氨基酸密碼子對照表

1、精心整理與核甘酸序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表丙氨酸AlanineA 或 Ala89.079CH3-脂肪族類精氨酸ArginineR 或 Arg174.188HN=C(NH2)-NH-(CH2)3-堿性氨基酸類天冬酰胺AsparagineN 或 Asn132.104H2N-CO-CH2-酰胺類天冬氨酸AsparticacidD 或 Asp133.089HOOC-CH2-酸性氨基酸類半胱氨酸 1CysteineC 或 Cys121.145HS-CH2-含硫類谷氨酰胺GlutamineQ 或 Gln146.131H2N-CO-(CH2)2-酰胺類谷氨酸GlutamicacidE 或 Glu147.116H

2、OOC-(CH2)2-酸性氨基酸類甘氨酸GlycineG 或 Gly75.052H-脂肪族類組氨酸HistidineH 或 His155.141N=CH-NH-CH=C-CH2-|堿性氨基酸類異亮氨酸IsoleucineI 或 Ile r_ _. J131.160CH3-CH2-CH(CH3)-脂肪族類亮氨酸 JLeucineL 或 Leu131.160(CH3)2-CH-CH2-脂肪族類賴氨酸LysineK 或 Lys146.17H2N-(CH2)4-堿性氨基酸類蛋氨酸MethionineM 或 Met149.199CH3-S-(CH2)2-含硫類苯丙氨酸Phenylalanin eF 或

3、Phe165.177Phenyl-CH2-芳香族類脯氨酸ProlineP 或 Pro115.117-N-(CH2)3-CH- |亞氨基酸絲氨酸SerineS 或 Ser105.078HO-CH2-邇其米蘇氨酸ThreonineT 或 Thr119.105CH3-CH(OH)-邇其米色氨酸TryptophanW Trp204.213Phenyl-NH-CH=C-CH2-|芳香族類酪氨酸TyrosineY 或 Tyr181.1764-OH-Phenyl-CH2-芳香族類緞氨酸ValineV 或 Val117.133CH3-CH(CH2)-脂肪族類Enhancer順式-作用序列，它增強(qiáng)了（一些）真核

4、生物啟動子的作用 子相關(guān)的任何位置處（上游或下游）起作用,并能在方向和與啟動Exon編碼剪接 mRN腳分的基因組區(qū)域；可以含有5UTR,所有CDS,和3UTR關(guān)鍵詞說明allele相關(guān)的個體或菌株含有相同基因的穩(wěn)定的其它形式，該形式區(qū)別于這一位置的現(xiàn)有的序列（和或許其它序列）attenuator存在調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的終止的DNA區(qū)域，它控制了一些細(xì)菌操縱子的表達(dá)；（2）位于啟動子和第一個結(jié)構(gòu)基因之間，引起轉(zhuǎn)錄的部分終止的序列區(qū)段C_region免疫球蛋白輕和重鏈的怛定區(qū)，和T-細(xì)胞受體a , 0 ,和丫鏈；根據(jù)特定的鏈可包括一個或多個外顯子CAAT_signal一CAAT盒;位于可能參與RNA聚合酶結(jié)

5、合的真核生物轉(zhuǎn)錄單位的起始點的75bp上游的保守序列的一部分；共有序列GG（C或T）CAATCTCDS編碼序列；對應(yīng)于蛋白質(zhì)中的氨基酸序列的核甘酸的序列（位置包括終止密碼子）;特征包括氨基酸概念上的翻譯Conflict在這一位點或區(qū)域，單獨確定的相同”序列有所不同D-loop置換環(huán)；線粒體 DNA內(nèi)的一個區(qū)域，其中RNA的短的序列與 DNA的一條鏈配對，代替 了這一區(qū)域的原始配對DNA鏈；也用于說明在 RecA蛋白質(zhì)催化的反應(yīng)中，侵入的單鏈替代雙鏈DNA的一條鏈的區(qū)域D-segment免疫球蛋白重鏈的多變區(qū)，和T-細(xì)胞受體的0鏈GC_signalGC盒；位于真核生物轉(zhuǎn)錄單位起始點上游的保守的富

