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文檔簡(jiǎn)介

1、中醫(yī)藥學(xué)言語系統(tǒng)中醫(yī)藥學(xué)言語系統(tǒng)賈李蓉賈李蓉中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研討所中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研討所: jialr163: jialr163前 言l從20世紀(jì)80年代起,由于生物醫(yī)學(xué)信息量不斷添加,且分散于各個(gè)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),因此要檢索完好而新穎的信息很不容易,于是一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)應(yīng)運(yùn)而生。l1986年美國國立醫(yī)學(xué)圖書館National Library of Medicine, NLM主持了一項(xiàng)長(zhǎng)期研討和開發(fā)方案,即一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)Unified Medical Language System,UMLS。其目的是在于提升系統(tǒng)之才干,使系統(tǒng)能了解讀者在生物醫(yī)學(xué)方面的問題,并進(jìn)而協(xié)助讀者檢索及

2、整合相關(guān)信息。 l近年來,由于中醫(yī)藥學(xué)信息量的不斷增多,且各種概念不規(guī)范不一致,因此給中醫(yī)藥信息查詢帶來了多重的困難。在此情勢(shì)下,中國中醫(yī)研討院主持開發(fā)了中醫(yī)藥學(xué)言語系統(tǒng)。 2. 背景:一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)l2.1.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)研制的目的和意義l2.2.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的開展階段l2.3.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的組成l2.4.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的開展戰(zhàn)略與開發(fā)原那么l2.5.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的運(yùn)用 2.1.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)研制的目的和意義l美國國立醫(yī)學(xué)圖書館自1986年開場(chǎng)研制一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng),其目的在于抑制計(jì)算機(jī)生物醫(yī)學(xué)信息檢索中一樣的概念具有不同的表達(dá)方式、有用的信息分散在不同的數(shù)

3、據(jù)庫系統(tǒng)中所呵斥的查詢困難。l一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)是計(jì)算機(jī)化的情報(bào)檢索言語集成系統(tǒng),它不僅是言語翻譯、自然言語處置及言語規(guī)范化的工具,而且是實(shí)現(xiàn)跨數(shù)據(jù)庫檢索的詞匯轉(zhuǎn)換系統(tǒng),它可以協(xié)助用戶在聯(lián)接情報(bào)源,包括數(shù)字化的病案記錄、書目數(shù)據(jù)庫、現(xiàn)實(shí)數(shù)據(jù)庫以及專家系統(tǒng)的過程中,對(duì)其中的電子式生物醫(yī)學(xué)情報(bào)作一致的檢索。 2.2.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的開展階段19861988年一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的初始階段 19891991年一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的開展階段 1992年至今一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的運(yùn)用階段 19861988年為一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的初始階段,l其研討和開發(fā)的重點(diǎn)是調(diào)查用戶需求、開發(fā)研討工具、確定一致的醫(yī)學(xué)言語

4、系統(tǒng)的性能及其實(shí)施方案、界定系統(tǒng)組成等。在此階段主要界定了一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的三個(gè)組成部分即超級(jí)敘詞表、語義網(wǎng)絡(luò)、情報(bào)源圖譜,并且進(jìn)展了包括MeSHMedical Subject Headings、SNOMEDSystematized Nomenclature of Medicine、CMITCurrent Medical Information and Terminology和PDQ(Physicians Data Query)詞表在內(nèi)的聯(lián)接實(shí)驗(yàn)。19891991年為一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的開展階段l其開發(fā)的重點(diǎn)是迅速研制和發(fā)行三個(gè)一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)產(chǎn)品的實(shí)驗(yàn)版,同時(shí)繼續(xù)開展用戶調(diào)查和一致的醫(yī)學(xué)

5、言語系統(tǒng)功能開發(fā)。1990年秋,美國國立醫(yī)學(xué)圖書館發(fā)行了超級(jí)敘詞表和語義網(wǎng)絡(luò)第一版的CDROM;一年后,發(fā)行了實(shí)驗(yàn)版的情報(bào)源圖譜和更新版的超級(jí)敘詞表和語義網(wǎng)絡(luò),同時(shí)獲得了大量的反響信息,促進(jìn)了一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的研討與開發(fā)。1992年至今為一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的運(yùn)用階段l其研討的重點(diǎn)是圍繞一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)所進(jìn)展運(yùn)用開發(fā),不斷擴(kuò)展和修訂一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的三個(gè)組成部分,發(fā)行修訂一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)三個(gè)組成部分的年度版,建立健全產(chǎn)品體系。 2019年一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)新增了一個(gè)組成部分,即“專家詞典Specialist Lexicon。l在此階段,許多研討機(jī)構(gòu)利用一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)進(jìn)展了基于Inte

