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文檔簡介
蛋白質(zhì)合成liu的課件資料第1頁/共80頁翻譯是蛋白質(zhì)生物合成的同義詞。翻譯就是將核酸中由堿基序列組成的遺傳信息,通過遺傳密碼破譯的方式轉(zhuǎn)變成為蛋白質(zhì)中的氨基酸排列順序的過程。第2頁/共80頁蛋白質(zhì)生物合成體系
ProteinBiosynthesisSystem
第一節(jié)第3頁/共80頁20種氨基酸(AA)作為原料酶:氨基酰-tRNA合成酶,轉(zhuǎn)肽酶眾多蛋白因子,如IF、eIFATP、GTP、無機(jī)離子參與蛋白質(zhì)生物合成的物質(zhì)包括:
三種RNAmRNA(messengerRNA,信使RNA)rRNA(ribosomalRNA,核蛋白體RNA)tRNA(transferRNA,轉(zhuǎn)移RNA)第4頁/共80頁一、翻譯模板mRNA及遺傳密碼
mRNA是遺傳信息的攜帶者遺傳學(xué)將編碼一個多肽的遺傳單位稱為順反子(cistron)。原核細(xì)胞中數(shù)個結(jié)構(gòu)基因常串聯(lián)為一個轉(zhuǎn)錄單位,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA可編碼幾種功能相關(guān)的蛋白質(zhì),為多順反子(polycistron)
。真核mRNA只編碼一種蛋白質(zhì),為單順反子(singlecistron)
。
第5頁/共80頁多順反子單順反子真核生物原核生物非編碼序列第6頁/共80頁
mRNA上存在遺傳密碼
mRNA分子上從5至3方向,由AUG開始,每相鄰的3個核苷酸為一組,決定肽鏈上某一個氨基酸,或是蛋白質(zhì)合成的起始、終止信號,稱為遺傳密碼(geneticcodon),又稱為三聯(lián)體密碼(tripletcodon)。起始密碼(initiationcoden):AUG
終止密碼(terminationcoden):UAA,UAG,UGA第7頁/共80頁第8頁/共80頁從mRNA5端起始密碼子AUG到3端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開放閱讀框架(openreadingframe,ORF)。5’…ACUAUGCCCGCUAUG…CGUUAA…3’ORF第9頁/共80頁1.連續(xù)性(commaless)遺傳密碼的特點:編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間既無間斷也無交叉。第10頁/共80頁基因損傷引起mRNA閱讀框架內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失,可能導(dǎo)致框移突變(frameshiftmutation)。第11頁/共80頁2.簡并性(degeneracy)第12頁/共80頁幾種密碼子代表一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼的簡并性。密碼的簡并性主要是由于密碼子的第三個堿基發(fā)生擺動現(xiàn)象形成的。密碼的簡并性對于保證物種穩(wěn)定性有一定意義。第13頁/共80頁3.通用性(Universal)蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動物細(xì)胞的線粒體、植物細(xì)胞的葉綠體。密碼的通用性進(jìn)一步證明各種生物進(jìn)化自同一祖先。
第14頁/共80頁4.擺動性
(Wobble)轉(zhuǎn)運氨基酸的tRNA的反密碼需要通過堿基互補(bǔ)與mRNA上的遺傳密碼反向配對結(jié)合,但反密碼與密碼間不嚴(yán)格遵守常見的堿基配對規(guī)律,稱為擺動配對。
第15頁/共80頁密碼子、反密碼子配對的擺動現(xiàn)象tRNA反密碼子第1位堿基IUGACmRNA密碼子第3位堿基U,C,AA,GU,CUG第16頁/共80頁二、tRNA與氨基酸的活化反密碼環(huán)氨基酸臂第17頁/共80頁tRNA的三級結(jié)構(gòu)示意圖:第18頁/共80頁氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶1.氨基酰-tRNA合成酶
