不可忽視的轉(zhuǎn)膜和封閉WesternBlot專題(經(jīng)驗(yàn)篇)(共26頁)_第1頁
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文檔簡介

1、不可忽視的轉(zhuǎn)膜和封閉(fngb):WesternBlot專題(經(jīng)驗(yàn)篇) 生物通技術(shù)專題:既可以定性(dng xng),又可以半定量的Western是初步鑒定蛋白質(zhì)最方便也是最通用的方法。Western印跡要想做的好,當(dāng)然每個(gè)步驟都不能馬虎,看看這張圖,從電泳,轉(zhuǎn)膜,封閉,一抗,二抗到最后的檢測,就像“發(fā)現(xiàn)號(hào)”升空的120萬個(gè)步驟那樣(nyng)一個(gè)也不能少。如果忽視了其中的一步,結(jié)果做不出來,也是令人非常頭痛的。 “工欲善其事,必先利其器”,要想有好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,好儀器是相當(dāng)重要的,因此讓我們先來看看什么樣的儀器能讓我們無后顧之憂,順利痛快的一步到位。 Western 印跡的儀器主要就是電泳系統(tǒng)

2、和電轉(zhuǎn)移系統(tǒng)了,最好的品牌當(dāng)然是Bio-Rad和Amersham(GE Healthcare)的Hoefer系列了,現(xiàn)在國內(nèi)出品的物美價(jià)廉的電泳系列產(chǎn)品,也是不錯(cuò)的選擇,幾乎每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都需要至少一套Mini Cell吧?如果還沒有你該怎么挑選呢。一、Bio-Rad經(jīng)典Mini系列 Bio-Rad Laboratories由 David Schwartz 先生和妻子化學(xué)家Alice Schwartz于1957 年創(chuàng)建,總部位于加州 Hercules,下設(shè)三大部門生命科學(xué)部,臨床診斷部和工業(yè)材料部,其中生命科學(xué)部成功躋身世界排名前五名。在2004年,Bio-Rad還低價(jià)收購了因侵犯知識(shí)產(chǎn)權(quán)限于困境

3、的MJ Research,使得伯樂在PCR領(lǐng)域的市場份額驟然擴(kuò)大。Bio-Rad生命科學(xué)部產(chǎn)品包括蛋白組研究產(chǎn)品、層析儀與填料、蛋白質(zhì)和核酸電泳產(chǎn)品等,不過最為普通實(shí)驗(yàn)室熟悉的莫過于蛋白電泳Mini系列和層析儀。只要是提到SDS,Bio-Rad絕對(duì)是每個(gè)實(shí)驗(yàn)室首先考慮的品牌,經(jīng)典就是經(jīng)典呀。 Mini-PROTEAN3電泳系統(tǒng)與Mini Trans-Blot轉(zhuǎn)移系統(tǒng)這一套Mini系列可謂是Bio-Rad最多人熟悉和稱道的產(chǎn)品了。自上個(gè)世紀(jì)50年代Raymond利用聚丙烯酰胺凝膠的分子篩性質(zhì)來延緩蛋白質(zhì)的遷移率從而達(dá)到分離蛋白的目的以來,經(jīng)過這么多年來的發(fā)展, SDS電泳技術(shù)已經(jīng)基本成熟了。而且

4、在操作手段方面也越來越簡便,越來越準(zhǔn)確。Mini Protein Cell的出現(xiàn)使得Western的制膠和電泳的消耗成本更經(jīng)濟(jì)、操作更簡便快速這種簡便也間接促進(jìn)了Western技術(shù)的更廣泛采用。而Mini-PROTEAN 3 自被生產(chǎn)出來那天就可以說是“踩在巨人的肩膀上”,因?yàn)樗×薆io-Rad之前第一代和PROTEAN 2微型垂直電泳儀的優(yōu)點(diǎn),并在其基礎(chǔ)上進(jìn)行了優(yōu)化,所以獲得了全球?qū)嶒?yàn)人員廣泛的認(rèn)同與喜愛。 Mini-PROTEAN 3的優(yōu)點(diǎn)可以概括為8個(gè)字用途廣泛,操作簡便。由于Mini-PROTEAN 3可以用于SDS變性電泳、非變性電泳、Tric-Tricine電泳、等電聚焦和酶譜

5、分析,以及dsDNA、ssDNA和RNA的電泳分離,因此可以說只要實(shí)驗(yàn)室有一套Mini-PROTEAN 3,足以應(yīng)付常規(guī)垂直電泳需要了。Mini-PROTEAN 3體現(xiàn)了Bio-Red不斷改進(jìn)的努力方向設(shè)計(jì)人性化,令操作更簡便這在各個(gè)細(xì)節(jié)都可以體現(xiàn),比如說為了防止制膠過程出錯(cuò),Mini在玻璃板,夾合器(固定玻璃板的裝置)以及電泳槽里等處分別都有注明正反位、夾板高度或正負(fù)極;方便的夾子取代了以前需要擰4個(gè)螺絲來固定玻璃板的麻煩。由于未交聯(lián)的聚丙烯酰胺本身是神經(jīng)毒素,因此每個(gè)實(shí)驗(yàn)者都希望操作能簡單快速,盡可能減少討厭的意外“事故(shg)”漏膠的發(fā)生。Mini-PROTEAN 3巧妙的設(shè)計(jì)使得配膠

