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分子生物學(xué)染色體與詳解演示文稿當(dāng)前1頁(yè),總共50頁(yè)。優(yōu)選分子生物學(xué)染色體與當(dāng)前2頁(yè),總共50頁(yè)。2.11原核生物基因組1)結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)煉
序列利用率高,不轉(zhuǎn)錄序列<5%,不編碼的序列也為調(diào)控序列2)存在轉(zhuǎn)錄單元
操縱子和多順反子*(注意與蛋白前體的區(qū)別)3)連續(xù)基因
當(dāng)前3頁(yè),總共50頁(yè)。2.12真核生物基因組
&染色體(Chromosome)
(1)單一序列和低度重復(fù)序列(各種基因)中度重復(fù)序列(rRNA,tRNA,結(jié)構(gòu)基因)高度重復(fù)序列(衛(wèi)星DNA)編碼基因的DNA所占比例很小,
功能?當(dāng)前4頁(yè),總共50頁(yè)。(2)不連續(xù)基因
內(nèi)含子和外顯子
(3)多倍體
*C值反?,F(xiàn)象(C-valueparadox)C值是一種生物的單倍體基因組DNA的總量。高等生物一般C值高于低等生物,但有例外。即C值反?,F(xiàn)象。兩棲類比哺乳類高。(真核生物含有大量的重復(fù)DNA是原因)當(dāng)前5頁(yè),總共50頁(yè)。(4)形成核小體染色體(染色質(zhì))*DNA1*RNA0.1
*
蛋白質(zhì)
組蛋白
1(H1H2AH2BH3H4)
非組蛋白
0.6注意:原核,真核基因組都是由雙鏈DNA構(gòu)成.當(dāng)前6頁(yè),總共50頁(yè)。組蛋白的一般特性(1)進(jìn)化上的保守性(2)無(wú)組織特異性(3)肽鏈氨基酸分布的不對(duì)稱性堿性氨基酸分布在N端的半條鏈上.如N端的靜電荷為16+,C端僅3+;堿性半條鏈與DNA負(fù)電荷區(qū)結(jié)合,另半條鏈與其他蛋白結(jié)合。(4)組蛋白的可修飾性在細(xì)胞周期特定時(shí)間可發(fā)生甲基化、乙?;⒘姿峄虯DP核糖基化等。H3、H4修飾作用較普遍,H2B有乙?;饔?、H1有磷酸化作用。當(dāng)前7頁(yè),總共50頁(yè)。非組蛋白的一般特性(1)多樣性(有30~600種)(2)組織特異性(3)種屬特異性當(dāng)前8頁(yè),總共50頁(yè)。串珠模型DNA+組蛋白核小體螺旋體(30nmfiber)超螺旋體(300nmloop)染色體(人類總DNA長(zhǎng)度=180cm)146bp,八聚體,1.75圈,縮短7倍螺旋化,縮短6倍進(jìn)一步螺旋化,縮短40倍盤繞.縮短4倍當(dāng)前9頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前10頁(yè),總共50頁(yè)。2.13病毒基因組病毒基因基因組很小,但是不同的病毒之間相差亦甚大。
(3kb乙肝病毒—300kb痘病毒)2.病毒基因組可以由DNA組成,也可以由RNA組成;每種病毒顆粒中只含有一種核酸,或?yàn)镈NA或?yàn)镽NA,兩者一般不共存于同一病毒顆粒中。3.組成病毒基因組的DNA和RNA可以是單鏈的,也可以是雙鏈的,可以是閉環(huán)分子,也可以是線性分子。當(dāng)前11頁(yè),總共50頁(yè)。4.多數(shù)RNA病毒的基因組是由連續(xù)的核糖核酸鏈組成,但也有些病毒的基因組RNA由不連續(xù)的幾條核酸鏈組成。5.病毒基因組的大部分是用來(lái)編碼蛋白質(zhì)的,只有非常小的一部份不被翻譯.6.存在重疊基因(線粒體和葉綠體DNA也有)7.反轉(zhuǎn)錄病毒基因組有兩個(gè)拷貝(雙倍體)其它病毒基因組都是單倍體。8.細(xì)菌病毒(噬菌體)的基因是連續(xù)的;真核細(xì)胞病毒的基因可能是不連續(xù)的,具有內(nèi)含子.
