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文檔簡介

1、1. 舉例說明蛋白質(zhì)有哪些重要的生物學(xué)功能?蛋白質(zhì)元素組成有何特點(diǎn)?2. 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)形成的基本原理是什么?二級結(jié)構(gòu)主要有哪幾種形式?這些二級結(jié)構(gòu)是如何維持的?3. 什么是蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域?4. 進(jìn)行蛋白質(zhì)分子三維結(jié)構(gòu)研究的方法主要有哪些,請介紹其中兩種的基本原理。5. 舉例說明蛋白質(zhì)的變構(gòu)效應(yīng)。6. 蛋白質(zhì)是如何形成的?蛋白質(zhì)折疊指什么?7. 什么是分子伴侶?簡述分子伴侶的主要功能和作用模型。8. 舉例說明蛋白質(zhì)構(gòu)象?。ㄈ珉貌《静。┎㈥U述疾病發(fā)病機(jī)理。9. 舉例說明生物分子內(nèi)與分子間的各種相互作用力。1. 舉例說明蛋白質(zhì)有哪些重要的生物學(xué)功能?蛋白質(zhì)元素組成有何特點(diǎn)?(一)(1)

2、催化功能,如細(xì)胞內(nèi)的化學(xué)反應(yīng)離不開酶的催化,參與生物體各種生命活動的絕大多數(shù)酶都是蛋白質(zhì)。(2)運(yùn)輸功能,如紅細(xì)胞中的血紅蛋白是運(yùn)輸氧的蛋白質(zhì)。(3)營養(yǎng)和儲存功能,如酪蛋白廣泛分布在天然乳類中。酪蛋白分子量大,是攜帶礦物質(zhì)的載體,如酪蛋白磷酸肽就是其水解產(chǎn)物,能促進(jìn)鈣等礦物質(zhì)吸收利用。 (4)收縮和運(yùn)動功能,如肌球蛋白組成的粗肌絲和由肌動蛋白組成的細(xì)肌絲相互穿插排列,并且依靠粗肌絲頭端的橫橋使二者緊密接觸在一起。肌肉的收縮是粗肌絲和細(xì)肌絲發(fā)生相對運(yùn)動的結(jié)果,這個過程受Ca的調(diào)節(jié),并需要水解ATP來提供能量。 (5)結(jié)構(gòu)功能,如人和動物的肌肉主要是蛋白質(zhì),它們是構(gòu)成細(xì)胞和生物體的重要物質(zhì)。(6

3、)防御功能,如動物和人體內(nèi)的抗體能消除外來蛋白質(zhì)對身體的生理功能的干擾,起到免疫作用。(7)調(diào)控功能,如胰島素和生長激素都是蛋白質(zhì),能夠調(diào)節(jié)人體的新陳代謝和生長發(fā)育。(二)蛋白質(zhì)主要由元素 C、H、O、N組成,有些還有P、S等;所有的蛋白質(zhì)都含有碳(50-60%)、氫(6-8%)、氧(19-24%)、氮(13-19%);大多數(shù)蛋白質(zhì)含有硫(4%以下);有些蛋白質(zhì)含有磷;少數(shù)蛋白質(zhì)含有金屬元素(如鐵、銅、鋅、錳等);個別蛋白質(zhì)含有碘. 2. 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)形成的基本原理是什么?二級結(jié)構(gòu)主要有哪幾種形式?這些二級結(jié)構(gòu)是如何維持的?(1)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是多肽鏈借助氫鍵沿一維方向排列呈具有

4、周期性的結(jié)構(gòu)的構(gòu)象,它是多肽鏈骨架的排列規(guī)則,而不涉及側(cè)鏈的類型與構(gòu)象。(2)2-螺旋;-折疊;-轉(zhuǎn)角; 無規(guī)卷曲(3) 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)主要由肽鏈骨架內(nèi)的氫鍵來維持。3. 什么是蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域?(1)相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元組合在一起,彼此相互作用,排列成規(guī)則的、在空間結(jié)構(gòu)上能夠辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體,并充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件,稱為超二級結(jié)構(gòu)。(2)結(jié)構(gòu)域介于超二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)之間,多肽鏈在超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步盤繞折疊,形成緊密的近乎于球狀的獨(dú)立結(jié)構(gòu),稱為結(jié)構(gòu)域。4. 進(jìn)行蛋白質(zhì)分子三級結(jié)構(gòu)研究的方法主要有哪些,請介紹其中兩種的基本原理。(1) X-ray 晶體衍射;多維核磁共