6、rnet的運(yùn)用開發(fā),如決策支持系統(tǒng)DXplain、文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)WebMedline、臨床Web搜索系統(tǒng)Clinweb、醫(yī)學(xué)世界檢索medical world search以及集成化的 Medweave等。除了以CDROM方式發(fā)行其產(chǎn)品外,2019年美國國立醫(yī)學(xué)圖書館在Internet上建立了一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)知識(shí)源效力器,經(jīng)過Internet,加強(qiáng)國際交流與協(xié)作。從此,一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)由實(shí)驗(yàn)階段進(jìn)入到產(chǎn)品發(fā)行、維護(hù)和運(yùn)用的階段。2.3.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的組成l 超級(jí)敘詞表Metathesaurusl語義網(wǎng)絡(luò)l Semantic Networkl專家詞典l Specialist Lexico

7、n l情報(bào)源圖譜lInformation Sources Map,ISM l多元系統(tǒng)MetamorphoSys 超級(jí)敘詞表l超級(jí)敘詞表可視為一個(gè)概念名詞的知識(shí)庫,是由生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中許多不同索引典或分類表中所抽取出來的詞目所組成。 l超級(jí)敘詞表是生物醫(yī)學(xué)概念、術(shù)語、詞匯及其等級(jí)范疇的廣泛集成。2019年第8版的超級(jí)敘詞表收錄了來源于30多種生物醫(yī)學(xué)詞表和分類表的、能表達(dá)33萬多個(gè)概念的739439個(gè)詞匯;到目前超級(jí)敘詞表收錄了100多萬個(gè)生物醫(yī)學(xué)概念、共500多萬個(gè)詞。這些概念和詞來自100多個(gè)生物醫(yī)學(xué)受控詞表、術(shù)語表、分類表、專家系統(tǒng)中的詞匯、詞典及工具性詞表等,如醫(yī)學(xué)主題詞詞表Medical

8、 Subject Headings,MeSH及其葡萄牙語、西班牙語、法語、德語、俄語等各種譯本、醫(yī)學(xué)系統(tǒng)術(shù)語表Systematized Nomenclature of Medicine,SNOMED、國際疾病分類修訂第10版International Classification of Diseases , 10th Revision , ICD-10及其他各版、LOINCLogical Observation Identifiers Names and Codes、臨床藥物規(guī)范術(shù)語RxNorm等。l超級(jí)敘詞表是根據(jù)概念concept或涵義meaning組織起來的,其根本目的是將一樣概念的交替

9、稱號(hào)和不同方式聯(lián)絡(luò)在一同,并識(shí)別不同概念之間的聯(lián)絡(luò)。因此,可以說概念是超級(jí)敘詞表組織系統(tǒng)的中心。l對(duì)于同一概念的不同術(shù)語以及不同的變異方式,超級(jí)敘詞表采用三級(jí)構(gòu)造方式,即概念I(lǐng)級(jí)術(shù)語 II級(jí)詞串III級(jí),將一個(gè)概念的多種不同術(shù)語連同多個(gè)變異詞串有序地組織在一同。對(duì)于不同的概念,超級(jí)敘詞表采用多種“關(guān)系概念如相關(guān)概念、組配概念、共現(xiàn)概念等來描畫不同概念之間的關(guān)系。語義網(wǎng)絡(luò)l語義網(wǎng)絡(luò)是為建立概念、術(shù)語間錯(cuò)綜復(fù)雜的關(guān)系而設(shè)計(jì)的,它為超級(jí)敘詞表中一切概念提供了語義類型、語義關(guān)系和語義構(gòu)造。語義網(wǎng)絡(luò)包括了種語義類型和54種語義關(guān)系。l語義網(wǎng)絡(luò)是經(jīng)過種語義類型,為出如今超級(jí)敘詞表中的一切概念提供一種目錄組

