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第八章基因診斷與基因治療基因診斷(genediagnosis):——從基因水平探測(cè)和分析疾病的起因?;蛑委煟╣enetherapy):——從基因水平干涉和矯正疾病造成的紊亂。1多數(shù)非感染性疾病發(fā)生的根本原因是基因結(jié)構(gòu)的變異或表達(dá)水平的異常;感染性疾病則是病原體入侵在體內(nèi)表達(dá)外源性基因所致。授課老師:江黎明2021/7/91第八章基因診斷與基因治療基因診斷(genediagnos一、基因診斷的概念和特點(diǎn)二、基因診斷的主要技術(shù)方法三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)四、疾病的基因診斷(自習(xí))五、基因診斷在法醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用第一節(jié)基因診斷(gene
diagnosis)2021/7/92一、基因診斷的概念和特點(diǎn)二、基因診斷的主要技術(shù)方法三、常見(jiàn)的
基因診斷通常是指利用分子生物學(xué)的方法技術(shù),直接檢測(cè)體內(nèi)DNA的結(jié)構(gòu)變異或RNA的水平變化,從而對(duì)疾病作出診斷的方法。一、基因診斷的概念和特點(diǎn)(一)概念
適用于遺傳性疾病、感染性疾病、腫瘤等多種疾病的診斷,以及個(gè)體識(shí)別和親子鑒定等法病學(xué)領(lǐng)域。2021/7/93基因診斷通常是指利用分子生物學(xué)的方法技術(shù),直接檢測(cè)體(二)特點(diǎn)--以已知基因作為檢測(cè)對(duì)象(l)特異性強(qiáng):直接檢測(cè)導(dǎo)致疾病發(fā)生的基因變化;(2)靈敏度高:所采用的分子雜交和聚合酶鏈反應(yīng)等技術(shù)都具有信號(hào)放大作用;(3)取樣便利:一般不受組織或時(shí)相的限制;(4)早期診斷:易在疾病尚無(wú)臨床表現(xiàn)時(shí)作出診斷;(5)應(yīng)用廣泛:可檢測(cè)自體基因和外源基因。一、基因診斷的概念和特點(diǎn)2021/7/94(二)特點(diǎn)--以已知基因作為檢測(cè)對(duì)象(l)特異性強(qiáng):直接檢測(cè)(一)核酸分子雜交(NAhybridization)(二)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(SSCP)(四)DNA分子多態(tài)性(DNApolymorphism)分析(五)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)分析(六)顯微切割(microdissection)技術(shù)5(七)DNA序列測(cè)定(DNAsequencing)二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/95(一)核酸分子雜交(NAhybridization)(二(一)核酸分子雜交4.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)
Southern/DNA印跡、Northern/RNA印跡(第七/六章)和Western/蛋白質(zhì)印跡(第九/二章)其他雜交方法:1.斑點(diǎn)印跡(dotblotting)與狹縫雜交2.組織原位雜交(tissureinsituhybridization)3.等位基因特異性寡核苷酸雜交(allele-specificoligonucleotidehybridization,ASOH)二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/96(一)核酸分子雜交4.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)71.斑點(diǎn)印跡(dotblotting)雜交將核酸(DNA或RNA)樣品點(diǎn)在NC膜上,變性后與標(biāo)記探針結(jié)合,顯影或顯色,密度測(cè)量,與對(duì)照品比較確定所測(cè)核酸量的高低。方法:應(yīng)用:主要用于檢測(cè)細(xì)胞基因拷貝數(shù)的變化或者mRNA含量的變化。便于大規(guī)模檢測(cè)和篩選;容易出現(xiàn)假陽(yáng)性。特點(diǎn):2021/7/9771.斑點(diǎn)印跡(dotblotting)雜交將核酸(DNASlot-blot結(jié)果GS-670型光密度掃描儀(Bio-Rad)
2021/7/98Slot-blot結(jié)果GS-670型光密度2021/7/9892.組織原位雜交(tissureinsituhybridization)組織或細(xì)胞(新鮮組織切片、細(xì)胞涂片或石蠟切片)樣品做適當(dāng)處理(如固定劑固定、蛋白酶消化),使其通透性增大,標(biāo)記探針進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與核酸雜交。方法:應(yīng)用:被檢測(cè)基因或mRNA在細(xì)胞內(nèi)的檢測(cè)及定位。特點(diǎn):不需提取被檢核酸,可確定被檢核酸細(xì)胞內(nèi)定位。1986創(chuàng)建的熒光原位雜交(FISH)用于特定基因的定位及其缺失、擴(kuò)增或重排的檢測(cè)。2021/7/9992.組織原位雜交(tissureinsituhybr2021/7/9102021/7/910原癌基因ERBB-2(Her-2),基因擴(kuò)增熒光原位雜交檢測(cè)2021/7/911原癌基因ERBB-2(Her-2),基因擴(kuò)增熒光原位雜交檢測(cè)熒光原位雜交2021/7/912熒光原位雜交2021/7/9123.等位基因特異性寡核苷酸雜交(ASOH)根據(jù)已知基因突變位點(diǎn)的堿基序列,設(shè)計(jì)和制備與野生型或突變型基因序列片段互補(bǔ)的兩種探針,分別與被檢DNA進(jìn)行雜交,確定基因突變存在與否,分辨純/雜合子。方法:應(yīng)用:基因結(jié)構(gòu)變異所致疾病的診斷。特點(diǎn):雜交條件要求嚴(yán)格,以避免出現(xiàn)假陽(yáng)性或假陰性。2021/7/9133.等位基因特異性寡核苷酸雜交(ASOH)根據(jù)已知基因突變位N:正?;?;H:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2NHMASOH示意圖2021/7/914N:正?;颍籋:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2N4.