微生物分類與鑒定

1、第九章第九章微生物的分類和鑒定微生物的分類和鑒定 地球上的物種估計(jì)大約有150萬(wàn)，其中微生物超過(guò)10萬(wàn)種，而且其數(shù)目還在不斷增加。生物分類的二種基本原則：生物分類的二種基本原則：a）根據(jù)表型表型(phenetic)特征的相似程度分群歸類，這種 表型分類重在應(yīng)用，不涉及生物進(jìn)化或不以反映生 物親緣關(guān)系為目標(biāo)。b）按照生物系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性水平來(lái)分群歸類，其目標(biāo) 是探尋各種生物之間的進(jìn)化關(guān)系，建立反映生物系 統(tǒng)發(fā)育的分類系統(tǒng)。從進(jìn)化論誕生以來(lái)，已經(jīng)成生物學(xué)家普遍接受的分類原則生物系統(tǒng)學(xué)生物系統(tǒng)學(xué)(systematics)(systematics)章節(jié)內(nèi)容章節(jié)內(nèi)容第一節(jié)第一節(jié) 通用分類單元通用分類單元系

2、統(tǒng)分類單元、種的概念、學(xué)名、亞種第二節(jié)第二節(jié) 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位生物界級(jí)分類學(xué)說(shuō)、五界系統(tǒng)、三域?qū)W說(shuō)及其發(fā)展、微生物的進(jìn)化第三節(jié)第三節(jié) 各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要原核微生物分類系統(tǒng)綱要、真菌的分類系統(tǒng)綱要第四節(jié)第四節(jié) 微生物的鑒定微生物的鑒定經(jīng)典分類鑒定方法、現(xiàn)代分類鑒定方法。 第一節(jié)第一節(jié) 通用分類單元通用分類單元 分類是認(rèn)識(shí)客觀事物的一種基本方法。我們分類是認(rèn)識(shí)客觀事物的一種基本方法。我們要認(rèn)識(shí)、研究和利用各種微生物資源也必須對(duì)它要認(rèn)識(shí)、研究和利用各種微生物資源也必須對(duì)它們進(jìn)行分類。們進(jìn)行分類。分類學(xué)涉及三個(gè)相互依存又有區(qū)別的組成部分：鑒定鑒

3、定分類、分類、命名、命名、命名命名(nomenclature)：鑒定鑒定(identification或或determination)：分類分類(classification)：一、分類單元及其等級(jí)一、分類單元及其等級(jí)界界 （Kingdom） (Regnum)門(mén)門(mén) （Phylum） (Phylum)綱綱（Class） (Classis)目目（Order） (Ordo)科科（Family） (Familia)屬屬（Genus） (Genus)種種（Species） (Species)根據(jù)Carl Woese的理論，現(xiàn)在還在界界之上之上使用域域(domain) （把全部生物先分為古生菌域、細(xì)菌域和

4、真核生物域，域下面再分界。）常用的細(xì)菌分類學(xué)術(shù)語(yǔ)：1）培養(yǎng)物）培養(yǎng)物(culture)：2）菌株）菌株(strain)：從自然界中分離得到的任何一種微生物的純從自然界中分離得到的任何一種微生物的純培養(yǎng)物都可以稱為微生物的一個(gè)菌株；用實(shí)驗(yàn)方法培養(yǎng)物都可以稱為微生物的一個(gè)菌株；用實(shí)驗(yàn)方法( (如通過(guò)誘變?nèi)缤ㄟ^(guò)誘變) ) 所獲得的某一菌株的變異型，也可以稱為一個(gè)新的菌株，以便所獲得的某一菌株的變異型，也可以稱為一個(gè)新的菌株，以便與原來(lái)的菌株相區(qū)別。與原來(lái)的菌株相區(qū)別。Bacillus subtilisASI.398Bacillus subtilisBF7658生產(chǎn)蛋白酶生產(chǎn)淀粉酶3）型）型(form

