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文檔簡(jiǎn)介
1、多肽合成技術(shù)多肽化學(xué)已經(jīng)走過(guò)了一百多年的光輝歷程,1902年,Emil Fischer首先開(kāi)始 關(guān)注多肽合成,由于當(dāng)時(shí)在多肽合成方面的知識(shí)太少,進(jìn)展也相當(dāng)緩慢當(dāng)時(shí)合成采用了苯甲酰,乙酰保護(hù),脫去相當(dāng)困難,而且容易導(dǎo)致肽鏈斷裂。直到1932年,Max Bergmann等人開(kāi)始使用芐氧羰基(Z)來(lái)保護(hù)a -氨基,該保護(hù)基可以在催化氫化或氫溴酸的條件下定 量脫除,多肽合成才開(kāi)始有了一定的發(fā)展。到了20世紀(jì)50年代,隨著越來(lái)越多的生物活性多肽的發(fā)現(xiàn),大大推動(dòng)了有機(jī)化學(xué)家們對(duì)多肽合成方法以及保護(hù)基的研究,因此這一階段 的研究成果也非常豐富,人們合成了大量的生物活性多肽,包括催產(chǎn)素( oxytocin )
2、,胰島 素等,同時(shí)在多肽合成方法以及氨基酸保護(hù)基上面也取得了不少成績(jī),這為后來(lái)的固相合 成方法的出現(xiàn)也提供了實(shí)驗(yàn)和理論基礎(chǔ)。也就是這個(gè)階段,F(xiàn)red Sanger 發(fā)明了氨基酸序列測(cè)定方法,并為此獲得了 1958年的Nobel化學(xué)獎(jiǎng)。還是他后來(lái)發(fā)明了 DNA序列檢測(cè)方法, 并于1980年再次獲得了 Nobel化學(xué)獎(jiǎng),成為到目前為止唯一獲得兩次Nobel化學(xué)獎(jiǎng)的科學(xué)家。1963年,Merrifield提出了固相多肽合成方法(SPPS,這個(gè)在多肽化學(xué)上具有里程碑意義的合成方法,一出來(lái),就由于其合成方便,迅速,現(xiàn)在已經(jīng)成為多肽合成的首選方 法,隨后的發(fā)展也證明了該方法不僅僅是一種合成方法,而且也帶來(lái)
3、了有機(jī)合成上的一次 革命,并成為了一支獨(dú)立的學(xué)科,固相有機(jī)合成(SPOS。當(dāng)然,Merrifield 也因此榮獲了 1984年的 Nobel 化學(xué)獎(jiǎng)。也正是 Merrifield ,他經(jīng)過(guò)了反復(fù)的篩選,最終屏棄了芐氧羰 基(Z)在固相上的使用,首先將叔丁氧羰基(BOC用于保護(hù)a -氨基并在固相多肽合成 上使用,其可以在酸性條件下定量的脫除,反應(yīng)也非常迅速,在 30min 就可以反應(yīng)完全。 由于叔丁氧羰基(BOC方法中,氨基酸側(cè)鏈的保護(hù)基團(tuán)大多基于芐基(Bzl ),因此也稱(chēng)為 BOC-Bzl 策略。同時(shí), Merrifield 在20世紀(jì)60年代末發(fā)明了第一臺(tái)全自動(dòng)多肽合成儀,并 首次合成生物蛋
4、白酶,核糖核酸酶( 124個(gè)氨基酸)。隨后的多肽化學(xué)研究主要集中在固相 合成樹(shù)脂,多肽縮合試劑,氨基酸保護(hù)基的研究。1972, Lou Carpino 首先將9-芴甲氧羰基(FMOC用于保護(hù)a -氨基,其在堿性條件下可以迅速脫除,10min就可以反應(yīng)完全,而 且由于其反應(yīng)條件溫和,迅速得到廣泛使用,到了 20世紀(jì)80年代取代了叔丁氧羰基( BOC,But),成為了固相多肽合成中的首選合成方法。該方法中氨基酸的側(cè)鏈大多基于叔丁基( 因此,也稱(chēng)為FMOC-Bu策略。同時(shí),在多肽合成樹(shù)脂,縮合試劑以及氨基酸保護(hù),包括合 成環(huán)肽的氨基酸正交保護(hù)上也取得了豐碩的成果。進(jìn)入 21世紀(jì),隨著蛋白質(zhì)組學(xué)的研究
