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臨床分子生物學(xué)檢——11級(jí)醫(yī)3分子生物學(xué):是利用分子生物學(xué)理論與技術(shù) ★表觀遺傳geneticsDNA(DNAmethylation生物體在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyltransferase,DNMT)S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl臨床分子生物學(xué)檢——11級(jí)醫(yī)3分子生物學(xué):是利用分子生物學(xué)理論與技術(shù) ★表觀遺傳geneticsDNA(DNAmethylation生物體在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyltransferase,DNMT)S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)為甲基供體,將甲★突變:是指DNA序列的改變或重排。從突變的尺度和性質(zhì)分突變組突變結(jié)構(gòu)的改變突變的突變★組:一個(gè)細(xì)胞或一種生物體的整套遺傳物質(zhì),包和非編碼DNADNA原核生物(prokaryote)是細(xì)菌、支原體、衣原體、立克次體、螺旋體、放線菌和藍(lán)綠★質(zhì)粒:細(xì)菌下質(zhì)粒的不兼容性利用同系統(tǒng)的質(zhì)粒(FColEI)(omptibility串聯(lián)重復(fù)序列:人組中10~15序列(重復(fù)序列)DNADNAE5~E6bp小DNA:可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù),10~100bp*幾十或幾百或幾千=1~5kb的重復(fù)序列★循環(huán)核酸:是存在RNA體液中細(xì)胞外游離狀態(tài)的核酸,包括游離循環(huán)DNA多態(tài)性DNADNA核酸分子雜交技術(shù)探針與核酸分子雜交特異性識(shí)別靶DNA或RNA以檢測(cè)靶序列的一★變性(denaturation):在某些理DNADNA(renaturation:螺旋結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象,它是變性的一種逆轉(zhuǎn)過(guò)程。temperaturem50%DNA★分子雜交(molecularhybridization):★核酸探針(nucleicacidprobe):是特定核苷酸序列(單鏈,被標(biāo)記)與靶序列發(fā)生特cDNA針mRNADNARNAFISH引物:是★實(shí)時(shí)定量★核酸探針(nucleicacidprobe):是特定核苷酸序列(單鏈,被標(biāo)記)與靶序列發(fā)生特cDNA針mRNADNARNAFISH引物:是★實(shí)時(shí)定量PCR:在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)累積實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR★聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainR)(意位置上,一般熒光域值的設(shè)置是基線(背景)熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。Ct值:PCR擴(kuò)增過(guò)程中,擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)過(guò)的擴(kuò)增循環(huán)次數(shù)★熒光定量PCR(FQ-PCR)基于熒光能量傳遞技術(shù)(FluorescenceresonanceenergytransferFRET),通過(guò)受體發(fā)色團(tuán)之間偶極-偶極相互作用,能量從供體發(fā)色團(tuán)轉(zhuǎn)移到受體發(fā)色團(tuán),效率與兩個(gè)發(fā)色團(tuán)之間距離的6DNAPCR★生技術(shù)是指通過(guò)微加工和微電子技術(shù)在固相基質(zhì)表面集成了成千上萬(wàn)密集排列檢測(cè)的技術(shù)★蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics:以蛋白質(zhì)組★雙向凝膠電泳(two-DE:SDS聚丙烯凝膠電泳(SDS)組成的分離系統(tǒng)。IEF是基于蛋白質(zhì)等電點(diǎn)(pI)的差異進(jìn)行分離,SDS則是根據(jù)蛋白質(zhì)分子量(Mw)的不同進(jìn)行分離。