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文檔簡介
第三章
核酸的結構與功能StructureandFunctionofNucleicAcid5′端3′端CGA
以單核苷酸為基本單位組成的生物大分子。是生物遺傳的物質基礎。核酸(nucleicacid):
脫氧核糖核酸(DNA)
核糖核酸(RNA)
核酸mRNAtRNArRNA第一節(jié)核酸的化學組成和一級結構TheChemicalComponentofNucleicAcid核酸的化學組成1.元素組成C、H、O、N、P(9~10%)2.分子組成——堿基(base):嘌呤堿,嘧啶堿——戊糖(ribose):核糖,脫氧核糖——磷酸(phosphate)嘌呤(purine)
腺嘌呤(adenine,A)鳥嘌呤(guanine,G)堿基嘧啶(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)戊糖(構成RNA)1′2′3′4′5′核糖(ribose)(構成DNA)脫氧核糖(deoxyribose)核苷:AR,GR,UR,CR脫氧核苷:dAR,dGR,dTR,dCR一、核苷酸的結構1.核苷(nucleoside)的形成堿基和核糖(脫氧核糖)通過糖苷鍵連接形成核苷(脫氧核苷)。1′1核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP脫氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP
2.核苷酸(nucleotide)的結構與命名核苷(脫氧核苷)和磷酸以磷酸酯鍵連接形成核苷酸(脫氧核苷酸)。
體內重要的游離核苷酸及其衍生物含核苷酸的生物活性物質:NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD等都含有AMP
多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP
環(huán)化核苷酸:cAMP,cGMPAMPADPATPcAMPNADP+NAD+二、核酸的一級結構定義核酸中核苷酸的排列順序。由于核苷酸間的差異主要是堿基不同,所以也稱為堿基序列。5′端3′端CGA5′端3′端核苷酸之間以磷酸二酯鍵連接形成多核苷酸鏈,即核酸。CGAA
G
P5P
T
PG
PC
PT
P
OH3
書寫方法5pApCpTpGpCpT-OH35
ACTGCT
3第二節(jié)DNA的空間結構與功能DimensionalStructureandFunctionofDNADNA雙螺旋結構的研究背景
20世紀20年代,大多數(shù)科學家認為蛋白質是遺傳物質,而不是DNA1944年Avery等利用從致病肺炎球菌中提取的DNA使另一種非致病性(無夾膜)肺炎球菌的遺傳性狀改變而成為致病菌(有夾膜),證實了遺傳物質是DNA而非蛋白質AveryDNA雙螺旋結構的研究背景
1951年,Pauling利用X線晶體衍射技術發(fā)現(xiàn)了蛋白質的α螺旋結構
α螺旋結構理論首次解釋了生物大分子的空間結構
LinusPaulingα螺旋結構的提出對DNA二級結構的發(fā)現(xiàn)也起了很重要的啟發(fā)作用
DNA雙螺旋結構的研究背景
1952年,Chargaff等科學家采用層析和紫外吸收光譜分析等技術發(fā)現(xiàn)了DNA堿基的組成規(guī)律(Chargaff定律)
ChargaffChargaff定律[A]=
[T],[G]=
[C]不同種屬DNA的4種堿基組成不同
堿基組成沒有組織和器官的特異性
揭示了DNA分子堿基之間存在A與T,G與C的互補配對關系
DNA雙螺旋結構的研究背景
1953年,F(xiàn)ranklin獲得高質量的DNAX射線衍射圖譜
DNA雙螺旋結構的研究背景
1953年,Wilkins發(fā)表了DNAX射線衍射的分析數(shù)據(jù)
DNA雙螺旋結構的研究背景
綜合了前人的研究成果,Watson和Crick提出了DNA分子的雙螺旋結構模型,并于1953年4月在英國《Nature》雜志上發(fā)表
Watson
Crick1958年,F(xiàn)ranklin因癌癥離開了人世,年僅37歲
諾貝爾獎的遺憾Pauling錯誤地分析了X射線照片中DNA的密度,由此得出了DNA是一個三螺旋分子的錯誤結論,從而與諾貝爾獎失之交臂一、DNA的二級結構——雙螺旋結構(一)DNA雙螺旋結構提出的依據(jù)
堿基組成分析Chargaff規(guī)則:[A]=
[T][G]=
[C]
堿基的理化數(shù)據(jù)分析A-T、G-C以氫鍵配對較合理
DNA纖維的X-線衍射圖譜分析
(二)DNA雙螺旋結構模型要點(Watson,Crick,1953)DNA分子是反向平行的互補雙鏈結構,兩鏈以-脫氧核糖-磷酸-為骨架,以右手螺旋方式繞公共軸盤旋。螺旋直徑為2.37nm,形成大溝及小溝相間。(二)DNA雙螺旋結構模型要點(Watson,Crick,1953)堿基垂直螺旋軸在內側,與對側堿基形成氫鍵配對(互補配對形式:A=T;GC)。相鄰堿基平面距離0.34nm,螺旋一圈螺距3.54nm,一圈10.4對堿基。堿基互補配對TAGC(二)DNA雙螺旋結構模型要點(Watson,Crick,1953)氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定性,堿基堆積力維持雙鏈縱向穩(wěn)定性。(三)DNA雙螺旋結構的多樣性二、DNA的超螺旋結構及其在染色質中的組裝(一)DNA的超螺旋結構(supercoil)
