新冠病毒變異株監(jiān)測工作方案

新冠病毒變異株監(jiān)測工作方案四川省疾病預(yù)防控制中心新冠病毒全球流行情況

BA.5及其亞分支仍為全球優(yōu)勢流行毒株，占比約60%。

BA.2及其亞分支的流行比例升高，占比約18%。

占比前三的進(jìn)化分支：

―BA.2.75：15.26%

―BQ.1.1：10.33%―BQ.1.1.20：8.22%(丹麥)https://gisaid.org/Omicron變異株進(jìn)化速度四川本土疫情本土疫情基因分型本土疫情基因分型2020年12月郫都疫情B.1.362022年8月

西藏相關(guān)BA.2.762021年7月

南京相關(guān)疫情Delta2022年8月

海南相關(guān)BA.5.1.32021年11月

西北相關(guān)疫情Delta2022年8月

新疆相關(guān)BA.5.22022年2月

瀘州BA.1.12022年11月

內(nèi)蒙相關(guān)BF.72022年2月

成都BA.22022年4月

上海相關(guān)疫情BA.1.1/BA.2.22022年5月

廣安BA.2.22022年7月

成都BG.22022年7月

成都BA.2.386-12月全省本土序列變化情況8-12月市州數(shù)據(jù)報送情況月份報送序列市州數(shù)總計序列總計8月10839月1132610月1318311月1540012月83421334入境病例病毒亞型月份亞型數(shù)9月12種10月17種11月28種12月26種新冠病毒變異株監(jiān)測工作方案監(jiān)測目的、對象、時間監(jiān)測目的為實(shí)時動態(tài)監(jiān)測新冠病毒變異情況，評估不同變異株的臨床分型差異，及時監(jiān)測和捕獲傳播力、致病力和免疫逃逸能力發(fā)生重要改變的本土和輸入奧密克戎變異株，為檢測試劑、疫苗和藥物的研發(fā)和評價提供科學(xué)基礎(chǔ)。監(jiān)測對象（?）本?病例監(jiān)測。（?）輸?病例監(jiān)測。監(jiān)測時間全年持續(xù)開展監(jiān)測。監(jiān)測內(nèi)容和方法（?）監(jiān)測內(nèi)容抽取代表性城市哨點(diǎn)醫(yī)院門急診、重癥和死亡病例、代表性口岸（陸路、航空、海港）入境人員的新冠病毒核酸陽性樣本，開展新冠病毒全基因組測序，動態(tài)監(jiān)測病毒變異情況，及時發(fā)現(xiàn)輸入和本土流行的新變異株和潛在重要變異株，評估不同變異株的臨床分型差異，研判新變異株和重要變異株的致病力和免疫逃逸能力，及其對現(xiàn)有核酸檢測試劑及疫苗效力的影響。（?）監(jiān)測地點(diǎn)選取監(jiān)測內(nèi)容和方法本土病例監(jiān)測。每個省選擇不少于3個城市（含1個省會城市和2個地級市），每個城市選擇1-2個具有新冠重癥病房的三甲綜合醫(yī)院或新冠定點(diǎn)醫(yī)院作為哨點(diǎn)監(jiān)測醫(yī)院。鼓勵其他市州開展哨點(diǎn)監(jiān)測。輸入病例監(jiān)測陸路口岸（5個）：廣東深圳、云南瑞麗、內(nèi)蒙古滿洲里、黑龍江綏芬河/黑河、新疆霍爾果斯、廣西防城港/崇左；航空口岸（7個）：廣東廣州、四川成都、重慶、陜西西安、北京、福建廈門、上海；海港口岸（5個）：海南三亞、遼寧大連、山東青島、浙江寧波、天津。（三）樣本采集原則監(jiān)測內(nèi)容和方法本土病例監(jiān)測每個哨點(diǎn)醫(yī)院每周采集15例門急診新冠病例、10例重癥和所有因新冠死亡病例核酸陽性樣本，原則上每個哨點(diǎn)醫(yī)院每周采集重癥病例新冠病毒核酸陽性樣本不少于5份。輸入病例監(jiān)測上述入境口岸采用方便抽樣的方法每周抽樣采集10例新冠病毒核酸陽性樣本，原則上10份樣本盡可能代表不同來源國家、且相對均勻分散于一周的不同日期。上述監(jiān)測需在新冠病毒核酸陽性樣本采集后的一周內(nèi)完成病毒全基因組測序工作，病例采樣時間和序列上報時間不應(yīng)超過1周，在完成測序后的48小時內(nèi)將測序數(shù)據(jù)通過報送國家疾控中心病毒病所。監(jiān)測信息報告信息表各市州疾控統(tǒng)一將序列及信息表發(fā)給省疾控中心，省疾控匯總初