生物信息學(xué)(bioinformatics):包含生物信息的獲取、處理、貯存、分發(fā)、分析和一級(jí)數(shù)數(shù)據(jù)都直接來(lái)源于實(shí)驗(yàn)獲得的二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù):由核酸和蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)、生物大分子三位空間結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)ORF:(TG3(GAAGAA間策略基于遺傳標(biāo)記與致。mtDNA★異質(zhì)性變異mtDNA發(fā)生了某一變異,異質(zhì)性變異的程度往往★動(dòng)態(tài)突變(Dynamic):不穩(wěn)定三核苷酸重復(fù)序列其突變是由 組中脫氧三核苷酸串無(wú)創(chuàng)產(chǎn) ?!锼幗M學(xué)指以藥物效應(yīng)和安全性為目標(biāo)藥代和藥效差異 特性以PGD:胚胎間策略基于遺傳標(biāo)記與致。mtDNA★異質(zhì)性變異mtDNA發(fā)生了某一變異,異質(zhì)性變異的程度往往★動(dòng)態(tài)突變(Dynamic):不穩(wěn)定三核苷酸重復(fù)序列其突變是由 組中脫氧三核苷酸串無(wú)創(chuàng)產(chǎn) ?!锼幗M學(xué)指以藥物效應(yīng)和安全性為目標(biāo)藥代和藥效差異 特性以PGD:胚胎與導(dǎo)斷某些 遺傳病★原核生組特組較真核小4.6E6bp :RNA和支架蛋白 :雙鏈閉環(huán)超螺旋。原核生物的mRNA :無(wú)內(nèi)含子 。 DNA★組特 組中非編碼序列少編碼>90%(組 之間無(wú)間隔區(qū).mRNA5’端無(wú)帽子結(jié)構(gòu).★人組的特PCR:使用兩對(duì)引物,一對(duì)引物序列在模板的外側(cè),用于擴(kuò)增含目的的大片段,另一對(duì)引物序列在模板內(nèi)側(cè),用于擴(kuò)增目的PCRPCRPCR★YMDD突變:YMDD代表四個(gè)氨基酸殘基,即酪氨酸-蛋氨酸-天門(mén)冬氨酸-天門(mén)冬氨酸,其中★完整性檢出策略夠出帶菌者和潛在染者,并能對(duì)進(jìn)行拷貝數(shù)測(cè)定、分型檢測(cè)及亞型和耐藥 +97%DNA(轉(zhuǎn)座因子和大量不屬于已知分類(lèi)序列 串聯(lián)重復(fù)序列|組中10~15%序列(重復(fù)序列DNA首尾相連多次重復(fù),長(zhǎng)度可達(dá)到E5~E6bp,為高度重復(fù)序列,又稱(chēng)微 +97%DNA(轉(zhuǎn)座因子和大量不屬于已知分類(lèi)序列 串聯(lián)重復(fù)序列|組中10~15%序列(重復(fù)序列DNA首尾相連多次重復(fù),長(zhǎng)度可達(dá)到E5~E6bp,為高度重復(fù)序列,又稱(chēng)微 element,SINE)LTRpolyApolyA 第二種為L(zhǎng)TR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(LTR- ons),也稱(chēng)為反轉(zhuǎn)樣元件-like DNA轉(zhuǎn)座子(DNA Tm的影:DNApH核酸探針的種DNA方法 聚合酶鏈反應(yīng) 特點(diǎn)克隆在載體中的RNA而言,DNA探針不易降解,表 RNA酶的影響, RNARNA探針與靶序列的雜交效率較高,RNA分子大多以單鏈形式存在,RNA分子中不存在高度重復(fù)序列,非特異性雜交少,雜交后未雜交的探針?lè)肿涌捎肦NA酶水解去除,本底的干擾低。RNA探針有易降解和標(biāo)記方法復(fù)雜等缺點(diǎn), 特點(diǎn)探針長(zhǎng)度較短(一般為 由于探針的長(zhǎng)度較短,特異性較低,,但經(jīng)過(guò)精心設(shè)計(jì)仍可★核酸分子雜交技術(shù)類(lèi)DNA特點(diǎn)探針長(zhǎng)度較短(一般為 由于探針的長(zhǎng)度較短,特異性較低,,但經(jīng)過(guò)精心設(shè)計(jì)仍可★核酸分子雜交技術(shù)類(lèi)DNARNASouthernDNANorthernRNADNARNADNA變性→中和→Southern、Northern印跡雜交Southern印跡雜交比較RNARNASouthernRNARNA2’-RNA分子形成發(fā)夾式的二級(jí)結(jié)構(gòu),以保持其單鏈線形★PCR術(shù)原 的過(guò)程,在DNA模板、引物、四種dNTP存在下,DNA聚合酶的聚合反應(yīng),由變性、退火、延伸三個(gè)步驟組成。