中國藥科大學(xué)計算機輔助藥物設(shè)計實驗報告(共12頁)

1、對乙酰氨基酚的結(jié)構(gòu)(jigu)計算對乙酰氨基酚的研究(ynji)背景對乙酰氨基酚（撲熱息痛）為一種(y zhn)非甾體抗炎藥，主治感冒發(fā)熱。圖 對乙酰氨基酚紅外光譜圖該品是非那西丁在體內(nèi)的代謝產(chǎn)生，其抑制中樞神經(jīng)系統(tǒng)前列腺素合成的作用與阿司匹林相似，但抑制外周前列腺素合成作用弱，故解熱鎮(zhèn)痛作用強，抗風(fēng)濕作用弱，對血小板凝血機制無影響。 口服吸收迅速，完全，在體液內(nèi)分布均勻，大部分在肝臟代謝，中間代謝產(chǎn)物對肝臟有毒，以葡萄糖醛酸結(jié)合物形式或從腎臟排泄，半衰期一般為1-4小時。計算方法1、用Hyperchem畫出分子結(jié)構(gòu)2、build-add H and model build3、comput-幾

2、何優(yōu)化3、保存為.mol文件？.ml2?4、gaussView 打開，轉(zhuǎn)換為gjf格式5、文檔編輯器打開，修改開頭部分6、gauss打開，計算7、打開Editplus、gaussView、hpyerChem觀看結(jié)果：鍵角、鍵長、紅外光譜、震動、電荷（用gausesview打開1.out，保存為2.mol，再用hyper打開）對乙酰氨基酚的計算結(jié)果優(yōu)化獲得(hud)的分子幾何結(jié)構(gòu)原子(yunz)編號：分子(fnz)基本參數(shù)：Optimized Parameters ! ! (Angstroms and Degrees) ! - - ! Name Definition Value Derivati

3、ve Info. ! - ! R1 R(1,2) 1.3695 -DE/DX = 0.0001 ! ! R2 R(1,12) 0.9696 -DE/DX = 0. ! ! R3 R(2,3) 1.3955 -DE/DX = 0.0001 ! ! R4 R(2,7) 1.3977 -DE/DX = -0.0001 ! ! R5 R(3,4) 1.3934 -DE/DX = -0.0001 ! ! R6 R(3,13) 1.0854 -DE/DX = 0. ! ! R7 R(4,5) 1.4045 -DE/DX = 0.0001 ! ! R8 R(4,14) 1.0801 -DE/DX = 0.

4、! ! R9 R(5,6) 1.4055 -DE/DX = -0.0002 ! ! R10 R(5,8) 1.412 -DE/DX = 0. ! ! R11 R(6,7) 1.3908 -DE/DX = 0.0001 ! ! R12 R(6,15) 1.0877 -DE/DX = 0. ! ! R13 R(7,16) 1.0884 -DE/DX = 0. ! ! R14 R(8,9) 1.3854 -DE/DX = 0. ! ! R15 R(8,17) 1.0142 -DE/DX = 0. ! ! R16 R(9,10) 1.2245 -DE/DX = -0.0001 ! ! R17 R(9,

5、11) 1.5147 -DE/DX = 0. ! ! R18 R(11,18) 1.0905 -DE/DX = 0. ! ! R19 R(11,19) 1.0955 -DE/DX = 0. ! ! R20 R(11,20) 1.0955 -DE/DX = 0. ! ! A1 A(2,1,12) 108.9854 -DE/DX = 0. ! ! A2 A(1,2,3) 117.831 -DE/DX = 0. ! ! A3 A(1,2,7) 123.2081 -DE/DX = 0. ! ! A4 A(3,2,7) 118.9609 -DE/DX = 0. ! ! A5 A(2,3,4) 120.8

6、767 -DE/DX = 0. ! ! A6 A(2,3,13) 118.9223 -DE/DX = 0. ! ! A7 A(4,3,13) 120.201 -DE/DX = 0. ! ! A8 A(3,4,5) 120.7526 -DE/DX = 0. ! ! A9 A(3,4,14) 117.9868 -DE/DX = 0. ! ! A10 A(5,4,14) 121.2606 -DE/DX = 0. ! ! A11 A(4,5,6) 117.7346 -DE/DX = 0. ! ! A12 A(4,5,8) 125.8829 -DE/DX = 0. ! ! A13 A(6,5,8) 11

