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文檔簡介

吲哚喹啉生物堿衍生物與DNA作用研究盧宇靖古練權**基金項目中山大學化學與化工學院第三屆創(chuàng)新化學實驗基金項目(批準號:02023)資助第一作者盧宇靖(1980年出生),男,中山大學化學與化工學院應用化學專業(yè)99級指導教師古練權Email:cesglq@zsulink.zsu.edu中山大學化學與化工學院,廣州510275摘要通過紫外可見光譜研究了一系列新型的吲哚喹啉生物堿衍生物與DNA的作用方式,表明了該化合物與DNA具有良好的嵌入作用,為該類化合物具有良好的抗腫瘤效果提供了可能的作用機理。關鍵詞吲哚喹啉生物堿衍生物DNA作用機制嵌入作用抗癌藥吲哚喹啉生物堿是自然界比較稀少的生物堿,而quindoline和Cryptolepine(圖1)是這一家族的最好代表,這兩個化合物分別在1977年和1929年從西非的植物Cryptolepissanguinolenta中分離出來[1]。吲哚喹啉生物堿具有廣泛的生理特性,包括hypotensive、antipyretic、antimuscarinic、antibacterial、antiviral、antihyperglycemic等等[2]。研究表明Cryptolepine是一種有效的DNA拓撲異構酶II抑制劑,能夠抑制B16黑素瘤的DNA合成[3]。圖12002年JohnN.lisgarten應用單精衍射法研究了Cryptolepine與DNA片斷d(CCTAGG)2的作用,發(fā)現(xiàn)Cryptolepine以π-π堆積方式嵌入到片斷的嘧啶堿基之間,這是第一個小分子與DNA嘧啶-嘧啶不變序列嵌入作用的單晶結構[3]。臨床使用的許多抗癌藥物如阿霉素都是與DNA有較強的嵌入作用[4]。這類DNA嵌入劑抗癌藥物能夠牢固地,又可逆地嵌入DNA雙螺旋,但它們對結構有特定的要求,具有一些共同的結構特征。首先,它們都具有一組或多組非簇狀線性稠和芳環(huán)(不少于3)。小分子的發(fā)色團就有足夠的面積進行嵌插結合,而且要求稠環(huán)呈平面,易于插入DNA堿基對。但這不能產(chǎn)生充分有效的抗癌活性,即使它具有嵌入作用的能力。如果想有良好的抗癌活性,在小分子發(fā)色團的適當位置連上一條(或幾條)側鏈是很必要的,而且側鏈上能夠形成正電荷中心;而對正電荷中心的距離、位置和pKa值也有嚴格的要求[5]。因為帶正電荷的側鏈從DNA的溝槽接近DNA,剛好能與呈電負性的DNA磷酸骨架通過靜電作用。對于中性發(fā)色團的小分子,一般有一條(或幾條)帶正電荷的側鏈[6];如果發(fā)色團本身帶正電荷,一般帶一條(或幾條)位阻較大的側鏈(EB,amsacrine)。可以推測,這些側鏈對DNA和藥物的復合物有額外的穩(wěn)定作用,同時影響藥物與DNA結合的動力學過程[7]。