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文檔簡(jiǎn)介
第二章基因工程制藥2.4基因工程菌生長(zhǎng)代謝的特點(diǎn)一、比生長(zhǎng)速率μ(h-1)細(xì)胞生長(zhǎng)速率rX
:?jiǎn)挝粫r(shí)間內(nèi)細(xì)胞濃度的變化(g/L·h)。
X為細(xì)胞濃度,通常用單位體積培養(yǎng)液中所含細(xì)胞(或稱菌體)的干燥質(zhì)量(drycellweight,DCW)表示(g/L,gDCW/L)。培養(yǎng)過程中,細(xì)胞的生長(zhǎng)速率與細(xì)胞濃度成正比。2g/L4g/L10g/L20g/L生長(zhǎng)速率rX
:?jiǎn)挝粫r(shí)間內(nèi)細(xì)胞濃度的變化(g/L·h)
2g/L·h10g/L·h
1h-11h-11h2.5基因工程菌的穩(wěn)定性一、質(zhì)粒的不穩(wěn)定性(1)分裂不穩(wěn)定性工程菌分裂時(shí)出現(xiàn)一定比例不含質(zhì)粒的子代菌。
相關(guān)因素:質(zhì)粒的丟失率(宿主菌、質(zhì)粒特性和培養(yǎng)條件)含質(zhì)粒菌與不含質(zhì)粒菌的生長(zhǎng)速度差異(2)結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定
DNA從質(zhì)粒上丟失、質(zhì)粒上序列發(fā)生重排等。二、提高質(zhì)粒穩(wěn)定性的方法1.選擇合適的宿主菌株2.選擇合適的載體低拷貝數(shù)質(zhì)粒丟失的頻率較大含高拷貝數(shù)質(zhì)粒的菌比生長(zhǎng)速度明顯低于不含質(zhì)粒菌。3.加入抗生素二、提高質(zhì)粒穩(wěn)定性的方法4.分階段培養(yǎng)表達(dá)水平越高,重組質(zhì)粒越不穩(wěn)定。
二階段培養(yǎng):第一階段菌體生長(zhǎng)第二階段誘導(dǎo)表達(dá)5.控制培養(yǎng)條件
高比生長(zhǎng)速率下質(zhì)粒穩(wěn)定性明顯增加。培養(yǎng)基成分、溫度等培養(yǎng)條件對(duì)質(zhì)粒穩(wěn)定性也有影響。6.固定化
固定化適用于分泌表達(dá)的蛋白,對(duì)非分泌表達(dá)蛋白難以大規(guī)模采用。3、連續(xù)培養(yǎng)(continuousculture)培養(yǎng)開始時(shí)為分批培養(yǎng),培養(yǎng)至一定程度后,連續(xù)不斷的補(bǔ)加新鮮培養(yǎng)基同時(shí)排出等量培養(yǎng)液。一定時(shí)間后,細(xì)胞濃度和培養(yǎng)基中各種物質(zhì)濃度均保持不變?;蚬こ叹环€(wěn)定,很難連續(xù)培養(yǎng)。4、透析培養(yǎng)(dialysisculture)
通過透析除去乙酸。
E.coliHB101(pPAKS2)生產(chǎn)青霉素?;柑岣?1倍。二、基因工程菌的培養(yǎng)工藝1、培養(yǎng)基的影響
碳源:葡萄糖、甘油、乳糖、果糖等。氮源、無(wú)機(jī)鹽等其他成分。通過單因子實(shí)驗(yàn)、正交設(shè)計(jì)等方法優(yōu)化培養(yǎng)基組成,提高蛋白表達(dá)水平。2、接種量的影響
接種量小,延遲期長(zhǎng),菌容易老化,不利于蛋白表達(dá)。較大的接種量延遲期短,適于蛋白表達(dá)。接種量一般為5~15%。3、溫度的影響
