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1、組蛋白修飾及其功能 組蛋白翻譯完成后,其氨基尾巴會(huì)發(fā)生多種共價(jià)修飾,如乙?;⒓谆?、磷酸化,泛素化和ADP核糖基化等,這些修飾都是可逆性修飾,這些修飾共同構(gòu)成了“組蛋白密碼”。 表觀遺傳學(xué)(epigentics)是研究不改變DNA序列而由于其外部修飾引起的基因開(kāi)放與否的學(xué)科,涉及的主要機(jī)制有DNA甲基化、組蛋白修飾、基因印記、RNA干擾等。其中研究得最多是DNA甲基化和組蛋白乙?;?、組蛋白甲基化,這些修飾與活化或失活染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)形成相關(guān)。 染色質(zhì)是由許多核小體組成的,大部分真核生物中有5種富含堿性氨基酸的組蛋白,即H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B,H3和H4各2個(gè)分子構(gòu)成的8
2、聚體是核小體的核心部分,H1的作用是與線形 DNA結(jié)合以幫助后者形成高級(jí)結(jié)構(gòu)。1. 組蛋白乙?;?核心組蛋白乙酰化反應(yīng)多發(fā)生在核心組蛋白 N端堿性氨基酸集中區(qū)的特定 Lys 殘基。組蛋白乙?;山M蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HAT)和組蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)協(xié)調(diào)進(jìn)行。HAT通過(guò)將乙酰輔酶 A 的乙酰基轉(zhuǎn)移到 Lys 的NH+,中和掉一個(gè)正電荷。 HDAC使組蛋白去乙?;?,與帶負(fù)電荷的DNA緊密結(jié)合,染色質(zhì)致密卷曲,基因的轉(zhuǎn)錄受到抑制。 分子效應(yīng):乙?;赡芡ㄟ^(guò)對(duì)組蛋白電荷以及相互作用蛋白的影響,增加組蛋白與DN
3、A的排斥力,來(lái)調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄。組蛋白的乙?;欣贒NA與組蛋白八聚體的解離,核小體結(jié)構(gòu)松弛,從而使各種轉(zhuǎn)錄因子和協(xié)同轉(zhuǎn)錄因子能與DNA結(jié)合位點(diǎn)特異性結(jié)合,激活基因的轉(zhuǎn)錄。同時(shí)影響泛素與組蛋白的H2A的結(jié)合,導(dǎo)致蛋白質(zhì)的選擇性降解。 通常,異染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域組蛋白呈低乙?;H旧|(zhì)結(jié)構(gòu)域組蛋白呈高乙?;?。酵母組蛋白乙?;c去乙?;恼{(diào)節(jié)組蛋白乙?;{(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的機(jī)制組蛋白乙?;鹑旧|(zhì)結(jié)構(gòu)改變及基因轉(zhuǎn)錄活性變化的至少包括以下幾個(gè)方面:組蛋白尾部賴(lài)氨酸殘基的乙?;軌蚴菇M蛋白攜帶正電荷量減少,降低其與帶負(fù)電荷的DNA鏈的親和性,導(dǎo)致局部 DNA與組蛋白八聚體解開(kāi)纏繞,從而促使參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的各種蛋白因子
4、與DNA特異序列結(jié)合,進(jìn)而發(fā)揮轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用;組蛋白的N末端尾巴可與參與維持染色質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的多種蛋白質(zhì)相互作用,更加穩(wěn)定了核小體的結(jié)構(gòu)。而組蛋白乙?;瘏s減弱了上述作用,阻礙了核小體裝配成規(guī)則的高級(jí)結(jié)構(gòu)(如螺線管);組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(HAT)對(duì)相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子或活化因子進(jìn)行乙?;揎椧哉{(diào)節(jié)基因的表達(dá)。如 CBPP300對(duì)P53的乙?;稍鰪?qiáng)其特異性 DNA結(jié)合能力、轉(zhuǎn)錄激活能力,并延長(zhǎng)其半衰期。局部乙酰化舉例 當(dāng)DNA與核小體尚未解開(kāi)纏繞時(shí),轉(zhuǎn)錄激活因子如糖皮質(zhì)激素受體可以和DNA上相應(yīng)的反應(yīng)元件(GRE)結(jié)合。當(dāng)結(jié)合至GRE之后,糖皮質(zhì)激素募集共激活因子如CBP到染色體上的靶轉(zhuǎn)錄基因區(qū)。此時(shí),共激