我們根據(jù)上面的理論,以吲哚喹啉生物堿為母體合成了一系列的吲哚喹啉生物堿衍生物,并系統(tǒng)研究了化合物Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ與DNA的相互作用(圖2)。圖2嘆1鑼實驗冒部分嫂1.漢1試補劑與優(yōu)儀器筋吲哚此喹啉罩生物賢堿衍墊生物阿化合譯物是屯根據(jù)捧本實幅驗室紋的合籮成方頂法合孕成的輩,均倆通過穴NM隆R、巧IR遺、F模AB優(yōu)質譜抓表征顛,合宿成的覆化合襖物都駁是色巾譜純堤的。舞小牛炮胸腺扎DN舊A碼是S撒ig干ma吉化學拔公司怨的產(chǎn)赴品,敞其它依試劑艘均為閥分析密純,襲是廣險州試冬劑一邪廠的劈產(chǎn)品玩。償紫外戚可見碼吸收北光譜仔是在刻UV祝-2呈50么1P贈C丘型紫執(zhí)外光扮譜儀外上測謎定的蒼;溶丟液p待H值己由O絨ri拼on競M路od抓el深7費20干A距pH巾計所雁確定厭,所戲用的服溶液揀為雙葉蒸水折。工1.敗2.慎稈實驗梁方法研1.訂2.緒1舞溶液秘的配必置賣(卻1進)暫0匯.1益M商p麗H敢7.仗4籠Tr書is宵-H貧Cl暢緩沖循溶液途配置扒:向棟50危0此mL扛0則.1劃M奶三字-羥爽甲基蠅-胺劉基甲暖烷水剝溶液柱中緩晌慢滴任加0款.1散M傳H加Cl役水溶饑液,澡混勻歪,用根pH瞧計調貨節(jié)溶槍液p簡H值塘至7流.4舌。旨(2遮)果DN扣A旦溶液剩的配頑置:嗓稱取致適量玉的小毫牛胸答腺D扛NA巴溶于女緩沖產(chǎn)溶液倉中,體抽濾木,濾痛液按幸需要皂稀釋虛到一派定濃朱度,暑測量矩26挪0n將m和鑰28稿0n皺m處勒吸收纏值,妙經(jīng)U慎V譜特檢驗它A襖26日0/削A2賭8綁0=棚1.瞞8箭~1銷.9睬,表陳明基福本上下不含僚蛋白模質,懷純度告符合蟻要求溉。D艘NA芹濃度艙以堿屬基對手摩爾掉濃度竹計,嫂測量探DN惹A在算26饅0n者m處另的吸鳳收光污度,蜜然后糾根據(jù)晉26添0恰nm儉的吸所光系詢數(shù)6杯60骨0M陰-1旁c毯m-拖1來輕確定滑DN麗A報濃度梳為1休.1湊02鏡×逗10念-3張mo勢l/故L億(3部)貴樣品評溶液由:稱誕取一智定量及各種命待分搬析樣周品成彎鹽后摩用緩忘沖溶眠液定歐容。確1.足2.簡2吸參收光引譜滴沃定遭在紫索外可零見光理譜儀趕中,盒向參疾比池姜中加蹲入緩返沖溶學液,倆在樣紅品池武中加來入同惹樣體社積的輛5蹄×宿10躬-5去mo斧l悉L-勇1的算樣品乏溶液鍛。用刊微量輝進樣喂器每蜘次往卷參比局池和辨樣品奉池加上入相議同體預積的份DN雅A溶濁液,究使D添NA蒼與樣辯品濃們度比提值不次斷增比加,笨直至堵飽和錫,樣準品的腿吸收煌峰不滔再減歇色。嗓2踩結果求與討夏論自2.偏1化告合物潛溶液蠟性質芳2.等1.器1湯化合手物不碧同濃扭度時鳴的存俊在形屆式蜻化合不物具胸有一桌組或道多組引稠和左芳環(huán)付,它詢們在垮一定網(wǎng)濃度爺時可疫能通路過布π班-益π襖堆積鋒而形廢成二遵聚或線多聚地,所廁以我挪們應取用吸香收光帳譜滴急定進離行觀碎察。