5、振 NMR;三維電子顯微鏡 EM;掃描探針顯微鏡STM。(2) X-ray 晶體衍射用布拉格方程描述X射線衍射條件:2dsin=n 式中d為相鄰兩個晶面之間的距離;為入射線或反射線與晶面的交角;為X射線波長;n 為正整數(shù)。晶體不動,改變波長,即采用白色X射線;波長不變,即用單色X射線 ,讓晶體繞某晶軸轉(zhuǎn)動。這樣可在某些特定的晶體方位得到衍射圖。由于X射線是一種波長比可見光短得多的電磁波,使X射線通過晶體,會發(fā)生衍射現(xiàn)象,能提供晶體內(nèi)原子排布的信息。根據(jù)衍射的方向可以測定晶格參數(shù)或晶胞的大小和形狀。根據(jù)衍射線強(qiáng)度分布能夠測定原子在晶胞中的坐標(biāo),因此X射線衍射法也是測定蛋白質(zhì)分子三級結(jié)構(gòu)的主要方法

6、。核磁共振是指原子核在外加恒定磁場作用下產(chǎn)生能級分裂,從而對特定頻率的電磁波發(fā)生共振吸收的現(xiàn)象。原子核都在不斷做自旋運(yùn)動,正電的原子核在自旋時可以產(chǎn)生磁場,就像一個小型的磁鐵,從而可以在磁場中受力產(chǎn)生轉(zhuǎn)動。不同取向的自旋核所具有的能量不同產(chǎn)生分裂,當(dāng)入射電磁波能量等于能級間能量差即引起原子核兩個能級間的躍遷,這時就發(fā)生了核磁共振。5. 舉例說明蛋白質(zhì)的變構(gòu)效應(yīng)。變構(gòu)效應(yīng),是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性改變的現(xiàn)象。變構(gòu)效應(yīng)在生命活動調(diào)節(jié)中起很重要作用。如阻遏蛋白受小分子物質(zhì)的影響發(fā)生構(gòu)象變化,改變了它與DNA結(jié)合的牢固程度,從而對遺傳信息的表達(dá)進(jìn)行調(diào)控。另如激素受體,神

7、經(jīng)遞質(zhì)受體等都是通過生物分子的影響發(fā)生構(gòu)象變化而傳遞信息的。可以說變構(gòu)效應(yīng)是生物分子“通訊”地基。 6.蛋白質(zhì)是如何形成的?蛋白質(zhì)折疊指什么?(1)DNA轉(zhuǎn)錄成mRNA,mRNA進(jìn)入核糖體,tRNA運(yùn)輸氨基酸,在核糖體中翻譯,形成多肽,經(jīng)過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體的修飾折疊,形成成熟的蛋白質(zhì),再運(yùn)輸出細(xì)胞。(2)蛋白質(zhì)折疊是多肽鏈憑借相互作用在細(xì)胞環(huán)境(特定的酸堿度、溫度等)下自己組裝自己,從無規(guī)卷曲(去折疊態(tài))折疊到三維功能結(jié)構(gòu)(天然態(tài))的物理過程。7. 什么是分子伴侶?簡述分子伴侶的主要功能和作用模型。(1)分子伴侶是細(xì)胞內(nèi)的一類保守蛋白質(zhì),在序列上沒有相關(guān)性但有共同功能,它們在細(xì)胞內(nèi)可

8、識別肽鏈的非天然構(gòu)象,幫助其完成正確的組裝,而且在組裝完畢后與之分離,不構(gòu)成這些蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)執(zhí)行功能時的組份。(2)在動物、植物、細(xì)菌內(nèi)廣泛分布和存在,其功能是介導(dǎo)其它蛋白質(zhì)的折疊和裝配,而本身卻不是最終功能蛋白質(zhì)分子的組成部分。(3)例如Bip蛋白可識別并結(jié)合折疊錯誤的多肽及尚未完成裝配的蛋白質(zhì)亞單位,使其滯留并促使其重新折疊與裝配,發(fā)揮糾錯功能。又如鈣網(wǎng)素、葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白94等。8. 舉例說明蛋白質(zhì)構(gòu)象?。ㄈ珉貌《静。┎㈥U述疾病發(fā)病機(jī)理。蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列沒有改變,即一級結(jié)構(gòu)正常,只是其二級結(jié)構(gòu)、乃至立體結(jié)構(gòu)(構(gòu)象)異常而導(dǎo)致的疾病稱為構(gòu)象病。朊病毒蛋白分子本身不能致病,而必須發(fā)生空間結(jié)

