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1、2010級生物技術(shù)蛋白質(zhì)與酶工程復(fù)習(xí)資料第 PAGE 61 頁2013年6月12日 蛋白質(zhì)與酶工程概述(i sh)1 相關(guān)概念(ginin)、2 蛋白質(zhì)工程概述、3 酶工程概述一、 相關(guān)(xinggun)概念1、工程:根據(jù)科學(xué)原理和有關(guān)技術(shù),組合出高效、合理的技術(shù)系統(tǒng),它除了要考慮技術(shù)的先進(jìn)性和可行性,還要考慮成本和質(zhì)量,做到經(jīng)濟(jì)、實(shí)用、美觀,要考慮對環(huán)境的影響,以避免污染它的成功有賴于多種科學(xué)技術(shù)的綜合集成和科學(xué)的管理2、生物工程( Bioengineering, Biologic engineering):以生命科學(xué)為基礎(chǔ),利用生物體系和工程原理生產(chǎn)生物制品和創(chuàng)造新物種的綜合性科學(xué)技術(shù),是

2、現(xiàn)代生物學(xué)中一切工程技術(shù)的總稱,包括:遺傳工程(基因工程)、蛋白質(zhì)工程、細(xì)胞工程、微生物工程(發(fā)酵工程)、酶工程(生化工程)、生物反應(yīng)器工程3、細(xì)胞工程(cell engineering ):應(yīng)用細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)和工程學(xué)的原理和技術(shù),在細(xì)胞或亞細(xì)胞水平上,通過細(xì)胞融合、核移植、細(xì)胞器移植或染色體操作,有目的地制造特定的細(xì)胞、細(xì)胞產(chǎn)品或新生物體的一門生物技術(shù)(如:改良生物品種,創(chuàng)造新品種,加速繁育動植物個體,或獲得某種有用的物質(zhì))。在細(xì)胞水平上動手,也稱細(xì)胞操作技術(shù)。狹義的細(xì)胞工程:指細(xì)胞融合和細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)。廣義的細(xì)胞工程:所有的生物組織、器官及細(xì)胞離體操作和培養(yǎng)技術(shù)(動植物細(xì)胞的體外培養(yǎng)

3、技術(shù)、細(xì)胞融合技術(shù)、單克隆抗體技術(shù)、核移植和胚胎移植技術(shù)等)二、比較不同的工程三、 蛋白質(zhì)工程1、定義:以蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)及其與功能的關(guān)系作為基礎(chǔ),通過理化和DNA重組等方法對基因和蛋白質(zhì)進(jìn)行有目的地設(shè)計(jì)、改造和修飾,最終獲得滿足人類生產(chǎn)和生活需求的新型蛋白質(zhì)(天然蛋白質(zhì)的改造,或是純新蛋白質(zhì))2、研究內(nèi)容:(1)通過定點(diǎn)突變、定向進(jìn)化等技術(shù),合成具有特定氨基酸序列和空間結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)(2)確定蛋白質(zhì)化學(xué)組成、空間結(jié)構(gòu)與生物功能之間的關(guān)系。此利于從aa序列預(yù)測蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)和生物功能,以設(shè)計(jì)合成具有特定功能的全新蛋白質(zhì)。具體包括:蛋白質(zhì)分離純化、結(jié)構(gòu)功能分析、設(shè)計(jì)和預(yù)測;通過基因重組或其它手段

4、改造或創(chuàng)造蛋白質(zhì) 3、蛋白質(zhì)工程原理:中心法則、中心法則的逆推4、蛋白質(zhì)工程與基因工程(jyn gngchng)的關(guān)系 1)都以中心法則為根本的理論(lln)基礎(chǔ) 2)蛋白質(zhì)工程(gngchng)是基因工程的發(fā)展,“第二代基因工程” 3)基因工程是實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)工程的重要手段 4)蛋白質(zhì)工程通過基因工程加速著蛋白質(zhì)的進(jìn)化過程5、蛋白質(zhì)工程的目的和主要內(nèi)容 1)目的: 以蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)及其與生物功能的關(guān)系為基礎(chǔ),通過修飾和合成,對現(xiàn)有蛋白質(zhì)加以定向改造,設(shè)計(jì)、構(gòu)建并最終生產(chǎn)出性能比自然界存在的蛋白質(zhì)更加優(yōu)良、更符合人類需要的新型蛋白質(zhì) 2)蛋白質(zhì)工程的核心內(nèi)容 = 1 * GB3 * MERGEFOR

5、MAT 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析:收集大量的蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)信息,建立結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系的數(shù)據(jù)庫,為闡明蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系奠定基礎(chǔ)。 = 2 * GB3 * MERGEFORMAT 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能的設(shè)計(jì)和預(yù)測:根據(jù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系的數(shù)據(jù)庫,預(yù)測一段氨基酸序列的空間結(jié)構(gòu)和功能;反之,也可根據(jù)特定的生物功能,設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)的氨基酸序列和空間結(jié)構(gòu)。 = 3 * GB3 * MERGEFORMAT 蛋白質(zhì)的創(chuàng)造和改造:理化法、生化方法基因重組或人工合成DNA:既可改造蛋白質(zhì)也可從頭合成全新蛋白質(zhì) 3)蛋白質(zhì)工程的基本類型 = 1 * GB3 * MERGEFORMAT 從頭合成 理論上:可設(shè)計(jì)合成滿足人類需要

6、的各種蛋白質(zhì) 實(shí)際上:要生產(chǎn)這樣的全新蛋白并不容易,技術(shù)不成熟,目前只能合成一些很短小的肽 = 2 * GB3 * MERGEFORMAT 局部修飾或改造:常用,目前主要集中在該領(lǐng)域基因水平的改造:增減一些編碼序列;其前提是知道改變哪些序列可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)性狀的改變;相對容易蛋白質(zhì)水平的改造:對生產(chǎn)出的蛋白質(zhì)進(jìn)行修飾、加工(磷酸化,糖基化等)。化學(xué)修飾的條件劇烈,且無特異性,且對每批蛋白都要進(jìn)行操作,故繁瑣 = 3 * GB3 * MERGEFORMAT 具體方法舉例:隨機(jī)突變【方法:易錯PCR、基因改組(DNA shuffling)、基因家族改組(DNA family shuffling)優(yōu)點(diǎn):

7、在體外模擬自然進(jìn)化的過程】、定位突變【在已知DNA序列中替換、插入或刪除一定長度的核苷酸片段。優(yōu)點(diǎn):突變率高,簡單易行和重復(fù)性好。方法:*寡核苷酸介導(dǎo)的定點(diǎn)突變?nèi)绾惺酵?cassette mutagenesis)又稱片段取代法(DNA fragment replacement),利用一段人工合成的含基因突變序列的寡核苷酸片段,取代野生型基因中的相應(yīng)序列】、蛋白質(zhì)融合蛋白質(zhì)工程的基本工序1)首先明確所需要的蛋白質(zhì)的特性2)根據(jù)3D結(jié)構(gòu)與生物活性的規(guī)律,設(shè)計(jì)具有上述特性的蛋白質(zhì)的3D結(jié)構(gòu)3)根據(jù)aa序列決定蛋白質(zhì)特定的3D結(jié)構(gòu)的內(nèi)在規(guī)律,設(shè)計(jì)出具有該3D結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)的aa序列和編碼之的基因序列4)

8、通過基因定位突變或其它方法獲得上述基因序列5)通過基因工程方法獲得該新蛋白6)主要困難:對aa序列決定蛋白質(zhì)特定的3D結(jié)構(gòu)的內(nèi)在規(guī)律、 3D結(jié)構(gòu)與生物活性之間的確切關(guān)系缺乏足夠的了解7、 蛋白質(zhì)工程的應(yīng)用舉例1)定點(diǎn)突變與蛋白質(zhì)藥物工程:如胰島素2)以融合蛋白形式提高活性3)定點(diǎn)(dn din)突變提高酶的穩(wěn)定性4)抗體(kngt)工程:嵌合抗體和生產(chǎn)人源化的抗體等8、蛋白質(zhì)工程(gngchng)小結(jié)1)蛋白質(zhì)工程匯集了當(dāng)代分子生物學(xué)等多學(xué)科的一些前沿領(lǐng)域的最新成就2)它把核酸與蛋白質(zhì)結(jié)合、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與生物功能結(jié)合起來研究,開創(chuàng)了按照人類意愿改造、創(chuàng)造符合人類需要的蛋白質(zhì)的新時期 3)它將

