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文檔簡介
腫瘤的分子生物學(xué)檢驗?zāi)[瘤的分子生物學(xué)檢驗1腫瘤的分子生物學(xué)檢驗?zāi)[瘤的分子生物學(xué)檢驗?zāi)[瘤標(biāo)志物的研究歷史第1階段(19631978)癌胚性抗原1963年AbelevAFP1965年Gold&FreemanCEA第2階段(19791989)糖鏈抗原為主1980年KoprowskiCA199(1116NS199)1981年BastCA125(OC125)第3階段(1990以后)基因標(biāo)志腫瘤基因標(biāo)志腫瘤標(biāo)志物的研究歷史第1階段(19631978)癌胚性抗原一、原癌基因(oncogene,onc)及其表達(dá)產(chǎn)物的作用
1、定義
原癌基因是指人類或其他動物細(xì)胞(以及致癌病毒)固有的一類基因,能誘導(dǎo)細(xì)胞正常轉(zhuǎn)化并使之獲得新生物特征的基因總稱。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。一、原癌基因(oncogene,onc)及其表達(dá)產(chǎn)物的作用
2、特點:
(1)v-onc是病毒基因組中特殊的核苷酸序列,能
引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化
(2)c-onc是存在于正常細(xì)胞基因組中的癌基因,
在正常情況下處于靜止或低表達(dá)的狀態(tài),不
僅對細(xì)胞無害,而且對維持細(xì)胞正常功能具
有重要作用,但在異常表達(dá)時,其產(chǎn)物可使
細(xì)胞無限制分裂
2、特點:
(1)v-onc是病毒基因組中特殊的核苷酸序列,細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相細(xì)胞癌基因的作用
通過其表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)來體現(xiàn)的,負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。細(xì)胞癌基因的作用
通過其表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)來體現(xiàn)的,負(fù)責(zé)調(diào)控正常二、癌基因定義:原癌基因在進(jìn)化上高度保守,負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因二、癌基因負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplification)
某些癌基因通過一些機(jī)制在原來的染色體上復(fù)制多個拷貝,超出了正常細(xì)胞的癌基因劑量,導(dǎo)致基因產(chǎn)物的增加,從而使細(xì)胞正常功能紊亂
例如
人視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤Nmyc擴(kuò)增了10200倍,相應(yīng)的mRNA和蛋白質(zhì)產(chǎn)物也都大量增加正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止向丟失p53等位基因的腫瘤細(xì)胞中導(dǎo)入野生型p53就會使腫瘤細(xì)胞凋亡染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生2、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)分析
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—限制性片段長度多態(tài)(PCR—RFLP)分析技術(shù)是在PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的。原癌基因MW腫瘤一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同將PCR產(chǎn)物在含有梯度濃度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中進(jìn)行分離,當(dāng)泳動至變性劑相應(yīng)濃度的位置時,產(chǎn)物片段中Tm值較低一端的雙鏈被部分變性而解鏈,這種部分解鏈的構(gòu)象致使該片段的電泳遷移率大大降低。5、SouthernBlot正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止三、原癌基因的激活機(jī)制
原癌基因具有正常的生理功能,被激活時又具有致癌能力,因此研究原癌基因如何被激活是很重要的。
現(xiàn)已證實
射線輻射
化學(xué)致癌劑
病毒感染
負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最三、原癌基因的激活機(jī)(一)原癌基因點突變(pointmutation)
癌基因在編碼順序的特定位置上的某一個核苷酸發(fā)生突變,使其表達(dá)蛋白質(zhì)中相應(yīng)的氨基酸發(fā)生變化,從而獲得了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的活性mutation(一)原癌基因點突變(pointmutation)
(二)原癌基因獲得外源啟動子而激活
腫瘤細(xì)胞中原癌基因的表達(dá)水平可以其轉(zhuǎn)錄的mRNA或翻譯產(chǎn)物蛋白質(zhì)的含量來表示
