藥物化學(xué)課件—先導(dǎo)物的優(yōu)化要求_第1頁
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文檔簡介

1、藥物化學(xué)課件先導(dǎo)物的優(yōu)化要求一、引 言 由于先導(dǎo)化合物只提供一種具有特定藥理作用的新結(jié)構(gòu)類型,作為線索物質(zhì),往往存在藥學(xué)、藥效學(xué)、藥代動力學(xué)的缺點(diǎn)或不足,存在不良反應(yīng)而不能臨床使用,需要對先導(dǎo)物進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造或修飾,以優(yōu)化上述性質(zhì)。例如:可能因?yàn)榛钚圆粔驈?qiáng),選擇性作用不高,生物利用度不好,毒副作用大,化學(xué)穩(wěn)定性差等需要進(jìn)行優(yōu)化。迄今所用的優(yōu)化方法大都是經(jīng)驗(yàn)性的操作,通過這樣的化學(xué)操作和生物評價(jià),可能發(fā)現(xiàn)決定藥理作用的藥效團(tuán)。 優(yōu)化過程就是揚(yáng)棄那些不利性質(zhì),提高和改善所希望的性質(zhì)。變換先導(dǎo)化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)是千差萬別的,相當(dāng)不明確的,在一定意義上講,往往要靠藥物化學(xué)家的知識、經(jīng)驗(yàn)和直覺,而且是個反復(fù)

2、試驗(yàn)的過程。 此外,先導(dǎo)物的優(yōu)化也有出于專利保護(hù)的考慮。 一般而言,優(yōu)化的策略是根據(jù)先導(dǎo)化合物結(jié)構(gòu)的復(fù)雜程度和要達(dá)到的目標(biāo)而定的。 結(jié)構(gòu)較復(fù)雜的先導(dǎo)物用簡化的方法,即將復(fù)雜結(jié)構(gòu)的化舍物解體成小片分子,即設(shè)計(jì)剖裂物; 分子大小適中的化合物則效仿原化合物的結(jié)構(gòu),設(shè)計(jì)類似物,也可以將兩個相同或不同活性的分子綴合在一起,形成孿生藥物或拼合物。二、先導(dǎo)物優(yōu)化的一般方法 (一)剖裂物先導(dǎo)化合物較復(fù)雜,常用剖裂操作,作分子剪切進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化。例如:對鎮(zhèn)痛藥嗎啡(4-69)進(jìn)行優(yōu)化中,累計(jì)合成了1000多個化合物,并揭示了苯基哌啶是呈現(xiàn)中樞鎮(zhèn)痛作用的藥效團(tuán)。簡化的過程是由五環(huán)系的嗎啡,簡化成四環(huán)系嗎啡喃(4-7

3、0),再簡化成三環(huán)系的苯并嗎啡烷(4-71)最后得到二環(huán)系派替啶(4-72)。應(yīng)當(dāng)指出,割裂和簡化的結(jié)構(gòu)雖仍保持強(qiáng)效鎮(zhèn)痛活性,但并未消除麻醉的副作用。五環(huán)系嗎啡(4-69) 四環(huán)系嗎啡喃(4-70)三環(huán)系苯并嗎啡烷(4-71) 二環(huán)系派替啶(4-72)天然產(chǎn)物曲林菌素(Asperlicin,4-73)是縮膽囊素(Cholecystokinin,CCK)受體的強(qiáng)效拮抗劑,通過簡化結(jié)構(gòu)和活性測定,證明苯并二氮卓酮與四氫吲哚片段是重要藥效團(tuán),并合成了MK-329(4-74)其活性強(qiáng)于曲林菌素100000倍,選擇性高,作用時間長,且可口服。曲林菌素(Asperlicin,4-73) MK-329(4-

