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1、真核生物基因表達的調(diào)控河南高校民生學院 王磊 生物技術(shù)一、生物基因表達的調(diào)控的共性首先,我們來看看在生物基因表達調(diào)控這一過程中體現(xiàn)的共性和一些基本模式。1、作用范圍。生物體內(nèi)的基因分為管家基因和鋪張基因。管家基因始終表達,鋪張基因只在需要的時候表達,但二者的表達都受到調(diào)控??梢?,調(diào)控是普遍存在的現(xiàn)象。2、調(diào)控方式?;虮磉_有兩種調(diào)控方式,即正調(diào)控與負調(diào)控,原核生物和真核生物都離不開這兩種模式。3、調(diào)控水平。一種基因表達的調(diào)控可以在多種層面上開放,包括DNA水平、轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后加工水平、翻譯后加工水公平。然為節(jié)省能量起見,轉(zhuǎn)錄的起始階段往往作為最佳調(diào)控位點。二、真核生物基因表達調(diào)控的特點真核生
2、物與原核細胞在結(jié)構(gòu)上就有著諸多不同,這打算了二者在運行方面的迥異途徑。真核生物比原核生物簡單,轉(zhuǎn)錄與翻譯不同時也不同地,基因組與染色體結(jié)構(gòu)簡單,因而有著更為簡單的調(diào)控機制。1、 多層次。真核生物的基因表達可發(fā)生在染色質(zhì)水平、轉(zhuǎn)錄起始水平、轉(zhuǎn)錄后水平、翻譯水平以及翻譯后水平。2、 無操縱子和衰減子。3、 大多數(shù)原核生物以負調(diào)控為主,而真核生物啟動子以正調(diào)控為主。4、 個體發(fā)育簡單,而受環(huán)境影響較小。真核生物多為多細胞生物,在生長發(fā)育過程中,不僅要隨細胞內(nèi)外環(huán)境的變化調(diào)整基因表達,還要隨發(fā)育的不同階段表達不同基因。前者為短期調(diào)控,后者屬長期調(diào)控。從整體上看,不行逆的長期調(diào)控影響更深遠。三、真核生物
3、基因表達調(diào)控的機制介于真核生物表達以多層次性為最主要特點,我們可以分別從它的幾個水平著眼,剖析它的調(diào)控機制。1、染色質(zhì)水平。真核生物基因組DNA以致密的染色質(zhì)形式存在,發(fā)生在染色質(zhì)水平的調(diào)控也稱作轉(zhuǎn)錄前水平的調(diào)控,產(chǎn)生永久性DNA序列和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化,往往伴隨細胞分化。染色質(zhì)水平的調(diào)控包括染色質(zhì)丟失、基因擴增、基因重排、染色體DNA的修飾,等等。a. 基因丟失:丟失一段DNA或整條染色體的現(xiàn)象。在細胞分化過程中,可以通過丟失掉某些基因而去除這些基因的活性。某些原生動物、線蟲、昆蟲和甲殼類動物在個體發(fā)育中,很多體細胞經(jīng)常丟失掉整條或部分的染色體,只有將來分化產(chǎn)生生殖細胞的那些細胞始終保留著整套
4、的染色體。如馬蛔蟲2n2,但染色體上有多個著絲粒。第一次卵裂是橫裂,產(chǎn)生上下2個子細胞。其次次卵裂時,一個子細胞仍進行橫裂,保持完整的基因組,而另一個子細胞卻進行縱向分裂,丟失部分染色體。目前,在高等真核生物(包括動物、植物)中尚未發(fā)覺類似的基因丟失現(xiàn)象。b. 基因擴增:基因擴增是指某些基因的拷貝數(shù)專一性增大的現(xiàn)象,它使得細胞在短期內(nèi)產(chǎn)生大量的基因產(chǎn)物以滿足生長發(fā)育的需要,是基因活性調(diào)控的一種方式。如非洲爪蟾卵母細胞中rDNA的基因擴增是因發(fā)育需要而消滅的基因擴增現(xiàn)象;基因組拷貝數(shù)增加,即多倍性,在植物中是格外普遍的現(xiàn)象?;蚪M拷貝數(shù)增加使可供遺傳重組的物質(zhì)增多,這可能構(gòu)成了加速基因進化、基因
5、組重組和最終物種形成的一種方式。c. 基因重排:將一個基因從遠離啟動子的地方移到距它很近的位點從而啟動轉(zhuǎn)錄,這種方式被稱為基因重排。通過基因重排調(diào)整基因活性的典型例子是免疫球蛋白結(jié)構(gòu)基因的表達。在人類基因組中,全部抗體的重鏈和輕鏈都不是由固定的完整基因編碼的,而是由不同基因片段經(jīng)重排后形成的完整基因編碼的。d. DNA甲基化抑制基因轉(zhuǎn)錄的機理:DNA甲基化導致某些區(qū)域DNA構(gòu)象變化,從而影響了蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,抑制了轉(zhuǎn)錄因子與啟動區(qū)DNA的結(jié)合效率。在一些不表達的基因中,啟動區(qū)的甲基化程度很高,而處于活化狀態(tài)的基因則甲基化程度較低。真核DNA約有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范圍與基因表
