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文檔簡介
1、1 SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)分子量聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)分子量 2 SDS-聚丙稀酰胺凝膠電泳技術是動物生物化學實驗技術教學中一個重聚丙稀酰胺凝膠電泳技術是動物生物化學實驗技術教學中一個重要實驗之一。要實驗之一。3 能夠帶動生化實驗技術綜合型實驗項目的開設。能夠帶動生化實驗技術綜合型實驗項目的開設。 如:蛋白質(zhì)鹽析沉淀提取如:蛋白質(zhì)鹽析沉淀提取 葡聚糖凝膠層析分離葡聚糖凝膠層析分離 DEAE-纖維素分離纖維素分離提純蛋白質(zhì)提純蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)純度鑒定、蛋白質(zhì)分子量測定等。蛋白質(zhì)純度鑒定、蛋白質(zhì)分子量測定等。4一、實驗目的一、實驗目的n通過該實驗使學生掌握通過該實驗使學生
2、掌握SDS-PAGESDS-PAGE測定蛋白質(zhì)分子量的原理;測定蛋白質(zhì)分子量的原理;n掌握該技術的操作方法(基礎性很強,使用范圍寬闊;掌握該技術的操作方法(基礎性很強,使用范圍寬闊;n運用運用SDS-PAGESDS-PAGE測定蛋白質(zhì)分子量及染色鑒定。測定蛋白質(zhì)分子量及染色鑒定。5二、實驗原理二、實驗原理 n帶電質(zhì)點在電場中向帶有異相電荷的電極移動,這種現(xiàn)象稱為電泳帶電質(zhì)點在電場中向帶有異相電荷的電極移動,這種現(xiàn)象稱為電泳。n電泳分類:移動界面電泳、區(qū)帶電泳等。電泳分類:移動界面電泳、區(qū)帶電泳等。n區(qū)帶電泳區(qū)帶電泳 是在半固相或膠狀介質(zhì)上加一個點或一薄層樣品溶液,然后加電場,是在半固相或膠狀介
3、質(zhì)上加一個點或一薄層樣品溶液,然后加電場,分子在支持介質(zhì)上或支持介質(zhì)中遷移。分子在支持介質(zhì)上或支持介質(zhì)中遷移。 6 區(qū)帶電泳使用不同的支持介質(zhì),有濾紙、纖維素粉、聚氯乙烯樹脂、淀區(qū)帶電泳使用不同的支持介質(zhì),有濾紙、纖維素粉、聚氯乙烯樹脂、淀粉凝膠、瓊脂凝膠、醋酸纖維素膜,現(xiàn)在則多用聚丙烯酰胺(粉凝膠、瓊脂凝膠、醋酸纖維素膜,現(xiàn)在則多用聚丙烯酰胺(PAGEPAGE)和瓊)和瓊脂糖凝膠。脂糖凝膠。7 (一)分類(一)分類 PAGEPAGE根據(jù)其有無濃縮效應,分為連續(xù)系統(tǒng)和不連續(xù)系統(tǒng)兩大類:根據(jù)其有無濃縮效應,分為連續(xù)系統(tǒng)和不連續(xù)系統(tǒng)兩大類: 1. 1. 連續(xù)系統(tǒng):電泳體系中緩沖液連續(xù)系統(tǒng):電泳體系
4、中緩沖液pHpH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場作用下,主要靠電荷和分子篩效應。場作用下,主要靠電荷和分子篩效應。 8 2. 2.不連續(xù)系統(tǒng):由于緩沖液離子成分、不連續(xù)系統(tǒng):由于緩沖液離子成分、pHpH、凝膠濃度及電位梯度的不、凝膠濃度及電位梯度的不連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動不僅有電荷效應,分子篩效應,還具有連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動不僅有電荷效應,分子篩效應,還具有濃縮效應,因而其分離條帶清晰度及分辨率均較前者佳。濃縮效應,因而其分離條帶清晰度及分辨率均較前者佳。9 (二)特點:(二)特點: SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,是在聚丙烯酰胺凝膠電泳,是在聚