5、或或type)：常指亞種以下的細(xì)分。當(dāng)同種或同亞種不同菌株之間的性狀差異，不足以分為新的亞種時(shí)，可以細(xì)分為不同的型。4）種（）種（species）： 微生物的種：具有高度特征相似性的菌株群，這個(gè)菌株群與其微生物的種：具有高度特征相似性的菌株群，這個(gè)菌株群與其 他類群的菌株有很明顯的區(qū)別。他類群的菌株有很明顯的區(qū)別。菌株與型的區(qū)別菌株與型的區(qū)別：菌株之間不存在鑒別性特征的差異，命名不同的菌株無(wú)需分類學(xué)菌株之間不存在鑒別性特征的差異，命名不同的菌株無(wú)需分類學(xué)依據(jù)，依據(jù)，不同型的細(xì)菌之間存在鑒別性特征的差異，命名或鑒定不同的型不同型的細(xì)菌之間存在鑒別性特征的差異，命名或鑒定不同的型必需有分類學(xué)依據(jù)。

6、必需有分類學(xué)依據(jù)。二、微生物的命名雙名法，由二個(gè)拉丁字或希臘字或拉丁化了的其它文字組成，一般用斜體表示一般用斜體表示屬名在前，一般用拉丁字名詞表示，字首字母大寫(xiě)種名在后，常用拉丁文形容詞表示，全部小寫(xiě)若所分離的菌株只鑒定到屬，而未鑒定到種，可用若所分離的菌株只鑒定到屬，而未鑒定到種，可用sp來(lái)表示來(lái)表示，例如例如 Bacillus sp由于細(xì)菌分類單元的劃分缺乏一個(gè)易于操作的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)，為了減少因采用不同標(biāo)準(zhǔn)界定分類單元所造成的混亂，細(xì)菌系統(tǒng)分類也像其他生物分類一樣采用“模式概念”種和亞種指定模式菌株（type strain）；亞屬和屬指定模式種（type species）；屬以上至目級(jí)分類單元

7、指定模式屬（type genus）；模式菌株應(yīng)送交菌種保藏機(jī)構(gòu)保藏，以便備查考和索取。第二節(jié)第二節(jié) 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位一、生物的界級(jí)分類學(xué)說(shuō)一、生物的界級(jí)分類學(xué)說(shuō)兩界系統(tǒng)三界系統(tǒng)四界系統(tǒng)五界系統(tǒng)六界系統(tǒng)利用16SrRNA建立分子進(jìn)化樹(shù)的美國(guó)科學(xué)家 Carl Woese 二、三域?qū)W說(shuō)及其發(fā)展二、三域?qū)W說(shuō)及其發(fā)展三、rRNA和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)1. rRNA的順序和進(jìn)化培養(yǎng)微生物培養(yǎng)微生物提取并純化提取并純化rRNArRNA序列測(cè)定序列測(cè)定分析比較分析比較微生物之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系微生物之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系2. 特征序列或序列印記（signature sequence）通過(guò)對(duì)通過(guò)對(duì)r R

8、NA全序列資料的分析比較（特別是全序列資料的分析比較（特別是采用計(jì)算機(jī)）發(fā)現(xiàn)的在不同采用計(jì)算機(jī)）發(fā)現(xiàn)的在不同種群水平上的特種群水平上的特異特征性寡核苷酸序列，或異特征性寡核苷酸序列，或在某些特定的序在某些特定的序列位點(diǎn)上出現(xiàn)的單堿基印記列位點(diǎn)上出現(xiàn)的單堿基印記。特征序列特征序列有助于有助于迅速確定某種微生物的迅速確定某種微生物的分類歸屬，或建立新的分類單位。分類歸屬，或建立新的分類單位。3. 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(phylogenetic tree) 通過(guò)比較通過(guò)比較生物大分子序列差異的數(shù)值構(gòu)生物大分子序列差異的數(shù)值構(gòu)建的系統(tǒng)樹(shù)稱為分子系統(tǒng)樹(shù)，其特點(diǎn)是建的系統(tǒng)樹(shù)稱為分子系統(tǒng)樹(shù)，其特點(diǎn)是用一用一種樹(shù)狀分枝