DNA雙螺旋鏈再盤繞即形成超螺旋結構。
負超螺旋正超螺旋DNA雙螺旋拓撲異構酶(二)原核生物DNA的三級結構(三)DNA在真核生物細胞核內的組裝真核生物染色體由DNA和蛋白質構成,其基本單位是核小體(nucleosome)。核小體的組成DNA:約200bp組蛋白:H1H2A,H2BH3H4三、DNA的功能以基因的形式荷載遺傳信息,并作為基因復制和轉錄的模板?;颍菏侵窪NA分子中的特定區(qū)段,包含有編碼生物活性產物的信息單位。
第三節(jié)
RNA的結構與功能StructureandFunctionofRNARNA的種類、分布、功能一、信使RNA的結構與功能hnRNA內含子(intron)mRNA*真核生物mRNA成熟過程
外顯子(exon)*mRNA含量較少(占細胞總RNA的3%~5%),
種類最多*mRNA的功能
把DNA所攜帶的遺傳信息,按堿基互補配對原則,抄錄并傳送至核糖體,用以決定其合成蛋白質的氨基酸排列順序。DNAmRNA蛋白轉錄翻譯原核細胞細胞質細胞核DNA內含子外顯子轉錄轉錄后剪接轉運mRNAhnRNA翻譯蛋白真核細胞*真核生物mRNA結構特點1.5′末端形成帽子結構:m7GpppNm-。2.3′末端有一個多聚腺苷酸(polyA)結構,稱為多聚A尾。帽子結構和PolyA尾巴mRNA核內向胞質的轉位mRNA的穩(wěn)定性維系翻譯起始的調控帽子結構和多聚A尾的功能:tRNA是細胞內分子量最小的RNA(占總RNA的15%)二、轉運RNA的結構與功能
含10~20%稀有堿基包括雙氫尿嘧啶(DHU)、假尿嘧啶(ψ)和甲基化的嘌呤等N,N二甲基鳥嘌呤N6-異戊烯腺嘌呤雙氫尿嘧啶4-巰尿嘧啶
稀有堿基
氨基酸臂
DHU環(huán)反密碼環(huán)額外環(huán)
TΨC環(huán)氨基酸臂額外環(huán)tRNA的二級結構——三葉草形*tRNA的三級結構——倒L形*tRNA的功能活化、搬運氨基酸到核糖體,參與蛋白質的翻譯。1.如果一種tRNA上的反密碼子是GUA,則它能結合的mRNA上的密碼子是:
A.CATB.CAUC.UACD.TACE.不能確定2.與mRNA上ACG密碼子相應的tRNA反密碼子是:
A.UGCB.TGCC.GCAD.CGUE.CGT*細胞內含量最多的
RNA,占RNA總量的80%以上
三、核糖體RNA的結構與功能*rRNA的功能參與組成核糖體,作為蛋白質生物合成的場所。核糖體的結構核糖體的組成原核生物(以大腸桿菌為例)真核生物(以小鼠肝為例)小亞基30S40SrRNA16S1542個核苷酸18S1874個核苷酸蛋白質21種占總重量的40%33種占總重量的50%大亞基50S60SrRNA23S5S2940個核苷酸120個核苷酸28S5.85S5S4718個核苷酸160個核苷酸120個核苷酸蛋白質31種占總重量的30%49種占總重量的35%四、其他小分子RNA及RNA組學除了上述三種RNA外,細胞的不同部位存在的許多其他種類的小分子RNA,統(tǒng)稱為非mRNA小RNA(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs)。
snmRNAs的種類核內小RNA核仁小RNA胞質小RNA催化性小RNA小片段干涉RNA
snmRNAs的功能參與hnRNA和rRNA的加工和轉運。
研究細胞中snmRNAs的種類、結構和功能。同一生物體內不同種類的細胞、同一細胞在不同時間、不同狀態(tài)下snmRNAs的表達具有時間和空間特異性。RNA組學核酸的理化性質ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四節(jié)腺嘌呤1.DNA或RNA的定量A260=1.0,相當于50μg/ml雙鏈DNA40μg/ml單鏈DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸2.判斷核酸樣品的純度DNA純品:A260/A280比值=1.8RNA純品:A260/A280比值=2.0一、
A260的應用二、DNA的變性(denaturation)定義:在某些理化因素作用下,DNA雙鏈解開成兩條單鏈的過程。方法:過量酸,堿,加熱,尿素、酰胺、有機溶劑(如乙醇、丙酮)等。變性后理化性質變化:A260增高 粘度下降 生物活性喪失DNA變性的本質是雙鏈間氫鍵的斷裂例:變性引起紫外吸收值的改變DNA的紫外吸收光譜增色效應:DNA變性時其溶液A260增高的現(xiàn)象。熱變性熔解曲線:如果在連續(xù)加熱DNA的過程中以溫度對A260值作圖,所得的曲線。A260
紫外光吸收值達到最大值的50%時的溫度稱為DNA的熔點,又稱熔解溫度(meltingtemperature,Tm)。其大小與G+C含量成正比。A260三、DNA的復性與分子雜交DNA復性(renaturation)在適當條件下,變性DNA的兩條互補鏈可恢復天然的雙螺旋構象。熱變性的DNA經緩慢冷卻后即可復性,這一過程稱為退火(annealing)
。在DNA復性過程中,如果將不同種類的DNA單鏈分子或RNA分子放在同一溶液中,在適宜的條件(溫度及離子強度)下,就可以在不同的分子間形成雜化雙鏈(heteroduplex)。這種現(xiàn)象稱為核酸分子雜交。核酸分子雜交(hybridization)DNA-DNA雜交雙鏈分子不同來源的DNA分子核酸分子雜交的應用1.研究DNA分子中某一種基因的位置2.鑒定兩種核酸分子間的序列相似性3.檢測某些專一序列存在與否4.是基因芯片技術的基礎
核
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