三維熒光數(shù)據(jù)平行因子分析(PARAFAC)

1、 三維熒光數(shù)據(jù)平行因子分析(PARAFAC)基于Matlab子軟件SOLO簡(jiǎn)介：Aqualog生成的激發(fā)一發(fā)射矩陣得到了充分的校正和處理，可以使用我們合作伙伴Eigenvector,Inc.的Solo軟件包中的多元工具箱進(jìn)行即時(shí)分析。本章解釋與PARAFAC相關(guān)的操作，這些操作用于評(píng)估混合組件的因子和數(shù)量。本文描述PARAFAC工具，從導(dǎo)入文件開始，通過預(yù)處理和編輯數(shù)據(jù)、擬合和評(píng)估模型，以及生成報(bào)告。此外，我們還舉例說明了如何使用分裂半分析驗(yàn)證函數(shù)比較數(shù)據(jù)集的內(nèi)部一致性，以及如何評(píng)估總熒光的無效性來量化應(yīng)用了EEM歸一化的模型的分?jǐn)?shù)。您可以使用Solo軟件包，通過Aqualog軟件的常規(guī)收集和

2、導(dǎo)出方案以及示例隊(duì)列工具來評(píng)估數(shù)據(jù)。有關(guān)Solo軟件包的理論和操作的詳細(xì)說明，請(qǐng)?jiān)L問/software/solo.htm網(wǎng)站。HULI$-1-fulvicacidTryptmph朋帕HUI-l$-3-t1CJnjicecldTyro&lne-liKe睥上的初d輩灑SIMCHO-IK曲5C550KfrMC-MMtK如IMOMK4X彳彈血*5SCExcitationwavelength(nm)VVavelengthi(nm)Fig.7Spectralpropertiesofthe4fluorophoresidentifiedbythtPARAFAC第一部分：使用PARAFAC注意:雖然理論上您可以

3、嘗試使用PARAFAC分解包含許多組件的混合物，但HORIBA建議實(shí)際最多只能分解六個(gè)組件。1啟動(dòng)PARAFAC建模方法1.1在主機(jī)桌面上，雙擊Solo+MIA或Solo圖標(biāo)。軟件可能需要一段時(shí)間來加載。耐心等待，直到Solo+MIA工作區(qū)瀏覽器窗口出現(xiàn):FiledrtViewAnalyze-HelpFigEraserNewJenciDnl醫(yī)罔HCUfTfirilFfrldfifD,Program口1口戸|!112品口rAnrrt詁nr站W(wǎng)CKitSpflWCurre-rrtWorkspaceVariablesUtlKVtluAAnalji?ToshTopics(doubterdkktoope

4、n)白奄FAVORITTESirttingStarted:LDartaSrtEditorkUg-u-PCA-卩ri松亡和川Componefiit詮Ll*TrendToolIt：黛TOOLS団盤DECOMPOSTJON應(yīng)HEGRESS-IDIVJS吊CLUSTERING壓胡dASEiFICATlON由JCESIQWOFEXPERIMENTS辻BATCHANALYSIS宙手TRANSFORJM京BOTHEftg-THELPwHEIGENGUIDEWLIMEVIK05RMadelGachc理Cache:preferGATEVie*(*=NotAveaable)HSCffltliBSettingsan

5、dMir*:NdCachedBataAvailableEi2lDwtoDe/raXTEtGEMVEmORREWEAHUHM師POINTED1.2在分析工具區(qū)域，單擊DECOMPOSITION打開副標(biāo)題雙擊PARAFAC-ParallelFactorAnalysis開始分析StartingANALYSIS窗口暫時(shí)出現(xiàn):然后Analysis-PARAFAC(NoModel窗口出現(xiàn):0UIhamPrepcocessinj1LoadcalibrationdataCalibrateApply/Validate3.ChooseConView:aTat4eNumberCmpanenitBPerctniVnn

6、ancepluredPARaFajCModelF?的？wModslCdnmpareModelscakrMdelRebuildh1MMtdkmodelUs*Mwlel8.LoadTestData叭憫域HelppfnNfffhcrMt4珂44CViWTPy1(4陽04HfiniRBdMorirporlKInWBmodnPaneNiHherMunorarrtHelnDurrrerTltyludiM冏関曲肝ifflotfdQfrniOAKlH耳丹中IMFIcAdraMaCTMTFFileMTF)AITASFHI#(ASFAIF.BKHAJTPiONURA|(PDRAn$lytiiC4lSpedr#lO

