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文檔簡(jiǎn)介
第二章核酸的化學(xué)核酸的概念和重要性核酸的組成成分DNA的結(jié)構(gòu)DNA和基因組RNA的結(jié)構(gòu)和功能核酸的性質(zhì)核酸的序列測(cè)定
1869年Mistier從細(xì)胞核中分離出核素(nuclein)。1889年Altman制備了核酸(nucleicacid)。1930~40年,Kossel&Levene等確定核酸的的組分:核酸脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)核糖核酸(ribonucleicacid,RNA)“四核苷酸假說”:核酸由四種核苷酸組成的單體構(gòu)成的,缺乏結(jié)構(gòu)方面的多樣性。一、核酸的概念和重要性核酸nucleicacid核苷酸nucleotide核苷nucleoside磷酸phosphate嘌呤堿purinebase
或嘧啶堿pyrimidinebase(堿基base)核糖ribose或脫氧核糖deoxyribose
(戊糖amylsugar)二、核酸的組成成分OHOH2COHOHOH12OHOH2COHOH12β-D-2-核糖β-D-2-脫氧核糖O核糖+H+糠醛甲基間苯二酚FeCl3綠色產(chǎn)物Δ脫氧核糖+H+
Δω-羥基-γ-酮戊醛二苯胺藍(lán)色產(chǎn)物RNA和DNA定性、定量測(cè)定(一)核糖和脫氧核糖核糖和脫氧核糖(二)嘌呤堿與嘧啶堿腺嘌呤Adenine鳥嘌呤Guanine尿嘧啶Uracil胞嘧啶Cytosine胸腺嘧啶Thymine腺嘌呤Adenine鳥嘌呤Guanine尿嘧啶Uracil胞嘧啶cytosine胸腺嘧啶Thymine
植物中有大量5-甲基胞嘧啶。
E.coli噬菌體中,5-羥甲基胞嘧啶代替C。
稀有堿基:100余種,多數(shù)是甲基化的產(chǎn)物。
DNA由A、G、C、T堿基構(gòu)成。
RNA由A、G、C、U堿基構(gòu)成。修飾堿基(三)核苷核苷由戊糖和堿基縮合而成,糖環(huán)上C1與嘧啶堿的N1或與嘌呤堿的N9連接。核酸中的核苷均為β-型核苷DNA的戊糖是:脫氧核糖
RNA的戊糖是:核糖(四)核苷酸核苷中戊糖C3、C5羥基被磷酸酯化,生成核苷酸。
1、
構(gòu)成DNA、RNA的核苷酸
2、
細(xì)胞內(nèi)游離核苷酸及其衍生物
①核苷5’-多磷酸化合物
ATP、GTP、CTP、ppppA、ppppG
在能量代謝和物質(zhì)代謝及調(diào)控中起重要作用。
②環(huán)核苷酸
cAMP(3’,5’-cAMP)cGMP(3’,5’-cGMP)
它們作為質(zhì)膜的激素的第二信使起作用,cAMP調(diào)節(jié)細(xì)胞的糖代謝、脂代謝。
③核苷5’多磷酸3’多磷酸化合物
ppGpppppGppppApp
④核苷酸衍生物
HSCoA、NAD+、NADP+、FAD等輔助因子。
GDP-半乳糖、GDP-葡萄糖等是糖蛋白生物合成的活性糖基供體。
ATP(腺嘌呤核糖核苷三磷酸)ATP的性質(zhì)ATP是生物體內(nèi)最重要的能量轉(zhuǎn)換中間體。ATP水解釋放出來的能量用于推動(dòng)生物體內(nèi)各種需能的生化反應(yīng)。ATP分子的最顯著特點(diǎn)是含有兩個(gè)高能磷酸鍵。ATP水解時(shí),可以釋放出大量自由能。ATP也是一種很好的磷?;瘎?。磷?;磻?yīng)的底物可以是普通的有機(jī)分子,也可以是酶。磷酰化的底物分子具有較高的能量(活化分子),是許多生物化學(xué)反應(yīng)的激活步驟。
GTP(鳥嘌呤核糖核苷三磷酸)GTP是生物體內(nèi)游離存在的另一種重要的核苷酸衍生物。它具有ATP類似的結(jié)構(gòu),也是一種高能化合物。GTP主要是作為蛋白質(zhì)合成中磷?;w。在許多情況下,ATP和GTP可以相互轉(zhuǎn)換。
cAMP
