分子生物學(xué)染色體與DNA

1、1會(huì)計(jì)學(xué)分子生物學(xué)染色體與分子生物學(xué)染色體與DNA（一）細(xì)胞周期牛牛文庫文檔分享（二）染色體與染色質(zhì)染色體（染色體（chromosome）是細(xì)胞在有絲分裂時(shí)遺傳物質(zhì)是細(xì)胞在有絲分裂時(shí)遺傳物質(zhì)存在的特定形式，是間期細(xì)胞染色質(zhì)結(jié)構(gòu)緊密包裝的結(jié)存在的特定形式，是間期細(xì)胞染色質(zhì)結(jié)構(gòu)緊密包裝的結(jié)果。果。真核生物的染色體在細(xì)胞生活周期的大部分時(shí)間里都是真核生物的染色體在細(xì)胞生活周期的大部分時(shí)間里都是以染色質(zhì)以染色質(zhì)(chromatin)的形式存在的。的形式存在的。染色質(zhì)是一種纖維狀結(jié)構(gòu)，叫做染色質(zhì)絲，它是由最基染色質(zhì)是一種纖維狀結(jié)構(gòu)，叫做染色質(zhì)絲，它是由最基本的單位本的單位核小體核小體(nucleosom

2、e)成串排列而成的。成串排列而成的。牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享n大腸桿菌的染色體特點(diǎn)： 閉環(huán)DNA，長(zhǎng)度約4.6Mb，集中分布在成為“擬核”（nucleoid）的區(qū)域內(nèi)，在正常生長(zhǎng)情況下DNA保持連續(xù)復(fù)制牛牛文庫文檔分享Bacterial DNA is compacted in a structure called the nucleoid, which occupies a large fraction of the bacterial cells volume 牛牛文庫文檔分享DNA結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域?qū)⒋竽c桿菌DNA與大多數(shù)結(jié)合蛋白分離開來，可觀察到由50100個(gè)環(huán)或結(jié)構(gòu)域組成，這些環(huán)或結(jié)

3、構(gòu)域的末端被與細(xì)胞膜部分連接的蛋白質(zhì)而固定牛牛文庫文檔分享大腸桿菌結(jié)構(gòu)域組成大腸桿菌結(jié)構(gòu)域組成牛牛文庫文檔分享基因組超螺旋基因組超螺旋電鏡結(jié)構(gòu)顯示，就整體而言，大腸桿菌的基因組是由大量超螺旋的結(jié)構(gòu)域構(gòu)成的牛牛文庫文檔分享組蛋白： H1 H2A H2B H3 H4非組蛋白核小體DNA蛋白質(zhì)染色體真核生物染色體的組成牛牛文庫文檔分享1、組蛋白 上海生化所分子遺傳學(xué)1998年試題： 在真核生物核內(nèi)。五種組蛋白（H1 H2A H2B H3 和H4）在進(jìn)化過程中，H4極為保守，H2A最不保守（ ）牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享簡(jiǎn)述真核生物染色體上組蛋白的種類，組蛋白修飾的種類及其生物學(xué)意義中國科學(xué)院2

4、003年碩士研究生入學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)試題牛牛文庫文檔分享所有這些修飾作用都有一個(gè)所有這些修飾作用都有一個(gè)共同共同的特點(diǎn)，即降低組蛋白的特點(diǎn)，即降低組蛋白所攜帶的正電荷。所攜帶的正電荷。這些組蛋白修飾的意義：一是改變?nèi)旧w的結(jié)構(gòu)，直接影響轉(zhuǎn)錄活性；二是核小體表面發(fā)生改變，使其他調(diào)控蛋白易于和染色質(zhì)相互接觸，從而間接影響轉(zhuǎn)錄活性。組蛋白的可修飾性牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享融解溫度（Melting temperature Tm ) 變性過程紫外線吸收值增加的中點(diǎn)稱為融解溫度。 生理?xiàng)l件下為85-95影響因素：G+C含量，pH值，離子強(qiáng)度，尿素，甲跣胺等牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛

5、文庫文檔分享C值矛盾牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享1、定義：用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位，是由DNA鏈纏繞一個(gè)組蛋白核構(gòu)成的。 牛牛文庫文檔分享核心顆粒、連接區(qū)DNA牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享中國科學(xué)院上海生化與細(xì)胞所2002年招收碩士研究生分子遺傳學(xué)入學(xué)考試：簡(jiǎn)述真核細(xì)胞內(nèi)核小體與核小體核心顆粒的結(jié)構(gòu)。 牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享6.8:140:11000:18000:1DNA double helixNucleosome (10 nm fiber)30 nm FiberLoops ILoops IIchromosome牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分

6、享X174 D-E-J-F-G-H mRNA 蛋白J、F、G H D EE.coli 色氨酸操縱子 9個(gè)順反子 9個(gè)酶1、原核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享rRNA、tRNA一般是不編碼蛋白質(zhì)的序列，在調(diào)控基因表達(dá)中起重要作用根據(jù) DNA復(fù)性動(dòng)力學(xué)研究，DNA序列可以分成哪幾種類型？并加以舉例說明。(2001年上海生化所）牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享1、 DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享 牛牛文庫文檔分享繞DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽（溝），寬的溝稱為大溝，窄溝稱為小溝。大溝，小溝都、是由