7、pvicS.(ASD1IaJico(W#ndV7)EirukerQPUS-FileBrukerXRPDRawFileCRAW)CytoSpwrCYTFile(CYT1ENVIFormal(HDR)GramsThermoGalarbcFite(&PC.DHB)Gu-idedW-aveFileCSCAN.AUTQSCAN!-HrtachiEEMFikL-TXT)HORIBAR*fn*nFil#(LSS.LSM.NGS.NGC.TSf.TVf)MORIBAA-IEEM/Aqu#lQgPDATHORIBAA-IEEM/AqualogAtKorfaancrFiles(A1B5.DAT)JascoEEMI

8、File(CSV)JCAMP(&X.JDX.JCMLJCAMP)netCDFExjmfromMSS-oftwae(CDF)OmracrSPA軒怙(PA)2.2單擊ImportData，子菜單出現(xiàn)。單擊HORIBAAqualogFile(DAT文件類型SelectFiletoOpen窗口出現(xiàn)0707BLANK0718BLANKBLANK-12.4瀏覽并選擇要分析的所有*.dat文件，然后單擊Open按鈕注意:您應(yīng)該使用為示例Q方法輸出文件夾分配的文件夾。注意:如果在這個(gè)文件夾中還Ft舷圉片J音樂宴面Windows(C;)Themes2019/9/411:312019/9/42?:512019/9

9、/422；30201/9/422皿2019/9/421;552010/9/421:432019/9/421r492019/9/421502019/9/421:502019/9/421:512019/9421:521-HORlBAA-TEEM/Aqua1ogt7打幵CQ有其他.dat文件（例如*ABS.dat）,那么單擊右上角的搜索字段并輸入*pam.dat。然后LoadingAqualogFiles窗口出現(xiàn)在LoadingAqualogFiles窗口完成后，EVRITip窗口出現(xiàn)。QEVRITipN,cvershewsgoin.(三三jCertaintypsofpreprocessingare

10、notcompalitilelAiithnwaydataandhavebeenremovedfromtheIbtofpossiblepreprocessingstepsforthecurrenldata昭Thistip網(wǎng)illbeshownonlyoncepersession)2.5點(diǎn)擊OK.此時(shí)淡藍(lán)色的X按鈕變成深藍(lán)色，您將在窗口左下角看到一條消息，數(shù)據(jù)已加載，但不存在模型”。pply/ValidateA葫buildMtodeBlAnalysisPARAFAC-NoModel)-MultipleAqualogFilesIA：甌80爆AnalysisFlowchartDllbr舐2Choose

11、PreprocessingVrewi3Cboos-eComponnlE-4BuMPfretntVthfACtCBpur*dbyPARAFACModalModlCcHnpareModels6ChangeCompownl&ckmod-tlUseModelflLodTes(DataDemoD4ldFrtC%ModtlJFrtt%d利Unique-FitC%X)DfllAhulxni郵*M聞nwdtl罄隔皿5dIhcprcTDCfungondodhcrflplwfliiAmPrei5ioc#s4*聞Tocb曲冋町a(chǎn)Mcap削色4iweeltctasmWwer2nHie5taluspare味血cbjib

12、eviewedardedtedbycbckr*g(mifraTCandM*Yj&pn*茂Ofhpz-毋斗wji+gCacheNaCachedLFil.EditPrpFc*G-Anjly-GicIFL-tfincTgl石HlpFigBrowctr5QT*即cNumberCamponenti:-clcmod雷Iolernod*lC4km&d*lcalcEod.l在模型分析之前有一些操作。第一個(gè)推薦操作是依次單擊Edit、Options、MethodOptions(PARAFAC)此時(shí)，InitializingOptions窗口將立即出現(xiàn)然后是Options/Preferences窗口Options

13、/PreferenceiResetUs#-Level曰Displayblockdltailsstandard曰AlgorithmEiconstraintsconstraints_Modlc-l1x1structconstraints_lModlZ1m1structcontriint1j1KHLructcam說明】FactoryResetOkCancel3.1在激發(fā)一發(fā)射矩陣(EEM)數(shù)據(jù)的并行因子分析中，必須保證三種PARAFAC分析模式都受非負(fù)值的約束。選擇constraints_Model1，它對(duì)應(yīng)于PARAFAC組件的得分。3.2單擊lxlstruct獲取constraints_Mode

