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基技學(xué)院嚴(yán)永敏
基因重組與基因工程概念基因重組(geneticrecombination):指不同來(lái)源的DNA分子通過(guò)重新組合(插入、缺失、置換等)形成新的重組DNA分子的過(guò)程。自然界的基因重組一、轉(zhuǎn)化作用概念:受體細(xì)胞直接吸收來(lái)自供體細(xì)胞的DNA片段,并使它整合到自己的基因組中,從而獲得供體細(xì)胞部分遺傳性狀的現(xiàn)象。
DNADNA片段新DNA重組攝取溶解轉(zhuǎn)導(dǎo)作用概念:以病毒為媒介發(fā)生在供體細(xì)胞與受體細(xì)胞之間的DNA轉(zhuǎn)移及基因重組。轉(zhuǎn)位:概念:基因從基因組的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位置。進(jìn)展1973年,CohenGroup第一次實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌遺傳性狀的轉(zhuǎn)移terr+nersr→terrner,導(dǎo)致基因工程技術(shù)誕生至今,人類已經(jīng)擁有了克隆羊、豬等等的技術(shù),可以復(fù)制一個(gè)生命體。(克隆羊多利1997-2003,體細(xì)胞克隆,胚胎細(xì)胞克?。┢渌珉s交水稻,基因工程藥物等PscloltetrRb-3nersrtetrnertetr
nerOtetrne圖8-1CohenGroup第一次實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌遺傳性狀轉(zhuǎn)移示意圖第一節(jié)概述第二節(jié)基因工程相關(guān)的酶學(xué)第三節(jié)基因工程的載體(vector)第四節(jié)目的基因制備和常用分離方法第五節(jié)載體DNA和目的基因的連接第六節(jié)重組DNA分子引入受體細(xì)胞第七節(jié)重組體的鑒定與分析第八節(jié)克隆基因的表達(dá)基因工程(geneticengineering):
在體外應(yīng)用人工方法進(jìn)行基因重組,然后導(dǎo)入宿主細(xì)胞去復(fù)制、擴(kuò)增或表達(dá)的過(guò)程。因?yàn)橥ㄟ^(guò)人工設(shè)計(jì),得到一定的設(shè)計(jì)方案,故稱為基因工程。
分子克隆(molecularcloning):
指按照人的意愿,在體外將制備的DNA片段與載體重組,然后導(dǎo)入受體細(xì)胞,并在受體細(xì)胞中復(fù)制、擴(kuò)增,以獲得該DNA分子的大量拷貝或表達(dá)產(chǎn)物。
分切連轉(zhuǎn)
篩基因工程步驟基因工程基因工程技術(shù)的應(yīng)用(P307)一、生產(chǎn)(基因工程)產(chǎn)品:1.構(gòu)建基因組文庫(kù),cDNA文庫(kù),核酸探針等2.生產(chǎn)基因的(用于醫(yī)藥目的)的一級(jí)產(chǎn)品,即蛋白質(zhì)、多肽;二級(jí)產(chǎn)品,如維生素、多糖、氨基酸(因?yàn)樗鼈冇擅复呋a(chǎn)生)3.生產(chǎn)基因疫苗、如:乙肝疫苗.二、改良生物的性狀如將固氮基因引入水稻,就可以不用施氮肥了
基因治療三、分子診斷
在分子克隆技術(shù)中,對(duì)DNA進(jìn)行切割、合成、補(bǔ)平、連接和修飾等工具酶是必不可少的。常用的工具酶主要有:
限制性核酸內(nèi)切酶、DNA聚合酶Ⅰ、逆轉(zhuǎn)錄酶、DNA連接酶、堿性磷酸酶、多核苷酸激酶和末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶,甲基化酶等。重要的工具酶(toolenzyme)
一、限制性核酸內(nèi)切酶