6、快速方便的同時(shí)更大大減少漏膠的幾率。除此之外,Mini的加樣容量也是可以多樣選擇的,包括10-well (30 l),15-well (15 l),10-well (50 l),12-well (20 l),9-well (30 l),IPG comb (7 cm IPG strip)。 電泳結(jié)束后就要轉(zhuǎn)膜。同系列的Mini Trans-Blot可以說是Mini-PROTEAN 3的“完美拍檔”,它們組合在一起就是做Western印跡實(shí)驗(yàn)的最好選擇之一了。說它好,當(dāng)然是有原因的,由于Mini Trans-Blot在轉(zhuǎn)移過程當(dāng)中的三個(gè)關(guān)鍵步驟里設(shè)計(jì)巧妙,幫助轉(zhuǎn)移順利進(jìn)行,提高了轉(zhuǎn)膜效率,因此才會(huì)

7、得到如此多的用戶的贊賞。第一就是在夾板盒,由于轉(zhuǎn)膜過程中的氣泡問題對(duì)于實(shí)驗(yàn)結(jié)果有很大的影響試想一下,在特異帶顯色處正好有一個(gè)氣泡,那么本來可以很漂亮的結(jié)果就付之一炬了,甚至可能會(huì)造成假陰性結(jié)果。Mini Trans-Blot的夾板盒通過兩塊海綿與封口式設(shè)計(jì)幫助減少氣泡的存在,同時(shí)夾板盒多孔的設(shè)計(jì)也可以在壓制過程中使緩沖液均勻的滲出,減少氣泡。其次,轉(zhuǎn)膜槽的人性設(shè)計(jì)。試問一下,在轉(zhuǎn)膜中最怕什么,我想大部分人都會(huì)說是正負(fù)極弄錯(cuò),Mini Trans-Blot為了防止這種造成整個(gè)實(shí)驗(yàn)完全失敗的情況出現(xiàn),在轉(zhuǎn)膜槽的正負(fù)極上明確的用大范圍的紅與黑這兩種顏色標(biāo)志出來了,這樣出錯(cuò)的可能性就大大降低了。第三,

8、就是Mini Trans-Blot的冷卻裝置。Mini Trans-Blot有一個(gè)冷卻盒,聽起來好像很復(fù)雜,其實(shí)就是一個(gè)塑料盒子,但是這個(gè)盒子在轉(zhuǎn)膜過程中卻可以起重要作用,眾所周知,轉(zhuǎn)膜過程中發(fā)熱不僅會(huì)造成氣泡的形成,而且很有可能會(huì)影響蛋白的正常轉(zhuǎn)移,因此大多數(shù)轉(zhuǎn)移是在冰上進(jìn)行的,但由于空氣(kngq)的隔熱現(xiàn)象往往效果不是很明顯,利用Mini Trans-Blot,實(shí)驗(yàn)人員可以在冷卻盒中裝入緩沖液將其冰凍起來,轉(zhuǎn)膜時(shí)就可以起到冷卻的作用。除了以上這些,Mini Trans-Blot還有一次可以轉(zhuǎn)兩塊膜,低電壓過夜轉(zhuǎn)膜以及令人放心的外觀設(shè)計(jì)等方面的優(yōu)點(diǎn)。Mini-PROTEAN 3加上Mini

9、 Trans-Blot一套價(jià)格不便宜,要1000多美元呢?,F(xiàn)在那個(gè)(n ge)超薄硬質(zhì)玻璃板也可以單買了,以前可是十套打包的。 Bio-Rad除了這個(gè)(zh ge)“鎮(zhèn)店之寶”外,還有適合于13.3 x 8.7 cm gels的Criterion系列(xli)(Mini系列是8.6 x 6.8 cm),這一系列無論是電泳系統(tǒng)還是轉(zhuǎn)移系統(tǒng)都和Mini相似,但是(dnsh)它可以容納更多塊膠,為蛋白質(zhì)組分析提供便利。而且有線電極和板電極兩種方式供選擇。除此之外,還有更大尺寸的the Trans-Blot Cell(16 x20cm,26.5 x28cm)適合特別的需要的實(shí)驗(yàn)來選擇。二、電泳世家Ho

10、efer 也許國內(nèi)的研究人員不那么熟悉Hoefer,但是這個(gè)1967就成立的公司在電泳產(chǎn)品領(lǐng)域可謂赫赫有名。多年來一直專注于核酸和蛋白電泳分離技術(shù),使得其產(chǎn)品質(zhì)量和設(shè)計(jì)一直處于領(lǐng)先地位,在國外真正屬于“頂級(jí)”口碑的電泳產(chǎn)品。被GE收購了的Amersham則是大家非常熟悉的品牌(包括獨(dú)步天下的原法碼西亞的蛋白純化王國),而多年為Amersham代工生產(chǎn)單向電泳產(chǎn)品的正是Hoefer。2003年Hoefer成為著名的哈佛生命科學(xué)全資子公司,GE(Amersham)目前繼續(xù)銷售Hoefer的各種產(chǎn)品,而且8月期間還有 HYPERLINK /custom/ge/web/1.htm t _blank 6