14、l1FJOptions./PrelerencesUserLevelUserLevel3.3單擊選項(xiàng)卡,然后InitializingOptions窗口暫時(shí)再次出現(xiàn)，然后Options/Preferences窗口發(fā)生變化,顯示一個(gè)下拉菜單Constraints,type=unrestricted:BOptions/PrefererKesIUiserLevel日CDnstraintstypg|urKCiri&raiirHKjurKCirstrainednannegativityunlnwdalihiyuirftodality_noftohorthogonalftyeo-lumnorthagon曲It

15、ypeunconstrained-dounconstrainedfitofA,nQnniegatrvrty,-Ais創(chuàng)Imonnegative：uFiimodality-AuninrodalcolumnsANDfr&nntgfftivity；-Ais.Orthogond(A曲豐I)-,tolurnrwQrtlhQgrQnal,-Aha?QriJwDgonialt&lunh-l(AA=diagonal);unrrrtodaliiyiwriion1-A.hasunimodalcelumnsonly-nononneatkitykimposedFaeloryOkCancel3.4單擊unrestric

16、ted以顯示其他約束選項(xiàng)的下拉菜單。3.5選擇nonnegativity。3.6單擊Ok。3.7對(duì)constraints_Model2（對(duì)應(yīng)于發(fā)射光譜）和constraints_Model3（對(duì)應(yīng)于激發(fā)光譜）重復(fù)上述步驟3.1-3.5。3.8單擊Ok關(guān)閉Options/Preferences窗口。4.數(shù)據(jù)前處理（RF1/RF2/Normalize）以下算法使用其他拉曼蒙版以及一階和二階瑞利線來編輯蒙版區(qū)域。此方法對(duì)于處理溶劑與折射率不匹配的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)也很有用。點(diǎn)擊Preprocess一X-blockCustomblockLoadPrepwcesuniHumtierCarV-blockClutLc

17、rAna1yiil-PARArACJ4oModel)-MultipleAq呵ogFFiltEditRefineloo-liHdpFig&rov*serCmtaiTL.PlotData石口何込丄陽倉?FepraewlData*Auta&caileZetCurrentAxDefauh1忡口fitMnCenterPreprocessingX-block窗口出現(xiàn)。Q怕pr&acG怦X-HecfeAnAlttbl4riansJirTunohs-AMniiiA也附JLIPiR申:卒CmiwTi-i5nw55iQn山F山呷一B50infrAuloic艸臣引料曲Lsnl別討9皓5”ElMftbntiAiiia

18、mMC丹hak*FttotEEMF蚪護(hù)耐MDifTUhzNiEMSC(mnnlM9C(nwiafi：HSf-UlJAaDlankSutjli日亡Lidr*!.(flO-ftB)仃Half-WidthVFirstOn&rRsyleihF毗即16(nmn)jSgiCndOrderRayfleighFitLr32(nmrRanterFifftgr(1st&2ndCnm)RamanShift.:3332(l/cm：1SiOrderShift)|1JUBIJBUUHBBBHBIIIIII11II|J1RepteceWith-IMiarigValues；LskwZsr4.zoratoub-Rdyleigt

19、iwaoilfl-ngllif：OK匚呂HelpFirstOrderR旳他ghFilter了SecondOrdfRayleighFiller我RanunFilerHaWdthW(nm)20(nm)ioo)dRamssiStirfl:332(1/crft)LovlZemAssignzerolasuti-Rayl&ighwaMdengths/IJz叫Halp選擇激活：FirstOrderRayleighFilter,SecondOrderRayleighFilter首先FirstOrderRayleighFilter設(shè)置為16nm(5nm),這個(gè)值需要等于或超過Aqualog實(shí)驗(yàn)中選擇的瑞利掩蔽值

20、。SecondOrderRayleighFilter設(shè)置為32nm(10nm),這個(gè)值需要是一介瑞利蒙版值的兩倍。對(duì)于“Replacewith”：選擇“MissingValues”?？梢試L試內(nèi)插值替換，以確定哪個(gè)函數(shù)提供最可靠的擬合和驗(yàn)證。對(duì)于“RamanFilter”，請(qǐng)使用默認(rèn)的3382cm-14.4當(dāng)所有需要的過濾器都設(shè)置正確，點(diǎn)擊OK，EEMFilterSettings窗口關(guān)閉。注意:激活這些屏蔽過濾器適用于您選擇的整個(gè)數(shù)據(jù)集，而不僅僅是窗口中可見的圖。4.5在可用方法列表中，雙擊Normalize以顯示NormalizeSettings窗口：4.6點(diǎn)擊OK您已激活的篩選器現(xiàn)在出現(xiàn)在列

