基于TCGA及SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)的

1、鄭州晟智科信教育培訓(xùn)中心(Zhengzhou SZKX education training center)PAGE 2基于TCGA及SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)的深度挖掘和科研設(shè)計(jì)培訓(xùn)通知各事業(yè)單位：身處大數(shù)據(jù)時(shí)代，對(duì)于從事腫瘤研究的臨床醫(yī)生或基礎(chǔ)科研人員，有沒(méi)有一種可以既不做實(shí)驗(yàn)又不查病史，直接調(diào)用公共數(shù)據(jù)撰寫(xiě)發(fā)表SCI論文的方法呢？TCGA和SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)即提供了這樣一種可能。TCGA和SEER分別側(cè)重于組學(xué)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)，各有優(yōu)勢(shì)。TCGA（癌癥基因組圖譜）數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)多組學(xué)的數(shù)據(jù)庫(kù)，包括常見(jiàn)癌癥的基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀遺傳組數(shù)據(jù)和與其關(guān)聯(lián)的臨床數(shù)據(jù)，為挖掘有意義的組學(xué)變化

2、和發(fā)現(xiàn)腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移等生物學(xué)機(jī)制提供了海量數(shù)據(jù)。美國(guó)的SEER（癌癥監(jiān)測(cè)、流行病學(xué)和結(jié)果）數(shù)據(jù)庫(kù)則是典型的臨床醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，是北美最具代表性的大型腫瘤登記注冊(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)之一，收集了各個(gè)癌種的海量臨床病理信息和預(yù)后數(shù)據(jù)，并向全世界免費(fèi)開(kāi)放，為臨床醫(yī)師的循證實(shí)踐及臨床研究提供了寶貴的第一手資料。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，全世界基于TCGA和SEER數(shù)據(jù)挖掘產(chǎn)生的文章已經(jīng)超過(guò)2000篇，其中不乏最頂尖的學(xué)術(shù)期刊文章（如JAMA、新英格蘭、Nature、Cell等），這一數(shù)目還在不斷增長(zhǎng)中。以往的TCGA課程往往側(cè)重于R語(yǔ)言程序的講解，不少學(xué)員反應(yīng)難以掌握。本課程立足應(yīng)用和實(shí)戰(zhàn)，宗旨是“臨床醫(yī)生聽(tīng)得懂、學(xué)得會(huì)，科

3、研人員亦有收獲”。本課程將從臨床應(yīng)用視角介紹癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)TCGA、SEER的基本情況、數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)、數(shù)據(jù)獲取方式及基本統(tǒng)計(jì)方法等，深度解析近年講課人發(fā)表的基于TCGA和SEER數(shù)據(jù)挖掘的經(jīng)典案例，重點(diǎn)對(duì)癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)挖掘和課題設(shè)計(jì)進(jìn)行討論，最后也將探討在此基礎(chǔ)上的基金申請(qǐng)、SCI論文撰寫(xiě)策略。一、時(shí)間地點(diǎn)： 2019年5月24日-5月26日 鄭州*鑫地酒店 （課程安排：第一天報(bào)到，授課兩天；）學(xué)習(xí)目標(biāo)：本次培訓(xùn)提供了一次系統(tǒng)掌握TCGA和SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、挖掘方法及分析流程的機(jī)會(huì)，目的在于助力有志于利用這些公共數(shù)據(jù)庫(kù)的臨床醫(yī)生以及轉(zhuǎn)化研究的科研人員，幫助研究者去更好地挖掘

4、利用這些免費(fèi)的公共數(shù)據(jù)。本次培訓(xùn)不側(cè)重于深入的生物信息學(xué)分析講授，擬解決的問(wèn)題包括：1、如何基于TCGA及SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)課題；2、TCGA及SEER數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)下載；3、獲取數(shù)據(jù)后如何分析；4、如何在此基礎(chǔ)上撰寫(xiě)SCI論文及申請(qǐng)科研基金。課程特色:1、優(yōu)質(zhì)師資權(quán)威專家：邀請(qǐng)具有豐富經(jīng)驗(yàn)的資深專家，精心設(shè)計(jì)并講授高品質(zhì)課程。 2、小班授課案例解析：通過(guò)案例教學(xué)與研討，解讀要點(diǎn)；為保障效果，嚴(yán)控名額；3、培訓(xùn)結(jié)束后，建立微信交流群，長(zhǎng)期跟蹤指導(dǎo)； 鄭州晟智科信企業(yè)管理咨詢有限公司 二零一九年四月十日 四、主講專家:本次主講老師是來(lái)自國(guó)內(nèi)知名三甲醫(yī)院腫瘤專業(yè)的臨床醫(yī)生和科研工作者，有著

5、豐富的臨床和轉(zhuǎn)化研究經(jīng)驗(yàn)。以一作和通訊作者發(fā)表SCI論文26篇，10分以上論文4篇，累計(jì)影響因子176。其中成功用TCGA、SEER數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)表十幾篇SCI，平均影響因子4.6分一篇。目前主持國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目及多項(xiàng)省部級(jí)人才項(xiàng)目，擔(dān)任一本SCI雜志的Section editor，以及多本影響因子5分以上SCI雜志審稿人。五、注冊(cè)費(fèi)用：費(fèi)用：3000元（報(bào)名費(fèi)、注冊(cè)費(fèi)、資料費(fèi)、會(huì)議費(fèi)、午餐費(fèi)等）食宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。注：2019年5月10前報(bào)名并繳費(fèi)人員每人優(yōu)惠200元！組團(tuán)報(bào)名享有更多優(yōu)惠，詳情咨詢會(huì)務(wù)組人員授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請(qǐng)函（蓋章）和發(fā)票。六、報(bào)名方式：請(qǐng)各單位接此通知后，盡快