11、到7折的特別優(yōu)惠,很值得看看(點(diǎn)擊這里)。老實(shí)說GE的這一單向電泳系列一直算是良心價(jià),和美國Hoefer的價(jià)格差不多,如果算上這么大的折扣優(yōu)惠,在美國也買不到這個(gè)價(jià)格呢! GE(通用電氣公司)有一個(gè)很有名的創(chuàng)始人托馬斯愛迪生,自1896年愛迪生電燈公司和休斯頓電氣公司合并成立GE公司以來,GE秉承著“夢想啟動(dòng)未來”的理念逐漸成為了一家多元化的科技、媒體和金融服務(wù)公司。2004年4月,GE宣布成功收購Amersham公司所有股票,自此GE Healthcare在生命科學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展生機(jī)勃勃,充滿朝氣,繼續(xù)拓展Amersham在基因組,蛋白質(zhì)組,分離純化,檢測試劑等領(lǐng)域打下的王朝。 在蛋白電泳與印跡

12、系統(tǒng)方面,Amersham做得標(biāo)準(zhǔn)全面,有各種的可以放置不同凝膠數(shù)目、凝膠面積和厚度的電泳槽可供選擇,通常可以分成三類:微型、中型和大型,另外電轉(zhuǎn)印跡系統(tǒng)也有多種選擇,比如說如果你想做半干轉(zhuǎn)移,那么就可以選擇Hoefer TE70或Hoefer TE77,如果是要做全濕轉(zhuǎn)移,那么Hoefer TE22或TE62是可以考慮的購買對(duì)象。所以如果你剛開始接觸蛋白電泳和Western印跡,那么可以考慮一下GE公司(Amersham)的產(chǎn)品,因?yàn)檫@些產(chǎn)品不僅購買放心,而且在產(chǎn)品服務(wù)方面也相當(dāng)不錯(cuò),能夠找到眾多有用的資料。別具一格Hofer MiniVE Amersham在電泳儀器方面挑選范圍廣,而在蛋白

13、垂直電泳系統(tǒng)中一定要提及的就是Hofer MiniVE了,這一設(shè)計(jì)完整、使用方便的新一代電泳儀器融合了蛋白電泳與Blot兩方面裝置配備,設(shè)計(jì)獨(dú)特,而且在前一段時(shí)間GE公司大減價(jià)活動(dòng)中,全套MiniVE只要560美元,只用花一套儀器的錢就可以用作兩種用途,這么著名的品牌,真是難得物美價(jià)廉?。ㄈ绻B同電泳電源還可以再打折哦,暈.)。 說它是好貨,那么到底MiniVE是好在哪兒呢?其實(shí)在眾多電泳儀器倍出的江湖,MiniVE有三招讓其獨(dú)步武林,第一招就是操作簡便,節(jié)省時(shí)間。由于有時(shí)蛋白電泳使用頻率很高,所以實(shí)驗(yàn)人員當(dāng)然會(huì)希望操作簡單啦。MiniVE配膠過程就三步:load clampcast,只需把玻

14、璃板放上去,夾緊,然后灌膠就完事了。漏膠?那是極少發(fā)生的事。細(xì)微之處見真功,MiniVE的設(shè)計(jì)有一些過人之處。比如Spacer有T邊,大大減少側(cè)邊漏膠的幾率;而將玻璃裝到模塊上的時(shí)候,兩邊底部的玻璃/Spacer/玻璃處都有Guide Foot,頂一下“三件套”的上面就可以保證足部完全對(duì)齊防止底部漏膠。裝玻璃的時(shí)候如果傳統(tǒng)的“插進(jìn)模塊”就容易導(dǎo)致Spacer和玻璃之間“走位”,MiniVE的模塊兩個(gè)側(cè)邊和底部都可以打開,將裝好的玻璃平放,合上夾邊再擰螺絲就行;底部的封邊也很特別,有3檔,一個(gè)是密封檔,可以密封底邊后直接倒膠;一個(gè)是半開的電泳檔,允許電泳液均勻連通膠底部,另一個(gè)當(dāng)然就是完全打開以

15、便裝卸玻璃了。所以MiniVE并沒有單獨(dú)的倒膠架子,將底部封條推到密封位置后就可以將模塊“掛”在電泳主槽的邊上倒膠了,不用擔(dān)心膠面不平哦。Amersham產(chǎn)品做工精良,值得信賴的。第二招,高品質(zhì)大容量。MiniVE與一般蛋白電泳相比,有個(gè)很大優(yōu)勢,就是其蛋白膠可薄至0.5mm,而且凝膠大小是1010.5cm(WH),比一般的108cm要長了30%,這樣的好處就是增加了蛋白分辨率,使一些“難舍難分”的蛋白組分“分道揚(yáng)鑣”,達(dá)到更好的分離效果。 HYPERLINK /feedback/newsforms/buyform.aspx?subid=2&companyname=Promega&compan