21、在PreprocessingX-block窗口右側(cè)的SelectedMethods列表中。單擊OK,運(yùn)行Fliters,PreprocessingX-block窗口關(guān)閉。定要檢查確定按鈕和不關(guān)閉窗口，因?yàn)轭A(yù)處理將不應(yīng)用。5.編輯校準(zhǔn)X-block數(shù)列5.1右擊藍(lán)色鍵CalibrateX-blockM血0；匚-PARAIFAC(NoModuli-MukiplaAqulocjFilrcFileEdtPveproc&5AnalysisRefineToolsHelpFiQBfOfcV&er軀囲魚I曲l匚harXDeliaha;&besnioa-dedbulnomaetlaastaSetttieprtp

22、rDCEismqandalheroptioria(frc-mlneFrepracfi-siEindTc-Dtemsrua)dndlcaltralie-enuhUElickcknnI/nJieriEcnintheSilutmpan).Etoiacurheviewedurdedr-dtrycbckngcneTandktiricf-naLoadDataImportDataNewD-3133PlotD2aLitj*EditlataTransform匚re-ateFromX匚口lumnsVSplrlintoCalibrationALjgnuent諒曲VelidatoflSaw-coke口del-calc

23、model-calcmodel-call：model-calcmodelAnatys-is-IPlawchart1Loadcshbrsliondata2ChcosePreprocessing3ChooseCurnponents4BuildModelRgyiewModel5.FZ的庖卅Campana6-ChangeGamponents7.RetwildModelUseMchAbIBLoadTs-sl:&ApplModel困Cschepb3CacheSetting.工NoCachedE田曰DemoData5.2下拉菜單點(diǎn)擊EditData，會(huì)打開MultipleAqualogFiles-DataS

24、etEditor窗口，顯示Data標(biāo)簽。5.3點(diǎn)擊Mode3Labels5.4在這個(gè)特定的數(shù)據(jù)集中，我們看到在240nm以下的激發(fā)模式下有很高的吸光度值。在這種情況下，我們通過取消選中“包含”中的復(fù)選框來標(biāo)記此數(shù)據(jù)范圍。（右邊的一列柱方框）。5.5右擊左邊編號(hào)列中的深灰色區(qū)域，可以顯示下拉菜單：5.6點(diǎn)擊ExcludeSelected,所選數(shù)據(jù)現(xiàn)在將被排除在分析之外。注意，數(shù)據(jù)仍然保留在數(shù)據(jù)集中。5.7重復(fù)上述步驟5.3-5.6以排除模式2標(biāo)簽中的數(shù)據(jù)（發(fā)射軸）和模式1標(biāo)簽（已加載的數(shù)據(jù)集）分析。5.8點(diǎn)擊File-close或者右上角關(guān)閉，來關(guān)閉MultipleAqualogFiles-Da

25、taSetEditor窗口。6.選擇“組分”數(shù)量6.1我們?cè)诒敬文Ｐ椭羞x擇4個(gè)組分，輸入到NumberComponentsfield中:除了上述兩步(6.2和6.3)之外，還可以雙擊與要建模的組分?jǐn)?shù)量對(duì)應(yīng)的行。耐心等待。iMlir-jXn:;hr”：Mrcs252.U-i=.Z!_i.Dr-ii.IiIjiL-2:iS-Frt-ZIi-I7.rp=.?：ih“IApfl/VaidaftIWnuiRCtlkbaiTi丄uk.ErjandaljiApjlJfr/VJij-daEiaEffllihraf:!:旳RfiMtMiHMUktRflHi戲MmIeI*亡Mo陽8I口JdTHh!口“Aruiii

26、ijEHewLk-tiflrtS沁WFjiJACJ.wn|Cmhr:ftwiIIiNIAlJfrVni*vhHibend*；i#a*E2DemnDrta主hWlipNgdl旳Filb5OkawCoopHitJkLKjiuEiftFt1SDe1VIO8i:epBv-flJbyMHiFiClicce*runfcIlknit4diki,iis4d:ikrnMiiIlkmrfdiakmi*l:ikrnNrliah*e由時(shí)ilkm?4dM4MWEZh、屈十血屯yM歲I：屮Kas險(xiǎn)ijLIS6畔削油“MilMHr3.Lu&SACneMWinff*iE出firproctflfralyuchmJooia|ft