9、蛋白質(zhì)與酶的研究推進(jìn)到嶄新的時代,為蛋白質(zhì)和酶在工業(yè)、農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥方面的應(yīng)用開拓了誘人的前景四、酶工程(Enzyme Engineering)1、酶及酶工程的定義1)酶(enzyme)生物催化劑(biocatalyst)由活細(xì)胞產(chǎn)生在細(xì)胞內(nèi)、外對其特異底物起高效催化作用本質(zhì)是蛋白質(zhì)和RNA 2)生物催化(Biocatalysis):利用酶或有機(jī)體(細(xì)胞或細(xì)胞器等)作為催化劑實(shí)現(xiàn)化學(xué)轉(zhuǎn)化的過程3)酶工程定義:是由酶學(xué)理論與化學(xué)工程技術(shù)、基因工程技術(shù)、微生物學(xué)技術(shù)相結(jié)合而產(chǎn)生的一門新的技術(shù)學(xué)科,是現(xiàn)代生物技術(shù)的主要組成部分之一;它從應(yīng)用的角度,研究酶的生產(chǎn)及其在各方面的應(yīng)用,即是酶的生產(chǎn)和應(yīng)用的技術(shù)

10、過程2、酶的化學(xué)性質(zhì):蛋白質(zhì)和RNA,故分為蛋白質(zhì)酶(proteozyme,P酶):是主要的一類,已發(fā)現(xiàn)數(shù)千種;數(shù)百種酶得到結(jié)晶,可作用于蛋白質(zhì)、核酸、脂肪等。核酸類酶(ribozyme,核酶,R酶):也稱酶RNA、類酶RNA;為數(shù)不多,主要作用于核酸(DNA和RNA);主要是切割,有些具RNA連接酶、磷酸酶等活性;也作用于多糖等與P酶相比,其催化效率較低,是一種較為原始的催化酶。3、酶的兩個特點(diǎn)和一個優(yōu)點(diǎn)兩個特點(diǎn):高效和專一。高效:指酶強(qiáng)大的催化能力;專一:一種酶只作用于具有一定結(jié)構(gòu)的物質(zhì)(底物)一個優(yōu)點(diǎn):常溫、常壓下發(fā)揮作用4、酶工程應(yīng)用:利用酶的催化作用進(jìn)行物質(zhì)轉(zhuǎn)化-合成有用物,分解有害

11、物;目前主要集中于食品工業(yè)、輕工業(yè)、醫(yī)藥工業(yè)和環(huán)境保護(hù)等領(lǐng)域5、酶工程任務(wù):通過預(yù)先設(shè)計(jì),再由人工操作而獲得大量所需的酶,并通過各種方法使酶發(fā)揮最大的催化功能。因?yàn)槊甘歉咝?、專一地催化特定化學(xué)反應(yīng),并且反應(yīng)條件溫和、反應(yīng)產(chǎn)物容易純化,因此,酶促反應(yīng)能耗低、污染小、操作簡單、容易控制。故而較之傳統(tǒng)的化工反應(yīng),具有更強(qiáng)的競爭力6、酶工程的主要內(nèi)容:酶制劑的來源酶的制備酶和細(xì)胞固定化酶分子改造(又稱:酶分子修飾)有機(jī)介質(zhì)中的酶反應(yīng) 酶傳感器(又稱酶電極)酶反應(yīng)器酶技術(shù)的應(yīng)用研究7、酶工程發(fā)展史(小結(jié))酶工程是在人類原始的應(yīng)用酶的催化作用的基礎(chǔ)上逐漸發(fā)展起來的50年代酶制劑的生產(chǎn)和應(yīng)用有了迅速發(fā)展,這

12、一時期主要是溶液酶的應(yīng)用60年代出現(xiàn)固定化酶技術(shù),并很快應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)70年代出現(xiàn)固定化細(xì)胞(產(chǎn)酶的細(xì)胞)等技術(shù),發(fā)展了包括輔助因子再生的固定化多酶反應(yīng)體系的研究80年代以來出現(xiàn)并應(yīng)用了酶修飾技術(shù)及基因工程蛋白質(zhì)與酶工程之酶學(xué)基本理論一、酶學(xué)基本(jbn)理論1-1 酶的概念(ginin)1)酶的現(xiàn)行定義:是由活細(xì)胞產(chǎn)生(chnshng)、在細(xì)胞內(nèi)外均對其特異底物起高效催化作用的生物催化劑,包括蛋白質(zhì)和RNA,分別稱為P酶和R酶2)據(jù)其是天然存在、還是誘導(dǎo)后出現(xiàn),分為: (1)結(jié)構(gòu)酶(固有酶):細(xì)胞中天然存在的酶 (2)誘導(dǎo)酶:當(dāng)細(xì)胞遇到特定情況后(如誘導(dǎo)劑)誘導(dǎo)產(chǎn)生的酶1-2 酶的催化作用及

13、特點(diǎn)1)酶所催化的反應(yīng)稱為酶促反應(yīng),在酶促反應(yīng)中被催化的物質(zhì)稱為底物(S),反應(yīng)的生成物稱為產(chǎn)物(P),酶所具有的催化能力稱為酶活性2)作為生物催化劑,具有一般催化劑的共性-反應(yīng)前后其質(zhì)和量不變, 只催化熱力學(xué)允許的化學(xué)反應(yīng),即自由能由高向低轉(zhuǎn)變的化學(xué)反應(yīng),降低反應(yīng)的活化能,縮短平衡到達(dá)的時間,不改變平衡常數(shù)k3)酶是生物大分子,又具有其特點(diǎn)(個性)(1)高效率:比非催化高 10 x810 x20倍 比非酶催化高 10 x710 x13倍(2)高度專一性(specificity) :即一種酶只作用一種或一類化合物,只催化一定的化學(xué)反應(yīng)并生成一定的產(chǎn)物, 這是酶最重要的特點(diǎn)之一,也是與一般催化劑

14、最主要的區(qū)別 酶的專一性可分為絕對特異性:酶只催化一種底物進(jìn)行一種化學(xué)反應(yīng)相對特異性:酶催化同一類化合物或同一種化學(xué)鍵進(jìn)行同一類型化學(xué)反應(yīng)立體異構(gòu)特異性:酶僅作用于立體異構(gòu)體中的一種(3)酶的不穩(wěn)定性要求反應(yīng)條件:溫和 37、1atm、pH7(4)部分酶的活力與其輔助因子有關(guān)(5) 酶的催化活性是可調(diào)控的.例如:抑制劑和激活劑、代謝物或產(chǎn)物的變化等都可抑制或激活酶的活性;還有別構(gòu)調(diào)控、酶原激活等1-4 兩類酶的區(qū)別舉例1)P酶:只能催化其它分子進(jìn)行反應(yīng);R酶:既能催化其它分子進(jìn)行反應(yīng)也能催化酶分子本身 2)催化大分子水解生成小分子的酶,在R酶叫剪切酶,在P酶則叫水解酶,意在便于區(qū)別R酶和P酶二

15、、 酶及其活性中心的組成、結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和活力測定2-1 酶的分子組成1)酶分為簡單酶(單純酶)和結(jié)合酶簡單酶:僅由肽鏈構(gòu)成,如脲酶 脂酶 淀粉酶等 結(jié)合酶:由蛋白部分(酶蛋白,Apoenzyme)和非蛋白部分(輔助因子,Cofactor)組成酶蛋白+輔助因子全酶(Holoenzyme)這兩部分都是酶催化活性所必需的,即只有全酶才具有催化活性2)根據(jù)蛋白的特點(diǎn),分為- (1)單體酶:由單條肽鏈組成;為數(shù)不多,均為水解酶(溶菌酶、胰蛋白酶和核糖核酸酶等) (2)寡聚酶:由多個(du )相同或不同的亞基以非共價(jià)鍵連接而成,如磷酸化酶、3-磷酸甘油醛脫氫酶等 (3)多酶體系(tx):細(xì)胞內(nèi)存在的、由幾種不

