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1、南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院試卷2008-2009學(xué)年第二學(xué)期課程名稱生物化學(xué)(A卷(閉卷教師姓名楊榮武學(xué)號(hào)姓名專業(yè)年級(jí)考試日期6月24日成績(jī)No notes or books of any sort may be used during the exam. All the cell phones must be powered off!I swear that I have neither given nor received aid on this exam.(Signature一、是非題(每題1分,共10題,請(qǐng)用"+"和"-"分別表示"對(duì)&quo
2、t;和"錯(cuò)"1. 如果一種突變導(dǎo)致Hb不能形成四級(jí)結(jié)構(gòu),那么這種Hb的突變體的氧合曲線一定是雙曲線。+2. 過(guò)渡態(tài)是酶在催化過(guò)程中形成的一種特殊的中間物。-3. 沒(méi)有一個(gè)酶的活性中心完全由疏水氨基酸殘基組成的。+4. 在DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)中沒(méi)有AG堿基對(duì),這是因?yàn)樗鼈冎g沒(méi)有合適的氫鍵供體和受體。-5. Hb既可以結(jié)合O2,還可以結(jié)合CO2和CO,但結(jié)合的位點(diǎn)都不一樣。+6. 富含GC的DNA雙螺旋比富含AT的雙螺旋穩(wěn)定的主要原因是GC堿基對(duì)比AT堿基對(duì)多一個(gè)氫鍵。-7. 細(xì)胞中的酶絕大多數(shù)是別構(gòu)酶。-8. 某氨基酸溶于pH 7的水中,所得氨基酸溶液的pH為6,那么此氨基酸的
3、pI肯定是大于6。-9. 假定一種別構(gòu)酶具有正協(xié)同效應(yīng),那么此酶負(fù)別構(gòu)效應(yīng)物的存在將增強(qiáng)它的正協(xié)同效應(yīng)。+10. 所有的單糖都具有還原性,而所有的多糖都沒(méi)有還原性。+二、選擇題(每題1.5分,共20題,:1. 最不容易出現(xiàn)在蛋白質(zhì)內(nèi)部的一對(duì)氨基酸殘基是:AA. Arg: Lys 同為親水,電性相同B. Ser: Thr 氫鍵C: Arg: Asp 電性相反D: Leu:Val 疏水E: Pro: Gly 疏水2. 以下物質(zhì)不具有pI的是:EA. 氨基酸B. 小肽C. 核苷酸D. 蛋白質(zhì)E. 脂肪3. 決定葡萄糖是D型還是L型立體異構(gòu)體的碳原子是:DA. C2B. C3C. C4D. C5E.
4、C64. Hsp70具有的酶活性是:CA. 激酶B. 蛋白酶C. ATP酶D. 異構(gòu)酶E. 沒(méi)有酶活性5. 絲氨酸蛋白酶的過(guò)渡態(tài)的穩(wěn)定受“氧負(fù)離子空穴”促進(jìn)。這里的“氧負(fù)離子空穴”主要的組成是:EA.一個(gè)鋅離子B. 一個(gè)His殘基C. 一個(gè)Lys殘基D. 一個(gè)疏水口袋E. 酶活性中心兩個(gè)氨基酸殘基的在肽鏈骨架上的酰胺基6. 以下能夠作為鈣離子結(jié)合的模體是:AA. 螺旋-環(huán)-螺旋B. Rossman折疊C. 希臘鑰匙D. 螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋E. 卷曲螺旋7. 在酶活性的各種條件機(jī)制中,調(diào)節(jié)速度最慢的是:AA. 酶的合成B. 酶的水解C. 別構(gòu)調(diào)節(jié)D. 共價(jià)修飾E. 水解激活8. 假定一個(gè)酶的活性中
5、心的結(jié)構(gòu)與底物的互補(bǔ)性比其對(duì)過(guò)渡態(tài)的互補(bǔ)性更好,那么這對(duì)酶促反應(yīng)的影響是:BA. 提高反應(yīng)速率B. 降低反應(yīng)速率C. 對(duì)反應(yīng)速率沒(méi)有影響D. 將改變反應(yīng)的平衡常數(shù)E. B和D9. 下圖是絲氨酸蛋白酶催化的一個(gè)中間階段,你認(rèn)為緊接著下一步反應(yīng)會(huì)是:A. Asp的質(zhì)子化B. H2O結(jié)合和進(jìn)攻羰基CC. 第一個(gè)產(chǎn)物離開(kāi)D. 第二個(gè)產(chǎn)物離開(kāi)E. 絲氨酸-羰基加合物被切開(kāi)10. 不能作為DNA變性的指標(biāo)是:DA. 增色效應(yīng)B. 浮力密度升高C. 黏度下降D. 生物功能喪失E. 解鏈11. 驅(qū)動(dòng)蛋白質(zhì)分子自發(fā)折疊成特定三維結(jié)構(gòu)的最重要的因素是:BA. -螺旋和-折疊之中氫鍵的形成B. 非極性側(cè)鏈避開(kāi)水C.