27、pligAiPVM!Youcanviewdetailsbyclickingdie5.ReviewResulltsbultunhorbyulicjkintheViewhlOdelDetailsbutlun6ii)tlietoolbiir.-icwruiiLAaL.-.er-暢|二.*.1BEt5呷記諂trAJQ.Dbi(|MutipliAqualFitaRLkiquc注00?VKRi|,4lUarl*j,i21-9121JWL!JSll.PRtftUuiniJn-i9J3l.曲ITIL8.1可以通過單擊5“査看結(jié)果”(ReviewResults)按鈕查看詳細(xì)信息，或單擊工具欄中的“查看模型詳細(xì)信

28、息”(ViewModelDetails)按鈕。圖1:PARAFAC窗口顯示每個(gè)圖的縮略圖:1.參數(shù)(Parameters)1.1LoadingM1加載ScatterM1散射InfluenceM1影響Variationpercomponent每個(gè)組分的變化2.殘差Residuals2.1ResSumSq.M1ResidualNormalProbability殘差正態(tài)概率2.3Averageresiduals平均殘差Residual殘差3.Data4.輔助Auxiliary4.1CoreConsistency核心一致性可能要查看的最佳參數(shù)集是“參數(shù)”(Parameters)列中的“加載Ml”(Lo

29、adingsM1)。這些分?jǐn)?shù)與每種成分的濃度成正比。在此數(shù)據(jù)集中，這些成分已被識(shí)別為綠色的酪氨酸樣成分，紅色的色氨酸樣成分，藍(lán)色的黃腐酸樣成分以及藍(lán)綠色的腐殖酸樣成分。8.2左鍵單擊左上方“加載Ml”(LoadingsMl)縮略圖中的白色背景，以查看“加載”參數(shù)的連續(xù)縮略圖(M2,然后是M3,然后再次是Ml)。Left-clickonlhewhitebadkgroutidintheLoadingsM1thumbnailintheupperlefltoviewsucccssiviEthumbrKiih(M2.,thenM3hthenM1again.)oftheLoadingsparameter.

30、同樣，左鍵單擊“參數(shù)”(Parameters)列中“散布和影響”(ScatterandInfluence)縮略圖中的白色背景，然后在殘差列(Residuals)單擊Res.SumSq.Ml,將在相應(yīng)的M1，M2和M3縮略圖之間切換。8.3右鍵單擊任何縮略圖中的白色背景，例如“加載M1”(LoadingsMl)，以在單獨(dú)的窗口中查看圖形的放大版本。右鍵單擊時(shí)，將顯示“此圖在單獨(dú)的窗口中”(Thisplotinseparatewindow)消息：Right-clickinthewhitebiickgrucndinanythumbnail,forexampleLoadingstoewanenlarg

31、edversionofthegniphin臥separatewindow.Whenyouright-click,tkeThisplotinseparatewindowmessage8.4單擊該消息以打開可見的圖和隨附的“圖控件”(PlotControls)窗口作為單獨(dú)的窗口：加載M1的放大圖顯示了四個(gè)成分的得分與樣本數(shù)量的關(guān)系。ISV羣丄|L2；I旳8.5在“繪圖控件”(PlotControls)窗口菜單欄上，單擊“View”。8.6單擊“表格”(Table)以顯示繪制數(shù)據(jù)的表格。OntliePlotControlswindowmenubarclickView.ClickTabl-frtosh

32、owa.tableofthe_-plotteddata.-_PkytCorrtrIVpcwPlolfigttnovw*,_TabicXSampINumbEn-LabelsCtrl*TCf-JCtri*LClassesEKdludedDftaCtdl*-ECcirnpraGp5DeclvtterL曲亡IfCtri*ICICui-APlotAiisLinesDiagonal111lineAuto-ScaleCtiri-FAdjuistAwesSubplotuplicntcFigureCtrf*CDockContrals百etting“161.2198412S03EG21.37505329B7E-0

33、Joisisogs-STiE-osm.dL62692553L-039.12S44412924E-031.017745006956E-029.S555129121E9E-039.74B0967O6E2E-C31.4020511165E-021.Q6483517S191E-02l.C9S396?iC5E-021.3712G5L5jE-021.292：436531：-021.255Q652fi71BE-02111S2347479E-O21.355065.3a65E-0ZL.4O2D95557QO41-021.3636e2SS793E-021.391931153B6E-021,36509526270-