16、同功能的酶彼此嵌合形成的多酶復(fù)合體,它有利于一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行,如丙酮酸脫氫酶體系、脂肪酸合成酶復(fù)合體。在多酶體系中,能夠影響整條代謝途徑方向和速度的酶是關(guān)鍵酶,它通常催化單向不平衡反應(yīng),或是該多酶體系中催化活性最低的限速酶3)酶的輔助因子 (1)輔酶(Coenzyme):以非共價(jià)鍵與酶蛋白疏松(sh sn)結(jié)合,可用透析、超濾法分離 (2)輔基(Prosthetic group ):以共價(jià)鍵與酶蛋白牢固結(jié)合,不易分離;在反應(yīng)中輔基不能離開酶蛋白 (3)金屬離子:多為酶的輔基,約2/3的酶含有之,常見的是K+、Mg2+、Cu2+、Zn2+等,其作用是多方面的:參與酶的活性中心;在酶蛋白與底物

17、之間起橋梁作用;維持酶分子發(fā)揮催化作用所必需的構(gòu)象;中和陰離子,降低反應(yīng)中的靜電斥力(4)小分子有機(jī)化合物:有的屬輔酶(NAD+、NADP+) 有的屬輔基(FAD、FMN) 它們是維生素樣的物質(zhì),參與酶的催化過程,在反應(yīng)中傳遞電子、質(zhì)子或一些基團(tuán)各種維生素的輔酶(輔基)形式4)1種酶蛋白+1種輔助因子=1種特異的酶only) 1種輔助因子+N種酶蛋白=N種特異性酶(以催化N種化學(xué)反應(yīng))5)每一種輔助因子都具有特殊的功能,可以特定地催化某一類型的反應(yīng)輔助因子-決定酶所催化的反應(yīng)類型(反應(yīng)專一性)酶蛋白決定所催化的底物類型(底物專一性)2-2 酶的活性部位(active site)1)定義:是酶與

18、底物結(jié)合并將之轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的區(qū)域,又稱活性中心2)酶活性中心的特點(diǎn) (1)是由在線性多肽鏈中可能相隔較遠(yuǎn)的氨基酸殘基形成的三維小區(qū) (2)在酶分子的總體中只占小的部分 (3)是位于亞基或結(jié)構(gòu)域之間的裂隙或是表面的凹陷部位(為裂縫或凹陷)(4)其與底物的形狀并非正好互補(bǔ),而是誘導(dǎo)契合,即它在構(gòu)象上具有柔性或可運(yùn)動性(5)對單純酶:它由一些aa殘基的側(cè)鏈基團(tuán)組成,對結(jié)合酶:還包括部分輔酶或輔基的結(jié)構(gòu)3)酶活性部位的組成,由必需基團(tuán)組成 (1)必需基團(tuán):參與酶活性中心組成、對維持該中心的空間構(gòu)象所必需的那些基團(tuán)。包括: 結(jié)合基團(tuán):它與底物結(jié)合,生成ES 催化基團(tuán):它影響底物分子中某些化學(xué)鍵的穩(wěn)定性,催

19、化底物發(fā)生化學(xué)反應(yīng),從S轉(zhuǎn)變?yōu)镻有的必需基團(tuán)同時兼有這兩種功能有些化學(xué)基團(tuán),位于酶活性中心外,但也是維持該中心構(gòu)象所必需的,稱為酶活性中心以外的必需基團(tuán) 酶活性中心-必需基團(tuán)(結(jié)合基團(tuán) + 催化基團(tuán))4) 構(gòu)成酶活性中心的常見基團(tuán):組氨酸的咪唑基、絲氨酸的羥基、半胱氨酸的巰基、谷氨酸的-羧基5)酶的別構(gòu)中心 (調(diào)節(jié)部位)多數(shù)寡聚酶除有結(jié)合S的活性中心外,還有可結(jié)合調(diào)節(jié)(tioji)物的別構(gòu)中心,兩個中心分別在酶分子的不同部位 2-3 酶原(mi yun)及其激活1)定義(dngy):沒有活性的酶的前體稱為“酶原”,酶原轉(zhuǎn)變成酶的過程稱為酶原激活,其實(shí)質(zhì)是酶活性部位形成或暴露的過程2)舉例:胃蛋

20、白酶和胰蛋白酶在最初合成和分泌時,沒有催化活性胃蛋白酶原在H+作用下,自N端切下幾個多肽碎片,形成酶催化所需的空間結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)化為胃蛋白酶胰蛋白酶原隨胰液進(jìn)入小腸時被腸激酶激活,自N端切除一個6肽,促使酶的構(gòu)象變化,形成活性中心,轉(zhuǎn)變成有活性的胰蛋白酶3)酶(聯(lián))級聯(lián)反應(yīng)1)定義:一種酶原的激活常會引發(fā)一系列酶的激活,這樣的系列激活反應(yīng)即酶(聯(lián))級聯(lián)反應(yīng) 2)意義(1)放大信號或生化過程(2)也給調(diào)控提供了機(jī)會3)舉例 (1)凝血過程中的酶級聯(lián)反應(yīng)(2)細(xì)胞凋亡啟動過程中的酶級聯(lián)反應(yīng)(3)MAPK級聯(lián)反應(yīng)4)酶原的生物合成和酶原激活一般不在同一組織、細(xì)胞或細(xì)胞器中進(jìn)行why?酶原的激活具有重要的生

21、理意義:(1)保護(hù)細(xì)胞本身不受酶的水解破壞(2)保證酶只在特定部位或環(huán)境中發(fā)揮催化作用2-4 同工酶、變構(gòu)酶和抗體酶1)同工酶(isozymes)具有不同的分子形式、但卻催化相同的化學(xué)反應(yīng)的一組酶,發(fā)現(xiàn)的第一個同工酶(1959年)是乳酸脫氫酶(LDH)它在NADH存在下,又催化丙酮酸逆轉(zhuǎn)化生成乳酸2)別(變)構(gòu)酶(allosteric enzyme)(1)變構(gòu)效應(yīng):一些物質(zhì)結(jié)合于酶活性部位以外的其它部位(變構(gòu)部位),引起酶分子的構(gòu)象變化,從而導(dǎo)致酶活性改變的現(xiàn)象(2)變構(gòu)酶:具有變構(gòu)效應(yīng)的酶。除有與底物結(jié)合的活性部位外,還有與變構(gòu)劑非共價(jià)結(jié)合的調(diào)節(jié)部位(3)引起變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì)稱為變構(gòu)效應(yīng)劑3)

22、抗體酶(abzyme)或催化抗體(catalytic antibody)定義:是具有催化功能的抗體本質(zhì):免疫球蛋白,其易變區(qū)被賦予了酶的屬性,即具有催化作用的免疫球蛋白抗體酶的研究,為人們提供了一條合理途徑去設(shè)計(jì)適合于市場需要的蛋白質(zhì),即人為地設(shè)計(jì)、制作酶。它是酶工程的一個全新領(lǐng)域.利用動物免疫系統(tǒng)產(chǎn)生抗體的高度專一性,可以得到一系列高度專一性的抗體酶,使抗體酶不斷豐富。隨之出現(xiàn)大量針對性強(qiáng)、藥效高的藥物 將抗體轉(zhuǎn)變?yōu)槊钢饕ㄟ^下列方法a誘導(dǎo)法:利用反應(yīng)過渡態(tài)類似物為半抗原制作單克隆抗體,篩選出具高催化活性的單抗b引入法:借助基因工程和蛋白質(zhì)工程將催化基因引入到特異抗體的抗原結(jié)合位點(diǎn)上,使其獲