在原癌基因的上游插入外源性啟動子或增強(qiáng)子可激活原癌基因,使其表達(dá)產(chǎn)物增多
病毒的增強(qiáng)子常位于5’端的長末端重復(fù)序列(1ongterminalrepeat,LTR)內(nèi)。如果增強(qiáng)子插入到原癌基因的附近或遠(yuǎn)處,均使之激活,促使癌基因的表達(dá)比正常表達(dá)增高幾十甚至上百倍
(二)原癌基因獲得外源啟動子而激活
腫瘤細(xì)胞中原癌基(三)原癌基因甲基化程度降低而激活
DNA分子中的甲基化(methylation)對阻抑基因的轉(zhuǎn)錄具有重要作用(三)原癌基因甲基化程度降低而激活
現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲基化水平比其鄰近的正常細(xì)胞明顯偏低,提示某些原癌基因是由于甲基化程度降低而激活現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplification)
某些癌基因通過一些機(jī)制在原來的染色體上復(fù)制多個拷貝,超出了正常細(xì)胞的癌基因劑量,導(dǎo)致基因產(chǎn)物的增加,從而使細(xì)胞正常功能紊亂
例如
人視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤Nmyc擴(kuò)增了10200倍,相應(yīng)的mRNA和蛋白質(zhì)產(chǎn)物也都大量增加(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplif(五)基因易位或重排使原癌基因激活
基因易位(translocation)
基因重排(rearrangemant)
有些癌基因從其染色體的正常位置轉(zhuǎn)移到另一染色體的某個位置,由于調(diào)控環(huán)境發(fā)生變化,導(dǎo)致從相對靜止?fàn)顟B(tài)變成激活狀態(tài),使原癌基因表達(dá)產(chǎn)物顯著增加而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生
(五)基因易位或重排使原癌基因激活
基因易位(t根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。第2階段(19791989)糖鏈抗原為主四、抑癌基因
抑癌基因(suppressergene)又稱抗癌基因(antionc),是存在于正常細(xì)胞內(nèi)的一類可抑制細(xì)胞生長的基因,并有潛在抑癌作用。(2)p53基因
★特點17p13,11個外顯子,10個內(nèi)含子
★編碼393個氨基酸,p53染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。單鏈DNA分子具有特定的二級空間構(gòu)象,取決于該分子本身的堿基組成(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失。現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲基化水平比其鄰近的正常細(xì)胞明顯偏低,提示某些原癌基因是由于甲基化程度降低而激活抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,當(dāng)這類基因發(fā)生突變、缺失或失活時,可引起細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生5、SouthernBlot★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因?;顒樱?xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)(一)原癌基因點突變(pointmutation)
癌基因在編碼順序的特定位置上的某一個核苷酸發(fā)生突變,使其表達(dá)蛋白質(zhì)中相應(yīng)的氨基酸發(fā)生變化,從而獲得了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的活性第2階段(19791989)糖鏈抗原為主負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最第1階段(19631978)癌胚性抗原染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生
根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。四、抑癌基因
抑癌基因(suppressergene)又稱抗癌基因(antionc),是存在于正常細(xì)胞內(nèi)的一類可抑制細(xì)胞生長的基因,并有潛在抑癌作用。當(dāng)這類基因發(fā)生突變、缺失或失活時,可引起細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生
四、抑癌基因
抑癌基因(suppresser(一)抑癌基因及其表達(dá)產(chǎn)物
抑癌基因與調(diào)控細(xì)胞分裂和分化過程相關(guān),可能與生長因子、某些蛋白激酶類活性密切相關(guān),只是抑癌基因給予細(xì)胞的信號與原癌基因相反(一)抑癌基因及其表達(dá)產(chǎn)物
抑癌基因與調(diào)控細(xì)胞分裂和(二)抑癌基因失活機(jī)理
1、視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(retinoblastoma,Rb)
(1)特點
★基因組成27個外顯子,317外顯子區(qū)域是基
因重組和突變的熱點
★編碼p105的蛋白質(zhì),其有結(jié)合DNA的活性,