5、深入,對(duì)于多肽化學(xué)的要求不僅僅是合成方法,而更 多的集中在多肽標(biāo)記與修飾方法,以及蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽的合成以及長(zhǎng)肽或蛋白合 成。多肽化學(xué)合成的基本介紹多肽化學(xué)合成方法,包括液相和固相兩種方法。液相合成方法現(xiàn)在主要采用BOCffi Z兩種保護(hù)方法,現(xiàn)在主要應(yīng)用在短肽合成,如阿斯巴甜,力肽,催產(chǎn)素等,其相對(duì)與固相合成, 具有保護(hù)基選擇多,成本低廉,合成規(guī)模容易放大的許多優(yōu)點(diǎn)。與固相合成比較,液相合 成主要缺點(diǎn)是,合成范圍小,一般都集中在 10個(gè)氨基酸以?xún)?nèi)的多肽合成,還有合成中需要 對(duì)中間體進(jìn)行提純,時(shí)間長(zhǎng),工作量大。固相合成方法現(xiàn)在主要采用FMO和BOCW種方法, 它具有合成方便,迅速,容易實(shí)
6、現(xiàn)自動(dòng)化,而且可以比較容易的合成到30個(gè)氨基酸左右多肽。氨基酸保護(hù)基20種常見(jiàn)氨基酸,根據(jù)側(cè)鏈可以分為幾類(lèi):脂肪族氨基酸( Ala, Gly, Val, Leu, Ile ,), 芳香族氨基酸(Phe, Tyr,Trp,His),酰胺或羧基側(cè)鏈氨基酸(Asp, Glu,Asn, Gin), 堿性側(cè)鏈氨基酸(Lys,Arg),含硫氨基酸(Cys,Met),含醇氨基酸(Ser,Thr),亞氨型 基酸(Pro)。多肽化學(xué)合成中氨基酸的保護(hù)非常關(guān)鍵,直接決定了合成能夠成功的關(guān)鍵。 因?yàn)槌R?jiàn)的 20中氨基酸中有很多都是帶有活性側(cè)鏈的,需要進(jìn)行保護(hù),一般要求,這些保 護(hù)基在合成過(guò)程中穩(wěn)定,無(wú)副反應(yīng),合成結(jié)
7、束后可以完全定量的脫除。合成中需要進(jìn)行保護(hù)的氨基酸包括:Cys,Asp,Glu, His,Lys,Asn,Gln,Arg,Ser,Thr, Trp,Tyr。需要進(jìn)行保護(hù)的基團(tuán):羥基,羧基,巰基,氨基,酰胺基,胍基,吲哚,咪唑等。其中Trp也可以不保護(hù),因?yàn)檫胚嵝再|(zhì)比較穩(wěn)定。當(dāng)然在特殊的情況下,有些氨基酸也可以不保護(hù),象,Asn, Gin ,Thr,Tyr。表1常見(jiàn)3種氨基脫除條件TFAHBr/TFAH2/Pd-CPiperidi ne/DMFBocyynnZnyynFmocnyny圖1常見(jiàn)3種氨基保護(hù)基結(jié)構(gòu)氨基酸側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)非常多,同一個(gè)側(cè)鏈有多種不同的保護(hù)基,可以在不同的條件下選擇 性的脫除
8、,這點(diǎn)在環(huán)肽以及多肽修飾上具有很重要的意義。而且側(cè)鏈保護(hù)基和選擇的合成 方法有密切的關(guān)系,液相和固相不一樣,固相中 BOC和FMO策略也不一樣,從某種意義上 看,多肽化學(xué)就是氨基酸保護(hù)基的靈活運(yùn)用與搭配。關(guān)于側(cè)鏈保護(hù)基的使用,請(qǐng)參考王德 心的固相有機(jī)合成 原理及應(yīng)用指南第四章,我們這里主要介紹 Cys,Lys,Asp的 幾種保護(hù)基及其脫除方法。Cys最常見(jiàn)的保護(hù)基有三種,Trt,Acm Mob這三個(gè)保護(hù)基可以完成多對(duì)二硫鍵多肽的合成。 Lys最常見(jiàn)的保護(hù)基有:Boc, Fmoc Trt , Dde Allyl , 這對(duì)于固相合成環(huán)肽提供了很多正交的保護(hù)策略。 Asp最常見(jiàn)的保護(hù)基有:Otbu,
