藥物研發(fā)技術平臺系統(tǒng)解決方案

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供應商：基因有限公司聯(lián)系人：XXX：

蛋白水平

個體水平

細胞水平

基因水平

組織水平

第一部分藥物研發(fā)總體技術路線

第二部分藥物研發(fā)平臺的硬件組成

amnis

第三部分各儀器平臺的功能介紹和技術優(yōu)勢

一、基因水平

1.Affymetrix的小鼠cyto芯片（SNP+CNV）、DMET芯片、表達譜芯片

【功能介紹】

請補充！

DMET芯片

Affymetrix推出的DMET?PlusPremierPack（DrugMetabolizingEnzymesandTransporters，DMET)能夠分析FDA驗證的225個基因中1936個藥物代謝生物標志物，目前經PharmaADMEgroup定義的ADME藥物代謝標志物中的90%以上的標志物都能夠在該芯片得到分析，結合分析軟件自動解釋和以starnomenclature形式給出數(shù)據(jù)，能夠方便整合到臨床試驗流程中。這些生物標志物包括：common/rareSNPs,insertions,deletions,tri-alleles,copynumber。

“十一五”國家高技術研究進展打算（863打算）生物和醫(yī)藥技術領域“常見重大疾病全基因組關聯(lián)分析和藥物基因組學研究”中，國家投2億巨資舉行精神疾病、高血壓、糖尿病、食管癌和肺癌的全基因組關聯(lián)分析和藥物基因組學研究，其中疾病的藥物基因組學部分采納的要緊技術平臺之一算是DMET芯片技術。

【技術優(yōu)勢】

二、蛋白水平

1.PTI多肽合成儀

【功能介紹】

【技術優(yōu)勢】

2.Bioscale生物分析儀

【功能介紹】

【技術優(yōu)勢】

3.SAWSam5生物傳感器

【功能介紹】

【技術優(yōu)勢】

4.Digilab公司蛋白質組學產品

ProPicII全自動蛋白斑點切取工作站

【功能介紹】

Digilab公司旗下InvestigatorTMProPicII工作

站要緊用于2D蛋白凝膠上蛋白質點的成像分析，自動

切取，可對考馬斯亮藍、銀染、熒光染群以及DIGE蛋

白凝膠舉行操作，是目前切割精度最高，功能最靈便

的蛋白切膠系統(tǒng)。

【技術優(yōu)勢】

1.可對考馬斯亮藍、銀染、熒光染群的蛋白凝膠舉行

切?。?/p>

2.自動化程度高，集凝膠成像和切割為一體，大大提

高切割準確性；

3.切割精度高,XYZ軸機械切割精度10μm，為同類產

品中最高；

4.切取速度200個/小時,成像和切割面積:28X24cm;

可并且切割1塊大膠或4塊小膠；

5.主機可放置6塊96孔板,可一批切割6X96個膠塊；

6.配備16位高分辨率冷CCD成像系統(tǒng)，對找尋低豐度蛋白更為有效；

7.儀器內部含HEPA過濾,有效防止角蛋白污染和其它的污染；

8.內置凝膠水合裝置，有效幸免凝膠變干；

9.能夠切割一般1D,2D膠,也可切割plastic膠(粘于膠

板),很靈便；

10．系統(tǒng)內部溫度和濕度能夠操縱，保證切割過程中膠

不可能干燥收縮，而妨礙切點精度；

11.可由軟件分析自動生成蛋白質點切取列表，亦可經過手動的point-click模式生成切取列表，在8小時的操作周期內無需專人治理，徹底自動化，結果可靠；

ProPrepII蛋白酶解點靶工作站

【功能介紹】

ProPrepII是Digilab公司旗下GenomicSolutions公司的第三代新型蛋白酶解點樣工作站。它可以自動完成凝膠蛋白質點酶解及酶解后樣品的濃縮，脫鹽和MALDI板點樣等一系列過程，經過4個樣品針頭并且操作使得實驗結果高效和自動化。酶解后的樣品適用于多種后續(xù)分析，包括將樣品轉移至LC－MS（液相群譜）和CE（毛細管電泳），尤其適用于質譜分析，如MALDITOF和MS/MS。該系統(tǒng)的酶解和MALDI點樣兩個操作過程能夠分開單獨舉行，也能夠整合成一具完整的過程舉行自動化操作。