可受多種激酶系統(tǒng)催化而發(fā)生磷酸化(二)抑癌基因失活機(jī)理
1、視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(retinobl
(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失。非磷酸化的Rb可防止細(xì)胞增殖,當(dāng)DNA腫瘤病毒抗原結(jié)合了非磷酸化的Rb時,Rb的活性就受到抑制,使細(xì)胞轉(zhuǎn)化為無限增殖狀態(tài),形成腫瘤
(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p10對于大量來自視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的Rb基因序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)Rb基因完全或部分發(fā)生缺失;另一些Rb腫瘤中,基因完整,但序列分析顯示有一個突變,它常發(fā)生于剪接點上,由于這一變異導(dǎo)致RbmRNA組裝時有外顯子被漏掉,因而產(chǎn)生異常Rb蛋白質(zhì)
對于大量來自視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的Rb基因序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)Rb基
抑癌基因又稱為隱性癌基因
基因1基因2原癌基因MW腫瘤抑癌基因MWMM腫瘤抑癌基因又稱為隱性癌基因(2)p53基因
★特點17p13,11個外顯子,10個內(nèi)含子
★編碼393個氨基酸,p53(2)p53基因
★特點17p13,11個外顯子,10個內(nèi)含★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。
(1)抑制腫瘤細(xì)胞停滯在修復(fù)前期不能進(jìn)入S期復(fù)制DNA而促使細(xì)胞凋亡★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。
(1)抑制腫瘤細(xì)胞停滯在野生型p53的蛋白質(zhì)
p53下調(diào)bcl-2而上調(diào)bax,促進(jìn)細(xì)胞凋亡過程。向丟失p53等位基因的腫瘤細(xì)胞中導(dǎo)入野生型p53就會使腫瘤細(xì)胞凋亡野生型p53的蛋白質(zhì)正常細(xì)胞的生長增殖由兩大基因調(diào)控正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止其發(fā)生終末分化—癌基因負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最后凋亡(apoptosis)—抑癌基因
兩種信號保持著動態(tài)平衡,對正常細(xì)胞的生長、增殖、死亡精確地調(diào)控,當(dāng)平衡被破壞,正調(diào)控信號基因功能過盛或負(fù)調(diào)控信號基因失活,導(dǎo)致細(xì)胞增殖調(diào)控的混亂而使細(xì)胞惡變正常細(xì)胞的生長增殖由兩大基因調(diào)控兩種信號保
原癌基因的激活
1、ras基因的變異
2.myc基因的變異抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,與卵巢癌的發(fā)生也緊密相關(guān)
原癌基因的激活
1、ras基因的變異
2.myc基因的變異五、檢測方法
1、PCR/ASO探針法(PCRallelespecificoligonucleotide)
被檢基因片段經(jīng)PCR擴(kuò)增并經(jīng)電泳分離后轉(zhuǎn)移到膜上,分別與經(jīng)標(biāo)記的野生型和突變型靶基因序列的寡核苷酸探針雜交。由于長度為20個堿基左右的探針中僅1個堿基的差異便會使其Tm值下降5.0~7.5℃,因此通過嚴(yán)格控制雜交條件,可以使PCR產(chǎn)物與完全互補(bǔ)的探針進(jìn)行雜交,也即野生型序列的產(chǎn)物僅與野生型探針雜交,含突變序列的產(chǎn)物僅與突變探針雜交。根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。
五、檢測方法
1、PCR/ASO探針法(PCRalleles第2階段(19791989)糖鏈抗原為主原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。與卵巢癌的發(fā)生也緊密相關(guān)第2階段(19791989)糖鏈抗原為主第1階段(19631978)癌胚性抗原將PCR產(chǎn)物在含有梯度濃度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中進(jìn)行分離,當(dāng)泳動至變性劑相應(yīng)濃度的位置時,產(chǎn)物片段中Tm值較低一端的雙鏈被部分變性而解鏈,這種部分解鏈的構(gòu)象致使該片段的電泳遷移率大大降低。單鏈DNA分子具有特定的二級空間構(gòu)象,取決于該分子本身的堿基組成★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生2、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)分析
