河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)

1、河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)項(xiàng)目編號(hào):河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)項(xiàng)目名稱:食管鱗癌差異表達(dá)基因的生物信息學(xué)分析項(xiàng)目負(fù)責(zé)人:郭志鵬學(xué)號(hào)：學(xué)31150262所在學(xué)院：醫(yī)學(xué)院年級(jí)專業(yè)：臨床醫(yī)學(xué)填寫(xiě)日期：20寫(xiě)年4月5R河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃領(lǐng)導(dǎo)組制4 / 22填寫(xiě)說(shuō)明一、封面中的項(xiàng)目編號(hào)由學(xué)校統(tǒng)一編排填寫(xiě)。二、申請(qǐng)書(shū)中第2頁(yè)和第一至第五項(xiàng)的內(nèi)容，經(jīng)項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)人員共同討論并征得指導(dǎo)教師意見(jiàn)后，由項(xiàng)目負(fù)責(zé)人主持填寫(xiě)。三、“項(xiàng)目所屬學(xué)科”按教育部1998年頒布的“普通高等學(xué)校本科專業(yè)目錄”中的哲學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)、法學(xué)、教育學(xué)、文學(xué)、歷史學(xué)、

2、理學(xué)、工學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)和管理學(xué)11個(gè)一級(jí)學(xué)科門(mén)類中的一種或多種（跨學(xué)科）；“學(xué)業(yè)能力與獲獎(jiǎng)情況”指項(xiàng)目負(fù)責(zé)人已經(jīng)獲取的成果和獎(jiǎng)勵(lì)，如正式發(fā)表的學(xué)術(shù)論文、創(chuàng)作、專利、參加完成的科研課題、被社會(huì)及生產(chǎn)實(shí)際采用的成果和校級(jí)以上的各種學(xué)業(yè)獎(jiǎng)勵(lì)（挑戰(zhàn)杯、電子設(shè)計(jì)大賽等），均須提供復(fù)印件，隨申請(qǐng)書(shū)一并報(bào)送。四、所填內(nèi)容要符合河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目管理辦法要求，實(shí)事求是、簡(jiǎn)明清晰、具體可靠。對(duì)提供虛假材料或信息數(shù)據(jù)不實(shí)者，將取消申報(bào)資格，并承擔(dān)相應(yīng)責(zé)任。五、格式要求：表格中的字體用小四號(hào)仿宋體，單倍行距，盡可能不加附頁(yè)。簽字部分必須由相關(guān)人員用黑色鋼筆或水筆簽名。A4紙雙面打印，左側(cè)裝訂。六、項(xiàng)

3、目申請(qǐng)書(shū)一式二份，報(bào)教務(wù)處一份、所在學(xué)院一份。河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)項(xiàng)目名稱食管鱗癌差異表達(dá)基因的生物信息學(xué)研究項(xiàng)目所屬學(xué)科類別醫(yī)學(xué)申請(qǐng)經(jīng)費(fèi)（元）5200起止時(shí)間2015年7月至2017年7月項(xiàng)目負(fù)責(zé)基本情況姓名郭志鵬性別男出生年月1994.8政治面貌團(tuán)員聯(lián)系電話E-mail人學(xué)業(yè)能力與獲獎(jiǎng)情況項(xiàng)目負(fù)責(zé)人郭志鵬，現(xiàn)為河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院12級(jí)本科學(xué)生，興趣廣泛，有很強(qiáng)的動(dòng)手操作能力，學(xué)習(xí)成績(jī)優(yōu)異、對(duì)科研有很濃的興趣。積極參與班級(jí)和學(xué)院組織的各種活動(dòng)，有良好的社交能力和團(tuán)隊(duì)合作能力。項(xiàng)姓名性別學(xué)號(hào)所在學(xué)院、專業(yè)年級(jí)項(xiàng)目分工目團(tuán)隊(duì)（含負(fù)責(zé)人）1郭志鵬男1231150262醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)

