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1、雌激素受體(ER)核酸擴(kuò)增檢測(cè)試劑盒說明書(PCR-熒光探針法)【名稱】通 用 名:人雌激素受體基因(ER)核酸擴(kuò)增檢測(cè)試劑盒英 文 名:Human Estrogen Receptor Fluorescence quantitative Polymerase Chain Reaction (PCR)Diagnostic kit 漢語拼音:ren ci ji su shou ti ji yin he suan kuo zeng jian ce shi ji he shuo ming shu【目的】本試劑盒適用于檢測(cè)乳腺癌、前列腺癌等患者組織及全血等樣本中雌激素受體(ER)基因的表達(dá),用于臨床輔助
2、診斷及其病人藥物治療的療效監(jiān)控。其檢測(cè)結(jié)果僅供臨床參考。【原理】本試劑盒選取一對(duì)人雌激素受體(ER)基因特異性引物和一條特異性熒光雜交探針,應(yīng)用Trizol提取RNA,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄酶作用將RNA轉(zhuǎn)錄成cDNA,后者在耐熱DNA聚合酶(Taq酶)作用下,配以FQ-Buffer(內(nèi)含Mg2+、Tris-HCl等)、四種核苷酸單體(dNTPs)等成分,通過PCR-熒光探針體外擴(kuò)增法對(duì)雌激素受體(ER)基因進(jìn)行擴(kuò)增,從而達(dá)到快速準(zhǔn)確實(shí)時(shí)定量檢測(cè)之目的。【組成】名 稱數(shù) 量規(guī) 格RNA提取液B1 管500l/管 逆轉(zhuǎn)錄酶系1 管40l/管 ER-RT MIX2 管140l/管 Taq 酶系1 管80l/管
3、ER-PCR MIX1 管960l/管ER陽性質(zhì)控品1 管50l/管(1107Copies/ml)陰性質(zhì)控品 1 管500l/管DEPC 水1 管2000l/管備注: 10RCLB、RNA 提取液A (500l Trizol reagents)等另行配備?!緲?biāo)本采集、保存和運(yùn)輸】1. 適用標(biāo)本類型:新鮮全血或組織等標(biāo)本。2. 標(biāo)本采集:新鮮全血:用一次性無菌注射器抽取受檢者靜脈血2-5毫升,注入含EDTA(乙二胺四乙酸二鈉)或枸櫞酸鈉抗凝劑的5ml玻璃管,立即輕輕顛倒玻璃管混合510次,使抗凝劑與靜脈血充分混勻。密閉送檢。新鮮組織:無菌條件下取受檢者腫瘤組織1g左右,轉(zhuǎn)至一潔凈的1.5ml的離
4、心管中,密閉送檢。3. 保存和運(yùn)輸:標(biāo)本應(yīng)立即用于測(cè)試,也可保存于-80或液氮待測(cè),標(biāo)本運(yùn)送時(shí)應(yīng)采用0冰壺?!具m用儀器】主要包括ABI GeneAmp PCR System7700、ABI GeneAmp PCR System7500、ABI PRISM 7300、LightCycler等毛細(xì)管的儀器,MJ Opticon系列或取得資格認(rèn)證的定量PCR儀?!举A藏、規(guī)格及有效期】40份/盒。-20避光保存,避免反復(fù)凍融。有效期12個(gè)月?!臼褂梅椒ā?RNA提取 1.1標(biāo)本處理全血:淋巴細(xì)胞分離 (用戶亦可用淋巴細(xì)胞分離液分離淋巴細(xì)胞):將抗凝血搖勻,取500l轉(zhuǎn)至一潔凈的1.5ml 離心管中,編
5、號(hào)標(biāo)記。加入1ml 1RCLB-紅細(xì)胞裂解液(RCLB,試劑盒配備10RCLB,使用前請(qǐng)用雙蒸餾水按1:9比例配制成1RCLB),劇烈震蕩30s,3000g離心5min,棄上清。重復(fù)裂解兩至三次至無明顯紅色沉淀。加入1ml生理鹽水,劇烈震蕩15s,13,000g離心1min,棄上清。沉淀加入500l RNA 提取液A (Trizol reagents),反復(fù)吹打,室溫放置5min。新鮮組織:取新鮮腫瘤組織50mg左右,液氮研磨,加500l RNA 提取液A (500l Trizol reagents),充分混勻,室溫放置5min。1.2. 加入100l氯仿,用力震蕩15s,室溫靜置2min,4
6、 13,000rpm離心5min。1.3. 小心將上層水相轉(zhuǎn)移到干凈離心管中,加300l無水乙醇,然后加10l RNA 提取液B(使用前請(qǐng)室溫溶解并充分混勻),充分混勻,13,000rpm離心1min。1.4. 棄上清,加入500 l 75%的DEPC乙醇,充分混勻,13,000rpm離心1min,小心吸去大部分乙醇。1.5. 將提取管敞口在室溫空氣中干燥5min待乙醇揮發(fā)干凈,用20l DEPC H2O溶解沉淀。陰性質(zhì)控品:取100l陰性質(zhì)控品加入500 l RNA提取液A(Trizol reagents)充分震蕩,室溫放置5min。后按1.21.5操作。ER陽性質(zhì)控品:直接取4l進(jìn)行PCR
