人類群體遺傳學(xué)第一講課件

s/s中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究胱研究生課程人類群體遺傳學(xué)人類群體遺傳學(xué)基本原理和分析方法徐書(shū)華金力◎中科院馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所s/s中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究胱研究生課程人類群體遺傳學(xué)1008-2009學(xué)年第二學(xué)期《人類群體遺傳學(xué)分析方法》課程表上課時(shí)間:每周四上午10:00-11:50上課地點(diǎn):中科大廈4樓403室第7教室果程內(nèi)容授課教師Hardy2Weinberg衡檢驗(yàn)原理及其應(yīng)用徐書(shū)華遺傳多態(tài)性統(tǒng)計(jì)最3月12日進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建方法及應(yīng)用徐書(shū)華3月19日cale原理及應(yīng)用李海鹍53月26日遺傳漂變效應(yīng)及有效群體大小的估計(jì)徐書(shū)華64月2目人群遺傳結(jié)構(gòu)分析(I徐書(shū)華4月9口單倍型估計(jì)及連鎖不平衡分析徐書(shū)華4月16日基因組中的連鎖不平衡模式及標(biāo)簽位點(diǎn)的選擇5月14日某因表達(dá)數(shù)據(jù)的分析方法135月21日人群史的遺傳學(xué)研究徐書(shū)華5月28日端午節(jié)6月4日法醫(yī)學(xué)檢測(cè)及分析方6月11日自然選擇檢驗(yàn)原理和方法徐書(shū)華6月18日全基因組基因型數(shù)據(jù)正選擇檢驗(yàn)方法徐書(shū)華6月25日課程考試教育某地008-2009學(xué)年第二學(xué)期《人類群體遺傳學(xué)分析方法》課程表2第一講Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)及其應(yīng)用Hardy-WeinbergEquilibrium(HWE定律HWE的偏離(固定指數(shù))HWE的偏離(Wahlund定律)HWE在單基因遺傳疾病研究中的應(yīng)用HWE在多基因復(fù)雜疾病研究中的應(yīng)用檢驗(yàn)HWE的常用方法和軟件全基因組數(shù)據(jù)中的HWE檢驗(yàn)問(wèn)題第一講3WhydostudentsneedtoknowHardy-WeinbergEquilibrium?AsThomasMerten(1992)states:Ifyouhaveeverbeenaskedquestionssuchastheonesthatfollow,youbegintowhystudyingpopulationgeneticsmightbeuseful1Imconfused!howcanobethemostcommonofthebloodtypesifitisarecessivetrait?2.IfHuntington'sdiseaseisadominanttrait,shouldrthree-fourthsofthepopulationhaveHuntington'swhileone-fourthhavethenormalphenotype?3.Shouldn'trecessivetraitsbegradually'swampedoutfromtheWhydostudentsneedtoknow4基本概念>突變(mutation)>遺傳多態(tài)性(geneticpolymorphism)遺傳座位(locus)位基因(allele)>核苷酸位點(diǎn)(nucleotide)序列(sequence)位點(diǎn)(ste)分離位點(diǎn)(segregatingsite)基本概念5人類群體遺傳學(xué)第一講課件6人類群體遺傳學(xué)第一講課件7人類群體遺傳學(xué)第一講課件8人類群體遺傳學(xué)第一講課件9人類群體遺傳學(xué)第一講課件10人類群體遺傳學(xué)第一講課件11人類群體遺傳學(xué)第一講課件12人類群體遺傳學(xué)第一講課件13人類群體遺傳學(xué)第一講課件14人類群體遺傳學(xué)第一講課件15人類群體遺傳學(xué)第一講課件16人類群體遺傳學(xué)第一講課件17人類群體遺傳學(xué)第一講課件18人類群體遺傳學(xué)第一講課件19人類群體遺傳學(xué)第一講課件20人類群體遺傳學(xué)第一講課件21人類群體遺傳學(xué)第一講課件22人類群體遺傳學(xué)第一講課件23人類群體遺傳學(xué)第一講課件24人類群體遺傳學(xué)第一講課件25人類群體遺傳學(xué)第一講課件26人類群體遺傳學(xué)第一講課件27人類群體遺傳學(xué)第一講課件28人類群體遺傳學(xué)第一講課件29人類群體遺傳學(xué)第一講課件30人類群體遺傳學(xué)第一講課件31人類群體遺傳學(xué)第一講課件32人類群體遺傳學(xué)第一講課件33人類群體遺傳學(xué)第一講課件34人類群體遺傳學(xué)第一講課件35人類群體遺傳學(xué)第一講課件36人類群體遺傳學(xué)第一講課件37人類群體遺傳學(xué)第一講課件38人類群體遺傳學(xué)第一講課件39人類群體遺傳學(xué)第一講課件40人類群體遺傳