也是不錯的選擇。NN.用的是Roche mo
36、lecular Biochemicals公司的由100kd , 75kd , 45kd , 30kd ,20kd , 10kd組成的marker。開始做Western Blot時 還能夠看到marker,當然也僅能看見其中最多三條帶。用80V進行SDS-PAGE電泳,用恒壓10V45min轉(zhuǎn)印的。前幾次做Western Blot時沒有進行麗春紅染色,但盡管用了此方法也僅能看到marker有一 條大約是30KD的條帶出現(xiàn)。再就是把70KD和130KD兩個目的蛋 白同時在一塊膠上進行分析,用培養(yǎng)基樣品進行分析,沒有用間接法, 而是直接用融合蛋白C端的V5表位的酶聯(lián)抗體(Anti-V5-HRP )。
37、但就是出不來結果,我很茫然。謝謝您過給予指點!解答:1、“我用的是Roche molecular Biochemicals公司的由100kd , 75kd ,45kd , 30kd , 20kd , 10kd組成的markero開始做Western Blot時還能夠看到marker,當然也僅能看見其中最多三條帶。”有的時候,Prestained Marker放久了效果就會變差,電泳是條帶不清晰,擴散。但是你的問題可能還有其他的方面的問題,可能是蛋白跟膜結合的不緊密。轉(zhuǎn)移是多加點甲醇。2、 “前幾次做WesternBlot時沒有進行麗春紅染色,但盡管用了此方 法也僅能看到marker有一條大約是
38、30KD的條帶出現(xiàn)?!鞭D(zhuǎn)移時半干 法建議用恒流,你這樣的也就30kd-50kd的轉(zhuǎn)移地比較好。3、 “再就是把70KD和130KD兩個目的蛋白同時在一塊膠上進行分析,用培養(yǎng)基樣品進行分析,沒有用間接法,而是直接用融合蛋白C端的V5表位的酶聯(lián)抗體(Anti-V5-HRP )?!笔欠駲z測了表達量,二抗是否是好的,你做了陽性對照?你要做這么 大的蛋白最好轉(zhuǎn)移時間延長到1.5hrs。6.染色的選擇OO. Western Blot哪種染色好?解答:(1)陰離子染料是最常用的,特別是氨基黑,脫色快,背景低檢測極限可達到1.5四,考馬雖然與氨基黑有相同的靈敏度,但脫 色慢,背景局。麗春紅S和快綠在檢測后容易
39、從蛋白質(zhì)中除去,以便進行隨后的氨基酸分析。缺點是:溶劑系統(tǒng)的甲醇會引起硝化纖維素膜的 皺縮或破壞。不能用語正電賀的膜。靈敏度低。(2)膠體金,靈敏度高,檢測范圍可到pg級,但染色比穩(wěn)定。(3)生物素化靈敏度位于1、2之間,可用于任何一種膜。7.參照的疑問PP.是否Western Blot實驗半定量一定要加ACTIN內(nèi)參?解答:對于發(fā)表文章的實驗最好加內(nèi)參,實驗嚴謹。QQ.用BANDSCAN分析結果行嗎?解答:分析一般的結果沒問題。RR.核內(nèi)抗原Western Blot內(nèi)參選擇什么合適?解答:可以選用組蛋白,組蛋白在細胞核中的表達是很穩(wěn)定的,有很 多都可以當成內(nèi)參,在網(wǎng)上查查就可以選出你要的內(nèi)參
40、。SS.轉(zhuǎn)膜時采用電流是否比電壓準確,是否根據(jù)0.8mA/cm2 ,一般1小時左右?解答:不是的,半干法推薦用恒流,一般根據(jù)目的蛋白的大小來確定電流和時間。TT.做半定量人卵巢癌細胞系的Western Blot,內(nèi)參B-actin ,GAPDH ,那個好?解答:選用beta-actin就可以。8.緩沖液配方的常見問題UU.轉(zhuǎn)膜后的脫脂奶粉封閉時,所用的防沫劑A是什么?還有Tris-HCl是不是就是用Tris和鹽酸配出來的呢?解答:轉(zhuǎn)膜后的脫脂奶粉封閉液是5%的TBST脫脂奶粉。Tris - HCl就是Tris鹽用HCl調(diào)ph值,配置而成。VV.準備做大鼠腦子的Western Blot,蛋白質(zhì)位