(restrictionendonuclease,RE)
簡(jiǎn)稱限制酶,是一類能識(shí)別和切割特定DNA序列的核酸內(nèi)切酶,為原核生物所特有。分為三型。其中Ⅱ型被稱為基因工程的分子剪刀,是分子克隆技術(shù)中最重要的工具酶。作用ⅠⅡⅢ
三種限制性核酸內(nèi)切酶的作用(P309)
酶活性
核酸內(nèi)切酶
核酸內(nèi)切酶
核酸內(nèi)切酶
甲基化酶甲基化酶
ATP酶
DNA解旋酶DNA鏈上的無(wú)
有
有特異識(shí)別位點(diǎn)DNA鏈上的無(wú)
在識(shí)別序列內(nèi)
在識(shí)別序列外特異切割位點(diǎn)在分子克隆中無(wú)
有
無(wú)的重要意義(一)限制酶的命名與分類EcoR
I產(chǎn)生該酶的宿主菌屬名微生物的種名
宿主菌的株或型同一菌株中不同限制酶的編號(hào)(按發(fā)現(xiàn)先后順序)
大腸桿菌Escherichia屬、coli種、RY13株中分離到幾種限制酶,分別表示為:
EcoR
I
、EcoR
Ⅱ、EcoR
Ⅴ等。(二)Ⅱ型限制性核酸內(nèi)切酶的作用
根據(jù)需要在特定的位點(diǎn)上精確切割雙鏈DNA分子,產(chǎn)生特異末端的DNA片段。識(shí)別序列:雙鏈DNA特異的堿基對(duì)(一般4
6個(gè)),在識(shí)別序列內(nèi)特異切割DNA。斷裂磷酸二酯鍵
Ⅱ型限制酶的特異識(shí)別序列回文結(jié)構(gòu)(palindromestructure):
指雙鏈DNA分子上按對(duì)稱軸排列的反向互補(bǔ)序列。5
——GAATTC——3
ATATGC5’3’EcoRⅠ識(shí)別序列:對(duì)稱軸3
——CTTAAG——5
粘性末端(cohesiveend):指限制酶錯(cuò)位切開(kāi)兩條對(duì)稱軸互補(bǔ)DNA雙鏈所產(chǎn)生的帶單鏈突出的末端。—GAATTC——CTTAAG—平末端(bluntend):
指限制酶在對(duì)稱軸上同時(shí)切割互補(bǔ)DNA雙鏈所產(chǎn)生的末端。EcoRⅠ—CCCGGG——GGGCCC—SmaⅠ4同裂酶(isoschizomers):來(lái)源不同,但能識(shí)別和切割同一核苷酸序列的限制酶,也稱異源同工酶。
這些同工異源酶可以互相代用。如:BamHⅠ和BstⅠ(GGATCC);
XhoⅠ和
PaeR7(CTCGAG)。
如:BamHⅠ(G
GATCC)和Sau3AⅠ(N
GATCN)。
同尾酶(isocaudamers):
來(lái)源,識(shí)別序列,且切割方式均不同,但可產(chǎn)生相同粘性末端的限制酶。
產(chǎn)生的DNA片段可借粘性末端相互連接,在DNA重組時(shí)具有更大的靈活性。“分子剪刀”的應(yīng)用
根據(jù)特異識(shí)別序列切割DNA片段
用于基因組計(jì)劃研究(如物理圖譜),基因組文庫(kù),DNA序列分析,DNA分子雜交,制備探針)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restrictionfragmentlengthpolymorphysm,RFLP)研究,用于法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和遺傳性疾病的診斷等-DNA指紋分析人類兩個(gè)個(gè)體的基因組DNA中平均有1000萬(wàn)處不同,多位于非編碼序列中。堿基的變異可能導(dǎo)致酶切點(diǎn)的消失或新的切點(diǎn)出現(xiàn),當(dāng)使用同一限制酶切割不同個(gè)體基因組DNA時(shí),DNA片段長(zhǎng)度出現(xiàn)差異,這種由于內(nèi)切酶切點(diǎn)變化所導(dǎo)致的DNA片段長(zhǎng)度的差異,稱為RFLP。
限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)GAATTC