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)DNA點(diǎn)陣(DNAarray)——把多種已知序列的DNA片段排列在固體支持物上,同時(shí)對(duì)樣品中的多種核酸進(jìn)行檢測(cè)和分析。方法:應(yīng)用:?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性(SNP)、基因表達(dá)譜和遺傳性疾病的分析;病原微生物的大規(guī)模檢測(cè)。DNA微陣列(DNAmicroarray)——通過(guò)計(jì)算機(jī)控制點(diǎn)樣和圖像掃描的高密度集成探針的雜交技術(shù)。2021/7/9154.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)DNA點(diǎn)陣(DN(二)PCR技術(shù)(第七/七章)1.PCR技術(shù)的原理以DNA分子為模板,加入與擬擴(kuò)增DNA片段兩端分別互補(bǔ)的一對(duì)寡核苷酸鏈作為引物,在DNA聚合酶的催化下,按照半保留復(fù)制的形式分別合成兩股新的DNA互補(bǔ)鏈,可使兩引物間的DNA片段拷貝數(shù)增加一倍。
多次重復(fù)這一過(guò)程,可使這段DNA拷貝數(shù)隨復(fù)制次數(shù)以指數(shù)形式擴(kuò)增。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/916(二)PCR技術(shù)(第七/七章)1.PCR技術(shù)的原理2.基因診斷中常用的PCR及其衍生技術(shù)(1)DNA的微量分析
總RNA(或mRNA)ss-cDNAds-cDNAPCR擴(kuò)增PCR法靈敏度高,對(duì)模板DNA純度要求不高,且樣品用量極微(如一滴血、一根頭發(fā)等)。(2)RT-PCR(reversetranscriptional-PCR)2021/7/9172.基因診斷中常用的PCR及其衍生技術(shù)(1)DNA的微18(3)巢式-PCR(nestedPCR)用2對(duì)引物(外引物、內(nèi)引物)擴(kuò)增,大大提高了擴(kuò)增的特異性(4)不對(duì)稱(chēng)PCR(asymmetricPCR)2個(gè)引物濃度不等,一般采用50:1或100:1的摩爾比,主要獲取單鏈DNA作構(gòu)象分析或用作探針。2021/7/91818(3)巢式-PCR(nestedPCR)用2對(duì)19(5)多重PCR(multiplexPCR)在同反應(yīng)體系中加入多對(duì)引物,同時(shí)擴(kuò)增同一DNA樣品中的多個(gè)不同序列區(qū)域,且每對(duì)引物所擴(kuò)增的產(chǎn)物長(zhǎng)度都不同,可根據(jù)電泳結(jié)果判斷是否存在某些基因片段的缺失或長(zhǎng)度改變。(6)等位基因特異性PCR(AS-PCR)
針對(duì)等位基因的序列差異區(qū)域設(shè)計(jì)引物,使引物的3’端與等位基因序列的差異堿基對(duì)應(yīng),僅能與突變型或野生型互補(bǔ)。2021/7/91919(5)多重PCR(multiplexPCR)(7)原位PCR(insituPCR,IS-PCR)技術(shù)
1)細(xì)胞和組織經(jīng)固定劑固定、蛋白酶消化,使細(xì)胞獲得適度的通透性,既利于PCR反應(yīng)試劑到達(dá)靶位,又可防止擴(kuò)增產(chǎn)物從細(xì)胞內(nèi)漏出;
2)把載玻片的靶DNA進(jìn)行常規(guī)PCR(病毒RNA的擴(kuò)增用RT-PCR);
3)最后通過(guò)間接法(原位雜交)或直接法(PRC過(guò)程中加入標(biāo)記)檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物。2021/7/920(7)原位PCR(insituPCR,IS-PCR)(8)實(shí)時(shí)熒光定量PCR
PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而使熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào);每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。2021/7/921(8)實(shí)時(shí)熒光定量PCRPCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’22(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析利用單個(gè)或多個(gè)堿基不同、但序列長(zhǎng)度相等的雙鏈核酸分子,經(jīng)變性成單鏈后可具有不同的構(gòu)象而在中性PAGE電泳中的遷移率不同;(singlestrandcomformationpolymorphism,SSCP)與正常的電泳圖型對(duì)照,出現(xiàn)新條帶即可判定存在堿基變異。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/92222(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析利用單個(gè)或多個(gè)堿基不同與PCR聯(lián)用稱(chēng)為PCR-SSCP;廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。2021/7/923與PCR聯(lián)用稱(chēng)為PCR-SSCP;廣泛用于大批樣品基因突變的241.限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性的檢測(cè)3.單核苷酸多態(tài)性2.數(shù)目可變的串聯(lián)重復(fù)序列多態(tài)性的檢測(cè)(四)DNA分子多態(tài)性(DNApolymorphism)分析(singlenucleotidepolymorphism,SNP)(variablenumberoftandemrepeats,VNTR)(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/924241.限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性的檢測(cè)3.單核苷酸多態(tài)性2.數(shù)目25VNTR的重復(fù)序列出現(xiàn)次數(shù)在6次100次之間;小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA):重復(fù)單元長(zhǎng)度為6~70bp;微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA):重復(fù)單元長(zhǎng)度為1~6bp。短串聯(lián)重復(fù)DNA(shorttandemrepeatDNA,STRDNA):重復(fù)單元長(zhǎng)度為2~6bp。