16、yid=146&proname=ViaFect%2526%238482%3b%d7%aa%c8%be%ca%d4%bc%c1&extraEmail= t blank ViaFect轉(zhuǎn)染試劑(shj)第三招,Western印跡,MiniVE采用的轉(zhuǎn)移槽是“盒式”的,潤濕的轉(zhuǎn)移膜和濾紙(lzh)、海綿組成“三明治”結(jié)構(gòu)夾在“盒式”的轉(zhuǎn)移模塊中,閉合后每個(gè)轉(zhuǎn)移模塊只用350毫升的緩沖液,放入主槽中;而電泳主槽里只放預(yù)冷的去離子水作為降溫,就可以直接轉(zhuǎn)膜了。這種轉(zhuǎn)移方法不用整個(gè)電泳主槽裝滿電泳轉(zhuǎn)移緩沖液,可以節(jié)約不少緩沖液(1.21.7升)呢,而且可以減少不均勻的發(fā)熱。Amersham除了這種微型的電

17、泳系統(tǒng),還有Hofer其它系列,比如SE250垂直電泳儀,這種電泳系統(tǒng)配有熱交換模塊,可以消除smile現(xiàn)象(一種由于熱量交換不及時(shí)而引起的蛋白帶波動(dòng)現(xiàn)象,生物通注)。再比如凝膠大小為1816cm的SE600 Ruby,以及為了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的需要開發(fā)的Ettan DALT six和Ettan DALT twelve,這兩種電泳系統(tǒng)分別可以進(jìn)行6塊和12塊凝膠的電泳,這可以說是“庫斯拉級(jí)”的電泳系統(tǒng)??!三、國產(chǎn)品牌 國產(chǎn)電泳儀,國內(nèi)的老牌六一是大家非常熟悉的產(chǎn)品,價(jià)格的絕對(duì)優(yōu)勢令其歷時(shí)數(shù)十年而屹立不倒。電泳儀這玩意本來技術(shù)含量不比芯片掃描儀什么的,只要設(shè)計(jì)合理(hl)好用,電極絲筆直耐用分離效

18、果好,塑料槽晶瑩剔透美觀易清洗,價(jià)格合理就好。國內(nèi)品牌現(xiàn)在材料都沒話說,高透明度聚碳酸脂注塑成型,鑄造模具非常精密。關(guān)鍵就是設(shè)計(jì),好不好用,分離效果好不好。最近新冒頭的后起之秀,北京百晶生物技術(shù)有限公司的產(chǎn)品就值得關(guān)注-越是新出品的電泳槽,在設(shè)計(jì)上就越值得期待,無他,只因具體設(shè)計(jì)上可以參考其他著名品牌優(yōu)缺點(diǎn),揚(yáng)長避短,結(jié)合更多使用人多年的心得和期望進(jìn)行改進(jìn)-站在巨人的肩膀上自然有高度。 這個(gè)百晶其實(shí)是美國海灣基因集團(tuán)公司在中國設(shè)置的以出口為主兼顧國內(nèi)市場的外向型生產(chǎn)加工基地,專業(yè)研發(fā)和組裝生產(chǎn)“Baygene”品牌電泳及配套儀器,將美國工程師的人性化設(shè)計(jì)理念和國外制造的高精度模具組合起來,核心

19、進(jìn)口器件及不同程度的國產(chǎn)化率集成的國產(chǎn)貨。包括高、中、低壓電泳儀電源;垂直、水平電泳儀;可整支高溫消毒的移液器;超薄型磁力攪拌器;手掌式、臺(tái)式離心機(jī);高精度恒溫循環(huán)器;常溫、低溫干式恒溫器;顯微鏡數(shù)碼圖像系統(tǒng)等。其中最為值得稱道的就是Baygene BG-verMINI 迷你垂直電泳儀。因?yàn)樵O(shè)計(jì)更人性化,操作更簡便。1首先,跑蛋白電泳最重要是必須效果好。 BG-verMINI 迷你垂直電泳儀(標(biāo)配)凝膠尺寸是8297mm(WH),分離長度比一般迷你型凝膠8273cm長25%。由此增加了蛋白分辨率,分離了粘連的蛋白組分。同時(shí)又可以兼作8273cm迷你型凝膠,達(dá)到省時(shí)省液、快速方便的效果。兼顧到了