9、的圖型來(lái)概括各種種樹(shù)狀分枝的圖型來(lái)概括各種( (類類) )生物之間生物之間的親緣關(guān)的親緣關(guān)系。系。16 S r RNA系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)1）生命的第三種形式古生菌動(dòng)物界和植物界動(dòng)物界和植物界原核生物和真核生物（原核生物和真核生物（20世紀(jì)世紀(jì)60年代）年代）古細(xì)菌古細(xì)菌(archaebacteria)真細(xì)菌真細(xì)菌( (Eubacteria)真核生物真核生物(Eukaryotes)（1977，Carl Woese）Bacteria(細(xì)菌細(xì)菌)Archaea(古生菌古生菌)Eukarya(真核生物真核生物)（1990，Carl Woese）原核生物原核生物界（界（Kingdom）域（域（domain）2）

10、建立16 S r RNA系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的意義a）使生物進(jìn)化的研究范圍真正覆蓋所有生物類群；）使生物進(jìn)化的研究范圍真正覆蓋所有生物類群；傳統(tǒng)生物進(jìn)化研究主要基于復(fù)雜的形態(tài)學(xué)和化石記載，因此多限傳統(tǒng)生物進(jìn)化研究主要基于復(fù)雜的形態(tài)學(xué)和化石記載，因此多限于研究后生生物，而后者僅占整個(gè)生物進(jìn)化歷程的于研究后生生物，而后者僅占整個(gè)生物進(jìn)化歷程的1/5b）提出了一種全新的正確衡量生物間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的方法；c）對(duì)探索生命起源及原始生命的發(fā)育進(jìn)程提供了線索和理論依據(jù)；d）突破了細(xì)菌分類僅靠形態(tài)學(xué)和生理生化特性的限制，建立了全 新的分類理論；e）為微生物生物多樣性和微生物生態(tài)學(xué)研究建立了全新的研究理 論和研究方法，特

11、別是不經(jīng)培養(yǎng)直接對(duì)生態(tài)環(huán)境中的微生物進(jìn) 行研究。不可培養(yǎng)微生物（uncultured microorganisms） 從環(huán)境中直接分離并克隆從環(huán)境中直接分離并克隆rRNA并分析其序列并分析其序列和在分子進(jìn)化樹(shù)上的位置等方法而發(fā)現(xiàn)的的目前尚和在分子進(jìn)化樹(shù)上的位置等方法而發(fā)現(xiàn)的的目前尚不能在人工條件下獲得培養(yǎng)的微生物。不能在人工條件下獲得培養(yǎng)的微生物。不可培養(yǎng)的微生物與生物多樣性3）三（界）三（界)域生物的主要特征域生物的主要特征三界理論雖然是根據(jù)三界理論雖然是根據(jù)16SrRNA16SrRNA序列的比序列的比較提出的，但其他特征的比較研究結(jié)果較提出的，但其他特征的比較研究結(jié)果也在一定程度上支持了三

12、也在一定程度上支持了三界生物的劃分。界生物的劃分。 隨著越來(lái)越多的微生物的全基因組序列的測(cè)定，隨著越來(lái)越多的微生物的全基因組序列的測(cè)定，人們發(fā)現(xiàn)生物在進(jìn)化中存在著非常廣泛的水平基因人們發(fā)現(xiàn)生物在進(jìn)化中存在著非常廣泛的水平基因轉(zhuǎn)移現(xiàn)象，很多科學(xué)家都認(rèn)為不能僅靠對(duì)轉(zhuǎn)移現(xiàn)象，很多科學(xué)家都認(rèn)為不能僅靠對(duì)16SrRNA的序列比較來(lái)確定生物之間的親緣關(guān)系，還必須借的序列比較來(lái)確定生物之間的親緣關(guān)系，還必須借助各種信息對(duì)這個(gè)進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行改進(jìn)。助各種信息對(duì)這個(gè)進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行改進(jìn)。Carl Woose的rRNA進(jìn)化樹(shù)完美無(wú)缺？ 一項(xiàng)新的研究指出，一項(xiàng)新的研究指出，在我們體內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞中有在我們體內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞中有 40