(aminoacyl-tRNAsynthetase)
氨基酸的活化:第19頁/共80頁第一步反應(yīng):氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E
+AMP+PPi
第20頁/共80頁第二步反應(yīng):氨基酰-AMP-E+
tRNA↓
氨基酰-tRNA+AMP
+
E第21頁/共80頁tRNA與酶結(jié)合的模型tRNA氨基酰tRNA合成酶ATP第22頁/共80頁氨基酰-tRNA合成酶對底物氨基酸和tRNA都有高度特異性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:
Ala-tRNAAla,
Ser-tRNASer,
Met-tRNAMet
。第23頁/共80頁真核生物:Met-tRNAiMet原核生物:fMet-tRNAfMet2.起始肽鏈合成的氨基酰-tRNA第24頁/共80頁三、核蛋白體是多肽鏈合成的裝置第25頁/共80頁原核生物真核生物核蛋白體小亞基大亞基核蛋白體小亞基大亞基S值70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白質(zhì)rpS21種rpL36種rpS33種rpL49種
不同細(xì)胞核蛋白體的組成核蛋白體蛋白質(zhì)(ribosomalprotein,rp)第26頁/共80頁原核生物翻譯過程中核蛋白體結(jié)構(gòu)模式:氨基酰位(aminoacylsite,A位)肽酰位(peptidylsite,P位)排出位(exitsite,E位)第27頁/共80頁核蛋白體的組成第28頁/共80頁蛋白質(zhì)生物合成過程
ProcessofProteinBiosynthesis
第二節(jié)第29頁/共80頁翻譯的起始(Initiation)翻譯的延長(elongation)翻譯的終止(termination)整個翻譯過程可分為:翻譯過程從閱讀框架的5'-AUG開始,按mRNA模板三聯(lián)體密碼的順序延長肽鏈,直至終止密碼出現(xiàn)。第30頁/共80頁一、肽鏈合成起始指mRNA和起始氨基酰-tRNA分別與核蛋白體結(jié)合而形成翻譯起始復(fù)合物
(translationalinitiationcomplex)。第31頁/共80頁起始因子(initiationfactor,IF)
起始步驟原核生物IF真核生物eIF亞基分離
IF3(IF1)
eIF3mRNA就位
核酸–核酸,核酸–蛋白質(zhì)
eIF3,eIF1,eIF4A
之間的辨認(rèn)結(jié)合
eIF4B,CBP-1
eIF4E
(CBP-2)
起始tRNA就位
IF2,GTP(IF1)eIF2,co-eIF2-GTP
eIF3,eIF4C
大亞基結(jié)合
各種IF脫落,GTP水解
eIF5,eIF4D第32頁/共80頁(一)原核生物翻譯起始復(fù)合物形成核蛋白體大小亞基分離;mRNA在小亞基定位結(jié)合;起始氨基酰-tRNA的結(jié)合;核蛋白體大亞基結(jié)合。第33頁/共80頁1.核蛋白體大小亞基分離第34頁/共80頁2.mRNA在小亞基定位結(jié)合第35頁/共80頁S-D序列:AUG上游
8-13個核苷酸處的,由4-6個核苷酸組成的富含嘌呤的序列.能與小亞基的16SrRNA結(jié)合,又稱核蛋白體結(jié)合蛋白.第36頁/共80頁3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAfmet)結(jié)合到小亞基上。第37頁/共80頁4.核蛋白體大亞基結(jié)合,起始復(fù)合物形成。第38頁/共80頁第39頁/共80頁(二)真核生物翻譯起始復(fù)合物形成核蛋白體大小亞基分離;起始氨基酰-tRNA結(jié)合;mRNA在核蛋白體小亞基就位;核蛋白體大亞基結(jié)合。第40頁/共80頁met40S60Smetmet40S60SmRNAeIF-2B、eIF-3、