23、得催化功能c拷貝法:主要根據(jù)抗體生成過程中抗原-抗體互補(bǔ)性來設(shè)計(jì)Pollack等以硝基苯酚磷酸膽堿酯作為半抗原誘導(dǎo)產(chǎn)生單抗,經(jīng)篩選找到加快水解反應(yīng)1.2萬倍的抗體酶 抗體酶的應(yīng)用及前景a抗體酶可催化多種化學(xué)反應(yīng),包括酯水解、酰胺水解、?;D(zhuǎn)移、光誘導(dǎo)反應(yīng)、氧化還原分應(yīng)、金屬螯合反應(yīng)等;甚至過去沒有酶能催化的反應(yīng)和熱力學(xué)上無法進(jìn)行的反應(yīng)b在第一批應(yīng)用的抗體酶中,有與蛋白酶相似的抗體,可以在特定氨基酸序列上切割(qig)蛋白質(zhì),從而建立具有各種專一性的切割蛋白質(zhì)的抗體酶庫,猶如限制性內(nèi)切酶庫一樣供研究者選用抗體酶的應(yīng)用(yngyng)及前景c一種(y zhn)抗體酶可切開血纖維蛋白(血凝塊的主要成

24、分),可以用于溶栓治療d一些抗體酶可固定在癌細(xì)胞突出的蛋白質(zhì)上,破壞癌細(xì)胞膜,將用于癌癥治療e一些抗體酶可有選擇地使病毒外殼蛋白的肽鍵裂解,從而防止病毒與靶細(xì)胞結(jié)合f立體專一性抗體酶的研究,使生產(chǎn)高純度立體專一性的藥物成為現(xiàn)實(shí),因此隨之出現(xiàn)大量針對性強(qiáng)、藥效高的藥物g有機(jī)化學(xué)家則希望利用抗體酶技術(shù)提供新的催化劑,使那些現(xiàn)在還不能利用天然酶催化的復(fù)雜反應(yīng)得以催化。h抗體酶的固定化已獲得成功,將大大地推進(jìn)工業(yè)化進(jìn)程 2-6 酶的活力及其測定1)酶活力(enzyme activity):也稱酶活性,是酶性質(zhì)的重要參數(shù),其實(shí)質(zhì)是酶催化化學(xué)反應(yīng)的能力2)酶活力測定:指采用各種檢測手段,確定酶催化化學(xué)反應(yīng)

25、的能力大小的技術(shù)過程,是酶的研究、生產(chǎn)和應(yīng)用過程中不可缺少的環(huán)節(jié) 酶活力大小不能用重量或體積來表示,可以用在一定條件下酶所催化的反應(yīng)的初速度表示。外界條件相同的情況下,反應(yīng)初速度越大,意味著酶活力越高 酶催化反應(yīng)的速度通常用單位時間內(nèi)底物的減少量或產(chǎn)物的增加量來表示3)常用的酶活力單位(active unit)是人們定義的一種酶量單位,用來衡量酶活力高低(1)國際單位(IU):1961年國際生化與分子生物學(xué)聯(lián)合會規(guī)定的: 酶在一定條件下(溫度25、pH等條件;均采用最適條件),每1分鐘催化1mol底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量叫做1個酶活力單位,也即IU,即1IU=1mol/min 酶的含量就可以用

26、每克或每毫升酶制劑含有多少酶活力單位來表示(IU/g, IU/ml)(2) Kat:在最適條件下,每秒催化1mol 底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量叫做1個酶活力單位,1 Kat6107 IU*為比較酶制劑的純度和活力高低,引入了比活力(specific activity),即特定條件下,單位質(zhì)量蛋白質(zhì)或RNA所具有的酶活力單位數(shù)*對同一種酶來說,比活力愈高,酶愈純 比活力活力單位數(shù) / 毫克(蛋白 或RNA) 酶制劑的總活力比活力 總體積 (ml)或總量(mg) 純化倍數(shù)每次純化后的比活力 / 初制品的比活力 回收率()(每次純化后的總活力/初制品的總活力)1004)酶活力測定方法:要求快速、簡便、

27、準(zhǔn)確,化學(xué)測定法、光學(xué)測定法、氣體測定法等一般包括五個步驟:選擇適宜的一定濃度的底物;確定酶促反應(yīng)的條件;將一定量的酶液和底物溶液混合,記錄反應(yīng)開始時間;反應(yīng)到一定時間(因要測定酶促反應(yīng)初速度),取出反應(yīng)液終止反應(yīng);通過各種生化檢測技術(shù),測定產(chǎn)物的生成量或底物的消耗量(一般多以產(chǎn)物的生成量來表示)* 終止反應(yīng)的常用方法沸水浴,加熱使酶滅活加入適宜的酶變性劑使酶失活(三氯醋酸等)加入酸或堿溶液,使反應(yīng)液遠(yuǎn)離最適pH而終止立即冷藏,使反應(yīng)液溫度迅速降低到10以下而終止反應(yīng)實(shí)際(shj)應(yīng)用時,可根據(jù)酶的特性、反應(yīng)底物和產(chǎn)物的性質(zhì)、酶活力測定方法等來具體選擇三、酶的作用(zuyng)機(jī)制3-1 鎖與

28、鑰匙(yo shi) (lock and key)學(xué)說1894年,由Fisher提出, 即酶與底物如鎖與鑰匙的關(guān)系,以此說明酶與底物結(jié)構(gòu)上的互補(bǔ)性,或底物的形狀與酶的活性部位彼此相適合,這是一種剛性的、固定的組合3-2 Henri中間產(chǎn)物學(xué)說1902年Henri的“中間產(chǎn)物學(xué)說”即酶催化時,酶活性中心首先與底物結(jié)合生成一種酶-底物復(fù)合物(ES),此復(fù)合物再分解,釋放出酶,并生成產(chǎn)物,即E+S ES E+P 該學(xué)說已為實(shí)驗(yàn)所證實(shí),且分離到若干種ES結(jié)晶3-3 米氏學(xué)說1913年, Michaelis 和 Menten根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說進(jìn)行數(shù)學(xué)推導(dǎo),得出V與S的數(shù)學(xué)方程式,即米-曼氏方程式Km是米氏

29、常數(shù),是酶的特征性常數(shù)之一,只與酶的結(jié)構(gòu)、酶所催化的底物和反應(yīng)環(huán)境有關(guān),與酶的濃度無關(guān)Km值為1/2Vmax時的底物濃度該方程式是:當(dāng)Km和Vmax一定時,酶反應(yīng)速度與S之間的定量關(guān)系3-4 誘導(dǎo)契合學(xué)說(induced-fit hypothesis ) 當(dāng)發(fā)現(xiàn)酶具有相當(dāng)?shù)娜嵝院螅?958年Koshland提出“誘導(dǎo)契合學(xué)說”*底物的結(jié)合誘導(dǎo)酶活性部位的構(gòu)象變化;*酶也可使底物變形,迫使其構(gòu)象近似于它的過渡態(tài),即:酶與底物相互結(jié)合的過程是相互誘導(dǎo)、相互變形、相互適應(yīng)的柔性過程3-5 操作子學(xué)說1961年,法國巴斯德研究所著名的科學(xué)家 Jacob 和 Monod提出“乳糖操縱子學(xué)說”調(diào)節(jié)乳糖催化

30、酶產(chǎn)生的操縱子*解釋了原核基因調(diào)控的原理 *闡明了酶生物合成的調(diào)節(jié)機(jī)制-通過誘導(dǎo)和解除阻遏,可顯著提高酶的產(chǎn)量乳糖操作子學(xué)說之調(diào)控機(jī)制 1)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)控(1)抑制作用:在無乳糖(Lac)的環(huán)境,I基因轉(zhuǎn)錄、合成的阻遏蛋白與操縱基因O結(jié)合,致RNA聚合酶不能與啟動基因P結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因便不能轉(zhuǎn)錄、合成酶蛋白,即該操縱子處于阻遏狀態(tài) (2)誘導(dǎo)作用:有乳糖時,乳糖代謝產(chǎn)生別乳糖,后者與阻遏蛋白結(jié)合并改變其構(gòu)象,以致不能再與O結(jié)合(去阻遏),RNA聚合酶便與P序列結(jié)合,從而激活結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯出酶蛋白,使半乳糖苷酶在細(xì)胞內(nèi)的含量增加1000倍。此即乳糖對該操縱子的誘導(dǎo)作用(3)負(fù)反饋:當(dāng)胞質(zhì)