溫度對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)理很復(fù)雜,對(duì)不同蛋白,最佳的誘導(dǎo)表達(dá)溫度不同。4、溶氧(dissolvedoxygen,DO)的影響
較高水平的DO(大于10~30%)的有利于蛋白表達(dá),供氧不足,產(chǎn)生乙酸。加大攪拌、增加氣流、提高氧分壓、提高罐壓??刂铺窃吹牧骷铀俣?。
恒溶氧發(fā)酵:通過以上手段控制DO在一恒定值。5、pH的影響
流加酸、堿調(diào)節(jié)pH。pH一般控制在6.8~7.6,少數(shù)例外。6、誘導(dǎo)時(shí)機(jī)的影響
一般在對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。三、高密度發(fā)酵理論上計(jì)算大腸桿菌發(fā)酵所能達(dá)到的最高菌體密度(干重)為400g/L,一般認(rèn)為最高的發(fā)酵密度(干重)為200g/L。目前培養(yǎng)所達(dá)到的最高密度是175g/L。高密度發(fā)酵的成功關(guān)鍵是補(bǔ)料策略。
乙酸的積累是高密度培養(yǎng)生產(chǎn)重組蛋白質(zhì)的一個(gè)主要問題是。
三、高密度發(fā)酵工藝上對(duì)策:在發(fā)酵工藝上常通過改變培養(yǎng)基組成(以甘油為初始碳源)降低培養(yǎng)溫度限制性流加葡萄糖提高供氧能力(加強(qiáng)攪拌、提高氧分壓、提高罐壓)三、高密度發(fā)酵菌種上對(duì)策:阻斷E.coli乙酸產(chǎn)生:敲除磷酸轉(zhuǎn)乙酰酶基因(pta1)和乙酸激酶(ack)的基因;改變代謝流方法:導(dǎo)入丙酮酸脫羧酶基因pdc1和乙醇脫氫酶adh2,丙酮酸生成乙醇;限制葡萄糖攝取主要途徑(磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)),同時(shí)還需加強(qiáng)其他葡萄糖攝取途徑;引入血紅蛋白基因2.7基因工程藥物的分離純化二、建立分離純化工藝需了解的因素1、起始物料的特點(diǎn)菌種類型、蛋白的表達(dá)部位、產(chǎn)物濃度等。2、目的產(chǎn)物特性(各種物理化學(xué)性質(zhì)、穩(wěn)定性)3、雜質(zhì)的種類和性質(zhì)4、產(chǎn)品質(zhì)量的要求
準(zhǔn)許存在的雜質(zhì)種類和最低含量、純度、比活等。三、細(xì)胞破碎物理方法
珠磨、高壓勻漿、超聲波破碎、勻漿、凍融、低滲裂解、研磨等化學(xué)方法有機(jī)溶劑(甲苯、丙酮等)、表面活性劑等。
生物方法酶法:溶菌酶、葡聚糖酶、溶壁酶等;自溶:一定pH和溫度;一般采用加熱法,自溶時(shí)間較長(zhǎng)。
四、固液分離胞外蛋白:離心包含體:離心、低速離心胞內(nèi)蛋白:去除細(xì)胞碎片高速離心、微濾(0.1~10um)、雙水相萃?。≒EG-Dextran、PEG-鹽系統(tǒng))、絮凝、膨脹床吸附
五、分離純化方法
主要為各種層析方法:離子交換層析、凝膠過濾、疏水層析、親和層析超濾六、非蛋白類雜質(zhì)的去除DNA(離子交換、疏水層析等)熱原(脂多糖,超濾、陰離子交換、疏水層析、多黏菌素B親和層析)病毒(紫外線照射、40nm膜過濾)2.8、包含體的復(fù)性
外源基因在大腸桿菌中高水平表達(dá)時(shí)通常會(huì)形成一種由目的蛋白構(gòu)成的不溶的、無(wú)活性的蛋白聚集體即包含體(InclusionBody)