根據(jù)重復(fù)單元長(zhǎng)度可分為:2021/7/92525VNTR的重復(fù)序列出現(xiàn)次數(shù)在6次100次之間;小衛(wèi)星DN26不同個(gè)體間重復(fù)單元[如(CA)n/(TG)n]的拷貝數(shù)(即出現(xiàn)的頻率)不同,因而產(chǎn)生多態(tài)性,稱(chēng)為VNTR多態(tài)性。VNTR多態(tài)性:限制酶識(shí)別位點(diǎn)限制酶識(shí)別位點(diǎn)2021/7/92626不同個(gè)體間重復(fù)單元[如(CA)n/(TG)n]27(五)限制酶譜分析當(dāng)某種限制酶的切點(diǎn)改變時(shí)(由點(diǎn)突變、單個(gè)堿基的插入或缺失引起),用該種限制酶切割后得到的DNA片段的大小和數(shù)目都隨之發(fā)生變化,通過(guò)電泳分析即可作出判斷。PCR-RFLP設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)臄U(kuò)增引物,使擴(kuò)增片段包括某一個(gè)或數(shù)個(gè)限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別序列,在PCR擴(kuò)增后用該限制酶切割PCR產(chǎn)物,根據(jù)電泳后酶切片段長(zhǎng)度變化,即可作出診斷。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/92727(五)限制酶譜分析當(dāng)某種限制酶的切點(diǎn)改變時(shí)(由ABCDEFG-+DEFBGCA-GAATTC--CTTAAG-EFBG-+C+DAEcoRⅠ限制性?xún)?nèi)切酶位點(diǎn)的變化2021/7/928ABCDEFG-+DEFBGCA-GAATTC-EFBG-29(六)顯微切割(microdissection)技術(shù)是應(yīng)用激光捕獲顯微鏡,在高倍鏡下選擇幾個(gè)甚至一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分析;可用于石蠟包埋組織進(jìn)行回顧性診斷。2.染色體的顯微切割。1.組織細(xì)胞的顯微切割是切割分裂中期的染色體的目的區(qū)域,如某些斷裂或易位、倒位位點(diǎn)的染色體片段,再進(jìn)行后續(xù)分析。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/92929(六)顯微切割(microdissection)技術(shù)
瑞士MIICellCut全自動(dòng)激光顯微切割(熒光)系統(tǒng)
可通過(guò)紫外激光切割需要分離的組織,然后通過(guò)有黏性的Eppendorff管蓋進(jìn)行收集,這樣就可以將特定類(lèi)型的細(xì)胞從組織切片上分離下來(lái)。2021/7/930瑞士MIICellCut全自動(dòng)激光顯微切割(熒可以準(zhǔn)確、快速、無(wú)損傷地分離出純凈的特定細(xì)胞或組織,保持細(xì)胞內(nèi)生物分子的完整性,以便用于后續(xù)的DNA、RNA和蛋白質(zhì)分析。配有近紅外激光(波長(zhǎng)810nm);紫外激光(波長(zhǎng)349nm);紅色、綠色、藍(lán)色三種熒光濾光片。美國(guó)Arcturus公司的Veritas激光捕獲顯微分離儀2021/7/931可以準(zhǔn)確、快速、無(wú)損傷地分離出純凈的特定細(xì)胞或組織,PICS
Altra
II流式細(xì)胞儀(分析分選)2021/7/932PICS
Altra
II流式細(xì)胞儀(分析分選)2021/733(七)DNA序列測(cè)定該法是基因診斷所有的技術(shù)方法中最準(zhǔn)確最可靠的—種。缺點(diǎn):費(fèi)時(shí)、費(fèi)力、費(fèi)用高。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/93333(七)DNA序列測(cè)定該法是基因診斷所有的技術(shù)方法34(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)(二)大片段核苷酸丟失或插入的檢測(cè)(三)基因重排的檢測(cè)(四)基因擴(kuò)增的檢測(cè)(五)DNA多態(tài)性的檢測(cè)(六)基因表達(dá)異常的檢測(cè)(七)病原體基因的檢測(cè)2021/7/93434(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)(二)大片段35(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)
狹義的點(diǎn)突變指堿基替代,分為單點(diǎn)突變和多點(diǎn)突變;廣義的點(diǎn)突變還包括少數(shù)核苷酸的缺失或插入。1.已知點(diǎn)突變的檢測(cè)突變位點(diǎn)已被闡明的遺傳病,可采用PCR等位基因特異性寡核苷酸雜交(PCR/AS0H)檢測(cè)。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/93535(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)狹義的點(diǎn)突變指堿基替代,分為單PCR/AS0H
檢測(cè):(1)根據(jù)突變點(diǎn)上下游的序列設(shè)計(jì)合成引物,PCR擴(kuò)增出突變區(qū)的DNA片段。(2)將PCR產(chǎn)物用斑點(diǎn)或狹縫點(diǎn)樣器點(diǎn)在尼龍膜上,以紫外線照射固定。(3)針對(duì)上述每種突變位點(diǎn),分別合成2個(gè)寡核苷酸探針;其中一個(gè)具有正常的堿基序列,另一個(gè)則具有突變的堿基序列。(4)分別預(yù)雜交、雜交、洗膜、放射自顯影或顯色。(5)分析正常探針及突變探針?lè)謩e雜交得到的顯影或顯色圖譜,即可作出基因診斷2021/7/936PCR/AS0H檢測(cè):(1)根據(jù)突變點(diǎn)上下游的序列設(shè)計(jì)N:正?;颍籋:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2NHM(PCR/AS0H檢測(cè)示意圖)2021/7/937N:正?;?;H:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2N2.未知點(diǎn)突變的檢測(cè)初篩:PCR-SSCP分析法確認(rèn):DNAsequencing。2021/7/9382.未知點(diǎn)突變的檢測(cè)初篩:PCR-SSCP分析法確認(rèn):DNAPCR-SSCP:廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。2021/7/939PCR-SSCP:廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。3.少數(shù)核苷酸缺失或插入的檢測(cè)可供選擇的方法:PCR-RFLP分析、AS-PCR、PCR-SSCP及DNA測(cè)序等2021/7/9403.少數(shù)核苷酸缺失或插入的檢測(cè)可供選擇的鐮形細(xì)胞貧血原因:β-珠蛋白鏈第6位密碼子GAG→GTG,造成Glu→Val所致。方法:設(shè)計(jì)一對(duì)引物PCR擴(kuò)增可得294bp,OxaNI