31、中有了-半乳糖苷酶后,便催化分解乳糖(生成半乳糖和葡萄糖)。乳糖被分解利用后,于是阻遏蛋白又與操縱基因結(jié)合,使結(jié)構(gòu)基因處于阻遏狀態(tài) 2) CAP的正性調(diào)控:CAP分子內(nèi)有DNA結(jié)合區(qū)及cAMP結(jié)合位點(diǎn)。當(dāng)沒有葡萄糖及cAMP濃度較高時,cAMP與CAP結(jié)合于乳糖啟動序列附近的CAP位點(diǎn),可刺激RNA轉(zhuǎn)錄活性,使之提高50倍;當(dāng)葡萄糖存在時,cAMP濃度降低,cAMP與CAP結(jié)合受阻,因此乳糖操縱子表達(dá)下降3) 乳糖操縱子的強(qiáng)誘導(dǎo):既需要有乳糖的存在,又需要沒有葡萄糖可供利用對調(diào)節(jié)機(jī)制的解釋:由此可見,對乳糖操縱子來說 CAP是正性調(diào)節(jié)因素,乳糖阻遏蛋白是負(fù)性調(diào)節(jié)因素。兩種調(diào)節(jié)機(jī)制根據(jù)存在的碳源

32、性質(zhì)及水平協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)乳糖操縱子的表達(dá)狀態(tài),以決定大腸桿菌的代謝方式:*有葡萄糖存在時,細(xì)菌優(yōu)先選擇葡萄糖供能。葡萄糖通過降低 cAMP濃度,阻礙cAMP與CAP結(jié)合(jih)而抑制乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄,使細(xì)菌只能利用葡萄糖*在無葡萄糖而只有乳糖的條件下,阻遏蛋白與 O序列(xli)解聚,CAP結(jié)合cAMP后與乳糖操縱子的CAP位點(diǎn),激活轉(zhuǎn)錄,使得細(xì)菌可利用乳糖作為能源 四、 酶促反應(yīng)(fnyng)動力學(xué)4-1 酶反應(yīng)速度:在一定條件下,單位時間內(nèi)某化學(xué)反應(yīng)的底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物的速度;或者產(chǎn)物濃度增加的速度,單位: mol/L/s, mol/L/min, mol/L/h*測定酶反應(yīng)速度時,一般要求非常高的底

33、物濃度,以保證實(shí)驗(yàn)測定的起始反應(yīng)速度與酶濃度成正比*當(dāng)研究某一因素對酶促反應(yīng)速度的影響時,體系中的其它因素保持不變,而只變動所要研究的因素4-2 酶對反應(yīng)速度的影響,當(dāng)?shù)孜?酶或當(dāng)?shù)孜镒銐虼髸r,酶促反應(yīng)速度 酶4-3 底物對酶反應(yīng)速度的影響 根據(jù)米-曼氏方程,當(dāng)Km和Vmax一定時,酶反應(yīng)速度與S之間具有定量關(guān)系4-3 底物對酶反應(yīng)速度的影響1)當(dāng)S較低時,V與S呈正比關(guān)系(一級反應(yīng))2)隨著S的增高,V的增加逐步減慢(混合級反應(yīng))3)增到一定程度時,酶的活性中心已被S飽和 ,V不再增加,而是趨于穩(wěn)定(零級反應(yīng))4)當(dāng)SKm 時,v = Vmax S/Km,V與S成正比5)當(dāng)S Km 時 ,v

34、Vmax,V達(dá)到最大,再增加S也不影響V 反應(yīng)級數(shù)及特征一級反應(yīng):反應(yīng)速率與反應(yīng)物的濃度的一次方成正比。二級反應(yīng):反應(yīng)速率與兩種物質(zhì)濃度的乘積成正比。零級反應(yīng):反應(yīng)速率與反應(yīng)物濃度無關(guān)而受它種因素影響而改變的反應(yīng)。4-4 pH對酶反應(yīng)速度的影響 1)每一種酶只能在一定的pH范圍內(nèi)才表現(xiàn)活力,酶表現(xiàn)最大活力時的pH稱為酶的最適pH2)最適pH的微小偏離可使酶活性部位的基團(tuán)離子化發(fā)生變化而降低酶的活性3)偏離較大時,維護(hù)酶三維結(jié)構(gòu)的許多非共價(jià)鍵受到干擾,導(dǎo)致酶蛋白的變性4)酶的最適pH不是酶的特征性常數(shù),其受酶的純度、底物的種類和濃度、緩沖液的種類和濃度等的影響5)一般酶的最適pH在4-8之間植物

35、和微生物體內(nèi)的酶最適pH多在4.5-6.5,動物體內(nèi)的最適pH多在6.5-8,多在6.8左右例外,如胃蛋白酶最適pH為1.9,胰蛋白酶的最適pH為8.1,肝精氨酸酶的最適pH為9.06)Vo與pH的關(guān)系圖形是鐘形曲線pH影響酶活力的機(jī)制過酸、過堿都會使酶蛋白的構(gòu)象發(fā)生改變pH的改變能影響酶分子活性部位上有關(guān)基團(tuán)的解離pH也會影響底物分子的解離狀態(tài)4-5 溫度對酶反應(yīng)速度的影響溫度對Vo關(guān)系的圖形是一條曲線,它表示出最適溫度多數(shù)哺乳動物的酶最適溫度在37左右,植物體內(nèi)酶的最適溫度在50左右,有些微生物的酶(Taq酶)適應(yīng)在高溫或低溫下工作升溫對酶促反應(yīng)速度(fn yng s d)由雙重影響提高(

36、t go)反應(yīng)速度和酶遇熱易變性失活最終決定酶反應(yīng)速度的是這兩個相反效應(yīng)(xioyng)間的平衡*反應(yīng)體系的溫度低于最適溫度時,加熱可使反應(yīng)速度加快,每升高10,反應(yīng)速度增加12倍*當(dāng)反應(yīng)溫度高于最適溫度時,反應(yīng)速度則因酶受熱變性而降低酶的最適溫度不是酶的特征性常數(shù),它與反應(yīng)時間有關(guān)若酶促反應(yīng)進(jìn)行的時間短暫,則最適溫度要高些;反之,反應(yīng)時間延長,則最適溫度要低些低溫,一般不破壞酶,只是降低酶活性,當(dāng)溫度恢復(fù)后,活性仍可恢復(fù)。因此醫(yī)學(xué)上可用低溫保持生物制品如酶(固態(tài)最好)、菌種等4-6 激活劑對反應(yīng)速度的影響凡能使酶活性從無到有、從低到高的物質(zhì),即為酶的激活劑(activator)-必需激活劑:

37、對酶促反應(yīng)是不可缺少的,常是金屬離子,如Mg2+、K+ 、Mn2+ 等 Mg2+是多種激酶和合成酶的必需激活劑非必需激活劑:其不存在時,酶仍有一定活性,但加了這些激活劑,酶活性增加。包括有機(jī)化合物和Cl-等(如:膽汁酸鹽是胰脂肪酶,Cl-是唾液淀粉酶的非必需激活劑)激活劑種類1)無機(jī)離子 2)金屬離子3)具有蛋白質(zhì)性質(zhì)的大分子物質(zhì)(蛋白酶) 4)中等大小的有機(jī)分子 如:EDTA(乙二胺四乙酸)一些還原劑(半胱氨酸、谷胱甘肽)4-7 抑制劑對反應(yīng)速度的影響1) 酶抑制劑(1)酶活性的抑制:由于酶的必需基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)改變而引起的酶活性降低或喪失,非酶變性所致 酶的抑制劑:導(dǎo)致酶活性降低或喪失而不導(dǎo)