eIF-6①elF-3②GDP+Pi各種elF釋放elF-5④ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PAB③Metmet-tRNAiMet-elF-2
-GTP真核生物翻譯起始復(fù)合物形成過程第41頁/共80頁二、肽鏈合成延長指根據(jù)mRNA密碼序列的指導(dǎo),按次序添加氨基酸從N端向C端延伸肽鏈,直到合成終止的過程。肽鏈延長在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,又稱為核蛋白體循環(huán)(ribosomalcycle),每次循環(huán)增加一個氨基酸,包括以下三步:進(jìn)位(Entrance)成肽(Peptidebondformation)轉(zhuǎn)位(Translocation)第42頁/共80頁延伸過程所需蛋白因子稱為延長因子(elongationfactor,EF
)原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)
EF-G
真核生物:EF-1、EF-2第43頁/共80頁原核延長因子生物功能對應(yīng)真核延長因子EF-Tu促進(jìn)氨基酰-tRNA進(jìn)入A位,結(jié)合分解GTPEF1-αEF-Ts調(diào)節(jié)亞基EF1-βγEFG有轉(zhuǎn)位酶活性,促進(jìn)mRNA-肽酰-tRNA由A位前移到P位,促進(jìn)卸載tRNA釋放EF-2肽鏈合成的延長因子第44頁/共80頁又稱注冊(registration
)1.進(jìn)位指根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋白體A位。
第45頁/共80頁延長因子EF-T催化進(jìn)位(原核生物)
第46頁/共80頁第47頁/共80頁2.成肽是由轉(zhuǎn)肽酶(transpeptidase)催化的肽鍵形成過程。第48頁/共80頁第49頁/共80頁3.轉(zhuǎn)位延長因子EF-G有轉(zhuǎn)位酶(translocase)活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3'側(cè)移動。第50頁/共80頁第51頁/共80頁進(jìn)位轉(zhuǎn)位成肽第52頁/共80頁第53頁/共80頁真核生物肽鏈合成的延長過程與原核基本相似,但有不同的反應(yīng)體系和延長因子。另外,真核細(xì)胞核蛋白體沒有E位,轉(zhuǎn)位時卸載的tRNA直接從P位脫落。第54頁/共80頁
三、肽鏈合成的終止當(dāng)mRNA上終止密碼出現(xiàn)后,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽酰-tRNA中釋出,mRNA、核蛋白體等分離,這些過程稱為肽鏈合成終止。
第55頁/共80頁終止相關(guān)的蛋白因子稱為釋放因子(releasefactor,RF)。一是識別終止密碼,如RF-1特異識別UAA、UAG;而RF-2可識別UAA、UGA。二是誘導(dǎo)轉(zhuǎn)肽酶改變?yōu)轷ッ富钚裕喈?dāng)于催化肽?;D(zhuǎn)移到水分子-OH上,使肽鏈從核蛋白體上釋放。釋放因子的功能:原核生物釋放因子:RF-1,RF-2,RF-3
真核生物釋放因子:eRF第56頁/共80頁原核肽鏈合成終止過程第57頁/共80頁多聚核蛋白體(Polysome)——使蛋白質(zhì)合成高速、高效進(jìn)行。第58頁/共80頁電鏡下的多聚核蛋白體現(xiàn)象第59頁/共80頁蛋白質(zhì)合成后加工PosttranslationalProcessing