4、74)(二)類似物先導(dǎo)物優(yōu)化的結(jié)構(gòu)改造,更常用的方法是類似物變換,即對先導(dǎo)物結(jié)構(gòu)作局部變換或修飾。包括:改變分子的大小,增加或減少飽和碳原子數(shù)的同系化合物,引人雙鍵的插烯操作,引入或除去手性中心,引入、去除或變換功能基或有空間障礙的大體積基團(tuán),鏈狀化合物變成環(huán)狀物,環(huán)狀分子開環(huán)成鏈狀物,柔性-剛性分子的變換,基團(tuán)的位置或方向的變換,分子的電荷分布或狀態(tài)的變換等,這些都是局部變換和修飾的內(nèi)容。同系物的變換同系物原理最早始于有機(jī)化學(xué),在藥物化學(xué)中該原理的含義相同,即分子間的差異只是亞甲基的數(shù)目不同。在先導(dǎo)物優(yōu)化中最常見的同系物操作是單烷基衍生化,不同碳原子數(shù)的脂環(huán)同系物,直鏈雙功能基化合物和多亞甲

5、基化合物。單烷基衍生化是在先導(dǎo)物結(jié)構(gòu)中逐個增加或減少亞甲基的操作。烷基鏈的增長或縮短,得到活性高或低同系物,這是最常用的設(shè)計(jì)方法。3-哌嗪基-1,2,5,6-四氫-1-甲基吡啶(4-75)為M1蕈毒堿樣受體激動劑;由O-甲基增加到O-丁基,對M1受體親和力由L增加到組成脂環(huán)的碳原子數(shù)不同所構(gòu)成同系物,對活性的影響可用縮膽囊素的擬肽加以說明。-甲基色氨酸的氨基被環(huán)烷氧羰基酰化,羧基將苯乙胺酰化,所得到的擬三肽(4-76),對受體的結(jié)合作用與環(huán)的大小相關(guān),但并不完全與分配系數(shù)相平行。擬三肽對受體的結(jié)合作用與環(huán)的大小相關(guān),但并不完全與 lgP相平行。苯并咪唑類血栓素A2受體拮抗劑(4-77)對亞甲基

6、的變換則非常敏感,例如:當(dāng)n=0時,IC50為1700nmol/L;n=1,;n=2,IC50=20mmol/L。同系化合物生物活性的變化隨化合物序列和活性特征的不同而改變,無普遍規(guī)律可循。例如:全身麻醉藥、揮發(fā)性殺蟲藥和表面活性物質(zhì)等結(jié)構(gòu)非特異性藥物,隨碳原子數(shù)的增加活性有規(guī)律地增高,達(dá)到最高活性后,再增加碳原子數(shù)則活性降低,直至完全無活性。具有蕈毒堿樣作用的RNMe3+同系物和神經(jīng)節(jié)阻滯劑R3N+(CH2)nNR3+,活性隨碳原子數(shù)的增加而升高,當(dāng)前者的R為4個碳原子、后者n為4、5或6時活性達(dá)最大值,在一定范圍內(nèi)進(jìn)一步增加碳原于數(shù),活性變化不顯著。烷基鏈碳原子數(shù)的奇數(shù)和偶數(shù)之間對活性有較

7、大的影響,例如:抗瘧藥6-甲氧基-8-氨基喹啉的烷基鏈,的奇數(shù)碳鏈比相鄰的具有偶數(shù)碳鏈的化合物活性高。烷基碳原子數(shù)的變化還會引起藥理作用的翻轉(zhuǎn),例如:激動和拮抗、興奮和抑制的變化。去甲腎上腺素氨基NH2的1個氫原子隨著被甲基、乙基或正丙基代替,升高血壓作用依次減弱,但若被異丙基或叔丁基代替時,則為降壓作用,這可以認(rèn)為烷基的變換導(dǎo)致與不同受體的作用:伯胺化合物與-腎上腺受體作用,異丙基和叔丁基化合物與-腎上腺受體結(jié)合,甲、乙、丙基化合物則同時與-和-受體結(jié)合。去甲腎上腺素(三)引入烯鍵 生物活性分子中引入雙鍵包括兩個方面:一是在飽和碳鏈上引入雙鍵,另一是形成插烯物(vinylogues)。由于雙