41、于細胞核中,請問此 蛋白質(zhì)的提取液及操作方法是?每一步都必須要低溫嗎?這種蛋白 質(zhì)是磷酸化的蛋白質(zhì),操作時如何防止去磷酸化的發(fā)生?解答:可以用提取總蛋白的buffer提核蛋白,可以加NaF防止去磷 酸化。WW.想問一下細胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時有什么原則嗎?受不 受組織來源的影響?胞膜和胞漿有區(qū)別嗎?解答:一般來說提取時加入光譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時保持低溫。除非有文獻特別指明用特殊的方法,一般來說都沒有區(qū)別。XX.最近作了兩次Western Blot,不但沒陽性結果,顯色背景都沒有, 電泳和轉(zhuǎn)膜都染過,有條帶。底片和顯色液及DAB顯色液均試過,沒問題。1、檢測GAD-分子量67kd
42、 ,提取液有蔗糖,其余同三去污 裂解液。蔗糖不會有影響把?樣本-20度放置一周內(nèi)測。2、一抗放 置2年,可能效價不高!用的是1:100。如果是一抗的原因,不會背 景都沒有把? 3、第一次有不均勻背景,因為一抗過夜時密封袋不均 勻。后兩次無背景顯色。4、封閉液用的是含15%脫脂奶粉TBST,漂洗液用的是含 1%BSA 的 TBST 液,TWEEN-20 為0.1% ,不會是 封閉液的問題吧?解答:可以在下面幾個問題上找找原因。1.封閉液用5%Milk,漂洗 液(washingbuffer用TBST) 2.看看一抗是否能work,降到1: 20。3.看看二抗是否有問題。YY.加甲醇的目的是什么?解
43、答:加甲醇起著一定的固定作用,因為小分子蛋白質(zhì)容易轉(zhuǎn)出去.(特 別是在硝酸纖維素膜上,因為NC膜結合蛋白質(zhì)的能力較弱)。ZZ.“轉(zhuǎn)膜后的脫脂奶粉封閉液是5%的TBST脫脂奶粉”, 其中TBST最后那個T是Tween嗎,濃度多大?解答:是Tween,配方如下:Tris-Buffered Saline Tween-20 (TBST), Dissolve8.8g of NaCl , 0.2g of KCl , and 3g of Tris base in 800ml of distilled H2O, Add500ul of Tween-20, Adjust the pH to 7.4 with H
44、Cl, Add distilled H2O to 1L,Sterilize by autoclaving.AAA.封閉,一抗,二抗時的溫度有沒有什么規(guī)定呢,比如現(xiàn)在我就 在室溫里做,或者要在4度下?解答:均可在室溫進行,如果時間不夠,一抗孵育可以先在室溫進行 一個小時,然后4度過夜。BBB.實驗室暫無NP40我用sds可以嗎?另外有過用尿素和硫月尿提 取膜蛋白嗎?配方如下:7M尿素,2M硫月尿,Triton-x-1000.2ml ,新鮮加入:65mM DTT蛋白酶抑制劑:試劑盒HaltTM Protease inhibitor cocktail kit 1%(v/v)是用于抽提雙向電泳用蛋白的