6、確定參會(huì)人員，認(rèn)真填寫(xiě)報(bào)名回執(zhí)并傳真至發(fā)E-mail至: ，會(huì)務(wù)組收到回執(zhí)后將通知相關(guān)報(bào)到事宜。七、聯(lián)系方式： 電 話/傳真QQ：1445908422 聯(lián)系人：楊敏 158-3834-2318（同微信） E_mail：報(bào)名回執(zhí)表：基于TCGA及SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)的深度挖掘和科研設(shè)計(jì)會(huì)議單位名稱發(fā)票抬頭發(fā)票類型增值稅普票納稅人識(shí)別號(hào)發(fā)票內(nèi)容培訓(xùn)費(fèi)會(huì)議費(fèi)會(huì)務(wù)費(fèi) 會(huì)議注冊(cè)費(fèi)學(xué)員姓名性別部門(mén)工作（研究）方向職務(wù)聯(lián)系方式郵箱合計(jì)費(fèi)用萬(wàn) 仟 佰 拾 元電匯日期繳費(fèi)方式：現(xiàn)場(chǎng)辦理費(fèi)用（可刷卡、現(xiàn)金） 電匯 （請(qǐng)用“”標(biāo)注）匯款賬戶賬戶：鄭州晟

7、智科信企業(yè)管理咨詢有限公司開(kāi)戶行：中國(guó)工商銀行股份有限公司鄭州黃委會(huì)支行賬號(hào)：1702 6206 0920 0015 091注：請(qǐng)將銀行匯款憑證發(fā)送至?xí)?wù)組。是否需要住宿： 口是 口否入住日期_，住宿天數(shù)_天，標(biāo)準(zhǔn)間_間。參會(huì)單位蓋章：參會(huì)學(xué)員簽名：會(huì)務(wù)負(fù)責(zé)人：許秋夢(mèng) 二零一九年 月 日課程大綱:（全部課程均含上機(jī)實(shí)踐）：題 目?jī)?nèi) 容第一天上午：TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)入門(mén)1. 什么是TCGA？TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)基本概念介紹（數(shù)據(jù)類型、數(shù)據(jù)級(jí)別及barcode）2. 哪里獲取TCGA數(shù)據(jù)？（實(shí)戰(zhàn)）TCGA數(shù)據(jù)獲取方法（下載單樣本數(shù)據(jù)與匯總數(shù)據(jù)表）3. 如何利用TCGA數(shù)據(jù)撰寫(xiě)論文？結(jié)合講者發(fā)文案例，進(jìn)行基于

8、TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)表文章的深度解析第一天下午：SEER數(shù)據(jù)庫(kù)入門(mén)1. 什么是SEER？SEER數(shù)據(jù)庫(kù)基本概念介紹（數(shù)據(jù)構(gòu)成、變量類型）2. 哪里獲取SEER數(shù)據(jù)？（實(shí)戰(zhàn)）SEER軟件安裝、權(quán)限申請(qǐng)及數(shù)據(jù)獲取3. 如何利用SEER數(shù)據(jù)撰寫(xiě)論文？結(jié)合講者發(fā)文案例，進(jìn)行基于SEER數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)表文章的深度解析第二天上午：TCGA和SEER數(shù)據(jù)深度挖掘1. 如何深度挖掘公共數(shù)據(jù)庫(kù)并進(jìn)行臨床轉(zhuǎn)化課題設(shè)計(jì)二代測(cè)序與腫瘤靶標(biāo)鑒定思路2. 實(shí)戰(zhàn)：利用Excel、SPSS、Graphpad進(jìn)行基于TCGA數(shù)據(jù)挖掘a) 如何實(shí)現(xiàn)TCGA原始數(shù)據(jù)的整理b) 如何使用Excel進(jìn)行不同數(shù)據(jù)表的拼接c) 如何在整理數(shù)據(jù)表基礎(chǔ)上進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析和作圖3. 實(shí)戰(zhàn)：利用R程序進(jìn)行TCGA和SEER數(shù)據(jù)挖掘a) R語(yǔ)言基礎(chǔ)知識(shí)b) 如何利用R程序?qū)崿F(xiàn)單個(gè)樣本文件的拼接和計(jì)算c) 如何利用R程序進(jìn)行圖形制作d) 如何利用R程序制作nomogram第二天下午：論文標(biāo)書(shū)撰寫(xiě)與實(shí)用統(tǒng)計(jì)方法1. SCI論文撰寫(xiě)技巧a) SCI論文框架與寫(xiě)作思路b) SCI論文圖表制作技巧c) 如何撰寫(xiě)Cover Letter并在修回時(shí)與審稿人有效溝通2. 實(shí)用科研統(tǒng)計(jì)方法實(shí)戰(zhàn)以GraphPad和SPSS軟件使用為例，介紹：a) 直方圖、散點(diǎn)圖、折線圖、生存曲線、熱圖等常用統(tǒng)計(jì)圖形制作b) t檢驗(yàn)