34、02l,27il0231112E-02lS31115O7543E-021,47521132893E02i.3609L4339B2E-02=954453.7756271.104267=5.673H-G075.531H20319269259rZ19Q3905,952306311.1959733.079994764.24278687raPlottedUa?aFtltEdit出ewFigBrowExaminetheCoreConsistencythumbnailinliteAuxiliarycolumn.Threecomponentstogethermakeup100%ofdiemixture,wit

35、hnolinexplainedleftovers,soitisagoodfit.Qpm1事弘A1W：違idAquittjifctoaH9ldBiipdivdAuwiiarvP-aranielerwIhitaConrlDnsMencf!5科厲hiRaudMJiivEftIA和郵甘AJ-、”:包2D置信區(qū)間為綠線(95)和紅線(99)：9.3檢查“輔助”(Auxiliary)列中的“核心一致性”(CoreConsistency)縮略圖。三個(gè)成分加在一起構(gòu)成混合物的100，沒有無法解釋的殘留物，因此非常適合。9.4檢查“殘差”(Residuals)列中的“殘差”(Residuals)縮略圖。這些是數(shù)

36、據(jù)減去模F3twn、X,”一-,liudNjffdPiMjWf型的圖，應(yīng)該很好地?cái)M合才能隨機(jī)出現(xiàn)。Res.Sum.Sq.M1縮略圖顯示異常值。9.5通過單擊右上角的=來關(guān)閉圖1：PARAFAC(Figure1:PARAFAC)窗口。9.6要查看樣本中的各個(gè)組件，請(qǐng)?jiān)凇胺治觥?Analysis)窗口中單擊“繪制2D加載曲面”(Plot2DLoadingSurfaces)按鈕Toseeiheindtviduatcompartenuinthesample,intheAndyshwindowdiet血亡Plot2DLoadingbuttonFJAralyjis-PiSAtFiuC4trr-MuhipJ

37、eml旳HJk一凰融Jp細(xì)筐世i-亜IDIutEIjLcjidirigSuLBi&IiVtodeJCalibrate同時(shí)出現(xiàn)兩個(gè)窗口：繪圖控制(PlotControls)窗口加載表面(LoadingSurfaces)窗口grajrcwM-aid斜聲njlaLiunnitMJt；-Thcplotcanberotatedfo呂hewtheam,caxesviewsasseenintheAqualugyjiiphwnidcw.ByclickingonadiilerenicoiuponeiitinthePlotControlswiridow+youcun!*ccthtitcomponentviewin

38、thesximcurieiitatioai.在3D旋轉(zhuǎn)(3DRotate)模式下，將出現(xiàn)3D旋轉(zhuǎn)指示器?？梢孕D(zhuǎn)繪圖以顯示與光譜儀圖形窗口中相同的軸視圖。通過在“繪圖控制”(PlotControls)窗口中單擊其他組件，您可以以相同方向查看該組件視圖。xpcrtl-igijreSpawnSleitcViewMSPorntMSWordtpbc-ardOpisnfteportFolderDockThisWindowAJIFtgumQnAuto-dockLktfFiKiureCopyFigurePkflfSatMtfiijure-Them4用“廟訊世&wM!rFiauneThjmbndkHndFig

39、ureMLoadingSurfacesfile|Fig&rser|PldiGLO匸2加空U.UJThesefigurescunbeexportedinelvarietyofwaysbyclickingonFigBrowser,ExportFigureintheLoadingSurfaceswindow,and通過單擊“圖片瀏覽器”(FigBrowser),在“加載曲面”(LoadingSurfaces)窗口中的“導(dǎo)出圖形”(ExportFigure),然后選擇一個(gè)選項(xiàng)，可以通過多種方式導(dǎo)出這些圖形。自動(dòng)導(dǎo)出到MSPowerPoint或MSWord。通過單擊文件，另存為(File,SaveAs)

40、，可以將圖形保存為多種圖形格式：ByclickingonFile,SaveAs.theplotcobesavedin討numberof事aptiic若Ifomuits:/ap*TL_OweJPnnrtFTcr.Ctd-P9.9通過單擊右上角的互衛(wèi)來關(guān)閉“繪圖控件”(PlotControIs)和“加載曲面”(LoadingSurfaces)窗口。10.檢驗(yàn)殘差10.1在分析窗口中，單擊PlotDataEstimateandResiduals按鈕,Zmtyi5-PARAFAjE岔耳-Muhipk：AqualogFilesfileEdrtPiepmoewIWieTdAHb(pFgDrowvModel