13、 個(gè)左右的細(xì)菌基因，這個(gè)由細(xì)菌到人類寄主的個(gè)左右的細(xì)菌基因，這個(gè)由細(xì)菌到人類寄主的所謂的所謂的“橫向轉(zhuǎn)移橫向轉(zhuǎn)移(lateral transfer)”給進(jìn)化生物學(xué)給進(jìn)化生物學(xué)帶來(lái)了極大的問(wèn)題帶來(lái)了極大的問(wèn)題。 2001年5月18日 美國(guó)科學(xué)周刊292卷 第5520期人類基因組中的細(xì)菌基因？人類基因組中的細(xì)菌基因？第三節(jié)第三節(jié) 各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要二 、真菌（菌物）分類系統(tǒng)簡(jiǎn)介真菌（菌物）分類系統(tǒng)簡(jiǎn)介一、 原核微生物分類系統(tǒng)原核微生物分類系統(tǒng)一、 原核微生物分類系統(tǒng)原核微生物分類系統(tǒng)（一）伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)(Bergeys Manual of Determina

14、tive Bacteriology)美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)伯杰氏手冊(cè)伯杰氏手冊(cè): 是目前進(jìn)行細(xì)菌分類、鑒定的最重要參考書(shū)，是目前進(jìn)行細(xì)菌分類、鑒定的最重要參考書(shū)，其特點(diǎn)是描述非常詳細(xì)，包括對(duì)細(xì)菌各個(gè)屬種的特征及進(jìn)行其特點(diǎn)是描述非常詳細(xì)，包括對(duì)細(xì)菌各個(gè)屬種的特征及進(jìn)行鑒定所需做的實(shí)驗(yàn)的具體方法。鑒定所需做的實(shí)驗(yàn)的具體方法。1923年以來(lái)已出至第九版年以來(lái)已出至第九版(1994)；第九版伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)設(shè)立第九版伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)設(shè)立35個(gè)群，將古細(xì)菌部個(gè)群，將古細(xì)菌部改編為改編為5個(gè)群，全書(shū)描寫(xiě)了約個(gè)群，全

15、書(shū)描寫(xiě)了約500個(gè)屬。個(gè)屬。劃分為四大類：劃分為四大類： 第一類第一類 具細(xì)胞壁的革蘭氏陰性真細(xì)菌具細(xì)胞壁的革蘭氏陰性真細(xì)菌 第二類第二類 具細(xì)胞壁的革蘭氏陽(yáng)性真細(xì)菌具細(xì)胞壁的革蘭氏陽(yáng)性真細(xì)菌 第三類第三類 無(wú)細(xì)胞壁的真細(xì)菌無(wú)細(xì)胞壁的真細(xì)菌 第四類第四類 古細(xì)菌古細(xì)菌 伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)（二）伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)（二）伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)(Bergeys Manual of Systematic Bacteriology)第一版第一版 1984年問(wèn)世，至年問(wèn)世，至1989年出齊，共年出齊，共4卷。卷。第二版第二版 由由George Garrity主編分為主編分為5卷，將從卷，

16、將從2000年起年起陸續(xù)出版。這一版納入了研究核糖體陸續(xù)出版。這一版納入了研究核糖體RNA測(cè)序所產(chǎn)生測(cè)序所產(chǎn)生的許發(fā)育的許發(fā)育)分類系統(tǒng)。分類系統(tǒng)。伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第二版 分古細(xì)菌和真細(xì)菌分古細(xì)菌和真細(xì)菌2個(gè)界，下設(shè)18門(mén)、27綱、73目、186科，包括870余屬和4900多個(gè)種。界界：古細(xì)菌：古細(xì)菌(Archaeota)(Archaeota) 部部1 1：熱變形菌、硫化葉菌、嗜壓菌：熱變形菌、硫化葉菌、嗜壓菌(Thermoprotei(Thermoprotei、SulfolobiSulfolobi、BarophilesBarophiles，2121屬屬3636種種) ) 部部2 2：產(chǎn)甲