和cGMPcAMP(3’,5’-環(huán)腺嘌呤核苷一磷酸)和cGMP(3’,5’-環(huán)鳥嘌呤核苷一磷酸)的主要功能是作為細(xì)胞之間傳遞信息的信使。cAMP和cGMP的環(huán)狀磷酯鍵是一個(gè)高能鍵。在pH7.4條件下,cAMP和cGMP的水解能約為43.9kj/mol,比ATP水解能高得多。(五)核苷酸的連接方式核苷酸間的連接方式是:3/-5/-磷酸二
酯鍵
一級(jí):脫氧核苷酸分子間連接方式及排列順序。二級(jí):DNA的兩條多聚核苷酸鏈間通過氫鍵形成的雙螺旋結(jié)構(gòu)。三級(jí):DNA雙鏈進(jìn)一步折疊卷曲形成的構(gòu)象。
三、DNA的結(jié)構(gòu)因?yàn)镈NA的脫氧核苷酸只在它們所攜帶的堿基上有區(qū)別,所以脫氧核苷酸的序列常被認(rèn)為是堿基序列(basesequence)。通常堿基序列由DNA鏈的5′→3′方向?qū)?。DNA中有4種類型的核苷酸,有n個(gè)核苷酸組成的DNA鏈中可能有的不同序列總數(shù)為4n。(一)DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)(二)
DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
1953年,Watson和Crick根據(jù)Chargaff規(guī)律和DNANa鹽纖維的X光衍射數(shù)據(jù)提出了DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。
Chargaff
規(guī)律1950年
a.所有DNA中,A=T,G=C且A+G=C+T。
b.DNA的堿基組成具有種的特異性,即不同生物的DNA皆有自己獨(dú)特的堿基組成。
c.DNA堿基組成沒有組織和器官的特異性。
d.年齡、營(yíng)養(yǎng)狀況、環(huán)境等因素不影響DNA的堿基組成。
DNA的Na鹽纖維和
DNA晶體的X光衍射分析
相對(duì)濕度92%,DNA鈉鹽結(jié)晶,B—DNA。
相對(duì)濕度75%,DNA鈉鹽結(jié)晶,A—DNA。
Z—DNA。
生物體內(nèi)DNA均為B—DNA。
Franklin的工作電位滴定證明,嘌呤與嘧啶的可解離基團(tuán)由氫鍵連接。1、
Watson-Crick雙螺旋結(jié)構(gòu)建立的根據(jù)2、
Watson-Crick雙螺旋結(jié)構(gòu)模型a.兩條反平行的多核苷酸鏈繞同一中心軸相纏繞,形成右手雙股螺旋,一條5’→3’,另一條3’→5’
b.嘌呤與嘧啶堿位于雙螺旋的內(nèi)側(cè),磷酸與脫氧核糖在外側(cè)。磷酸與脫氧核糖彼此通過3/、5/-磷酸二酯鍵相連接,構(gòu)成DNA分子的骨架。
寬1.2nm寬0.6nm
大溝
小溝
深0.85nm深0.75nm
c.螺旋平均直徑2nm
每圈螺旋含10個(gè)核苷酸
堿基堆積距離:0.34nm
螺距:3.4nm
d.兩條核苷酸鏈,依靠彼此堿基間形成的氫鏈結(jié)合在一起。堿基平面垂直于螺旋軸。A=T、G=C
堿基互補(bǔ)原則具有極重要的生物學(xué)意義:DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、反轉(zhuǎn)錄等的分子基礎(chǔ)都是堿基互補(bǔ)。
堿基間的連接(堿基互補(bǔ))H—H(3)H—H(2)3、
穩(wěn)定雙螺旋結(jié)構(gòu)的因素①堿基堆積力(主要因素)
形成疏水環(huán)境。
②堿基配對(duì)的氫鍵。GC含量越多,越穩(wěn)定。
③磷酸基上的負(fù)電荷與介質(zhì)中的陽(yáng)離子或組蛋白的正離子之間形成離子鍵,中和了磷酸基上的負(fù)電荷間的斥力,有助于DNA穩(wěn)定。
④堿基處于雙螺旋內(nèi)部的疏水環(huán)境中,可免受水溶性活性小分子的攻擊。
DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的不均一性和多型性
DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的不均一性DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的多型性
DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的不均一性
1、
反向重復(fù)序列(回文序列)
DNA序列中,以某一中心區(qū)域?yàn)閷?duì)稱軸,其兩側(cè)的堿基對(duì)順序正讀和反讀都相同,即對(duì)稱軸一側(cè)的片段旋轉(zhuǎn)180°后,與另一側(cè)片段對(duì)稱重復(fù)。
較長(zhǎng)的回文結(jié)構(gòu),在某些因素作用下,可形成莖環(huán)式的十字結(jié)構(gòu)和發(fā)夾結(jié)構(gòu)。功能還不完全清楚,但轉(zhuǎn)錄的終止作用與回文結(jié)構(gòu)有關(guān)。
較短的回文序列,可作為一種特別信號(hào),如限制性核酸內(nèi)切酶的識(shí)別位點(diǎn)。
2、
富含AT的序列
高等生物中,A+T與C+G的含量差不多相等,但在它們的染色體的某一區(qū)域,AT含量可能很高。
在很多有重要調(diào)節(jié)功能(不是蛋白質(zhì)編碼區(qū))的DNA區(qū)段都富含AT堿基對(duì)。特別是在復(fù)制起點(diǎn)和啟動(dòng)的Pribnow框的DNA區(qū)中,富含AT對(duì)。這對(duì)于復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的起始十分重要,因?yàn)镚C對(duì)有三個(gè)氫鍵,而AT對(duì)只有兩個(gè)氫鍵,此處雙鍵易解開。
DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的多型性
DNA雙螺旋的構(gòu)象類型B-DNA:92%相對(duì)濕度,接近細(xì)胞內(nèi)的DNA構(gòu)象,與Watson和Crick提出的模型相似。A-DNA:75%相對(duì)濕度,與溶液中DNA-RNA雜交分子的構(gòu)象相似,推測(cè)轉(zhuǎn)錄時(shí)發(fā)生B→A。其堿基平面傾斜20°,螺距與每一轉(zhuǎn)堿基對(duì)數(shù)目都有變化。
Z-DNA:主鏈呈鋸齒型左向盤繞,直徑約1.8nm,螺距4.5nm,每一轉(zhuǎn)含12個(gè)bp,只有小溝。B-DNA與Z-DNA的相互轉(zhuǎn)換可能和基因的調(diào)控有關(guān)。1、B—DNA:典型的Watson-Crick雙螺旋DNA右手雙股螺旋
每圈螺旋10.4個(gè)堿基對(duì)
每對(duì)
螺旋扭角36°
螺距:3.32nm
堿基傾角:1°
2、A-DNA在相對(duì)濕度75%以下所獲得的DNA纖維。
A-DNA也是右手雙螺旋,外形粗短。
RNA-RNA、RNA-DNA雜交分子具有這種結(jié)構(gòu)。
3、Z-DNA左手螺旋的DNA。
天然B-DNA的局部區(qū)域可以形成Z0-DNA4、DNA三股螺旋
在多聚嘧啶和多聚嘌呤組成的DNA螺旋區(qū)段,序列中有較長(zhǎng)的鏡像重復(fù)時(shí),可形成局部三股螺旋,稱H-DNA。
DNA的三鏈結(jié)構(gòu)常出現(xiàn)在DNA復(fù)制、重組、轉(zhuǎn)錄的起始或調(diào)節(jié)位點(diǎn),第三股鏈的存在可能使一些調(diào)控蛋白或RNA聚合酶等難以與該區(qū)段結(jié)合,從而阻遏有關(guān)遺傳信息的表達(dá)。
環(huán)狀DNA生物體內(nèi)有些DNA是以雙鏈環(huán)狀DNA的形式存在,包括:
某些病毒DNA
某些噬菌體DNA
某些細(xì)菌染色體DNA
細(xì)菌質(zhì)粒DNA
真核細(xì)胞中的線粒體DNA、葉綠體DNA1、
環(huán)形DNA的不同構(gòu)象(1)、
松弛環(huán)形DNA
線形DNA直接環(huán)化
(2)、
解鏈環(huán)形DNA