8、鍵的引入改變了分子的構(gòu)型和構(gòu)象,分子形狀與飽和化合物有較大的差別,因此,生物活性會有較大的變化。例如:順式苯丙烯酸具有調(diào)節(jié)植物生長作用,而相應(yīng)的飽和化合物苯丙酸無此活性。雙鍵作為功能基比相應(yīng)的飽和烷基有較強(qiáng)的生物活性,例如:含不飽和鍵的巴比妥類藥物的催眠作用強(qiáng)于相應(yīng)的飽和化合物。烯鍵的引入使分子的剛性增加,會改變物理化學(xué)性質(zhì)。與雙鍵相連不同的基團(tuán)會因產(chǎn)生幾何異構(gòu)體而呈現(xiàn)不同的生物活性。 在分子中加入乙烯基或多乙烯基,根據(jù)插烯規(guī)則(vinylogy principle)在分子A-B之間插入一個或多個乙烯基制成插烯物A-(CHCH)n-B,n為1,2或3,或A與B處于苯環(huán)的鄰位或?qū)ξ唬藭r,在電性

9、分布上,A同B猶如直接相連,往往可獲得相似或活性更強(qiáng)的藥物。 A與B被乙烯基或共軛多烯分開,空間距離加長,也會對活性產(chǎn)生很大的影響。普魯卡因的插烯物(4-78)仍有局部麻醉作用。乙氧脲(Ethoxyurea,4-79)和甘素(Dulcin,4-80)均為生甜物質(zhì),后者是前者的插烯(對位取代苯)物。(四)合環(huán)和開環(huán) 飽和鏈狀化合物合環(huán)成環(huán)狀化合物,或環(huán)狀化合物開環(huán)成鏈狀物,是分子設(shè)計(jì)中常見的方法。由于合環(huán)或開環(huán),分子的形狀、構(gòu)象和表面積發(fā)生了變化,會影響與受體的結(jié)合,也會改變藥代動力學(xué)性質(zhì)。對于藥效團(tuán)的三維結(jié)構(gòu)以及重要功能基的立體配置,可用半剛性或合環(huán)的方法,將柔性的先導(dǎo)物“固定”于某個特定的構(gòu)

10、象,這對于提高藥理作用和確定藥效構(gòu)象意義是很大的。 N,N-二甲基多巴胺(4-81)是多巴胺受體激動劑,在與受體結(jié)合時,苯環(huán)與胺乙基側(cè)鏈究竟呈怎樣的構(gòu)象配置,可用N,N-二甲基-5,6-二羥基四氫萘(4-82)和N,N-二甲基-6,7-二羥基四氫萘(4-83)作為構(gòu)象的限制物,這兩個化合物代表了柔性的多巴胺分子兩種不同的構(gòu)象。藥理試驗(yàn)表明,N,N-二甲基-6,7-二羥基四氫萘活性強(qiáng)于5,6-異構(gòu)體,提示多巴胺在與受體結(jié)合時,苯環(huán)處于特定的空間取向。 N,N-二甲基多巴胺(4-81) N,N-二甲基-5,6-二羥基四氫萘(4-82) N,N-二甲基-6,7-二羥基四氫萘(4-83)抗菌藥培氟沙星

11、(Pefloxacin,4-84)經(jīng)環(huán)合到8位,得到OPC-7241(4-85),再經(jīng)氧原子替換亞甲基,制出氧氟沙星(Ofloxacin,4-86),后者的抗菌作用強(qiáng)于培氟沙星。止咳藥奧昔拉定(Oxeladin,4-87)和噴托維林(Pentoxyverine,4-88)分別是開環(huán)和閉環(huán)化合物,前者的二乙基被四亞甲基代替,成為環(huán)戊化合物。同樣,抗膽堿藥曲地碘銨(Tridihex-ethy1 Iodide,4-89)的三乙銨基被N-甲基吡咯烷代替,成為三環(huán)氯銨(Tricyclamol chloride,4-90)。抗瘧藥氯胍和環(huán)氯胍也分別是開環(huán)和閉環(huán)化合物。開鏈-閉環(huán)的變換也會引起活性發(fā)生質(zhì)的變

