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1、作物育種技術(shù)質(zhì)量性狀的基因定位教 學(xué) 目 標(biāo)種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)一、基因定位的原理無(wú)論是遺傳標(biāo)記還是基因,都在染色體上占有它們的座位,而這些座位都是DNA的一個(gè)片段,因此從座位上看,它們并沒有什么區(qū)別。通過遺傳圖譜的構(gòu)建,很多分子標(biāo)記在染色體上的位置已經(jīng)確定,因此只要確定基因與分子標(biāo)記之間的連鎖關(guān)系,就可以確定基因在染色體上的位置。種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)一、基因定位的原理分子標(biāo)記是通過它們產(chǎn)生的帶型來識(shí)別的,而基因是通過它們產(chǎn)生的表現(xiàn)型來識(shí)別的。因此,基因定位既要分析分子標(biāo)記的帶型,又要分析基因型產(chǎn)生的表現(xiàn)型?;蚨ㄎ坏幕驹硎峭ㄟ^分析分子標(biāo)記與表現(xiàn)型之間的連鎖關(guān)系,確定基因在

2、遺傳圖譜中的位置。種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)二、質(zhì)量性狀基因定位的方法尋找與質(zhì)量性狀緊密連鎖的DNA標(biāo)記主要有兩個(gè)目的:n 在育種中對(duì)質(zhì)量性狀進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選擇n 對(duì)質(zhì)量性狀基因進(jìn)行圖位克隆主要分析方法:n 近等基因系(NIL)分析法n 群體分離分析法(BSA)種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)二、質(zhì)量性狀基因定位的方法(一)近等基因系(NIL)分析法通常采用連續(xù)回交的方法進(jìn)行。在每一分離世代對(duì)目的基因加以選擇,經(jīng)過回交7-8代以上,才能選育成近等基因系。近等基因系除目的性狀外,其它性狀應(yīng)與輪回親本相似。 PF1BC1F1BCnFnNIL種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)(一)近等基因系(NIL)分析

3、法1. 原理如果一對(duì)近等基因系在目標(biāo)性狀上表現(xiàn)差異,那么凡是能在這對(duì)近等基因系之間揭示多態(tài)性的分子標(biāo)記就可能位于目標(biāo)基因的附近。因此利用NIL材料,可以尋找與目標(biāo)基因緊密連鎖的分子標(biāo)記。種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)(一)近等基因系(NIL)分析法2.基本步驟篩選與目標(biāo)基因連鎖的分子標(biāo)記進(jìn)行標(biāo)記與目的基因連鎖的驗(yàn)證基因定位種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)二、質(zhì)量性狀基因定位的方法(二)群體分離分析法(BSA)BSA法是從近等基因系分析法演化而來的,它克服了許多作物沒有或難以創(chuàng)建相應(yīng)的NIL的限制,對(duì)于尚無(wú)連鎖圖或連鎖圖飽和程度較底的植物,利用BSA法也是快速獲得與目標(biāo)基因連鎖的分子標(biāo)記的有效方法。種

4、子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)(二)群體分離分析法(BSA)1. 原理 在作圖群體中(F2、BC、DH等),依據(jù)目標(biāo)性狀表型的相對(duì)差異(如抗病與感病、可育與不育等),將個(gè)體或株系分成兩組,分別將兩組中的個(gè)體或株系的DNA等量混合,形成相對(duì)的DNA池(DNA pool)。這兩個(gè)DNA池之間除了在目標(biāo)基因座所在染色體區(qū)域的DNA組成上存在差異外,來自基因組其它部分的DNA組成應(yīng)該是完全相同或基本相同的,即兩DNA池間差異相當(dāng)于兩近等基因系基因組之間的差異,或者說構(gòu)成了一對(duì)近等基因DNA池。因此在這兩個(gè)DNA池之間表現(xiàn)出多態(tài)性的DNA標(biāo)記,就有可能與目標(biāo)基因連鎖。種子生產(chǎn)與經(jīng)營(yíng)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)(二)群體分離分析法(BSA)2.基本步驟(1)根據(jù)目標(biāo)性狀表型或基因型的相對(duì)差異構(gòu)建兩個(gè)近等DNA池或代表群,尋找在兩者之間表現(xiàn)多態(tài)性的標(biāo)記。 (2)利用分離群體驗(yàn)證候選標(biāo)記是否與目標(biāo)

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