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文檔簡介
會計學1甲胎蛋白基因(alpha-fetoprotein,AFP)(GenBank登錄號:NM_001134.1)的異常表達與肝癌、前列腺癌等惡性腫瘤有關,請根據(jù)基因表達的檢測方法,設計實驗方案從轉錄水平檢測AFP的表達情況。實驗方案包括:實驗目的、實驗方法及原理、技術路線、可能的結果分析及應用等。討論題目第1頁/共13頁甲胎蛋白是人胚胎期血清中的主要蛋白成分。甲胎蛋白是一種糖蛋白,正常情況下,這種蛋白主要來自胚胎的肝細胞,在胎兒13周AFP含量占血漿蛋白總量的1/3,胎兒出生后約兩周甲胎蛋白從血液中消失。在妊娠30周達最高峰,以后逐漸下降,出生時血漿中濃度為高峰期的1%左右,約40mg/L,在周歲時接近成人水平。正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20微克/升,如在成人血清中含量過高,則提示有肝癌的可能。甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)第2頁/共13頁1、掌握RT-PCR技術、northern印記雜交的原理和方法2、了解實驗的操作方法和步驟3、判斷基因在轉錄水平的表達情況實驗目的第3頁/共13頁使用細胞RNA提取技術,然后通過逆轉錄合成cDNA,PCR擴增,利用瓊脂糖凝膠電泳技術,測定AFPmRNA的表達。逆轉錄PCR,是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板經(jīng)反轉錄酶或隨
機引物的作用從RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段檢測基因表達。實驗方法及原理第4頁/共13頁1、提取mRNA2、反轉錄cDNA鏈4、凝膠電泳3、PCR擴增5、結果顯示實驗技術路線第5頁/共13頁1、若有AFP基因表達,則在與其反轉
錄cDNA鏈分子量平行處應有檢測信號。
2、若AFP基因未表達,則在與其反轉
錄cDNA鏈分子量平行處沒有檢測信號。結果分析第6頁/共13頁Northern印跡雜交是指將RNA變性及電泳分離后,將其轉移到固相支持物上,然后利用雜交反應來鑒定其中特定mRNA分子的含量及其大小的過程。RNA印跡技術正好與DNA相對應,故被稱為Northern印跡雜交,與此原理相似的蛋白質印跡技術則被稱為Western
blot。Northern印記雜交實驗原理第7頁/共13頁1、若出現(xiàn)明顯雜交帶,則表明細胞組織內(nèi)有AFP基因的表達,則會有患肝癌的風險。2、若沒有出現(xiàn)明顯雜交帶,則表明細胞組織內(nèi)基因未表達。結果分析第8頁/共13頁Northern印跡雜交技術檢測mRNA表達水平的敏感性較PCR技術低,但其特異性強,假陽性率低,因此被認為是最可靠的mRNA和miRNA定量分析方法之一。RT-PCR使RNA檢測的靈敏性提高了幾個數(shù)量級,使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。Northern印記雜交與PCR方法的比較第9頁/共13頁診斷原發(fā)性肝癌。檢測AFP的含量是診斷原發(fā)性肝癌的重要手段之一,由于肝癌的癌細胞能合成或分泌較多的AFP釋放入血的緣故。正因為如此,醫(yī)生們就把檢測人體血液中的AFP作為診斷肝癌的重要依據(jù),并把AFP稱為“肝癌標志物”。檢測AFP是診斷肝癌的一種簡便、靈敏、快捷的方法,現(xiàn)認為它在發(fā)現(xiàn)早期肝癌方面有獨一無二的價值,用AFP診斷肝癌的“專一性”僅次于病理學檢查。血清AFP升高,還可出現(xiàn)于畸胎瘤、睪丸和卵巢腫瘤等。急性肝炎和肝硬化的鑒別診斷肝細胞再生時期,AFP在血液中呈陽性,急、慢性肝炎、肝硬化時會有肝細胞再生,因而AFP在血液中的濃度升高。一般急性肝病,可隨病情好轉
AFP含量下降或正常,肝硬化可呈下降或持續(xù)低水平,肝癌則逐漸上升。應用(臨床意義)第10頁/共13頁先天性疾病的診斷先天性疾病的診斷:檢測羊水中AFP含量的意義已引起注意,Rendle用放射免疫法檢測,發(fā)現(xiàn)無腦兒羊水中含量顯著升高。正常妊娠12~16周羊水AFP含量為21.1±1.2mg/L,以后逐月下降,足月時為0.5±0.2mg/L。無腦兒患者在妊娠26~31周為95.7±19.3mg/L,32-38周為25.7±5.9mg/L。先天性腎病及脊柱裂也有類似報道。因此用放免法檢測羊水中AFP含量,有助于某些先天性疾病的出生前診斷。母體血中A
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