包含體內(nèi)約90%的成分是蛋白質(zhì),目的蛋白占50%以上。一、包含體表達(dá)的優(yōu)點(diǎn)表達(dá)量高密度高(1.2-1.4g/mL之間),容易分離抗蛋白酶對(duì)宿主毒性小二、包含體蛋白處理過程細(xì)胞破碎包涵體分離包涵體溶解目的產(chǎn)物的復(fù)性變性條件下純化包涵體洗滌三、包含體的復(fù)性方法方法:1.稀釋復(fù)性2.透析復(fù)性3.層析復(fù)性影響復(fù)性的操作參數(shù):蛋白濃度、溫度、pH、離子強(qiáng)度。提高蛋白復(fù)性率的策略:復(fù)性添加劑如PEG、表面活性劑分子伴侶常用半胱氨酸之間形成二硫鍵方法:1.空氣氧化法在堿性條件下通空氣,氧化時(shí)可以加入二價(jià)銅離子加快反應(yīng)速度,能夠取得更好的效果,缺點(diǎn)是不易控制氧化還原電勢(shì),而且二硫鍵的氧化形成速度慢;2.氧化還原對(duì)重排體系常用氧化還原對(duì)有氧化型谷胱甘肽/還原型谷胱甘肽和胱氨酸/半胱氨酸,通過調(diào)整氧化還原兩種物質(zhì)的比例可以控制較精確的氧化還原電勢(shì),對(duì)二硫鍵反應(yīng)進(jìn)行控制,其二硫鍵形成速率快于空氣氧化法。2.9基因工程藥物的質(zhì)量控制
生物材料、培養(yǎng)過程、純化過程、產(chǎn)品的質(zhì)量控制。
目標(biāo)產(chǎn)品的質(zhì)量控制:產(chǎn)品的鑒別、純度、活性、安全性、穩(wěn)定性、一致性。1.生物活性測(cè)定活性、比活2.產(chǎn)品的鑒定(1)相對(duì)分子量
SDS、凝膠過濾,允許10%誤差。
必要時(shí)采用質(zhì)譜準(zhǔn)確測(cè)定。(2)等電點(diǎn)
等電聚焦測(cè)定,等電點(diǎn)常不均一,每批測(cè)定結(jié)果應(yīng)一致。(3)紫外吸收光譜
特征型吸收,每批一致(4)氨基酸序列測(cè)定
送檢中試頭三批產(chǎn)品,N端15個(gè)氨基酸序列,C端1~3個(gè)氨基酸殘基。(5)氨基酸組成分析(6)免疫印跡(westernblot)(7)圓二色光譜(8)肽圖一般用胰蛋白酶或CNBr裂解,再用RP-HPLC或SDS分析(9)二硫鍵分析3.蛋白純度分析
必須采用非還原SDS和HPLC進(jìn)行檢定,其他檢測(cè)方法包括CE(毛細(xì)管電泳)等。4.雜質(zhì)檢測(cè)(1)內(nèi)毒素家兔法、鱟試劑法(2)宿主細(xì)胞蛋白免疫分析(3)宿主細(xì)胞殘余DNA
核酸雜交,100pg/劑量(4)細(xì)菌、酵母、真菌、支原體、病毒微生物學(xué)方法(5)其他物質(zhì)抗生素牛血清采用了抗體親和層析,檢測(cè)小鼠IgG含量。5.穩(wěn)定性檢測(cè)
在不同溫度下保存,定期取樣檢測(cè)生物活性及其他特性的變化。6.一致性
各批次產(chǎn)品均符合標(biāo)準(zhǔn)規(guī)格。產(chǎn)品的保存:液態(tài)保存低溫:-20℃、-80℃和液氮、短期4℃穩(wěn)定的pH
高濃度加保護(hù)劑:糖類、脂類、蛋白類、還原劑(二硫蘇糖醇)等固體保存含水量5%以下,4℃長(zhǎng)期保存冷凍干燥
凍干過程中加保護(hù)劑:低分子化合物(葡萄糖、蔗糖等)、高分子物質(zhì)(糊精、血清)
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