7、于堿基對(duì)堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。 牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享ABZ牛牛文庫文檔分享ABZ牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享拓?fù)洚悩?gòu)酶or溴化乙錠拓?fù)洚悩?gòu)酶or溴化乙錠DNA扭曲與雙螺旋相同（擰緊）DNA扭曲與雙螺旋相反（松開）負(fù)超螺旋松弛DNA正超螺旋牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享三、DNA的復(fù)制DNARNA蛋白質(zhì)復(fù)制轉(zhuǎn)錄翻譯逆轉(zhuǎn)錄RNA復(fù)制牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享（一）DNA的半保留復(fù)制（semi-conservative replication）牛牛文庫文檔分享Semi-conservative Conse

8、rvative Dispersive牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享Matthew Messelson Franklin Stahl牛牛文庫文檔分享“Heavy” DNA“Hybrid” DNA“l(fā)ight” DNA “Hybrid” DNA牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享。酶。牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享性質(zhì) 聚合酶聚合酶 聚合酶3 5 外切活性+ + + +5 3 外切活性+-5 3 聚合活性+ 中+ 很低+ 很高新生鏈合成-+主要是對(duì)主要是對(duì)DNADNA損傷的修損傷的修復(fù)；以及在復(fù)；以及在DNADNA復(fù)制時(shí)復(fù)制時(shí)切除切除RNARNA引物并填補(bǔ)其引物并填補(bǔ)其留下的空隙。留下的空隙。修復(fù)

9、紫外修復(fù)紫外光引起的光引起的DNADNA損傷損傷DNA DNA 復(fù)制的主要復(fù)制的主要聚合酶，還具有聚合酶，還具有3 3-5-5 外切酶的外切酶的校對(duì)功能，提高校對(duì)功能，提高DNADNA復(fù)制的保真性復(fù)制的保真性牛牛文庫文檔分享引物引物 合成合成修復(fù)修復(fù)作用作用線粒體線粒體DNADNA的復(fù)制的復(fù)制核核DNADNA的復(fù)制的復(fù)制？牛牛文庫文檔分享過程中起重要作用過程中起重要作用3535OHOHP P牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享reprep蛋白沿蛋白沿3 3 5 5移動(dòng)，而解螺旋酶移動(dòng)，而解螺旋酶I I、IIII、IIIIII沿沿5 5 3 3移動(dòng)。移動(dòng)。牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔

10、分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享1 1、雙鏈的解開、雙鏈的解開 DNA的復(fù)制有特定的起始位點(diǎn)，叫做復(fù)制原點(diǎn)。 ori(或o）、富含A、T的區(qū)段?；靖拍睿?上海生化所1998年分子遺傳學(xué)試題：真核生物復(fù)制起始點(diǎn)的特征包括（ ）A富含GC區(qū) B富含AT區(qū) C Z DNA D無明顯特征牛牛文庫文檔分享 從復(fù)制原點(diǎn)到終點(diǎn)，組成一個(gè)復(fù)制單位，叫從復(fù)制原點(diǎn)到終點(diǎn)，組成一個(gè)復(fù)制單位，叫復(fù)制子復(fù)制子復(fù)制時(shí)，解鏈酶等先將DNA的一段雙鏈解開，形成復(fù)制點(diǎn)，這個(gè)復(fù)制點(diǎn)的形狀象一個(gè)叉子，故稱為復(fù)制叉牛牛文庫文檔分享復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制叉牛牛文庫文檔分享單單起點(diǎn)、起點(diǎn)、雙雙向等速向等速多多起點(diǎn)、起點(diǎn)、雙雙向等速

11、向等速牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享大約20個(gè)DnaA蛋白在ATP的作用下與oriC處的4個(gè)9bp保守序列相結(jié)合牛牛文庫文檔分享在HU蛋白和ATP的共同作用下,Dna復(fù)制起始復(fù)合物使3個(gè)13bp直接重復(fù)序列變性,形成開鏈牛牛文庫文檔分享解鏈酶六體分別與單鏈DNA相結(jié)合(需DnaC幫助),進(jìn)一步解開DNA雙鏈牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享2 2、RNARNA引物的合成引物的合成DnaB蛋白活化引物合成酶，引發(fā)RNA引物的合成。引物長(zhǎng)度約為幾個(gè)至10個(gè)核苷酸，基因組DNA復(fù)制時(shí)，先導(dǎo)鏈的引物是DNA，后隨鏈的引物是RNA (-) 2002年上海生化與細(xì)胞所牛牛文庫文檔分享在DNA復(fù)制時(shí)，合成方