45、配方。 不止用于抽提細胞全蛋白(主要 是想得到其中的膜蛋白)是否可行?改良的RIPA裂解緩沖液(Tris.HCl , 50 mmol/L , pH 7.5; NaCl , 150 mmol/L;NP-40 , 1%;脫氧膽酸鈉,0.5%; SDS , 0.1%; EDTA , 1 mmol/L; PMSF , 1 mmol/L;Leupeptin , 2四/ml)不知對于膜蛋白 效果如何?此外該方中的EDTA ,是否用做蛋白酶抑制劑? 解答:做2 D絕對不推薦使用NP-4 0(因為即使進口的NP- 4 0也不純,其中的雜質(zhì)會影響質(zhì)譜結果)。對于動物細胞,其蛋 白酶活性較弱(相對于組織和大腸桿菌
46、等),可以不使用cocktail ,因為7M尿素+2 M硫月尿+4 %CH AP S構成的變性環(huán)境已經(jīng)足 以抑制大部分蛋白酶的活性,2 M硫月尿+4 %CH AP S對于抽提膜 蛋白有很大的幫助,不過如果您專職做膜蛋白建議采用分級抽提法。 此外還可以采用梯度離心法和一些基于去垢劑的方法。EDTA用于滅活金屬蛋白酶(主要是其鰲合作用)。加過多的蛋白酶抑制劑可以 導致蛋白質(zhì)的修飾,做WB無所謂,做MAILD I時會給正確鑒定 帶來麻煩。裂解緩沖液中少了兩性電解質(zhì)(在2-D裂解緩沖液中,兩 性電解質(zhì)起的作用:提供連續(xù)的PH梯度,從很大程度上增加蛋白質(zhì) 的溶解性;還可以去除一部分核酸);也不推薦采用S
47、DS,因SDS會 與蛋白質(zhì)結合導致其等電點發(fā)生改變,如果您實在要用,終濃度降到0.1%以下METHOD2(50ml總量):?-mercaptoethanol 342底20% SDS 5 ml ; Tris-Cl pH 6.7 3.125ml;力口ddH2O至50 ml。方法:將用過的膜浸入stripping buffer中,置50 C水浴箱中30min,間斷振搖。之后用TTBS洗3*5min就好。此 時你已經(jīng)可以按新的轉(zhuǎn)移好的膜來再次使用了。該方法的優(yōu)點:省事,省力,省錢,符合國際慣例。METHOD31、beta-metaptoethanol 35ul2、10%SDS 1ml3、tris (
48、0.5M , pH6.7) 625ul4、dH2O 3.34ml50 -55 C , 30min。METHOD4stripping buffer應該是可以放置很久的。不過我習慣于現(xiàn)配- 畢竟,加了6-mercaptoethanol以后太難聞了,配了就用;而且,有了 現(xiàn)成的Tris-HCl緩沖液和SDS的母液,現(xiàn)配還是很方便的。每次用 量5ml少了點,我每次用50ml。METHOD5 0.5M NaCl , 0.5M HAc ;室溫搖床15min。METHOD6將用過的膜泡在1*TBS中室溫振搖過夜,中間可以換液2-3次,然 后封閉,加一抗,二抗(同第一次發(fā)光),實踐證明方法完全可行。不管用那種
49、方法,洗脫后都要用PBS或TBS再洗幾次。9.條件的摸索DDD.用的是SantaCruz的抗體, 也實驗過一抗和二抗肯定能結合, 二抗加DAB肯定能顯色。電泳的膠用考馬斯亮藍染色沒問題,但是 不知道與Marker對應的條帶是否是我要的(我目的蛋白的分子量分 別是55KD、29KD)。半干法2小時轉(zhuǎn)膜后,麗春紅染色發(fā)現(xiàn)大分 子量蛋白轉(zhuǎn)過去的較少。難道是裂解液出了問題?我用的是三去污 劑,但沒加疊氮鈉和大概叫Apoptin的那種蛋白酶抑制劑。冰上裂解-80度凍存的細胞,4度12000g離心5分鐘,取上清,與分子克隆 (第二版)上的加樣buffer混合,沸水變隹5分鐘,上樣。不知道是 哪里出了問題?
