第10章 酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第1頁(yè)
第10章 酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第2頁(yè)
第10章 酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第3頁(yè)
第10章 酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第4頁(yè)
第10章 酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第5頁(yè)
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研究?jī)?nèi)容:反應(yīng)速率、影響其速率的因素第10章酶動(dòng)力學(xué)

化學(xué)反應(yīng)的兩個(gè)基本問(wèn)題:反應(yīng)進(jìn)行的方向、可能性和限度反應(yīng)進(jìn)行的速率和反應(yīng)機(jī)制一、有關(guān)化學(xué)動(dòng)力學(xué)概念化學(xué)熱力學(xué)化學(xué)動(dòng)力學(xué)(一)基元反應(yīng)和化學(xué)計(jì)量方程(二)化學(xué)反應(yīng)的速率方程基元反應(yīng)瞬時(shí)速率:基元反應(yīng)速率方程:

(三)反應(yīng)分子數(shù)和反應(yīng)級(jí)數(shù)1.反應(yīng)分子數(shù):反應(yīng)中真正相互作用的分子的數(shù)目。單分子反應(yīng):AP雙分子反應(yīng):A+BP+Q

反應(yīng)級(jí)數(shù):速率方程中反應(yīng)物濃度的指數(shù)或指數(shù)和。單分子反應(yīng)v=kc雙分子反應(yīng)v=kc1c2c、c1、c2:反應(yīng)物濃度(mol/l)

k:比例常數(shù)/反應(yīng)速率常數(shù)2.反應(yīng)級(jí)數(shù)能以v=kc表示,為一級(jí)反應(yīng);能以v=kc1c2表示,則為二級(jí)反應(yīng);v與反應(yīng)物濃度無(wú)關(guān),則為零級(jí)反應(yīng)。雙分子反應(yīng)、一級(jí)反應(yīng)(四)各級(jí)反應(yīng)的特征

1.一級(jí)反應(yīng):

反應(yīng)速率與反應(yīng)物濃度的一次方成正比。v=kcC0C0/20t?[P]Ct反應(yīng)物的消耗產(chǎn)物的增加半衰期t1/2:有一半反應(yīng)物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的時(shí)間lnC0lnC0/20t?Ctk當(dāng)t=t?時(shí),c=1/2c0,則t?=0.693/k,即半衰期與反應(yīng)物的初濃度無(wú)關(guān)。2.二級(jí)反應(yīng):v=k(a-x)(b–x)a、b:反應(yīng)物A、B的初濃度

x:t時(shí)已發(fā)生反應(yīng)的物質(zhì)濃度

(a-x)、(b–x):t時(shí)后A、B的濃度3.零級(jí)反應(yīng):v=k一級(jí)反應(yīng):半衰期與反應(yīng)物的初濃度無(wú)關(guān)二級(jí)反應(yīng):半衰期與反應(yīng)物的初濃度成反比零級(jí)反應(yīng):半衰期與反應(yīng)物的初濃度成正比E+SESP+Ek1k2k3二、中間絡(luò)合物學(xué)說(shuō)

k4三個(gè)假設(shè):(1)E與S形成ES復(fù)合物的反應(yīng)是快速平衡反應(yīng),而ES分解為E及P的反應(yīng)為慢反應(yīng),反應(yīng)速度取決于慢反應(yīng)即

V=k3[ES]。(2)S的總濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于E的總濃度,因此在反應(yīng)的初始階段,S的濃度可認(rèn)為不變即[S]=[St]。(3)P→0忽略這步反應(yīng)三、底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響(一)底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響(文字描述)1、底物濃度低時(shí),反應(yīng)速率與底物成正比,為一級(jí)反應(yīng)。2、底物濃度較高時(shí),反應(yīng)速率隨底物濃度升高而增加,但不成正比,為混合級(jí)反應(yīng)。3、底物濃度達(dá)到某一恒定值時(shí),反應(yīng)速率達(dá)到最大,不在增加。為零級(jí)反應(yīng)。(二)反應(yīng)速度與底物濃度關(guān)系的數(shù)學(xué)方程式——米氏方程(方程描述)VVmax[S]Km+[S]=──[S]:底物濃度V:不同[S]時(shí)的反應(yīng)速度Vmax:最大反應(yīng)速度(maximumvelocity)

Km:米氏常數(shù)(Michaelisconstant)