線形DNA擰松后再環(huán)化
(3)、
正超螺旋與負(fù)超螺旋DNA
線形DNA擰緊或擰松后再環(huán)化,成為超螺旋結(jié)構(gòu)。
繩子的兩股以右旋方向纏繞,如果在一端使繩子向纏緊的方向旋轉(zhuǎn),再將繩子兩端連接起來,會(huì)產(chǎn)生一個(gè)左旋的超螺旋,以解除外加的旋轉(zhuǎn)造成的脅變,這樣的超螺旋叫正超螺旋。
如果在繩子一端向松纏方向旋轉(zhuǎn),再將繩子兩端連接起來,會(huì)產(chǎn)生一個(gè)右旋的超螺旋,以解除外加的旋轉(zhuǎn)所造成的脅變,這樣的超螺旋稱負(fù)超螺旋。
對(duì)于右手螺旋的DNA分子,如果每圈初級(jí)螺旋的堿基對(duì)數(shù)小于10.4,則其二級(jí)結(jié)構(gòu)處于緊纏狀態(tài),是正超螺旋。
如果每圈初級(jí)螺旋的堿基對(duì)數(shù)大于10.4,則其二級(jí)結(jié)構(gòu)處于松纏狀態(tài),是負(fù)超螺旋
2、
環(huán)形DNA的拓?fù)鋵W(xué)特性(1)①連環(huán)數(shù)(L)
DNA雙螺旋中,一條鏈以右手螺旋繞另一條鏈纏繞的次數(shù),以L表示。
松馳環(huán):L=25解鏈環(huán):L=23超螺旋:L=23
②纏繞數(shù)(T)
DNA分子中的Watson-Crick螺旋數(shù)目,以T表示
松馳環(huán)T=25解鏈環(huán)T=23超螺旋T=25
③超螺旋周數(shù)(扭曲數(shù)W)
松馳環(huán)W=0解鏈環(huán)W=0超螺旋W=-2
L=T+W
④比連環(huán)差(λ)
表示DNA的超螺旋程度
λ=(L—L0)/L0
L0是指松馳環(huán)形DNA的L值
天然DNA的超螺旋密度一般為-0.03~-0.09,平均每100bp上有3-9個(gè)負(fù)超螺旋。
負(fù)超螺旋DNA是由于兩條鏈的纏繞不足引起,很易解鏈,易于參加DNA的復(fù)制、重組和轉(zhuǎn)錄等需要將兩條鏈分開才能進(jìn)行的反應(yīng)。
環(huán)形DNA的拓?fù)鋵W(xué)特性(2)3、
拓?fù)洚悩?gòu)酶此酶能改變DNA拓?fù)洚悩?gòu)體的L值。
①拓?fù)洚悩?gòu)酶酶I(擰緊)
能使雙鏈負(fù)超螺旋DNA轉(zhuǎn)變成松馳形環(huán)狀DNA,每一次作用可使L值增加1,同時(shí),使松馳環(huán)狀DNA轉(zhuǎn)變成正超螺旋。
②拓?fù)洚悩?gòu)酶酶II(擰松)
能使松馳環(huán)狀DNA轉(zhuǎn)變成負(fù)超螺旋形DNA,每次催化使L減少2,同時(shí)能使正超螺旋轉(zhuǎn)變成松馳DNA。
染色體的結(jié)構(gòu)
1、
大腸桿菌染色體大腸桿菌染色體是由4.2×106bp組成的雙鏈環(huán)狀DNA分子,約3000個(gè)基因。
大腸桿菌DNA結(jié)合蛋白:
每個(gè)細(xì)胞
H兩個(gè)28KD的相同亞基30000個(gè)二聚體
HU兩個(gè)各9KD的不同亞基40000個(gè)二體聚體
HLP117KD的亞基20000個(gè)單體
P3KD的亞基
未知
這些DNA結(jié)合蛋白,使4.2×106bp的E.coli染色體DNA壓縮成為一個(gè)手腳架形結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)中心是多種DNA結(jié)合蛋白,DNA雙螺旋分子有許多位點(diǎn)與這些蛋白結(jié)合,形成約100個(gè)小區(qū),每個(gè)小區(qū)的DNA都是負(fù)超螺旋,一個(gè)小區(qū)的DNA有兩個(gè)端點(diǎn)被蛋白質(zhì)固定,每個(gè)小區(qū)相對(duì)獨(dú)立。
用極微量的DNA酶I處理時(shí),只能使少量小區(qū)的DNA成為松馳狀態(tài),而其它小區(qū)仍然保持超螺旋狀態(tài)。
2、
真核生物染色體主要由組蛋白和DNA組成。