較在紫洲外光鴨譜儀笑中,揪向參群比池摧中加布入一長定的烈緩沖擦溶液銳,在版樣品釋池中也加入跡一定互體積歲的樣最品溶搖液,跟不斷國增加抵樣品汽的濃恒度,景直到洽飽和胖,樣福品的犯吸收扇峰不布色。夠數(shù)據(jù)許處理娘可知抵化合超物在弦c跡≥導4.鈴64陳×虎10亦-5更m堤ol款L慚-1育時親以雙訂分子渣形式警存在關,在桐c<鹿4.督64歲×斑10做-5萌m匯ol符L蒜-1爆時桐以單揀分子詢形式賊存在關,可取以保憂證在范測試際條件裝下,跪濃度左2化×論10陶-5晌m茂ol杰L壯-1判,組該化洽合物乏以單敵分子辛存在膽,使外得測犁試條瑞件下保真實奏反映決了該屈化合投物與限DN擋A的制作用甲。如望果小桶分子或以雙佛分子總形式杠存在盡,D衛(wèi)NA欣要先困拆分蟻小分捕子,宇能量恰耗損慈,放棄應出貢的吸凡收光緒譜就惑有變接化。棵圖短3楊(儉a)納化競合物災I自板身隨肌濃度化增加靜的吸矮收光唐譜(求p欄H為限7.春4)槽;或(b奸)重化合復物I澤摩敘爾消堡光系輪數(shù)與退濃度浮對數(shù)搞圖予2.脆1.郊2化幣合物藥不同狗pH以值的誤存在命形式嶼化合衣物不鈴同p炸H值鄭的可看見光鵝譜可遷以從著圖4擱數(shù)據(jù)婆處理倒可知婆,化峰合物閃Ⅰ余、池Ⅱ溜、言Ⅲ徒、害Ⅳ振的p掀K蟲a值著分別公為8弊.3倒、8蚊.1次、8渾.2傍、8惱.3鎮(zhèn),說安明化習合物毀在生熟理p凡H即弓測定巾條件設下,蓬以鹽鑼的形訊式存似在。圖圖4(a)(b)(c)(d)化合物I、II、III、IV在不同pH下的吸收光譜圖(e)化合物IV吸光度對pH圖門2.躍2幾葡種化城合物飯與D擺NA盯分子千相互隸作用止由于錫紫外美-可充見吸像收光遵譜法碗是研諒究小機分子頓與D震NA圓相互健作用鍋機理姑的最極常用早、方老便的違方法錄之一訂。通蝕常,駕吲哚螞喹啉孝生物賢堿衍井生物綢小分案子在經(jīng)紫外火區(qū)有燃一定傘的電良子吸糖收。捎當小賢分子撿與D地NA臟結合偏后,儉其電耕子結努構會膊受到寄DN民A的去擾動盯,導稼致小著分子寫所處愉的環(huán)勵境發(fā)肝生變義化,荒小分遣子與彈DN亡A的緊結合栗強弱兆可通菊過光滾譜變鋸化的典幅度毫反映跨出來冤。一盡般來辭說,蘆當小倉分子寬以嵌拉入??偸脚c錘DN易A作默用時制,其倡吸收虜光譜港會出亞現(xiàn)一影定的賴減色炸效應廳和峰搞位紅堅移現(xiàn)誦象。柿這是旺因為繼插入金的的猾小分仔子與宇DN沃A的夠堿基界對發(fā)掘生殊π掌電子碎堆積幻后,匙使其越π*識空軌輸?shù)琅c菠堿基降的攻π垂電子狀軌道劈發(fā)生警偶合棉,能們級下傘降,四從而撫導致耕π→位π*辮躍遷惕能減牢少,慣產(chǎn)生限紅移健現(xiàn)象盲。同撿時,棵偶合論后的痕π塑軌道抵因部然分填截充電兇子,岡使躍筍遷幾醫(yī)率減詢少,待產(chǎn)生渾減色運效應粉。減線色效銳應與拼小分矩子插琴入程可度有需關,壞減色格效應榜越明倡顯,葡吸收記峰紅望移越采大,洗表明快插入陽程度躺越大降。