12、化,例如:平喘藥麻黃素(Ephedrine,4-91)的相應(yīng)環(huán)狀化合物芬美曲秦(Phen-metrazine,4-92)無平喘作用,為食欲抑制劑。(五)大基團(tuán)的引入、去除或置換藥物分子中引入體積較大的基團(tuán),會阻礙與酶或受體的相互作用,導(dǎo)致生物活性改變。例如:青霉素和頭孢菌素類抗生素分子中引入大體積基團(tuán),會阻斷-內(nèi)酰胺酶對-內(nèi)酰胺環(huán)的水解破壞,提高耐受-內(nèi)酰胺酶的能力。在藥物設(shè)計(jì)中。向內(nèi)源性活性物質(zhì)分子中引入大體積基團(tuán),可造成分子與受體作用的強(qiáng)烈變化,甚至翻轉(zhuǎn)活性,例如由激動作用轉(zhuǎn)成拮抗作用。組胺的咪唑環(huán)被二苯甲氧基代替,變成苯海拉明,使H1受體激動作用轉(zhuǎn)向?yàn)檗卓棺饔?,為抗過敏藥;4-甲基咪唑的

13、側(cè)鏈修飾成,如西咪替丁的長鏈結(jié)構(gòu),則由H2受體激動劑變成具有抗消化道潰瘍作用的H2受體拮抗劑。-腎上腺能激動劑去甲腎上腺素(4-93)分子中引入大體積基團(tuán),可轉(zhuǎn)變成拮抗劑,例如:莫西賽利(Moxisylyte,4-94)為腎上腺能拮抗劑,是血管擴(kuò)張藥;-腎上腺能激動劑異丙腎上腺素(Isoprenaline,4-95)的苯環(huán)換成萘環(huán),側(cè)鏈再作適當(dāng)?shù)男揎棧瑒t為-受體阻滯劑普萘洛爾(Propranolol,4-96)。乙酰膽堿(4-97)的甲基被三環(huán)代替,成為抗膽堿藥溴丙銨太林(Propantheiineromide,4-98);5-羥色胺的受體拮抗劑美西麥角(Methyyse響df,4-99)是治

14、療偏頭痛藥物,它含有引哚乙胺的結(jié)構(gòu)。(六)改變基團(tuán)的電性 基團(tuán)的變換引起分子電荷分布的改變,主要通過兩種效應(yīng):誘導(dǎo)效應(yīng)和共軛效應(yīng)。這兩種效應(yīng)會導(dǎo)致藥物的物理和化學(xué)性質(zhì)發(fā)生深刻的變化,因而,對活性產(chǎn)生重大的影響。由于元素電負(fù)性的不同,分子內(nèi)電荷沿著鍵移動所產(chǎn)生的靜電引力就是誘導(dǎo)效應(yīng)。吸電子比氫原子強(qiáng)的原子或基團(tuán)產(chǎn)生負(fù)誘導(dǎo)效應(yīng)(-I),比氫原子弱的基團(tuán)產(chǎn)生正誘導(dǎo)效應(yīng)(+I)。 負(fù)誘導(dǎo)效應(yīng)的原子和基團(tuán)按照吸電子性的強(qiáng)弱次序?yàn)椋?NH2+,-NR3+,-NO2,-CN,-COOH,-COOR,-CHO,-COR,-F,-Cl,-Br,-OH,-OR,-SH,-SR,-CHCH2,-CRCR2,,-CC