每一個(gè)循環(huán)完成后DNA成為兩個(gè)分子。由于每個(gè)循環(huán)所生成的 段即為下一個(gè)★Southern印跡雜交原理及應(yīng)是膜上檢測(cè)DNA的雜交技術(shù),是進(jìn)行 瓊脂凝膠電泳分離經(jīng)限制性?xún)?nèi)切酶消化的DN 段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈 構(gòu)的標(biāo)記探針進(jìn)行雜交,用放射自顯影或酶反應(yīng)顯色,從而檢測(cè)特定DNA分子的含量。主 環(huán)的模板,反應(yīng)產(chǎn)物移植術(shù)形式增長(zhǎng)。N=期前特異性好。30個(gè)循環(huán)最多擴(kuò)增條1.PCR變性溫度:95℃~97DNATmTm5PCR擴(kuò)增特異環(huán)的模板,反應(yīng)產(chǎn)物移植術(shù)形式增長(zhǎng)。N=期前特異性好。30個(gè)循環(huán)最多擴(kuò)增條1.PCR變性溫度:95℃~97DNATmTm5PCR擴(kuò)增特異72TaqDNA2.PCR30725min3.PCR產(chǎn)物的保存與檢測(cè):PCR4℃保存,PCRPCR技術(shù)PCR(PCRDNARNA★三大核酸數(shù)據(jù) : EMBL(Europeanmolecularbiologicallaboratory) EBI(歐洲分子生物學(xué)SRS,提交通過(guò)WEBIN或sequin) (theNationalInstituteofGenetics,NIG)年建立也是一個(gè)全面的核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)與GenB 和EMBL數(shù)據(jù)庫(kù)合作檢索通過(guò)SRS,提交通過(guò)sequin。蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)★請(qǐng)分析PCR擴(kuò)增體系 (個(gè)人意見(jiàn),另一份有詳細(xì)的 自80~90℃的水棲嗜熱菌中提取的耐熱酶。④dNTP:包括dATP、dTTP、dGTP、dCTP。dNTP會(huì)絡(luò)合Mg離子,當(dāng)PCR需要較高濃度的dNTP時(shí),應(yīng)在反應(yīng)體系中適當(dāng)增加Mg離子濃度。 最大的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)是UniProt:整合了SWISS-PROT 和TrEMBL和PIR-PSD(蛋白質(zhì)信息資源庫(kù)-公共蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù))SWISS-PROT:人工審閱嚴(yán)格,每個(gè)條目包含條基本信息、分類(lèi)信息(描述蛋白質(zhì)的生物來(lái)源)冗余度低。包括蛋白質(zhì)的功能、翻譯后修飾、結(jié)構(gòu)域和結(jié)合位點(diǎn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、四級(jí)結(jié)構(gòu)、 最大的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)是UniProt:整合了SWISS-PROT 和TrEMBL和PIR-PSD(蛋白質(zhì)信息資源庫(kù)-公共蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù))SWISS-PROT:人工審閱嚴(yán)格,每個(gè)條目包含條基本信息、分類(lèi)信息(描述蛋白質(zhì)的生物來(lái)源)冗余度低。包括蛋白質(zhì)的功能、翻譯后修飾、結(jié)構(gòu)域和結(jié)合位點(diǎn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、四級(jí)結(jié)構(gòu)、 TrEMBLEMBL庫(kù)中的核酸序列翻譯出的氨基酸序列;PIR -PSD蛋白質(zhì)信息資源-國(guó)際蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)Information ernationalProteinR-PSD)(MedlinePDBTIGR等PIR-PSD的另一個(gè)重要特征是其對(duì)蛋白質(zhì)超 PDB的策技術(shù):PCR+PCR 