4、12項(xiàng)目負(fù)責(zé)2345指導(dǎo)教師姓名性別出生年月學(xué)歷職稱所在單位聯(lián)系電話齊義軍男1972-11博士副教授河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院22河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)晁瑋霞女1982-10大學(xué)實(shí)驗(yàn)員河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一指導(dǎo)教師的業(yè)務(wù)特長(zhǎng)與主要學(xué)術(shù)成果4 / 22齊義軍，河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院，副教授，博士，碩士研究生導(dǎo)師主要從事河南食管癌高發(fā)區(qū)食管癌變分子機(jī)制研究及食管癌生物標(biāo)志物的篩查與鑒定。近1年來(lái)，應(yīng)用蛋白質(zhì)組技術(shù)，全面系統(tǒng)的鑒定了ESCC特異的差異蛋白表達(dá)譜(316個(gè))，該成果豐富了食管癌變多分子多階段演進(jìn)理論，并為闡明食管癌變機(jī)理奠定了重要理論基礎(chǔ)，為高危人群監(jiān)測(cè)、早期診斷和生物防治提供了重要手段和方

5、法。申請(qǐng)人先后主持國(guó)家自然科學(xué)基金2項(xiàng)、教育部重點(diǎn)項(xiàng)目1項(xiàng)、河南省高等學(xué)校青年骨干教師資助1項(xiàng)，已發(fā)表50余篇論文和文摘，參編國(guó)際專著1項(xiàng)，其中SCI論文11篇，最高單篇引用次數(shù)達(dá)117次。代表性論文：1. Yi-JunQi,MingWang,Rui-MinLiu,HuaWei,Wei-XiaChao,TianZhang,QiangLou,Xiu-MinLi,JinMa,HanZhu,Zhen-HuaYang,Hai-QingLiu,Yuan-FangMa.Downregulationof14-3-3ocorrelateswithmultistagecarcinogenesisandpoorp

6、rognosisofesophagealsquamouscellcarcinoma.PLoSOne.2014Aprl7;9(4):e95386.2. Yi-JunQi,DouglasGWard,ChunPang,Qi-MingWang,WenbinWei,JinMa,JuanZhang,QiangLou,NeilJShimwell,AshleyMatin,NathalieWong,Wei-XiaChao,MingWang,Yuan-FangMa,PhilipJ.Johnson.Proteomicprofi1ingofN-linkedglycoproteinsidentifiesConA-bin

7、dingprocathepsinDasanovelserumbiomarkerforhepatocellularcarcinoma.Proteomics.2014,14(2-3):186-195.3. LowQiang,YijunQi,YuanfangMa,DiQu.Two-ComponentSignalTransductionSystemSaeRSPositivelyRegulatesStaphylococcusepidermidisGlucoseMetabolism.ScientificWor1dJourna1.2014Jan23;2014:908121.doi:10.1155/2014/

8、9081214. HuYZ,ZhangJ,LiS,WangC,ChuL,ZhangZ,MaZ,WangM,JiangQ,LiuG,QiY,MaY.Thetranscriptionactivityofheatshockfactor-lbisregulatedbyFGF2.IntJBiochemCellBiol.2013,45(2):317-3255. Yi-JunQi,Wei-XiaChao,Jen-FuChiu.Anoverviewofesophagealsquamouscellcarcinomaproteomics.JProteomics.2012,75(11):3129-31376. Wa

9、ngQi-Ming,QiYi-Jun,JiangQi,MaYuan-Fang,WangLi-dong.Relevanceofserumestradiolandestrogenreceptorbetaexpressionfromahigh-incidenceareaforesophagealsquamouscellcarcinomainChina.MedOncol.2011,28(1):188-1937. WangQi-Ming,YuanLing,QiYi-Jun,MaZhi-Yong,WangLi-Dong-Estrogenanalogues：promisingtargetforprevent

10、ionemdtreatmentofesophag河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)ealsquamouscellcarcinomainhighriskareas.MedSciMonit.2010,16(7):HY19-2222河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)一、主要研究?jī)?nèi)容及研究?jī)r(jià)值、目前國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀、本項(xiàng)目的創(chuàng)新與特色1、主要研究?jī)?nèi)容及研究?jī)r(jià)值基因芯片是21世紀(jì)生命科學(xué)領(lǐng)域的一項(xiàng)重要的技術(shù)平臺(tái)，是篩選差異表達(dá)基因的有效手段，具有高通量和快速測(cè)量等優(yōu)點(diǎn)。由于表達(dá)譜芯片在研究細(xì)胞基因表達(dá)模式上的優(yōu)勢(shì)，利用它可獲取腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)的各期以及腫瘤發(fā)生與發(fā)展過(guò)程中相關(guān)基因的表達(dá)模式變化，因

