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1、實(shí)驗(yàn)四、凝膠實(shí)驗(yàn)四、凝膠DNA回收回收一、概論一、概論DNA經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離后,有效地回收特定的DNA片段是進(jìn)行隨后DNA克隆的一個(gè)主要步驟?;厥盏腄NA片段的質(zhì)量的好壞將嚴(yán)重影響DNA轉(zhuǎn)化的效率。目前雖然有許多方法可從凝膠中回收DNA,如透析袋電洗脫法、低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠法、瓊脂糖酶法及DEAE-纖維素膜法等,但普遍存在以下問題: 1 大片段DNA不容易回收。 2 回收的DNA中存在酶反應(yīng)抑制物 3 少量DNA片段的回收率低。 二、實(shí)驗(yàn)方法二、實(shí)驗(yàn)方法 V-gene V-gene 瓊脂糖凝膠瓊脂糖凝膠DNADNA的回收試劑盒的回收試劑盒1 1、 試劑試劑塑料件:DNA制備管,2ml離心管。
2、DE-A溶液:凝膠熔化劑(含DNA保護(hù)劑,防止DNA在高溫下降解)。室溫密閉貯存。DE-B溶液:高離液序列溶液(促使大于100bp的DNA片段選擇性結(jié)合到DNA制備膜上),室溫密閉貯存。W1溶液: 洗滌液。室溫密閉貯存。W2溶液:脫鹽液。室溫密閉貯存。洗脫液:2.5mM Tris.HCl,pH8.5。室溫密閉貯存。2 2、實(shí)驗(yàn)步驟、實(shí)驗(yàn)步驟在紫外燈下切下含有目的DNA的瓊脂糖凝膠,用紙巾吸盡凝膠表面液體并切碎。計(jì)算凝膠重量(提前記錄1.5ml離心管重量),該重量作為一個(gè)凝膠體體積(如100mg=100ul體積).根據(jù)凝膠濃度,按下表所提供的參數(shù)加DE-ADE-A溶液溶液: 凝膠濃度 DE-A溶
3、液體積 1.0 3個(gè)凝膠體積 1.5 4個(gè)凝膠體積 20 5個(gè)凝膠體積 混合均勻后于70加熱(低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠于40加熱),間斷搖晃,直至凝膠塊完全熔化(約6-8min).在濾液中加0.5個(gè)DE-A體積的DE-BDE-B溶液溶液,混合均勻。當(dāng)分離 的DNA片段小于400bp時(shí),加入異丙醇至終濃度為20%。2 2、實(shí)驗(yàn)步驟、實(shí)驗(yàn)步驟( (續(xù))續(xù))吸取步驟C中的混合液,轉(zhuǎn)移到DNADNA制備管制備管(置于2 ml離心管)中,3600 rpm 離心1min。如制備管中有液體殘留,適當(dāng)提高離心速度,再離心1min, 棄濾液。將制備管置回離心管,加0.5ml W1W1溶液溶液,3600rpm離心30s,
4、棄濾液;將制備管置回離心管,加0.7ml W2W2溶液溶液,3600rpm離心30s,棄濾液。再以同樣的方法洗滌一次。將制備管置于離心管中,最高速度離心1min;將制備管置于新的1.5ml離心管中,在DNADNA制備膜制備膜正中央加 25ul水或洗脫液溫靜置1min。最高速度離心1min洗脫DNA。收集洗脫液,保存于-20,電泳檢測(cè)DNA片段回收情況。 3 3、注意事項(xiàng)、注意事項(xiàng) 以下操作步驟適于從TAE或TBE瓊脂糖泳膠中提取DNA。從其它緩沖液電泳膠中提取DNA時(shí),加入DE-B溶液后溶液的pH應(yīng)調(diào)整到65以下(步驟C)。 在步驟A中,將疑膠切成細(xì)小的碎塊可大大縮短凝膠熔化時(shí) 間(線型DNA長(zhǎng)時(shí)間暴露在高溫條件下易于水解),從而提高回收率。勿將含DNA的凝膠長(zhǎng)時(shí)間地暴露在紫外燈下,減少紫外線對(duì)DNA造成的損傷。 在步驟B中凝膠必須完全熔化,否則將嚴(yán)重影響DNA回收率。 如采用離心法,在步驟5B中吸回濾液到DNA制備管中再吸附一次
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