6、含GC區(qū)域，可以以多重拷貝或方向存在；共有序列=GGGCGGgene鑒定為基因的生物學(xué)意義的區(qū)域，并已經(jīng)指定名稱iDNA間插DNA;通過幾種重組中的任何一種能被消除的DNAintron被轉(zhuǎn)錄的DNA區(qū)段，但通過同時剪接位于其兩側(cè)的序列（外顯子）即可從轉(zhuǎn)錄本內(nèi)部將其除去J_segment免疫球蛋白輕鏈和重鏈的連接區(qū)段，和T-細(xì)胞受體a , 0和丫鏈LTR長的末端重復(fù)，在確定序列的兩端直接重復(fù)的序列，類型典型地見于逆轉(zhuǎn)錄病毒中mat_peptid e成熟的肽或蛋白質(zhì)的編碼序列；翻譯后修飾之后成熟的或最終的肽或蛋白質(zhì)產(chǎn)物的編碼序列；位置不包括終止密碼子 （與相應(yīng)的CDS不同）misc_bindi n

7、g不能用任彳S其它Binding 關(guān)鍵詞（primer_bind 或protein_bind）表述的與另一個組成成分共價或非-共價結(jié)合的核酸中的位點misc_diffe rence特征序列與記載中存在的有所不同，并且不能用任何其它不同關(guān)鍵詞（conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或 modified_base）表述misc_featu re不能用任何其它的特征關(guān)鍵詞表述的具有生物學(xué)意義的區(qū)域；新的或少見的特征misc_recom b任何一般性的，位點特異性的或復(fù)制的重組事件的位點，該位點中有不能用其它重組關(guān)鍵詞（iDNA和v

8、irion）或來源關(guān)鍵詞的修飾詞（/transposon,/proviral）表述的雙螺旋DNA的斷裂和愈合misc_RNA不能用其他RNA關(guān)鍵詞(prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5clip,3clip,5UTR,3UTR,exon,CDS1sig_peptide,transitpeptide,mat_peptide,intron,polyA_site,rRNA,tRNA,scRNA和snRNA)限定的任何轉(zhuǎn)錄本或RNA/物misc_signa含有控制或改變基因功能或表達(dá)之信號的任何區(qū)域，所述信號不能用其他Signal關(guān)鍵詞(promoter,CAAT_s

9、ignal,TATA_signal,-35_signal,10_signal,GC_signal,RBS,po yA_signal,enhancer,attenuator,terminator,和 rep_origin) 表述misc_struc ture不能用其他Structure 關(guān)鍵詞（stem_loop和D-loop）表述的任何二級或三級結(jié)構(gòu)或 構(gòu)象modified_b ase被指示的核甘酸是經(jīng)修飾的核甘酸，并應(yīng)由被指示的分子（在mod_base修飾詞意義中給出）所取代mRNA信使RNA包括5非翻譯區(qū)（5UTR）,編碼序列（CDS,外顯子）和3 非翻譯區(qū)（3UTR）mutationN_

10、region在此位置處，相關(guān)品系的序列中具有突然的，可遺傳的變化在重排的免疫球蛋白區(qū)段之間插入的額外的核甘酸rOld_sequen ce在此位置處，所表述的序列修改了此序列以前的版本PolyA_sign al聚腺甘酸化之后內(nèi)切核酸酶裂解RNA轉(zhuǎn)錄本所必需的識別區(qū)域；共有序列=AATAAPolyA_siteRNA轉(zhuǎn)錄本上的位點，通過轉(zhuǎn)錄后聚腺甘酸化該位點將被加上腺喋吟殘基Precursor.RNA仍不是成熟的 RNA產(chǎn)物的任何 RNA中類；可包括 5剪切區(qū)（5clip） , 5非翻譯區(qū) （5UTR）,編碼序列（CDS,外顯子），間插序列（內(nèi)含子），3非翻譯區(qū)（3UTR）,和3剪切區(qū)（3clip）

