基于微衛(wèi)星標記的個地方雞種遺傳多樣性保護等級分析

基于微衛(wèi)星標記的個地方雞種遺傳多樣性保護等級分析第1頁/共32頁1、摘要2、材料3、方法4、結果5、分析與討論第2頁/共32頁摘要【目的】分析我國地方雞品種資源的遺傳多樣性保護等級，為我國地方雞種資源遺傳多樣性保護方案的制定提供理論依據(jù)。【方法】采用１６個微衛(wèi)星標記，計算我國１２個地方雞品種（白耳雞、茶花雞、大骨雞、河南斗雞、絲羽烏骨雞、固始雞、狼山雞、鹿苑雞、藏雞、仙居雞、蕭山雞、北京油雞）間的ＤＲ遺傳距離、基因流（Ｎｍ）、雜合度和各群體基因組分數(shù)的分布，并采用Ｗｅｉｔｚｍａｎ和Ｃａｂａｌｌｅｒｏ２種遺傳多樣性保護理論，分析各品種在遺傳多樣性最大化保護中的相對重要性?！窘Y果】固始雞與其他１１個雞種間的平均遺傳距離最遠（０．２０９５），基因流最?。ǎ保保矗保保?；藏雞與其他１１個雞種間的平均遺傳距離最近（０．１０１３），基因流最大（２．７７３０）。１２個地方雞種中，除蕭山雞、鹿苑雞和藏雞外，其他群體的基因組分數(shù)均大于０．８００。Ｗｅｉｔｚｍａｎ保種理論分析表明，固始雞、河南斗雞、茶花雞、絲羽烏骨雞、北京油雞對總群現(xiàn)實多樣性的品種貢獻率較高（＞１０％），這與這幾個雞品種獨特的特征特性和相對封閉的品種形成歷史基本一致。Ｃａｂａｌｌｅｒｏ保種理論分析表明，茶花雞、河南斗雞、北京油雞、絲羽烏骨雞、大骨雞、藏雞和蕭山雞對總群的遺傳多樣性有正的貢獻率，與Ｗｅｉｔｚｍａｎ保護理論確定的保護等級順序相比，固始雞、藏雞和蕭山雞的保護等級發(fā)生了較大改變，這與Ｗｅｉｔｚｍａｎ保護理論未考慮品種內的遺傳多樣性有關?！窘Y論】在分析家禽品種資源的遺傳多樣性保護等級時，應充分考慮品種間和品種內的遺傳多樣性。［關鍵詞］微衛(wèi)星；地方雞種；遺傳多樣性；保護等級第3頁/共32頁本研究擬采用Ｗｅｉｔｚｍａｎ和Ｃａｂａｌｌｅｒｏ２種保種理論，綜合評價我國１２個地方雞種在遺傳多樣性最大化保護中的相對重要性，以期為今后更合理地制定我國地方雞品種資源保護方案提供理論依據(jù)。第4頁/共32頁材料1、雞種白耳雞（ＢＡＩ）、茶花雞（ＣＨＡ）、大骨雞（ＤＡＧ）、河南斗雞（ＤＯＵ）、絲羽烏骨雞（ＷＵＧ）、固始雞（ＧＵＳ）、狼山雞（ＬＡＮ）、鹿苑雞（ＬＵＹ）、藏雞（ＴＩＢ）、仙居雞（ＸＩＡ）、蕭山雞（ＸＩＳ）和北京油雞（ＹＯＵ）,每個品種隨機抽?。矗爸唬犰o脈采血，酚／氯仿法提?。模危粒瑴y定含量和純度，稀釋到１００ｎｇ／μＬ，－２０℃保存?zhèn)溆?。?頁/共32頁十二種雞介紹白耳雞又名白耳銀雞、江山白耳雞、上饒地區(qū)白耳雞。產地（或分布）：主產于江西上饒地區(qū)廣豐、上饒、玉山三縣和浙江的江山市。白耳黃雞圖片集隨著江西省上饒市廣豐縣白耳黃雞原種場晉升為國家級畜禽遺傳資源保種場，白耳黃雞再次引起了新聞媒體的關注。12月2日，央視七套《科技苑》欄目組的2位編導深入該縣白耳黃雞原種場實地采訪。廣豐白耳黃雞是我國稀有的白耳黃雞品種，2001年被國家農業(yè)部首批確認為我國11個地方品種雞國家級資源保護品種。2005年，廣豐白耳黃雞作為亞洲第二例活體動物獲得國家原產地域保護產品認證。近幾年來，該縣大力實施白耳黃雞保護工程，制定并實施《白耳黃雞地方標準》等技術標準，建立了白耳黃雞原種場、技術推廣示范區(qū)，積極推進白耳黃雞的保護和開發(fā)。為我國稀有的白耳蛋用早熟雞品種。白耳黃雞以“三黃一白”的外貌特征為標準，即黃羽、黃喙、黃腳，白耳，耳葉大，呈銀白色，似白桃花瓣，虹彩金黃色，喙略彎，呈黃色或灰黃色，全身羽毛呈黃色，單冠直立，公母雞的皮膚和脛部呈黃色，無脛羽。初生重平均為37克，開產日齡平均為150天，年產蛋180枚，蛋重為54克，蛋殼深褐色，殼厚0.34～0.38毫米，蛋形指數(shù)1.35～1.38。第6頁/共32頁茶花雞尋常略大（雄鳥70厘米，雌鳥42厘米）的家雞野生祖先。雄鳥上體力具金屬光澤的金黃、橙黃或橙紅色，并具褐色羽干紋。臉部裸皮、肉冠及肉垂紅色，且大而顯著。飛羽褐黑色，具栗色外緣。尾羽黑色具金屬綠色光澤，中央兩枚尾羽最長，下垂如鐮刀狀。下體褐黑色。腳藍灰色。雌鳥上體大部黑褐色，上背黃色具黑紋，胸部棕色，往后漸變?yōu)樽鼗疑?。虹膜－紅色；嘴－角質色；腳－藍灰色。叫聲：只在春季繁殖季節(jié)鳴叫。雄鳥叫聲如gege--gege中間有一明顯停頓，最后的ge非常短，如家養(yǎng)公雞縮短的叫聲。體型近似家雞。頭具肉冠，喉側有一對肉垂，是本屬獨具的特征。雌雄異色。雄性羽色很像家養(yǎng)的公雞，最顯著的差別是頭和頸的羽毛狹長而尖，前面的為深紅色，向后轉為金黃色。這些狹尖的長羽，從頸向后延伸，覆于背的前部，比家雞更為華麗。尾羽和尾上覆羽均黑，并具金屬綠色反光，羽基白色，飛時特別明顯。雌性與家養(yǎng)的母雞相似，體形較雄性小，尾亦較短。頭和頸項黑褐綴紅；頸羽亦特長，軸部黑褐而具金黃色羽緣。