5、丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進SDSSDS(十二(十二烷基磺酸鈉)。烷基磺酸鈉)。 10 蛋白質(zhì)在一定濃度的含有強還原劑的蛋白質(zhì)在一定濃度的含有強還原劑的SDSSDS溶液中,與溶液中,與SDSSDS分子按比例分子按比例結合,形成帶負電荷的結合,形成帶負電荷的SDS-SDS-蛋白質(zhì)復合物。蛋白質(zhì)復合物。 蛋白質(zhì)喪失了原有的電荷狀態(tài)形成僅保持原有分子大小為特征的負蛋白質(zhì)喪失了原有的電荷狀態(tài)形成僅保持原有分子大小為特征的負離子團塊,降低或消除了各種蛋白質(zhì)分子之間天然的電荷差異,因此在離子團塊,降低或消除了各種蛋白質(zhì)分子之間天然的電荷差異,因此在進行電泳時,進行電泳時,11蛋白質(zhì)分蛋白
6、質(zhì)分子移速度取決于分子大小。當分子量在子移速度取決于分子大小。當分子量在15000KD15000KD到到200000KD200000KD之之間時,蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關系。合下式:間時,蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關系。合下式: ,式中,式中 將已知分子量的標準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標將已知分子量的標準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標準曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標準曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標準曲線上求得分子量。準曲線上求得分子量。12圖1 標準蛋白質(zhì)與待測樣品電泳圖譜
7、圖2 電泳遷移率與logMW之間的關系 94 00062 00043 00031 00020 10014 400膠槽膠槽123注:膠槽1 標準蛋白;膠槽2、3 樣品蛋白得到同行專家贊13 采用采用SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法測蛋白質(zhì)分子量時,必須完全聚丙烯酰胺凝膠電泳法測蛋白質(zhì)分子量時,必須完全打開蛋白質(zhì)之間的二硫鍵,使蛋白質(zhì)分子被解聚,打開蛋白質(zhì)之間的二硫鍵,使蛋白質(zhì)分子被解聚,SDSSDS才能定量地才能定量地結合到亞基上。因此在用結合到亞基上。因此在用SDSSDS處理樣品同時用巰基乙醇處理。巰基處理樣品同時用巰基乙醇處理。巰基乙醇是一種強還原劑,它使被還原的二硫鍵不易再氧化,從而使
8、很乙醇是一種強還原劑,它使被還原的二硫鍵不易再氧化,從而使很多不溶性蛋白質(zhì)溶解而與多不溶性蛋白質(zhì)溶解而與SDSSDS定量結合。定量結合。14 三、三、 實驗試劑和器材實驗試劑和器材 材料材料 實驗試劑實驗試劑 1.低分子量標準蛋白試劑盒: 兔磷酸化酶兔磷酸化酶B MW=97,400 牛血清白蛋白牛血清白蛋白 MW=66,200 兔肌動蛋白兔肌動蛋白 MW=43,000 牛碳酸酐酶牛碳酸酐酶 MW=31,000 胰蛋白酶抑制劑胰蛋白酶抑制劑 MW=20,100 雞蛋清溶菌酶雞蛋清溶菌酶 MW=14,400 開封后溶于開封后溶于200l蒸餾水,置蒸餾水,置-20保存,使用前室溫融化,沸水浴中加保存
9、,使用前室溫融化,沸水浴中加熱熱3-5分鐘后上樣。分鐘后上樣。 樣品樣品1:稱:稱3mg樣品樣品1,加,加2 ml蒸餾水溶解。蒸餾水溶解。15 2. 30%丙烯酰胺(丙烯酰胺(Acr):稱):稱Acr30g,甲叉雙丙烯酰胺,甲叉雙丙烯酰胺 (Bis)0.8g,加蒸餾水至,加蒸餾水至100ml,過濾后置棕色瓶中,過濾后置棕色瓶中 3. 10%SDS(十二烷基磺酸鈉)(十二烷基磺酸鈉) 4. 1.5mol/L pH8.8 Tris-HCl緩沖液:稱取緩沖液:稱取Tris18.2g(PH計)計)16 (7)10%過硫酸銨過硫酸銨(AP) (8)TEMED(四甲基乙二胺)(四甲基乙二胺) (9)樣品溶