6、達程度呈反比。2.轉(zhuǎn)錄起始水平。這一環(huán)節(jié)是調(diào)控的最主要環(huán)節(jié),由對基因轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控來完成,包括基因的空間結(jié)構(gòu)、折疊狀態(tài)、DNA上的調(diào)控序列、與調(diào)控因子的相互作用等。e. 活化染色質(zhì):在真核生物體內(nèi),RNApol與啟動子的結(jié)合受染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的限制,需通過染色質(zhì)重塑來活化轉(zhuǎn)錄。常態(tài)下,組蛋白可使DNA鏈形成核小體結(jié)構(gòu)而抑制其轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄因子若與轉(zhuǎn)錄區(qū)結(jié)合則基因具有轉(zhuǎn)錄活性。因而基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄是限制性的,核小體的解散時必要前提,組蛋白與轉(zhuǎn)錄因子之間的競爭結(jié)果可以打算是否轉(zhuǎn)錄。組蛋白的抑制力量可因其乙?;档?。另外,由于端粒位置效應(yīng)或中心粒的原因,抑或是收到一些蛋白的調(diào)控,真核生物細胞可能消滅10%的異
7、染色質(zhì),異染色質(zhì)空間上壓縮緊密,不利于轉(zhuǎn)錄。f. 活化基因:真核生物編碼蛋白的基因含啟動子元件和增加子元件(啟動子:在DNA分子中,RNA聚合酶能夠識別、結(jié)合并導致轉(zhuǎn)錄起始的序列。增加子:指能使與它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列。),轉(zhuǎn)錄因子與啟動子元件相互作用調(diào)整基因表達;轉(zhuǎn)錄激活因子與增加子元件相互作用,再通過與結(jié)合在啟動子元件上的轉(zhuǎn)錄因子相互作用來激活轉(zhuǎn)錄。兩種元件以相同的機制作用于轉(zhuǎn)錄。真核生物RNApol對啟動子親和力很小或沒有,轉(zhuǎn)錄起始依靠于多個轉(zhuǎn)變路激活因子的作用,而若干個調(diào)整蛋白與特定DNA序列的結(jié)合大大提高了活化的精確度,無疑是這一作用機制的一大優(yōu)勢。在這一作用中,增
8、加子與適當?shù)恼{(diào)整蛋白作用以增加接近啟動子的轉(zhuǎn)錄是沒有方向性的,典型的增加子可以消滅在轉(zhuǎn)錄起始位點上游或下游。RNApol與啟動子的結(jié)合一般需要三種蛋白質(zhì)的作用,即基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子(又名通用轉(zhuǎn)錄因子)、轉(zhuǎn)錄激活因子和輔激活因子。能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)又名轉(zhuǎn)錄因子?;A(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子與RNApol結(jié)合成全酶復合物并結(jié)合到啟動子上,轉(zhuǎn)錄激活因子可以以二聚體或多聚體的形式結(jié)合到DNA靶位點上,遠距離或近距離作用域啟動子。在遠距離作用時,往往還會有絕緣子參與,以阻斷鄰近的增加子對非想關(guān)基因的激活;在近距離作用時,結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄因子可以轉(zhuǎn)變DNA調(diào)控區(qū)的外形,使其他蛋白質(zhì)相互作用、激活轉(zhuǎn)錄。3.轉(zhuǎn)錄后水平。真核生物mRNA前體須經(jīng)過5-加帽、3-加尾以及拼接過程、內(nèi)部堿基修飾才能成為成熟度的mRNA,加帽位點與加尾位點、拼接點的選擇就成了調(diào)控的手段。g. 5-加帽:幾乎全部的真核生物和病毒mRNA的5端都具有帽子結(jié)構(gòu),其作用為愛護mRNA免遭5外切酶降解、為mRNA的核輸出供應(yīng)轉(zhuǎn)運信號和提高翻譯模板的穩(wěn)定性和翻譯效 率。試驗證明,對于通過滑動搜尋起始的轉(zhuǎn)錄過程來說,mRNA的翻譯活性依靠于5端的帽子結(jié)構(gòu)。h. 3-加尾:3UTR序列及結(jié)構(gòu)調(diào)整mRNA穩(wěn)定性和壽命4.翻譯水平。在翻譯
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