系統(tǒng)的蛋白酶解功能能夠從2D或SDS膠上切取膠塊的自動化酶解以及MALDI的點樣。經過反應程序的設定，從而實現(xiàn)酶解過程中的脫群，還原，烷基化，清洗，加酶和恒溫孵育等多個步驟循環(huán)，從而有組于蛋白酶解的效率，提高蛋白質譜分析的成功率。系統(tǒng)的點樣要緊用于質譜分析前的蛋白樣品脫鹽、純化、濃縮、MALDI點樣,該系統(tǒng)能夠經過C18柱

反向洗脫原理將酶解樣品中的鹽和其它雜質去除，同時將蛋白高度濃縮，然后將蛋白樣品精確點到靶板上。點樣的靶板能夠舉行后續(xù)的質譜分析，該系統(tǒng)能夠提高蛋白質譜分析的成功率。并且，系統(tǒng)也能夠將酶解產物轉移至LC-MS.

【技術優(yōu)勢】

1.在同一儀器內完成自動化、高通量的蛋白質點酶解和點樣工作系統(tǒng)；

2.自動完成脫群，還原，烷基化，清洗，加酶和恒溫孵育以及點樣工作；

3.可以并且舉行96個樣品反應,每輪反應時刻為6.5小時；

4.操作空間密封，有特意的密封罩；

5.內部要求HEPA過濾的超凈環(huán)境，防止樣品受到操作者和環(huán)境污染；

6.內置微處理器精確操縱膠內酶解反應條件；

7.單向流技術，使細小膠塊不可能Tip頭吸走，保證膠塊100％別損失；

8.廢液直截了當從孔板底部排出，別經過Tip頭回吸，幸免交叉污染；

9.能夠將蛋白酶解產物脫鹽、純化、濃縮、點樣到任何商品化的MALDItargets；

10.可對反應精確操縱，多肽反向洗脫提高樣品純度，增加質譜檢測靈敏度；

11.軟件操作方便，可依照用戶需要舉行定制；

三、細胞水平

1.AmnisImagestreamX高分辨率顯微成像流式細胞儀

【功能介紹】

ImageStreamX是一種臺式多譜段成像流式細胞儀（MultispectralImagingFlowCytometry），可以最多并且采集12個檢測通道中的細胞圖像（圖一）。它將流式細胞檢測與熒光顯微成像結合于一身，既能提供細胞群的統(tǒng)計數(shù)據(jù)，又能夠獲得單個細胞的圖像，從而提供細胞形態(tài)學、細胞結構和熒光亞細胞信號分布的信息。與傳統(tǒng)流式細胞儀非常類似，ImageStreamX

也是由液流系統(tǒng)，光學系統(tǒng)和電子系統(tǒng)等三大部分組成(圖一)。液流系統(tǒng)將樣本細胞懸液和系統(tǒng)鞘液注入流淌室中，使細胞在鞘液流的約束下聚焦在液流的中心，逐個流過檢測窗口。光學系統(tǒng)中光源照耀經過檢測窗口的細胞，從而產生光信號。光源分為兩種，其一是用于產

生明場細胞圖像的鹵燈（BrightfieldIlluminator），另一種是用于產生熒光細胞圖像的激光器。光源照耀細胞產生的光信號被具有非常大數(shù)值孔徑（NA：0.75）的物鏡收集，然后經過光路系統(tǒng)傳遞到由二向XXX鏡構成的濾光片堆棧（DichroicFilterStack）。光信號在這個地方被分成別同波段投射到一具或者兩個六通道CCD上，產生一具明場細胞圖像，一具暗場細胞圖像（SideScatter，SSC）及最多十個別同熒光通道的細胞圖像。ImageStreamX的光路系統(tǒng)可以自動調整焦距，并實時測定細胞運動速度，而其CCD采納時刻延遲積分方式（TimeDelayIntegration，TDI）舉行信號采集，上述這些手段保證了系統(tǒng)采集到的細胞圖像的質量。