當(dāng)前12頁(yè),總共50頁(yè)。2.2DNA的結(jié)構(gòu)2.21DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)2.22DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)2.23DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)當(dāng)前13頁(yè),總共50頁(yè)。2.21DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)1.一級(jí)結(jié)構(gòu)的概念
指4種脫氧核苷酸(A,T,G,C)的連接及其排列順序,DNA序列是這一概念的簡(jiǎn)稱。由于核苷酸之間的差異僅僅是堿基的不同,故可稱為堿基序列。
2.一級(jí)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)
(1)脫氧核糖和磷酸通過(guò)5’-3’磷酸二酯鍵交替連接,構(gòu)成外側(cè)DNA骨架,堿基排在內(nèi)側(cè);(2)內(nèi)側(cè)堿基通過(guò)氫鍵互補(bǔ)配對(duì)(A=T,G三C),形成雙鏈;
(3)堿基(對(duì))的順序產(chǎn)生了DNA分子的多樣性(遺傳信息);(4)雙鏈反向平行配對(duì).(*DNA通常以線性或環(huán)狀形式存在,絕大多數(shù)DNA分子都由堿基互補(bǔ)的雙鏈構(gòu)成,有少數(shù)生物以單鏈形式存在,如某些噬菌體和病毒)當(dāng)前14頁(yè),總共50頁(yè)。核苷酸當(dāng)前15頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前16頁(yè),總共50頁(yè)。3′5′磷酸二酯鍵5′3′當(dāng)前17頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前18頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前19頁(yè),總共50頁(yè)。2.22DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的要點(diǎn)
指二條多核苷酸鏈反向平行盤繞所產(chǎn)生的雙螺旋立體結(jié)構(gòu)主鏈(backbone):由脫氧核糖和磷酸基通過(guò)酯鍵交替連接而成。主鏈有二條,它們似"麻花狀繞一共同軸心以右手方向盤旋,相互平行而走向相反形成雙螺旋構(gòu)型。主鏈處于螺旋的外則,這正好解釋了由糖和磷酸構(gòu)成的主鏈的親水性。所謂雙螺旋就是針對(duì)二條主鏈的形狀而言的。堿基對(duì)(basepair):堿基位于螺旋的內(nèi)則,它們以垂直于螺旋軸的取向通過(guò)糖苷鍵與主鏈糖基相連。同一平面的堿基在二條主鏈間形成堿基對(duì)。配對(duì)堿基總是A與T和G與C。堿基對(duì)以氫鍵維系,A與T間形成兩個(gè)氫鍵。大溝和小溝:大溝和小溝分別指雙螺旋表面凹下去的較大溝槽和較小溝槽。在大溝和小溝內(nèi)的堿基對(duì)中的N和O原子朝向分子表面。結(jié)構(gòu)參數(shù):螺旋直徑2nm;螺旋周期包含10對(duì)堿基;螺距3.4nm;相鄰堿基對(duì)平面的間距0.34nm。
當(dāng)前20頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前21頁(yè),總共50頁(yè)。3.4nm當(dāng)前22頁(yè),總共50頁(yè)。1.B-DNA最常見的DNA構(gòu)象;2.A-DNA出現(xiàn)DNA-RNA雜交分子中,與基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)有關(guān).3.Z-DNA基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控(近----抑制;遠(yuǎn)-----促進(jìn))DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的多態(tài)性
右手螺旋:A-DNA,B-DNA*,左手螺旋:Z-DNA當(dāng)前23頁(yè),總共50頁(yè)。ABZ當(dāng)前24頁(yè),總共50頁(yè)。
DNA的基本理化特點(diǎn)1)DNA的變性和復(fù)性變性(Denaturation)
DNA雙鏈的氫鍵斷裂,最后完全變成單鏈的過(guò)程稱為變性。
增色效應(yīng)(Hyperchromaticeffect)在變性過(guò)程中,260nm紫外線吸收值先緩慢上升,當(dāng)達(dá)到某一溫度時(shí)驟然上升,稱為增色效應(yīng)。融解溫度(MeltingtemperatureTm)
變性過(guò)程紫外線吸收值增加的中點(diǎn)稱為融解溫度。生理?xiàng)l件下為85~95OC影響因素:G+C含量,pH值,離子強(qiáng)度,尿素,甲跣胺等當(dāng)前25頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前26頁(yè),總共50頁(yè)。復(fù)性(Renaturation)熱變性的DNA緩慢冷卻,單鏈恢復(fù)成雙鏈。復(fù)性出現(xiàn)減色效應(yīng)(Hypochromaticeffect)。復(fù)性的速率與DNA的濃度和序列的復(fù)雜性有關(guān)。當(dāng)前27頁(yè),總共50頁(yè)。(三)DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)超螺旋結(jié)構(gòu)是DNA高級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式。分為:正超螺旋負(fù)超螺旋當(dāng)前28頁(yè),總共50頁(yè)。雙螺旋DNA擰緊則導(dǎo)致正超螺旋,而雙螺旋DNA的松開導(dǎo)致負(fù)超螺旋。超螺旋DNA分子比松散分子能量高。對(duì)于負(fù)超螺旋,這一能量會(huì)使DNA螺旋易于局部解旋,負(fù)超螺旋有利于需要解旋過(guò)程的進(jìn)行,如轉(zhuǎn)錄起始和復(fù)制起始。當(dāng)前29頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前30頁(yè),總共50頁(yè)。2.3DNA的復(fù)制一.DNA復(fù)制的基本條件:
模板、dNTP、RNA引物、酶等。
二.
DNA復(fù)制的特點(diǎn):1.半保留復(fù)制2.半不連續(xù)復(fù)制3.復(fù)制起點(diǎn)固定
三.