20、多種使用習(xí)慣。2:其次,只是效果好就可以嗎?在當(dāng)今越來越講究效率的今天光是效果好還不夠,還得必須操作簡單不漏膠。那么讓我們來看看 BG-verMINI 迷你垂直電泳儀如何實(shí)現(xiàn)簡單方便的。它具有獨(dú)特的灌膠裝置,可同時(shí)灌1-2塊膠。制膠過程只需三步:把帶固定墊條的玻璃固定在主槽上,再將主槽放在獨(dú)特的灌膠裝置上,即可完全放心的灌膠。任何人都能在1分鐘內(nèi)操作完成,沒有任何漏膠的可能。凝膠制成后卸掉灌膠裝置,凝膠板無需二次移動(dòng)(不用拆下玻璃板),將主槽整個(gè)放入殼體中即可電泳。最大限度避免了玻璃板移動(dòng)過程的失誤以及凝膠滲漏等等。在國內(nèi)外相關(guān)產(chǎn)品都需二次移動(dòng)的情況下,此特點(diǎn)更加彰顯突出和有效。3液體攪拌:槽

21、體底部留有1cm空間,便于電泳或轉(zhuǎn)印時(shí)放置磁力棒進(jìn)行攪拌,以使溫度和離子強(qiáng)度均勻,實(shí)現(xiàn)電泳或轉(zhuǎn)印的最好效果。若不用此功能時(shí),可放置減液板(電泳配件)填充其空間,以減少緩沖液量。4充分接觸:電極的正極結(jié)構(gòu)為V字形設(shè)計(jì),兩側(cè)有氣泡出孔,電泳時(shí)不會(huì)有氣泡在電極周圍存留,保證了電極與緩沖液的充分接觸,達(dá)到了散熱的良好效果。5緩沖液量自由放置:槽體寬大,充分達(dá)到了足量緩沖液帶來的極佳散熱效果。既避免了用戶自制“冰盆”冷卻的尷尬, 又避免了凝膠譜帶的“笑臉”現(xiàn)象。需要節(jié)省緩沖液時(shí),減液板又可以發(fā)揮作用啦。上下槽合計(jì)最低緩沖液量為400ml。6多板制膠:需要提前制成大量凝膠板冷藏保存的用戶,我們也準(zhǔn)備了多板

22、制膠器供選擇,每次可制4塊凝膠。7轉(zhuǎn)印電泳:配套的聚碳酸脂模具成型BG-blotMINI迷你轉(zhuǎn)移槽,內(nèi)置冷卻裝置冰盒,其快速吸收了轉(zhuǎn)印過程的熱量,克服了無冰盒轉(zhuǎn)印的發(fā)熱現(xiàn)象。具有限位功能的轉(zhuǎn)移槽,配以顏色明顯的轉(zhuǎn)印夾和電極,確保了轉(zhuǎn)印過程的正確定向。生物通Western Blot技術(shù)(jsh)專輯之PAGE膠電泳(din yn)和轉(zhuǎn)膜 PAGE倒膠的儀器我們(w men)在前面 HYPERLINK /newsf/2005-8/2005825181619.htm t _blank WesternBlot儀器之選已經(jīng)介紹過了,除了順手的工具能防止漏膠,PAGE配膠的試劑和配方比例對(duì)電泳結(jié)果的質(zhì)量當(dāng)

23、然有決定性的影響,這個(gè)配膠的比例,在分子克隆上有詳細(xì)的論述,相信大家都不難查到。容易忽視的問題主要在于過硫酸銨(AP)一定要新鮮最好用小指管配AP(寫日期)保存在-20度,超過2周的AP扔掉算了,或者已經(jīng)反復(fù)打開使用多次的AP都別用,小氣病發(fā)作的后果往往是得不償失膠凝不好多半是這里疏忽(或者混合不勻),因?yàn)橄鄬?duì)配膠的其他組分,AP算最活躍分子如果還有諸如漏加某組分或者配比錯(cuò)誤或者Buffer搞錯(cuò),那絕對(duì)是你自己找罵,不值得同情。水要用去離子的純水,MilliQ級(jí)更好。Cambrex(原來的FMC)有商品化的丙烯酰胺母液,很貴,也很好配出的膠對(duì)200KD以上的蛋白的分辨率高于普通PAGE膠,條帶

24、清晰漂亮,可惜一直沒有搞清楚配方的奧秘;但是數(shù)十倍于丙烯酰胺粉劑的價(jià)格令人卻步,不過,對(duì)接觸丙烯酰胺粉塵嚴(yán)重過敏的人可以選擇這個(gè)。更加豪華的選擇是已經(jīng)凝好的預(yù)制膠,各種配方各種比例各種梳孔大小多少任君選擇,打開即用,當(dāng)然更直接方便,更吸引人的是結(jié)果漂亮,分辨率高,特別是重復(fù)性好,條帶真正是razor sharp啊!平時(shí)都能用這么豪華的東西心情當(dāng)然超爽啊,實(shí)驗(yàn)緊湊又輕松,效率也更高??!如果實(shí)驗(yàn)都能這么“好馬配好鞍”,想必更容易出結(jié)果,也就更容易拿經(jīng)費(fèi)吧!什么時(shí)候我們的實(shí)驗(yàn)才能實(shí)現(xiàn)這種良性循環(huán)啊!Invitrogen旗下的Norvex和Cambrex(原來的FMC)PAGEr都是首選預(yù)制膠??墒窃?/p>