存在與否做出明確販毒★HBV分子生物學(xué)檢驗(yàn)、PCRPCRDNA技術(shù)(DNA(bDNA)的帶有許多側(cè)鏈的HBVDNAFQ-PCR患HBVHBVDNA★HBVYMDD耐藥性突變檢法 PCRTM的分型檢測(cè)方法(可選一兩個(gè)具體描述HIV檢測(cè)的分子生物學(xué)檢HIV抗體檢測(cè)(p24)初篩試驗(yàn):酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)試紙(金標(biāo)試紙,雙抗原夾心法6確認(rèn)試驗(yàn):免疫印跡(WesternblotHIVRNA結(jié)核分枝桿TB分子生物學(xué)檢驗(yàn)方1.HIV檢測(cè)的分子生物學(xué)檢HIV抗體檢測(cè)(p24)初篩試驗(yàn):酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)試紙(金標(biāo)試紙,雙抗原夾心法6確認(rèn)試驗(yàn):免疫印跡(WesternblotHIVRNA結(jié)核分枝桿TB分子生物學(xué)檢驗(yàn)方1.TBDNAPCR擴(kuò)增所選靶序列65kD、MPB、、 DNA★2.TB耐藥 β基)或缺失。RNA 對(duì)異煙肼:過(guò)氧化氫酶Kat rrs 因(16srRNA)拓?fù)洚悩?gòu)酶(少見(jiàn))gyrA和編碼DNA回旋酶 TB: 補(bǔ):分 不外乎 雜 CFP10( ESAT6(6kD性抗原靶 方法:時(shí)間分辨熒光免疫分析時(shí)間延遲 Tr★病例分析(12分問(wèn)答題模板,可能會(huì)換個(gè)疾病也可能不換解答重點(diǎn)1.①根據(jù)病情分析可能是發(fā)生了耐藥②青霉素結(jié)合蛋白(PBPs)重要的外膜青霉素主要PBPs作用PBPs。主要有penA、,在較長(zhǎng)時(shí)間使用青霉治療可能使得這發(fā)1.①根據(jù)病情分析可能是發(fā)生了耐藥②青霉素結(jié)合蛋白(PBPs)重要的外膜青霉素主要PBPs作用PBPs。主要有penA、,在較長(zhǎng)時(shí)間使用青霉治療可能使得這發(fā)生突變,從而導(dǎo)PBPs結(jié)構(gòu)的改變 奈瑟菌耐藥檢測(cè)的分子生物學(xué)技術(shù):詳細(xì)描述1檢查為×××,疑為結(jié)核分枝桿解答重點(diǎn)方法列舉:PCR、real-timePCR、PCR-RFLP、線性探針雜交real-timePCR等1.提取該患者外周抗凝血中的2.庫(kù)中獲取結(jié)核分枝桿菌16S 的序列,利用軟件設(shè)計(jì)一QRreal-timePCR擴(kuò)增6S 上的特異片線粒組的特點(diǎn):因組小,16569bpDNA組與耳mtDNA的A1555GmtDNAPCR-RFLPDHPLC RFLPDHPLC★線粒DNA突變A3243G析,充分確認(rèn)了該位點(diǎn)的存在。為異質(zhì)性突變不同人突變比例不同 方法:PCR技術(shù)、DHPLC技術(shù)、PCR-RFLP技術(shù)、分怎么檢測(cè)線DNA異質(zhì)性edNext-generationPyrosequencingTM倒位(Inver 或缺失(Indels)缺失或重復(fù)(Deletion/Duplication 的突變,直接揭示導(dǎo)致遺傳病發(fā)生的各種遺傳缺陷 融直策略(接檢出致對(duì)(AA對(duì)(ASO特異性RFLP、PCR-ELISA、DHPLCSSCPPyrosequencingTM倒位(Inver 或缺失(Indels)缺失或重復(fù)(Deletion/Duplication 的突變,直接揭示導(dǎo)致遺傳病發(fā)生的各種遺傳缺陷 融直策略(接檢出致對(duì)(AA對(duì)(ASO特異性RFLP、PCR-ELISA、DHPLCSSCP SouthernblotPCR★⑵動(dòng)態(tài)突變:outhernblot、Β珠蛋白生 性貧血及Ββ11 (掌握其中一個(gè)技術(shù)的原理 (反向點(diǎn)雜交)βα地中海貧血PCRsouthern印跡技術(shù):BRCA的檢測(cè)-分子影像學(xué):-HER2表達(dá)-胚胎植入前的分子生物學(xué)檢驗(yàn)PCR技術(shù)(PCR(熟悉原理及應(yīng)用。往屆考的名解和簡(jiǎn)答范圍名解和簡(jiǎn)答是關(guān)于老上課講的,講的少或沒(méi)講的沒(méi)有整理,有時(shí)間自己可以熟悉下05年級(jí)分子生物學(xué)檢驗(yàn)PCR、2-DEYMDD因的獲取方式、質(zhì)粒載體的特點(diǎn)、PCR06年級(jí)分子生物學(xué)檢驗(yàn)名解:T-載體、分子雜交(
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