第7頁/共32頁大骨雞又稱莊河雞。大骨雞形成歷史悠久，據(jù)資料記載，早在二百多年以前，山東移民將山東大型的壽光雞帶入遼寧，與當?shù)仉u雜交，后經(jīng)當?shù)厝罕婇L期選育而成。主要產于遼寧省莊河市。分布于東溝、鳳城、金縣、新金、復縣等地。大骨雞是以蛋大為突出特點的兼用型地方雞種。具體大墩實，覓食力強，產蛋多而大，且蛋殼厚而堅實，肉質鮮嫩等特性。大骨雞曾與蒙古馬、秦川牛、長白豬并列中國農業(yè)的四大品牌，而且在上世紀50年代，還進入過教材書，甚至在國家級禽資源保護品種名錄里，位列11個雞種的第二位。第一位是九斤黃，而大骨雞則是200多年前，九斤黃與壽光雞和當?shù)赝岭u雜交出來的新品種。大骨雞體型大，胸深寬廣，背寬而長，腿高粗壯，腹部豐滿。公雞羽毛棕紅色，尾羽黑色并帶綠色光澤。母雞多呈麻黃色，頭頸粗壯，眼大而明亮。公雞單冠直立，母雞單冠、冠齒較小。冠、耳葉、肉垂呈紅色，嗓、胚、趾均呈黃色。大骨雞屬大型兼用型品種。第8頁/共32頁河南斗雞

屬觀賞型雞種。在中國斗雞品種中體型最大，數(shù)量最多，其胸、腿肌發(fā)達，可作為肉雞育種的原始素材。河南斗雞主產于河南省開封、鄭州、洛陽等縣市。2002年存欄10萬只。外貌特性