11、prim trans .cript初級（最初的，未加工的）轉(zhuǎn)錄本；包括5剪切區(qū)（5 clip ） , 5 非翻譯區(qū)（5UTR）,編碼序列（CDS,外顯子）,間插序列（內(nèi)含子）,3非翻譯區(qū)（3UTR）和3剪切區(qū) （3clip）prim_bind起始復(fù)制，轉(zhuǎn)錄或逆轉(zhuǎn)錄的非-共價的引物結(jié)合位點 的位點；包括合成的例如 PCR引物元件Promoter參與RNA聚合酶的結(jié)合以啟動轉(zhuǎn)錄的DNA分子區(qū)域protein_bi nd核酸上非共價的蛋白質(zhì)結(jié)合位點RBS核糖體結(jié)合位點repeat_reg on含有重復(fù)單位的基因組區(qū)域repeat_uni單個重復(fù)元件rep_origin復(fù)制起點；復(fù)制核酸以得到兩個相同

12、拷貝的起始位點RRNA成熟的核糖體 RNA將氨基酸裝配成蛋白質(zhì)的核糖核蛋白顆粒（核糖體）中的RNA成份S_region免疫球蛋白重鏈的開關(guān)區(qū)；它參與重鏈 DNA的重排疫球蛋白類的表達(dá),導(dǎo)致來自相同B細(xì)胞的不同免Satellite短的基本重復(fù)單位的很多串聯(lián)重復(fù)（相同或相關(guān)的性質(zhì)與基因組的一般水平不同，這使得它們與大部分）；大多數(shù)具有的堿基組成或其它（主帶）的基因組DNA分離開來ScRNA小的細(xì)胞質(zhì) RNA;幾個小的細(xì)胞質(zhì)RN A分子中的任何一個存在于真核生物的細(xì)胞 質(zhì)和（有時）核中sig_peptid e信號肽編碼序列；被分泌的蛋白質(zhì)的N-末端結(jié)構(gòu)域的編碼序列；此結(jié)構(gòu)域涉及新 生多肽與膜的結(jié)合；

13、前導(dǎo)序列SnRNA小的核RNA很多小的 RNA種類中的任何一個都被局限于核中；幾個snRNA參與剪接或其它RNA加工反應(yīng)source鑒定序列中特定范圍的生物來源；此關(guān)鍵詞是強(qiáng)制性的；每一項至少要有一個跨越 整個序列的單一來源關(guān)鍵詞；每個序列可允許有一個以上的來源關(guān)鍵詞stem_loop發(fā)卡結(jié)構(gòu)；由 RNA或DNA單鏈的相鄰（反向）互補(bǔ)序列之間的堿基一配對形成的雙 螺旋區(qū)域STS序列標(biāo)記位點：表述基因組上作圖界標(biāo)并能通過PCR檢測的短的，單拷貝DNA序列；通過測定STS系列的次序即可作出圖譜的基因組區(qū)域TATA_signa一 ,TATA盒；Goldberg-Hogness 盒；在每個真核生物RN

14、AM合酶n轉(zhuǎn)錄單位起點前約25bp處發(fā)現(xiàn)的保守的富含 AT的七聚體，它可能涉及使酶定位以正確地起始；共有 序列=TATA （ A或T） A （人或?。﹖erminator；| xx或者位于轉(zhuǎn)錄本的末端或者與啟動子區(qū)域相鄰的DNA序列，該序列可導(dǎo)致 RNA聚合酶終止轉(zhuǎn)錄；也可以是阻抑蛋白的結(jié)合位點transit_pe ptide轉(zhuǎn)運肽編碼序列；核編碼的細(xì)胞器蛋白質(zhì)N-末端結(jié)構(gòu)域的編碼序列；此結(jié)構(gòu)域參 與將蛋白質(zhì)翻譯后運送到細(xì)胞器中tRNA成熟的轉(zhuǎn)移 RNA,小的RNA分子（75 85個堿基長），介導(dǎo)核酸序列翻譯成氨基 酸序列unsure作者不能確定此區(qū)域的準(zhǔn)確序列V_region免疫球蛋白輕鏈和