15、H;正誘導(dǎo)效應(yīng)的原子和基團(tuán)按照推電子性強(qiáng)弱依次為:-CH3,-CH2R,-CHR2,-CR3,-COO-。分子中存在的,-共軛或p-共軛由于電子的離域化而導(dǎo)致電荷的流動稱為共軛效應(yīng)。能夠增加共軛系統(tǒng)電荷密度的原子或基團(tuán)呈現(xiàn)正性共軛效應(yīng)+R;降低系統(tǒng)電荷密度的原于或基團(tuán)呈現(xiàn)負(fù)性共軛效應(yīng)-R。具有負(fù)性共軛效應(yīng)(-R)和負(fù)性誘導(dǎo)效應(yīng)(-I)的基團(tuán)有:-NO2,-CN,-CHO,-COR,-COOH,-COOR,-CONH2,-CF3;具有正性共軛效應(yīng)(+R)和正性誘導(dǎo)效應(yīng)(+I)的基團(tuán)有:-O-,-S,-CH3,-CR3;同時具有正性共軛效應(yīng)(+R)和負(fù)性誘導(dǎo)效應(yīng)(-I)的原子或基團(tuán)有:-F,-C1

16、,-Br,-I,-OH,-OR,-OCOR,-SH,-SR,-NH2,-NR2,-NHCOR。分子設(shè)計(jì)中常把鹵素(尤其是F、Cl)原子引入芳香環(huán)上,從而改變了藥代和藥效學(xué)性質(zhì)。芳香環(huán)上引入鹵原子可產(chǎn)生3種效應(yīng):立體效應(yīng)、電性效應(yīng)和阻斷效應(yīng),氟或氯作用占據(jù)了苯環(huán)的對位,可以阻滯因生物氧化而形成的環(huán)氧化合物或羥基,從而,可降低毒性及延長作用時間。(七)生物電子等排 前已述及,電子等排概念是指化學(xué)上完全不同的物質(zhì),在物理性質(zhì)上有很大的相似性,例如:一氧化碳和氮?dú)?,乙烯酮和重氮甲烷。這種相似性可歸結(jié)與它們分別有相同的電子數(shù)和排布:一氧化碳和氮?dú)庥?4個軌道電子,乙烯酮和重氮甲烷有X個軌道電子。藥物化學(xué)

17、家擴(kuò)展了這一概念,處理化合物的生物活性。 生物電子等排體是指一組可產(chǎn)生相似或相反生物活性并具有相關(guān)物理、化學(xué)性質(zhì)的分子或基團(tuán)。生物電子等排的相似性是基于原子或基團(tuán)的價(jià)電子的數(shù)目和排布,而并不要求總電子數(shù)是相同的。一般而言,生物電子等排體是與同一受體部位相結(jié)合,或以相同的作用機(jī)理起作用的。常用的電子等排基團(tuán)和化合物如表4-3所示:-氨基丁酸(GABA,4-100)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的重要遞質(zhì),二氫蠅蕈堿(Dihydromuscimol,4-101)和硫代蠅蕈堿(Thiomuscimol,4-102)是GABA的環(huán)狀類似物,環(huán)中的CN鍵是GABA的CO鍵電子等排基,環(huán)上的羥基具有一定的酸性,二者的氨基

18、也與GABA的氨基位置相當(dāng),是GABA-A受體的強(qiáng)效激動劑。L-多巴(4-103)與L-含羞草堿(Mimosine,4-104)具有生物電子等排相似性,對酪氨酸酶卻呈現(xiàn)完全相反的藥理活性,L-多巴是該酶的底物,而L-含羞草堿是酶的抑制劑。檳榔堿(Arecoline,4-105)是蕈毒堿樣膽堿能M1受體激動劑,下面3個化合物(4-106,4-107,4-108)是它的生物電子等排體,也是該受體的激動劑。異羥肟酸作為羧酸的電子等排基團(tuán)用于非甾體抗炎藥,例如:異丁普生(Ibuproxam,4-109)是布洛芬(Ibuprofen,4-110)的類似物,奧沙美辛(Oxamethacin,4-111)與