10、織構(gòu)造。語義類型之間的54種銜接關(guān)系為這種組織構(gòu)造提供構(gòu)架,并代表生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的重要相互關(guān)系。l語義網(wǎng)絡(luò)為超級(jí)敘詞表提供了指定給每一個(gè)概念至少一種語義類型的信息,同時(shí)語義類型也指定給情報(bào)源圖譜中特定的數(shù)據(jù)庫,以表達(dá)情報(bào)資源之間的內(nèi)在聯(lián)絡(luò)。也就是說,語義網(wǎng)絡(luò)是試圖建立一種語義類型及其相互關(guān)系的權(quán)威規(guī)那么,用以標(biāo)引每一個(gè)超級(jí)敘詞概念,或表達(dá)概念之間能夠存在的相互關(guān)系。語義網(wǎng)絡(luò)的這種權(quán)威規(guī)那么,既在文字上,也從等級(jí)關(guān)系或非等級(jí)關(guān)系上界定語義類型及其相互間能夠存在的關(guān)系與內(nèi)在涵義。l語義類型是經(jīng)過計(jì)算機(jī)程序指定的或在人工復(fù)審過程中添加的,它既是超級(jí)敘詞表與語義網(wǎng)絡(luò)之間的銜接,也是超級(jí)敘詞表與情報(bào)源圖

11、譜的銜接之一。目前語義類型主要分為生物體、解剖構(gòu)造、生物功能、化學(xué)、事件、客觀物體、概念和觀念等。各類范疇深度不一。在實(shí)踐運(yùn)用中,語義類型不斷完善和擴(kuò)展。lUI: T048lSTY : Mental or Behavioral Dysfunction 心思或行為功能失調(diào)lDefinition:A clinically significant dysfunction whose major manifestation is behavioral or psychological. These dysfunctions may have identified or presumed biologi

12、cal etiologies or manifestations.l表現(xiàn)為行為性或精神性的具有臨床意義的功能失調(diào),這些功能失調(diào)能夠曾被以為或被假定為生物學(xué)病因或生物學(xué)表現(xiàn)。lExamples:Memory Disorders記憶混亂; Agoraphobia(廣場(chǎng)恐懼癥); Hallucinations幻覺; Cyclothymic Disorder循環(huán)情感性精神妨礙l語義類型是語義網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn),節(jié)點(diǎn)與節(jié)點(diǎn)之間的關(guān)系即為語義關(guān)系。最根本的語義關(guān)系是“is a關(guān)系,經(jīng)過它建立了節(jié)點(diǎn)與節(jié)點(diǎn)之間的一種等級(jí)關(guān)系,這種等級(jí)關(guān)系的最大特性是它的承繼性,即下一級(jí)節(jié)點(diǎn)對(duì)上一級(jí)節(jié)點(diǎn)的承繼關(guān)系。除了is a關(guān)系外,

13、還有 53種語義關(guān)系,它們均是非等級(jí)關(guān)系,這些關(guān)系可以出如今任何一級(jí)節(jié)點(diǎn)上,表示一種能夠、允許的關(guān)系。l等級(jí)關(guān)系鏈 is a l相關(guān)關(guān)系鏈 associated _with l物理上相關(guān)physically related tol功能上相關(guān)functionally related tol概念上相關(guān)conceptually related tol空間上相關(guān)Spatially related tol時(shí)間上相關(guān)temporally related toH.H.等級(jí)關(guān)系鏈等級(jí)關(guān)系鏈isaisaR.R.相關(guān)關(guān)系鏈相關(guān)關(guān)系鏈1 1物理上相關(guān)物理上相關(guān)1.1.的部分的部分2.2.由由組成組成3.3.包含包含

14、4.4.與與相連相連5.5.分開分開2.2.空間上相關(guān)空間上相關(guān)1.1.位于位于2.2.與與相鄰相鄰3.3.包圍,周圍包圍,周圍4.4.穿過穿過3 3功能上相關(guān)功能上相關(guān)1.1.影響影響1. 11. 1管理管理1. 21. 2治療治療1. 31. 3干擾干擾1. 41. 4并發(fā)并發(fā)1. 51. 5與與相互作用相互作用1. 61. 6預(yù)防預(yù)防2.2.帶來、呵斥帶來、呵斥 2. 1 2. 1產(chǎn)生產(chǎn)生 2. 2 2. 2引起引起3.3.執(zhí)行執(zhí)行 3. 1 3. 1實(shí)施實(shí)施 3. 2 3. 2展現(xiàn)展現(xiàn) 3. 3 3. 3練習(xí)練習(xí)4.4.發(fā)生于發(fā)生于情況下情況下 4. 1. 4. 1.的進(jìn)程的進(jìn)程5.5

