酵母雙雜交(自激活)_第1頁
酵母雙雜交(自激活)_第2頁
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文檔簡介

1、酵母雙雜交(自激活)第1頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三真核生物的轉錄因子是由兩個可以分開的、功能上相互獨立的結構域(domain)組成的。一、原理酵母的轉錄激活因子GAL4,在N端有一個由147個氨基酸組成的DNA結合域(DNA binding domain,BD),C端有一個由113個氨基酸組成的轉錄激活域(transcription activation domain,AD)。第2頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三 GAL4分子的BD可以同上游激活序列(upstream activating sequence,UAS)結合。 AD則能激活

2、UAS下游的基因進行轉錄。單獨的BD和AD都不能激活UAS的下游基因,它們之間只有通過某種方式結合在一起才具有完整的轉錄激活功能。第3頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三第4頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三第5頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三His, -gal第6頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三 一般情況下,單獨的 BD 可以與 GAL4 上游活化序列(GAL UAS)結合,但不能引起轉錄。然而,將一段具有轉錄激活活性的轉錄因子基因構建到BD載體上,若其表達產(chǎn)生的 BD 單獨與 UAS 結合也可

3、以引起下游報告基因的轉錄,那么就稱之為酵母雙雜中的自激活現(xiàn)象。反過來,可以利用這種自激活現(xiàn)象來驗證某個轉錄因子是否具有轉錄激活活性。第7頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三His, -gal自激活原理Transcription factorsGAL4BD第8頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三YPDA液體 500ml固體 100ml蛋白胨10g2g酵母提取物5g1g瓊脂2g0.2%ade10ml2ml葡萄糖10g2gYPDA培養(yǎng)基0.2g ade定容至 100ml 0.2%的ade母液pH 6.5 滅菌 121 15min第9頁,共15頁,2022年

4、,5月20日,20點56分,星期三正對照:pGAL4負對照: pBD-GAL4第10頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三將-70下凍存的酵母菌在YPAD平板上劃線,倒置于30培養(yǎng)2-3天。挑取2-4個大菌落(直徑2-3mm)于1.5ml YPAD液體培養(yǎng)基中,劇烈震蕩5min,打散菌落,接種于50ml YPAD液體培養(yǎng)基中(250ml三角瓶),230-250轉/min,30培養(yǎng)18-24hr。取菌液測定其OD600值,需達到1.5。若不到,再培養(yǎng)12hr,若還不到,換單克隆重搖。取50ml菌液于300mlYPAD培養(yǎng)基中(1-2L大三角瓶),30,230rpm,搖培3hr

5、,至 OD600值為0.40.6。4000rpm 5min 于常溫收集菌體,重復一次。室溫下1000g離心5min,去上清,加入50ml 超純水清洗懸浮3次。1000g離心5min,棄上清,用新配的1.5ml 1TE/LiAc重懸細胞,置冰上,即成為酵母感受態(tài)細胞。(只能現(xiàn)做現(xiàn)用,不能貯存,室溫只能放置1-2hr)。酵母菌株感受態(tài)細胞制備:第11頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三 酵母轉化鮭魚精 DNA(20g/l)沸水中煮20min,冰上冷卻10min。加入100l酵母感受態(tài)細胞、12l構建質粒(約200ng)、100g鮭魚精、600l TE-LiAc-PEG,變速渦

6、旋10s1min至混勻。30,200rpm/min,恒溫搖床振蕩30min。加入70l DMSO,溫和顛倒混勻。42水浴熱休克15min,后冰浴10min。常溫下,3000rpm離心10s;棄上清(去干凈),用0.5ml 1TE重懸細胞。( 1TE室溫只能放置12hr)將轉化后的酵母培養(yǎng)于SD/-Trp培養(yǎng)基上,30倒置培養(yǎng)約3-5天,直至出現(xiàn)菌落。第12頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三陽性克隆的篩選: 將在SD/-Trp培養(yǎng)基上長出的酵母菌落轉移到SD/-His培養(yǎng)基上進行篩選。30培養(yǎng)2天,檢查生長情況。 對生長狀態(tài)較好的單克隆進行-半乳糖苷酶活性分析。第13頁,共15頁,2022年,5月20日,20點56分,星期三-半乳糖苷酶活性分析(酵母克隆濾紙顯色分析)取2ml的Z緩沖液/X- gal溶液潤透2張濾紙;小心取一張濾紙覆蓋于生長有轉化子的平皿上,用涂布棒小心趕出氣泡,使濾紙盡可能與酵母菌接觸(1min);用一根針在濾紙上刺個小孔以標記菌落位置,用鑷子輕輕取出濾紙,沾有菌的面朝上置液氮中10s,夾出濾紙,室溫解凍;重復3次;沾有菌的面朝上,緊貼于預先用Z緩沖液/X-gal溶液潤透過的那張濾紙上,同時吸掉多余的Z緩沖液/X-g

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