19、吲哚美辛(Indomethacin,4-112)互為電子等排體,均為抗炎藥。異丁普生在體內(nèi)代謝成布洛芬,可認(rèn)為是布洛芬的前藥。然而奧沙美辛在體內(nèi)不能轉(zhuǎn)變成吲哚美辛,所以不是前藥。 肽類藥物的C端氨基酸殘基的羧基可用硫酸酯基代替,硫酸酯基可認(rèn)為是羧基的電子等排體。 例如:胃泌素的C端天冬氨酸的羧基被-OSO3H替代;七肽的腸促胰酶肽C末端殘基被絲氨酸或蘇胺的O-硫酸酯置換,仍具有酶活性。氨基酸的羧基被磷酸或亞磷酸置換,例如:鳥氨酸的電子等排物,是鳥氨酸的抗代謝物,可抑制大鼠肝鳥氨酸脫羧酶活性。 環(huán)系的電子等排,在苯環(huán)和芳香雜環(huán)之間的互換有許多成功的實(shí)例。分子內(nèi)氫鍵形成的環(huán)系是芳環(huán)或芳雜環(huán)的電子等

20、排體。例如:抗精神分裂作用的鄰甲氧基苯甲酰胺化合物(4-113)形成的分子內(nèi)氫鍵相當(dāng)于多巴胺的苯環(huán),可與多巴胺受體結(jié)合,因而有抗精神病作用。利尿藥阿米洛利(Amiloride,4-114)的羧基與胍基形成分子內(nèi)氫鍵,構(gòu)成了第二個雜環(huán)系,進(jìn)而合成了嗯二唑化合物(4-115),后者仍有利尿作用。三、孿藥 兩個相同的或不同的先導(dǎo)物或藥物經(jīng)共價(jià)鍵連接,綴合成新的分子,稱作孿藥(twin-drugs)。孿藥的設(shè)計(jì),是基于兩種考慮:一是孿藥在體內(nèi)重新分裂成原來兩個藥物,是為了改善藥代動力學(xué)或藥劑學(xué)性質(zhì),因此,孿藥可以認(rèn)為是前藥;另一類則在體內(nèi)不裂解??烧J(rèn)為組成孿藥的兩個藥物結(jié)合受體的不同位點(diǎn),產(chǎn)生新的或更

21、強(qiáng)的作用。(雖然設(shè)計(jì)的根據(jù)不足)將兩個相同的先導(dǎo)物或藥物連接,例如:將- 腎上腺能受體拮抗劑匹羅克生(Piperoxan,4-16)制成對稱的雙波贊(Dibozaneb,4-117):鈣通道拮抗劑尼群地平(Nitrendipine,4-118,IC50=0.2nm)經(jīng)間基-丁二醇連接得到的孿藥(BDHP,4-119),活性大約是尼群地平的10倍。兩個不同的藥物綴合成新化合物,希望產(chǎn)生雙重作用的藥物,即作用于兩個不同的受體,或同一受體的兩個不同位點(diǎn)。兩種藥物綴合在一起與同時服用該兩種藥物相比較,往往因改變了原有各自的藥代動力學(xué)性質(zhì),改善了藥效。組成孿藥的兩個藥物的藥效要適當(dāng),即在化學(xué)計(jì)量下的兩個

22、藥物與各自受體作用的濃度應(yīng)匹配,否則,雙重的孿藥會失去意義。例如:將安定(劑量:2-5mg/次)與乙酰水楊酸(劑量:200-500 mg/次)以1:1綴合的孿藥是沒有意義的。然而將氯磺酰胺類利尿藥與-腎上腺能受體阻斷劑綴合(4-120),兼有利尿和-阻斷劑作用。尼群地平(Nitrendipine,4-118)間基-丁二醇連接孿藥(BDHP,4-119)氯磺酰胺類利尿藥與-腎上腺能受體阻斷劑綴合(4-120) 將具有擴(kuò)張血管作用的肼基噠嗪與-阻斷劑拼合成兼具-阻斷和擴(kuò)張血管作用的藥物普齊地洛(Prizidilol,4-121)。-內(nèi)酰胺類抗生素與-內(nèi)酰胺酶抑制劑的縮合產(chǎn)物也是常見的拼合方法。兩種