6、 側(cè)鏈基團(tuán)之間形成氫鍵D. 在緊密堆積的原子之間形成的范德華力E. 在水分子和極性側(cè)鏈基團(tuán)之間形成氫鍵12. 在一個(gè)結(jié)合脂肪酸的酶活性中心之中,最有可能與脂肪酸的尾部結(jié)合的氨基酸殘基是: EA. HisB. ArgC. AspD. LysE. Leu13. 具有正協(xié)同效應(yīng)的別構(gòu)酶的Hill常數(shù)是:AA. 大于1B. 小于1C. 等于1D. 大于或等于1E. 小于或等于114. 不可能參與一種酶的催化機(jī)制的氨基酸殘基是:DA. LysB. AspC. CysD. ValE. Tyr15. 真核細(xì)胞內(nèi)的染色體DNA的存在形式是:DA. 共價(jià)閉環(huán)負(fù)超螺旋B. 共價(jià)閉環(huán)正超螺旋C. 共價(jià)閉環(huán)松弛型D.
7、 線性負(fù)超螺旋E. 線性正超螺旋16. 與DNA呈特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)更喜歡在大溝里與DNA結(jié)合,這是因?yàn)?CA. 小溝太窄,蛋白質(zhì)結(jié)合不上去B. 大溝能提供獨(dú)特的疏水作用和范德華力,而小溝不能C. 大溝能提供具有較高特異性的氫鍵受體和供體D. 小溝具有太多的靜電斥力E. DNA只有大溝,沒(méi)有小溝17. 蛋白質(zhì)分子上不會(huì)被磷酸化的氨基酸殘基是:EA.SerB. ThrC. TyrD. HisE. Ala18. 如果將一個(gè)蛋白質(zhì)分子表面的Glu殘基放入內(nèi)部主要由疏水氨基酸殘基組成的核心,則它的pKa值將:AA. 升高B. 降低C. 不變D. 無(wú)法預(yù)測(cè)19. 非Watson-Crick堿基對(duì)發(fā)現(xiàn)在:
8、EA. 由逆轉(zhuǎn)錄酶催化產(chǎn)生的RNA-DNA 雜交雙鏈B. Z-DNA或A-DNAC. 隨機(jī)卷曲的DNAD. 甲基化的DNAE. tRNA20. 以下是五種由不同序列構(gòu)成的DNA雙螺旋,在相同的條件下進(jìn)行熱變性,然后再通過(guò)緩慢冷卻進(jìn)行復(fù)性。你認(rèn)為復(fù)性最快的序列是:AA. ATATATATB. AATATTATC. AAAATTTAD. AAAATTTTE. ATAAATTA三、填充題(每題0.5分,共20題1. 多聚(Trp-Asn的酸水解產(chǎn)物是Asp 。2. GFP是指綠色熒光蛋白。3. Pauling在提出螺旋與Watson和Crick在提出DNA雙螺旋時(shí)都采取了體外模型建立方法。Rosal
9、ind Franklin對(duì)他們發(fā)現(xiàn)雙螺旋結(jié)構(gòu)的主要貢獻(xiàn)是_提供清晰的DNA X射線衍射照片_。4. 角蛋白不能形成螺旋是因?yàn)樗缓珿ly 氨基酸。5. 反映一種米氏酶完美程度的指標(biāo)是Kcat/Km 。6. kcat是指酶的周轉(zhuǎn)周期數(shù)。7. 支持酶催化的過(guò)渡態(tài)穩(wěn)定學(xué)說(shuō)的兩個(gè)主要的證據(jù)是和。8. 所有的蛋白酶在催化過(guò)程中都經(jīng)歷碳四面體形式的過(guò)渡態(tài),該過(guò)渡態(tài)形成的原因是一個(gè)親核基團(tuán)進(jìn)攻肽鍵的羰基碳。9. GroEL在促進(jìn)蛋白質(zhì)折疊的時(shí)候形成兩層七元環(huán)桶式結(jié)構(gòu)。10. 半胱氨酸蛋白酶在催化過(guò)程中前后涉及到兩次親核進(jìn)攻,先后作為親核試劑的是和-SH H2O ,限速步驟是第二次親核進(jìn)攻。11. 細(xì)胞內(nèi)的D
10、NA形成的雙螺旋通常是_B-DNA_型,枯草桿菌的孢子內(nèi)的DNA 形成的雙螺旋通常為_(kāi)A-DNA_型,這是因?yàn)殒咦觾?nèi)_H2O_含量低,另外一個(gè)原因是受到一種特殊的_蛋白質(zhì)_分子的誘導(dǎo)。12. 當(dāng)環(huán)形DNA每一圈的堿基對(duì)大于或者小于10.6 bp的時(shí)候,通常形成超螺旋結(jié)構(gòu)。四、問(wèn)答題(每題5分,共10題1. 有些蛋白質(zhì)因?yàn)槠渲械腍is殘基突變成Arg而完全喪失活性,有些不會(huì),為什么?2. 預(yù)測(cè)以下突變對(duì)血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能帶來(lái)什么影響?為什么?(1血紅蛋白只能以單體的形式存在;(2血紅蛋白以二聚體的形式存在;(3血紅蛋白不能結(jié)合血紅素輔基;(4血紅蛋白上面的鐵更容易被氧化成高價(jià)態(tài)。3. 如果有人
