A第四講 新藥開(kāi)發(fā)原理和方法(講授1)

1、第四講 新藥開(kāi)發(fā)原理 1.半個(gè)世紀(jì)之前，人們對(duì)在細(xì)胞水平和分子水平上的生命現(xiàn)象了解甚少，尋找新藥的方法多是基于經(jīng)驗(yàn)和嘗試，主要是通過(guò)大量化合物的篩選與偶然發(fā)現(xiàn)?？窟@種方法發(fā)現(xiàn)了大批治療藥物。但它的不可預(yù)見(jiàn)性和盲目性，人力和物力的巨大消耗，發(fā)現(xiàn)新藥的成功率越來(lái)越低，促使人們發(fā)展具有較高預(yù)測(cè)性的更合理的研究方法。2.發(fā)現(xiàn)新藥的途徑3.隨著生命科學(xué)的相關(guān)學(xué)科在上世紀(jì)后半期的迅速發(fā)展，定量構(gòu)效關(guān)系、合理藥物設(shè)計(jì)、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)、組合化學(xué)、高通量篩選等新技術(shù)、新方法不斷涌現(xiàn)，基因技術(shù)被應(yīng)用到新藥的研究之中，新藥設(shè)計(jì)學(xué)也應(yīng)運(yùn)而生。近十年來(lái)，新藥設(shè)計(jì)與開(kāi)發(fā)有了突飛猛進(jìn)的發(fā)展，優(yōu)良的新藥不斷問(wèn)世，為世界制

2、藥工業(yè)帶來(lái)了勃勃生機(jī)。4.藥物作用的生物學(xué)基礎(chǔ)5.根據(jù)藥物在分子水平上的作用方式，可把藥物分成兩種類型，即非特異性結(jié)構(gòu)藥物（Structurally Nonspecific Drug）和特異性結(jié)構(gòu)藥物（Structurally Specific Drug）。非特異性結(jié)構(gòu)藥物的藥理作用與化學(xué)結(jié)構(gòu)類型的關(guān)系較少，主要受藥物的理化性質(zhì)的影響。如全身麻醉藥（氣體、低分子量的鹵烴、醇、醚、烯烴等），其作用主要受藥物的脂水（氣）分配系數(shù)的影響。特異性結(jié)構(gòu)藥物發(fā)揮藥效的本質(zhì)是藥物小分子與受體生物大分子的有效結(jié)合，這包括二者在立體空間上互補(bǔ)；在電荷分布上相匹配，通過(guò)各種鍵力的作用使二者相互結(jié)合，進(jìn)而引起受體生

3、物大分子構(gòu)象的改變，觸發(fā)機(jī)體微環(huán)境產(chǎn)生與藥效有關(guān)的一系列生物化學(xué)反應(yīng)。 6. 藥物的構(gòu)效關(guān)系、藥物作用方式 構(gòu)效關(guān)系（SAR）藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)與活性的關(guān)系 藥物從給藥到產(chǎn)生藥效的過(guò)程可分為 藥劑相、藥物動(dòng)力相和藥效相三個(gè)階段， 藥物的結(jié)構(gòu)對(duì)每一相都產(chǎn)生重要影響， 1 . 非特異性結(jié)構(gòu)藥物 其藥理作用主要受藥物理化性質(zhì)的影響，與化學(xué)結(jié)構(gòu)關(guān)系較小。 一般認(rèn)為是通過(guò)物理化學(xué)過(guò)程起作用，稍改變其結(jié)構(gòu)化學(xué)結(jié)構(gòu)， 對(duì)藥理作用的影響不明顯。 (404頁(yè)) 例如： 全麻藥。 根據(jù)藥物的作用方式將藥物分成下列兩種類型7. 2. 特異性結(jié)構(gòu)藥物（多數(shù)藥物） 其藥理作用依賴于藥物特異的化學(xué)結(jié)構(gòu)及特異的空間結(jié)構(gòu)。 通常