15、.運(yùn)用運(yùn)用6.6.景象表達(dá)景象表達(dá)7.7.證明證明8.8.的結(jié)果、效果的結(jié)果、效果4 4時(shí)間上相關(guān)時(shí)間上相關(guān)1.1.與與同時(shí)發(fā)生同時(shí)發(fā)生2.2.先于先于發(fā)生發(fā)生5 5概念上相關(guān)概念上相關(guān)1.1.的評(píng)價(jià)的評(píng)價(jià)2.2.的程度、等級(jí)的程度、等級(jí)3.3.分析分析 3. 1 3. 1分析評(píng)價(jià)分析評(píng)價(jià)的影響的影響4.4.的丈量值的丈量值5.5.丈量丈量6.6.診斷診斷7.7.的特性的特性8.8.衍生的衍生的9.9.的發(fā)育階段的發(fā)育階段10.10.的方法的方法11.11.的概念部分的概念部分12.12.之中的焦點(diǎn)問題之中的焦點(diǎn)問題l語義類型和語義關(guān)系構(gòu)成網(wǎng)狀的語義構(gòu)造,它起著統(tǒng)領(lǐng)超級(jí)敘詞表概念的作用。由于超

16、級(jí)敘詞表的概念來自許多不同的詞表,它們有各自的構(gòu)造體系,語義網(wǎng)絡(luò)將全部概念劃分成許多組,每一組共享幾種特定的語義類型,語義類型又共享幾種語義關(guān)系,這樣概念不僅高度構(gòu)造化而且廣泛聯(lián)絡(luò)。語義關(guān)系的等級(jí)承繼規(guī)那么和承繼阻斷 l在語義類型等級(jí)構(gòu)造的高層節(jié)點(diǎn)之間的語義關(guān)系,在任何能夠的情況下都是固定的,正如語義關(guān)系“影響鏈接的這些高層語義類型節(jié)點(diǎn)。而且高層語義類型之間的語義關(guān)系,普通地可經(jīng)過等級(jí)構(gòu)造(isa鏈)承繼給這些節(jié)點(diǎn)的一切子類。 l在有些情況下,假設(shè)按照語義類型的等級(jí)構(gòu)造及鏈的承繼規(guī)那么,會(huì)使語義類型與語義關(guān)系的銜接產(chǎn)生歧義。例如,語義關(guān)系“的進(jìn)程存在于語義類型“生物體功能和“生物體之間,“生物

17、體功能有一個(gè)子類是“心思功能,而植物也是一種“生物體,按照承繼規(guī)那么,心思過程也是一種“植物的活動(dòng)、功能或形狀,顯然,植物不能夠有“心思過程。不能承繼的鏈稱為阻斷 。語義網(wǎng)絡(luò)使概念之間語義關(guān)系的準(zhǔn)確細(xì)致表達(dá) lMeSH樹狀范圍表所表達(dá)的MeSH上位詞與下位詞之間的關(guān)系,只是簡(jiǎn)單的較泛指與較專指關(guān)系。例如,MeSH“羊水(Amnioticfluid)是MeSH“胚胎(Embryo)的一個(gè)下位詞:lEmbryoA16.254AmnioticfluidA16.254.72l在UMLS語義網(wǎng)絡(luò)中,Embryo標(biāo)引的語義類型是“胚胎構(gòu)造(Embryonicstructure),Amnioticfluid

18、標(biāo)引的語義類型是“機(jī)體物質(zhì)(BodySubstance),語義關(guān)系標(biāo)引的是“周圍(Surround)。所以“羊水與“胚胎之間的關(guān)系就被確切地表達(dá)為“胚胎構(gòu)造周圍的機(jī)體物質(zhì)。 專家詞典l專家詞典是一個(gè)包含眾多生物醫(yī)學(xué)詞匯的英語詞典。它是在美國國立醫(yī)學(xué)圖書館自然言語處置專家系統(tǒng)工程根底上開發(fā)出來的。專家詞典約有183000條詞匯記錄,共292000多個(gè)詞。l每條詞匯記錄均記錄了它的句法、詞法和字法信息。詞條由詞或詞組組成。一切詞條均共享它們的根本方式和拼寫變異。詞的根本方式包括詞的不變方式、名詞的單數(shù)方式、動(dòng)詞的原形以及描畫詞和副詞的原級(jí)方式。l詞匯信息包括句法分類、詞形變異以及詞的補(bǔ)充成份。詞形