38、致酶分子變性的物質(zhì) 酶的失活(inactivation):是由于酶分子變性而引起的酶活力喪失的現(xiàn)象2)抑制作用的類型及特征 可逆和不可逆抑制兩類,以可逆抑制更重要 (1)不可逆抑制作用 定義:抑制劑與酶的必需基團(tuán)以共價(jià)鍵結(jié)合而致酶活力喪失;不能用透析、超濾或凝膠過濾等物理方法去除抑制劑而使酶復(fù)活,故稱。但是,可用某些藥物解毒,使酶恢復(fù)活性如:農(nóng)藥敵百蟲、敵敵畏、1059等有機(jī)磷化合物能特異地與膽堿酯酶活性中心的絲氨酸羥基結(jié)合,使酶失活,導(dǎo)致乙酰膽堿不能水解而積蓄,從而出現(xiàn)迷走神經(jīng)興奮的中毒狀態(tài) 解磷定(PAM)可解除有機(jī)磷化合物對羥基酶的抑制作用,顯然這類解毒藥物與有機(jī)磷農(nóng)藥結(jié)合的強(qiáng)度大于與酶

39、結(jié)合再如:重金屬鹽引起的巰基酶中毒,可用絡(luò)合劑或加入其他過量的巰基化合物,如二巰基丙醇(BAL)來解毒(2)可逆抑制作用(reversible inhibition) 定義:抑制劑與酶和/或ES以非共價(jià)鍵方式可逆結(jié)合而引起酶活力的降低或喪失,能夠用物理的方法除去抑制劑而使酶復(fù)活 分類:競爭性抑制;非競爭性抑制;反競爭性抑制競爭性抑制作用(competitive inhibition) 定義:抑制劑與酶的底物結(jié)構(gòu)相似,可與底物競爭酶的活性中心,從而阻礙酶與底物結(jié)合形成中間產(chǎn)物或者降低酶和底物的親和力,而抑制酶的活性和酶促反應(yīng)速度;但是,隨底物濃度的增加,抑制劑與酶結(jié)合的幾率(j l)就降低甚至消

40、除。因此,其Vmax不變,但是Km增大 Vmax:是酶完全被底物飽和時的反應(yīng)速度(fn yng s d),與酶濃度成正比 Km:是Vmax/2時的底物濃度(nngd); 與酶濃度無關(guān)競爭性抑制特點(diǎn):1.抑制劑與底物分子結(jié)構(gòu)相似(往往是底物類似物或反應(yīng)產(chǎn)物),并且與酶的結(jié)合部位相同。因此,抑制劑與底物之間有競爭關(guān)系2.I越大,則抑制作用越大;抑制程度與I成正比,與S成反比;增大S可減輕或消除抑制作用3.動力學(xué)參數(shù):Km值增大,Vmax值不變利用競爭性抑制是藥物設(shè)計(jì)的主要思路 例如: 磺胺類藥的抗菌機(jī)理1)其與對氨基苯甲酸的結(jié)構(gòu)類似2)其與對氨基苯甲酸競爭二氫葉酸合成酶,從而競爭性抑制細(xì)菌葉酸形成

41、,抑制細(xì)菌繁殖3)人可以通過食物直接補(bǔ)充葉酸,所以,其對人無害 競爭性抑制作用舉例非競爭抑制作用(noncompetitive inhibition)概念:抑制劑與酶活性中心外的必需基團(tuán)結(jié)合,底物與抑制劑之間無競爭關(guān)系抑制劑既與E結(jié)合,也與ES結(jié)合,后者生成的三元復(fù)合物(ESI)不能進(jìn)一步分解為產(chǎn)物(死端復(fù)合物),從而抑制酶活性反競爭性抑制(uncompetitive inhibition) 定義:抑制劑只與ES結(jié)合,使ES的量下降和形成非活性形式ESI,從而使酶失去活性反競爭抑制作用特點(diǎn): 1.抑制劑與底物分子結(jié)構(gòu)不同,可同時與酶的不同部位結(jié)合 2.抑制劑只與ES結(jié)合,因此底物的存在是抑制劑

42、與酶結(jié)合的先決條件 3.抑制程度取決于I和ES 4. Vmax和Km都變小,并且Vmax和Km隨I的增加而減小,但Vmax/Km比值不變其它可逆抑制 產(chǎn)物抑制:產(chǎn)物對酶反應(yīng)的抑制作用在生物體中較為常見在細(xì)胞內(nèi),酶反應(yīng)的產(chǎn)物雖然不斷被另外的酶作用,但S和P總是同時存在的酶工程之酶的分離純化一、概述1-1 酶提取與分離純化的定義 將酶從細(xì)胞或其它含酶原料中提取出來,再與其它物質(zhì)分開,從而獲得所需酶的技術(shù)過程 1)酶的純化程度根據(jù)需要而定 2)純化方法多種多樣,為獲得較好的效果往往是2種或2種以上聯(lián)合應(yīng)用提取 分離 純化1-2 提取純化之目的 1)酶催化功能的應(yīng)用 2)酶學(xué)研究 酶的結(jié)構(gòu)、功能、催化

43、機(jī)制、催化動力學(xué) 酶的生物合成及其調(diào)控規(guī)律等 1-3 純化的必要性1)生物細(xì)胞中同時(tngsh)存在多種多樣的酶2)多酶可能(knng)作用于同一個底物3)酶在生物細(xì)胞中的分布(fnb)并不是均一的1-4 酶分離純化的主要步驟 抽提、分離純化、結(jié)晶1)提?。簩⒚笍暮冈现刑崛〕鰜恚?xì)胞破碎、提取和濃縮破碎細(xì)胞:獲取胞內(nèi)酶的第一步就是破壞細(xì)胞的外層結(jié)構(gòu)提取(抽提):一般用緩沖液進(jìn)行抽提。緩沖液的類型由酶的種類和理化特性決定濃縮:提取液或發(fā)酵液中酶濃度很低,必須濃縮富集2)分離純化:就是去除雜質(zhì)的過程 目的是:提高酶純度 與此同時酶的總量也將不可避免的損失3)結(jié)晶:溶質(zhì)以晶體形式從溶液中析

44、出的過程,也是酶分離純化的一種手段 濃縮液經(jīng)過各種方法去除雜質(zhì)后,再通過結(jié)晶析出靶酶,可得到較純的結(jié)晶形式的酶產(chǎn)品二、酶的提取2-1 了解所分離酶在細(xì)胞中的分布 1)細(xì)胞外酶:由細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生后分泌到胞外發(fā)揮作用的酶;大多屬于水解酶,通常含量高,容易得到2)細(xì)胞內(nèi)酶:在細(xì)胞內(nèi)合成后并不分泌到細(xì)胞外,而在細(xì)胞內(nèi)起催化作用。該類酶在細(xì)胞內(nèi)往往與細(xì)胞器結(jié)合,不僅有一定的區(qū)域性,而且催化的反應(yīng)具有一定順序性補(bǔ)充:酶在細(xì)胞內(nèi)的集中存在和隔離分布對代謝的調(diào)節(jié):(1).真核細(xì)胞的胞核、線粒體、高爾基體以及細(xì)胞質(zhì)等均呈分室狀態(tài)(2).分室的膜調(diào)節(jié)著各種物質(zhì)的出入,因此: *各分室間的PO2、PCO2、ATP/AD

45、P的比例等保持一定差異 *代謝受所在分室代謝物、酶及其它因素的調(diào)節(jié) *各分室有不同功能,以實(shí)現(xiàn)對代謝的精細(xì)調(diào)節(jié) *分室間隔的破壞會引起代謝的紊亂(3)另外,各室中的酶系分布也有部位效應(yīng),從而對代謝進(jìn)行有序調(diào)節(jié) 如:同是線粒體 外膜-與電子轉(zhuǎn)移及氧化磷酸化有關(guān)的酶系 內(nèi)膜-含有脂肪酸氧化等的酶系真核細(xì)胞內(nèi)酶的分布:細(xì)胞膜:ATP酶、腺苷酸環(huán)化酶等細(xì)胞核:DNA聚合酶、連接酶和RNA聚合酶等線粒體:三羧酸循環(huán)、電子傳遞、氧化磷酸化、尿素循環(huán)、脂肪酸氧化、脂肪酸合成酶以及蛋白質(zhì)合成、DNA聚合酶、RNA聚合酶等高爾基體:多糖、核蛋白粘液生成酶溶酶體:各種水解酶等葉綠體:參與光合作用形成ATP、NAD