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—限制性片段長度多態(tài)(PCR—RFLP)分析技術(shù)是在PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的。DNA堿基置換正好發(fā)生在某種限制性內(nèi)切酶識別位點上,使酶切位點增加或者消失,利用這一酶切性質(zhì)的改變,PCR特異擴(kuò)增包含堿基置換的這段DNA,經(jīng)某一限制酶切割,再利用瓊脂糖凝膠電泳分離酶切產(chǎn)物,與正常比較來確定是否變異。應(yīng)用PCR—RFLP,可檢測某一致病基因已知的點突變,進(jìn)行直接基因診斷,也可以此為遺傳標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析進(jìn)行間接基因診斷。
第2階段(19791989)糖鏈抗原為主2、限制性片段長度多3、PCR-SSCP、測序等單鏈DNA分子具有特定的二級空間構(gòu)象,取決于該分子本身的堿基組成突變DNA的PCR產(chǎn)物經(jīng)變性后產(chǎn)生與正常DNA空間構(gòu)象不同的兩條單鏈在非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳中時,不同構(gòu)象的單鏈片段具有不同的電泳遷移率,從而能區(qū)別正常與突變的DNA3、PCR-SSCP、測序等4、變性梯度凝膠電泳(DGGE)在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。將PCR產(chǎn)物在含有梯度濃度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中進(jìn)行分離,當(dāng)泳動至變性劑相應(yīng)濃度的位置時,產(chǎn)物片段中Tm值較低一端的雙鏈被部分變性而解鏈,這種部分解鏈的構(gòu)象致使該片段的電泳遷移率大大降低。由于野生序列與突變序列的PCR產(chǎn)物片段的Tm不同,它們在電泳過程中被部分解鏈的先后不同,經(jīng)過一定時間的電泳,可以發(fā)現(xiàn)這些產(chǎn)物片段在凝膠中所處的位置也不同,據(jù)此,可以區(qū)別野生序列片段還是突變序列片段。4、變性梯度凝膠電泳(DGGE)根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。p53下調(diào)bcl-2而上調(diào)bax,促進(jìn)細(xì)胞凋亡過程。原癌基因MW腫瘤另一些Rb腫瘤中,基因完整,但序列分析顯示有一個突變,它常發(fā)生于剪接點上,由于這一變異導(dǎo)致RbmRNA組裝時有外顯子被漏掉,因而產(chǎn)生異常Rb蛋白質(zhì)基因1基因2根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。正常細(xì)胞的生長增殖由兩大基因調(diào)控(三)原癌基因甲基化程度降低而激活
DNA分子中的甲基化(methylation)對阻抑基因的轉(zhuǎn)錄具有重要作用4、變性梯度凝膠電泳(DGGE)DNA堿基置換正好發(fā)生在某種限制性內(nèi)切酶識別位點上,使酶切位點增加或者消失,利用這一酶切性質(zhì)的改變,PCR特異擴(kuò)增包含堿基置換的這段DNA,經(jīng)某一限制酶切割,再利用瓊脂糖凝膠電泳分離酶切產(chǎn)物,與正常比較來確定是否變異。4、變性梯度凝膠電泳(DGGE)2、特點:
(1)v-onc是病毒基因組中特殊的核苷酸序列,能
引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化
(2)c-onc是存在于正常細(xì)胞基因組中的癌基因,
在正常情況下處于靜止或低表達(dá)的狀態(tài),不
僅對細(xì)胞無害,而且對維持細(xì)胞正常功能具
有重要作用,但在異常表達(dá)時,其產(chǎn)物可使
細(xì)胞無限制分裂(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失。染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生5、Southern
Blot具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補(bǔ)的原則特異性地雜交形成雙鏈。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經(jīng)限制性內(nèi)切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段轉(zhuǎn)移至尼龍膜或其他固相支持物上,經(jīng)干烤或者紫外線照射固定,再與相對應(yīng)結(jié)構(gòu)的標(biāo)記探針進(jìn)行雜交,用放射自顯影或酶反應(yīng)顯色。根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。5、So腫瘤的分子生物學(xué)檢驗?zāi)[瘤的分子生物學(xué)檢驗33腫瘤的分子生物學(xué)檢驗?zāi)[瘤的分子生物學(xué)檢驗?zāi)[瘤標(biāo)志物的研究歷史第1階段(19631978)癌胚性抗原1963年AbelevAFP1965年Gold&FreemanCEA第2階段(19791989)糖鏈抗原為主1980年KoprowskiCA199(1116NS199)1981年BastCA125(OC125)第3階段(1990以后)基因標(biāo)志腫瘤基因標(biāo)志腫瘤標(biāo)志物的研究歷史第1階段(19631978)癌胚性抗原一、原癌基因(oncogene,onc)及其表達(dá)產(chǎn)物的作用
1、定義
原癌基因是指人類或其他動物細(xì)胞(以及致癌病毒)固有的一類基因,能誘導(dǎo)細(xì)胞正常轉(zhuǎn)化并使之獲得新生物特征的基因總稱。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。一、原癌基因(oncogene,onc)及其表達(dá)產(chǎn)物的作用