組蛋白是富含堿性a.a(Lys、Arg)的堿性蛋白質(zhì),根據(jù)Lys/Arg比值不同,可分為H1、H2A、H2B、H3、H4五種,均為單鏈蛋白質(zhì),分子量11000-21000。
H2A、H2B、H3、H4各兩分子對(duì)稱聚集成組蛋白八聚體。
146bp長(zhǎng)度的DNA雙螺旋盤繞在八聚體上形成核小體。
核小體間DNA長(zhǎng)度15-100bp(一般60bp)其上結(jié)合有H1
2H2A、2H2B、2H3、2H4組蛋白八聚體146bpDNA核小體
串聯(lián)
染色質(zhì)
折疊
染色體
真核生物染色體組成組蛋白的組成多級(jí)螺旋模型壓縮倍數(shù)76405(8400)
DNA
→
核小體→螺線管→超螺線管→染色單體2nm10nm
30(10)nm400nm
2~10μm
一級(jí)包裝二級(jí)包裝三級(jí)包裝四級(jí)包裝
真核生物染色體包裝DNA的生物學(xué)功能(1)首次直接證明DNA的遺傳功能的是Avery的肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)。
Avery的肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn):DNA的生物學(xué)功能(2)DNATranscription
RNA(mRNA、tRNA、rRNA)TranslationProtein基因基因是DNA片段的核苷酸序列,DNA分子中最小的功能單位。結(jié)構(gòu)基因調(diào)節(jié)基因基因組四DNA與基因組1.DNA大部分為結(jié)構(gòu)基因,每個(gè)基因出現(xiàn)頻率低。2.功能相關(guān)基因串聯(lián)在一起,并轉(zhuǎn)錄在同一mRNA中(多順反子)。3.有基因重疊現(xiàn)象。ABCDEFG原核生物基因組的特點(diǎn)1.重復(fù)序列單拷貝序列:在整個(gè)DNA中只出現(xiàn)一次或少數(shù)幾次,主要為編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因。中度重復(fù)序列:在DNA中可重復(fù)幾十次到幾千次。高度重復(fù)序列:可重復(fù)幾百萬(wàn)次高度重復(fù)序列一般富含A-T或G-C,富含A-T的在密度梯度離心時(shí)在離心管中形成的區(qū)帶比主體DNA更靠近管口;富含G-C的更靠近管底,稱為衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)富含A-T富含G-C主體DNA真核生物基因組的特點(diǎn)(1)2.有斷裂基因mRNA1872bp內(nèi)含子(intron):基因中不為多肽編碼,不在mRNA中出現(xiàn)。ABCDEG7700bpF外顯子(exons):為多肽編碼的基因片段。:由于基因中內(nèi)含子的存在。例外:組蛋白基因(histongene)和干擾素基因(interferongene)沒有內(nèi)含子。transcription真核生物基因組的特點(diǎn)(2)mRNA&hnRNAmRNA約占細(xì)胞RNA總量的3~5%,是蛋白質(zhì)合成的模板。真核生物mRNA的前體在核內(nèi)合成,包括整個(gè)基因的內(nèi)含子和外顯子的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,形成分子大小極不均勻的hnRNA。snRNA&asRNAsnRNA主要存于細(xì)胞核中,占細(xì)胞RNA總量的0.1~1%,與蛋白質(zhì)以RNP(核糖核酸蛋白)的形式存在,在hnRNA和rRNA的加工、細(xì)胞分裂和分化、協(xié)助細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸、構(gòu)成染色質(zhì)等方面有重要作用。asRNA可通過互補(bǔ)序列與特定的mRNA結(jié)合,抑制mRNA的翻譯,還可抑制DNA的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。