消化,電泳。294191103bpAA:正常人BB:純合子病人CC:雜合子病人結(jié)果:2021/7/941鐮形細(xì)胞貧血原因:β-珠蛋白鏈第6位密碼子GAG→GTG,(二)大片段核苷酸丟失或插入的檢測(cè)1.中等長(zhǎng)度(0.5-1.5kb)的DNA片段缺失或插入,可用一對(duì)引物的普通PCR檢測(cè)。2.若基因較大度(大于1.5kb),且多個(gè)位點(diǎn)存在插入或缺失、位點(diǎn)間距離較遠(yuǎn),宜采用多重PCR法檢測(cè)。5’3’3’5’(多重PCR的引物設(shè)計(jì)示意圖)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/942(二)大片段核苷酸丟失或插入的檢測(cè)1.中等長(zhǎng)度DMD基因定位于人類(lèi)X染色體短臂Xp21.2上。位于該區(qū)的dystrophin(肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白)基因的突變或部分缺失,是導(dǎo)致DMD的原發(fā)病因。
dystrophin基因中有9個(gè)易發(fā)生缺失的熱點(diǎn)區(qū)片段,它們分別位于外顯子4、8、12、17、19、44、45、48和51。杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(Duchennemusculardystrophy,
DMD)2021/7/943DMD基因定位于人類(lèi)X染色體短臂Xp21.2上。多重PCR法檢測(cè)中的基因突變同時(shí)用2對(duì)引物雙重?cái)U(kuò)增dystrophin基因外顯子17和48區(qū)域內(nèi)的2個(gè)片段,可檢測(cè)出75%左右的基因缺失型患者;
若同時(shí)用9對(duì)引物多重?cái)U(kuò)增,則可以檢測(cè)到90%左右的基因缺失型患者。2021/7/944多重PCR法檢測(cè)中的基因突變同時(shí)用2對(duì)引物雙重?cái)U(kuò)增d(三)基因重排的檢測(cè)基因從一條染色體的正常位置轉(zhuǎn)移到其他染色體的某個(gè)位置稱(chēng)基因易位或重排。1.熒光原位雜交技術(shù)(FISH)。2.PCR擴(kuò)增可用不同顏色的熒光標(biāo)記DNA探針,可在染色體上定位基因或DNA片段及它們彼此間的排序。
前提條件是已知重排基因和位點(diǎn)的序列。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/945(三)基因重排的檢測(cè)基因從一條染色體的正常位熒光原位雜交(雙色FISH)2021/7/946熒光原位雜交(雙色FISH)2021/7/946(四)基因擴(kuò)增的檢測(cè)基因擴(kuò)增指基因拷貝數(shù)增加的現(xiàn)象,可增加幾十到上千倍??捎么郎y(cè)基因的DNA片段或cDNA片段為探針,基因組DNA采用適當(dāng)?shù)南拗泼该盖泻笞鱏outhern印跡雜交分析。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/947(四)基因擴(kuò)增的檢測(cè)基因擴(kuò)增指基因拷貝數(shù)增加的現(xiàn)象
(五)DNA多態(tài)性的檢測(cè)
1.限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)2.數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)多性多態(tài)性位點(diǎn)周?chē)鶧NA序列已知時(shí),可用PCR/RFLP分析。針對(duì)串聯(lián)重復(fù)序列兩側(cè)的DNA序列設(shè)計(jì)引物,PCR擴(kuò)增后電泳。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/948(五)DNA多態(tài)性的檢測(cè)1.限制性片段長(zhǎng)度1.mRNA的相對(duì)定量分析
(1)斑點(diǎn)雜交或狹線雜交放射或非放射標(biāo)記的cDNA探針與待測(cè)RNA雜交,經(jīng)顯影或顯色,與正常對(duì)照比較即可定量待測(cè)RNA。(2)RT-PCR法
對(duì)電泳凝膠中的擴(kuò)增產(chǎn)物cDNA行光密度掃描,計(jì)算模板mRNA的量;若dNTPs帶放射性標(biāo)記,作放射活性測(cè)定,并由此推算mRNA的含量。(六)基因表達(dá)異常的檢測(cè)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/9491.mRNA的相對(duì)定量分析2.mRNA的絕對(duì)定量分析
(1)采用一系列已知不同濃度的與待測(cè)mRNA序列相同但長(zhǎng)度不同的內(nèi)對(duì)照mRNA,在同一體系中一同進(jìn)行RT-PCR(加32p-dCTP),擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳分離,分別測(cè)定兩者放射性強(qiáng)度,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線即可查出特異mRNA的量。(2)用熒光定量PCR法對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物定量。3.mRNA的長(zhǎng)度分析(2)先分析RT-PCR產(chǎn)物電泳條帶長(zhǎng)度,后測(cè)序確認(rèn)。(1)采用Northern印跡雜交法檢測(cè)某種特異的mRNA的長(zhǎng)度有否改變;2021/7/9502.mRNA的絕對(duì)定量分析(1)采用一系列已知不同濃(一)遺傳病的基因診斷1.血紅蛋白?。╤emoglobinopathy)四、疾病的基因診斷(自習(xí))2.苯丙酮尿癥(phenylketonuria,PKU)(二)感染性疾病的基因診斷1.乙型肝炎的基因診斷2.痢疾桿菌和侵襲性大腸桿菌的檢測(cè)(三)腫瘤的基因診斷1.肺癌(lungcancer)2.