4、需與機(jī)體內(nèi)三維結(jié)構(gòu)的受體 契合而 產(chǎn)生藥理效應(yīng)。 化學(xué)結(jié)構(gòu)稍加改變，就會(huì)直接影響其藥物活性（如：電子分布、 分子構(gòu)型構(gòu)象等起著決定性的作用）。 例如： 甾體激素、鎮(zhèn)痛藥等。 8. 藥物結(jié)構(gòu) 決定 物理性質(zhì) 結(jié)構(gòu)類型 化學(xué)性質(zhì) 立體結(jié)構(gòu) 影響 決定 非特異性結(jié)構(gòu)藥物 特異性結(jié)構(gòu)藥物 生物活性 9. 三. 藥 物 設(shè) 計(jì) 目 的： 提高尋找新藥的合理性，減少盲目性， 加快新藥研究的步伐。 研究?jī)?nèi)容： （1）開(kāi)拓性研究 改進(jìn)現(xiàn)有的藥物或有效化合物。 （2）探索性研究 尋找新的先導(dǎo)化合物或設(shè)計(jì)新的分子結(jié)構(gòu)。 構(gòu)效關(guān)系的研究是藥物設(shè)計(jì)的基礎(chǔ)。 本節(jié)重點(diǎn)討論藥物結(jié)構(gòu)對(duì)藥效的影響。10. 化學(xué)結(jié)構(gòu)與藥效關(guān)系

5、（一）藥物產(chǎn)生藥效的決定性因素 1. 首先必須以一定的濃度（有效濃度）到達(dá)作用部位。 2. 與作用部位的受體發(fā)生作用。 這兩個(gè)因素都與藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)關(guān)系密切， 是構(gòu)效關(guān)系研究的重要內(nèi)容。 有的藥物體外試驗(yàn)具有強(qiáng)烈活性（符合受體要求），但體內(nèi)幾乎無(wú)效，說(shuō)明其結(jié)構(gòu)并不一定具有轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程 所要求的最合適的理化參數(shù)，無(wú)法接近作用部位，故 體內(nèi)幾乎無(wú)效(藥效與理化性質(zhì)有關(guān))。 有的藥物雖易轉(zhuǎn)運(yùn)到達(dá)作用部位，但與受體嵌和不良,同樣療效不佳(與結(jié)構(gòu)類型、立體結(jié)構(gòu)關(guān)系密切)。50左右%無(wú)效原因11.(二）理化性質(zhì)對(duì)藥效的影響 口服給藥時(shí)，藥物由胃腸道吸收，進(jìn)入血液。藥物在運(yùn)轉(zhuǎn)過(guò)程中，必須透過(guò)各種生物膜（如：人與

6、細(xì)菌的細(xì)胞膜），才能到達(dá)作用部位或受體部位。 藥物的藥代動(dòng)力學(xué)（吸收、轉(zhuǎn)運(yùn)、分布、代謝、排泄）會(huì)對(duì)藥物在受體部位的濃度產(chǎn)生直接影響，而藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì)是由藥物的理化性質(zhì)決定的。 藥物在作用部位達(dá)到有效濃度，是藥物與受體結(jié)合的基本條件。 以上的一系列過(guò)程均與藥物的理化性質(zhì)有關(guān)。 藥物結(jié)構(gòu)決定藥物的理化性質(zhì)，理化性質(zhì)影響藥物的有效濃度，從而影響活性（如：青霉素）。 此外還與藥物的穩(wěn)定性、毒副作用關(guān)系也很密切。 理化性質(zhì)中，對(duì)藥效影響較大的主要是 溶解度、分配系數(shù)、解離度。 12.1. 溶解度、脂水分配系數(shù)對(duì)藥效的影響 藥 物 一定 水溶性 一定 水溶性 （親水性） （親脂性） 擴(kuò)散轉(zhuǎn)運(yùn) 通過(guò)脂質(zhì)生物