9、 OBzl,OMe oaii,OFm同樣也提供了多種正交的保護(hù)策略。表2巰基常見(jiàn)保護(hù)基簡(jiǎn)稱(chēng)結(jié)構(gòu)脫除條件TrtTFA HCI/HOAc 12/MeOHAcm12/MeOH, Hg2+MobHF, TFMSA Hg2+表3氨基常見(jiàn)保護(hù)基簡(jiǎn)稱(chēng)結(jié)構(gòu)脫除條件TrtTFA HOAc HCOOHBocHCI/HOAq TFA/DCMFmocPip/DMF , NaOH/MeOHDdeH2NNH2/DMFAllylPd( Ph3P 4,嗎啉 /THF表3羧基常見(jiàn)保護(hù)基簡(jiǎn)稱(chēng)結(jié)構(gòu)脫除條件OtbuTFA HOA,HCOOHOBzlH2/Pd, HF, TFMSAOMeNaOH/MeOHOAIIPd( Ph3F)4,
10、嗎啉 /THFOFmPip/DMF,DBU/DMF多肽縮合試劑目前多肽合成中,主要采用羧基活化方法來(lái)完成接肽反應(yīng),最早使用的是將氨基酸活化為酰氯,疊氮,對(duì)稱(chēng)酸酐以及混合酸酐的方法,但是由于這些條件下,存在氨基酸消旋,以 及反應(yīng)試劑危險(xiǎn)以及制備比較復(fù)雜,逐漸被后來(lái)的縮合試劑取代,按照其結(jié)構(gòu)可以分為兩 種:縮合試劑主要有:碳二亞胺型,鎓鹽型(Uronium)。碳二亞胺型主要包括:DCC DIC,等。采用DCC進(jìn)行反應(yīng),由于反應(yīng)中生成的 DCU在DMF中溶解度 很小,產(chǎn)生白色沉淀,所以一般不用在固相合成中,但是由于其價(jià)格便宜,在液相合成中, 可以通過(guò)過(guò)濾除去,應(yīng)用仍然相當(dāng)廣泛。因?yàn)槠渌芙庑缘奶攸c(diǎn),
11、在多肽與蛋白的連接中使用比較多,而且也相當(dāng)成功。但是該類(lèi)型的縮合試劑的一個(gè)最大的缺點(diǎn),就是如果單獨(dú)使用,會(huì)有比較多的副反應(yīng),但是研究表明如果在活化過(guò)程中添加HOB,HOAt等試劑,可以將其副反應(yīng)控制在很低的范圍。其反應(yīng)機(jī)理如下:O-Acyitfioureaor in ca&a of OAt:MA cyl u普電 undesir&d side product, not adiw for coiwling(HGAf) N M圖2 DIC活化反應(yīng)機(jī)理鎓鹽型鎓鹽型縮合試劑反應(yīng)活性高,速度快,現(xiàn)在使用非常廣泛,主要包括:HBTUTBTUHATUPyBOP等。該試劑使用過(guò)程中需要添加有機(jī)堿
12、,女口,二異丙基乙胺(DIEA), N-甲基嗎啉(NMM, 該試劑加入后,才能活化氨基酸。其反應(yīng)機(jī)理如下:* 乳恥的田DIPE圖3 TBTU活化反應(yīng)機(jī)理多肽合成方法比較液相多肽合成(solution phase synthesis)液相多肽合成現(xiàn)在仍然廣泛的使用,在合成短肽和多肽片段上具有合成規(guī)模大,合成成本低的顯著優(yōu)點(diǎn),而且由于是在均相中進(jìn)行反應(yīng),可以選擇的反應(yīng)條件更加豐富,象一些催化氫化,堿性水解等條件,都可以使用,這在固相中,使用卻由于反應(yīng)效率低,以及副反應(yīng)等原因,無(wú)法應(yīng)用。液相多肽合成中主要采用B0(和Z兩種反應(yīng)策略。圖4液相合成Glu-Trp固相多肽合成1 .MaOH/MeOH2