2、特點:
(1)v-onc是病毒基因組中特殊的核苷酸序列,能
引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化
(2)c-onc是存在于正常細(xì)胞基因組中的癌基因,
在正常情況下處于靜止或低表達(dá)的狀態(tài),不
僅對細(xì)胞無害,而且對維持細(xì)胞正常功能具
有重要作用,但在異常表達(dá)時,其產(chǎn)物可使
細(xì)胞無限制分裂
2、特點:
(1)v-onc是病毒基因組中特殊的核苷酸序列,細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相細(xì)胞癌基因的作用
通過其表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)來體現(xiàn)的,負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。細(xì)胞癌基因的作用
通過其表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)來體現(xiàn)的,負(fù)責(zé)調(diào)控正常二、癌基因定義:原癌基因在進(jìn)化上高度保守,負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因二、癌基因負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplification)
某些癌基因通過一些機(jī)制在原來的染色體上復(fù)制多個拷貝,超出了正常細(xì)胞的癌基因劑量,導(dǎo)致基因產(chǎn)物的增加,從而使細(xì)胞正常功能紊亂
例如
人視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤Nmyc擴(kuò)增了10200倍,相應(yīng)的mRNA和蛋白質(zhì)產(chǎn)物也都大量增加正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止向丟失p53等位基因的腫瘤細(xì)胞中導(dǎo)入野生型p53就會使腫瘤細(xì)胞凋亡染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生2、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)分析
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—限制性片段長度多態(tài)(PCR—RFLP)分析技術(shù)是在PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的。原癌基因MW腫瘤一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同將PCR產(chǎn)物在含有梯度濃度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中進(jìn)行分離,當(dāng)泳動至變性劑相應(yīng)濃度的位置時,產(chǎn)物片段中Tm值較低一端的雙鏈被部分變性而解鏈,這種部分解鏈的構(gòu)象致使該片段的電泳遷移率大大降低。5、SouthernBlot正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。一旦這類基因發(fā)生某些錯誤或功能喪失時,極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止三、原癌基因的激活機(jī)制
原癌基因具有正常的生理功能,被激活時又具有致癌能力,因此研究原癌基因如何被激活是很重要的。
現(xiàn)已證實
射線輻射
化學(xué)致癌劑
病毒感染
負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最三、原癌基因的激活機(jī)(一)原癌基因點突變(pointmutation)
癌基因在編碼順序的特定位置上的某一個核苷酸發(fā)生突變,使其表達(dá)蛋白質(zhì)中相應(yīng)的氨基酸發(fā)生變化,從而獲得了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的活性mutation(一)原癌基因點突變(pointmutation)
(二)原癌基因獲得外源啟動子而激活
腫瘤細(xì)胞中原癌基因的表達(dá)水平可以其轉(zhuǎn)錄的mRNA或翻譯產(chǎn)物蛋白質(zhì)的含量來表示
在原癌基因的上游插入外源性啟動子或增強(qiáng)子可激活原癌基因,使其表達(dá)產(chǎn)物增多
病毒的增強(qiáng)子常位于5’端的長末端重復(fù)序列(1ongterminalrepeat,LTR)內(nèi)。如果增強(qiáng)子插入到原癌基因的附近或遠(yuǎn)處,均使之激活,促使癌基因的表達(dá)比正常表達(dá)增高幾十甚至上百倍
(二)原癌基因獲得外源啟動子而激活
腫瘤細(xì)胞中原癌基(三)原癌基因甲基化程度降低而激活
DNA分子中的甲基化(methylation)對阻抑基因的轉(zhuǎn)錄具有重要作用(三)原癌基因甲基化程度降低而激活
現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲基化水平比其鄰近的正常細(xì)胞明顯偏低,提示某些原癌基因是由于甲基化程度降低而激活現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplification)