7、膜 血液或體液 進(jìn)入細(xì)胞內(nèi) （至作用部位） 適宜、合適的P（脂水分配系數(shù)）必須具有13. 藥物在體內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)、擴(kuò)散進(jìn)入血液循環(huán)，達(dá)到有效濃度，需要一定的水溶性（親水性）。通過(guò)各種脂性細(xì)胞膜與作用部位（受體、DN、酶）結(jié)合生效，又需要有一定的脂溶性（親脂性）。所以：藥物必須既具有一定的水溶性又具有一定的只溶性才能產(chǎn)生藥效，否則無(wú)效。 口服藥物強(qiáng)親水性或強(qiáng)親脂性都將顯著降低藥效或無(wú)效。14. 例如： 抗瘧藥 血液循環(huán)需脂溶性 紅細(xì)胞膜、 瘧原蟲(chóng)膜 瘧原蟲(chóng)DNA 生長(zhǎng)、繁殖 抗瘧藥效進(jìn)入穿過(guò)作用干擾產(chǎn)生需水溶性15. 例如： 巴比妥類藥物 名稱 結(jié)構(gòu) 離子型 分子型 巴比妥酸 99.9% （無(wú)效） 三乙

8、基苯 基巴比妥 100% （無(wú)效） 16. 苯巴比妥 50% 50% （離子型） （分子型） 有效17.例如： 抗精神失常藥 藥 名 R 脂溶性 藥 效 異丙嗪 H 鎮(zhèn) 靜 氯丙嗪 C l 抗精神失常 三氟丙嗪 CF3 強(qiáng)效抗精神失常 改變藥物的結(jié)構(gòu)（先導(dǎo)化合物的優(yōu)化）， 可改變其脂溶性（易透過(guò)血腦屏障達(dá)有效濃度）， 從而改變了藥物的作用，或 影響了藥效的強(qiáng)弱。 RR（副作用）18. 分子的結(jié)構(gòu)取代基對(duì)脂水分配系數(shù)P 影響： 基 團(tuán) P 值引入 ： 羥基 5150倍 脂氨基 2100倍 鹵素原子 420倍 甲基 24倍 羧基成甲酯 24倍 19. 2. 解離度對(duì)藥物的影響 有機(jī)藥物多為弱酸或弱

9、堿，在體液中部分解離， 以離子型和分子型混存于體液中且存在動(dòng)態(tài)平衡。 藥物以脂溶性的分子通過(guò)生物膜， 在膜內(nèi)解離成離子，以離子型起作用。 （1） 穿過(guò)生物膜需要脂溶性的分子型。 （2） 與受體結(jié)合、相互作用需要離子型。 （3） 吸收、分布和保持有效濃度，需混合型。 20.例如： 磺胺藥的解離常數(shù)與制菌強(qiáng)度有關(guān) （1）解離常數(shù)在6.57.2之間，抗菌活性最強(qiáng)。 （2）抗菌活性最強(qiáng)具有適宜的分子、離子比。 事實(shí)上，許多較好的磺胺藥（SD、SMZ等）的 解離常數(shù)均在67.4之間。 磺胺藥物的制菌作用是離子和分子的總效應(yīng)。 21. 例如： 巴比妥類藥物 藥 名 解離常數(shù) 分子型% 藥效 無(wú)取代類巴比妥

10、酸 4. 12 0. 052 無(wú)效單取代5-苯基巴比妥 3. 75 0. 022 無(wú)效 乙基巴比妥 7. 0 50. 00 + 苯巴比妥 7. 4 50 + 丙烯巴比妥 7. 7 66. 6 1 異戊巴比妥 7. 9 75. 97 + 戊巴比妥 8. 0 79. 92 + 己瑣巴比妥 8. 4 90. 00 + 1，3，5-三乙基 - 5-苯基巴比妥 0. 0 100. 00 無(wú)效5，5-雙取代類五取代類22.一、藥物作用的生物靶點(diǎn)能夠與藥物分子結(jié)合并產(chǎn)生藥理效應(yīng)的生物大分子現(xiàn)通稱為藥物作用的生物靶點(diǎn)。這些靶點(diǎn)的種類主要有受體、酶、離子通道和核酸，存在于機(jī)體靶器官細(xì)胞膜上或細(xì)胞漿內(nèi)。就目前上市