CTTAAGGATTTC
CTAAAG1212III2kb3kb5kb7kb個(gè)體識(shí)別
RFLP反映了常見(jiàn)的個(gè)體間DNA核苷酸的可遺傳性變異,它按照孟德?tīng)柗绞竭z傳。
RFLP在遺傳病檢測(cè)中的應(yīng)用鐮狀細(xì)胞貧血癥(globin,6),其GAGGTG的突變(MstII,CCTNAGG)一、限制性核酸內(nèi)切酶
限制性核酸內(nèi)切酶(restrictionendonuclease,簡(jiǎn)稱限制酶),分為三型。其中Ⅱ型被稱為基因工程的分子手術(shù)刀,是分子克隆技術(shù)中最重要的工具酶。甲基化限制酶作用ⅠⅡⅢ三種限制性核酸內(nèi)切酶的作用
酶活性
核酸內(nèi)切酶
核酸內(nèi)切酶
核酸內(nèi)切酶
甲基化酶甲基化酶ATP酶DNA解旋酶DNA鏈上的無(wú)
有
有特異識(shí)別位點(diǎn)DNA鏈上的無(wú)
在識(shí)別序列內(nèi)
在識(shí)別序列外特異切割位點(diǎn)在分子克隆中無(wú)
有
無(wú)的重要意義(二)Ⅱ型限制性核酸內(nèi)切酶的作用限制酶功能:根據(jù)需要在特定的位點(diǎn)上
精確切割雙鏈DNA分子。Ⅱ型限制酶能識(shí)別雙鏈DNA特異的4
6個(gè)堿基對(duì),并在此序列內(nèi)特異切割DNA?;匚慕Y(jié)構(gòu)(palindromestructure):
指雙鏈DNA分子上按對(duì)稱軸排列的反向互補(bǔ)序列(常為限制酶所識(shí)別)。5
——GAATTC——3
ATATGC5’3’EcoRⅠ識(shí)別序列:對(duì)稱軸3
——CTTAAG——5
粘性末端(stickyend):指限制酶錯(cuò)位切開(kāi)兩條對(duì)稱軸互補(bǔ)DNA雙鏈所產(chǎn)生的末端?!狦AATTC——CTTAAG—平末端(bluntend):
指限制酶平齊切開(kāi)兩條對(duì)稱軸互補(bǔ)DNA雙鏈所產(chǎn)生的末端。EcoRⅠ—CCCGGG——GGGCCC—SmaⅠ圖4-1回文結(jié)構(gòu)和限制性核酸內(nèi)切酶作用模式圖二、DNA連接酶
基因工程的縫紉針主要功能:催化兩個(gè)互補(bǔ)粘性末端或平末端雙鏈DNA分子的5
磷酸基團(tuán)與3
羥基形成磷酸二酯鍵,將具有相同粘性末端或平末端的DNA連接起來(lái),實(shí)現(xiàn)DNA體外重組。包括大腸桿菌DNA連接酶和T4DNA連接酶。圖4-4DNA連接酶作用模式圖
大腸桿菌DNA連接酶只能連接粘性末端,而T4DNA連接酶既能連接粘性末端,又能連接平末端。三、DNA聚合酶(一)DNA聚合酶Ⅰ和Klenow片段大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ(E.ColiDNApolymeraseⅠ)是單一多肽鏈的多功能酶,分子量為109kD,它具有3種酶活性:①5
→3
DNA聚合酶活性。②3
→5
核酸外切酶活性。③5
→3
核酸外切酶活性。Klenow片段的主要用途:
①補(bǔ)齊雙鏈DNA的3
末端,同時(shí)可使3
末端DNA標(biāo)記同位素。②cDNA克隆中,合成cDNA第二鏈。圖4-2DNA聚合酶Ⅰ和Klenow片段5
→3
外切酶5
→3
聚合酶3
→5
外切酶DNA聚合酶Ⅰ(103kD)Klenow片段NC
5
→3
聚合酶3
→5
外切酶(68kD)35kD(小)68kD(大)CN枯草桿菌蛋白酶(二)TaqDNA聚合酶TaqDNA聚合酶(簡(jiǎn)稱Taq酶)是一種耐熱的DNA聚合酶,分子量為65Kd,最佳作用溫度是70~80℃,Taq酶具有5
→3
聚合酶活性和依賴于聚合作用的5
→3
外切酶活性。TaqDNA聚合酶可用于DNA測(cè)序及通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)對(duì)DNA分子的特定序列進(jìn)行體外擴(kuò)增。
①RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性(RDDP)。②核糖核酸酶H活性(RNaseH)。③DNA聚合酶活性(DDDP)。逆轉(zhuǎn)錄酶的作用:(三)逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)是依賴RNA的DNA聚合酶,它以RNA為模板,4種dNTP為底物,催化合成DNA,此過(guò)程稱為逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程。逆轉(zhuǎn)錄酶是多功能酶。
5
3
3
5
RNA(用表示)RNA-DNA雜化分子3
5
RNase(核酸酶H活性)
DDDP(DNA聚合酶活性)
4種dNTPRDDP(逆轉(zhuǎn)錄酶)引物、4種dNTP病毒雙鏈DNA用表示)(cDNA第二鏈(complementaryDNA,cDNA)與病毒RNA互補(bǔ)的DNA(用表示)5
3
3
5
5
3
5
3
圖4-3逆轉(zhuǎn)錄酶的作用
末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(terminaldeoxynucleotidyltransferase,TdT,簡(jiǎn)稱末端轉(zhuǎn)移酶)分子量為60Kd,在二價(jià)陽(yáng)離子存在下,催化脫氧核糖核苷酸轉(zhuǎn)移到單鏈或雙鏈DNA分子的3
末端-OH上。四、末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶末端轉(zhuǎn)移酶的功能主要有:①在載體或目的基因3
末端加上互補(bǔ)的同質(zhì)多聚尾,形成人工粘性末端,便于DNA重組連接。②用于DNA3
末端的同位素探針標(biāo)記。(A、G、C、T)nOH5′3′5′3′OH5′3′5′3′(A、G、C、T)nMg2+dNTPnppiMg2+dNTPnppi5′3′OH5′3′OH
5′3′5′3′(A、G、C、T)nCo2+dNTPnppiCo2+dNTPnppi(1)底物是單鏈DNA或有3
突出末端的雙鏈DNA,需要Mg2+。(2)底物是平端或3
凹端的雙鏈DNA,需要Co2+。(A、G、C、T)n五、堿性磷酸酶
堿性磷酸酶(alkalinephosphatase)的作用是催化去除DNA、RNA或dNTP上的5
-磷酸基團(tuán)。主要用途有:除去DNA片段上的5
磷酸以防自身連接。
5
-pCpGpC┅┅-OH3
堿性磷酸酶5
-CpGpC┅┅-OH3
5
-p3
-HO5
-HO3
-HO第二節(jié)載體
指能攜帶外源DNA片段導(dǎo)入宿主細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增或表達(dá)的工具。載體的本質(zhì)為DNA。制備的目的基因或外源性DNA片段必須與合適的載體連接形成重組體,才能進(jìn)入受體細(xì)胞并進(jìn)行復(fù)制和表達(dá)。載體包括克隆載體和表達(dá)載體。載體(vector):①能自我復(fù)制并具較高的拷貝數(shù)。分子量一般<10Kb。②帶有遺傳篩選標(biāo)記。③有適當(dāng)?shù)南拗泼盖形稽c(diǎn),便于外源基因的插入和篩選。
載體上具有多個(gè)限制酶的單一切點(diǎn)(即在載體的其它部位無(wú)這些酶的相同切點(diǎn))稱為多克隆位點(diǎn)(multiplecloningsites,MCS)。載體應(yīng)具備的特征:多克隆位點(diǎn)復(fù)制起始點(diǎn)抗藥基因抗藥基因質(zhì)粒(plasmid)載體
噬菌體(phage)載體
真核病毒(virus)載體
按來(lái)源分:PBR322;pUC系列;pGEM系列;M13mp系列;噬菌體載體;柯斯質(zhì)粒(粘粒);SV40載體;逆轉(zhuǎn)錄病毒載體;腺病毒載體;