13、39;.HCIA1OAcOH0 00 丄U-cM-oh td2 ch2 0=01 .DIEA2.MX 門(mén)p/DMF0 0戰(zhàn) j| H NHC -O'N-CHC-OH 加ch2 6=oi0I.WC/MOBt220% PipTDMF0 U!0也 IM-Ch8-N-CH-OH 仍TF 貴 CH2丄-ch2G=0OHGlu-Trp圖5 FMOC固相合成Glu-Trp固相多肽合成現(xiàn)在使用的主要有兩種策略:BOC和FMOC兩種。BOC方法合成過(guò)程中,需要反復(fù)使用TFA脫 BOC而且在最后從樹(shù)脂上切割下來(lái)需要使用 HF,由于HF必須使用專(zhuān)門(mén)的 儀器進(jìn)行操作,而且切割過(guò)程中容易產(chǎn)生副反應(yīng),因此現(xiàn)在使用
14、受到實(shí)驗(yàn)條件限制,使用 也逐漸減少。FMO方法反應(yīng)條件溫和,在一般的實(shí)驗(yàn)條件下就可以進(jìn)行合成,因此,也得 到了非常廣泛的應(yīng)用。固相合成中常用樹(shù)脂固相合成中樹(shù)脂,一般都是聚苯乙烯-二乙烯苯材料,大小在75-150卩m交聯(lián)度在1-2%之間,現(xiàn)在使用的大多是1%因?yàn)檫@種交聯(lián)度下,樹(shù)脂在DMFDCM中具有很好的溶脹性能,立體上是一個(gè)空間網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),反應(yīng)物分子可以在樹(shù)脂內(nèi)部自由移動(dòng)。樹(shù)脂中最關(guān)鍵的部分 是連接手臂,它一端連接在樹(shù)脂上,一端作為反應(yīng)位點(diǎn)。目前廣泛使用的樹(shù)脂有:PAMMBHAWang 2-Cl-Trt ,Rink-Amide-MBHA等。其中 PAM MBHA是用在 BOC策略中,因?yàn)槠鋵?duì)酸
15、非常穩(wěn)定,需要在HF, TFMS等強(qiáng)酸條件下才能夠切割下來(lái)。0HMBHAW 曲g2TrtFAMRitik-Amide圖6固相合成常用樹(shù)脂茚三酮檢測(cè)檢測(cè)方法稱(chēng)為Kaiserpro,ser,His)。固相多肽合成中,主要是通過(guò)檢測(cè)樹(shù)脂上游離氨基來(lái)判斷連接效率,方法,其檢測(cè)結(jié)果,如果有游離氨基的時(shí)候,顯示蘭色,或紅褐色(Kaiser試劑包括:A, 6%茚三酮的乙醇溶液B, 80%苯酚的乙醇溶液C, 2% KCN的吡啶溶液配制中的吡啶需要經(jīng)過(guò)茚三酮處理后,重蒸后再使用。檢測(cè)過(guò)程,取少量樹(shù)脂,加入A,B, C各2-3滴,100C下加熱1-2min,如果溶液有蘭色,或樹(shù)脂出現(xiàn)蘭色,紅褐色,表明還 有游離氨
16、基,否則說(shuō)明連接完全。還有其它檢測(cè)游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,苦味酸法,溴芬蘭法等。圖7茚三酮檢測(cè)原理固相合成切割方法固相合成完成之后,必須選擇合適的切割試劑將多肽從樹(shù)脂上切割下來(lái),然后經(jīng)過(guò)冰乙醚沉淀,離心收集沉淀,經(jīng)過(guò)HPLC分離純化,冷凍干燥得到最后產(chǎn)品。由于選擇的樹(shù)脂不同, 氨基酸序列不同,在切割時(shí)候,選擇的切割方法也不完全相同,一般都是選擇酸性條件下 切割的條件,對(duì)于PAM MBH樹(shù)脂,一般采用HF切割,切割過(guò)程中需要添加對(duì)甲苯酚,對(duì) 巰基苯酚,苯甲醚等試劑。而對(duì)于 Wang Rink-Amide , Trt樹(shù)脂,一般采用TFA切割,切割過(guò)程中加入,乙二硫醇,苯甲硫醚,水,三異丙基