7、擴(kuò)增。或按照PCR擴(kuò)增介紹方法進(jìn)行定量分析。2. 逆轉(zhuǎn)錄 根據(jù)標(biāo)本數(shù)量取DEPC水處理的200l PCR反應(yīng)管,取出ERRT MIX、逆轉(zhuǎn)錄酶系,室溫融化并振蕩混勻后,10,000rpm離心10s。向反應(yīng)管中加1l逆轉(zhuǎn)錄酶系,7l ER-RT-MIX,充分混勻后短暫離心,4230分鐘,后98 5min滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。即得到cDNA。3PCR擴(kuò)增從試劑盒中取出ER PCR MIX、Taq酶系,室溫融化并振蕩混勻后,10,000rpm離心10s。設(shè)所需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對(duì)照+4管陽性對(duì)照),每個(gè)測(cè)試反應(yīng)體系配制如下表:試劑ER PCR MIXTaq酶系用量24l2l計(jì)算好
8、各試劑的使用量,加入一適當(dāng)體積潔凈離心管中,充分混勻,10,000rpm離心10s,向設(shè)定的N個(gè)PCR反應(yīng)管中分別加入26l,向每管中加入處理后樣品(所獲得的cDNA樣品)或ER陽性質(zhì)控品(使用前用陰性質(zhì)控品梯度稀釋10倍、100倍、1000倍,記為110P6PCopies/ml,110P5PCopies/ml,110P4PCopies/ml)和陰性質(zhì)控品4l,10,000rpm瞬時(shí)離心30秒。將各反應(yīng)管放入定量PCR儀器的反應(yīng)槽內(nèi),按對(duì)應(yīng)順序設(shè)置陰性控品,陽性定量標(biāo)準(zhǔn)品以及未知標(biāo)本,并設(shè)置反應(yīng)體積(30l)、樣品名稱、標(biāo)記熒光基團(tuán)種類(報(bào)告基團(tuán)為FAM,淬滅基團(tuán)為TAMRA)和循環(huán)條件:AB
9、I PRISM 7700,ABI PRISM5700,ABI GeneAmp 7000 (需要剪掉反應(yīng)蓋),ABI PRISM7300/7500(使用8聯(lián)管),MJ Opticon(使用8聯(lián)管)等使用薄壁管的儀器,循環(huán)條件:942分鐘,后93 30秒55 45秒, 40個(gè)循環(huán)。LightCycler等使用毛細(xì)管的儀器,循環(huán)條件:942分鐘,后93 5秒56 45秒,共40個(gè)循環(huán)。3結(jié)果分析判定反應(yīng)結(jié)束后保存檢測(cè)數(shù)據(jù)文件。根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)baseline的start值(38),stop值(1318)以及Threshold值,使Std curve 窗口下的標(biāo)準(zhǔn)曲線達(dá)到最佳(correlation
10、數(shù)值介于-0.97-1之間,correlation數(shù)值等同于r值),最后到Reporter窗口下記錄儀器自動(dòng)分析計(jì)算出的未知標(biāo)本數(shù)值(Qty-Copies/ml)?!举|(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)】陰性質(zhì)控品:全部陰性。沒有熒光值增長(zhǎng)。ER陽性質(zhì)控品:陽性質(zhì)控品的 Ct 值均應(yīng)小于 35.0。r0.97(correlation數(shù)值介于-0.97-1之間,correlation數(shù)值等同于r值)。 以上條件應(yīng)同時(shí)滿足 ,否則,此次試驗(yàn)視為無效,全部試驗(yàn)應(yīng)重新進(jìn)行?!窘Y(jié)果判定】測(cè)定結(jié)果的計(jì)算:如果Ct值38,則實(shí)驗(yàn)樣品的ER含量(基因拷貝數(shù)/ml)= Qty-Copies/ml。如果38Ct值40,為灰區(qū)建議重新檢測(cè),重新檢測(cè)若38Ct值40判為陽性,否則為陰性。如果Ct值=40,則ER含量(基因拷貝數(shù)/ml)110P2PCopies/ml (低于檢測(cè)下限)?!咀⒁馐马?xiàng)】 使用前請(qǐng)仔細(xì)閱讀說明書。并且嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行操作。試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)充分融化混勻并經(jīng)高速短暫離心后試用。試劑盒須避光保存,以免熒光物質(zhì)衰減。所有使用的離心管、 Tip 頭應(yīng)DEPC水處理并高壓滅菌,而且必須不含RNase。樣本提取、試劑配置、加樣需在不同區(qū)的超凈工作臺(tái)進(jìn)行,以免污染。試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對(duì)待,并按照衛(wèi)生部微生物生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通則進(jìn)行處理?!旧a(chǎn)企業(yè)】公司名稱:北京索奧生物醫(yī)藥
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