克隆載體(cloningvector):
用于克隆和擴(kuò)增某一DNA序列,為研究提供材料或建立基因庫(kù)。表達(dá)載體(expressionvector):附加表達(dá)構(gòu)件——參與轉(zhuǎn)錄和翻譯所必需的調(diào)控序列,用于表達(dá)相關(guān)的蛋白質(zhì)產(chǎn)品。穿梭載體(shuttervector):既能在原核細(xì)胞中復(fù)制,又能在真核細(xì)胞中復(fù)制表達(dá)的載體。按功能分:一、克隆載體(一)質(zhì)粒載體
質(zhì)粒(plasmid)是指細(xì)菌染色體以外的小分子環(huán)狀雙鏈DNA,能自我復(fù)制和表達(dá)其攜帶的遺傳信息。
分為“緊密型”和“松弛型”質(zhì)粒與宿主細(xì)胞的關(guān)系(1)質(zhì)粒對(duì)宿主的生存不是必需的,只是“友好”的“借居”宿主細(xì)胞中(2)質(zhì)粒離開(kāi)宿主就無(wú)法生存,必須依賴宿主細(xì)胞的(3)質(zhì)粒賦于宿主各種有利的表型(質(zhì)粒編碼蛋白質(zhì)或酶),使宿主獲得生存優(yōu)勢(shì),與我們基因工程實(shí)驗(yàn)緊密相關(guān)的,如抗生素抗性基因:Ampr酶,水解β-內(nèi)酰胺環(huán),解除氨芐毒性,使細(xì)菌抗氨芐。Tetr膜蛋白,可阻止四環(huán)素進(jìn)入細(xì)胞,使細(xì)菌抗四環(huán)素。①
用于保存和擴(kuò)增<2Kb目的DNA。②
構(gòu)建cDNA文庫(kù)。③目的DNA的測(cè)序。④作為核酸雜交時(shí)的探針來(lái)源。質(zhì)粒克隆載體的主要用途:Super-coiledformRelaxedcircleLinearized
form質(zhì)粒的理化性質(zhì)具有核酸分子的一般理化特性:
可嵌入某些染料(溴化乙錠)具有較強(qiáng)的抗切割和抗變性的能力質(zhì)粒DNA瓊脂糖凝膠電泳轉(zhuǎn)GFP質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染細(xì)胞復(fù)制起始點(diǎn)抗藥基因抗藥基因圖4-5pBR322質(zhì)粒的物理圖譜1.pBR322質(zhì)粒載體圖4-6pUC質(zhì)粒物理圖譜
2.pUC18、pUC19質(zhì)粒載體pUC18和pUC19質(zhì)粒長(zhǎng)約2.69Kb,除多克隆位點(diǎn)互為相反方向排列外,其它序列均相同。pUC質(zhì)粒含Ampr,可供菌落篩選。半乳糖苷酶的藍(lán)白斑篩選實(shí)驗(yàn):lacZ
基因
-半乳糖苷酶氨基端+缺陷型
-半乳糖苷酶IPTG
-半乳糖苷酶
-互補(bǔ)藍(lán)色菌落X-gal(二)噬菌體載體噬菌體(bacteriophage,phage):
指感染細(xì)菌的病毒。(三)動(dòng)物細(xì)胞基因克隆的載體已構(gòu)建并經(jīng)常使用的動(dòng)物病毒克隆載體有:猿猴空泡病毒40(simianvacuolatingvirus40,SV40)載體、腺病毒(adenovirus)載體和逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus)載體等,它們都有各自的特點(diǎn)和應(yīng)用范圍。原核細(xì)胞的表達(dá)載體主要是大腸桿菌表達(dá)載體。大腸桿菌表達(dá)載體是在克隆載體的基礎(chǔ)上導(dǎo)入表達(dá)系統(tǒng)調(diào)控元件:?jiǎn)?dòng)子—核糖體結(jié)合位點(diǎn)—克隆位點(diǎn)—轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)。(一)原核細(xì)胞表達(dá)載體二、表達(dá)載體5