11、的藥物來(lái)說(shuō)，以受體為作用靶點(diǎn)的藥物約占52%；以酶為作用靶點(diǎn)的藥物約占22%；以離子通道為作用靶點(diǎn)的藥物約占6%；以核酸為作用靶點(diǎn)的藥物約占3；其余17藥物的作用靶點(diǎn)尚不清楚。 23.1. 以受體為靶點(diǎn)藥物與受體結(jié)合才能產(chǎn)生藥效。理想的藥物必須具有高度的選擇性和特異性。選擇性要求藥物對(duì)某種病理狀態(tài)產(chǎn)生穩(wěn)定的功效。特異性是指藥物對(duì)疾病的某一生理、生化過(guò)程有特定的作用，此即要求藥物僅與疾病治療相關(guān)聯(lián)的受體或受體亞型產(chǎn)生結(jié)合。24.現(xiàn)已有幾百種作用于受體的新藥問(wèn)世，其中絕大多數(shù)是GPCR（G-蛋白偶聯(lián)的受體）的激動(dòng)劑或拮抗劑。例如，治療高血壓的血管緊張素II受體拮抗劑洛沙坦、依普沙坦，中樞鎮(zhèn)痛的阿片

12、受體激動(dòng)劑丁丙諾啡、布托啡諾，a-受體激動(dòng)劑阿芬他尼等。 25.G-蛋白偶聯(lián)受體（G-protein cross-linked receptor）26.G蛋白偶聯(lián)型受體G蛋白腺苷酸環(huán)化酶信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑示意圖 27.G蛋白偶聯(lián)型受體G蛋白腺苷酸環(huán)化酶信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑示意圖 28.近年來(lái)，受體的亞型及新受體不斷被發(fā)現(xiàn)和克隆表達(dá)，有關(guān)它們的生化、生理、藥理性質(zhì)也相繼被闡明，為新藥的設(shè)計(jì)和研究提供了更準(zhǔn)確的靶點(diǎn)和理論基礎(chǔ)和降低藥物毒副作用作出了很大的貢獻(xiàn)?，F(xiàn)已知道，腎上腺能受體有a1、a2、bl、b2、b3亞型，多巴胺受體有Dl、D2、D3、D4、D5亞型，阿片受體有m、k、s、d、e亞型等。孤兒受體(or

13、phan receptor)是近年來(lái)提出的一種新概念，是指其編碼基因與某一類受體家族成員的編碼有同源性，但目前在體內(nèi)還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其相應(yīng)的配基。29.2. 以酶為靶點(diǎn)： 由于酶催化生成或滅活一些生理反應(yīng)的介質(zhì)和調(diào)控劑，因此，酶構(gòu)成了一類重要的藥物作用靶點(diǎn)。酶抑制劑通過(guò)抑制某些代謝過(guò)程，降低酶促反應(yīng)產(chǎn)物的濃度而發(fā)揮其藥理作用。理想的酶抑制劑藥物，應(yīng)該對(duì)靶酶有高度親和力和特異性。近年來(lái)，基于細(xì)胞代謝理論的指導(dǎo)，合理設(shè)計(jì)的酶抑制劑類藥物發(fā)展較快，目前世界上銷售量最大的20個(gè)藥物中有近一半為酶抑制劑類藥物。 30.近年來(lái)，酶抑制劑研究比較活躍的領(lǐng)域有：降壓藥的血管緊張素轉(zhuǎn)化酶（ACE）抑制劑，腎素抑制劑，

14、調(diào)血脂藥HMG-CoA還原酶抑制劑非甾體抗炎藥物中的環(huán)氧化酶-2（COX-2）抑制劑，抗腫瘤藥物中的芳構(gòu)化酶抑制劑抗前列腺增生治療藥中的5a-還原酶抑制劑等一氧化氮(NO)作為生物體內(nèi)的重要信使分子和效應(yīng)分子，在心血管、神經(jīng)和免疫系統(tǒng)方面具有重要的生理功能。但過(guò)量產(chǎn)生或釋放時(shí)能介導(dǎo)多種疾病的發(fā)生和發(fā)展。一氧化氮合成酶(NOS)抑制劑可阻止NO過(guò)量生成。NO以及有關(guān)的NOS抑制劑的研究已成為近年來(lái)生物醫(yī)學(xué)和藥學(xué)研究的前沿領(lǐng)域之一。31.3. 以離子通道為靶點(diǎn)： 帶電荷的離子由離子通道出入細(xì)胞，不斷運(yùn)動(dòng)、傳輸信息，構(gòu)成了生命過(guò)程的重要組成部分，保持著生物體中細(xì)胞與細(xì)胞間的有效聯(lián)系。離子通道的阻滯劑