17、硅烷,苯酚等。這些添加試劑主要作 為碳正離子俘獲試劑使用,目的是俘獲切割反應(yīng)過(guò)程中生成的碳正離子,減少這些碳正離 子對(duì)部分氨基酸側(cè)鏈的進(jìn)攻導(dǎo)致的副反應(yīng),比較容易產(chǎn)生副反應(yīng)的氨基酸有:Trp,Tyr。切割試劑用量一般10-15ml/g樹(shù)脂。常用的切割配比:HF/p-cresol/p-thiocresol (90/5/5), TFA/TIS/EDT/H2O (94/1/),反應(yīng)一般是在室溫條件下 2h-4h。多肽合成中主要問(wèn)題消旋及其反應(yīng)機(jī)理多肽合成過(guò)程中,部分氨基酸在活化的過(guò)程中會(huì)導(dǎo)致不同程度的消旋,特別容易消旋的氨 基酸有:Cys, His,Phe,當(dāng)然這些消旋化還和溶劑,溫度以及合成中的有機(jī)
18、堿等因素有關(guān)。 對(duì)于這些氨基酸,可以通過(guò)采用高效縮合試劑,減少反應(yīng)時(shí)間,可以減少消旋的比例,一 般條件選擇適當(dāng),消旋化都可以控制在 5沖內(nèi)。消旋反應(yīng)機(jī)理如下:圖8消旋反應(yīng)機(jī)理酮哌嗪(DKP反應(yīng)DKP副反應(yīng)出現(xiàn)在FMOC-Wan樹(shù)脂合成過(guò)程中,主要出現(xiàn)在第一個(gè)氨基酸為 Pro的時(shí)候, 當(dāng)?shù)诙€(gè)氨基酸脫FMOC勺時(shí)候,a -氨基被游離出來(lái)之后,立即對(duì)Wang樹(shù)脂的芐酯鍵進(jìn)行 分子內(nèi)胺解,生成六元環(huán)二酮哌嗪衍生物,同時(shí)從 Wang樹(shù)脂上釋放出來(lái),導(dǎo)致反應(yīng)終止。該反應(yīng)非常迅速,文獻(xiàn)報(bào)道采用50%Pip/DMF脫1min,4min的條件,但是我們實(shí)驗(yàn)證明在多數(shù)情況下,即使是1min左右反應(yīng)就超過(guò)了 20
19、%因此一般在末端第一個(gè)氨基酸為 Pro的時(shí)候,建議采用2-Cl-Trt樹(shù)脂合成,由于該樹(shù)脂巨大的空間阻力,可以完全消除該副反應(yīng)。 這個(gè)副反應(yīng)在BOC策略合成過(guò)程中,卻可以完全避免,因?yàn)?BOC在使用TFA脫除后,使氨 基以TFA鹽的形式存在,從而失去了親核性,不能進(jìn)攻芐酯鍵。O1圖9 DKP反應(yīng)機(jī)理困難序列多肽合成固相多肽合成中也經(jīng)常遇到多肽合成失敗或合成效率很低的問(wèn)題,這里面的主要原因是由于多肽序列引起的,因?yàn)橛行┒嚯男蛄性跇?shù)脂上形成B -折疊,改變了樹(shù)脂的溶脹性能,還有可能將反應(yīng)的活性位點(diǎn)埋藏在樹(shù)脂里面,這樣使得反應(yīng)很難進(jìn)行,目前報(bào)道使用的主 要方法有:使用混合溶劑,DMSO/DMF6N胍
20、啶/DMF溶液提高反應(yīng)溫度,或采用微波方法使用高離液鹽,LiCI,NaCIO4等。使用溶脹性能更好的PEG-PS樹(shù)脂,同時(shí)減少樹(shù)脂擔(dān)載量()合成多肽分析鑒定方法多肽的分析鑒定方法有多肽一級(jí)結(jié)構(gòu),二級(jí)結(jié)構(gòu)鑒定,多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)包括:質(zhì)譜分析,氨 基酸組成分析,氨基酸序列分析。二級(jí)結(jié)構(gòu)包括:圓二色譜(CD,NMR X-衍射等方法。純度分析多肽的純度分析,一般都采用HPLC進(jìn)行分析,選擇RP-C18粒徑5卩m孔徑300A,x 150mm 流動(dòng)相:A, % TFA/H2O B, %TFA/ACN洗脫梯度,5%B-65%B時(shí)間30min。也有些多肽, 特別是短肽,由于親水性強(qiáng),在 C181保留很弱,需要改變
