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手性分子的結(jié)構(gòu)-保留拓?fù)淠P?/p>
手的特征是自然界中普遍存在的特征。所謂的手性指的是不能完全適應(yīng)圖像的化合物,而且左右或左右之間的關(guān)系。這種現(xiàn)象的出現(xiàn)最初是由于自然界中一些藥物的不同映體而產(chǎn)生的。定量構(gòu)效關(guān)系(QuantitativeStructureActivityRelationship,QSAR)研究是建立在物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或理化性質(zhì)與生物效應(yīng)間定量關(guān)系的統(tǒng)計分析方法,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于藥物的篩選、設(shè)計及新藥研制工作中本研究從手性分子中成鍵原子的結(jié)構(gòu)特征和手性原子所處的化學(xué)微環(huán)境出發(fā),應(yīng)用原子的平衡電負(fù)性方法對分子圖進(jìn)行著色,在拓?fù)淇臻g距離矩陣基礎(chǔ)上結(jié)合分子中各原子的支化度,并引入手性校正因子得到手性拓?fù)渲笖?shù)w1手性拓?fù)渲笖?shù)的構(gòu)建對于由n個原子構(gòu)成的分子隱氫圖,其距離矩陣可以表示為D=(d根據(jù)拓?fù)浠瘜W(xué)理論可知,分子隱氫圖中每條邊都是由化學(xué)鍵構(gòu)成的,由于手性分子中手性原子的存在,各個化學(xué)鍵的強(qiáng)度因此不同,而且由于其他成鍵原子的電負(fù)性不同其鍵的強(qiáng)度將不同,因而將導(dǎo)致同種原子在不同化學(xué)環(huán)境中的性質(zhì)存在差異.作者認(rèn)為原子形成分子是伴隨原子電負(fù)性改變的過程,分子一旦形成,分子中各原子與相鄰原子的電負(fù)性不再改變即達(dá)到電負(fù)性平衡,這種電負(fù)性我們稱之為原子的平衡電負(fù)性x式中∑χ為此,本文將相應(yīng)頂點平衡電負(fù)性定義為電負(fù)性矩陣E,且E=[χ另外考慮到手性分子中每一原子的成鍵情況、原子之間的聯(lián)結(jié)關(guān)系建立了分子支化度矩陣B,且B=[b在矩陣D,E,B的基礎(chǔ)上,本文構(gòu)建了一個新的擴(kuò)展矩陣M,且M=D·E·B.因此,矩陣M表達(dá)式為:同時,為了糅合手性原子的立體效應(yīng),有效區(qū)分手性分子的兩個對映體,本文對其支化度矩陣引入了校正因子進(jìn)行校正:對于R構(gòu)型支化度矩陣中手性原子其所在的行的第一列保持原值不變,而S構(gòu)型支化度矩陣中手性原子其所在的行的第一列取其負(fù)值(即在手性原子對應(yīng)的b值前添一負(fù)號,其他值與R構(gòu)型一致).然后在擴(kuò)展矩陣M的基礎(chǔ)上,對M進(jìn)行如下處理,得到校正矩陣Q:將矩陣Q的特征根值λ因此,本文在此基礎(chǔ)上,提出了一組新的手性拓?fù)渲笖?shù)w如R-2-羥基丙酸(R-乳酸)的校正矩陣Q為:校正矩陣Q的特征值如下:-3.3958,-0.0001,0,0.7432,1.3252,14.476.因此,R-2-羥基丙酸(R-乳酸)的手性拓?fù)渲笖?shù)w本文根據(jù)上述過程,對18種手性羥基酸和氨基酸的手性拓?fù)渲笖?shù)w2結(jié)果與討論2.1數(shù)據(jù)集的選擇和軟件本文研究了18種手性羥基酸和氨基酸的手性薄層色譜保留指數(shù)的實驗值R2.2啟動拓?fù)淠P臀覀儗?8種手性羥基酸和氨基酸的手性拓?fù)渲笖?shù)w上式中N是樣本數(shù),R是相關(guān)系數(shù),R2.3手性拓?fù)渲笖?shù)w的檢驗一個好的模型除了有很好的預(yù)測能力和穩(wěn)定性能還必須進(jìn)行必要的模型檢驗,模型外部預(yù)測能力和真實有效性檢驗是定量構(gòu)效關(guān)系研究中非常重要的一環(huán),為此我們采用留一交互檢驗(Leave-one-outcross-validation)為了進(jìn)一步驗證模型的預(yù)測能力,表明本文所構(gòu)建的手性拓?fù)渲笖?shù)w從以上結(jié)果可知,本文構(gòu)建的手性拓?fù)渲笖?shù)w本文還將所得到的拓?fù)淠P?6)進(jìn)行檢驗,并將文獻(xiàn)[4]中的16個手性化合物的薄層色譜保留指數(shù)R由此可見利用模型(6)得到的計算值R2.4手性拓?fù)渲笖?shù)w判別一個拓?fù)渲笖?shù)的優(yōu)劣,主要是看它是否具有高的結(jié)構(gòu)選擇性以及良好的性質(zhì)相關(guān)性.根據(jù)手性薄層色譜保留指數(shù)計算的基本原理可知,薄層色譜保留指
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