19、變異有名詞的單復(fù)方式、動(dòng)詞的規(guī)那么與不規(guī)那么變化方式、描畫詞和副詞的原級(jí)、比較級(jí)、最高級(jí)方式等。專家詞典能識(shí)別11種句法分類和引語部分:動(dòng)詞、名詞、描畫詞、副詞、助詞、語氣詞、代詞、介詞、連詞、補(bǔ)語、定語。l專家詞典包括一組詞典程序,它們可以確定英語詞匯的范圍以及識(shí)別生物醫(yī)學(xué)術(shù)語和文本詞的詞形變異。還包括三個(gè)索引:超級(jí)敘詞表中一切詞串的單個(gè)詞索引;規(guī)范詞索引;規(guī)范詞串索引。l專家詞典包括四個(gè)詞匯數(shù)據(jù)庫:知詞源變異文檔,如“aphasic feizik n. adj.患失語癥者 失語癥的與“aphasia feizi n. 失語癥;親密相關(guān)詞文檔。親密相關(guān)詞是意義一樣但句法分類不同的詞,如肝細(xì)胞

20、“hepatocellular與“l(fā)iver cells;拼寫變異文檔,如“foetalfi:tl與“fetal;意義相近但構(gòu)詞方式不同的詞文檔,如“heart與“cardio。情報(bào)源圖譜l情報(bào)源圖譜是一個(gè)關(guān)于生物醫(yī)學(xué)機(jī)讀情報(bào)資源的數(shù)據(jù)庫,其目的是利用超級(jí)敘詞表和語義網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)以下功能:測(cè)度情報(bào)源與特定提問的相關(guān)性,以便選取最適宜的情報(bào)源;為用戶提供特定情報(bào)源的范圍、功能和檢索條件等人工可讀的信息;自動(dòng)銜接相關(guān)情報(bào)源;在一個(gè)或多個(gè)情報(bào)源中自動(dòng)檢索并自動(dòng)組織檢索的結(jié)果。l在情報(bào)源圖譜中,從4個(gè)方面對(duì)情報(bào)源進(jìn)展標(biāo)引:超級(jí)敘詞表中的MeSH詞表;超級(jí)敘詞表中的主題詞和副主題詞組配;一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)語

21、義網(wǎng)絡(luò)的語義類型;一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)語義網(wǎng)絡(luò)的語義關(guān)系。多元系統(tǒng)MetamorphoSysl多元系統(tǒng)是一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)新建立的一個(gè)可以為用戶提供個(gè)性化效力的系統(tǒng)。它包含一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的一切版本??梢园惭b一個(gè)或多個(gè)一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的知識(shí)資源。假設(shè)用戶選擇一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的超級(jí)敘詞表,用戶可以指定一個(gè)用戶化的超級(jí)敘詞表的子集。系統(tǒng)可以排除不用要的或者是本地用戶不答應(yīng)的詞匯,還可以從大量的數(shù)據(jù)中進(jìn)展選擇和過濾。2.4.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的開展戰(zhàn)略與開發(fā)原那么l多學(xué)科、多研討小組協(xié)同開發(fā)原那么l集中開發(fā)與分散開發(fā)相結(jié)合的原那么l資金保證原那么2.5.一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的運(yùn)用l電子數(shù)據(jù)處置系統(tǒng)

22、l管理信息系統(tǒng)l決策支持系統(tǒng) l一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)可將分散的情報(bào)源集成為一致的機(jī)讀生物醫(yī)學(xué)信息資源,大大提高了信息檢索系統(tǒng)的效率。目前已被廣泛運(yùn)用于信息系統(tǒng)的智能化檢索、自然言語系統(tǒng)研討、專業(yè)詞表的編制、自動(dòng)標(biāo)引、醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎的開發(fā)、醫(yī)學(xué)圖像的描畫及獲取、課程分析等方面。l一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)在電子數(shù)據(jù)處置系統(tǒng)的運(yùn)用主要表如今電子病案系統(tǒng)。荷蘭Erasmus大學(xué) ( Rotterdam ) Erik M van Mulligen方案開發(fā)一個(gè)經(jīng)過一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)獲取CPRThe Center For Public Resources數(shù)據(jù)的系統(tǒng)。美國護(hù)理學(xué)會(huì) ( The American Nu