第三節(jié)第60頁/共80頁從核蛋白體釋放出的新生多肽鏈不具備蛋白質(zhì)生物活性,必需經(jīng)過不同的翻譯后復(fù)雜加工過程才轉(zhuǎn)變?yōu)樘烊粯?gòu)象的功能蛋白。主要包括:多肽鏈折疊為天然的三維結(jié)構(gòu)肽鏈一級結(jié)構(gòu)的修飾高級結(jié)構(gòu)修飾第61頁/共80頁一、多肽鏈折疊為天然功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)新生肽鏈經(jīng)盤曲折疊形成空間結(jié)構(gòu)。新生肽鏈的折疊可能是隨著肽鏈的不斷延伸而逐步完成的,逐漸產(chǎn)生正確的二級結(jié)構(gòu)、模序、結(jié)構(gòu)域,,最終形成完整空間構(gòu)象。一般認(rèn)為,多肽鏈自身氨基酸順序儲存著蛋白質(zhì)折疊的信息,即一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)。第62頁/共80頁在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)由2—3個二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上互相接近,形成立體形狀和拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)類似的,具有特殊功能的局部區(qū)域,稱為模序。某些蛋白質(zhì)分子中多肽鏈上相鄰的超二級結(jié)構(gòu)可以形成結(jié)構(gòu)比較緊密、穩(wěn)定和具有不同功能的區(qū)域,稱為蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域。第63頁/共80頁二、一級結(jié)構(gòu)的修飾(一)肽鏈N端的修飾:去除N-甲?;騈-蛋氨酸。(二)個別氨基酸的共價修飾:磷酸化修飾;PrPr-PATP蛋白激酶ADP
羥基化修飾:羥脯氨酸、羥賴氨酸。(三)二硫鍵的生成(四)多肽鏈的水解修飾第64頁/共80頁鴉片促黑皮質(zhì)素原(POMC)的水解修飾NC信號肽POMCKRKR103肽
(?)促腎上腺皮質(zhì)激素ACTH-LT促脂解激素Endophin-內(nèi)啡肽第65頁/共80頁三、高級結(jié)構(gòu)的修飾(一)亞基聚合(二)輔基連接第66頁/共80頁(一)亞基聚合
血紅蛋白是α2β2四聚體蛋白,聚合過程如下:
α鏈合成后自行釋下,與尚在聚核糖體上的β鏈相連,形成αβ二聚體。此二聚體再與血紅素結(jié)合,然后再形成四聚體。第67頁/共80頁(二)輔基連接
有些蛋白質(zhì)是由蛋白質(zhì)和非蛋白質(zhì)兩部分組成,稱為結(jié)合蛋白質(zhì),其中的非蛋白質(zhì)部分稱為輔基。結(jié)合蛋白質(zhì)中的輔基是在蛋白質(zhì)合成后加上的。例如糖蛋白的糖即是多肽鏈合成后在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或高爾基氏體中加上的。第68頁/共80頁蛋白質(zhì)合成后需要經(jīng)過復(fù)雜機(jī)制,定向輸送到最終發(fā)揮生物功能的細(xì)胞靶部位,這一過程稱為蛋白質(zhì)的靶向輸送(proteintargeting)
。
四、蛋白質(zhì)合成后的靶向輸送第69頁/共80頁蛋白質(zhì)生物合成的干擾和抑制
Interference&InhibitionofProteinBiosynthesis第四節(jié)第70頁/共80頁蛋白質(zhì)生物合成是很多抗生素和某些毒素的作用靶點。它們就是通過阻斷真核、原核生物蛋白質(zhì)翻譯體系某組分功能,干擾和抑制蛋白質(zhì)生物合成過程而起作用的。可針對蛋白質(zhì)生物合成必需的關(guān)鍵組分作為研究新抗菌藥物的作用靶點。同時盡量利用真核、原核生物蛋白質(zhì)合成體系的任何差異,以設(shè)計、篩選僅對病原微生物特效而不損害人體的藥物。第71頁/共80頁
抗生素(antibiotics):是微生物產(chǎn)生的能夠殺滅或抑制細(xì)菌的一類藥物??勾x藥物指能干擾生物代謝過程,從而抑制細(xì)胞過度生長的藥物。
某些毒素也作用于基因信息傳遞過程。第72頁/共80頁一、抗生素類抗生素作用點作用原理應(yīng)用四環(huán)素族(金霉素新霉素、土霉素)鏈霉
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