21、條件,這里主要有兩種方法: 一個(gè)改變分析梯度,可以將起始梯度改為 2%,等度或小梯度洗脫;另外一個(gè)方法是在流動(dòng) 相中加入強(qiáng)離子對(duì)試劑,如七氟丁酸,十八烷基磺酸鈉等。一級(jí)結(jié)構(gòu)分析質(zhì)譜分析質(zhì)譜分析的目的主要是確證分子量, 當(dāng)然采用MS/M列以部分的了解多肽序列的信息,但 是這個(gè)需要比較全的數(shù)據(jù)庫(kù)作為基礎(chǔ),分析才能比較準(zhǔn)確。由于多肽性質(zhì)不穩(wěn)定,需要采 用軟電離技術(shù),目前多肽分析主要使用了電噴霧(ESI-MS),基質(zhì)輔助激光解吸(MALDI-MS。 其中ESI-MS通常會(huì)給出多電荷峰,電荷數(shù)目和多肽序列上氨基,胍基,咪唑基的數(shù)目有關(guān), 因此,經(jīng)常給出了雙電荷,三電荷等離子峰。MALDI-M舸以分析蛋白
22、大分子,而且通常情況下很少帶多電荷,因此數(shù)據(jù)直接對(duì)應(yīng)了分子離子峰,容易分析。此外,通常在分析長(zhǎng)肽 或蛋白過(guò)程中,需要添加NH4 Na, K等離子,提高靈敏度,所以一般在 MS中出現(xiàn)一組峰, 分別對(duì)應(yīng):( M+H) +,( M+NH)4 +,( M+N)a +,( M+K) +。氨基酸組成分析氨基酸組成分析一般需要產(chǎn)品的純度較高,它可以給出多肽中氨基酸的種類(lèi),數(shù)目。分析 過(guò)程首先通過(guò)酸水解破壞肽鍵,典型酸水解的條件是:真空條件下,110C,用6M鹽酸水解16至72小時(shí)。酸水解雖然很有用,但酸水解條件下不能獲得完整的氨基酸分析,因?yàn)樘?冬酰胺和谷氨酰胺的側(cè)鏈含有酰胺鍵,用于切斷蛋白質(zhì)肽鍵的酸也可以
23、將天冬酰胺轉(zhuǎn)換為 天冬氨酸,谷氨酰胺轉(zhuǎn)換為谷氨酸。由于水解溫度比較高,色氨酸的吲哚環(huán)容易被空氣氧 化,即使在密封的管中,色氨酸的吲哚環(huán)也幾乎都被破壞了。因此蛋白質(zhì)的色氨酸含量往 往是通過(guò)它的紫外吸收光譜估計(jì)的,也可以通過(guò)堿水解分析色氨酸的含量。半胱氨酸在酸 水解中也不能精確測(cè)定,要精確測(cè)量需要在蛋白質(zhì)水解之前進(jìn)行氧化或羧甲基化,形成的 衍生物在酸水解之后才能定量。氨基酸序列分析氨基酸序列分析的基本原理是 Edman?降解,主要涉及耦聯(lián)、水解、萃取和轉(zhuǎn)換等4個(gè)過(guò)程。 首先使用苯異硫氰酸酯(PITC)在的堿性條件下對(duì)蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行處理,PITC與肽鏈的N-端的氨基酸殘基反應(yīng),形成苯氨基硫甲酰(P
24、TC衍生物,即PTC肽。然后PTC肽用三 氟乙酸處理,N-端氨基酸殘基肽鍵被有選擇地切斷,釋放出該氨基酸殘基的噻唑啉酮苯胺 衍生物。接下來(lái)將該衍生物用有機(jī)溶劑(例如氯丁烷)從反應(yīng)液中萃取出來(lái),而去掉了一 個(gè)N-端氨基酸殘基的肽仍留在溶液中。萃取出來(lái)的噻唑啉酮苯胺衍生物不穩(wěn)定, 經(jīng)酸作用, 再進(jìn)一步環(huán)化,形成一個(gè)穩(wěn)定的苯乙內(nèi)酰硫脲(PTH衍生物,即PTH氨基酸。留在溶液中的減少了一個(gè)氨基酸殘基的肽再重復(fù)進(jìn)行上述反應(yīng)過(guò)程,整個(gè)測(cè)序過(guò)程現(xiàn)在都是通過(guò)測(cè) 序儀自動(dòng)進(jìn)行。二級(jí)結(jié)構(gòu)分析圓二色譜( CD)圓二色譜是一種特殊的吸收譜, 它通過(guò)測(cè)量蛋白質(zhì)等生物大分子的圓二色光譜, 從而得到 生物大分子的二級(jí)結(jié)構(gòu),