17、烷菌：產(chǎn)甲烷菌(Methanogens(Methanogens，2121屬屬9797種種) ) 部部3 3：鹽桿菌：鹽桿菌(Halobacteria(Halobacteria，1414屬屬5050種種) ) 部部4 4：熱原體：熱原體(Thermoplasma(Thermoplasma，2 2屬屬4 4種種) ) 部部5 5：熱球菌：熱球菌(Thermococci(Thermococci，5 5屬屬1919種種) ) 界界：真細(xì)菌：真細(xì)菌(Bacteria)部部6 6：產(chǎn)液菌：產(chǎn)液菌(Aquifex)(Aquifex)和相關(guān)細(xì)菌和相關(guān)細(xì)菌(3(3屬屬5 5種種) )部部7 7：棲熱袍菌：棲熱袍

18、菌(Thermotoga)(Thermotoga)和和GeotogasGeotogas，9 9屬屬2222種種) )部部8 8：異常球菌：異常球菌(Deinococci(Deinococci，1 1屬屬8 8種種) ) 部部9 9：棲熱菌和歸屬不明的屬：棲熱菌和歸屬不明的屬(Thermi(Thermi，1010屬屬2121種種) ) 部部1010：產(chǎn)菌黃：產(chǎn)菌黃(Chrysiongenes,1(Chrysiongenes,1屬屬2 2種種) ) 部部1111：綠屈撓菌和滑柱菌：綠屈撓菌和滑柱菌(Chloroflexi(Chloroflexi和和HerpetosiphonsHerpetosiph

19、ons，5 5屬屬1111種種) ) 界界：真細(xì)菌：真細(xì)菌(Bacteria) 部12：熱微菌(Thermomicrobia,1屬2種) 部13：藍(lán)細(xì)菌(Cyanobacteria，69屬73種) 部14：綠菌(Chlorobia，6屬17種) 部15：-變形細(xì)菌(-Proteobacteria，117屬392種) 部16：-變形細(xì)菌(-Proteobacteria，53屬204種) 界界：真細(xì)菌：真細(xì)菌(Bacteria)部部1717：-變形細(xì)菌(-Proteobacteria，150屬854種) 部部1818：-變形細(xì)菌(-Proteobacteria，39屬128種)部部1919：-變形

20、細(xì)菌(-Proteobacteria，6屬56種) 部部2020：梭菌(Clostridia)和相關(guān)細(xì)菌(73屬403種) 部部2121：柔膜菌(Mollicutes，10屬191種) 部部2222：芽胞桿菌和乳桿菌(Bacilli和Lactobacilli，55屬535種)界界：真細(xì)菌：真細(xì)菌(Bacteria)部部2323：放線細(xì)菌(Actinobacteria，117屬，1371種) 部部2424：浮霉?fàn)罹鸵略w(Planctomycetes和Chlamydia，5屬14種) 部部2626：絲狀桿菌(Fibrobacters，3屬5種) 部部2727：擬桿菌(Bacteroides，2

21、0屬130種)界界：真細(xì)菌：真細(xì)菌(Bacteria)部部2828：黃桿菌(Flavobacteria，15屬72種)部部2929：鞘氨醇桿菌(Sphingobacteria，22屬76訓(xùn))部部3030：梭形菌(Fusoforms，6屬29種) 部部3131：疣微菌和相關(guān)細(xì)菌(Verrucomicrobium，2屬5種) 二 真菌（菌物）分類系統(tǒng)簡(jiǎn)介真菌（菌物）分類系統(tǒng)簡(jiǎn)介Ainsworth et al(1973) V.Arx (1981) 真菌字典（真菌字典（1983）Kendrick (1992) 真菌字典（真菌字典（1995）Alexopoulos&Mins(1996)黏菌門(mén)：黏