妙圖5柳區(qū)化合泰物展Ⅰ旨(a當)、動Ⅱ組(b工)、建Ⅲ即(c拴)、勿Ⅳ路(d薦)活與小隨牛胸分腺D虹NA譯相附互作文用的攤吸收扒光譜鏡圖招化合提物與卻DN粘A作美用的種吸收鍋光譜治如圖那5所關示。破作用豪后的甘相關縮數(shù)據(jù)敗見表栽1。擇從圖復中可貸見,究化合翻物溶桂液中陳加入霸DN顧A后善都出侵現(xiàn)不阻同程蓄度的竟擾動淺,化懼合物簡的吸祝收光栽譜都報出現(xiàn)目了減悠色效盾應,可較強概的紅績移現(xiàn)鞋象。旗這些慨光譜節(jié)變化虎特征果表明旦化合品物是誦以嵌題入模午式與耐DN方A作意用的攀。亭為了撕定量撫的比銀較化鈔合物利與D染NA摟結合塌的強阻弱,川我們順通過按化合突物光抗譜滴伏定實霉驗,界以最徒大波蒙長峰獨吸光昏度的乞變化損,按捏照下越列方制程式腦計算割了化昨合物閥與D攝NA揉的結候合常稀數(shù)K既b汽[8耽]逃。敲澆腸絕鄙幻幟鵲冷尼[印DN巧A]健/(搶ε謝a狀-危ε鄰f擇)=芝[D艙NA歷]/堂(疊ε移b非-獎ε酸f更)+拳1/痛Kb險(慣ε柄b祖-仔ε翅f增)辮式中驗[D符NA塑]表秋示D診NA沫濃度營,踢ε呢a靠,詠ε斧f糠和辟ε支b林分別洞表示籌A幫ob嚼sd壇/[?;先菸颹唉,自悶由化蝴合物惑的摩艦爾吸掙光系這數(shù)和喜完全番結合怠后的背化合山物的幼摩爾線吸光謊系數(shù)弓。以委[D姨NA家]/偏(朽ε匆a創(chuàng)-脊ε網(wǎng)f貴)對榮[D架NA的]作購圖,第斜率棟與截掠距的滑比值披為結吵合常驢數(shù)欺Kb困,如借表1田所示禾。與柏文獻院比較愛,化巴合物盾與D硬NA付的結你合力喘較強犁[9誰.1河0]貸。革表1三化牽合物秒與小舅牛胸球腺D圖NA摸相互山作用飯的吸錢收光竊譜變伐化擱化合漲物外λ靠ma純x碌/n法m文紅移調Δλ縣/n技m蛙減色役率遇%搖結合幼常數(shù)跳K搖b磁/M鑰-1壘自由掛結合患30石3咬33序8佛39屠8狂41鞋4冶34劫5東40汽6仆42刮5廁7嘩8輔11稍24津.8部38泛.0呈35戀.7具19歐.5麻×缺10銹4合30吼4拋32啊7搶35群5檢37襲2猴33根2渣36買4漏38汁2也5肢9磨10姑16斜.1狠34北.8搶33口.0項8.量4龜×擊10揀4顯31皆7專33暖6較39釀8引41鄉(xiāng)3扒33驗8豈40爺0烤41刺4新2跨2林1并14邀.8債17常.6闊14搖.8曠17遍.6岔×妙10籌4弟31蕉8槳32丟6作35屆8召37蒼7交32櫻9胞36蔽6鎮(zhèn)38磁4距3摧8姥7康14凍.4遼32樓.4繳27雨.0秤12禽.8仔×四10失4酸2.鵝3吲咸哚喹爭啉類虹化合市物的仔抗癌樂活性坊測定臣及研辣究前盈景疫應用棕噻唑匆藍(飛MT戴T)裳法測度定了國這4喇個吲田哚喹繳啉類獅化合恐物對艦體外喝培養(yǎng)狂的人全鼻咽省癌C達NE逃2細詠胞、科人肝碌癌竿Be紛l-舉74負02招細胞兵和人床肺腺觸癌G惰LC抖-8幣2細撒胞的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