頭半棱形，冠型以豆冠為主。喙短粗，呈半弓形。羽色以青、紅、白三色為主色，三色羽之間相互交配形成青、紅、紫、皂、白、花等色。骨骼比一般雞種發(fā)達，最突出的是腦殼骨厚，是普通雞的二倍厚。胸骨長，腿襠較寬。成年雞體重：公3500克，母2000～3000克。第9頁/共32頁絲羽烏骨雞

別名：泰和雞、武山雞、白絨雞、竹絲雞產地（或分布）：產于江西泰和縣。福建省泉州市、廈門市和閩南沿海有分布。主要種質特性：絲羽烏骨雞屬藥用型雞種，以其具有潔白如雪的絲狀羽，皮膚、肌肉、骨膜皆烏和具有獨特的藥用價值而聞名國內外。還具有性情溫馴、不善飛躍、適應性強、外形美觀、肉質鮮嫩等特性。體型外貌：絲羽烏骨雞在國際標準中被列為觀嘗型雞種。其體型為頭小、頸短、腳矮、結構細致緊湊、體態(tài)小巧輕盈。其外貌具十大特征，也稱“十全”：桑棋冠冠屬草梅類型，在性成熟前為暗紫色似桑椹，成年以后色減退略帶紅色似荔枝。纓頭頭頂有一叢纓狀冠羽，母雞比公雞發(fā)達，狀如絨球，稱之為“鳳頭”。綠耳耳葉圣暗紫色，在性成熟前明顯呈藍綠色彩，成年后逐漸成為暗紫色。趾，也有個別的從第一趾再多生一趾成為六趾的。腳毛腹部和第四趾著生有脛羽和趾羽。烏皮全身皮膚以及眼、臉、喙、脛、趾均呈烏色。烏肉全身肌肉略帶烏色，內臟及腹脂膜均呈烏色。烏骨骨質暗烏，骨膜深黑色。第10頁/共32頁固始雞固始雞屬黃雞類型，具有產蛋多、蛋大殼厚、遺傳性能穩(wěn)定等特點，為蛋肉兼用雞。全區(qū)均有分布，以固始為最多。固始雞體軀呈三角形，羽毛豐滿，單冠直立，六個冠齒，冠后緣分叉，冠、岡揮、耳垂呈鮮紅色，眼大有神，味短呈青黃色。公雞毛呈金黃色，母雞以黃色、麻黃色為多。母雞長到180天開產，年產蛋為130-200枚，平均蛋重50克，蛋黃呈鮮紅色。成年公雞體重2.1公斤，母雞1.5公斤，為我國寶貴的家禽品種資源之一。特點固始雞有以下突出的優(yōu)良性狀：一是耐粗飼，抗病力強，適宜野外放牧散養(yǎng)；二是肉質細嫩，肉味鮮美，湯汁醇厚，營養(yǎng)豐富，具有較強的滋補功效；三是母雞產蛋較多，蛋大，蛋清較稠，蛋黃色深，蛋殼厚，耐貯運?；铍u及鮮蛋在明清時期為宮廷貢品，本世紀五十年代開始出口港澳，六、七十年代被指定為京、津、滬特供商品，贏得了“土雞之王”和“王牌蛋”的美譽。青嘴、青腿是固始雞的天然防偽標志。固始雞有青腳和烏骨兩個品系。第11頁/共32頁說起“狼山雞”，還流傳著一段有趣的故事。遠在1872年，一艘英國商船，停泊在南通附近的長江中，炊事員上岸買回一批黑雞做菜。因雞肉質細嫩，味道鮮美異常，船長甚感驚奇，如獲至寶，便將剩下的幾只帶回英國。后來這種黑雞竟然在英國家禽展覽會上展出，受到歐美各國養(yǎng)禽專家的青睞，獲得金質獎章。于是，歐、美、亞許多國家便從我國進口此雞。由于這些雞都從南通狼山出口，故取名“狼山雞”。建國后，狼山雞又曾作為種雞飛往德國、澳大利亞等國。一時，狼山雞身價百倍，中外馳名。第12頁/共32頁狼山雞是我國著名的蛋肉兼用型地方雞種，體格健壯，頭昂尾翹，具有典型的U字形特征；被毛緊密、有光澤；活潑好動，行動靈活。狼山雞按羽色可分黑、白兩種。狼山黑雞單冠直立，有5～6個冠齒；耳垂和肉髯均為鮮紅色；喙黑褐色，尖端顏色較淡；全身被毛黑色；成年公雞背部、尾部羽毛有墨綠色金屬光澤；脛、趾部均呈灰黑色，皮膚為白色。