乳腺癌(breastcancer)2021/7/951(一)遺傳病的基因診斷1.血紅蛋白?。╤emoglobino(一)重復(fù)序列多態(tài)性與DNA指紋人類(lèi)基因組DNA序列中存在眾多的多態(tài)遺傳標(biāo)記,除非同卵雙生,幾乎沒(méi)有任何兩個(gè)人的DNA分析圖譜會(huì)完全相同,稱(chēng)為DNA指紋。五、基因診斷在法醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用人類(lèi)基因組中存在有大量的數(shù)目可變的串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR);可分為小衛(wèi)星DNA、微衛(wèi)星DNA/短串聯(lián)重復(fù)(STR)。VNTR位點(diǎn)的平均雜合度在70%左右,存在極為廣泛,分布十分理想,且檢測(cè)方法簡(jiǎn)便,以取代RFLP而成為構(gòu)建連鎖圖譜的新標(biāo)記。2021/7/952(一)重復(fù)序列多態(tài)性與DNA指紋人類(lèi)基因組DNA序列1985年,英國(guó)遺傳學(xué)家Jeffreys等用串聯(lián)重復(fù)序列(TR)的核心序列為探針進(jìn)行RFLP分析,檢測(cè)到許多高度可變區(qū)(HVR),所得圖譜具有高度的個(gè)體特異性,達(dá)到了如同人類(lèi)指紋那樣的高度專(zhuān)一性,稱(chēng)為DNA指紋圖譜(DNAfingerprinting)。
AlecJohnJeffreysOxford,UnitedKingdom
2021/7/9531985年,英國(guó)遺傳學(xué)家Jeffreys等用串聯(lián)(二)DNA指紋與法醫(yī)案檢工作法醫(yī)學(xué)中基因診斷的目的主要是個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。以往法醫(yī)學(xué)鑒定中應(yīng)用的是血型、血清蛋白型、紅細(xì)胞酶型和HLA分型、單位點(diǎn)特異性探針RFLP分析;個(gè)體分辨力不夠,只能排除,不能做到統(tǒng)一認(rèn)證。五、基因診斷在法醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用2021/7/954(二)DNA指紋與法醫(yī)案檢工作法醫(yī)學(xué)中基因診斷的目法醫(yī)案檢中的基因診斷技術(shù)VNTR(可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列/小衛(wèi)星)的核酸分子雜交分析STR(短串聯(lián)重復(fù)序列/微衛(wèi)星)的PCR分析SNP的基因芯片檢測(cè)2021/7/955法醫(yī)案檢中的基因診斷技術(shù)VNTR(可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列/小衛(wèi)親權(quán)鑒定與DNA指紋圖由此圖可推斷出:A和C是親生女兒;B為妻子和其前夫所生;D為養(yǎng)女。2021/7/956親權(quán)鑒定與DNA指紋圖2021/7/956血跡中的DNA2021/7/957血跡中的DNA2021/7/957問(wèn)題?問(wèn)題?第八章基因診斷與基因治療基因診斷(genediagnosis):——從基因水平探測(cè)和分析疾病的起因?;蛑委煟╣enetherapy):——從基因水平干涉和矯正疾病造成的紊亂。59多數(shù)非感染性疾病發(fā)生的根本原因是基因結(jié)構(gòu)的變異或表達(dá)水平的異常;感染性疾病則是病原體入侵在體內(nèi)表達(dá)外源性基因所致。授課老師:江黎明2021/7/959第八章基因診斷與基因治療基因診斷(genediagnos一、基因診斷的概念和特點(diǎn)二、基因診斷的主要技術(shù)方法三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)四、疾病的基因診斷(自習(xí))五、基因診斷在法醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用第一節(jié)基因診斷(gene
diagnosis)2021/7/960一、基因診斷的概念和特點(diǎn)二、基因診斷的主要技術(shù)方法三、常見(jiàn)的
基因診斷通常是指利用分子生物學(xué)的方法技術(shù),直接檢測(cè)體內(nèi)DNA的結(jié)構(gòu)變異或RNA的水平變化,從而對(duì)疾病作出診斷的方法。一、基因診斷的概念和特點(diǎn)(一)概念
適用于遺傳性疾病、感染性疾病、腫瘤等多種疾病的診斷,以及個(gè)體識(shí)別和親子鑒定等法病學(xué)領(lǐng)域。2021/7/961基因診斷通常是指利用分子生物學(xué)的方法技術(shù),直接檢測(cè)體(二)特點(diǎn)--以已知基因作為檢測(cè)對(duì)象(l)特異性強(qiáng):直接檢測(cè)導(dǎo)致疾病發(fā)生的基因變化;(2)靈敏度高:所采用的分子雜交和聚合酶鏈反應(yīng)等技術(shù)都具有信號(hào)放大作用;(3)取樣便利:一般不受組織或時(shí)相的限制;(4)早期診斷:易在疾病尚無(wú)臨床表現(xiàn)時(shí)作出診斷;(5)應(yīng)用廣泛:可檢測(cè)自體基因和外源基因。一、基因診斷的概念和特點(diǎn)2021/7/962(二)特點(diǎn)--以已知基因作為檢測(cè)對(duì)象(l)特異性強(qiáng):直接檢測(cè)(一)核酸分子雜交(NAhybridization)(二)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(SSCP)(四)DNA分子多態(tài)性(DNApolymorphism)分析(五)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)分析(六)顯微切割(microdissection)技術(shù)63(七)DNA序列測(cè)定(DNAsequencing)二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/963(一)核酸分子雜交(NAhybridization)(二(一)核酸分子雜交4.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)