25、“社會(huì)主義初級(jí)階段”這種奢侈品平時(shí)流流口水就算了,偏偏最近Invitrogen公司推出了新的優(yōu)惠活動(dòng), HYPERLINK /custom/Invitrogen/10/index.html t _blank 買3盒NuPAGE預(yù)制膠就送電泳儀或者電轉(zhuǎn)移,面對(duì)這種誘惑,你難道就沒有一點(diǎn)非份之想的沖動(dòng)?上樣電泳(din yn):上樣前蛋白樣品(yngpn)最好離心,上樣量不宜過多,以免看結(jié)果時(shí),每個(gè)條帶都彎彎地“笑”你貪多嚼不爛哦。其他的操作,按照說明控制電流,不要過多重復(fù)使用電泳Buffer(別小氣,重復(fù)使用會(huì)降低緩沖能力的),好像基本不會(huì)出問題了。當(dāng)預(yù)染的Marker告訴你,你要分辨的蛋白已經(jīng)

26、到達(dá)最佳分辨區(qū)分離膠的2/3處,OK,電泳結(jié)束了。電泳結(jié)果(ji gu)檢查:如果要做Western Blot,是否需要先檢查電泳結(jié)果呢?能先看看結(jié)果如何再進(jìn)行下一步轉(zhuǎn)膜當(dāng)然最好。考馬斯亮藍(lán)使用簡便快速,可以分辨1ug左右的條帶,是最經(jīng)濟(jì)通用的蛋白PAGE膠電泳染色方法。銀染操作復(fù)雜一些但分辨率高很多,可以分辨2-5ng蛋白??墒怯捎诳捡R斯亮藍(lán)染色或者銀染經(jīng)過固定不可逆結(jié)合,會(huì)干擾后面的Western Blot實(shí)驗(yàn),很多人會(huì)選擇省略掉這一步同樣的樣品跑2塊膠,一塊染色一塊轉(zhuǎn)膜,一般也可以說明問題。如果想在轉(zhuǎn)膜前看看電泳結(jié)果,你需要用SYPRO Tangerine這種金色熒光蛋白染料靈敏度很高檢

27、測4ng-8ng蛋白,接近銀染,但使用非常簡單,最重要的是由于不用酸堿或者有機(jī)溶劑固定,不干擾蛋白活性,特別適合Western轉(zhuǎn)膜前的染色,或者非變性膠的活性蛋白的檢測(比如染色后還需要在膠上進(jìn)行活性檢測等等)。可惜SYPRO Tangerine價(jià)格挺貴的,500ul(5000 x)要2000元,即使很節(jié)約的用只夠大概100多次呢。所以最經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的方法是:麗春紅S,直接染色轉(zhuǎn)移膜,檢測轉(zhuǎn)膜效果,充分脫色后不干擾Western結(jié)果。麗春紅的檢測靈敏度和考馬斯亮藍(lán)差不多。轉(zhuǎn)膜:經(jīng)過PAGE電泳分離后的蛋白質(zhì)樣品需要經(jīng)過“轉(zhuǎn)膜”步驟從PAGE膠轉(zhuǎn)移到膜上固定,才能用各種方法進(jìn)行Western Blo

28、t的檢測和顯色,而且為了防止沒有電場的情況下已經(jīng)分離的蛋白條帶擴(kuò)散,轉(zhuǎn)移要盡快進(jìn)行轉(zhuǎn)膜的首要是選膜。在轉(zhuǎn)移膜上顯色其實(shí)就像是畫家在畫布上作畫一樣,不光要有好的畫筆和顏料,適合的畫布也是相當(dāng)之重要。Western Blotting亦是如此,沒有選擇好合適的轉(zhuǎn)移膜是無法做出漂亮的結(jié)果的。因此,選擇適合的轉(zhuǎn)移膜,要讓轉(zhuǎn)移“膜”高一尺,幫襯而不是阻礙到我們的實(shí)驗(yàn)。 Western Blot印跡常用的轉(zhuǎn)移膜主要是硝酸纖維素膜(Nitrocellulose Blotting Membranes,NC)和PVDF膜(Polyvinylidene-Fluoride) ,此外也有用尼龍膜、DEAE纖維素膜做蛋白

29、印跡。具體哪種膜適合于哪些實(shí)驗(yàn)?zāi)??選擇的根據(jù)主要有:a.膜與目的蛋白分子的結(jié)合能力(也就是單位面積的膜能結(jié)合蛋白的載量),以及膜的孔徑(也就是攔截蛋白的大?。籦.不影響后續(xù)的顯色檢測(也就是適和用于所選的顯色方法,信噪比好);c.如果后繼實(shí)驗(yàn)有其他要求,比如要做蛋白測序或者質(zhì)譜分析,還要根據(jù)不同目的來挑選不同的轉(zhuǎn)移膜,就像國畫要選擇宣紙,油畫要挑亞麻布或薄棉扣布一樣。首先(shuxin)來比較下這幾種膜的特點(diǎn)NC膜尼龍膜PVDF膜靈敏度和分辨率高高高背景低較高低結(jié)合能力80110 ug/cm2400 ug/cm2125200 ug/cm2(適合于SDS存在下與蛋白質(zhì)的結(jié)合)材料質(zhì)地干的NC膜

