生物信息學(xué)（0904Z2）專業(yè)培養(yǎng)方案

第頁生物信息學(xué)（0904Z2）一、學(xué)科簡介生物信息學(xué)是分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)等多學(xué)科交叉的新興學(xué)科。生命的復(fù)雜性迫使科學(xué)家需以整體觀來審視研究對象，得益于高通量技術(shù)的成熟，大規(guī)模測序、各種組學(xué)產(chǎn)生了海量數(shù)據(jù)。生物信息學(xué)的核心正是發(fā)展新算法，用于分析大樣本、高維、異構(gòu)復(fù)雜生物數(shù)據(jù)。我校生物信息學(xué)于2008年開始招收碩士研究生，2015年開始招收博士研究生(2007年始掛靠其他學(xué)科招收生物信息方向博士生)。本學(xué)科現(xiàn)有教師7人，均具博士學(xué)位，其中教授、博士生導(dǎo)師4人，湖南省“百人計(jì)劃”特聘教授1人，教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃1人，湖南省新世紀(jì)121人才工程人選2人，博士后5人。經(jīng)過近10年的不懈努力，現(xiàn)已步入發(fā)展快車道。近5年主持國家自然科學(xué)基金、教育部博士點(diǎn)基金、湖南省杰出青年基金、中國博士后基金等省部級以上課題23項(xiàng)。2010年以來在BMCBioinformatics、BMCMedicalGenomics、Genomics、Genetics等重要期刊發(fā)表SCI論文63篇。2012年以來申請發(fā)明專利與軟件著作權(quán)登記5項(xiàng)，獲國家科技進(jìn)步獎二等獎、湖南省自然科學(xué)獎二等獎、高等學(xué)?？茖W(xué)研究優(yōu)秀成果二等獎各一項(xiàng)。研究生培養(yǎng)成效顯著。獲省優(yōu)碩士論文3篇，校優(yōu)博士論文2篇，校優(yōu)碩士論文7篇，研究生國家獎學(xué)金5人次，省研究生創(chuàng)新項(xiàng)目7人次，全國研究生數(shù)學(xué)建模競賽獲獎3人次，省研究生數(shù)學(xué)建模競賽獲獎6人次，2014年獲PMI和IBM組織的IMPROVERSpeciesTranslation國際挑戰(zhàn)賽第一名。二、培養(yǎng)目標(biāo)1.掌握馬克思主義基本原理、中國特色社會主義理論、科學(xué)發(fā)展觀；熱愛祖國，擁護(hù)黨的領(lǐng)導(dǎo)，遵紀(jì)守法，品德優(yōu)良，具有正確的世界觀、人生觀和價(jià)值觀，培育和踐行社會主義核心價(jià)值觀，具有嚴(yán)謹(jǐn)?shù)闹螌W(xué)態(tài)度，恪守學(xué)術(shù)道德行為規(guī)范，積極為社會主義現(xiàn)代化建設(shè)服務(wù)。2.培養(yǎng)全面了解生物信息學(xué)科的發(fā)展方向、國際學(xué)術(shù)研究前沿和動態(tài)，具備扎實(shí)寬廣的分子生物學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)等等基礎(chǔ)理論知識和系統(tǒng)深入的生物信息學(xué)專業(yè)知識，掌握至少一門外國語并有較好的聽說讀寫能力，掌握至少一門計(jì)算機(jī)語言編程技能與常用統(tǒng)計(jì)軟件、生物信息學(xué)軟件與數(shù)據(jù)庫應(yīng)用技能，具備獨(dú)立從事生物信息學(xué)教學(xué)與科研工作能力，能開展算法創(chuàng)新，并應(yīng)用于復(fù)雜生物數(shù)據(jù)分析、模式識別與預(yù)測、統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)與遺傳學(xué)等具體問題的高級生物信息學(xué)人才。3.身心健康，具有承擔(dān)本學(xué)科專業(yè)各項(xiàng)工作的良好體魄和素質(zhì)。三、研究方向1.復(fù)雜數(shù)據(jù)分析新算法：發(fā)展高維特征選擇、直接推理、多變量關(guān)聯(lián)分析、生物動力學(xué)等復(fù)雜生物數(shù)據(jù)分析新算法，應(yīng)用于高通量序列數(shù)據(jù)、表達(dá)數(shù)據(jù)的基因功能解析與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析等。2.模式識別與預(yù)測：定量構(gòu)效關(guān)系、定量序效模型、藥物設(shè)計(jì)、圖像識別、生物信息學(xué)信號位點(diǎn)識別、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測、多維時間序列預(yù)測等。3.統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)與遺傳學(xué)：基因組水平的比較與進(jìn)化、植物數(shù)量性狀的QTL作圖、全基因組關(guān)聯(lián)分析等。四、課程設(shè)置課程類別課程編碼課程名稱學(xué)分學(xué)時開課學(xué)期開課學(xué)院考核方式備注公共學(xué)位課b100000001中國馬克思主義與當(dāng)代2361學(xué)期馬院考試b100000002基礎(chǔ)英語2601學(xué)期外語院考試專業(yè)學(xué)位課b309040003專業(yè)英語1151學(xué)期植保院考試按一級學(xué)科開設(shè)b30904z204高級生物信息學(xué)2301學(xué)期植保院考試b30904z205生物信息學(xué)研究進(jìn)展專題2301學(xué)期植保院考試b309040006植物保護(hù)學(xué)科前沿1151學(xué)期植保院考試b30904z207生物信息學(xué)研究生班討論2301-5學(xué)期植保院考查專業(yè)選修課b40904z208高級復(fù)雜數(shù)據(jù)分析2301學(xué)期植保院考查選修課累計(jì)學(xué)分不少于2學(xué)分b40904z209基因組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)2301學(xué)期植保院考查b409040019應(yīng)用生態(tài)學(xué)2301學(xué)期植保院考查公共選修課b200000001馬克思主義經(jīng)典著作選讀2361學(xué)期馬院考查b200000002學(xué)術(shù)論文寫作與發(fā)表1151學(xué)期按門類開考查b200000003知識產(chǎn)權(quán)2301學(xué)期公法院考查其他選修課在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，研究生根據(jù)需要，從全校公共選修課和其他專業(yè)研究生課程中選修。補(bǔ)修課以同等學(xué)力或跨學(xué)科門類錄取的博士生至少應(yīng)補(bǔ)修本學(xué)科碩士生主干課程3門，不計(jì)學(xué)分，中期考核前完成。

五、必讀書目序號書目名稱作者、書號、出版時間1分子生物學(xué)(影印本第2版)Turner等，科學(xué)出版社，20052基因VIIIBenjaminLewin著，余龍主譯，科學(xué)出版社，20053生物信息學(xué)：序列與基因組分析DavidWMount著，曹志偉譯，科學(xué)出版社，20064IntroductionofPopulationGeneticsTheoryJamesF.Crow等著，TheBlackburnPress，20095BioinformaticsOxfordPress6BMCBioinformaticsBioMedCentralLtd7GenomeResearch\o"[opensinanewwindow]"ColdSpringHarborLaboratoryPress8NucleicAcidsResearch