10、解液:)樣品溶解液:SDS(100mg)+巰基乙醇(巰基乙醇(0.1ml)+ 溴酚藍(溴酚藍(2mg)+甘油(甘油(2g) +0.05mol/L pH8.0Tris- HCl(2ml),最后定容至),最后定容至10ml。 (10)固定液:?。┕潭ㄒ海喝?0%甲醇甲醇454ml,冰乙酸,冰乙酸46ml混勻?;靹?。 (11)染色液:稱取考馬斯亮藍)染色液:稱取考馬斯亮藍R250 0.125g,加上述固定液,加上述固定液 250ml, 過濾后備用。過濾后備用。 (12)脫色液:冰乙酸)脫色液:冰乙酸75ml,甲醇,甲醇50ml,加蒸餾水定容至,加蒸餾水定容至1000ml。 (13)電極緩沖液(內(nèi)含)
11、電極緩沖液(內(nèi)含0.1%SDS,0.05mol/LTris- 0.384mol/L甘氨酸緩甘氨酸緩沖液沖液pH8.3):稱):稱Tris6.0g,甘,甘 氨酸氨酸28.8g,加入,加入SDS1g,加蒸餾水使其溶解后,加蒸餾水使其溶解后定容至定容至1000ml。 17實驗器材實驗器材n 垂直板電泳裝置垂直板電泳裝置n直流穩(wěn)壓電源電泳厚膠濃度后要做直流穩(wěn)壓電源電泳厚膠濃度后要做8各小時,薄膠各小時,薄膠5各小時)各小時)n 電泳儀電泳儀n 標準型酸度計(標準型酸度計(TLD80-2B)n 離心機等離心機等18 四、實驗過程四、實驗過程 如:如:免疫球蛋白免疫球蛋白G G 分子量的測定分子量的測定
12、(一)血清(一)血清- -球蛋白的提取球蛋白的提取 硫酸胺鹽析沉淀法硫酸胺鹽析沉淀法 (二)(二) - -球蛋白脫鹽純化球蛋白脫鹽純化 葡聚糖凝膠過濾(柱層析法)除去硫酸胺,得到葡聚糖凝膠過濾(柱層析法)除去硫酸胺,得到- -球蛋白(去年完成球蛋白(去年完成的基金項目)的基金項目) (三)純化免疫球蛋白(三)純化免疫球蛋白G G DEAE-DEAE-離子交換纖維素法純化免疫球蛋白離子交換纖維素法純化免疫球蛋白G G。 (四)(四) SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法測定血液免疫球蛋白聚丙烯酰胺凝膠電泳法測定血液免疫球蛋白G G的分子量的分子量( 連續(xù)四個單項實驗)。 19 (1 1)制膠(簡
13、單敘述)(雙層膠,摸索膠濃度)制膠(簡單敘述)(雙層膠,摸索膠濃度) A.A.將玻璃板用蒸餾水洗凈晾干將玻璃板用蒸餾水洗凈晾干, , 準備準備2 2個干凈的錐形瓶。把玻璃板在灌個干凈的錐形瓶。把玻璃板在灌膠支架上固定好。膠支架上固定好。 B.B.按比例配好分離膠,溶液立即傾入制膠模板中按比例配好分離膠,溶液立即傾入制膠模板中(1 5(1 5模板模板) ),加少,加少許蒸餾水,待膠凝固后,倒出水并用濾紙把剩余的水分吸干,按比例配好濃許蒸餾水,待膠凝固后,倒出水并用濾紙把剩余的水分吸干,按比例配好濃縮膠,連續(xù)平穩(wěn)加入濃縮膠至離邊緣縮膠,連續(xù)平穩(wěn)加入濃縮膠至離邊緣5mm5mm處,樣梳需一次平穩(wěn)插入,
14、靜置處,樣梳需一次平穩(wěn)插入,靜置4040分鐘,待模板中的膠定型后,輕輕取出梳形樣品槽模具,梳口處不得有氣泡,分鐘,待模板中的膠定型后,輕輕取出梳形樣品槽模具,梳口處不得有氣泡,拔出樣梳后,在上槽內(nèi)加入緩沖液。拔出樣梳后,在上槽內(nèi)加入緩沖液。 20 C. C.拔出樣梳后拔出樣梳后, ,在上槽內(nèi)加入緩沖液在上槽內(nèi)加入緩沖液, , D. D.加樣(摸索加樣量)加樣(摸索加樣量) 取取10l標準蛋白溶解液于標準蛋白溶解液于EP管內(nèi),再加入管內(nèi),再加入10l 2倍樣品倍樣品緩沖液,上樣量為緩沖液,上樣量為20l。 取取10l樣品溶液,再加入樣品溶液,再加入10l 2倍樣品緩沖液,上樣量分別為倍樣品緩沖液