30、易脆軟而結(jié)實(shí)機(jī)械強(qiáng)度高溶劑耐受性無無有操作程序緩沖液潤濕,避免氣泡緩沖液潤濕使用前100%甲醇潤濕檢測方式常規(guī)染色,可用放射性和非放射性檢測不能用陰離子染料常規(guī)染色,比較于NC膜,可用考馬斯亮藍(lán)染色,可用于ECL檢測,快速免疫檢測。適用范圍0.45um一般蛋白0.2um一分子量小于20kD蛋白0.1um一分子量小于7kD蛋白低濃度小分子蛋白、酸性蛋白、糖蛋白和蛋白多糖(主要用在核酸檢測中)糖蛋白檢測和蛋白質(zhì)測序價(jià)格價(jià)格較便宜便宜較貴1. 硝酸(xio sun)纖維素膜 硝酸纖維素膜是蛋白印跡最廣泛使用的轉(zhuǎn)移介質(zhì),對(duì)蛋白有很強(qiáng)的結(jié)合能力,而且適用于各種顯色方法,包括同位素,化學(xué)發(fā)光(Lumino

31、l類)、常規(guī)顯色、染色和熒光顯色;背景低,信噪比高。NC膜的使用也很簡便,比如不需要甲醛預(yù)處理,只要在無離子水面浸潤排出膜內(nèi)氣泡,再在電泳緩沖液中平衡幾分鐘就可以了;比如NC膜很容易封閉,也不需要特別嚴(yán)謹(jǐn)?shù)那逑礂l件。轉(zhuǎn)移到NC膜上的蛋白在合適的條件下可以穩(wěn)定保存很長時(shí)間, Schleicher & Schull公司的一個(gè)實(shí)驗(yàn)表明,轉(zhuǎn)移到NC膜上的幾種蛋白4度條件下保存5年依然保持免疫識(shí)別特性,依然可以得到清晰可信的Western Blot結(jié)果。不過要注意的是純的硝纖膜在比較脆,又容易卷,操作要小心,不適合用于需要多次重復(fù)清洗的用途因?yàn)榻?jīng)不起多次“折磨”。選擇硝纖膜時(shí)要注意的是選擇合適的孔徑,通

32、常20KD以上的大分子蛋白用0.45um孔徑的膜,小于20KD的話建議選擇0.2um的,如果小于7KD的話最好選擇0.1um的膜。另外還要注意選擇純的NC膜混有含醋酸纖維(CM)的NC膜結(jié)合力會(huì)有所降低。另外提醒一句:由于NC膜上結(jié)合的蛋白會(huì)因?yàn)橐恍┤ノ蹌┒淮妫虼嗽诜忾]時(shí)最好使用較溫和的Tween20,而且濃度不要超過0.3%(據(jù)說0.05%效果最好)。 硝纖膜最為大家熟悉和認(rèn)可的品牌就是 Schleicher & Schull;Millipore;PALL,另外羅氏、Invitrogen、GE(Amersham)、Santa Cruz等公司都有提供各式的硝纖膜(估計(jì)OEM的可能性比較大

33、,不過有時(shí)挺奇怪的,OEM的有時(shí)比生產(chǎn)廠家賣的還便宜)。 Schleicher & Schull的名字拗口那大概需要舌頭在口腔里經(jīng)過若干次不同弧度和不同速度的上下往返精確運(yùn)動(dòng)再配合適當(dāng)?shù)耐職獠拍茏x得準(zhǔn)確優(yōu)雅,不過作為第一個(gè)提供硝纖膜的廠家依然廣為人知,其NC膜分為純NC膜和強(qiáng)化NC膜兩種:Protran nitrocellulose membrane和Optitran nitrocellulose membrane。前者Protran一直是 Schleicher & Schull自豪的產(chǎn)品,這種“100% Pure Nitrocellulose Membranes”。一般而言,NC膜越純,其蛋

34、白結(jié)合能力就越高,所以要增加WB的靈敏度和分辨率,提高所使用膜的純度是個(gè)可以考慮的選擇。如果NC膜攙雜一些醋化纖維素這在前面已經(jīng)提到,會(huì)影響蛋白質(zhì)結(jié)合。而Protran在制作過程中去除了各種雜質(zhì),保證了其純度,從而增加了蛋白結(jié)合能力。除了這一點(diǎn)以外,Protran還有低背景、多孔徑選擇(0.45, 0.2, 0.1um)和保存時(shí)間長(實(shí)驗(yàn)證明膜上蛋白辨認(rèn)時(shí)間可長達(dá)5年!真是“路遙知馬力”的典范)等優(yōu)點(diǎn)。但是Protran由于是純NC膜,比較脆,機(jī)械耐受力欠佳,需要小心操作,如果擔(dān)心自己“粗手粗腳”,那么就可以考慮一下Optitran或者(huzh)Pall公司的以耐受力著稱的BioTrace