23、rses Association , ANA ) 開發(fā)了一個(gè)基于一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的CPR數(shù)據(jù)系統(tǒng)。l一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)在決策系統(tǒng)中的運(yùn)用主要表如今醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎的開發(fā)。美國國立醫(yī)學(xué)圖書館利用一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)開發(fā)了兩個(gè)網(wǎng)上Medline文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫智能檢索軟件PubMed與IGMInternet Grateful Med。一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)目前支持的醫(yī)學(xué)搜索引擎包括醫(yī)學(xué)世界搜索( Medial World search , mwsearch,提供網(wǎng)上臨床醫(yī)學(xué)信息指引);國際臨床網(wǎng)(CliniWeb International, /cliniweb,是Internet上醫(yī)學(xué)網(wǎng)站

24、全文搜索引擎)與Med Weaver (提供醫(yī)學(xué)鑒別診斷、醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)及其相關(guān)醫(yī)學(xué)網(wǎng)站指引)。UMLS 地址:l://research/umls/ 3. 中醫(yī)藥學(xué)言語系統(tǒng)簡(jiǎn)介 l3.1.背景l(fā)3.2.設(shè)計(jì)思想及原那么l3.3.組成l言語系統(tǒng)的建立是自然言語處置的根底研討,國外從20世紀(jì)90年代起進(jìn)入頂峰研討期,并獲得了艱苦的進(jìn)展。美國國家圖書館建立的言語支持系統(tǒng),為醫(yī)學(xué)信息數(shù)字化及其利用發(fā)明了條件。l中醫(yī)藥學(xué)的開展同樣需求言語系統(tǒng)的支持,因此建立中醫(yī)藥言語系統(tǒng)是中醫(yī)藥信息學(xué)需求研討的主要問題之一。3.1.中醫(yī)藥言語系統(tǒng)背景中醫(yī)藥言語現(xiàn)狀現(xiàn)代文獻(xiàn)收詞已超越60萬條多樣性同名異物

25、 異物同名無規(guī)范化短少國標(biāo)無一致機(jī)讀詞庫短少系統(tǒng)構(gòu)造中醫(yī)藥學(xué)科歷經(jīng)千年,產(chǎn)生了大量的概念與術(shù)語,多種語義詞匯差別,妨礙了中醫(yī)藥數(shù)字化的開展。數(shù)據(jù)DATA知識(shí)KNOWLEDGE發(fā)掘MINING 百科全書及中英詞典等術(shù)語、名詞。 中醫(yī)藥學(xué)科收詞:中醫(yī)藥學(xué)教材、辭典、專家詞典。 臨床病例與臨床用語收詞。 相關(guān)學(xué)科:名詞委與醫(yī)學(xué)、生物、化學(xué)等相關(guān)收詞。 古文獻(xiàn)收詞:中醫(yī)藥學(xué)科古文獻(xiàn)中收詞。 中醫(yī)藥及中醫(yī)藥相關(guān)的可控詞表。 國家規(guī)范中的中醫(yī)與中藥相關(guān)名詞與術(shù)語。 國際醫(yī)學(xué)相關(guān)規(guī)范及國際專業(yè)與中醫(yī)藥相關(guān)的可控詞表。苦楚:太多同物異名、同名異物,無法作出正確判別!為什么要建立TCMLS? 國際醫(yī)學(xué)詞典等。3

26、.2設(shè)計(jì)思想l中醫(yī)藥學(xué)言語系統(tǒng)是按照中醫(yī)藥言語特點(diǎn)及學(xué)科體系、按照本體論原理設(shè)計(jì)而研制的言語系統(tǒng),其目的是為中醫(yī)藥學(xué)科的數(shù)字化與規(guī)范化提供必要的工具,處理一樣的概念具有不同的表達(dá)方式,同樣的表達(dá)方式表示不同的概念;同時(shí)利用本系統(tǒng),進(jìn)一步提示中醫(yī)藥學(xué)概念間的相互關(guān)聯(lián)。中醫(yī)藥學(xué)一體化言語系統(tǒng)是個(gè)繁雜龐大的系統(tǒng),其根本設(shè)計(jì)思緒是自創(chuàng)美國一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的原理與構(gòu)架,將中醫(yī)藥學(xué)概念中隱含的各種語義關(guān)系全部提取出來,構(gòu)成關(guān)系表,并以此為中心,建立學(xué)科術(shù)語概念與概念、概念與名詞、概念與含義、名詞與名詞之間的內(nèi)在聯(lián)絡(luò),構(gòu)成一個(gè)網(wǎng)狀的信息表示構(gòu)造。方法:從四方面入手研討方法:從四方面入手研討 中醫(yī)藥一體化言