15、和激活劑調(diào)節(jié)離子進(jìn)出細(xì)胞的量，進(jìn)而調(diào)節(jié)相應(yīng)的生理功能，可用于疾病的治療。K+,Cl-Channel currentsPumpExchangerK+Ca2+Na+Na+Ca2+OutsideNa+insideMembrance32.這方面的研究近年來(lái)進(jìn)展較快。如： 作用于Na+通道的藥物有奎尼丁、美西律、普羅帕酮等。作用于Ca2+通道的藥物有二氫吡啶類、苯烴胺類和硫氮雜卓類等，如硝苯地平、尼卡地平、尼莫地平 作用于K+通道的藥物主要為K+-ATP酶的激活劑和拮抗劑，如治療II型糖尿病的甲苯磺丁脲、格列本脲為K+通道的拮抗劑；而尼可地爾和吡那地爾為K+通道的激活劑，主要用于高血壓、心絞痛的治療。

16、III類抗心律失常藥物多為K+通道拮抗劑，主要藥物有胺碘酮、索他洛爾等。 33.4. 以核酸為靶點(diǎn)： 人們普遍認(rèn)為腫瘤的癌變是由于基因突變導(dǎo)致基因表達(dá)失調(diào)和細(xì)胞無(wú)限增殖所引起的。因此，可將癌基因作為藥物設(shè)計(jì)的靶，利用反義技術(shù)(antisense technology)抑制癌細(xì)胞增殖。以已知的抗腫瘤藥物為先導(dǎo)，以DNA為靶點(diǎn)設(shè)計(jì)新的抗癌藥物也正在開(kāi)展。 34.二、藥物作用的體內(nèi)過(guò)程藥物在體內(nèi)發(fā)揮治療作用的關(guān)鍵與其在作用部位的濃度和與生物靶點(diǎn)相互作用（阻斷或刺激）的能力有關(guān)。藥物的作用必須考慮影響藥物療效的兩個(gè)基本因素，一個(gè)是藥物到達(dá)作用部位的濃度，以藥物作用的動(dòng)力學(xué)時(shí)相（pharmacokine

17、tic phase）來(lái)描述。另一個(gè)重要因素是藥物與生物靶點(diǎn)的特異性結(jié)合，以藥物作用的藥效學(xué)時(shí)相（pharmcodynamic phase）來(lái)闡述。35.1. 動(dòng)力學(xué)時(shí)相： 對(duì)于一個(gè)藥物來(lái)說(shuō)，除了必須考慮它與生物靶點(diǎn)的相互作用之外，還要考慮它在體內(nèi)的吸收、分布、代謝和消除(ADME)。藥物的結(jié)構(gòu)決定其物理化學(xué)性質(zhì)，理化性質(zhì)又決定其在體內(nèi)的藥物動(dòng)力學(xué)過(guò)程。一個(gè)藥物結(jié)構(gòu)改變而引起療效的差異，很可能與影響其體內(nèi)動(dòng)力學(xué)過(guò)程有關(guān)。 吸收(absorption）分布(distribution)代謝(metabolism)排泄(excretion) 36.2藥效學(xué)時(shí)相： 結(jié)構(gòu)特異性藥物發(fā)揮藥效的本質(zhì)是藥物有機(jī)