7、6.3825 -DE/DX = 0. ! ! A14 A(5,6,7) 121.5548 -DE/DX = 0. ! ! A15 A(5,6,15) 119.3951 -DE/DX = 0. ! ! A16 A(7,6,15) 119.0501 -DE/DX = 0. ! ! A17 A(2,7,6) 120.1205 -DE/DX = 0. ! ! A18 A(2,7,16) 120.3027 -DE/DX = 0. ! ! A19 A(6,7,16) 119.5768 -DE/DX = 0. ! ! A20 A(5,8,9) 136.3572 -DE/DX = 0. ! ! A21 A(5

8、,8,17) 114.3473 -DE/DX = 0. ! ! A22 A(9,8,17) 109.2955 -DE/DX = 0. ! ! A23 A(8,9,10) 118.4412 -DE/DX = 0. ! ! A24 A(8,9,11) 119.9986 -DE/DX = 0. ! ! A25 A(10,9,11) 121.5602 -DE/DX = 0. ! ! A26 A(9,11,18) 107.2838 -DE/DX = 0. ! ! A27 A(9,11,19) 111.5559 -DE/DX = 0. ! ! A28 A(9,11,20) 111.5559 -DE/DX

9、= 0. ! ! A29 A(18,11,19) 109.1143 -DE/DX = 0. ! ! A30 A(18,11,20) 109.1143 -DE/DX = 0. ! ! A31 A(19,11,20) 108.1707 -DE/DX = 0. ! ! D1 D(12,1,2,3) 180. -DE/DX = 0. ! ! D2 D(12,1,2,7) 0. -DE/DX = 0. ! ! D3 D(1,2,3,4) 180. -DE/DX = 0. ! ! D4 D(1,2,3,13) 0. -DE/DX = 0. ! ! D5 D(7,2,3,4) 0. -DE/DX = 0.

10、! ! D6 D(7,2,3,13) -180. -DE/DX = 0. ! ! D7 D(1,2,7,6) 180. -DE/DX = 0. ! ! D8 D(1,2,7,16) 0. -DE/DX = 0. ! ! D9 D(3,2,7,6) 0. -DE/DX = 0. ! ! D10 D(3,2,7,16) 180. -DE/DX = 0. ! ! D11 D(2,3,4,5) 0. -DE/DX = 0. ! ! D12 D(2,3,4,14) 180. -DE/DX = 0. ! ! D13 D(13,3,4,5) 180. -DE/DX = 0. ! ! D14 D(13,3,4

11、,14) 0. -DE/DX = 0. ! ! D15 D(3,4,5,6) 0. -DE/DX = 0. ! ! D16 D(3,4,5,8) 180. -DE/DX = 0. ! ! D17 D(14,4,5,6) 180. -DE/DX = 0. ! ! D18 D(14,4,5,8) 0. -DE/DX = 0. ! ! D19 D(4,5,6,7) 0. -DE/DX = 0. ! ! D20 D(4,5,6,15) 180. -DE/DX = 0. ! ! D21 D(8,5,6,7) 180. -DE/DX = 0. ! ! D22 D(8,5,6,15) 0. -DE/DX =

12、 0. ! ! D23 D(4,5,8,9) 0. -DE/DX = 0. ! ! D24 D(4,5,8,17) 180. -DE/DX = 0. ! ! D25 D(6,5,8,9) 180. -DE/DX = 0. ! ! D26 D(6,5,8,17) 0. -DE/DX = 0. ! ! D27 D(5,6,7,2) 0. -DE/DX = 0. ! ! D28 D(5,6,7,16) 180. -DE/DX = 0. ! ! D29 D(15,6,7,2) 180. -DE/DX = 0. ! ! D30 D(15,6,7,16) 0. -DE/DX = 0. ! ! D31 D(

13、5,8,9,10) 180. -DE/DX = 0. ! ! D32 D(5,8,9,11) 0. -DE/DX = 0. ! ! D33 D(17,8,9,10) 0. -DE/DX = 0. ! ! D34 D(17,8,9,11) 180. -DE/DX = 0. ! ! D35 D(8,9,11,18) 180. -DE/DX = 0. ! ! D36 D(8,9,11,19) -60.5512 -DE/DX = 0. ! ! D37 D(8,9,11,20) 60.5512 -DE/DX = 0. ! ! D38 D(10,9,11,18) 0. -DE/DX = 0. ! ! D3