27、語中醫(yī)藥一體化言語系統(tǒng)系統(tǒng)中醫(yī)藥為中心以中醫(yī)藥為中心,其他學(xué)科疊加:中醫(yī)藥信息化過程中運(yùn)用與利用的一切相關(guān)的學(xué)科與概念、術(shù)語中醫(yī)藥言語構(gòu)造體系一體化:建立、融入中醫(yī)藥術(shù)語表達(dá)方式一體化:詞條屬性中醫(yī)藥概念定義與釋義方式一體化:回答是 什么、關(guān)聯(lián)關(guān)系是什么、學(xué)科中的位置是什么一樣概念詞一體化:無論文字、圖表、正名與異名、正確與誤用海量言語術(shù)語集成為根底:制定收詞范圍、順序規(guī)范化網(wǎng)狀構(gòu)造解釋概念的語義歸類與關(guān)聯(lián):多程度控制:詞匯、形狀、語義、語用;本體論與詮釋論相結(jié)合設(shè)計(jì)分層構(gòu)造與網(wǎng)狀立體構(gòu)造;符合言語體系,限定與商定復(fù)雜度;采用歸納定性,將同類事物合并;參照UMLS的整體構(gòu)造,堅(jiān)持兼容性與包容性

28、;系統(tǒng)堅(jiān)持靈敏性與可擴(kuò)展性 ;Protg程序3.2設(shè)計(jì)原那么l系統(tǒng)設(shè)計(jì)以中醫(yī)藥學(xué)科為中心,堅(jiān)持中醫(yī)藥學(xué)科的特性l系統(tǒng)設(shè)計(jì)表達(dá)學(xué)科相關(guān)性與包容性l系統(tǒng)設(shè)計(jì)符合言語體系l系統(tǒng)設(shè)計(jì)采用語義歸納方法,將同類事物合并定性l系統(tǒng)設(shè)計(jì)參照一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的構(gòu)造,堅(jiān)持系統(tǒng)的兼容性 l系統(tǒng)堅(jiān)持靈敏性與可擴(kuò)展性研討內(nèi)容:研討內(nèi)容:設(shè)計(jì)詞條屬性構(gòu)造總體系統(tǒng)設(shè)計(jì)概念詞屬性定義四種可控詞表的構(gòu)造比較中醫(yī)藥概念的語義類型設(shè)計(jì)127種建立中醫(yī)藥一級(jí)分類體系16中醫(yī)藥語義的關(guān)聯(lián)關(guān)系58種事件與物質(zhì)二大類的構(gòu)造展開以中醫(yī)五、六版教材的學(xué)科分類為根據(jù)立體表達(dá)關(guān)系等級(jí)關(guān)系相關(guān)關(guān)系時(shí)間、空間、概念、功能、物理完成概念詞屬性設(shè)計(jì)語料

29、庫收詞40萬語義關(guān)聯(lián)關(guān)系127萬中醫(yī)學(xué)科構(gòu)造規(guī)范詞典教材臨床術(shù)語其他定義實(shí)現(xiàn)語義表達(dá)言語集成與規(guī)范建立數(shù)據(jù) 庫根底言語平臺(tái)共享平臺(tái)檢索查詢運(yùn)用工具數(shù)據(jù)發(fā)掘與知識(shí)再現(xiàn)支撐條件數(shù)據(jù)分發(fā)十三家Templates數(shù)據(jù)加工DATADATADATA合并整理學(xué)科分類語義提取數(shù)據(jù)查詢LogTCMLS平臺(tái)選取數(shù)據(jù). 規(guī)范、教材、辭典、工具書、臨床術(shù)語設(shè)計(jì)構(gòu)造TCMLS的建立流程圖中醫(yī)藥一體化言語系一致級(jí)學(xué)科分類161.中醫(yī)基礎(chǔ)理論中醫(yī)基礎(chǔ)理論(包括中醫(yī)生理、心理)Basic material in human body in Chinese medicine2.中醫(yī)學(xué)說與相關(guān)學(xué)科中醫(yī)學(xué)說與相關(guān)學(xué)科(包括中醫(yī)各家

