常用分子生物學技術的原理及其應用-課件

生物化學與分子生物學2020/10/281常用分子生物學技術的原理及應用ThePrincipleandApplicationofCommonUsedTechniquesinMolecularBiology第二十章2020/10/282精品資料2020/10/283第一節(jié)分子雜交與印跡技術MolecularHybridizationandBlottingTechnique2020/10/284核酸分子雜交(nucleicacidhybridization)在DNA復性過程中，如果把不同DNA單鏈分子放在同一溶液中，或把DNA與RNA放在一起，只要在DNA或RNA的單鏈分子之間有一定的堿基配對關系，就可以在不同的分子之間形成雜化雙鏈(heteroduplex)。一、分子雜交與印跡技術的原理2020/10/285復性RNADNA2020/10/286（一）印跡技術利用各種物理方法使電泳膠中的生物大分子轉移到NC等各種膜上，使之成為固相化分子。這一技術類似于用吸墨紙吸收紙張上的墨跡，因此稱之為“blotting”，譯為印跡技術。2020/10/287用放射性核素、生物素或熒光染料標記其末端或全鏈的已知序列的多聚核苷酸鏈被稱為“探針”，探針可以與固定在NC膜上的核苷酸結合，判斷是否有同源的核酸分子存在。（二）探針技術2020/10/288二、印跡技術的類別及應用（一）DNA印跡

(Southernblotting)（二）RNA印跡(Northernblotting)（三）蛋白質的印跡

(Westernblotting)用于基因組DNA、重組質粒和噬菌體的分析。

用于RNA的定性定量分析。用于蛋白質定性定量及相互作用研究。2020/10/289其他：斑點印跡(dotblotting)原位雜交(insituhybridization)DNA點陣(DNAarray)DNA芯片技術(DNAchip)2020/10/2810三種印跡技術的比較2020/10/2811分子雜交實驗①②③2020/10/2812放射自顯影照片2020/10/2813DNA芯片技術2020/10/2814第二節(jié)PCR技術的原理與應用ThePrincipleandApplicationof

PCRTechnology2020/10/28155Primer15Primer2Cycle2Cycle15555

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5TemplateDNA一、PCR技術的工作原理555555552020/10/2816Cycle355

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525～30次循環(huán)后，模板DNA的含量可以擴大100萬倍以上。2020/10/2817PCR技術原理示意圖2020/10/2818PCR的基本反應步驟變性95?C延伸72?C退火Tm-5?C2020/10/2819模板DNA特異性引物耐熱DNA聚合酶dNTPsMg2+