11、此，基因表達(dá)譜芯片已廣泛應(yīng)用于腫瘤發(fā)生機(jī)制、早期診斷、腫瘤基因分型、指導(dǎo)治療及評(píng)估預(yù)后等研究領(lǐng)域。隨著表達(dá)譜芯片技術(shù)的廣泛開(kāi)展，產(chǎn)生了豐富的、海量的、復(fù)雜的生物信息數(shù)據(jù)。如何解讀芯片上成千上萬(wàn)個(gè)基因點(diǎn)的雜交信息，揭示其中蘊(yùn)含的生命特征和規(guī)律，已成為限制基因芯片技術(shù)應(yīng)用和發(fā)展的主要“瓶頸”。生物信息學(xué)是綜合利用生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和信息技術(shù)來(lái)揭示大量而復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)所賦有的生物學(xué)奧秘的一門(mén)交叉學(xué)科，它以生物芯片研究為基礎(chǔ)，以序列比對(duì)、統(tǒng)計(jì)分析方法、可視化作圖、生物聚類、通路分析及啟動(dòng)子預(yù)測(cè)等方法為手段，在分子水平進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘、對(duì)疾病進(jìn)行闡述，為腫瘤分子發(fā)病機(jī)理的研究開(kāi)闊了新的研究思路，從而更加全面

12、地從整體上對(duì)疾病進(jìn)行研究。2、目前國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀食管癌(Esophagealcancer,EC)的發(fā)病率和死亡率在全球腫瘤中分別居第八位和第六位,而每年新確診的EC病例約有一半發(fā)生在中國(guó)。在中國(guó)，EC的主要組織學(xué)類型為食管鱗癌，約占所有EC的90%oEC的發(fā)病率具有明顯的地區(qū)分布差異，中國(guó)華北的太行山區(qū)是EC發(fā)病率和死亡率高發(fā)區(qū)之一，如河南省的林州、安陽(yáng)、輝縣等地的發(fā)病率超過(guò)100/100,000,遠(yuǎn)高于美國(guó)、歐洲等西方國(guó)家的發(fā)病率(5/100,000)o近幾十年來(lái)，美國(guó)等西方國(guó)家EC的主要組織學(xué)類型已由原來(lái)的食管鱗癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)

13、逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)槭彻芟侔?Esophagealadenocarcinoma,EAC),盡管自雌國(guó)EC的組織學(xué)類型仍是ESCC,但EAC也有升高的趨勢(shì)，提示經(jīng)濟(jì)和生活水平的提高對(duì)EC發(fā)病模式的影響。除此之外，ESCC高發(fā)區(qū)還出現(xiàn)家族性聚集現(xiàn)象。因此，多數(shù)學(xué)者認(rèn)為：基因易感性和環(huán)境因素在EC的發(fā)生發(fā)展中起著重.二、已具備的條件(含已具備的知識(shí)、技能、特長(zhǎng)、實(shí)驗(yàn)條件、研究基礎(chǔ)等)1 .已具備的知識(shí)、技能、特長(zhǎng)我們團(tuán)隊(duì)的同學(xué)相互熟知，彼此了解，專業(yè)相近，友誼深厚，配合默契，同時(shí)我們還具備扎實(shí)的專業(yè)基礎(chǔ)知識(shí)，豐富的社會(huì)實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，嚴(yán)謹(jǐn)求實(shí)的治學(xué)態(tài)度，又有年輕人所具備的熱情,激情和活力。在對(duì)專業(yè)課程的學(xué)習(xí)中我們積

14、極努力，自強(qiáng)進(jìn)取，主動(dòng)將平時(shí)學(xué)習(xí)和和社會(huì)實(shí)踐相結(jié)合，積極參加學(xué)院舉辦的各類學(xué)術(shù)講座，主動(dòng)接觸學(xué)術(shù)界專家名流，平時(shí)認(rèn)真思考，熱情于社會(huì)實(shí)踐和各類科研項(xiàng)目，注重自身素質(zhì)的培養(yǎng)，也關(guān)注社會(huì)新聞和政策動(dòng)向，勇于提出自己的見(jiàn)解和構(gòu)想。2 .現(xiàn)有的可利用資源(1)團(tuán)隊(duì)成員：團(tuán)隊(duì)成員交際面都比較廣闊，性格開(kāi)朗、外向，善于與人溝通；背后有學(xué)院專家教授們的熱情支持和鼎力相助。同時(shí)依托于河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院濃厚的研究氛圍和嚴(yán)謹(jǐn)、求真、負(fù)責(zé)、篤行的治學(xué)傳統(tǒng)。(2)資料基礎(chǔ)：掌握和運(yùn)用中國(guó)知網(wǎng)，找到中國(guó)學(xué)術(shù)網(wǎng)絡(luò)出版總庫(kù)，涵蓋基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、生物化學(xué)、分子生物學(xué)、微生物學(xué)、醫(yī)學(xué)材料學(xué)、口腔材料學(xué)、高分子醫(yī)學(xué)材料、醫(yī)學(xué)電子

