生物信息學題kegg簡介

1、KEGGKEGG(KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes組信在GENES數(shù)據(jù)庫 里，包括完整和部的PATHWAYLIGAND，包含關(guān)于化學物質(zhì)、酶分子、酶反應(yīng)等信息。可以免費獲取。KEGG(pathway)查詢十分出色，包括碳水化合物、核且對催化各步反應(yīng)的酶進行 了全面的注解，包含有氨基酸序列、PDB 庫的等等。KEGGKEGGKEGGKECC（組及代謝途徑數(shù)據(jù)庫組19955KEGGKEGG的功能進行系統(tǒng)化的分析。KEGGKEGGKEGG(KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes組信在GENES數(shù)據(jù)庫 里，包括完整和部的

2、PATHWAYLIGAND，包含關(guān)于化學物質(zhì)、酶分子、酶反應(yīng)等信息?？梢悦赓M獲取。KEGG(pathway)查詢十分出色，包括碳水化合物、核且對催化各步反應(yīng)的酶進行 了全面的注解，包含有氨基酸序列、PDB 庫的等等。KEGGKEGGKEGGKECC（組及代謝途徑數(shù)據(jù)庫組19955KEGGKEGG的功能進行系統(tǒng)化的分析。KEGG組至細胞層次做in silicoKEGGKEGG。下，它可以對蛋白質(zhì)交互（互動）二、KEGGKEGG 現(xiàn)在由 6 個各自獨立的數(shù)據(jù)庫組成，分別是數(shù)據(jù) 庫database) 、通路數(shù)據(jù)庫(PATHWAY database) 、配體化學反應(yīng)數(shù)據(jù)庫表達數(shù)據(jù)庫)、蛋白數(shù)據(jù)庫(GE

3、NES database)Arabidopsis240943SWISS數(shù)據(jù)庫(GENESdatabase2.通路數(shù)據(jù)庫(PATHWAY了在通路數(shù)據(jù)庫(PATHWAY database)ortholog group最好的，有大約 90 個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或 ECECEC的4519database) 、通路數(shù)據(jù)庫(PATHWAY database) 、配體化學反應(yīng)數(shù)據(jù)庫表達數(shù)據(jù)庫)、蛋白數(shù)據(jù)庫(GENES database)Arabidopsis240943SWISS數(shù)據(jù)庫(GENESdatabase2.通路數(shù)據(jù)庫(PATHWAY了在通路數(shù)據(jù)庫(PATHWAY dat

4、abase)ortholog group最好的，有大約 90 個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或 ECECEC的4519物)中所有組分。KEGG ortholog grope否具備組成一個功能組的完生物體中的 ortholog grope三、KEGGKEGGjavaKEGG數(shù)據(jù)庫(GENESdatabase，。JavaJavaKEGG四、KEGGObject 三、KEGGKEGGjavaKEGG數(shù)據(jù)庫(GENESdatabase，。JavaJavaKEGG四、KEGGObject 5K05032D003362-4map00010br08301 。KEGGReleaseDatab

5、aseObjectIdentifier 1995 KEGG PATHWAY map numberGENESlocus_tag/GeneID ENZYME EC number COMPOUND C numberanismcode/Tnumber REACTION R numberORTHOLOGYKnumber GLYCAN G number RPAIR A number BRITE br numberKEGG DRUG D 2007 KEGG MODULE M KEGG DISEASE H 下面我以一個例子來介紹怎樣使用pathway 在KEGG 上找有關(guān)氨基酸代KEGG DRUG D 2007 KEGG MODULE M KEGG DISEASE H 下面我以一個例子來介紹怎樣使用pathway 在KEGG 上找有關(guān)氨基酸代謝的KEGGPATHWAY,AminoAcidMetabolism，然后找相應(yīng)的Glutamate metabolismPathway entr