5、活因子利用HAT活性使得結(jié)合在DNA啟動(dòng)子區(qū)域的核心組蛋白乙?;?,進(jìn)而使DNA與組蛋白結(jié)合減弱,核小體釋放,轉(zhuǎn)錄因子和RNA聚合酶可以與DNA上特異的啟動(dòng)子結(jié)合,啟動(dòng)靶基因的轉(zhuǎn)錄。2. 組蛋白的甲基化 組蛋白甲基化是由組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶(histone methyl transferase,HMT)完成的。甲基化可發(fā)生在組蛋白的賴(lài)氨酸和精氨酸殘基上,而且賴(lài)氨酸殘基能夠發(fā)生單、雙、三甲基化,而精氨酸殘基能夠單、雙甲基化,這些不同程度的甲基化極大地增加了組蛋白修飾和調(diào)節(jié)基因表達(dá)的復(fù)雜性。 研究表明,組蛋白精氨酸甲基化是一種相對(duì)動(dòng)態(tài)的標(biāo)記,精氨酸甲基化與基因激活相關(guān),而H3和H4精氨酸的甲基化丟失與
6、基因沉默相關(guān)。相反,賴(lài)氨酸甲基化似乎是基因表達(dá)調(diào)控中一種較為穩(wěn)定的標(biāo)記。組蛋白甲基化的調(diào)節(jié)機(jī)制1. H3-K9甲基化與異染色質(zhì)的形成:人們?cè)槍?duì)異染色質(zhì)的形成提出過(guò)一個(gè)模型:首先組蛋白脫乙酰酶使H3中的K9、K14脫乙酰化,然后Suv39h1或Clr4對(duì)H32K9進(jìn)行甲基化,H32K9的甲基化再影響DNA的甲基化,隨后甲基化的H32K9做為一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)招募HP1或Swi6蛋白的定位,最后HP1/Swi6通過(guò)它們的shadow染色質(zhì)結(jié)合區(qū)域定位在C末端,進(jìn)而形成異染色質(zhì)的多聚體。2. H32K9甲基化對(duì)常染色體中基因表達(dá)調(diào)控的影響:3. 組蛋白其他位點(diǎn)上發(fā)生甲基化與基因表達(dá)的關(guān)系:大量實(shí)驗(yàn)表明H
7、32K9甲基化的功能與基因沉默有關(guān),但其它位點(diǎn)甲基化可能存在激活轉(zhuǎn)錄作用。4. 組蛋白甲基化與DNA甲基化:H32K9的甲基化可以直接或間接影響DNA 的甲基化,DNA甲基化可能是組蛋白甲基化的間接結(jié)果組蛋白修飾的生物學(xué)意義尤其是組蛋白乙?;?、甲基化修飾能為相關(guān)調(diào)控蛋白提供其在組蛋白上的附著位點(diǎn),改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)和活性。一般來(lái)說(shuō),組蛋白乙酰化能選擇性的使某些染色質(zhì)區(qū)域的結(jié)構(gòu)從緊密變得松散,開(kāi)放某些基因的轉(zhuǎn)錄,增強(qiáng)其表達(dá)水平。而組蛋白甲基化既可抑制也可增強(qiáng)基因表達(dá)。乙?;揎椇图谆揎椡窍嗷ヅ懦獾?。在細(xì)胞有絲分裂和凋亡過(guò)程中,磷酸化修飾能調(diào)控蛋白質(zhì)復(fù)合體向染色質(zhì)集結(jié)。有絲分裂過(guò)程也與特異性組蛋白修飾有顯著的相關(guān)性。在有絲分裂過(guò)程中,有數(shù)個(gè)組蛋白磷酸化反應(yīng),其中大多數(shù)由Aurora B激酶催化。特異性組蛋白修飾可在有絲分裂的不同階段檢測(cè)到,在細(xì)胞核分裂中發(fā)揮多種功能。組蛋白修飾還參與DNA損傷和凋亡。在凋亡的級(jí)聯(lián)反應(yīng)中,激酶(包括CHK1和CHK2)的主
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