9、構(gòu)上的變化轉(zhuǎn)化為朊病毒才會損害神經(jīng)元。一個致病分子先與一個正常分子結(jié)合,在致病分子的作用下,正常分子轉(zhuǎn)變?yōu)橹虏》肿?,然后這兩個致病分子分別與兩個正常分子結(jié)合,再使后者轉(zhuǎn)變?yōu)橹虏》肿?。病變蛋白只要通過接觸其他正常蛋白就可以把它們也帶壞。周而復(fù)始,通過多米諾效應(yīng)倍增致病。9. 舉例說明生物分子內(nèi)與分子間的各種相互作用力。(1)強(qiáng)相互作用:例如共價(jià)鍵、離子鍵、配位鍵這種能夠維持原子結(jié)合,形成一級結(jié)構(gòu)的相互作用力。(2)弱相互作用:例如氫鍵、范德化力以及蛋白質(zhì)形成中主要的三種非共價(jià)作用,能夠維持大分子的空間結(jié)構(gòu)的相互作用力。(3)水結(jié)構(gòu)與水化作用:水化作用是物質(zhì)與水發(fā)生化合的反應(yīng),一般指分子或離子的水

10、合作用。其中當(dāng)鹽類溶于水中生成電解質(zhì)溶液時,離子的靜電力破壞了原來的水結(jié)構(gòu),在其周圍形成一定的水分子層,稱為水化。 10. 簡述酵母雙雜交技術(shù)的原理。酵母雙雜交的目的是檢測兩種蛋白的是否有相互作用?;驹?酵母雙雜交系統(tǒng)由Fields和Song等首先在研究真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中建立 i 。典型的真核生長轉(zhuǎn)錄因子, 如GAL4、GCN4、等都含有二個不同的結(jié)構(gòu)域: DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA-binding domain)和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域(transcription-activating domain)。前者可識別DNA上的特異序列, 并使轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域定位于所調(diào)節(jié)的基因的上游, 轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域可同

11、轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的其他成分作用, 啟動它所調(diào)節(jié)的基因的轉(zhuǎn)錄。二個結(jié)構(gòu)域不但可在其連接區(qū)適當(dāng)部位打開, 仍具有各自的功能。而且不同兩結(jié)構(gòu)域可重建發(fā)揮轉(zhuǎn)錄激活作用。酵母雙雜交系統(tǒng)利用雜交基因通過激活報(bào)道基因的表達(dá)探測蛋白蛋白的相互作用。 11. 闡述熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)的原理。熒光共振能量轉(zhuǎn)移是指兩個熒光發(fā)色基團(tuán)在足夠靠近時,當(dāng)供體分子吸收一定頻率的光子后被激發(fā)到更高的電子能態(tài),在該電子回到基態(tài)前,通過偶極子相互作用,實(shí)現(xiàn)了能量向鄰近的受體分子轉(zhuǎn)移(即發(fā)生能量共振轉(zhuǎn)移)。12. DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的主要特點(diǎn)是什么?該模型的建立有什么生物學(xué)意義?維持DNA分子雙螺旋結(jié)構(gòu)的力是什么?1)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu):

12、有兩條DNA單鏈,反向平行,一段由3端開始,一段由5端開始,螺旋成雙鏈結(jié)構(gòu)。外部是磷酸和脫氧核糖交替構(gòu)成的,內(nèi)部堿基遵循堿基互補(bǔ)配對原則(A-T,C-G),堿基之間是由氫鍵連接,脫氧核苷酸之間由磷酸二脂鍵鏈接。2)雙螺旋模型的意義:雙螺旋模型的意義,不僅意味著探明了DNA分子的結(jié)構(gòu),更重要的是它還提示了DNA的復(fù)制機(jī)制:由于腺膘呤(A)總是與胸腺嘧啶(T)配對、鳥膘呤(G)總是與胞嘧啶(C)配對,這說明兩條鏈的堿基順序是彼此互補(bǔ)的,只要確定了其中一條鏈的堿基順序,另一條鏈的堿基順序也就確定了。因此,只需以其中的一條鏈為模版,即可合成復(fù)制出另一條鏈。3)維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的因素主要是上下