15、重鏈的可變區(qū)，和T細(xì)胞受體末端部分；可由 7 segment,D_segment,N_regiona , 0和丫鏈；編碼可變的氨基和 J_segment 組成V_segment免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)段，和T 細(xì)胞受體a , 0和丫鏈；編碼大多數(shù)可變區(qū)（v_region ）和前導(dǎo)肽的最后幾個氨基酸variation含有來自相同基因的穩(wěn)定突變的相關(guān)系列（例如RFLP,多態(tài)性等），在此（和可能其它）位置處所述相同基因與被表述的不同3 clip在加工過程中被切下的前體轉(zhuǎn)錄本3端大部分區(qū)域3 UTP不被翻譯成蛋白質(zhì)的成熟轉(zhuǎn)錄本的3末端區(qū)域（終止密碼子之后）5 clip在加工過程中被切下的前體轉(zhuǎn)錄本

16、5端大部分區(qū)域5 UTP不被翻譯成蛋白質(zhì)的成熟轉(zhuǎn)錄本的5末端區(qū)域(起始密碼子之前)_10_signalPribnow合；細(xì)菌轉(zhuǎn)錄單位起點上游約 合酶；共有序列=TatAaT10bp處的保守區(qū)域，它口能參與結(jié)合RN磔_35_signal細(xì)菌轉(zhuǎn)錄單位起點上游約35bp處的保守K聚體；共后序列=TTGACa口或 TGTTGACA口與蛋白質(zhì)序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表關(guān)鍵詞說明CONFLICT不同的論文報道了不同的序列VARIANT作者報道存在序列變體；VARSLIC由可選擇的剪接產(chǎn)生的序列變體的表述.MUTAGEN軍實驗操作已改變的位點MOD_RES殘基的翻譯后修飾ACETYLATIONN-末端或其它AM

17、IDATION通常位于成熟的活性肽的C-末端BLOCKED不能被測定的 N-或C末端封閉基團(tuán)1FORMYLATIONN末端甲硫氨酸的I 1 C.XGAMMA-CARBOXY-GLUTAMICACIDHYDROXYLATION天冬酰胺，天冬氨酸，脯氨酸半賴氨酸的METHYLATION通常為賴氨酸或精氨酸的.PHOSPHORYLATION絲氨酸，蘇氨酸，酪,氨酸，天備女酸或組氨酸的PYRROLIDONECARBOXYLICACID已形成內(nèi)部環(huán)內(nèi)酰胺的N末端谷氨酸SULFATATION四常為酪氨酸的LIPID指質(zhì)組成成分的共價結(jié)合MYRISTATE，二PALMITATE通過酰胺鍵與蛋白質(zhì)成熟形式的N

18、-末端甘氨酸殘基或內(nèi)部的賴氨酸度基結(jié)合的豆蔻酸基團(tuán)通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基或通過酯鍵與絲氨酸或蘇氨酸殘基結(jié)合的棕桐酸基團(tuán)FARNESYL通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基結(jié)合的法尼基GERANYL-GERANYL通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基結(jié)合的香葉基-香葉基基團(tuán)GPI ANCHOR一與蛋白質(zhì)成熟形式C -末端殘基的a -竣基相連的糖基-磷脂酰肌醇(GPI)基團(tuán)N ACYLDIGLYCERIDE原核生物脂蛋白成熟形式的N-末端半胱氨酸，所述脂蛋白具有酰胺鍵聯(lián)的脂肪酸和通過酯鍵連接J兩個脂肪酸的甘油基DISULFID二硫鍵； FROM和 TO終點表示通過一個鏈內(nèi)二硫鍵連接的兩 個殘基；如果“ FROM和 TO終點是完全相同的，則二硫鍵是鏈 間鍵，而說明書領(lǐng)域示出交聯(lián)的性質(zhì)THIOLEST硫醇酯鍵； FROIM和 TO終點表示通過硫醇酯鍵連接的兩個殘基THIOETH硫醴鍵； FROM和 TO終點表示通過硫醴鍵連接的兩個殘基CARBOHYD糖基化位點；碳水化物（如果已知）的性質(zhì)在說明書領(lǐng)域給出METAL金屬離子的結(jié)合位點；說明書領(lǐng)域不出金屬的性質(zhì)BINDING r引可化孝篁團(tuán)（輔酷，輔臭，等等）的結(jié)合位點；篁團(tuán)的化孝性質(zhì)在 歷明書領(lǐng)域給出SIGNAL言號序列的范圍（前肽）