35、NT Nitrocellulose Transfer Membrane。 Optitran是在一層超薄聚酯支撐膜的兩面均勻鋪上100%純的硝酸纖維素,結(jié)果表面看起來和純硝纖膜完全一樣,保持了NC膜各種優(yōu)點(diǎn),只是內(nèi)部多了一層中性支持物,大大增強(qiáng)這種強(qiáng)化NC膜的柔韌度和機(jī)械耐受力,不容易卷曲,方便操作,特別是重復(fù)標(biāo)記和洗脫的實(shí)驗(yàn)(shyn)。不過有的使用過的人反應(yīng)不如純NC膜結(jié)合能力強(qiáng)。 NC膜除了一般的Discs、Rolls和Sheets以外,像Invitrogen、Bio-Rad公司還有一種方便顧客使用的“sandwich”三明治形,十分有趣。說它有趣是因?yàn)榭紤]周到,利于高通量操作,但其實(shí)也就

36、是將濾紙和NC膜紙?zhí)壮蔀V紙NC膜濾紙的層迭形式,預(yù)先切割裝訂好,方便使用。不過,卷膜肯定是最實(shí)惠的選擇,只不過要自己動(dòng)手裁剪切記,必須帶手套操作。不知道為什么在國外硝纖膜會(huì)被當(dāng)作危險(xiǎn)品來運(yùn)輸還要加收運(yùn)費(fèi),所以貨期蠻長的,所以還是卷膜好,一卷用n年如果非要給這個(gè)n加個(gè)期限,那就是至少可以用到等我畢業(yè)之后。2. PVDF膜 剛開始做WB的人也許會(huì)有這種疑問:為什么實(shí)驗(yàn)室的老師(或者(huzh)師兄師姐們)在教我們做WB的時(shí)候,如果是用PVDF膜做,總是小心翼翼的剪,節(jié)省著用,甚至一些邊邊角角也舍不得丟掉呢?其實(shí),這不僅是因?yàn)镻VDF膜比較貴,還由于PVDF膜是做WB的“殺手锏”。 聚偏二氟乙烯(P

37、VDF)膜作為基質(zhì)的轉(zhuǎn)印膜由Millipore公司在1985年首先推出。與硝酸纖維素膜相比,PVDF膜在蛋白質(zhì)截留能力,機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)相容性上都更優(yōu)越的性能(xngnng)(Pluskal,et al.,1986)。市售硝酸纖維素膜的典型結(jié)合量是80-100g/cm2,而PVDF膜結(jié)合量是100-200g/cm2(而結(jié)合強(qiáng)度PVDF比硝纖膜強(qiáng)6倍!)。在艾滋病毒(HIV)血清學(xué)檢驗(yàn)中直接比較PVDF和硝酸纖維素膜,PVDF膜具有更好的截留總HIV抗原能力并提高抗體檢測糖基化被膜抗原的性能。但是PVDF膜最大的優(yōu)點(diǎn)不僅于此:更好的機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)耐受性使PVDF膜在各種染色應(yīng)用和多重免疫檢測中成為

38、理想選擇;而且單個(gè)凝膠的泳道復(fù)本可用于多種目的,如考馬斯亮藍(lán)染色后切出條帶并進(jìn)行N-末端測序、蛋白消化/肽分離/內(nèi)部測序和免疫檢測(Kurien,et al.,2003)。特別是需要做N端蛋白測序,在相當(dāng)“嚴(yán)酷”的清洗條件下,當(dāng)尼龍或者硝纖膜已經(jīng)降解的情況下PVDF膜依然保持本色,笑傲江湖。所以PVDF也是要做蛋白測序的唯一選擇。此外,個(gè)人經(jīng)驗(yàn),一些強(qiáng)疏水蛋白用PVDF膜效果會(huì)更好一些。PVDF膜適用的檢測方法也不少,化學(xué)發(fā)光、常規(guī)顯色、同位素和標(biāo)準(zhǔn)染色都一樣OK,但不適合熒光。PVDF膜特別注意的是需要100%甲醇預(yù)處理(不超過15秒)再用緩沖液平衡,才能用,而且適用過程中萬一干了也要同樣程

39、序再處理(不過要真出現(xiàn)這種問題也是自己欠扁,誰要你不小心呢,轉(zhuǎn)膜前處理也就罷了,轉(zhuǎn)膜后再這樣處理可能會(huì)影響后繼的抗體識(shí)別呢)。PVDF膜同樣分0.45um和0.2um的,后者孔徑小,對(duì)小分子蛋白有較好的攔截吸附,背景可能會(huì)比前者稍高。PVDF膜常見(chn jin)的有以下幾個(gè)品牌公司產(chǎn)品名孔徑適用范圍參考價(jià)格MilliporeImmobilon Transfer Membranes0.45um0.2um$212Bio-RadImmun-Blot PVDF MembraneChemiluminescent, colorimetric western blots,amino-terminal sequence and total amino acid compositionPiercePVDF Membrane0.45um0.2umWestern, Southern, N

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