46、PH有關(guān)的酶類、與暗反應(yīng)有關(guān)的酶系線粒體主要酶的分布(約有120種酶)部 位酶 的 名 稱外 膜單胺氧化酶、犬尿氨酸羥化酶、NADH-細(xì)胞色素C還原酶、脂類代謝有關(guān)的酶(?;o酶A合成酶、脂肪酸激酶等)特征酶:單胺氧化酶膜 間 隙腺苷酸激酶、核苷酸激酶、二磷酸激酶、亞硫酸氧化酶特征酶:腺苷酸激酶內(nèi) 膜細(xì)胞色素氧化酶、琥珀酸脫氫酶、NADH脫氫酶、肉堿?;D(zhuǎn)移酶、-羥丁酸和 -羥丙酸脫氫酶、丙酮酸氧化酶、ATP合成酶系、腺嘌呤核苷酸載體特征酶:細(xì)胞色素(c)氧化酶基 質(zhì)檸檬酸合成酶、烏頭酸酶、蘋果酸脫氫酶、異檸檬酸脫氫酶、延胡索酸酶、谷氨酸脫氫酶、丙酮酸脫氫酶復(fù)合體、天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、蛋白質(zhì)和

47、核酸合成酶系、脂肪酸氧化酶系特征酶:蘋果酸脫氫酶2-2 起始材料(cilio)的選擇原則:1)選取(xunq)酶含量高的材料 2)可以(ky)是天然的動植物 3)或人工培養(yǎng)的微生物、動植物細(xì)胞等注意事項(xiàng):注意材料的年齡 注意酶在生物體內(nèi)的富集區(qū)域由于從動物內(nèi)臟或植物果實(shí)中提取酶制劑受到原料和成本的限制,因此,目前工業(yè)上大多采用培養(yǎng)微生物的方法來獲得大量的酶制劑2-3 細(xì)胞膜和細(xì)胞壁的破碎1)主要方法:2)選擇原則: 1)不影響或最小影響酶活性的前提下 2)到較好的破碎效果 不同的生物體或同一生物體的不同組織細(xì)胞,其細(xì)胞外層結(jié)構(gòu)(jigu)(細(xì)胞壁和細(xì)胞膜)也可能不同,應(yīng)根據(jù)具體情況選用適宜的方

48、法;必要時2種或2種以上的方法聯(lián)合應(yīng)用例如(lr):大的組織塊需先搗碎或研磨,再勻漿3)常用(chn yn)方法 動植物組織:凍融 組織搗碎器研磨 加石英砂等(助磨劑)研磨 細(xì)菌:加砂或氧化鋁研磨或超聲波振蕩2-4 酶的提取或抽提1)酶的抽提之定義:在適當(dāng)條件下,用適當(dāng)?shù)奶崛∫禾幚砗冈希姑赋浞秩苡谄渲械倪^程影響酶提取的主要因素:酶在溶劑中的溶解度 酶向溶劑相中的擴(kuò)散速度2)提取液的選擇根據(jù)酶的結(jié)構(gòu)和溶解特性來選擇適當(dāng)?shù)奶崛∫簶O性物質(zhì)易溶解于極性溶劑,反之。即相似相溶 酸性物質(zhì)易溶解于堿性溶液,反之3)常用的提取液:酶通常都溶于水,因此通常用水作為溶劑,配制成一定濃度的稀酸、稀堿、稀鹽溶液

49、進(jìn)行抽提4)有些酶與脂質(zhì)結(jié)合或含有較多的非極性基團(tuán),則可用有機(jī)溶劑抽提,如: 丙酮粉:有助于酶與脂肪或磷脂膜分離 高離子強(qiáng)度:有助于酶從結(jié)合的膜上解析下來5)主要的提取方法(1)鹽溶液提取 該法用于在低濃度鹽溶液中溶解度大的酶的提取 常用的鹽濃度:0.02-0.05mol/L, 較多的P酶用該法提取 ,R酶常用0.14mol/L的NaCl溶液提取鹽溶現(xiàn)象:低鹽條件下,酶在水中的溶解度隨鹽濃度升高而增加的現(xiàn)象 鹽析現(xiàn)象:當(dāng)鹽濃度達(dá)到一定界限后,酶的溶解度則隨鹽濃度升高而降低的現(xiàn)象(2)酸溶液提取 在酸性條件下溶解度大并穩(wěn)定的酶可用此法。如:胰蛋白酶可用0.12mol/L的硫酸溶液(3)堿溶液提取

50、 在堿性條件下溶解度大并穩(wěn)定的酶該法適用。如:細(xì)菌L-天冬酰胺酶可用pH11-12.5的溶液(4)有機(jī)溶劑提?。喝缑概c脂質(zhì)結(jié)合牢固,或含有較多非極性基團(tuán)的酶,可用與水混溶的有機(jī)溶劑(乙醇、丙酮、丁醇等),如:P酶:膽堿酯酶、細(xì)胞色素氧化酶、琥珀酸脫氫酶等用丁醇萃取,有較好效果 R酶:可用苯酚水溶液提取主要的提取方法小結(jié)6)影響酶提取的其它(qt)重要因素 (1)溫度:適當(dāng)(shdng)提高,可以提高酶的溶解度和酶分子的擴(kuò)散速度;過高則引起酶失活 (2)pH: 在等電點(diǎn)條件下,酶的溶解度最??;為提高溶解度,要避開酶的等電點(diǎn);但是,也不宜偏離pI太遠(yuǎn)(過高或過低),以免引起(ynq)酶變性失活(3

51、)提取液體積 *適當(dāng)增加其體積,可以提高酶的產(chǎn)率 *過量,則降低酶,增加后續(xù)分離純化的難度 一般為原始材料的3-5倍,且分3次使用 (4)加入保護(hù)劑,以提高酶的穩(wěn)定性。如酶的底物、輔酶和某些抗氧化劑3-1 分離純化方法分類1)基于分子大小或質(zhì)量:(1)離心 (2)透析 (3)凝膠過濾 (4)超過濾2)基于電荷:(1) 離子交換色譜 (2) 電泳 (3) 等電聚焦3)基于溶解度:改變pH、離子強(qiáng)度、介電常數(shù)等實(shí)現(xiàn)的沉淀分離(1) 鹽析法(2) 復(fù)合沉淀法 (3) 有機(jī)溶劑沉淀法(4) 等電點(diǎn)沉淀法 (5) 選擇性變性沉淀法蛋白質(zhì)變性、沉淀和凝固之間的關(guān)系蛋白質(zhì)分子相互聚集而從溶液中析出即沉淀 蛋

52、白質(zhì)變性并凝聚成塊狀稱為凝固補(bǔ)充:變性后的蛋白質(zhì)由于疏水基團(tuán)的暴露而易于沉淀但沉淀的蛋白質(zhì)不一定都是變性的 凡凝固的蛋白質(zhì)一定發(fā)生了變性 4)基于特異性結(jié)合位置/親和力的差異:親和色譜5)其它方法(略):(1)基于分配系數(shù)的差異:雙水相系統(tǒng)萃取法(2)基于疏水作用的差異:疏水層析(3)在磷酸鈣凝膠柱上分級吸附(4)羥基磷灰石色譜(5)冷凍干燥(濃縮)3-2 常用的分離純化方法1)離心2)凝膠過濾3)透析4)超濾5)離子交換層析6)電泳7)層析聚焦8)沉淀分離9)親和層析10)吸附層析11)濃縮和干燥1)離心(centrifugation)(1)定義:利用離心機(jī)旋轉(zhuǎn)產(chǎn)生的離心力,使不同(b tn