DNA復(fù)制的主要方式:1.線性DNA雙鏈的復(fù)制2.環(huán)狀DNA雙鏈的復(fù)制當(dāng)前31頁(yè),總共50頁(yè)。①拓?fù)洚悩?gòu)酶(Topoisomerase):主要功能是消除DNA解鏈過(guò)程中所產(chǎn)生的扭曲力。②解鏈酶(Helicase):將DNA母鏈不斷解開形成單鏈。③單鏈結(jié)合蛋白(SSB):使新解鏈的DNA保持穩(wěn)定結(jié)構(gòu)。
DNA復(fù)制時(shí)的一些重要酶和蛋白質(zhì)當(dāng)前32頁(yè),總共50頁(yè)。④引物酶(Primases):為DNA復(fù)制提供RNA引物。⑤DNA聚合酶(polymerases):合成新生DNA鏈,切除RNA引物。⑥D(zhuǎn)NA連接酶(Ligases):使新生DNA鏈上的缺口(3'-OH,5′-p)生成磷酸二酯鍵。當(dāng)前33頁(yè),總共50頁(yè)。二.
DNA復(fù)制的特點(diǎn)1958年Meselson和Stahl所做的實(shí)驗(yàn):15N標(biāo)記培養(yǎng)基,CsCl離心密度標(biāo)記(0);14N培養(yǎng)基培養(yǎng)3代。1.半保留復(fù)制當(dāng)前34頁(yè),總共50頁(yè)。1.新鏈同時(shí)合成方向5’3’2.前導(dǎo)鏈,
滯后鏈{岡崎片段1000bp~2000bp(大腸桿菌),100~200bp(真核生物)}3.RNA引物的合成;DNA鏈的延伸;引物的切除,缺口補(bǔ)平,連接.半不連續(xù)復(fù)制當(dāng)前35頁(yè),總共50頁(yè)。半不連續(xù)復(fù)制DNA復(fù)制動(dòng)畫:
當(dāng)前36頁(yè),總共50頁(yè)。復(fù)制起點(diǎn)固定
1原核一個(gè)復(fù)制子,真核多個(gè)復(fù)制子
2.一個(gè)復(fù)制子,(一般)兩個(gè)復(fù)制叉;3.前導(dǎo)鏈,滯后鏈相對(duì)
4.在一個(gè)復(fù)制周期中,真核為一次;原核可同時(shí)進(jìn)行多次復(fù)制,形成多個(gè)復(fù)制叉當(dāng)前37頁(yè),總共50頁(yè)。當(dāng)前38頁(yè),總共50頁(yè)。三.復(fù)制的幾種主要方式1.線性DNA雙鏈的復(fù)制①單一起點(diǎn)的單向復(fù)制。(如腺病毒)當(dāng)前39頁(yè),總共50頁(yè)。③多個(gè)起始點(diǎn)的雙向復(fù)制(如真核生物)②單一起點(diǎn)的雙向復(fù)制(如T7噬菌體)當(dāng)前40頁(yè),總共50頁(yè)。2環(huán)狀DNA雙鏈的復(fù)制①θ型復(fù)制(如大腸桿菌)---單一起點(diǎn)的雙向等速?gòu)?fù)制③D-環(huán)型復(fù)制(單向)-----線粒體②滾環(huán)型復(fù)制(單向)—ΦX174當(dāng)前41頁(yè),總共50頁(yè)。eg原核大腸桿菌1雙鏈環(huán)狀DNA2.DNA復(fù)制形式為θ型3.定點(diǎn)(ori)開始雙向等速?gòu)?fù)制4.兩個(gè)復(fù)制叉在距起始點(diǎn)1800處會(huì)合(Ter-Tus復(fù)合物阻止復(fù)制叉的移動(dòng))。5.只有一個(gè)復(fù)制單元,但可有多個(gè)復(fù)制叉。當(dāng)前42頁(yè),總共50頁(yè)。大腸桿菌DNA聚合酶
聚合酶Ⅰ
聚合酶Ⅱ聚合酶Ⅲ酶活性5′→3′聚合作用+++3′→5′外切酶活性+++5′→3′外切酶活性+--構(gòu)成(亞基數(shù))單體單體多亞基生物學(xué)活性10.0515
功能修復(fù)合成、校對(duì)校對(duì)復(fù)制去除引物、填補(bǔ)空隙修復(fù)校對(duì)
當(dāng)前43頁(yè),總共50頁(yè)。真核生物的DNA復(fù)制1.細(xì)胞周期的S期;2.多個(gè)復(fù)制起點(diǎn)(ARS);3.復(fù)制周期中,只完成一次復(fù)制;4.不同的復(fù)制子按一定的時(shí)序啟動(dòng)5.端粒的復(fù)制當(dāng)前44頁(yè),總共50頁(yè)。真核生物DNA聚合酶
聚合酶αβγδε
5′→3′聚合作用+++++3′→5′外切作用--+++5′→3′外切作用-----細(xì)胞內(nèi)定位核核線粒體核核功能復(fù)制引發(fā)修復(fù)復(fù)制復(fù)制復(fù)制DNA聚合酶δ是負(fù)責(zé)DNA復(fù)制主要的酶,參與先導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成。而DNA聚合酶ε的功能是補(bǔ)全去掉RNA引物后的缺口。
聚合酶αβγδε
5′→3′聚合作用+++++3′→5′外切作
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