Southern/DNA印跡、Northern/RNA印跡(第七/六章)和Western/蛋白質(zhì)印跡(第九/二章)其他雜交方法:1.斑點(diǎn)印跡(dotblotting)與狹縫雜交2.組織原位雜交(tissureinsituhybridization)3.等位基因特異性寡核苷酸雜交(allele-specificoligonucleotidehybridization,ASOH)二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/964(一)核酸分子雜交4.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)651.斑點(diǎn)印跡(dotblotting)雜交將核酸(DNA或RNA)樣品點(diǎn)在NC膜上,變性后與標(biāo)記探針結(jié)合,顯影或顯色,密度測(cè)量,與對(duì)照品比較確定所測(cè)核酸量的高低。方法:應(yīng)用:主要用于檢測(cè)細(xì)胞基因拷貝數(shù)的變化或者mRNA含量的變化。便于大規(guī)模檢測(cè)和篩選;容易出現(xiàn)假陽(yáng)性。特點(diǎn):2021/7/96571.斑點(diǎn)印跡(dotblotting)雜交將核酸(DNASlot-blot結(jié)果GS-670型光密度掃描儀(Bio-Rad)
2021/7/966Slot-blot結(jié)果GS-670型光密度2021/7/98672.組織原位雜交(tissureinsituhybridization)組織或細(xì)胞(新鮮組織切片、細(xì)胞涂片或石蠟切片)樣品做適當(dāng)處理(如固定劑固定、蛋白酶消化),使其通透性增大,標(biāo)記探針進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與核酸雜交。方法:應(yīng)用:被檢測(cè)基因或mRNA在細(xì)胞內(nèi)的檢測(cè)及定位。特點(diǎn):不需提取被檢核酸,可確定被檢核酸細(xì)胞內(nèi)定位。1986創(chuàng)建的熒光原位雜交(FISH)用于特定基因的定位及其缺失、擴(kuò)增或重排的檢測(cè)。2021/7/96792.組織原位雜交(tissureinsituhybr2021/7/9682021/7/910原癌基因ERBB-2(Her-2),基因擴(kuò)增熒光原位雜交檢測(cè)2021/7/969原癌基因ERBB-2(Her-2),基因擴(kuò)增熒光原位雜交檢測(cè)熒光原位雜交2021/7/970熒光原位雜交2021/7/9123.等位基因特異性寡核苷酸雜交(ASOH)根據(jù)已知基因突變位點(diǎn)的堿基序列,設(shè)計(jì)和制備與野生型或突變型基因序列片段互補(bǔ)的兩種探針,分別與被檢DNA進(jìn)行雜交,確定基因突變存在與否,分辨純/雜合子。方法:應(yīng)用:基因結(jié)構(gòu)變異所致疾病的診斷。特點(diǎn):雜交條件要求嚴(yán)格,以避免出現(xiàn)假陽(yáng)性或假陰性。2021/7/9713.等位基因特異性寡核苷酸雜交(ASOH)根據(jù)已知基因突變位N:正常基因;H:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2NHMASOH示意圖2021/7/972N:正?;?;H:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2N4.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)DNA點(diǎn)陣(DNAarray)——把多種已知序列的DNA片段排列在固體支持物上,同時(shí)對(duì)樣品中的多種核酸進(jìn)行檢測(cè)和分析。方法:應(yīng)用:?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性(SNP)、基因表達(dá)譜和遺傳性疾病的分析;病原微生物的大規(guī)模檢測(cè)。DNA微陣列(DNAmicroarray)——通過(guò)計(jì)算機(jī)控制點(diǎn)樣和圖像掃描的高密度集成探針的雜交技術(shù)。2021/7/9734.DNA芯片(DNAchip)技術(shù)DNA點(diǎn)陣(DN(二)PCR技術(shù)(第七/七章)1.PCR技術(shù)的原理以DNA分子為模板,加入與擬擴(kuò)增DNA片段兩端分別互補(bǔ)的一對(duì)寡核苷酸鏈作為引物,在DNA聚合酶的催化下,按照半保留復(fù)制的形式分別合成兩股新的DNA互補(bǔ)鏈,可使兩引物間的DNA片段拷貝數(shù)增加一倍。
多次重復(fù)這一過(guò)程,可使這段DNA拷貝數(shù)隨復(fù)制次數(shù)以指數(shù)形式擴(kuò)增。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/974(二)PCR技術(shù)(第七/七章)1.PCR技術(shù)的原理2.基因診斷中常用的PCR及其衍生技術(shù)(1)DNA的微量分析
總RNA(或mRNA)ss-cDNAds-cDNAPCR擴(kuò)增PCR法靈敏度高,對(duì)模板DNA純度要求不高,且樣品用量極微(如一滴血、一根頭發(fā)等)。(2)RT-PCR(reversetranscriptional-PCR)2021/7/9752.基因診斷中常用的PCR及其衍生技術(shù)(1)DNA的微76(3)巢式-PCR(nestedPCR)用2對(duì)引物(外引物、內(nèi)引物)擴(kuò)增,大大提高了擴(kuò)增的特異性(4)不對(duì)稱(chēng)PCR(asymmetricPCR)2個(gè)引物濃度不等,一般采用50:1或100:1的摩爾比,主要獲取單鏈DNA作構(gòu)象分析或用作探針。2021/7/97618(3)巢式-PCR(nestedPCR)用2對(duì)77(5)多重PCR(multiplexPCR)在同反應(yīng)體系中加入多對(duì)引物,同時(shí)擴(kuò)增同一DNA樣品中的多個(gè)不同序列區(qū)域,且每對(duì)引物所擴(kuò)增的產(chǎn)物長(zhǎng)度都不同,可根據(jù)電泳結(jié)果判斷是否存在某些基因片段的缺失或長(zhǎng)度改變。(6)等位基因特異性PCR(AS-PCR)
針對(duì)等位基因的序列差異區(qū)域設(shè)計(jì)引物,使引物的3’端與等位基因序列的差異堿基對(duì)應(yīng),僅能與突變型或野生型互補(bǔ)。2021/7/97719(5)多重PCR(multiplexPCR)(7)原位PCR(insituPCR,IS-PCR)技術(shù)
1)細(xì)胞和組織經(jīng)固定劑固定、蛋白酶消化,使細(xì)胞獲得適度的通透性,既利于PCR反應(yīng)試劑到達(dá)靶位,又可防止擴(kuò)增產(chǎn)物從細(xì)胞內(nèi)漏出;
2)把載玻片的靶DNA進(jìn)行常規(guī)PCR(病毒RNA的擴(kuò)增用RT-PCR);
3)最后通過(guò)間接法(原位雜交)或直接法(PRC過(guò)程中加入標(biāo)記)檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物。2021/7/978(7)原位PCR(insituPCR,IS-PCR)(8)實(shí)時(shí)熒光定量PCR
PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而使熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào);每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。2021/7/979(8)實(shí)時(shí)熒光定量PCRPCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’80(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析利用單個(gè)或多個(gè)堿基不同、但序列長(zhǎng)度相等的雙鏈核酸分子,經(jīng)變性成單鏈后可具有不同的構(gòu)象而在中性PAGE電泳中的遷移率不同;(singlestrandcomformationpolymorphism,SSCP)與正常的電泳圖型對(duì)照,出現(xiàn)新條帶即可判定存在堿基變異。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/98022(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析利用單個(gè)或多個(gè)堿基不同與PCR聯(lián)用稱(chēng)為PCR-SSCP;廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。2021/7/981與PCR聯(lián)用稱(chēng)為PCR-SSCP;廣泛用于大批樣品基因突變的821.限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性的檢測(cè)3.單核苷酸多態(tài)性2.數(shù)目可變的串聯(lián)重復(fù)序列多態(tài)性的檢測(cè)(四)DNA分子多態(tài)性(DNApolymorphism)分析(singlenucleotidepolymorphism,SNP)(variablenumberoftandemrepeats,VNTR)(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/982241.限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性的檢測(cè)3.單核苷酸多態(tài)性2.數(shù)目83VNTR的重復(fù)序列出現(xiàn)次數(shù)在6次100次之間;小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA):重復(fù)單元長(zhǎng)度為6~70bp;微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA):重復(fù)單元長(zhǎng)度為1~6bp。短串聯(lián)重復(fù)DNA(shorttandemrepeatDNA,STRDNA):重復(fù)單元長(zhǎng)度為2~6bp。根據(jù)重復(fù)單元長(zhǎng)度可分為:2021/7/98325VNTR的重復(fù)序列出現(xiàn)次數(shù)在6次100次之間;小衛(wèi)星DN84不同個(gè)體間重復(fù)單元[如(CA)n/(TG)n]的拷貝數(shù)(即出現(xiàn)的頻率)不同,因而產(chǎn)生多態(tài)性,稱(chēng)為VNTR多態(tài)性。VNTR多態(tài)性:限制酶識(shí)別位點(diǎn)限制酶識(shí)別位點(diǎn)2021/7/98426不同個(gè)體間重復(fù)單元[如(CA)n/(TG)n]85(五)限制酶譜分析當(dāng)某種限制酶的切點(diǎn)改變時(shí)(由點(diǎn)突變、單個(gè)堿基的插入或缺失引起),用該種限制酶切割后得到的DNA片段的大小和數(shù)目都隨之發(fā)生變化,通過(guò)電泳分析即可作出判斷。PCR-RFLP設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)臄U(kuò)增引物,使擴(kuò)增片段包括某一個(gè)或數(shù)個(gè)限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別序列,在PCR擴(kuò)增后用該限制酶切割PCR產(chǎn)物,根據(jù)電泳后酶切片段長(zhǎng)度變化,即可作出診斷。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/98527(五)限制酶譜分析當(dāng)某種限制酶的切點(diǎn)改變時(shí)(由ABCDEFG-+DEFBGCA-GAATTC--CTTAAG-EFBG-+C+DAEcoRⅠ限制性?xún)?nèi)切酶位點(diǎn)的變化2021/7/986ABCDEFG-+DEFBGCA-GAATTC-EFBG-87(六)顯微切割(microdissection)技術(shù)是應(yīng)用激光捕獲顯微鏡,在高倍鏡下選擇幾個(gè)甚至一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分析;可用于石蠟包埋組織進(jìn)行回顧性診斷。2.染色體的顯微切割。1.組織細(xì)胞的顯微切割是切割分裂中期的染色體的目的區(qū)域,如某些斷裂或易位、倒位位點(diǎn)的染色體片段,再進(jìn)行后續(xù)分析。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/98729(六)顯微切割(microdissection)技術(shù)
瑞士MIICellCut全自動(dòng)激光顯微切割(熒光)系統(tǒng)
可通過(guò)紫外激光切割需要分離的組織,然后通過(guò)有黏性的Eppendorff管蓋進(jìn)行收集,這樣就可以將特定類(lèi)型的細(xì)胞從組織切片上分離下來(lái)。2021/7/988瑞士MIICellCut全自動(dòng)激光顯微切割(熒可以準(zhǔn)確、快速、無(wú)損傷地分離出純凈的特定細(xì)胞或組織,保持細(xì)胞內(nèi)生物分子的完整性,以便用于后續(xù)的DNA、RNA和蛋白質(zhì)分析。配有近紅外激光(波長(zhǎng)810nm);紫外激光(波長(zhǎng)349nm);紅色、綠色、藍(lán)色三種熒光濾光片。美國(guó)Arcturus公司的Veritas激光捕獲顯微分離儀2021/7/989可以準(zhǔn)確、快速、無(wú)損傷地分離出純凈的特定細(xì)胞或組織,PICS
Altra
II流式細(xì)胞儀(分析分選)2021/7/990PICS
Altra