18、小分子經(jīng)吸收、分布到達(dá)其作用的生物靶點(diǎn)后，與受體生物大分子相互作用的結(jié)果。藥物與受體分子結(jié)合形成復(fù)合物，進(jìn)而引起受體構(gòu)象的改變，觸發(fā)機(jī)體微環(huán)境產(chǎn)生與藥效有關(guān)的一系列生理效應(yīng)。 37.三、藥物一受體相互作用的化學(xué)本質(zhì)藥物分子和受體的結(jié)合，除靜電相互作用外，主要是通過(guò)各種化學(xué)鍵連接，形成藥物-受體復(fù)合物，其中共價(jià)鍵的鍵能很大，結(jié)合是不可逆的。下面討論藥物與受體間可能產(chǎn)生的幾種化學(xué)鍵的情況。 生長(zhǎng)因子和受體38.1共價(jià)鍵結(jié)合： 這是藥物和受體間可以產(chǎn)生的最強(qiáng)的結(jié)合鍵，它難以形成，但一旦形成也不易斷裂。某些有機(jī)磷殺蟲(chóng)藥、膽堿酯酶抑制劑和烷化劑類抗腫瘤藥都是通過(guò)與其作用的生物受體間形成共價(jià)鍵結(jié)合而發(fā)揮作

19、用的。39.具有高張力的四元環(huán)內(nèi)酯或內(nèi)酰胺類藥物如-內(nèi)酰胺類抗生素也是同樣的情況。青霉素的抗菌作用就是由于它能和細(xì)菌細(xì)胞壁生物合成中的轉(zhuǎn)肽酶生成共價(jià)鍵，從而使轉(zhuǎn)肽酶失活。40.2非共價(jià)鍵的相互作用： 化療藥物和受體之間生成鍵能較大的不可逆的共價(jià)鍵，保持藥物與生物靶點(diǎn)的持久性結(jié)合，對(duì)于殺滅病原微生物和腫瘤細(xì)胞往往是理想的。而對(duì)于中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥物來(lái)說(shuō)，藥物和受體間持久作用是非常有害的，人們希望其藥理作用只在較短時(shí)間內(nèi)持續(xù)。藥物和相應(yīng)受體間的結(jié)合通常建立在離子鍵或更弱的結(jié)合力上，這些力對(duì)于形成的藥物和受體復(fù)合物來(lái)說(shuō)已足夠牢固和穩(wěn)定，使其不太易于從作用部位除去。 41.帶有電荷的蛋白多肽鏈 42.藥物

20、-受體之間形成的這種離子鍵的結(jié)合，是非共價(jià)鍵中最強(qiáng)的一種，是藥物受體復(fù)合物形成過(guò)程中的第一個(gè)結(jié)合點(diǎn)。其他尚有多種非共價(jià)鍵形式，在藥物-受體相互作用過(guò)程中起著重要的作用。 43.受體大多是蛋白質(zhì)。若一個(gè)藥物分子結(jié)構(gòu)中的電荷分布正好與其特定受體區(qū)域相適應(yīng)，那么藥物的正電荷（或部分正電荷）與受體的負(fù)電荷（或部分負(fù)電荷）產(chǎn)生靜電引力。藥物的負(fù)電荷（或部分負(fù)電荷）與受體的正電荷（或部分正電荷）產(chǎn)生靜電引力。當(dāng)接近到一定程度時(shí)，分子的其余部分還能與受體通過(guò)分子間普遍存在的范德華引力相互吸引，這樣藥物與受體就結(jié)合形成復(fù)合物。 44.局部麻醉藥分子與受體相互作用模型 45.四、藥物與受體相互作用的立體效應(yīng)由蛋白質(zhì)組成的受體，有一定的三維空間結(jié)構(gòu)。在藥物與受體的各原子或基團(tuán)間相互作用時(shí)，作用的原子或基團(tuán)間的距離對(duì)于相互的引力有重要的影響。藥物中官能團(tuán)間的距離，手征性中心及取代基空間排列的改變，均能強(qiáng)烈地影響藥物受體復(fù)合物的互補(bǔ)性，從而影響藥物和受體的結(jié)合。46.由于受體和藥物都是三維實(shí)體，也導(dǎo)致了藥物的立體異構(gòu)，即幾何異構(gòu)和光學(xué)異構(gòu)對(duì)藥物活性有較大的影響。幾何異構(gòu)是由雙鍵或環(huán)等剛性或半剛性系統(tǒng)導(dǎo)致分子內(nèi)旋轉(zhuǎn)受到限制而產(chǎn)