41、p_I|/Auply/Yailidmag|TheDisplayDatawindow:DisplaaDispldf口耐JR&cimtnMledDLa(Z_has)Refill(Eord_uQn”Re匚DnstruclEdDdla(X_haAJRisiduti(EorQ_conjJT嘉iD耐兇CaneelCancel10.2選擇要顯示的數(shù)據(jù)，然后單擊OK按鈕。FittingPRARFAC的窗口會(huì)立即出現(xiàn)PlotControls窗口和Figure1:Data+DataEstimate+Residuals-PARAFACNcompMultipleAqualogFiles窗口會(huì)出現(xiàn)(N=組分?jǐn)?shù)量)。默認(rèn)

42、數(shù)據(jù)集顯示在：Figurel,窗口顯示的是PlotControls窗口的列表中的第一個(gè)。注意:單擊(Figure1:)圖1右下角的圖標(biāo):工具欄以擴(kuò)展工具欄用以顯示更多的圖標(biāo)。XEntfsift(rfn|應(yīng)iE!跡訓(xùn)九佃咖*rg18*1?佃RQ01UrtyH_ft-li-innhiiir事口廠&dFileFqBiTT*rM-PiKXJ!昌也址述|紬匕竺玉印堅(jiān)型蒞壁鯊邂纏區(qū)0川BflRum丄；DadiC!iEatrnraRah-duu-P4RAF/E4ccnpMjLphAqjiiagG1?1dFTflTAAmTTIIPFM曲iWW450360300EKMafliwm250醫(yī)EdnAI沁鄧S亡Iww

43、eTHMbwfiuticns10.3在Plot控件X和Y列表中選擇set(s),然后單擊Select按鈕，圖即可更改為所需的數(shù)據(jù)集。*10.4為方便查看，單擊Figure1：圖1右下角的圖標(biāo),toolbar然后單擊EditAllSettings按鈕。初始化InitializingOptions窗口會(huì)即刻出現(xiàn)。隨后出現(xiàn)Options/Preferences選項(xiàng)/首選項(xiàng)窗口。10.5將plottype更改為contour，然后單擊Ok按鈕。fittediocm:okirHrdunnuitirr憑*1啊2仃！nniik5vn*saliJDeFd-u：DfyOkJiul圖即可切換到俯視圖“topvie

44、w。Fiune1;Dabfl+Dab*E?naieu-dLMCPNb上MaT瓦L310.6通過單擊右上角的紅色X按鈕來關(guān)閉PlotControls和Figure1:Data+DataEstimate+Residuals-PARAFACNcompMultipleAqualogFiles窗口。第二部分：執(zhí)行對(duì)半分析(Split-HalfAnalysis)如果一個(gè)數(shù)據(jù)集中有四個(gè)以上的樣本，可以使用此函數(shù)oPerformSplit-HalfAnalysis執(zhí)行對(duì)半分析)即將數(shù)據(jù)集分為兩個(gè)部分，并且將每個(gè)半集與另一個(gè)半集進(jìn)行比較，也將每個(gè)半集與整個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行比較。這是對(duì)數(shù)據(jù)一致性的檢查。1將數(shù)據(jù)集加載到

45、PARAFAC窗口進(jìn)行分析。數(shù)據(jù)集必須包含四個(gè)以上的數(shù)據(jù)點(diǎn)。2在PARAFAC窗口中，單擊執(zhí)行對(duì)半分析(PerformSplit-HalfAnalysis）按鈕軟件即會(huì)執(zhí)行對(duì)半分析，PerformingSplitHalfAnalysis進(jìn)程的進(jìn)度條會(huì)出現(xiàn)Ii=E31PsrfarmngSplrlHaHICIdmIsCaiKcfl1當(dāng)分析完成時(shí)，一系列的圖表將出現(xiàn)在SplitHalfAnalysisResults分析結(jié)果窗口中相似性度量是檢查每個(gè)數(shù)據(jù)集與另一個(gè)數(shù)據(jù)集的匹配程度的參數(shù)。在這里，相似度是97.6%。第三部分：總熒光TotalFluorescence在PARAFAC中，我們已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化了/