14、9 D(10,9,11,19) 119.4488 -DE/DX = 0. ! ! D40 D(10,9,11,20) -119.4488 -DE/DX = 0. !原子(yunz)電荷分布情況模擬紅外振動(zhndng)光譜實驗(shyn)討論與感想本次實驗極大激發(fā)了我對使用計算機研究物質(zhì)分子結(jié)構(gòu)的興趣，讓我感到計算機之神奇的同時更加讓我感到蘊藏(yncng)在背后的量子化學(xué)的神奇。曾有人在21世紀初推測2010年約60%的化學(xué)研究者進行量子化學(xué)計算?，F(xiàn)在雖然不懂它的原理，但是它實用又富有美感的模型及參數(shù)計算促使我們將計算機輔助計算推廣到更多領(lǐng)域。附件(fjin)：對乙酰氨基酚鑒別、檢查、結(jié)構(gòu)

15、確證及含量測定學(xué)號：1342905 姓名：徐俊超1.實驗?zāi)康?.1.了解對乙酰氨基酚化學(xué)結(jié)構(gòu)，并對該原料藥進行官能團鑒別與結(jié)構(gòu)確證；1.2.對該原料藥的雜質(zhì)（一般/有關(guān)）含量限度檢查；并求出其中純品含量。實驗原理與步驟對乙酰氨基酚（撲熱息痛）為一種非甾體抗炎藥，主治感冒發(fā)熱。2.1.官能團鑒別（一般鑒別）2.1.1化學(xué)法：法1：原理：+6 +(紫色絡(luò)合物證明酚羥基存在)。步驟：取本品水溶液加三氯化鐵試液顯藍紫色。法2：原理：水解后與NaNO2反應(yīng)生成紅色重氮鹽（鑒別芳伯胺）。取本品約0.1g，加稀鹽酸5ml，置水浴中加熱40分鐘，放冷；取0.5ml，滴加亞硝酸鈉試液5滴，搖勻，用水3ml稀釋后

16、，加堿性-萘酚試液2ml，振搖，即顯紅色。2.2結(jié)構(gòu)確證（專屬鑒別）2.2.1.IR法：IR法具有高度專屬特異性，適宜確證。基團的振動頻率和吸收強度與組成基團的相對原子質(zhì)量、化學(xué)鍵類型及分子幾何構(gòu)型有關(guān)。根據(jù)樣品光譜與光譜集（或?qū)φ掌饭庾V）比對峰位、峰強、峰形及峰數(shù)推斷結(jié)構(gòu)是否吻合。圖 對乙酰氨基酚紅外光譜圖步驟(bzhu)：1：波數(shù)檢驗：PS膜置于IR儀的試樣安放處，在4000600范圍掃描得吸收光譜；2：制備KBr壓片：應(yīng)取約2mg樣品研磨，然后與100200mg干燥KBr粉末充分混合，并再次用球磨機研磨12min，研磨時間將對最終的光譜外觀有顯著影響。再轉(zhuǎn)入合適的模具中，使之分布均勻，抽

17、空下壓成透明薄片(bo pin)。裝入壓片夾以KBr空白壓片作參比掃描紅外光譜。查譜線索引找出標準譜圖對照譜峰位置、形狀和相對強度進行鑒定（參比為空氣）。Table. Assignment of the theoretical vibration of APAP and experimental IRS2.3雜質(zhì)(zzh)限量檢查2.3.1一般雜質(zhì)：（1）重金屬：一定條件下，重金屬與或作用顯色。中國藥典規(guī)定在弱酸條件下進行，用稀HAc調(diào)節(jié)。實驗證明在pH=3時PbS沉淀最完全，反應(yīng)式為：重金屬的檢查(jinch)是在相同條件下進行比色試驗。步驟：取25ml納氏比色管三支，甲管中加標準鉛溶液一定

18、量與 HYPERLINK /view/106631.htm t /view/_blank 醋酸(c sun)鹽 HYPERLINK /view/901429.htm t /view/_blank 緩沖液(pH3.5)2ml后，加水稀釋(xsh)成25ml，乙管中加入供 HYPERLINK /view/2404854.htm t /view/_blank 試液25ml，再加與甲管相同量的標準鉛溶液與醋酸鹽緩沖液（pH3.5）2ml后，用溶劑稀釋成25ml，若供試液帶顏色，可在甲管中滴加少量的稀焦糖溶液或其他無干擾的有色溶液,使之與乙管一致；再在甲、乙管中分別加硫代乙酰胺試液各2ml，搖勻，放置2

