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1、鼠T細(xì)胞抗原識(shí)別受體v5.2核酸序列分析軟件功能BLAST是基礎(chǔ)局域聯(lián)培搜索工具（basic local alignment search tool）的縮寫，是目前最常用的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)程序。在運(yùn)行時(shí)，根據(jù)分析的數(shù)據(jù)類型和要求搜素?cái)?shù)據(jù)庫(kù)類型。以及是否把核酸序列翻譯成蛋白質(zhì)，選用不同的BLAST程序程序名稱查詢序列搜素的數(shù)據(jù)庫(kù)BLASTN核酸核酸BLASTP蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)BLASTX核酸的6個(gè)讀框蛋白質(zhì)TBLASTN蛋白質(zhì)核酸的6個(gè)讀框TBLASTX核酸的6個(gè)讀框核酸的6個(gè)讀框比對(duì)返回的結(jié)果，與查詢序列的相似程度用期待值E值表示。只有搜素時(shí)找到的期待值比E值小的序列才作為結(jié)果返回。操作過程Tcrb-v

2、5.2的獲得：進(jìn)入NCBI首頁(yè)（）選擇Protein,輸入T-cell receptor beta, variable 5.2search點(diǎn)擊進(jìn)入即出現(xiàn)所需序列Tcrb-5.2核酸序列ORIGIN 1 msntvladsa wgitllswvt vfllgtssad sgvvqsprhi ikekggrsvl tcipisghsn 61 vvwyqqtlgk elkfliqhye kverdkgflp srfsvqqfdd yhsemnmsal eledsamyfc 121 assl/Tcrb-v5.2核酸序列的比對(duì)分析：1 進(jìn)入NCBI/BLAST頁(yè)面（/）點(diǎn)擊進(jìn)入2 選擇protien blast進(jìn)入3 輸入核酸序列，選擇nr，物種輸入mouse點(diǎn)擊搜索4 搜索結(jié)果結(jié)果分析 對(duì)比得到的分值，分值 比值越小， 越大，表示匹配程度越高 匹配程度越高 BLAST與FASTA比較 BLAST和FASTA都有多種工作方式，主要區(qū)別在于搜索數(shù)據(jù)庫(kù)種類不同。 一般認(rèn)為，BLAST運(yùn)行的速度較快，對(duì)蛋白序列的比較更有效；而FASTA運(yùn)行速度比較慢但對(duì)核酸更敏感。 BLAST需要根據(jù)分析數(shù)據(jù)類型和要求搜索數(shù)據(jù)庫(kù)類型等選擇不同的BLAST程序，F(xiàn)ASTA服務(wù)器可自動(dòng)根據(jù)提交的序列的字母類型判斷是蛋白

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