—TTGACA——TATAAT———//——3
-35區(qū)-10區(qū)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)PribnowboxDNA
如乳糖啟動(dòng)子(Lac)、色氨酸啟動(dòng)子(Trp)、Tac啟動(dòng)子(Trp-Lac)以及PL和PR啟動(dòng)子等。原核細(xì)胞啟動(dòng)子示意圖1.啟動(dòng)子(promoter):mRNA核蛋白體小亞基上的16SrRNA2.SD序列SD-序列示意圖
一個(gè)基因的3
末端有一特定的DNA序列,它具有被RNA聚合酶識(shí)別并停止轉(zhuǎn)錄的功能,此序列稱為終止子。該序列含有一段富含A/T和富含G/C的回文對(duì)稱結(jié)構(gòu),終止子轉(zhuǎn)錄后形成的RNA具有莖環(huán)狀局部二級(jí)結(jié)構(gòu)。3.終止子:-NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCTTTTTTNNN-DNA-NNTTCGCGGCNNNNGGCCGCGAAAAAANNN-G/C富含區(qū)2G/C富含區(qū)1A/T富含區(qū)5
3
5
3
RNA-NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCUUUUUUNNN-OH5
3
RNA結(jié)構(gòu)5
GC
NNNNCCGCGCGGCGCAUAU—NNNNUUUU-OH
3
DNA轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)終止子模式圖轉(zhuǎn)錄圖4-8pKK223-3質(zhì)粒載體的物理圖譜
(二)哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)載體真核表達(dá)載體的真核表達(dá)元件有:?jiǎn)?dòng)子/增強(qiáng)子—克隆位點(diǎn)—終止位點(diǎn)和加polyA信號(hào)。1.原核DNA序列包括能在大腸桿菌中自身復(fù)制的復(fù)制子和抗藥基因的篩選標(biāo)記。2.啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游25~30bp有富含AT的TATA框,TATA框的上游約100~200bp處為上游啟動(dòng)子元件。3.增強(qiáng)子(enhancer)是一類顯著提高基因轉(zhuǎn)錄效率的順式作用元件。4.終止子和加polyA信號(hào)。
第三節(jié)分子克隆的基本步驟一、目的基因的獲取二、載體的選擇三、目的基因和載體酶切與連接四、重組DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞五、重組體的篩選和鑒定連接含重組子的陽(yáng)性克隆載體+目的基因轉(zhuǎn)化、篩選和鑒定陽(yáng)性克隆DNA重組體+受體細(xì)胞分切連轉(zhuǎn)篩基因工程步驟分--分離目的基因DNA和載體DNA從組織或器官中提取并分離出某基因DNA或cDNA目的基因DNA質(zhì)粒染色體基因克隆用細(xì)菌提取載體質(zhì)粒DNA質(zhì)粒DNA質(zhì)粒是細(xì)菌染色體外雙鏈環(huán)狀DNA,是基因工程最常用的載體之一。目的基因可以來(lái)源于動(dòng)植物的組織、培養(yǎng)的細(xì)胞或者PCR產(chǎn)物切--對(duì)目的基因DNA和載體DNA進(jìn)行酶切修飾目的DNA限制性核酸內(nèi)切酶質(zhì)粒DNA基因克隆的載體粘性末端平末端DNA經(jīng)過(guò)酶切后產(chǎn)生兩種形式的末端酶切后的質(zhì)粒示意圖酶切后的質(zhì)粒DNA簡(jiǎn)單表示為重組質(zhì)粒同種限制酶切除目的基因和載體,產(chǎn)生相互對(duì)應(yīng)的粘性末端,退火后以連接酶共價(jià)互補(bǔ)連接。