19、分鐘，同置白紙上，自上向下透視，乙管中顯示的顏色與甲管比較，不得更深。（其中Fe鹽應(yīng)改用KSCN(aq)與其生成血紅色配合物檢驗）（2）酸堿度：步驟：取本品0.50g，加水50ml溶解后，加溴麝香草酚藍指示劑(pH6.07.6，黃色藍色)2滴，如顯黃色，加氫氧化鈉滴定液(0.02mol/L)0.10ml，應(yīng)變?yōu)樗{色；如顯藍色或綠色，加鹽酸滴定液(0.02mol/L)0.20ml，應(yīng)變?yōu)辄S色。2.3.2有關(guān)雜質(zhì)原料藥產(chǎn)生來源：其中有關(guān)物質(zhì)為對乙酰酚，宜用HPLC洗脫法測定該雜質(zhì)含量。（1）色譜條件色譜柱以反向鍵合相色譜柱（250mm4.6mm）和 0.1%H3PO4（A）和5%乙腈(B)的甲醇溶

20、液為流動相進行梯度洗脫，梯度洗脫順序為：1min 90%A，10%B，12min 45%A，55%B，220min 45%A，55%B，檢測波長為272nm，流速1.0（mL/min),柱溫30，進樣量20.儀器與試藥：高效液相色譜儀（美國安捷倫1260）；紫外分光光度計：型號：UV-1700(島津)；對照品對乙酰氨基酚，對氨基酚；對乙酰氨基酚原料藥自制；甲醇，乙腈均為色譜純，水：娃哈哈純凈水。（2）檢測波長的選擇分別精密稱取對照品對乙酰氨基酚!對氨基酚適量，用甲醇溶解并定量稀釋成每1ml 約含 13的對乙酰氨基酚溶液和每1ml約含12的對氨基酚溶液。在 200400nm波長范圍內(nèi)進行紫外掃描

21、，對乙酰氨基酚和對氨基酚的最大吸收波長分別為245nm 和272nm，為提高檢測的靈敏度，故選用對氨基酚的最大吸收波長272nm為檢測波長。（3）系統(tǒng)(xtng)適用性試驗配制(pizh)每1ml 約含50的對乙酰氨基酚20的對氨基酚的對照品混合溶液，按（1）項下色譜條件，記錄色譜圖，理論塔板數(shù)按對乙酰氨基酚峰計算(j sun)；對乙酰氨基酚與對氨基酚的分離度。（4） 有關(guān)物質(zhì)對氨基酚取同一批號的供試品，精密稱定6份，用甲醇溶解并稀釋成 40mg/ml的溶液，作為供試品溶液；另精密稱取對氨基酚對照品適量，用甲醇溶解并制成 2/ml對氨基酚溶液作為對照品溶液。照上述色譜條件試驗，精密量取對照品溶

22、液50注入液相色譜儀，調(diào)節(jié)檢測器靈敏度，使主成分色譜峰的峰高為滿量程的10%；再量取供試品溶液與對照品溶液各50，分別注入液相色譜儀，記錄色譜圖，供試品溶液色譜圖中如顯示對氨基酚峰，按外標法以峰面積計算，平行測定三次，得出對氨基酚平均含量和RSD。2.4純品含量2.4.1.UV法測定：2010年版中國藥典收載的對乙酰氨基酚含量測定采用紫外分光光法。按干燥品計算，其含量應(yīng)為98%102%.試劑：對乙酰氨基酚、0.4%氫氧化鈉溶液、純化水；儀器：洗耳球、移液管5ml、量瓶250ml、量瓶100ml、紫外分光光度計。步驟：取本品40mg，精密稱定，置250ml量瓶中，加0.4%氫氧化鈉溶液50ml溶解后加水置刻度，搖勻，精密量取5ml，置100ml量瓶中，加0.4%氫氧化鈉溶液10ml,加水置刻度，搖勻，照紫外-可見分光光度法，在257nm的波長處測定吸光度，按C6H9NO2的吸收系數(shù)（E）為715計算，即得。(依據(jù)：對乙酰氨基酚在稀堿性溶液中，在257nm波長處有最大吸收，其紫外吸收光譜特征可用于原料及部分制劑的含量測定。)實驗序號對氨基乙酰酚（%）平均值（%）RSD對氨基酚（%）平均值（%）