23、作用不同的分子結(jié)合成新的分子也有時出現(xiàn)新的藥理作用。如:具有誘導(dǎo)分化作用的全反式維甲酸與維生素E形成的酯,稱作維甲生育醇酯(Tocoretinate,4-122),具有抗?jié)冏饔?,臨床上用于治療褥瘡。四、定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR) 創(chuàng)制新藥需要有大量的信息與數(shù)據(jù):藥物分子的化學(xué)信息和生物活性信息。正確地對這兩方面的信息進(jìn)行分析和關(guān)聯(lián),可在分子水平上揭示藥物的作用機(jī)理和作用方式,并對指導(dǎo)先導(dǎo)物的優(yōu)化與合成起重要的作用。倘若藥物分子的化學(xué)信息,例如:結(jié)構(gòu)式、化學(xué)性質(zhì)和化學(xué)參數(shù)能夠定量地描述,生物活性數(shù)據(jù)也可以定量地表達(dá),并用適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計(jì)學(xué)方法進(jìn)行分析處理,則可以較精確地研究藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)與生物活性之間

24、的關(guān)系,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化。定量構(gòu)效關(guān)系是計(jì)算機(jī)輔助分子設(shè)計(jì)的一個重要內(nèi)容。定量的結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系,簡稱定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)。通過分子變換進(jìn)行先導(dǎo)物優(yōu)化,合成新化合物并進(jìn)行活性評價(jià),探索活性對結(jié)構(gòu)變換的依賴關(guān)系。應(yīng)用計(jì)算機(jī)可以分析隱含在化學(xué)結(jié)構(gòu)內(nèi)的各樣物理和化學(xué)參數(shù)同生物活性數(shù)據(jù)的內(nèi)在聯(lián)系,用一種數(shù)學(xué)模型(例如:方程式或圖形)加以表達(dá),從而更加準(zhǔn)確和深入地認(rèn)識影響活性的諸結(jié)構(gòu)因素,并依此數(shù)學(xué)模型進(jìn)行新化合物的預(yù)測,指導(dǎo)新一輪的合成。進(jìn)行定量構(gòu)效關(guān)系分析的前提條件: 化合物的結(jié)構(gòu)或其物理化學(xué)性質(zhì)能夠定量地描述;生物活性也應(yīng)定量描述;適宜的計(jì)算機(jī)軟件。化合物的結(jié)構(gòu)參數(shù)可以用多種方法表示,最

25、常用的是Hansch-藤田創(chuàng)立的線性自由能相關(guān)分析法LtsJ,該方法所用的結(jié)構(gòu)參數(shù)是化合物的物理化學(xué)常數(shù)。 Hansch-藤田分析法的理論根據(jù)是,藥物呈現(xiàn)的生物活性是由于藥物分子與生物大分子(受體)相互作用的結(jié)果。這種相互作用,本質(zhì)上是藥物與受體雙方的原子或原子團(tuán)之間的化學(xué)或物理化學(xué)結(jié)合作用。 結(jié)合鍵可以是較強(qiáng)的共價(jià)鍵,或較弱的氫鍵、靜電引力、疏水鍵、或范德華力,以及在空間契合和適配的程度。 當(dāng)猶如“黑箱”的受體結(jié)構(gòu)不甚了了時,Hansch-藤田分析法用一系列結(jié)構(gòu)已知的藥物分子及其活性作“投石問路”,借助藥物分子一方的物化參數(shù)對活性的貢獻(xiàn),映射出受體與藥物結(jié)合的特征。 這種方法所使用的結(jié)構(gòu)參數(shù),有表征基團(tuán)的電性參數(shù);描述基團(tuán)的疏水性常數(shù);以及表示基團(tuán)空間效應(yīng)的各種參數(shù)如:Es,MR等。計(jì)算機(jī)的作用是用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法找出哪些結(jié)構(gòu)參數(shù)影響生物活性以及影響的相對程度,以構(gòu)效方程的方式表示: 生物活性BE(1/IC50)=a +b+d2+eMR+c圖4-7是定量構(gòu)效關(guān)系研究的模式圖: 用Hansch-藤田法研究苯酞類化合物的抗驚厥作用得到構(gòu)效方程19: 1g 1/ED50= 1gP+ MR6 式中,1g1/ED50代表化合物為保護(hù)半數(shù)小鼠免受最大電休克引起驚厥時

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