53、)大小、不同密度的顆粒分離的技術(shù)過程 *優(yōu)點(diǎn)(yudin):處理量大,可達(dá)幾升 *離心條件(tiojin)的選擇:以靶酶與雜質(zhì)的顆粒大小、密度和特性的差異為依據(jù),選擇適當(dāng)?shù)碾x心機(jī)、離心方法和離心條件 (2)離心機(jī)(centrifuge)分類按分離形式不同:分為沉降式和過濾式按離心操作形式:分為間歇式、連續(xù)式和半連續(xù)式按使用目的:分為分析用、制備用和分析-制備用按離心機(jī)結(jié)構(gòu)特點(diǎn):吊籃式、轉(zhuǎn)鼓式、管式和蝶式等按其最大轉(zhuǎn)速,分為:常速、高速和超速(3)離心機(jī)的常用分類常速/低速離心機(jī):主要用于細(xì)胞、細(xì)胞碎片和培養(yǎng)基殘?jiān)扔行挝镔|(zhì)分離,也可分離較大顆粒的酶結(jié)晶分離高速離心機(jī):最大轉(zhuǎn)速2.5萬。在酶的分

54、離中,主要用于沉淀及細(xì)胞碎片和細(xì)胞器的分離為防止離心過程中溫度升高而致酶失活,最好用高速冷凍離心機(jī)超速離心機(jī):最大轉(zhuǎn)速達(dá)2.5-12x104rpm。主要用于DNA、RNA(酶)、蛋白質(zhì)(酶)等生物大分子以及細(xì)胞器、病毒等的分離純化等(4)離心方法的選擇 對于常速和高速離心機(jī),由于分離的顆粒大小和密度差異較大,所以只需要選擇離心速度和時間就能夠達(dá)到分離效果 如果需要從中分離出2種以上不同的顆粒,則需要采用差速離心 對于超速離心,則可根據(jù)需要而采用差速離心、密度梯度離心(速率-區(qū)帶)或平衡密度梯度離心等差速離心(differential centrifugation):即采用不同的離心速度和離心時

55、間,使不同沉降速度的顆粒分批分離。主要用于分離那些差異大的顆粒;操作簡單、方便,但是分離效果差 密度梯度離心:用一定的介質(zhì)在離心管內(nèi)形成 連續(xù)或不連續(xù)的密度梯度,通過重力或離心力場的作用,使樣品中的組份依據(jù)其沉降速率和密度的不同而分層、分離這類分離又分為: 速率-區(qū)帶(RateZonal,R-Z) 等密度(Isopycnic)/平衡密度梯度離心補(bǔ)充:對產(chǎn)生梯度的介質(zhì)(jizh)的要求*能產(chǎn)生(chnshng)密度梯度,且密度高而粘度卻不高*pH中性(zhngxng)或易調(diào)為中性*濃度大時,滲透壓不大*不與樣品中的組份發(fā)生反應(yīng),也不引起樣品中組份的凝集、變形或失活*常用的介質(zhì):氯化銫,蔗糖和多聚

56、蔗糖A.速率-區(qū)帶(R-Z):是根據(jù)分離的顆粒在梯度液中沉降速度的不同,并使之處于不同的密度梯度層內(nèi),從而形成一系列區(qū)帶,達(dá)到彼此分離的目的 方法:是在離心前于離心管內(nèi)先裝入密度梯度介質(zhì)(如蔗糖、甘油、CsCl等),待分離的樣品以很薄的一層鋪在梯度液的上部,在離心過程中由于不同組份在梯度液中沉降速率的差別,而在離心的某一時刻形成了數(shù)個分別含不同組份顆粒的區(qū)帶各自歸位 注意事項(xiàng):1)離心過程在沉降得最快的組份形成沉淀前就停止。即樣品是在沉降過程中被收集的,而不是到其形成沉淀時,因此對其離心時間要嚴(yán)格控制,既有足夠的時間使各種顆粒在介質(zhì)梯度中形成區(qū)帶,又要控制在任一粒子達(dá)到沉淀前2)如果離心時間過

57、長,所有的樣品可全部到達(dá)離心管底部,“前功盡棄”3)離心時間不足,各區(qū)帶沒有形成,也無法分離4)梯度液的最大密度 樣品中各組分的密度它是依賴樣品顆粒的不同密度實(shí)現(xiàn)分離的;一旦各自分開后,即使增加離心時間,也不會改變其成帶的位置(一定是在各自的等密度點(diǎn))混合樣品可以鋪在梯度液之上,也可以置于梯度液之下,甚至和梯度液混在一,然后在選定的離心力作用下,經(jīng)過足夠時間的離心分離因此,(1)等密度梯度離心的時間是指顆粒完全達(dá)到等密度點(diǎn)的時間(稱平衡時間);而(2)速率-區(qū)帶離心時,是指形成界限分明的區(qū)帶的時間(區(qū)帶形成時間)(5)注意離心溫度和介質(zhì)pH的影響,以免目的酶凝集、變性和失活,甚至引起轉(zhuǎn)子和離心

58、機(jī)其它部件的腐蝕*一般4左右,耐熱酶除外 *必須是酶穩(wěn)定的范圍內(nèi),必要時采用緩沖液2)凝膠過濾(1)過濾(filtration):借助于各種濾過介質(zhì)將不同大小、形狀的組份分離的技術(shù)過程(2)凝膠過濾(gel filtration):是指以各種多孔凝膠為固定相,利用流動相中所含有各種組份的相對分子量不同而達(dá)到分離的一種層析技術(shù)(5)相對分子量不是唯一的分離依據(jù); 對于分子量相同的分子,也可依據(jù)其分子形狀的不同,再加上各種( zhn)物質(zhì)與凝膠之間的非特異性吸附作用的差異,也可以分離(6)其它名稱:凝膠層析(cn x)(gel chromatography) 分子排阻層析 分子篩層析(3)凝膠過濾

59、的原理:不同大小的分子進(jìn)入顆粒狀凝膠內(nèi)微孔的能力不同,能進(jìn)入微孔的小分子不斷地進(jìn)出于一個個凝膠顆粒的微孔,做無定向的分子擴(kuò)散運(yùn)動(布朗運(yùn)動(b ln yn dn)),因而其向下移動的速度就很慢;不能進(jìn)入微孔的大分子則只能分布于凝膠顆粒的間隙,隨溶液流動而進(jìn)行垂直向下的移動,以較快的速度通過凝膠柱換言之,其分離是因?yàn)椴煌笮〉姆肿踊蜻M(jìn)入或不進(jìn)入凝膠微孔,因而所經(jīng)過的路程不同、走過柱全長所需的時間各異,實(shí)現(xiàn)彼此分離的目的(4)凝膠材料種類 層析用的微孔凝膠是凝膠材料與交聯(lián)劑交聯(lián)聚合而成的;交聯(lián)劑越多,載體顆粒的孔徑越小 *常用的交聯(lián)劑是環(huán)氧氯丙烷 *常用的凝膠材料:葡聚糖凝膠(Sephadex)

60、瓊脂糖凝膠(Sepharose) 聚丙烯酰胺凝膠(PAGE) 共同點(diǎn):凝膠內(nèi)部具有微細(xì)的、多孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),其孔徑大小決定其能夠分離的顆粒的大小3)透析透析(dialysis):是利用小分子物質(zhì)的擴(kuò)散作用,使小分子不斷透過半透膜而擴(kuò)散到膜外,而大分子則被截留于膜內(nèi),從而實(shí)現(xiàn)分離 用途:用于去除酶液中無機(jī)鹽、有機(jī)溶劑或低分子量的抑制劑 缺點(diǎn):耗時;透析結(jié)束后,樣品體積大,濃度低,難于工業(yè)化生產(chǎn)透析膜是帶有微孔的篩子,其孔徑在一定范圍內(nèi)是可選的;可用動物膜、羊皮紙、火棉膠等制成4)超(過)濾(ultrafiltration)定義:以膜兩邊的流體靜壓差為推動力的膜分離技術(shù)。在靜壓差作用下,小于孔徑的顆粒

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