II流式細(xì)胞儀(分析分選)2021/791(七)DNA序列測(cè)定該法是基因診斷所有的技術(shù)方法中最準(zhǔn)確最可靠的—種。缺點(diǎn):費(fèi)時(shí)、費(fèi)力、費(fèi)用高。二、基因診斷的主要技術(shù)方法2021/7/99133(七)DNA序列測(cè)定該法是基因診斷所有的技術(shù)方法92(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)(二)大片段核苷酸丟失或插入的檢測(cè)(三)基因重排的檢測(cè)(四)基因擴(kuò)增的檢測(cè)(五)DNA多態(tài)性的檢測(cè)(六)基因表達(dá)異常的檢測(cè)(七)病原體基因的檢測(cè)2021/7/99234(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)(二)大片段93(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)
狹義的點(diǎn)突變指堿基替代,分為單點(diǎn)突變和多點(diǎn)突變;廣義的點(diǎn)突變還包括少數(shù)核苷酸的缺失或插入。1.已知點(diǎn)突變的檢測(cè)突變位點(diǎn)已被闡明的遺傳病,可采用PCR等位基因特異性寡核苷酸雜交(PCR/AS0H)檢測(cè)。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/99335(一)點(diǎn)突變的檢測(cè)狹義的點(diǎn)突變指堿基替代,分為單PCR/AS0H
檢測(cè):(1)根據(jù)突變點(diǎn)上下游的序列設(shè)計(jì)合成引物,PCR擴(kuò)增出突變區(qū)的DNA片段。(2)將PCR產(chǎn)物用斑點(diǎn)或狹縫點(diǎn)樣器點(diǎn)在尼龍膜上,以紫外線照射固定。(3)針對(duì)上述每種突變位點(diǎn),分別合成2個(gè)寡核苷酸探針;其中一個(gè)具有正常的堿基序列,另一個(gè)則具有突變的堿基序列。(4)分別預(yù)雜交、雜交、洗膜、放射自顯影或顯色。(5)分析正常探針及突變探針?lè)謩e雜交得到的顯影或顯色圖譜,即可作出基因診斷2021/7/994PCR/AS0H檢測(cè):(1)根據(jù)突變點(diǎn)上下游的序列設(shè)計(jì)N:正?;?;H:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2NHM(PCR/AS0H檢測(cè)示意圖)2021/7/995N:正常基因;H:雜合子基因;M:突變基因ASO1ASO2N2.未知點(diǎn)突變的檢測(cè)初篩:PCR-SSCP分析法確認(rèn):DNAsequencing。2021/7/9962.未知點(diǎn)突變的檢測(cè)初篩:PCR-SSCP分析法確認(rèn):DNAPCR-SSCP:廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。2021/7/997PCR-SSCP:廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。3.少數(shù)核苷酸缺失或插入的檢測(cè)可供選擇的方法:PCR-RFLP分析、AS-PCR、PCR-SSCP及DNA測(cè)序等2021/7/9983.少數(shù)核苷酸缺失或插入的檢測(cè)可供選擇的鐮形細(xì)胞貧血原因:β-珠蛋白鏈第6位密碼子GAG→GTG,造成Glu→Val所致。方法:設(shè)計(jì)一對(duì)引物PCR擴(kuò)增可得294bp,OxaNI
消化,電泳。294191103bpAA:正常人BB:純合子病人CC:雜合子病人結(jié)果:2021/7/999鐮形細(xì)胞貧血原因:β-珠蛋白鏈第6位密碼子GAG→GTG,(二)大片段核苷酸丟失或插入的檢測(cè)1.中等長(zhǎng)度(0.5-1.5kb)的DNA片段缺失或插入,可用一對(duì)引物的普通PCR檢測(cè)。2.若基因較大度(大于1.5kb),且多個(gè)位點(diǎn)存在插入或缺失、位點(diǎn)間距離較遠(yuǎn),宜采用多重PCR法檢測(cè)。5’3’3’5’(多重PCR的引物設(shè)計(jì)示意圖)三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/9100(二)大片段核苷酸丟失或插入的檢測(cè)1.中等長(zhǎng)度DMD基因定位于人類(lèi)X染色體短臂Xp21.2上。位于該區(qū)的dystrophin(肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白)基因的突變或部分缺失,是導(dǎo)致DMD的原發(fā)病因。
dystrophin基因中有9個(gè)易發(fā)生缺失的熱點(diǎn)區(qū)片段,它們分別位于外顯子4、8、12、17、19、44、45、48和51。杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(Duchennemusculardystrophy,
DMD)2021/7/9101DMD基因定位于人類(lèi)X染色體短臂Xp21.2上。多重PCR法檢測(cè)中的基因突變同時(shí)用2對(duì)引物雙重?cái)U(kuò)增dystrophin基因外顯子17和48區(qū)域內(nèi)的2個(gè)片段,可檢測(cè)出75%左右的基因缺失型患者;
若同時(shí)用9對(duì)引物多重?cái)U(kuò)增,則可以檢測(cè)到90%左右的基因缺失型患者。2021/7/9102多重PCR法檢測(cè)中的基因突變同時(shí)用2對(duì)引物雙重?cái)U(kuò)增d(三)基因重排的檢測(cè)基因從一條染色體的正常位置轉(zhuǎn)移到其他染色體的某個(gè)位置稱(chēng)基因易位或重排。1.熒光原位雜交技術(shù)(FISH)。2.PCR擴(kuò)增可用不同顏色的熒光標(biāo)記DNA探針,可在染色體上定位基因或DNA片段及它們彼此間的排序。
前提條件是已知重排基因和位點(diǎn)的序列。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/9103(三)基因重排的檢測(cè)基因從一條染色體的正常位熒光原位雜交(雙色FISH)2021/7/9104熒光原位雜交(雙色FISH)2021/7/946(四)基因擴(kuò)增的檢測(cè)基因擴(kuò)增指基因拷貝數(shù)增加的現(xiàn)象,可增加幾十到上千倍??捎么郎y(cè)基因的DNA片段或cDNA片段為探針,基因組DNA采用適當(dāng)?shù)南拗泼该盖泻笞鱏outhern印跡雜交分析。三、常見(jiàn)的基因異常及其檢測(cè)2021/7/9105
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