25、簡(jiǎn)單、快捷,廣泛應(yīng)用在蛋白質(zhì)折疊,蛋白質(zhì)構(gòu)象研究,酶動(dòng)力 學(xué)等領(lǐng)域。圓二色譜紫外區(qū)段(190-24Onm),主要生色團(tuán)是肽鏈,這一波長(zhǎng)范圍的 CD譜包 含了生物大分子主鏈構(gòu)象的信息。a -螺旋構(gòu)象的CD譜在222nm 208nm處呈負(fù)峰,在190nm附近有一正峰。B -折疊構(gòu)象的CD譜,在217-218nm處有一負(fù)峰,在195-198nm處有一強(qiáng)的 正峰。無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)象的 CD譜在198nm附近有一負(fù)峰,在220nm附近有一小而寬的正峰核磁共振 (NMR)隨著二維、三維以及四維 NMR勺應(yīng)用,分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)處理技術(shù)的發(fā)展,使NMR逐漸成為大分子結(jié)構(gòu)物質(zhì)分析的主要方法之一。NMR可用于確定氨
26、基酸序列、分布以及構(gòu)象。目前,NMRt分析分子中含少于30個(gè)氨基酸的小肽時(shí)是非常有用的,分析結(jié)果快速準(zhǔn)確。衍射X-衍射可獲得有關(guān)化合物晶型的直接信息,而且可以判斷相對(duì)與絕對(duì)構(gòu)型。多肽標(biāo)記及修飾目前多肽標(biāo)記及修飾的內(nèi)容非常多,廣泛應(yīng)用在多肽藥物,多肽生物學(xué),多肽抗體以及多 肽試劑的研究中。目前應(yīng)用廣泛的有:非放射性核素標(biāo)記(C13, H2),熒光標(biāo)記(FAMFITC), 生物素標(biāo)記,磷酸化修飾等。非放射性核素標(biāo)記目前在非放射性核素標(biāo)記中,使用廣泛的仍然是 C13, H2,因?yàn)槠涫褂冒踩?,放射性小?現(xiàn)在有比較完全的非放射性標(biāo)記的氨基酸,可以按照正常的多肽合成方法將標(biāo)記好的氨基 酸直接連接到多肽上
27、。熒光標(biāo)記熒光標(biāo)記由于沒(méi)有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單。因此,目前在生物學(xué)研究中熒光標(biāo)記應(yīng)用非常 廣泛,熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游離羧基的采用的方法與接肽反應(yīng) 相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法連接。但是對(duì)于FITC標(biāo)記,需要在連接FITC前,增加一個(gè)氨基己酸,避免在切割的過(guò)程中被 TFA切割掉生物素標(biāo)記生物素-親合素系統(tǒng)(biotin-avidin system, BAS),是70年代后期應(yīng)用于免疫學(xué),并得到迅速發(fā)展的一種新型生物反應(yīng)放大系統(tǒng)。由于它具有生物素與親合素之間高度親和力及 多級(jí)放大效應(yīng),并與熒光素、酶、同位素等免疫標(biāo)記技術(shù)有機(jī)地結(jié)合,使各種示蹤免疫分 析的特異
28、性和靈敏度進(jìn)一步提高。主要有用于標(biāo)記多肽氨基的生物素N-羥基丁二酰亞胺酯(BNHS和生物素對(duì)硝基酚酯(pBNP),其中以BNHS最常用,當(dāng)然,也可以直接使用生物素也 可以標(biāo)記,因?yàn)槠浣Y(jié)構(gòu)上有個(gè)游離的羧基,采用HBTU/HOBt/DIEA方法縮合,由于生物素的溶解度低,使用DMSO/DMF混合溶劑增加溶解度。磷酸肽合成磷酸肽在生命過(guò)程中發(fā)揮重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Ser,Thr,Tyr。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,目前使用的都是單芐基磷酸化氨基酸, Tyr 也可以直接 使用磷酸化氨基酸。磷酸化氨基酸的連接一般采用 HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采用該 方法合成磷酸化