15、,上樣量分別為5l 和和10l。 E.E.用微量注射器距槽底三分之一處進樣用微量注射器距槽底三分之一處進樣, ,加樣前加樣前, ,樣品在沸水中加熱樣品在沸水中加熱3 3分鐘,去掉分鐘,去掉亞穩(wěn)態(tài)聚合。亞穩(wěn)態(tài)聚合。21 F. F.電泳槽中加入緩沖液,接通電源,進行電泳,開始電流恒定在電泳槽中加入緩沖液,接通電源,進行電泳,開始電流恒定在8mA,(電,(電流、電壓)當進入分離膠后改為流、電壓)當進入分離膠后改為16mA,溴酚藍距凝膠邊緣約,溴酚藍距凝膠邊緣約5mm時,停止電泳。時,停止電泳。 G.G.凝膠板剝離與染色凝膠板剝離與染色 電泳結束后,撬開玻璃板,將凝膠板做好標記后放在電泳結束后,撬開玻
16、璃板,將凝膠板做好標記后放在大培養(yǎng)皿內(nèi),加入染色液,染色大培養(yǎng)皿內(nèi),加入染色液,染色 過夜。過夜。 H.H.脫色脫色 染色后的凝膠板用蒸餾水漂洗數(shù)次,再用脫色液脫色染色后的凝膠板用蒸餾水漂洗數(shù)次,再用脫色液脫色 。剝膠時要小心剝膠時要小心, ,保持膠完好無損保持膠完好無損, ,染色要充分染色要充分。22圖1 標準蛋白質(zhì)與待測樣品電泳圖譜 圖2 電泳遷移率與logMW之間的關系 五、實驗結果分析五、實驗結果分析94 00062 00043 00031 00020 10014 400膠槽膠槽123注:膠槽1 標準蛋白;膠槽2、3 樣品蛋白23六、分析計算六、分析計算繪制標準曲線:繪制標準曲線:按下
17、式計算 電泳遷移率電泳遷移率 = 樣品遷移距離樣品遷移距離/溴酚籃遷移距離溴酚籃遷移距離 以每個蛋白標準的分子量對數(shù)對它的相對遷移率作圖得標準曲線,量出未以每個蛋白標準的分子量對數(shù)對它的相對遷移率作圖得標準曲線,量出未知蛋白的遷移率即可測出其分于量,這樣的標難曲線只對同一塊凝膠上的樣品知蛋白的遷移率即可測出其分于量,這樣的標難曲線只對同一塊凝膠上的樣品的分子量測定才具有可靠性。的分子量測定才具有可靠性。24 標準蛋白分子量(標準試劑盒):標準蛋白分子量(標準試劑盒): 97400kD、66200kD、43000kD、 31000kD、20100kD、14400kD。 采用不連續(xù)采用不連續(xù)SDS
18、-PAGE電泳法對所分離純化的蛋白質(zhì)進行純度鑒定,電泳法對所分離純化的蛋白質(zhì)進行純度鑒定,發(fā)現(xiàn)圖中電泳圖譜可以清晰的看到兩條蛋白帶。發(fā)現(xiàn)圖中電泳圖譜可以清晰的看到兩條蛋白帶。25 兩條蛋白帶代表綿羊免疫球蛋白兩條蛋白帶代表綿羊免疫球蛋白G的重鏈和輕鏈。的重鏈和輕鏈。 計算分析結果表明:計算分析結果表明: 綿羊血清綿羊血清lgG重鏈和輕鏈的分子量分別為重鏈和輕鏈的分子量分別為50000和和28000Kd。一般說來,。一般說來,當?shù)鞍踪|(zhì)的分子量在當?shù)鞍踪|(zhì)的分子量在200000至至15000 kD 之間時,電泳遷移率與分子量的之間時,電泳遷移率與分子量的對數(shù)呈線性關系對數(shù)呈線性關系 。實驗結果各譜帶
19、所代表的成分的分子量的范圍均在此之。實驗結果各譜帶所代表的成分的分子量的范圍均在此之間。用間。用SDS-PAGE垂直板電泳測得綿羊血清具有一定的可信度垂直板電泳測得綿羊血清具有一定的可信度 。 26 七、思考題七、思考題n在不連續(xù)體系在不連續(xù)體系SDS-PAGESDS-PAGE中中, ,當分離膠加完后當分離膠加完后, ,需在其上加一層水需在其上加一層水, ,為什么為什么? ?n在不連續(xù)體系在不連續(xù)體系SDS-PAGESDS-PAGE中中, ,分離膠與濃縮膠中均含有分離膠與濃縮膠中均含有TEMEDTEMED和和AP,AP,試述其試述其作用作用? ?n樣品液為何在加樣前需在沸水中加熱幾分鐘樣品液為何在加樣前需在沸水中加熱幾分鐘? ?27 十二、達到預期目標十二、達到預期目標 1. SDS-聚丙稀酰胺凝膠電泳技術是動物生物化學實驗技術教學中一個聚丙稀酰胺凝膠電泳技術是動物生物化學實驗技術教學中一個綜合性實驗項目,綜合性實驗項目, 且是一個較高水平的一個實驗項目。且是一個較高水平的一個實驗項目。 28 蛋白質(zhì)鹽析沉淀提取蛋白質(zhì)鹽析沉淀提取 凝膠層析分離(上年基金項目已完成)凝
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