22、菌綱黏菌門(mén)：黏菌綱 根腫菌綱根腫菌綱真菌門(mén)：真菌門(mén)：鞭毛菌亞門(mén)：壺菌綱鞭毛菌亞門(mén)：壺菌綱 絲壺菌綱絲壺菌綱 卵菌綱卵菌綱接合菌亞門(mén)：接合菌綱接合菌亞門(mén)：接合菌綱 毛菌綱毛菌綱子囊菌亞門(mén)：半子囊菌綱子囊菌亞門(mén)：半子囊菌綱 不整囊菌綱不整囊菌綱 核菌綱核菌綱 盤(pán)菌綱盤(pán)菌綱 腔菌綱腔菌綱 蟲(chóng)囊菌綱蟲(chóng)囊菌綱擔(dān)子菌亞門(mén)擔(dān)子菌亞門(mén) ：冬孢菌綱：冬孢菌綱 層菌綱層菌綱 腹菌綱腹菌綱半知菌亞門(mén)：半知菌亞門(mén)： 芽孢綱芽孢綱 絲孢綱絲孢綱 腔孢綱腔孢綱 真真 菌菌 界界（1995）第四節(jié)第四節(jié) 微生物分類鑒定的方法微生物分類鑒定的方法生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)分子生物學(xué)指標(biāo)分子生物學(xué)指標(biāo) 微型、簡(jiǎn)便、快

23、速或自動(dòng)化鑒定技術(shù)微型、簡(jiǎn)便、快速或自動(dòng)化鑒定技術(shù)細(xì)菌的數(shù)值分類細(xì)菌的數(shù)值分類 形態(tài)學(xué)特征形態(tài)學(xué)特征生理學(xué)特征生理學(xué)特征生態(tài)學(xué)生態(tài)學(xué)特征 從不同層次，用不同學(xué)科的技術(shù)方法來(lái)研究和比較不同微生物的細(xì)胞、細(xì)胞組分或代謝產(chǎn)物，從中發(fā)現(xiàn)的反映微生物類群特征的資料。生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)一、形態(tài)學(xué)特征培養(yǎng)特征、培養(yǎng)特征、運(yùn)動(dòng)性、運(yùn)動(dòng)性、特殊的細(xì)胞結(jié)構(gòu)、特殊的細(xì)胞結(jié)構(gòu)、細(xì)胞形態(tài)及其染色特性、細(xì)胞形態(tài)及其染色特性、等等等等微生物分類和鑒定的重要依據(jù)之一：微生物分類和鑒定的重要依據(jù)之一：a）易于觀察和比較，尤其是真核微生物和具有特殊）易于觀察和比較，尤其是真核微生物和具有特殊 形態(tài)結(jié)構(gòu)的細(xì)菌；形

24、態(tài)結(jié)構(gòu)的細(xì)菌；b）許多形態(tài)學(xué)特征依賴于多基因的表達(dá)，具有相對(duì)）許多形態(tài)學(xué)特征依賴于多基因的表達(dá)，具有相對(duì) 的穩(wěn)定性；的穩(wěn)定性；二、生理生化特征二、生理生化特征與微生物的酶和調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的本質(zhì)和活性直接相關(guān)；代謝產(chǎn)物等代謝產(chǎn)物等營(yíng)養(yǎng)類型；營(yíng)養(yǎng)類型；與氧的關(guān)系；與氧的關(guān)系；對(duì)溫度的適應(yīng)性；對(duì)溫度的適應(yīng)性；對(duì)對(duì)pH的適應(yīng)性；的適應(yīng)性；對(duì)滲透壓的適應(yīng)性；對(duì)滲透壓的適應(yīng)性；酶及蛋白質(zhì)都是基因產(chǎn)物；對(duì)微生物生理生化特征的比較也是對(duì)微生物基因組的間接比較；測(cè)定生理生化特征比直接分析基因組要容易得多；1 1、 API API 細(xì)菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)細(xì)菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)2 2、 Enterotube Enterotube