50、 解答:建議:1、首先確定您提的蛋白質(zhì)量如何?可用PIERCE公司 的BCA試劑盒測蛋白的濃度,一般來講,其濃度應該在幾-20微克/微升。2、若是蛋白沒問題,哪就看是不是電泳的問題,首先要看膠的濃度, 您目的蛋白的分子量分別是55KD、29KD,建議分別用10%和12%的膠。60-80V, 1小時左右。跑過積層膠與分離膠的線時,換用100V , 3-4小時。3、轉(zhuǎn)膜,建議恒壓,15V,不用轉(zhuǎn)2小時,45分鐘足以。您所說的 大蛋白轉(zhuǎn)過去的,并不是真正的少,而是因為在提的蛋白中大蛋白本 身就很少。我曾經(jīng)也轉(zhuǎn)過2小時,但和45分鐘的區(qū)別并不大。4、根據(jù)MARKER的條帶 (我的是7條帶:14、18、
51、25、35、45、66、116KD) ,您根據(jù)MARKER的條帶剪下25與35之間(29KD)的條帶,45-66之間(50KD)的條帶。這樣第一,可以節(jié)省抗體, 第二,您要的目的條帶肯定在上面。5、延長1抗、2抗孵育時間(我曾室溫1小時,4度過夜),適當 加大1抗?jié)舛取?、我買的也是Santa Cruz的抗體,我覺得質(zhì)量還可以,我想您應該 先找其他方面的原因。EEE.電泳用的是恒流, 一塊膠,20mA ,100分鐘左右。 轉(zhuǎn)膜也是恒 流,38mA ,100分鐘。而且我用別人的細胞和一抗在我的整個反應 體系下做出來了,當然彼此的目的蛋白不同。所以,我想問題應該出 在抗原和一抗上,不知對不對。解答
52、:電泳的條件:樣品的分子量決定了膠的濃度,一般使樣品跑至 膠的中部即可。正常條件下,電泳時漠酚藍和10kd左右蛋白跑在一FFF. BIO-RAD的半干轉(zhuǎn)運系統(tǒng)有一個很致命的弱點就是無法控溫起。由此可以決定電泳的電壓和時間。建議你用恒壓80100伏(我用的就是這種),當電流過高,而系統(tǒng)的散熱又比較差,濾紙的 吸水性比較差的情況下,就很容易燒膠。就轉(zhuǎn)膜時,是采取恒壓還是恒流的問題,我想和大家探討一下,我感 覺我這個系統(tǒng)用恒流很容易燒膠,我的膠有68cm2,用50mA恒流來轉(zhuǎn)膜,剛開始電壓就很高,有20 v左右,而用恒壓,開始電流有110mA,但15min后,電流就降到8OmA , 30min后就穩(wěn)
53、定在40mA ,不就相當于恒流嗎?解答:恒流時電壓逐漸升高的原因是濕濾紙逐漸變干因而電阻逐漸增 大的緣故,如果電壓升得太快,可以使濾紙更濕一些以克服。就我的 感覺,20V的電流30min以后20Kd以下的分子丟失很多,不過我用 的是小膠40cm2 ,不知有無不同。GGG.我想盡量提高轉(zhuǎn)膜的效率(我的實驗要求轉(zhuǎn)到膜上的蛋白越多 越好,不管是什么大小蛋白)不知道有那些辦法?解答:不管怎么轉(zhuǎn)都會存在蛋白轉(zhuǎn)移不完全(電壓過小時間過短)或 過度轉(zhuǎn)移(電壓過大時間過長)的問題,魚(小分子量蛋白)和熊掌(大分子量蛋白)不可得兼呵呵。建議把膠切成兩半,比如以35KD為界,分別進行轉(zhuǎn)膜,下半時間短,上半時間長一
54、點,應該會好一些。HHH.請問一下PVDF膜和硝酸膜結合蛋白的原理是什么?解答:一般而言,硝酸纖維素膜是通過疏水作用來和蛋白質(zhì)相聯(lián),這 樣的話,反復洗幾次后,蛋白容易掉下來,結果較差。尼龍膜主要通過它膜上的正電荷和蛋白接合(注:常用的PVDF即帶正電荷的尼 龍膜),同時也有疏水作用,但相對較弱。這樣的話,PVDF膜和蛋白接合較牢,不易脫落,結果較好。III. 1、煮好后的樣品,若沒有及時上樣分離,應如何保存,可以保存 多久?2、有沒有人在用bio-rad的小型垂直電泳槽,有沒有操作手 冊?3、濕式轉(zhuǎn)移時是否必須要用bio-rad的專用濾紙?4、恒壓轉(zhuǎn)移 的條件如何確定,因為我要分離小至21KD
55、,中至66KD,大致170KD的蛋白質(zhì),轉(zhuǎn)移條件能夠相同嗎?5、凝膠的濃度是不是可以用一個濃度?書上寫不同的凝膠濃度分離的分子量范圍不同,還給出了一個線形范圍,是不是不在這個范圍內(nèi)也能分離,只是就不是線性范圍 了?解答:1、煮好后的樣品,放到-20,我們在一個月后此樣品,效果一 樣。2、bio-rad的小型垂直電泳槽的操作手冊在他們的主頁Bio-Rad USA上有。3、轉(zhuǎn)移時一般的WATERMEN濾紙就可以。4、轉(zhuǎn)移條件是和蛋白質(zhì)大小有關的:以次確定電壓和時間。具體可 讓ptglab幫你定奪。5、凝膠的濃度也是和分離蛋白質(zhì)大小有關。不是隨心所欲選的,否 則分離效果可能不是你所期望的。JJJ.怎