狼山黑雞初生雛頭部黑白絨毛相間，俗稱大花臉；背部為黑色絨羽，腹、翼尖部及下腭等處絨羽為淡黃色，這是狼山黑雞有別于其他黑色雞種的特征。狼山白雞雛雞羽毛為灰白色，成雞羽毛潔白。第13頁/共32頁藏雞喙多呈黑色，少數(shù)呈肉色或黃色。虹彩多呈橘色，黃栗色次之。耳葉多呈白色，少數(shù)紅白相間，個別紅色。脛黑色者居多，其次肉色，少數(shù)有脛羽。主、副翼羽、主尾羽和大鐮羽呈黑色帶金屬光澤，脛羽、蓑羽呈紅色或金黃色鑲黑邊羽，身體其他部位黑色羽多者稱黑紅公雞，紅色羽多者稱大紅公雞.此外，還有少數(shù)白色公雞和其他雜色公雞。母雞羽色較復雜，主要有黑麻、黃麻、褐麻等色，少數(shù)白色，純黑較少。但云南尼西雞則以黑色較多，白色麻黃花次之，尚有少數(shù)其他雜花、灰色等。初生重為28.1～30.8克，成年體重公雞為1145克，母雞為860.2克。第14頁/共32頁仙居雞是浙江省優(yōu)良的小型雞蛋地方品種，主要區(qū)在仙居縣及鄰縣。每年飼養(yǎng)量約50萬只以上，多分布在浙江省東南部地區(qū)，外省也有引種。該雞已有300多年的飼養(yǎng)歷史。對仙居雞的體重、體尺及公雞肉品質與屠宰性能進行測定,并對所涉及參數(shù)進行了相關性分析.結果表明:仙居雞平均體斜長、龍骨長、髖寬、脛長、脛圍分別為14.05cm、10.4cm、8.85cm、7.15cm、3.1cm;仙居公雞的屠宰率達90.97%,半凈膛率為80.16%,全凈膛率為63.27%,胸肌率7.7%,腿肌率14.2%;肉質參數(shù)(pH值、透光度、失水率、嫩度)中僅嫩度與pH值、透光度、龍骨長、脛長有中度相關;屠宰性能(體重、屠體重、半凈膛重、全凈膛重、胸肌及腿肌重)的各項指標間高度相關;龍骨長、脛長有中度相關;體尺指標(體斜長、龍骨長、髖寬、脛長、脛圍)的相關系數(shù)為0.424～0.885.第15頁/共32頁蕭山雞又名“越雞”、“沙地大種雞”，原產地是浙江省蕭山縣，是我國優(yōu)良的肉蛋兼用型品種，素以體型健碩，肉質鮮美而聞名，深受消費者青睞。特點由于蕭山雞腳黃、羽毛黃、皮肉黃，俗稱“三黃雞”，主產于瓜瀝、義蓬等沙地鄉(xiāng)鎮(zhèn)，分布于杭嘉湖及紹興地區(qū)。一般放養(yǎng)150多天，可以長到十多斤重，140-150天即將下蛋的蕭山雞母雞就是烹制叫花雞的原料。但是上世紀八九十年代，由于當?shù)胤N雞場實行企業(yè)化管理，個頭大、生長期長的蕭山雞逐漸被市場淘汰，蕭山雞就沒再進行保種和選育，處于瀕危狀態(tài)。蕭山雞一般成年公雞體重約3～3．5公斤，母雞約2公斤，閹雞達5公斤。胸部肌肉特別發(fā)達，兩腳粗壯結實，性活潑好動，喜覓活食。產區(qū)地處錢塘江沖積平原，農業(yè)發(fā)達，飼料豐富，又適宜雞群放養(yǎng)，加上當?shù)剞r民養(yǎng)雞經(jīng)驗豐富，故形成該雞成熟早、生長快、體形肥大、肉質細嫩、產蛋率高等特點。電孵生產的雛雞，飼養(yǎng)180天左右即能生蛋，年產120～150枚，枚重54～56克。蕭山雞具有較高的營養(yǎng)價值，雞肉脂肪含量較普通雞少，100克雞肉中含蛋白質23克，脂肪僅1克左右。