25、系統(tǒng)系統(tǒng)3 3、 Biolog Biolog 全自動(dòng)或手動(dòng)細(xì)菌鑒定系統(tǒng)全自動(dòng)或手動(dòng)細(xì)菌鑒定系統(tǒng) 微型、簡(jiǎn)便、快速或自動(dòng)化鑒定技術(shù)微型、簡(jiǎn)便、快速或自動(dòng)化鑒定技術(shù)1、 API 細(xì)菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)細(xì)菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)菌種菌種基本培養(yǎng)基基本培養(yǎng)基（液體）（液體） 菌懸液菌懸液檢測(cè)、編碼、查表、鑒定檢測(cè)、編碼、查表、鑒定適用于適用于APIAPI鑒定細(xì)鑒定細(xì)菌有菌有700700多種多種Analytica Products INC的簡(jiǎn)稱。法國(guó)生物- 梅里埃公司生產(chǎn)的細(xì)菌數(shù)值分類分析鑒定系統(tǒng)。約有1 000 種生化反應(yīng),可鑒定的細(xì)菌大于550 種。目前中國(guó)各級(jí)疾病預(yù)防控制機(jī)構(gòu)在細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)中比較多地應(yīng)用了此項(xiàng)技術(shù)

26、2、Enterotube 系統(tǒng)系統(tǒng) 不同培養(yǎng)基分裝不同小槽中，同不同培養(yǎng)基分裝不同小槽中，同步接種，培養(yǎng)后檢測(cè)、查表、鑒定。步接種，培養(yǎng)后檢測(cè)、查表、鑒定。3 3、BiologBiolog全自動(dòng)或手動(dòng)細(xì)菌鑒定系統(tǒng)全自動(dòng)或手動(dòng)細(xì)菌鑒定系統(tǒng) 在在96孔的細(xì)菌培養(yǎng)板上檢測(cè)微生物對(duì)孔的細(xì)菌培養(yǎng)板上檢測(cè)微生物對(duì)不同發(fā)酵性碳源利用情況進(jìn)行的分類鑒定。不同發(fā)酵性碳源利用情況進(jìn)行的分類鑒定。自動(dòng)化、快速自動(dòng)化、快速 可鑒定細(xì)菌有可鑒定細(xì)菌有11401140多種、酵母菌多種、酵母菌267267種、目種、目前已經(jīng)可用于絲狀真菌。前已經(jīng)可用于絲狀真菌。每個(gè)孔中含有每個(gè)孔中含有不同的底物不同的底物菌懸液或菌懸液或無(wú)菌

27、水無(wú)菌水分子生物學(xué)指標(biāo)分子生物學(xué)指標(biāo) DNA堿基因組成是各種生物一個(gè)穩(wěn)定的特征，即使個(gè)別基因突變，堿基組成也不會(huì)發(fā)生明顯變化。1. DNA的堿基組成(G+Cmol%) 分類學(xué)上，用分類學(xué)上，用G+C占全部堿基的克分占全部堿基的克分子百分?jǐn)?shù)子百分?jǐn)?shù)(G+Cmol%)來(lái)表示各類生物的來(lái)表示各類生物的DNA堿基因組成特征。堿基因組成特征。 每個(gè)生物種都有特定的GC%范圍，因此 可以作為分類鑒定的指標(biāo)。細(xì)菌的GC%范圍為25-75%，變化范圍最大，因此更適合于細(xì)菌的分類鑒定。 GC%測(cè)定主要用于對(duì)表型特征難區(qū)分的細(xì)菌 作出鑒定，并可檢驗(yàn)表型特征分類的合理性， 從分子水平上判斷物種的親緣關(guān)系。G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的含量的比較主要用于分類鑒定中的否定否定但具有相似但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它們含量的生物并不