連--目的基因連接到載體上,DNA連接酶連接切口。轉(zhuǎn)--即轉(zhuǎn)化。以質(zhì)粒DNA或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入受體細(xì)胞的過(guò)程稱為轉(zhuǎn)化(transformation)。重組質(zhì)粒細(xì)菌(CaCl2處理)細(xì)菌(CaCl2處理)質(zhì)粒導(dǎo)入未成功質(zhì)粒導(dǎo)入成功質(zhì)粒導(dǎo)入不成功細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)改變、通透性增加并具有攝取外源DNA能力的細(xì)胞稱謂感受態(tài)細(xì)胞(competentcell)。篩--即篩選。篩選含有質(zhì)粒的細(xì)菌和含有正確重組DNA的細(xì)菌克隆含重組質(zhì)粒的細(xì)菌不含質(zhì)粒的細(xì)菌含有抗生素的培養(yǎng)基由于質(zhì)粒本身能夠編碼產(chǎn)生分解抗生素的酶,因此,凡是轉(zhuǎn)化成功的細(xì)菌就能夠在含有抗生素的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。含質(zhì)粒的細(xì)菌(自身環(huán)化)含有質(zhì)粒者才能生存一、目的基因的獲?。ㄒ唬幕蛭膸?kù)中獲取(二)逆轉(zhuǎn)錄法(三)人工合成DNA片段(四)直接從染色體DNA中分離目的基因(一)從基因文庫(kù)中獲取
目的基因:
指被研究的某一基因或DNA序列,即需要克隆或表達(dá)的基因。
基因組文庫(kù)(genomiclibrary,G-文庫(kù))是指含有某種生物全部基因隨機(jī)片段的重組DNA克隆群。
cDNA文庫(kù)(cDNAlibrary):以細(xì)胞全部mRNA經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄,制備出全套cDNA建庫(kù)。構(gòu)建G文庫(kù)篩選目的基因一、分離基因組DNA二、載體的選擇(一般為
噬菌體)三、將基因組DNA片段連接入載體四、將重組載體轉(zhuǎn)入宿主細(xì)胞
組織細(xì)胞
破碎細(xì)胞,除去DNA與蛋白質(zhì)提取總RNA
Oligo(dT)纖維素親和層析制備mRNA
反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈合成cDNA第二鏈合成cDNA雙鏈
插入載體重組DNA
導(dǎo)入大腸桿菌擴(kuò)增構(gòu)建cDNA文庫(kù)構(gòu)建cDNA文庫(kù)篩選目的基因(二)逆轉(zhuǎn)錄PCR法。
選用富含目的基因mRNA的細(xì)胞作為實(shí)驗(yàn)材料,有利于分離到目的基因。如胰島素基因的mRNA主要存在于胰腺組織,血紅蛋白基因的mRNA占網(wǎng)質(zhì)紅細(xì)胞總mRNA的50%~90%。PCR
特點(diǎn):短時(shí)間獲得大量DNA片段。(三)人工合成DNA片段
根據(jù)已知某種基因的核苷酸序列,再用DNA合成儀人工合成目的基因,可分段合成。此法適用于合成分子量較小的目的基因(100bp以內(nèi)),如:人生長(zhǎng)激素釋放因子、血管加壓素、干擾素、胸腺素及胰島素原的基因等。(四)直接從染色體DNA中分離目的基因根據(jù)染色體DNA的限制性內(nèi)切酶圖譜,用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶切割染色體DNA、分離目的基因。本方法較適用于制備原核生物目的基因,
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