56、樣設計實驗來確定最佳的條件? 解答:隨便說一點,具體的還是需要白己想:1、在每個上樣孔里上同樣的蛋白樣品,量也一樣,最好是組織樣,(也可以跑1個大well,不插梳子,多上樣,)SDS-page ;2、轉(zhuǎn)移, 設定電流或電壓;3、每隔1 (orn)小時,取一點膜染色,看轉(zhuǎn)移效果。KKK.我要測兩種抗體,一種為磷酸化的目的蛋白,一種為總的目的 蛋白,不知道用什么方法strip最好,我用甘氨酸(PH2.9)漂洗15分鐘,似乎沒什么效果?解答:你可以加筑基乙醇(loadingbuffer一樣的濃度),56度,30mins ,看看。LLL. 1、在用PBS洗滌抗原-抗體-ProteinA-Agarose
57、復合物時,每次 要重懸多長時間合適?2、最后用2xSDS重懸抗原-抗體復合物離心 后,由于2XSDS中已經(jīng)加入了漠芬蘭,因此下面的Agarose珠子幾 乎看不到,所以吸取上清加樣時也不知道里面是否吸進了Agarose。不知有什么方法可以解決這個問題,或者即使吸進了一些Agarose也不要緊呢?解答:1、不用重懸多久,重懸起來了就可以離心了。2、力口2X BUFFER前大體上已經(jīng)知道有多少膠粒了,吸到那個位置 時小心點就是了。我也試過一些次,首先離心稍微長一點,長20秒 吧,希望膠粒能沉得結實點(我想象的),再吸取。如果感覺槍頭不是很順暢的時候可能就是碰到膠粒了。彳艮難一點膠粒也吸取不上來 的,
58、盡力做好就是了。MMM.磷酸化抗體的檢測樣本制備時是否一定要加NaF等?解答:NaF是一種廣譜磷酸化酶的抑制劑,一般最好加。但是不加也 可以,大部分時候是不用加的。我做的時候從未加過,都做出來了。NNN. Western Blot中block的最短時間?解答:每一步1小時足夠了,中間換抗體要洗的話多換液幾次,每 次時間10分鐘就夠,洗3次只要半小時。跑膠1小時,轉(zhuǎn)移1小 時,block半小時就行,1抗1小時,洗半小時,2抗1小時,洗半 小時,顯色10分鐘。一般跑兩塊膠,一塊染色,一塊westerno一天肯定完事,一般不用等到第二天。OOO.想用Western檢測基因轉(zhuǎn)染后細胞培養(yǎng)上清中表達的目
59、的蛋 白(定性),分子量為20KD,濃度約為幾百ng/ml。蛋白樣品需濃 縮、純化嗎?如何濃縮、純化上清液中的目的蛋白?對小分子蛋白Western blot時需特別注意哪些條件?解答:按照你提供的濃度,如果做Western Blot ,是不用濃縮樣品的 對于20kd的小分子的蛋白,Western Blot中要注意的是:1、轉(zhuǎn)移時的時間,2、轉(zhuǎn)移時的電流或電壓.3、transfer buffer中加20%的甲醇.4、可以用13-15%的分離膠.PPP.蛋白分子量大小分別為21kd、28kd ,用的是濕轉(zhuǎn),請問多大電流,多長時間比較合適?解答:分子量比較小,最好是用干轉(zhuǎn),濕轉(zhuǎn)效率太高,易轉(zhuǎn)過了。干
60、 轉(zhuǎn)的話,用2.5 A/cm2 , 30min就應該夠了。濕轉(zhuǎn),按照bio-rad的說明,用100mA,也得要半個多小時吧。QQQ.需要測同一種蛋白質(zhì)的總量與磷酸化的量, 但相互間干擾太 大, 怎么辦?解答:將膜放入stripping buffer (SDS 2% ,Tris Cl (PH=6.7) 62.5mM , beta-筑基乙醇100mM )中,50C孵育30分鐘,TTBS西三次, 再重新加入一抗,進行另一種抗原的檢測。RRR.做Western Blot實驗時,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)膜時的電流總是偏小, 轉(zhuǎn)膜的 效率也偏低.100V恒壓轉(zhuǎn)膜時的電流只有190mA左右,而以前都有250mA。體系和條件都和以前一
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