某些癌基因通過一些機(jī)制在原來的染色體上復(fù)制多個拷貝,超出了正常細(xì)胞的癌基因劑量,導(dǎo)致基因產(chǎn)物的增加,從而使細(xì)胞正常功能紊亂
例如
人視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤Nmyc擴(kuò)增了10200倍,相應(yīng)的mRNA和蛋白質(zhì)產(chǎn)物也都大量增加(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplif(五)基因易位或重排使原癌基因激活
基因易位(translocation)
基因重排(rearrangemant)
有些癌基因從其染色體的正常位置轉(zhuǎn)移到另一染色體的某個位置,由于調(diào)控環(huán)境發(fā)生變化,導(dǎo)致從相對靜止?fàn)顟B(tài)變成激活狀態(tài),使原癌基因表達(dá)產(chǎn)物顯著增加而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生
(五)基因易位或重排使原癌基因激活
基因易位(t根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。第2階段(19791989)糖鏈抗原為主四、抑癌基因
抑癌基因(suppressergene)又稱抗癌基因(antionc),是存在于正常細(xì)胞內(nèi)的一類可抑制細(xì)胞生長的基因,并有潛在抑癌作用。(2)p53基因
★特點17p13,11個外顯子,10個內(nèi)含子
★編碼393個氨基酸,p53染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。單鏈DNA分子具有特定的二級空間構(gòu)象,取決于該分子本身的堿基組成(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲基化水平比其鄰近的正常細(xì)胞明顯偏低,提示某些原癌基因是由于甲基化程度降低而激活抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,當(dāng)這類基因發(fā)生突變、缺失或失活時,可引起細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生5、SouthernBlot★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因?;顒樱?xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)(一)原癌基因點突變(pointmutation)
癌基因在編碼順序的特定位置上的某一個核苷酸發(fā)生突變,使其表達(dá)蛋白質(zhì)中相應(yīng)的氨基酸發(fā)生變化,從而獲得了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的活性第2階段(19791989)糖鏈抗原為主負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最第1階段(19631978)癌胚性抗原染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生
根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。四、抑癌基因
抑癌基因(suppressergene)又稱抗癌基因(antionc),是存在于正常細(xì)胞內(nèi)的一類可抑制細(xì)胞生長的基因,并有潛在抑癌作用。當(dāng)這類基因發(fā)生突變、缺失或失活時,可引起細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生
四、抑癌基因
抑癌基因(suppresser(一)抑癌基因及其表達(dá)產(chǎn)物
抑癌基因與調(diào)控細(xì)胞分裂和分化過程相關(guān),可能與生長因子、某些蛋白激酶類活性密切相關(guān),只是抑癌基因給予細(xì)胞的信號與原癌基因相反(一)抑癌基因及其表達(dá)產(chǎn)物
抑癌基因與調(diào)控細(xì)胞分裂和(二)抑癌基因失活機(jī)理
1、視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(retinoblastoma,Rb)
(1)特點
★基因組成27個外顯子,317外顯子區(qū)域是基
因重組和突變的熱點
★編碼p105的蛋白質(zhì),其有結(jié)合DNA的活性,
可受多種激酶系統(tǒng)催化而發(fā)生磷酸化(二)抑癌基因失活機(jī)理
1、視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(retinobl
(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失。非磷酸化的Rb可防止細(xì)胞增殖,當(dāng)DNA腫瘤病毒抗原結(jié)合了非磷酸化的Rb時,Rb的活性就受到抑制,使細(xì)胞轉(zhuǎn)化為無限增殖狀態(tài),形成腫瘤
(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p10對于大量來自視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的Rb基因序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)Rb基因完全或部分發(fā)生缺失;另一些Rb腫瘤中,基因完整,但序列分析顯示有一個突變,它常發(fā)生于剪接點上,由于這一變異導(dǎo)致RbmRNA組裝時有外顯子被漏掉,因而產(chǎn)生異常Rb蛋白質(zhì)