學(xué)第一講課件41人類群體遺傳學(xué)第一講課件42人類群體遺傳學(xué)第一講課件43人類群體遺傳學(xué)第一講課件44人類群體遺傳學(xué)第一講課件45人類群體遺傳學(xué)第一講課件46人類群體遺傳學(xué)第一講課件47s/s中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究胱研究生課程人類群體遺傳學(xué)人類群體遺傳學(xué)基本原理和分析方法徐書(shū)華金力◎中科院馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所s/s中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究胱研究生課程人類群體遺傳學(xué)48008-2009學(xué)年第二學(xué)期《人類群體遺傳學(xué)分析方法》課程表上課時(shí)間:每周四上午10:00-11:50上課地點(diǎn):中科大廈4樓403室第7教室果程內(nèi)容授課教師Hardy2Weinberg衡檢驗(yàn)原理及其應(yīng)用徐書(shū)華遺傳多態(tài)性統(tǒng)計(jì)最3月12日進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建方法及應(yīng)用徐書(shū)華3月19日cale原理及應(yīng)用李海鹍53月26日遺傳漂變效應(yīng)及有效群體大小的估計(jì)徐書(shū)華64月2目人群遺傳結(jié)構(gòu)分析(I徐書(shū)華4月9口單倍型估計(jì)及連鎖不平衡分析徐書(shū)華4月16日基因組中的連鎖不平衡模式及標(biāo)簽位點(diǎn)的選擇5月14日某因表達(dá)數(shù)據(jù)的分析方法135月21日人群史的遺傳學(xué)研究徐書(shū)華5月28日端午節(jié)6月4日法醫(yī)學(xué)檢測(cè)及分析方6月11日自然選擇檢驗(yàn)原理和方法徐書(shū)華6月18日全基因組基因型數(shù)據(jù)正選擇檢驗(yàn)方法徐書(shū)華6月25日課程考試教育某地008-2009學(xué)年第二學(xué)期《人類群體遺傳學(xué)分析方法》課程表49第一講Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)及其應(yīng)用Hardy-WeinbergEquilibrium(HWE定律HWE的偏離(固定指數(shù))HWE的偏離(Wahlund定律)HWE在單基因遺傳疾病研究中的應(yīng)用HWE在多基因復(fù)雜疾病研究中的應(yīng)用檢驗(yàn)HWE的常用方法和軟件全基因組數(shù)據(jù)中的HWE檢驗(yàn)問(wèn)題第一講50WhydostudentsneedtoknowHardy-WeinbergEquilibrium?AsThomasMerten(1992)states:Ifyouhaveeverbeenaskedquestionssuchastheonesthatfollow,youbegintowhystudyingpopulationgeneticsmightbeuseful1Imconfused!howcanobethemostcommonofthebloodtypesifitisarecessivetrait?2.IfHuntington'sdiseaseisadominanttrait,shouldrthree-fourthsofthepopulationhaveHuntington'swhileone-fourthhavethenormalphenotype?3.Shouldn'trecessivetraitsbegradually'swampedoutfromtheWhydostudentsneedtoknow51基本概念>突變(mutation)>遺傳多態(tài)性(geneticpolymorphism)遺傳座位(locus)位基因(allele)>核苷酸位點(diǎn)(nucleotide)序列(sequence)位點(diǎn)(ste)分離位點(diǎn)(segregatingsite)基本概念52人類群體遺傳學(xué)第一講課件53人類群體遺傳學(xué)第一講課件54人類群體遺傳學(xué)第一講課件55人類群體遺傳學(xué)第一講課件56人類群體遺傳學(xué)第一講課件57人類群體遺傳學(xué)第一講課件58人類群體遺傳學(xué)第一講課件59人類群體遺傳學(xué)第一講課件60人類群體遺傳學(xué)第一講課件61人類群體遺傳學(xué)第一講課件62人類群體遺傳學(xué)第一講課件63人類群體遺傳學(xué)第一講課件64人類群體遺傳學(xué)第一講課件65人類群體遺傳學(xué)第一講課件66人類群體遺傳學(xué)第一講課件67人類群體遺傳學(xué)第一講課件68人類群體遺傳學(xué)第一講課件69人類群體遺傳學(xué)第一講課件70人類群體遺傳學(xué)第一講課件71人類群體遺傳學(xué)第一講課件72人類群體遺傳學(xué)第一講課件73人類群體遺傳學(xué)第一講課件74人類群體遺傳學(xué)第一講課件75人類群體遺傳學(xué)第一講課件76人類群體遺傳學(xué)第一講課件77人類群體遺傳學(xué)第一講課件78人類群體遺傳學(xué)第一講課件79人類群體遺傳學(xué)第一講課件80人類群體遺傳學(xué)第一講課件81人類