成雞適時閹割，可加速生長，體形高大，俗稱"紅毛大閹雞"。蕭山雞營養(yǎng)豐富，對人體具有補益五臟、治脾胃虛弱之功效。民間以仔雞與黃芪燉服，對慢性肝炎、腰肌酸痛、神經(jīng)衰弱、氣虛盜汗、腎陽不足等癥有較好療效。第16頁/共32頁北京油雞是北京地區(qū)特有的地方優(yōu)良品種，距今已有300余年。北京油雞是一個優(yōu)良的肉蛋兼用型地方雞種。具特殊的外貌(即鳳頭、毛腿和胡子嘴)，肉質細致，肉味鮮美，蛋質佳良，生活力強和遺傳性穩(wěn)定等特性。數(shù)量：北京油雞（中華宮廷黃雞）2002年存欄6000只。主要特性：北京油雞（中華宮廷黃雞）屬蛋肉兼用型雞種。其中羽毛呈赤褐色（俗稱紫紅毛）的雞體型偏小；羽毛呈黃色（俗稱素黃色）的雞體型偏大。北京油雞（中華宮廷黃雞）初生雛雞全身披著淡黃或土黃色絨羽，冠羽、脛羽、髯羽也很明顯，體渾圓。北京油雞（中華宮廷黃雞）的羽毛厚密而蓬松，有冠羽、脛羽和髯羽，有些個體兼有趾羽。北京油雞（中華宮廷黃雞）多數(shù)個體的頜下或頰部生有髯須，冠型為單冠，冠葉小而薄，在冠葉的前段常形成一個小的“S”狀褶曲，冠齒不甚整齊。虹彩多呈棕褐色，喙各脛呈黃色，少數(shù)個體分生五趾。第17頁/共32頁鹿苑雞體型高大，體質結實，胸部較深，背部平直。公雞重3kg、母雞9kg左右，故有"鹿苑大雞"之稱。頭部冠小而薄，肉垂、耳葉亦小。眼中等大，瞳孔黑色，虹彩呈粉紅色，喙中等長、黃色，有的喙基部呈褐黑色。全身羽毛黃色，緊貼體軀，且使腿羽顯得比較豐滿。頸羽、主翼羽和尾羽有黑色斑紋。公雞羽毛色彩較濃，梳羽、蓑羽和小鐮羽呈金黃色，大鐮羽呈黑色，皆富有光澤、脛、趾黃色，兩腿間距離較寬，無脛羽。雛雞絨羽黃色。產區(qū)養(yǎng)雞歷來是分散飼養(yǎng)，每戶養(yǎng)母雞10余只，專養(yǎng)1只公雞，放牧混養(yǎng)，采取自由配種方式，并在春秋兩季進行由母雞孵化、育雛。在雞群公母配種比例1：15的情況下，采用人工孵化，種蛋的受精率為94．3%,受精蛋孵化率為87．23%。母雞就巢性較強，據(jù)對123只母雞統(tǒng)計，有就巢雞23只，占母雞總數(shù)的18．7%。近年各雞場通過選育，就巢率已有所下降。人工育雛時，30日齡育雛成活率在90%以上。第18頁/共32頁微衛(wèi)星引物2、１６個用于地方雞種遺傳多樣性研究的微衛(wèi)星基因座信息第19頁/共32頁方法STR1、定義短串聯(lián)重復(shorttandemrepeat,STR,SSR)，一種簡單串聯(lián)重復DNA序列。其重復單位為1～6個核苷酸，由10～50個重復單位串聯(lián)組成。微衛(wèi)星DNA是在研究DNA多態(tài)性標記過程中發(fā)現(xiàn)的。1981年Miesfeld等首次發(fā)現(xiàn)微衛(wèi)星DNA，雙核苷酸重復單位常為(CA)n和(TG)n。STR的核心序列為1～6bp,呈串聯(lián)重復排列,重復次數(shù)10~50次左右,其總長度常小于400bp,常見的有一、二、三、四核苷酸重復序列,約占真核生物基因組的5%。第20頁/共32頁實驗步驟