對于大量來自視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的Rb基因序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)Rb基
抑癌基因又稱為隱性癌基因
基因1基因2原癌基因MW腫瘤抑癌基因MWMM腫瘤抑癌基因又稱為隱性癌基因(2)p53基因
★特點17p13,11個外顯子,10個內(nèi)含子
★編碼393個氨基酸,p53(2)p53基因
★特點17p13,11個外顯子,10個內(nèi)含★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。
(1)抑制腫瘤細(xì)胞停滯在修復(fù)前期不能進(jìn)入S期復(fù)制DNA而促使細(xì)胞凋亡★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。
(1)抑制腫瘤細(xì)胞停滯在野生型p53的蛋白質(zhì)
p53下調(diào)bcl-2而上調(diào)bax,促進(jìn)細(xì)胞凋亡過程。向丟失p53等位基因的腫瘤細(xì)胞中導(dǎo)入野生型p53就會使腫瘤細(xì)胞凋亡野生型p53的蛋白質(zhì)正常細(xì)胞的生長增殖由兩大基因調(diào)控正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止其發(fā)生終末分化—癌基因負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最后凋亡(apoptosis)—抑癌基因
兩種信號保持著動態(tài)平衡,對正常細(xì)胞的生長、增殖、死亡精確地調(diào)控,當(dāng)平衡被破壞,正調(diào)控信號基因功能過盛或負(fù)調(diào)控信號基因失活,導(dǎo)致細(xì)胞增殖調(diào)控的混亂而使細(xì)胞惡變正常細(xì)胞的生長增殖由兩大基因調(diào)控兩種信號保
原癌基因的激活
1、ras基因的變異
2.myc基因的變異抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,與卵巢癌的發(fā)生也緊密相關(guān)
原癌基因的激活
1、ras基因的變異
2.myc基因的變異五、檢測方法
1、PCR/ASO探針法(PCRallelespecificoligonucleotide)
被檢基因片段經(jīng)PCR擴(kuò)增并經(jīng)電泳分離后轉(zhuǎn)移到膜上,分別與經(jīng)標(biāo)記的野生型和突變型靶基因序列的寡核苷酸探針雜交。由于長度為20個堿基左右的探針中僅1個堿基的差異便會使其Tm值下降5.0~7.5℃,因此通過嚴(yán)格控制雜交條件,可以使PCR產(chǎn)物與完全互補(bǔ)的探針進(jìn)行雜交,也即野生型序列的產(chǎn)物僅與野生型探針雜交,含突變序列的產(chǎn)物僅與突變探針雜交。根據(jù)有無雜交信號可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點。
五、檢測方法
1、PCR/ASO探針法(PCRalleles第2階段(19791989)糖鏈抗原為主原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。負(fù)調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,正調(diào)控信號:促進(jìn)細(xì)胞生長和增殖,并且阻止細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同在設(shè)計引物時應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對較低。與卵巢癌的發(fā)生也緊密相關(guān)第2階段(19791989)糖鏈抗原為主第1階段(19631978)癌胚性抗原將PCR產(chǎn)物在含有梯度濃度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中進(jìn)行分離,當(dāng)泳動至變性劑相應(yīng)濃度的位置時,產(chǎn)物片段中Tm值較低一端的雙鏈被部分變性而解鏈,這種部分解鏈的構(gòu)象致使該片段的電泳遷移率大大降低。單鏈DNA分子具有特定的二級空間構(gòu)象,取決于該分子本身的堿基組成★作用產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。原癌基因包括病毒癌基因(vonc)和細(xì)胞癌基因(conc)兩種,它們在正常情況下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動,包括細(xì)胞增生、生長因子信號傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。染色體易位使位于9q34的cabl基因轉(zhuǎn)移到第22對染色體上,重排形成bcrabl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生2、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)分析
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—限制性片段長
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