關(guān)于米氏方程的推導(dǎo)與發(fā)展?(了解)E+SESP+Ek1k2k3Km=

k2+k3k1米氏常數(shù)穩(wěn)態(tài)時(shí)ES濃度不變反應(yīng)速度:V0=k3[ES](Ⅲ)最大反應(yīng)速度:Vm=k3[Et](Ⅳ)ES的生成速度=消耗速度k1[E][S]=k2[ES]+k3[ES](Ⅰ)E的質(zhì)量平衡方程[E]=[Et]-[ES](Ⅱ)E+SESP+Ek1k2k3E+SESP+Ek1k2k3V=V0[S]Km+[S]Km=

k2+k3k1米氏常數(shù)

a.當(dāng)[S]很小時(shí)V=V[S]/Km一級(jí)反應(yīng)米氏曲線(xiàn)b.當(dāng)[S]很大時(shí)V=V[S]/[S]=V0級(jí)反應(yīng)混合級(jí)(三)米氏曲線(xiàn)(圖形描述)(四)動(dòng)力學(xué)參數(shù)的意義1、米氏常數(shù)Km的意義Km=[S](1)定義:Km值等于酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度,單位是mol/L。2=Km+[S]VmaxVmax[S]VmaxV[S]KmVmax/2(四)動(dòng)力學(xué)參數(shù)的意義1、米氏常數(shù)Km的意義(2)意義:對(duì)于簡(jiǎn)單的二步反應(yīng),Km的意義是真實(shí)解離常數(shù);對(duì)于多步反應(yīng),Km的意義是表觀(guān)解離常數(shù)。

其它:①Km是酶的特性常數(shù):

與pH、溫度、離子強(qiáng)度、酶及底物種類(lèi)有關(guān),與酶濃度無(wú)關(guān),可以鑒定酶。酶底物Km(mmol/L)脲酶尿素25溶菌酶6-N-乙酰葡萄糖胺0.006葡萄糖-6-磷酸脫氫酶6-磷酸-葡萄糖0.058胰凝乳蛋白酶苯甲酰酪氨酰胺2.5甲酰酪氨酰胺12.0乙酰酪氨酰胺32.0②可以判斷酶的專(zhuān)一性和天然底物Km值最小的底物——最適底物/天然底物1/Km近似表示酶對(duì)底物的親和力:1/Km越大、親和力越大Km=

k2+k3k1Km≈k2(分離能力)/k1(親合能力)E+SESP+Ek1k2k3Km越小,親和力越強(qiáng)。[S]很小時(shí),反應(yīng)速度就能達(dá)到很大。性能優(yōu),代謝中這類(lèi)酶更為重要k2>>k3時(shí)E+SESP+Ek1k2k3④Km可幫助判斷某代謝反應(yīng)的方向和途徑催化可逆反應(yīng)的酶對(duì)正/逆兩向底物Km不同——Km較小者為主要底物③根據(jù)Km:判斷某[s]時(shí)v與Vmax的關(guān)系判斷抑制劑的類(lèi)型(2)Vmax和k3(kcat)的意義一定酶濃度下,酶對(duì)特定底物的Vmax也是一個(gè)常數(shù)。[S]很大時(shí),Vmax=k3[E]。k3表示當(dāng)酶被底物飽和時(shí),每秒鐘每個(gè)酶分子轉(zhuǎn)換底物的分子數(shù),——又稱(chēng)為轉(zhuǎn)換數(shù)、催化常數(shù)kcatkcat越大,酶的催化效率越高(3)kcat/km的意義:V=Vmax[S]Km+[S]∵Vmax=kcat[Et]∴V=kcat[Et][S]Km+[S]當(dāng)[S]<<Km時(shí),[E]=[Et]是E和S反應(yīng)形成產(chǎn)物的表觀(guān)二級(jí)速率常數(shù)。其大小可用于比較酶的催化效率。kcat/km=

kcat/km的上限為k1,即生成ES的速率,即酶的催化效率不超過(guò)E和S形成ES的結(jié)合速率kcat/km的大小可以比較不同酶或同一種酶催化不同底物的催化效率(催化效率指數(shù)、專(zhuān)一性常數(shù))。(1)Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法(五)Km與Vm的求取林-貝氏方程(2)Eadie-Hofstee作圖法vV[S]Vmax斜率-Km四、多底物的酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)分為單底物、雙底物和三底物反應(yīng)1.酶促反應(yīng)按底物分子數(shù)分類(lèi):①有序反應(yīng)(orderedreactions)先導(dǎo)底物釋放釋放A和Q競(jìng)爭(zhēng)地與自由酶結(jié)合(1)序列反應(yīng)或單置換反應(yīng)2.多底物反應(yīng)按動(dòng)力學(xué)機(jī)制分類(lèi):②隨機(jī)反應(yīng)(randomreactions)如肌酸激酶使肌酸磷酸化的反應(yīng)AAEPE`PEE`QEQEBB

A和Q競(jìng)爭(zhēng)自由酶E形式B和P競(jìng)爭(zhēng)修飾酶形式E’A和Q不同E’結(jié)合B和P也不與E結(jié)合。(2)乒乓反應(yīng)或雙-置換反應(yīng)3.雙底物反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)方程(1)序列機(jī)制的底物動(dòng)力學(xué)方程及動(dòng)力學(xué)圖——在B的濃度達(dá)到飽和時(shí)A的米氏常數(shù)——在A(yíng)的濃度達(dá)到飽和時(shí)B的米氏常數(shù)——底物A與酶結(jié)合的解離常數(shù)——底物A、B都達(dá)到飽和時(shí)最大反應(yīng)速率(2)乒乓機(jī)制的底物動(dòng)力學(xué)方程及動(dòng)力學(xué)圖——在B的濃度達(dá)到飽和時(shí)A的米氏常數(shù)——在A(yíng)的濃度達(dá)到飽和時(shí)B的米氏常數(shù)——底物A、B都達(dá)到飽和時(shí)最大反應(yīng)速率五、影響酶促反應(yīng)速率的其它因素