圖一，ImageStreamX流式細胞成像系統(tǒng)工作原理

圖二，IDEAS分析軟件界面

ImageStreamX系統(tǒng)配有功能強大的數(shù)據(jù)分析軟件IDEAS，具備以下幾大特點：（1）直觀化的流式分析：每一具分析的細胞都能看到響應的圖片，利于更加準確的對細胞亞群舉行設門；（2）高內涵分析：軟件能夠對每個細胞分析近1000種量化參數(shù)。這些參數(shù)別僅包括細胞整體的散射光和熒光信號強度，還包括對細胞形態(tài)，細胞結構及亞細胞信號分布舉行統(tǒng)計學分析，真正實現(xiàn)細胞的高內涵分析，另外，使用者還可以依照自身研究的特別需要，舉行自定義參數(shù)的設定，舉行更深入的分析；（3）強大的流式分析工具：經過在細胞群體中對上述參數(shù)舉行統(tǒng)計，分析軟件能夠生成細胞群體的散點圖和柱狀圖，而這些統(tǒng)計數(shù)據(jù)與細胞圖像是徹底整合的，比如XXX散點圖上的點，就能夠直觀的看到那個點代表的細胞的圖像；（4）豐富的應用向導：軟件為眾多常用的分析提供了優(yōu)化好的應用向導，便于您分析數(shù)據(jù)；（5）靈便的圖像操作工具：重合圖像、顏群變換等豐富的圖像操作工具利于輸出報告和發(fā)表文章。

【技術優(yōu)勢】

ImageStreamX流式細胞成像系統(tǒng)結合了流式細胞檢測功能與熒光顯微成像功能，并整合

了功能強大的分析軟件，對每一具細胞舉行高內涵分析，幾乎可應用于細胞分析的所有領域，

深化和拓展了流式細胞術的應用。

熒光信號亞細胞定位統(tǒng)計學分析

ImageStreamX為每一具細胞提供最多12張圖像，同時在圖像的基礎上計算出了上千個特征參數(shù)。所以ImageStreamX別僅能檢測熒光強度，而且能分辨熒光信號的亞細胞定位。這大大拓展了流式分析的應用領域，如蛋白質核轉位、蛋白質共定位和細胞內吞研究等領域，相比于顯微鏡觀看分析的辦法，ImageStreamX對熒光信號亞細胞定位實行嚴格的參數(shù)化界定，使得所有分析有了一具客觀統(tǒng)一的標準，同時能在短時刻內輕松實現(xiàn)上萬個細胞的統(tǒng)計學分析。

●混合細胞中某一細胞亞群的熒光亞細胞定位統(tǒng)計學分析

傳統(tǒng)技術關于混合細胞中某一細胞亞群的熒光亞細胞定位統(tǒng)計學分析，需要經過以下步

驟：

這種辦法別僅煩惱，同時肉眼統(tǒng)計的結果別夠客觀、數(shù)量有限，另外還存在非常多技術瓶頸：（1）流式細胞儀舉行分選非常難做到100%的純度；（2）在共聚焦顯微鏡下面觀看，可以使用的熒光染料很有限，只能使用那些相熒光強度對照較強的染料。

然而假如用ImageStreamX舉行分析就顯得很的方便，它可以在別舉行分選的事情下輕松實現(xiàn)對混合細胞中的每一具細胞亞群的熒光信號亞細胞定位統(tǒng)計學分析。

傳統(tǒng)流式細胞儀分選別同實驗條件處理細胞

顯微鏡觀看

肉眼觀看幾百個細

胞舉行統(tǒng)計分析

●藥物作用下分析全血白細胞中單核細胞和T細胞的NF-kB轉位

（1）ImageStreamX高速采集每個細胞的圖像。

（2）利用單核細胞和T細胞特異性表面標記CD14(PE)

和CD3(APCAF750)，將這兩種細胞鑒定出來。

（3）對每個細胞舉行NFkB(FITC)核轉位程度分析。利用

IDEAS分析軟件預置的Similarity參數(shù)（即兩群熒光像素

空間分布的一致性，相似性越高，轉位程度越高），通

過分析算NFkB和細胞核(DAPI)的Similarity值，能夠準確

地統(tǒng)計出NFkB核轉位陽性細胞亞群所占比例。

相關文獻：

1.LyticGranuleLoadingofCD8+TCellsIsRequiredforHIV-InfectedCellEliminationAssociatedwith

ImmuneControl.Immunity.2008Dec19;29(6):1009-21.Epub2008Dec8

2.AutophosphorylationdockingsiteTyr867inMertkallowsfordissociationofmultiplesignalingpathwaysfor

phagocytosisofapoptoticcellsanddowXXXodulationofLPS-inducibleNF-κBtranscriptionalactivation.JBiolChem.2008Feb8;283(6):3618-27.Epub2007Nov26

3.TemporalDissectionofT-betFunctions.JImmunol.2007Mar