11、在大腸桿菌細(xì)胞里發(fā)現(xiàn)一種新的蛋白質(zhì),它既含有跨膜的結(jié)構(gòu)域,又含有與DNA 結(jié)合的結(jié)構(gòu)域,下面顯示的是這種蛋白質(zhì)的部分氨基酸序列:Ala-Leu-Phe-Ala-Gly-Ile-Val-Glu-Asn-Ser-Thr-Ala-Asp-Trp-His-Arg-Lys-His-Arg(1你認(rèn)為哪一段氨基酸序列最有可能發(fā)現(xiàn)在跨膜的結(jié)構(gòu)域?為什么?(2然而,進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)證明這種蛋白質(zhì)并不是一種跨膜蛋白,而是位于細(xì)胞質(zhì)。那么,你認(rèn)為(1中所指的氨基酸序列位于蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的什么部分?(3指出這種蛋白質(zhì)分子中最有可能與DNA結(jié)合、發(fā)生相互作用的氨基酸序列?為什么?(4你認(rèn)為這些氨基酸更可能與堿基還是磷酸核糖
12、骨架相互作用?(5何種次級(jí)鍵是蛋白質(zhì)與DNA之間作用最強(qiáng)的化學(xué)鍵?4. 假定你從人腦細(xì)胞中分離純化到一種新的蛋白質(zhì),你如何測(cè)定出它的大小和pI?如何知道它在肝細(xì)胞里是否表達(dá)?如何測(cè)定出它的三級(jí)結(jié)構(gòu)?如何預(yù)測(cè)出它可能具有的生物學(xué)功能?5. 最早提出的DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)并非雙螺旋,而是由Linus Pauling和Robert Corey于1952年提出的三螺旋結(jié)構(gòu)。三螺旋結(jié)構(gòu)認(rèn)為,DNA由三條鏈組成,不同的堿基在分子的外部,而磷酸在內(nèi)部,分子是螺旋的。給出至少五條理由,為什么這樣的三螺旋結(jié)構(gòu)是不正確的。6. 當(dāng)雙鏈DNA溶解在含有重水的緩沖溶液之中,發(fā)現(xiàn)堿基上的氫很容易與溶液中的質(zhì)子交換。DNA分子
13、中的AT堿基對(duì)含量越高,交換率就越高。為什么?7. 使用定點(diǎn)突變技術(shù)可將單個(gè)氨基酸的取代引入一個(gè)蛋白質(zhì)分子之中。如果你將一種酶分子上特定位置的Lys用Asp取代,當(dāng)在將一系列突變分子分離純化以后,進(jìn)行動(dòng)力學(xué)分析。下表是分析的結(jié)果:酶形式酶活性(微摩爾產(chǎn)物/mg酶野生型酶1,000K21D21的突變體970K86D 86的突變體100K101D101的突變體970(1從表中你可以推斷出K 21, 86和101在該酶的催化中起什么作用?(2預(yù)測(cè)K 21和K101的位置。你認(rèn)為這兩個(gè)氨基酸殘基在進(jìn)化的過(guò)程中會(huì)很保守嗎?(3K86的保守性又如何?為什么?8. 絲氨酸蛋白酶的在催化反應(yīng)中使用了哪些催化機(jī)
14、制?哪一種機(jī)制貢獻(xiàn)最大? 9. 如果你測(cè)定合成的單鏈 DNA 序列 5-ACTGTGTTACGCGTGG-3和相同序列的 RNA (T 被 U 取代)的紫外吸收,會(huì)發(fā)現(xiàn)兩者 OD260 十分相近。如果你合成新的 DNA 序列 5 -GCAGCGACTGTGTTGT-3,你會(huì)發(fā)現(xiàn)得到的 OD260 沒(méi)有變化,但如果你再合成相同序列的 RNA,就會(huì)發(fā)現(xiàn)得到的 OD260 會(huì)急劇下降。為什么? 10. 細(xì)胞在受熱的情況下,會(huì)受到熱激蛋白(HSP)的保護(hù)。HSP 通過(guò)與在溫度突然提高的 時(shí)候暴露出來(lái)的氨基酸殘基的側(cè)鏈基團(tuán)的結(jié)合保護(hù)細(xì)胞。 (1)列出可能與 HSP 結(jié)合的氨基酸殘基。 (2)這些氨基酸具有的什么性質(zhì)使得它們能夠與 HSP 結(jié)合? (3)HSP 與它們結(jié)合為什么能夠保護(hù)細(xì)胞? 五、Extra credit(5 points each. You have to answer in English) 1. If you are a physician and you have a patient who is suffering from premature pancreatic zymogen activation, which means that the pancreatic enzymes are being activated in the pancreas (rath
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