(一)pH對(duì)酶反應(yīng)的影響最適pH時(shí)的酶活力最大最適pH因酶而異,多數(shù)酶在7.0左右是酶的特性之一,但不是特征常數(shù)pH最適pHv影響原因:

過(guò)酸過(guò)鹼導(dǎo)致酶蛋白變性

影響酶分子解離狀態(tài)、影響酶的活性中心構(gòu)象

影響底物分子解離狀態(tài)(二)溫度對(duì)酶反應(yīng)的影響影響:1、在達(dá)到最適溫度以前,反應(yīng)速度隨溫度升高而加快。2、在達(dá)到最適溫度以后,反應(yīng)速度隨溫度升高而下降。原因:溫度升高,活化分子越多,反應(yīng)速度快;當(dāng)溫度過(guò)高,酶變性,反應(yīng)速度下降。幾個(gè)概念:

溫度系數(shù):最適溫度:

酶的最適溫度不是一個(gè)固定不變的常數(shù)。最適溫度動(dòng)物酶

35~40℃植物酶40~50℃微生物大部分

40~50℃?zhèn)€別高溫菌90℃以上(三)激活劑對(duì)酶反應(yīng)的影響定義:凡是能提高酶活性的物質(zhì),稱(chēng)為酶的激活劑(activator)類(lèi)別

金屬離子:K+、Na+、Mg2+、Cu2+、Mn2+、Zn2+、Se3+、Co2+、Fe2+陰離子:

Cl-、Br-

有機(jī)分子還原劑:抗壞血酸、半胱氨酸、谷胱甘肽金屬螯合劑:EDTA六、酶的抑制作用抑制劑:使酶促反應(yīng)速率減慢或完全停止的物質(zhì)。抑制作用:抑制劑與酶的必需基因結(jié)合,而降低酶活力甚至使酶完全喪失活性的效應(yīng)。(有選擇性)失活作用:使酶Pr變性而引起酶活力喪失。無(wú)選擇性。(一)抑制作用的概念1、概念2、抑制程度的表示方法V0:Vi:不加入抑制劑時(shí)的反應(yīng)速率加入抑制劑后的反應(yīng)速率以反應(yīng)速率的變化表示1.相對(duì)活力(殘余活力分?jǐn)?shù))ViV02.抑制分?jǐn)?shù)指被抑制而失去活力的分?jǐn)?shù)V0Vi研究意義:研究酶的作用機(jī)理確定代謝途徑研制殺蟲(chóng)劑、藥物

不可逆抑制與可逆抑制(二)抑制作用的類(lèi)型抑制作用可通過(guò)透析等方法除去。原因:非共價(jià)鍵結(jié)合根據(jù)抑制劑與底物的關(guān)系競(jìng)爭(zhēng)性抑制(competitiveinhibition)非競(jìng)爭(zhēng)性抑制(non-competitiveI.)反競(jìng)爭(zhēng)性抑制(uncompetitiveI.)

1、可逆抑制:

競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用【舉例】

丙二酸與琥珀酸競(jìng)爭(zhēng)琥珀酸脫氫酶琥珀酸琥珀酸脫氫酶FADFADH2延胡索酸琥珀酸磺胺類(lèi)藥物的抑菌機(jī)制:與對(duì)氨基苯甲酸競(jìng)爭(zhēng)二氫葉酸合成酶二氫蝶呤啶+對(duì)氨基苯甲酸+谷氨酸二氫葉酸合成酶二氫葉酸利用競(jìng)爭(zhēng)性抑制是藥物設(shè)計(jì)主要思路磺胺類(lèi)藥抗菌機(jī)理:(與對(duì)氨基苯甲酸是結(jié)構(gòu)類(lèi)似物)競(jìng)爭(zhēng)性抑制細(xì)菌葉酸形成,抑制細(xì)菌繁殖人通過(guò)食物直接補(bǔ)充葉酸,對(duì)人無(wú)毒害。反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用2、不可逆抑制作用:

抑制劑與酶必需基團(tuán)以牢固的共價(jià)鍵相連很多為劇毒物質(zhì)重金屬、有機(jī)磷、有機(jī)汞、有機(jī)砷、氰化物、青霉素、毒鼠強(qiáng)等。應(yīng)用舉例有機(jī)磷化合物(敵百蟲(chóng)、沙林)乙酰膽堿酯酶OHPOC2H5OC2H5S有機(jī)磷農(nóng)藥部分

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