13、層堿基對之間堆砌力和鏈間互補(bǔ)堿基之間的氫鍵.13. 簡述基因工程的定義和基因工程的主要研究內(nèi)容。1)所謂的基因工程是指在體外將核酸分子插入病毒、質(zhì)?;蚱渌d體分子,構(gòu)成遺傳物質(zhì)的新組合,并使之插入到原先沒有這類分子的寄主細(xì)胞內(nèi),而能持續(xù)穩(wěn)定地繁殖。2)1、目的基因的分離 2、DNA的體外重組(載體、受體系統(tǒng)等) 3、重組DNA分子轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞及其篩選 4、基因在受體細(xì)胞內(nèi)的擴(kuò)增、表達(dá)、檢測及其分析。 14. 作為基因工程載體,其應(yīng)具備哪些條件?載體的類型主要有哪些?在基因工程操作中如何選擇載體?具有針對受體細(xì)胞的親緣性或親和性(可轉(zhuǎn)移性);具有合適的篩選標(biāo)記; 具有較高的外源DNA的載裝能力

14、;具有多克隆位點(diǎn)(MCS);具有與特定受體細(xì)胞相適應(yīng)的復(fù)制位點(diǎn)或整合位點(diǎn)。 15. 重組體分子的選擇方法主要有哪些?并簡單闡述其原理。從總體上看,重組體分子的選擇與鑒定方法基本上可以分為如下幾個類型:(1)基于載體遺傳標(biāo)記檢測法在構(gòu)建基因工程載體系統(tǒng)時,載體DNA分子上通常攜帶了一定的選擇性遺傳標(biāo)記基因,轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染宿主細(xì)胞后可以使后者呈現(xiàn)出特殊的表型或遺傳學(xué)特性,據(jù)此可進(jìn)行轉(zhuǎn)化子或重組子的初步篩選。(2)基于克隆DNA序列檢測法Southern印跡雜交:根據(jù)毛細(xì)管作用的原理,使在電泳凝膠中分離的DNA片段轉(zhuǎn)移并結(jié)合在適當(dāng)?shù)臑V膜上,然后通過與已標(biāo)記的單鏈DNA探針的雜交作用以檢測這些被轉(zhuǎn)移的DN

15、A片段。(3)基于外源基因產(chǎn)物檢測法如果目的基因產(chǎn)物能降解某些藥物使菌株呈現(xiàn)出抗性標(biāo)記,或者基因產(chǎn)物與某些藥物作用是顯顏色反應(yīng),則可根據(jù)抗性或顏色直接篩選含目的基因的克隆子。 16. 試述PCR的原理和主要反應(yīng)過程,并分析影響PCR擴(kuò)增的影響因素。PCR原理:變性溫度下, DNA雙鏈變性雙螺旋解開成單鏈DNA,在退火溫度中人工合成的特異引物根據(jù)堿基互補(bǔ)配對原則與單鏈DNA特異結(jié)合,然后在DNA聚合酶的作用下,在延伸溫度下不同的脫氧核苷酸按照堿基互補(bǔ)配對原則在引物的引導(dǎo)下合成與模板DNA互補(bǔ)的新鏈,實(shí)現(xiàn)DNA的擴(kuò)增。影響PCR擴(kuò)增的影響因素: (1)Taq酶:常用1U/25L濃度低,擴(kuò)增產(chǎn)物不夠

16、;濃度高,非特異性擴(kuò)增增加;酶的活性; (2)dNTP的濃度:常用100-200mol/L,不能低于20mol/L,特異性、保真性; (3)模板:主要考慮純度及使用量,對純度要求不高,但含有酚、氯仿等雜質(zhì)則難以成功。使用量從幾個ng到100ng. (4)引物濃度:0.1-0.5mol/L之間,過多則非特異擴(kuò)增增加,形成引物二聚體; (5)Mg2+濃度:常用 0.5-2.5mmol/L;影響:酶的活性、引物-模板退火、特異性 (6)PCR反應(yīng)程序設(shè)定:變性溫度和時間、引物退火溫度Tm與時間、引物延伸溫度與時間和循環(huán)數(shù) 17. 分子雜交的類型主要有哪些?探針的標(biāo)記方法和標(biāo)記類型有哪些?常用的雙鏈DNA的標(biāo)記方法是哪兩種,簡述其標(biāo)記過程? 探針的標(biāo)記方法:切口平移法、隨機(jī)引物合成法,末端標(biāo)記法,PCR標(biāo)記法,體外轉(zhuǎn)錄標(biāo)記法。探針按核酸分子分:DNA探針和RNA探針;按標(biāo)記物的不同:放射性標(biāo)記探針和非放射性標(biāo)記探針。標(biāo)記類型:按核酸分子的不同:可分為DNA探針和RNA探針根據(jù)標(biāo)記物的不同:可分放射性標(biāo)記探針和非放射性標(biāo)記探針;雙鏈DNA探針標(biāo)記主要方法:切口平移法、隨機(jī)引物合成法;

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