PCR體系基本組成成分2020/10/2820利用特異性引物以cDNA或基因組DNA為模板獲得已知目的基因片段,或與逆轉錄反應相結合，直接以組織和細胞的mRNA為模板獲得目的片段；利用簡并引物從cDNA文庫或基因組文庫中獲得序列相似的基因片段；利用隨機引物從cDNA文庫或基因組文庫中克隆基因。二、PCR技術的主要用途（一）目的基因的克隆2020/10/2821利用PCR技術可以隨意設計引物在體外對目的基因片段進行嵌和、缺失、點突變等改造。PCR技術高度敏感，對模板DNA的量要求很低，是DNA和RNA微量分析的最好方法。（三）DNA和RNA的微量分析（二）基因突變2020/10/2822將PCR技術引入DNA序列測定，使測序工作大為簡化，也提高了測序的速度；待測DNA片段既可克隆到特定的載體后進行序列測定，也可直接測定。PCR與其他技術的結合可以大大提高基因突變檢測的敏感性。（四）DNA序列測定（五）基因突變分析2020/10/2823逆轉錄PCR(reversetranscriptionPCR，RT-PCR)是將RNA的逆轉錄反應和PCR反應聯(lián)合應用的一種技術。RT-PCR是目前從組織或細胞中獲得目的基因以及對已知序列的RNA進行定性及半定量分析的最有效方法。（一）逆轉錄PCR技術三、幾種重要的PCR衍生技術2020/10/2824原位PCR(insituPCR)是在組織切片或細胞涂片上的單個細胞內進行的PCR反應，然后用特異性探針進行原位雜交，即可檢出待測DNA或RNA是否在該組織或細胞中存在。原位PCR方法彌補了PCR技術和原位雜交技術的不足，是將目的基因的擴增與定位相結合的一種最佳方法。（二）原位PCR技術2020/10/2825（三）實時PCR技術實時PCR(real-timePCR)技術通過動態(tài)監(jiān)測反應過程中的產物量，消除了產物堆積對定量分析的干擾，亦被稱為定量PCR。2020/10/2826實時PCR技術原理QR3'3'5'5'上游引物下游引物熒光標記引物RQ3'3'5'5'2020/10/2827實時PCR分類：實時PRC非探針類探針類1.TaqMan探針法2.分子信標探針法3.FRET探針法2020/10/2828圖20-3TaqMan探針法實時PCR原理示意圖2020/10/2829第三節(jié)基因文庫GeneLibrary2020/10/2830基因組DNA文庫(genomicDNAlibrary)cDNA文庫(cDNAlibrary)基因文庫(genelibrary)是指一個包含了某一生物體全部DNA序列的克隆群體。2020/10/2831一、基因組DNA文庫基因組DNA文庫是指生物的基因組DNA的信息（包括所有的編碼區(qū)和非編碼區(qū)）以DNA片段形式貯存的克隆群體。用于構建基因組文庫的載體有噬菌體、粘粒和酵母人工染色體等。2020/10/2832基因組文庫和cDNA文庫的構建和篩選2020/10/2833第一輪篩選第二輪篩選第三輪篩選基因組文庫篩選結果舉例2020/10/2834cDNA文庫是包含某一組織細胞在一定條件下所表達的全部mRNA經逆轉錄而合成的cDNA序列的克隆群體，它以cDNA片段的形式貯存著該組織細胞的基因表達信息。二、cDNA文庫2020/10/2835第四節(jié)生物芯片技術BiologicalChipTechnique2020/10/2836是指將許多特定的DNA片段有規(guī)律地緊密排列固定于單位面積的支持物上，然后與待測的熒光標記樣品進行雜交，雜交后用熒光檢測系統(tǒng)等對芯片進行掃描，通過計算機系統(tǒng)對每一位點的熒光信號做出檢測、比較和分析，從而迅速得出定性和定量的結果。該技術亦被稱作DNA微陣列(DNAmicroarray)。一、基因芯片基因芯片(genechip)2020/10/2837基因芯片工作流程示意圖2020/10/2838是將高度密集排列的蛋白分子作為探針點陣固定在固相支持物上，當與待測蛋白樣品反應時，可捕獲樣品中的靶蛋白，再經檢測系統(tǒng)對靶蛋白進行定性和定量分析的一種技術。二、蛋白質芯片蛋白質分子間的親和反應蛋白質芯片(proteinchip)蛋白質芯片作用原理2020/10/2839第五節(jié)生物大分子相互作用研究技術

TheMethodofProtein-proteinandProtein-DNAInteractionStudy2020/10/2840一、蛋白質相互作用研究技術酵母雙雜交各種親和分析（標簽蛋白沉淀、免疫共沉淀等）熒光共振能量轉換效應分析噬菌體顯示系統(tǒng)篩選常用蛋白質相互作用的研究技術2020/10/2841標簽融合蛋白結合實驗是一個基于親和色譜原理的、分析蛋白質體外直接相互作用的方法。（一）標簽蛋白沉淀標簽融合蛋白結合實驗主要用于證明兩種蛋白分子是否存在直接物理結合、分析兩種分子結合的具體結構部位及篩選細胞內與融合蛋白相結合的未知分子。2020/10/2842標簽融合蛋白沉淀實驗流程示意圖2020/10/2843（二）酵母雙雜交技術的基本原理和用途2020/10/2844酵母雙雜交系統(tǒng)的應用證明兩種已知基因序列的蛋白質可以相互作用的生物信息學推測。分析已知存在相互作用的兩種蛋白質分子的的相互作用功能結構域或關鍵的氨基酸殘基。將擬研究的蛋白質的編碼基因與BD基因融合成為“誘餌”表達質粒，可以篩選AD基因融合的“獵物”基因表達文庫，篩選未知的相互作用蛋白質。2020/10/2845電泳遷移率變動測定(electrophoreticmobilityshiftassay，EMSA)或稱凝膠遷移變動實驗(gelshiftassay)最初用于研究DNA結合蛋白與相應DNA序列間的相互作用，可用于定性和定量分析，已經成為轉錄因子研究的經典方法。目前這一技術也被用于研究RNA結合蛋白和特定RNA序列間的相互作用。二、DNA-蛋白質相互作用分子分析技術（