29、也有缺點(diǎn),特別是在合成多磷酸化多肽或長(zhǎng)肽的時(shí)候,連接效率低,最后 產(chǎn)品純度很低,對(duì)于這種磷酸化多肽,我們考慮采用后磷酸化方法,其合成過(guò)程就是在多 肽合成結(jié)束后,選擇性脫去要標(biāo)記的氨基酸的側(cè)鏈保護(hù)基,對(duì)于Tyr,Thr可以直接使用側(cè)鏈不保護(hù)的氨基酸進(jìn)行反應(yīng),而 Ser可以采用Fmoc-Ser (trt),在1%TFA/DCM件下可以 定量的脫除。后磷酸化,采用雙芐基亞磷酰胺,四氮唑生成亞磷酰胺四唑活性中間體,連 接到羥基上,隨后在過(guò)氧酸下氧化生成磷?;瓿煞磻?yīng)。蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽 多肽在與蛋白受體結(jié)合發(fā)揮功能的時(shí)候,總是先折疊出某些特殊的結(jié)構(gòu),多肽類(lèi)似物合成 主要是為了模擬這些結(jié)構(gòu),保持或
30、提高生物活性,同時(shí)也為了改變多肽的穩(wěn)定性,提高其 抗酶解能力。a-螺旋多肽a -螺旋是蛋白結(jié)構(gòu)中最為普通的一種,但是一般多肽在溶液中大多是無(wú)規(guī)卷曲的,目前使用最多的方法是多肽保持 a -螺旋結(jié)構(gòu)就是在多肽表面通過(guò)共價(jià)鍵將處在 a -螺旋結(jié)構(gòu)的 兩個(gè)氨基酸連接起來(lái),選擇的位點(diǎn)(i,i+4或i,i+7),選擇的化學(xué)鍵包括:二硫鍵,硫 醚鍵,酰胺鍵,烯烴鍵(RCM等方法。二硫鍵二硫鍵廣泛存在與蛋白結(jié)構(gòu)中, 對(duì)穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)具有非常重要的意義, 二硫鍵一般是通過(guò) 序列中的2個(gè) Cys的巰基,經(jīng)氧化形成。形成二硫鍵的方法很多:空氣氧化法, DMSC氧化 法,過(guò)氧化氫氧化法等。二硫鍵的合成過(guò)程,可以通過(guò) E
31、llman檢測(cè)以及HPLC檢測(cè)方法對(duì) 其反應(yīng)進(jìn)程進(jìn)行監(jiān)測(cè)。硫醚鍵硫醚鍵的形成可以通過(guò)序列中的 Lys,將溴乙酸連接到Lys的側(cè)鏈氨基上,利用其和巰基 的特異性反應(yīng),反應(yīng)在緩沖溶液中進(jìn)行,迅速高效。酰胺鍵多肽的內(nèi)酰胺環(huán)肽的合成一般是利用 Lys,Asp(Glu)的選擇性保護(hù),在固相上直接環(huán)化。BOCft略中可以采用 BOC-Ly(FmoC,BOC-AspOFm,FMO策略中可以采用 FMOC-Ly6Aloc),F(xiàn)MOC-As(p Allyl )。對(duì)于首尾環(huán)肽,還可以先合成保護(hù)的多肽,然后在液相中環(huán)化生成目 標(biāo)多肽烯烴鍵(RCMRCM反應(yīng)是一個(gè)過(guò)渡金屬催化反應(yīng),其反應(yīng)中使用催化劑:(Cy3P)2CI2Ru=CHPh可以催化烯烴環(huán)化,過(guò)程中脫去一分子乙烯。-X-Kesin ll 1.20? pip/DIFI S.Fnj oc-Xl/HBTUZHOBt/DIEA7Cnsin(Cy 3FJ 2C12Ru=匸:HPh.E>CJ4Prcfl u-;X1-X2-1. cle avae reag ent £C2
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