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1、利用primer5計(jì)算生物群落指數(shù)1.利用primer軟件首先要將數(shù)據(jù)做成primer格式，我們主要在標(biāo)準(zhǔn)報(bào)表基礎(chǔ)上利用excel透視表功能來(lái)實(shí)現(xiàn)，步驟如下：打開(kāi)標(biāo)準(zhǔn)報(bào)表(以底棲動(dòng)物為例)，選擇圖1中藍(lán)色部分。選擇excel插入、數(shù)據(jù)透視表、數(shù)據(jù)透視表。2.出現(xiàn)透視表對(duì)話框，選新建工作表，確定。3.將監(jiān)測(cè)站位、生物種中文名、密度分別拖入列標(biāo)簽、行標(biāo)簽和數(shù)值欄中，單擊數(shù)值欄里的密度，選值字段設(shè)置，選擇求和，點(diǎn)確定。4.將空白、總計(jì)等行列刪除，空格替換為數(shù)字0，首行空一行，即完成數(shù)據(jù)的primer格式。（數(shù)據(jù)存為excel97-03版，高級(jí)版本不識(shí)別）。5打開(kāi)primer5，選擇打開(kāi)。6.選擇保存

2、好的primer excel表。7.選擇工作表序號(hào)。Ok.8.點(diǎn)cancel.9.點(diǎn)左上角方框，選中數(shù)據(jù)。10.選擇analyse/diverse.11.在other中選擇種類數(shù)S、數(shù)量N、豐富度指數(shù)D、均勻度指數(shù)J。12.在Shannon多樣性指數(shù)中選擇以2為底，結(jié)果輸出到工作表。OK。13.群落結(jié)構(gòu)的主要指數(shù)便可得到。14.關(guān)于群落優(yōu)勢(shì)種的計(jì)算采用公式Y(jié)=（ni/N）*fi。ni為第i個(gè)種的總個(gè)體數(shù)，N為所有物種的總個(gè)體數(shù)，fi為第i物種出現(xiàn)的頻率。計(jì)算結(jié)果中Y>0.02的為優(yōu)勢(shì)種。目前對(duì)于群落結(jié)構(gòu)的好壞沒(méi)有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)，在描述其群落結(jié)構(gòu)時(shí)盡量避免“差”、“較差”等字眼?？梢詤⒖肌叭郝浣Y(jié)構(gòu)穩(wěn)定”、“群落結(jié)構(gòu)較為穩(wěn)定”、“群落結(jié)構(gòu)基本穩(wěn)定” 、“群落

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