1.收集標本(血液或組織等標本)并提取DNA。

2.設計引物序列并擴增，瓊脂糖電泳檢測結果。

3.合成熒光標記引物。

4.進行PCR擴增，產物通過測序儀器電泳檢測,獲得擴增片段大小。

5.分析測序儀器讀出的數(shù)據(jù)，給結果圖譜。第21頁/共32頁STR用于遺傳學多態(tài)性研究STR標記多位于非編碼區(qū),變異一般不影響人體的結構與功能,突變在進化過程中受自然選擇壓力較小,以近乎穩(wěn)定的速率傳遞且不斷積累,形成多樣性。通過研究STR多態(tài)性,變異速率以及比較序列間差異、人群間差異,分析不同人群間的遺傳距離,就可從分子生物學角度揭示人類的起源、遷徙、進化等歷史進程。展望微衛(wèi)星DNA的研究近年來已取得了明顯進展,但微衛(wèi)星DNA標記還存在很多問題，如微衛(wèi)星DNA分子突變機制尚不完全清楚、PCR引物在不同物種間保守性較差、對于不同物種要進行特異性引物設計等，但微衛(wèi)星DNA仍然是研究當前種內遺傳變異中分辨率最高、揭示力最強的核DNA標記。相信隨著微衛(wèi)星DNA研究的不斷深入，微衛(wèi)星必將會在各個領域中有著更為廣泛的應用。第22頁/共32頁統(tǒng)計方法

各亞群的觀察雜合度、無偏雜合度和平均有效等位基因數(shù)利用Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ－Ｔｏｏｌｋｉｔ軟件進行計算；用ＦＳＴＡＴ軟件計算Ｆ－ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ統(tǒng)計量（Ｆｓｔ），基因流Ｎｍ由Ｆｓｔ＝１／（４Ｎｍ＋１）獲得，群體間的ＤＲ遺傳距離由ＰＨＹＬＩＰ軟件計算。采用Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ（Ｖ２．０）推斷各地方雞品種的基因組分數(shù)分布，采用混合模型（ＡｄｍｉｘｔｕｒｅＭｏｄｅｌ）進行分析，重復運行Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ程序２０次，每次在２００００Ｂｕｒｎ－ｉｎ基礎上運行５００００步。第23頁/共32頁輔助理解雜合度是指隨機抽取的樣本中其兩個等位基因不相同的可能性(Nei,1975)。期望雜合度主要是根據(jù)種群內當前優(yōu)勢等位基因的分布頻率來推算的,稀有基因的貢獻極其微弱遺傳學上的雜合度，用H表示:雜合性的一種狀態(tài)程度,反映一個位點具有兩個以上等位基因的狀態(tài)：H=1-Σpi

