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文檔簡介

1、核酸序列的獲取與比對核酸序列的獲取與比對尹富強尹富強生命科學研究院生命科學研究院1 1 從數(shù)據(jù)庫獲取核酸序列信息從數(shù)據(jù)庫獲取核酸序列信息2 2 序列搜索比對序列搜索比對3 3 多序列比對多序列比對31 1 從數(shù)據(jù)庫獲取從數(shù)據(jù)庫獲取基因基因mRNAmRNA序列信息序列信息4以以NCBINCBI數(shù)據(jù)庫為例數(shù)據(jù)庫為例 學習如何獲取核酸序列及序列相關信息學習如何獲取核酸序列及序列相關信息 genbank/NCBI GenBank 5HomePage6HomePage7CCL218Results910111213CCL21 mRNA CCL21 mRNA 序列序列CCL21 mRNA登錄號登錄號CCL2

2、1 編碼蛋白編碼蛋白CCL21登錄號登錄號14基基因因序序列列信信息息基基因因相相關關信信息息15.16成功提取成功提取CCL21 mRNACCL21 mRNA全長序列全長序列提取提取完成完成17.18編碼序列編碼序列19成功提取成功提取CCL21 mRNACCL21 mRNA編碼序列編碼序列提取提取完成完成20Advanced Search21222324252 2 序列搜索比對序列搜索比對26NCBI主站點：主站點： BLAST/ 對一般用戶來說，目前常用的辦法是通過對一般用戶來說，目前常用的辦法是通過NCBI國際著名生物信息中心國際著名生物信息中心的的BLAST服務器進行搜索。服務器進行

3、搜索。序列比對神器序列比對神器-BLAST27HomePage2829GATGGGATTGGGGTTTTCCCCTCCCATGTGCTCAAGACTGGCGCTAAAAGTTTTGAGCTTCTCAAAAGTC TAGAGCCACCGTCCAGGGAGCAGGTAGCTGCTGGGCTCCGGGGACACTTTGCGTTCGGGCTGGGAGCGTG30313 3 多序列比對多序列比對32多重序列比對網(wǎng)站及常用軟件多重序列比對網(wǎng)站及常用軟件Multiple Sequence Alignment （MSA） （ ）KEGG GENES Database （ ）DNAManDNAStar3334FASTA, GCG, EMBL, PIR, NBRF,UniProtKB/Swiss-Pro

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