12、向與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致并連續(xù)合成的鏈為前導(dǎo)鏈；合成方向與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反，形成許多不連續(xù)的片段，最后再連成一條完整的DNA鏈為滯后鏈。3 3、DNADNA鏈的延伸鏈的延伸牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享華中科技大學(xué)2004年生物化學(xué)與分子生物學(xué)碩士研究生入學(xué)試題名詞解釋 ：岡崎片段（3分）武漢大學(xué)2003年碩士研究生入學(xué)分子生物學(xué)試題：Replicon、 semi-conservative replication 牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享4 4、切除、切除RNARNA引物，填補(bǔ)缺口，連接相鄰的引物，填補(bǔ)缺口，連接相鄰的DNADNA片段片段 （復(fù)制終止）（復(fù)制終止）

13、在DNA聚合酶催化下切除RNA引物；留下的空隙由DNA聚合酶催化合成一段DNA填補(bǔ)上；在DNA連接酶作用下，連接相鄰的DNA鏈牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享制叉;牛牛文庫文檔分享單向復(fù)制的特殊方式如：動(dòng)物線粒體DNA牛牛文庫文檔分享、牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享DNA修復(fù)系統(tǒng)功能錯(cuò)配修復(fù)恢復(fù)錯(cuò)配堿基切除修復(fù)切除突變的堿基核甘酸切除修復(fù)修復(fù)被破壞的DNADNA直接修復(fù)修復(fù)嘧啶二體或甲基化DNA 扼要說明細(xì)胞中DNA修復(fù)系統(tǒng)有哪幾種（8分） 中國科學(xué)院2002年碩士學(xué)位研究生入學(xué)分子遺傳學(xué)試題牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享發(fā)現(xiàn)錯(cuò)配堿基在水解ATP的作用下，MutS， Mut

14、L與堿基錯(cuò)配點(diǎn)的DNA雙鏈結(jié)合MutS-MutL在DNA雙鏈上移動(dòng)，發(fā)現(xiàn)甲基化DNA后由MutH切開非甲基化的子鏈牛牛文庫文檔分享錯(cuò)配堿基位于切口3下游端，錯(cuò)配堿基位于切口5上游端，牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享.糖甘水解酶識(shí)別改變了的堿基，把堿基從N-糖苷鍵處切下來，在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn)，統(tǒng)稱為AP位點(diǎn)。牛牛文庫文檔分享由AP磷酸內(nèi)切酶將受損核甘酸的糖甘-磷酸鍵切開牛牛文庫文檔分享。DNA連接酶連接利用DNA聚合酶I切除損傷部位，補(bǔ)上核苷酸牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享識(shí)別損傷部位損傷的兩邊切除幾個(gè)核苷酸DNA 聚合酶以母鏈為模板復(fù)制合成新子

15、鏈DNA連接酶將切口補(bǔ)平牛牛文庫文檔分享在DNA光解酶的作用下將環(huán)丁烷胸腺嘧啶二體和6-4光化物還原成為單體甲基轉(zhuǎn)移酶使O6-甲基鳥嘌呤脫甲基生成鳥嘌呤，防止G-T配對(duì)牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享DNA的轉(zhuǎn)座：由可移位因子介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。轉(zhuǎn)座子（transposon）：存在與染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位。牛牛文庫文檔分享原核生物轉(zhuǎn)座子的類型：1、插入序列(insertional sequence,IS)2、復(fù)合轉(zhuǎn)座子(composite transposon)3、TnA家族牛牛文庫文檔分享1、插入序列(IS)IS是最簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)座子，不含有任何宿主基因，它們

16、是細(xì)菌染色體或質(zhì)粒DNA的正常組成部分。 ：IS1 牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（retrotransposon）：指通過RNA為中介，反轉(zhuǎn)錄成DNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)座的可動(dòng)元件。 牛牛文庫文檔分享牛牛文庫文檔分享IS-兩端有 IR，只編碼轉(zhuǎn)座酶類轉(zhuǎn)座因子-結(jié)構(gòu)同 IS，但不能獨(dú)立存在，僅作為復(fù)合轉(zhuǎn)座子的兩端組件復(fù)合轉(zhuǎn)座子-兩端由 IS 或類 IS 構(gòu)成，可編碼抗抗菌素物質(zhì)原核TnA 轉(zhuǎn)座子家族-兩端為 IR，可編碼轉(zhuǎn)座酶、解離酶和抗性物質(zhì)AC-Ds-植物（玉米）中的激活-解離因子轉(zhuǎn)座子P 因子-果蠅中父本因子，在 MP中導(dǎo)致雜種不育反轉(zhuǎn)錄病毒、RNA DNA整合宿主靶 DNATyCopia病毒超家族LINSL1（1）有長(zhǎng)末端重復(fù)序列（2）編碼反轉(zhuǎn)錄酶或整合酶（3）可含內(nèi)含子SINSB1/ Alu（1）無重復(fù)序列（2）不編碼轉(zhuǎn)座子產(chǎn)物（3）無內(nèi)含子轉(zhuǎn)座因子真核反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子非病毒超家族假基因牛牛文庫文檔分享定是一種非常保守的分子牛牛文庫文檔分享牛牛文庫