第24頁/共32頁等位基因數(shù)在數(shù)量性狀中，每對等位基的作用有積加的效應，如控制高度的基因，一個等位基因g平均可貢獻2cm的高度，G平均貢獻4cm的高度，gg純合貢獻4cm高度，Gg雜合可貢獻6cm高度，或者7cm，8cm的高度，GG純合可貢獻8cm的高度，它們的遺傳方差稱為加性遺傳方差（additivegeneticvariance）。若G對g有顯性作用，那么Gg將貢獻8cm，顯性作用使表型產生的方差稱顯性方差。若有非等位基因之間存在上位效應的話還必須考慮到上位方差，或稱為互作方差（interactionvariance）VI,因此遺傳方差是由下式表示：VG=VA+VD+VI遺傳距離衡量品種間若干性狀綜合遺傳差異大小的指標。育種目標所要求的性狀不止一個，為了能夠更全面地反映親本品種間的遺傳差異，需要對多個性狀綜合考慮，從而引伸出遺傳距離的概念。按多元統(tǒng)計分析方法計算品種間多個性狀基因型值構成的多維空間的幾何距離，就叫作品種間的遺傳距離?；蛄髦干飩€體從其發(fā)生地分散出去而導致不同種群之間基因交流的過程，可發(fā)生在同種或不同種的生物種群之間?；蛄鞯膹娙鹾统潭纫虿煌姆N或種群、不同的時間和地點而有很大差異，但其基本作用是消弱了種群間的遺傳差異。一般而言，鄰近種群基因頻率相似并不一定就是基因流產生的融合作用，也許是選擇壓力相同造成的；而鄰近種群間基因頻率出現(xiàn)較大差異，也不能說不存在基因流，這時自然選擇的作用超過了基因流，于是種群在強大的選擇壓力下，即使存在一定的基因流，還是發(fā)生了較大的遺傳分化。對植物種群而言，即使通過基因流實現(xiàn)了新基因的輸入，但由于生殖上的障礙（生殖隔離等），這種基因流并不能得以遺傳。第25頁/共32頁結果雜合度和等位基因數(shù)：藏雞的觀察雜合度最高（０．６９５９），等位基因數(shù)最多（６．１９）；固始雞的觀察雜合度最低（０．４９９２），等位基因數(shù)最少（３．９４）；１２個雞種的平均觀察雜合度為（０．６２３１），平均無偏雜合度為（０．６２７５），平均有效等位基因數(shù)為（５．０６）。ＤＲ遺傳距離和基因流固始雞與茶花雞、河南斗雞和狼山雞之間的ＤＲ遺傳距離較遠，分別為０．２７７５，０．２７５０和０．２５５２；就平均遺傳距離而言，固始雞與其他１１個雞種間的平均遺傳距離最遠（０．２０９５），其次為河南斗雞，藏雞與其他１１個雞種間的平均遺傳距離最近（０．１０１３）。蕭山雞與鹿苑雞（６．０９５２）、藏雞與茶花雞（５．４０５５）、藏雞與仙居雞（４．８６２５）之間的基因流較大；就平均基因流而言，藏雞與其他１１個雞種間的平均基因流最大（２．７７３０），其次為仙居雞，固始雞與其他１１個雞種間的平均基因流最?。ǎ保保矗保保５?6頁/共32頁基因組分數(shù)的分布Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ程序是一種基于多位點基因型和等位基因頻率數(shù)據(jù)推斷群體結構的模型分類法，每個推斷類別（Ｋ）均代表一組特定的基因型和等位基因頻率類型，其根據(jù)每一個被分析個體的位點基因型和等位基因頻率在所有推斷類別中的分布比例（即基因組分數(shù)，＞０．８００），確定個體所屬的品種類別，可用于分析各品種群體的遺傳背景（相對獨立或具有復雜的遺傳基礎）。采用Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ程序推斷的１２個地方雞種的群體基因組分數(shù)分布見表４。由表４可知，蕭山雞、鹿苑雞和藏雞群體的平均基因組分數(shù)在所屬推斷類別中均小于０．８００。遺傳多樣性貢獻率Ｗｅｉｔｚｍａｎ保種理論的分析結果表明，１２個地方雞種群體的現(xiàn)實多樣性為１．５７９２，固始雞、河南斗雞、茶花雞、絲羽烏骨雞對總群現(xiàn)實多樣性的品種貢獻率相對較高，且均超過１０％；鹿苑雞、藏雞和蕭山雞對總群現(xiàn)實多樣性的品種貢獻率較其他雞種小，且均低于５％。Ｃａｂａｌｌｅｒｏ保種理論的分析結果表明，茶花雞、河南斗雞、北京油雞、絲羽烏骨雞、大骨雞、藏雞和蕭山雞對總群遺傳多樣性有正的貢獻率，當該品種被從總群中移除時，分別會使總體遺傳多樣性減少０．９５６８％，０．５００９％，０．４９２９％，０．１１２９％，０．７７３８％，０．０４５２％和０．０２８２％。

第27頁/共32頁分析與討論１、Ｗｅｉｔｚｍａｎ遺傳多樣性保護等級分析Ｗｅｉｔｚｍａｎ遺傳多樣性保護理論是基于品種間遺傳距離，通過計算總群體現(xiàn)實多樣性及各品種對總群體現(xiàn)實多樣性的貢獻率來確定品種的優(yōu)先等級，以最大程度地保護資源群體間的遺傳多樣性。因此，Ｗｅｉｔｚｍａｎ保護理論對特征特性明顯、與其他品種間具有較大遺傳距離的品種給予最高保護等級。在本研究分析的１２個地方雞品種中，Ｗｅｉｔｚｍａｎ保護理論將固始雞、河南斗雞、茶花雞、絲羽烏骨雞、北京油雞列在品種保護等級的前列，與這幾個雞品種具有獨特的特征特性和相對封閉的品種形成歷史基本一致。上述品種與其他品種間較遠的遺傳距離、較少的基因流動及群體基因組分數(shù)在各自推斷類別