15、信息學(xué)等，幾乎涵蓋了所有門(mén)類的出自全國(guó)乃至全球的各類期刊或是碩、博論文。各種資料應(yīng)有盡有。我們以河南大學(xué)醫(yī)學(xué)院為依托，我們可以得到一大批高層專業(yè)醫(yī)學(xué)人員的支持，并有大量的文獻(xiàn)資料可以參考。省級(jí)科研機(jī)構(gòu)：免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室，多次獲得國(guó)家自然科學(xué)基金資助。這些無(wú)疑都將會(huì)給我們的調(diào)查研究帶來(lái)更大的方便和更多的支持。我們醫(yī)學(xué)院和東京臨床學(xué)院,(1) Java開(kāi)發(fā)工具包JavaPlatform(JDK)7u3(2) EelipseJava開(kāi)發(fā)平臺(tái)下載地址：http:www.eclipse,org/downloads/(3) Cytoscape生物信息網(wǎng)絡(luò)關(guān)系軟件下載地址：http：/www.cytoscape

16、.org/(4) BionetbuilderCytoscape插件下載地址：/cytoscape/bionetbuilder/(5) NetanalyzerCytoscape插件下載地址：http：/med.bioinf.inpi-inf.mpg.de/netanalyzer/(6) CerebralCytoscape插件下載地址：http：/pathogenomics.ca/cerebral/(7) HPA人類蛋白質(zhì)圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)地址：/8/22(8) Entrez基因數(shù)據(jù)庫(kù)河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)

17、劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)三、項(xiàng)目實(shí)施方案與進(jìn)度安排（按月份列出）（一）、實(shí)施方案：1、樣本收集和處理食管癌芯片分析的數(shù)據(jù)下載：搜索GEO數(shù)據(jù)庫(kù)并下載食管鱗癌基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù)；芯片分析：計(jì)算差異基因并挑選出差異基因；食管鱗癌調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及相關(guān)分析：從HPRD和BIOGRID兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中收集蛋白質(zhì)相互作用的數(shù)據(jù)；食管鱗癌生物學(xué)通路分析:KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,京都基因與基因組百科全書(shū)）是由曰本京都大學(xué)和東京大學(xué)聯(lián)合開(kāi)發(fā)的數(shù)據(jù)庫(kù)，可以用來(lái)查詢代謝途徑、酶（或編碼酶的基因）、產(chǎn)物等，也可以通過(guò)BLAST比對(duì)查詢未知序列的代謝途徑信息；差異表達(dá)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的

18、pathway代謝通路分析：找到食管癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中特定的相互作用蛋白之間的關(guān)系，以及轉(zhuǎn)錄因子之間的交互作用，闡述了食管鱗癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中蛋白質(zhì)的調(diào)控機(jī)制；在疾病相關(guān)的研究上，通過(guò)結(jié)合現(xiàn)有數(shù)據(jù)構(gòu)建疾病調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和生物學(xué)通路的交互作用分析，可以揭示更多潛在的疾病機(jī)制。（二）具體實(shí)踐安排1 .數(shù)據(jù)下載2015年7月-2015年12月2 .數(shù)據(jù)處理2016年1月-2016年5月3 .統(tǒng)計(jì)學(xué)處理2016年6月-2016年12月4 .撰寫(xiě)論文及發(fā)表2017年1月-2017年5月9 / 22河南大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)書(shū)四、項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)預(yù)算及用途序號(hào)經(jīng)費(fèi)科目經(jīng)費(fèi)預(yù)算（元）預(yù)算依據(jù)1非免費(fèi)軟件下載2000Matelab、SMA基因芯片分析、BionetbuilderCytoscape等多款數(shù)據(jù)分析軟件2資料費(fèi)用1000相關(guān)研究領(lǐng)域書(shū)籍、報(bào)刊的收集購(gòu)買(mǎi)以及相