30、學(xué)說、中醫(yī)流派、學(xué)術(shù)思想、學(xué)術(shù)觀點(diǎn))Related course in Chinese medicine3病因病機(jī)與診斷病因病機(jī)與診斷Etiological factors and pathogenesis and Diagnosis4疾病疾病(包括證候、癥狀)Chinese medicine disease5治則治法治則治法Curative principles and therapeutic methods6中藥學(xué)中藥學(xué)(包括藥劑學(xué)、調(diào)劑學(xué)、制劑學(xué)、制藥工藝、工程。注:此類下只包括單味藥)Chinese herbs7方劑學(xué)方劑學(xué)(包括中成藥)Prescriptions8中藥化學(xué)中藥化學(xué)TC

31、D chemical9藥用動(dòng)植物學(xué)藥用動(dòng)植物學(xué)(包括礦物藥、海洋藥、真菌藥等)Medicinal animals and plants10預(yù)防與養(yǎng)生學(xué)預(yù)防與養(yǎng)生學(xué)(只包括古代氣功部分,不要現(xiàn)代氣功部分)Chinese medicine prevention11針灸學(xué)針灸學(xué)(包括腧穴學(xué)、經(jīng)絡(luò)學(xué))Acupuncture and Moxibustion12人文科學(xué)人文科學(xué)Humanities13醫(yī)學(xué)信息學(xué)與文獻(xiàn)學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)與文獻(xiàn)學(xué)Medical Informatics and Literatures14自然科學(xué)、物理科學(xué)自然科學(xué)、物理科學(xué)Physical Sciences and Physics15

32、衛(wèi)生醫(yī)療機(jī)構(gòu)管理衛(wèi)生醫(yī)療機(jī)構(gòu)管理Organization and Administration 16地理學(xué)地理學(xué)Geography3.3.組成l根底詞庫系統(tǒng)l語義系統(tǒng)根底詞庫系統(tǒng)l這個(gè)系統(tǒng)是整個(gè)中醫(yī)藥學(xué)言語系統(tǒng)的中心及最根本的素材,是在對(duì)現(xiàn)存各種主題詞表、分類表、數(shù)據(jù)庫、工具書中有關(guān)詞匯進(jìn)展分析、選擇和組織的根底上產(chǎn)生的一個(gè)大型詞庫。本系統(tǒng)根底詞庫涵蓋可控詞表與中醫(yī)藥學(xué)科系統(tǒng)及與中醫(yī)藥學(xué)科相關(guān)聯(lián)的生物、植物、化工等自然與人文科學(xué)專業(yè)詞匯。根底詞庫建立在全面、廣泛、準(zhǔn)確、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)母咨?,最終構(gòu)成超級(jí)根底詞庫。l詞條屬性符合中醫(yī)藥學(xué)科自然言語與可控詞的雙重屬性。用準(zhǔn)確、完好的方式提示與表達(dá)中醫(yī)藥學(xué)科及相關(guān)術(shù)語。這個(gè)系統(tǒng)可以相當(dāng)于一致的醫(yī)學(xué)言語系統(tǒng)的超級(jí)敘詞表和專家詞典。l其中超級(jí)敘詞表部分的收詞范圍是中醫(yī)藥及相關(guān)的可控詞表:包括“中國中醫(yī)藥學(xué)主題詞表、“醫(yī)學(xué)主題詞表MeSH詞表、“第四版、“中醫(yī)藥學(xué)主題詞表等。 l詞典部分的收詞范圍包括:中醫(yī)藥學(xué)教材、辭典、規(guī)范、專家詞典;相關(guān)學(xué)科包括醫(yī)學(xué)、生物、化學(xué)等收詞;中醫(yī)藥學(xué)古代文獻(xiàn)收詞;臨床病例與臨床用語收詞;國家規(guī)范中的中醫(yī)與中藥相關(guān)名詞與術(shù)語;百科全書及中英詞典中的相關(guān)術(shù)語

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