46、歸一化數(shù)據(jù)集?，F(xiàn)在我們回到(TotalFluorescence.)總熒光。1編輯數(shù)據(jù)VmwtLthodPrepnaceLnUlOCilfM/Lnal/iisPAilAFAC啊口ModelMultiple山quaiogFitetftrfineToolsHelpFijBrpwrrtpr-occss|ArwlysisIPKatPreprocKsedDatzsI*feBr&advlSavePrcfiHScesiedDataCIUlTtfCuDn.CunrwrtAsD卅ult1.1單擊菜單欄中的Preprocess,將出現(xiàn)下拉菜單1.2單擊X-block,子菜單出現(xiàn)選擇Custom.Preprocess

47、ingX-block窗口即可出現(xiàn)在SelectedMethods列表中，選擇Normalize.1.5單擊Remove按鈕，則Normalize已從SelectedMethods所選方法列表中刪除1.6雙擊EEMFiltering行，顯示了EEMFilterSettings(EEM過濾器設(shè)置)窗口:8600400SODCancelMissingValuesBlankSuWraction3332(1/cirn.1stOrderShift)300ReplaceWithMissingValuesFirstOrderRayleighFilter|SecondOrderRayleighFilter.IR

48、amanFiller(1st&2mdlOrderRamanShiftLdwZeifl-陽豊IE(nm)20J32伽）ID.J10nm)Half-Width1.7單擊缺省值MissingValues以顯示下拉菜單.1.8在菜單中選擇InterpolatedValues（插入的值EEMFilterSettnnqaOKJCancelHekp1.9單擊OKPreprocessingX-block窗口即會(huì)出現(xiàn)Lfcaw-,-Li*Piferi6EMFmnfltlZlKMLRBOfl*aQl.bp叫nirLogiS-x：M心琢ffhMCTKWF卞屮也話更出盼亦黑JraiHU-=R*wPWt-m-H4).聞

49、WMEutouFFMl.io單擊ok保存預(yù)處理數(shù)據(jù)2.1在菜單欄點(diǎn)擊Preprocessed，出現(xiàn)一個(gè)下拉菜單。HAnalis-PARAFA匚(No-IModll-Multiple-AqualogFilesAleEditPreprocessAnalysRefineTools-HelpSgBrcwrs*X-clockY-HockCluttrrPlotPneprarestedData11Apply/VslidaiteCdbZi口nAnelya-ia.Flowchart1.Lkm)calibratondata2ChoosePreprocessing:gentryxDAIti-8CacheSettin

50、gsan由ODemoDzrta6HumbcranPreprocffSiedC)ata，X-blarkPcnccnlVangnceCophiV-block3ChooseComponents4BuildModelReviewModelKtUrC96Model)簟balid呂：ionX-block乩RevimResulte-Y-blockralemod?lc-alc-modelcacmodelCompareMedelsBChange匚口mponentscjIcmodel7RebuildModelcakmodelUaeModelitem:PARAFACitem;Multipleitem:PARAFAC

51、itemsMuldple.8LoadTestData9.AppJyModelToFileRefreshHelpSaveIDabsnas-brenlDae-dbutnomD-delFJtntx.SetthHproprccesungan-dotheropbons(fromihePreprcces&srniTa&ls-iTieiiusiandlcBibraiearrcdel(dickanHodlericuninBig伯I咱pane)D1bcan網(wǎng)弼用駅Jerndedl耐叩det.insDntnbXarKjjcrrmn尋選擇SavePreprocessedData，出現(xiàn)一個(gè)子菜單。選擇X-block。

52、Save窗口出現(xiàn):重整數(shù)據(jù)。3.1在Solo_MIA工作區(qū)瀏覽器的右上方面板中，雙擊MultipleAqualogFiles。DSolaWorkspw?Br3wwrXReEditVivwArLfllte斤gBi曲NewVerMn1qlanifqCunwr*Fdar靖土取或1.55戸致妊“矽浜EXfSitSaPgJMlDdfil”ifi*旳siwT口口1$Topks-idmibleclicktoopen_lXFAVORITES0MaSetEdilor*Gttt兩SiMedPCA-PrincipjilCcmprarberftArlyss-tfrTre-ndTm4eiXtocxs-I&DECOMPQSTlO漏沾M-aurHy-MCR.-MuHivariate-CurveRewlutioriPaRAKAjCPrJIdFadoArilysisiSPCfl-站rcipilAalyGEUSIMPLISMA-Purrty-REGRESSIOMCLU&TEAiMClASSlflCATiOlMDESIGNOFEXPERIMENTSSATCHANALYSISTRANIFORMWorkspace(CuirFtfll；Works.pactVuriffehfllaBjtIi-e!(1時(shí)4丄.1啊卩訂書CllEKhlfliJata