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關(guān)于實(shí)驗(yàn)六產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)第一頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日實(shí)驗(yàn)?zāi)康?.掌握瓊脂糖凝膠電泳的原理2.學(xué)會(huì)瓊脂糖凝膠的制作和進(jìn)行電泳的方法第二頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日實(shí)驗(yàn)原理1.DNA瓊脂糖凝膠電泳的原理
瓊脂糖是一種線性多糖聚合物,天然聚合長(zhǎng)鏈狀分子,在沸水中溶解,45℃開(kāi)始形成多孔性剛性濾孔,凝膠孔徑的大小取決于瓊脂糖的濃度,濃度越高,孔隙越小,其分辨能力就越強(qiáng)。DNA分子在瓊脂糖凝膠中泳動(dòng)時(shí)有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng)。第三頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日實(shí)驗(yàn)原理(1)電荷效應(yīng)
DNA分子在PH值高于其等電點(diǎn)的溶液中帶負(fù)電荷,在電泳時(shí)向陽(yáng)極移動(dòng)。第四頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日(2)分子篩效益在一定的電場(chǎng)強(qiáng)度下,DNA分子的遷移速度主要取決于分子篩效益,即DNA分子本身的大小和構(gòu)象(共價(jià)閉環(huán)DNA>線狀DNA>開(kāi)環(huán)DNA),而且其遷移速度與其相對(duì)分子質(zhì)量的對(duì)數(shù)值成反比,所以不用相對(duì)分子質(zhì)量的DNA分子可以在瓊脂糖凝膠電泳中分離。第五頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日2.DNA分子進(jìn)行染色的原理(以溴化乙錠為例)
觀察瓊脂糖凝膠中DNA最常用的方法是利用熒光染料溴化乙錠進(jìn)行染色。溴化乙錠是一種高度靈敏的熒光染色劑,用于觀察瓊脂糖凝膠中的DNA分子。溴化乙錠在紫外光照射下能發(fā)射熒光,當(dāng)DNA樣品在瓊脂糖凝膠中從負(fù)極向正極泳動(dòng)時(shí),溴化乙錠從正極向負(fù)極移動(dòng),這樣溴化乙錠分子就會(huì)嵌入到DNA分子中的堿基對(duì)之間形成絡(luò)合物,這種絡(luò)合物在紫外光下發(fā)射的熒光要比單純的DNA分子要強(qiáng)的多,便于DNA的檢測(cè)。第六頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日實(shí)驗(yàn)儀器、材料、試劑實(shí)驗(yàn)儀器及用具電泳儀、移液槍、電磁爐、錐形瓶、容量瓶、紫外分析儀實(shí)驗(yàn)材料及試劑實(shí)驗(yàn)材料:雞血DNAPCR擴(kuò)增產(chǎn)物
DNAMarker、GoldView核酸染色劑、瓊脂糖、三羥甲基氨基甲烷(Tris)、硼酸、乙二胺四乙酸二鈉、6×DNALodingBuffer
實(shí)驗(yàn)試劑:0.5×TBE(PH8.0)緩沖液、1.0%瓊脂糖溶液、
第七頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日實(shí)驗(yàn)步驟瓊脂糖凝膠的配制1g瓊脂糖100mlTBE緩沖液5μlGoldView冷卻到60℃第八頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日1.將適量的DNAMarker用移液槍加入凝膠的第一個(gè)孔中。2.在PCR產(chǎn)物中加入6×DNALodingBuffer(每5ul產(chǎn)物加入1ul),混勻后,用移液槍加入到樣品孔內(nèi),每孔加2ul。點(diǎn)樣第九頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日
肉眼可見(jiàn)指示劑泳至距制膠板前端約2-3cm處即可停止電泳。切斷電源,取出凝膠,置于紫外線透射儀上觀察電泳結(jié)果,或用凝膠成像分析系統(tǒng)拍照保存。電泳、觀察第十頁(yè),共十二頁(yè),2022年,8月28日注意事項(xiàng)1.瓊脂糖融化時(shí),檔位不宜太高。2.制膠和加樣過(guò)程中要防治氣泡的產(chǎn)生。3.操作過(guò)程必須戴手套操作,嚴(yán)格注意防護(hù)。4.加樣時(shí),Tip頭不宜插入樣品孔太深,也不要穿破膠孔壁,否則樣品滲漏或DNA帶型不整齊。5.電源接通時(shí),應(yīng)核實(shí)凝膠的方向是否正確。6.電泳儀有電壓顯示,并不一定標(biāo)志電泳槽已接通,應(yīng)觀察電極氣泡出現(xiàn)情況。負(fù)極的氣泡比正極多一倍,表示電泳已開(kāi)始。將
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