1981年,Cech發(fā)現(xiàn)RNA的催化活性,提出核酶(ribozyme)。大部分核酶參加RNA的加工和成熟,也有催化C-N鍵的合成,23SrRNA具肽酰轉(zhuǎn)移酶活性。RNA在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯中均有一定的調(diào)控作用,與某寫物質(zhì)的運(yùn)輸與定位有關(guān)。RNA的其它功能五RNA的結(jié)構(gòu)
mRNAmessegerRNA的結(jié)構(gòu)tRNAtransferRNA的結(jié)構(gòu)
rRNAribosomeRNA的結(jié)構(gòu)
5.1
RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
RNA是AMP、GMP、CMP、UMP通過3/、5/磷酸二酯鍵形成的線形多聚體。
①組成RNA的戊糖是核糖
②堿基中RNA的U替代DNA中的T,此外,RNA中還有一些稀有堿基。
③天然RNA分子都是單鏈線形分子,只有部分區(qū)域是A-型雙螺旋結(jié)構(gòu)。雙螺旋區(qū)一般占RNA分子的50%左右。5.2RNA基本結(jié)構(gòu)
①組成RNA的戊糖是核糖
②堿基中RNA的U替代DNA中的T,此外,RNA中還有一些稀有堿基。
③天然RNA分子都是單鏈線形分子,只有部分區(qū)域是A-型雙螺旋結(jié)構(gòu)。雙螺旋區(qū)一般占RNA分子的50%左右。
5.3RNA的類型
細(xì)胞中的RNA,按其在蛋白質(zhì)合成中所起的作用,主要可分為三種類型核糖體RNArRNA
轉(zhuǎn)運(yùn)
RNAtRNA
信使
RNAmRNA
此外,真核生物細(xì)胞中有少量核內(nèi)小RNA(smallnuclearRNAsnRNA)
沉降系數(shù):?jiǎn)挝浑x心場(chǎng)中的沉降速度,以S為單位,即10-13秒。
如23SrRNA
,單位離心場(chǎng)中沉降23×10-13秒
5SrRNA
,單位離心場(chǎng)中沉降5×10-13秒
5.4tRNA的結(jié)構(gòu)
tRNA約占全部RNA的15%
主要功能:在蛋白質(zhì)生物合成過程中轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸。
已知一級(jí)結(jié)構(gòu)的tRNA有160種,每種tRNA可運(yùn)載一種特定的a.a,一種a.a可由一種或多種tRNA運(yùn)載。
結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
①分子量在25kd左右,70-90b,沉降系數(shù)4S左右
②堿基組成中有較多稀有堿基
③3’末端為…CpCpA-OH,用來接受活化的氨基酸,此末端稱接受末端。
④5’末端大多為pG…或pC…
⑤二級(jí)結(jié)構(gòu)是三葉草形
1966年Crick對(duì)于tRNA能識(shí)別幾種密碼子的現(xiàn)象,提出堿基配對(duì)的“擺動(dòng)學(xué)說”:
認(rèn)為除A-U、G-C配對(duì)外,還有非標(biāo)準(zhǔn)配對(duì),I-A、I-C、I-U,并強(qiáng)調(diào)密碼子的5’端第1、2個(gè)堿基嚴(yán)格遵循標(biāo)準(zhǔn)配對(duì),而第3個(gè)堿基可以非標(biāo)準(zhǔn)配對(duì),具有一定程度的擺動(dòng)靈活性。
5.5mRNA的結(jié)構(gòu)
mRNA是從DNA上轉(zhuǎn)錄而來的,其功能是依據(jù)DNA的遺傳信息,指導(dǎo)各種蛋白質(zhì)的生物合成,每一種蛋白質(zhì)都由一種相應(yīng)的mRNA編碼,細(xì)胞內(nèi)
mRNA種類很多,大小不一,每種含量極低。
從功能上講,一個(gè)基因就是一個(gè)順反子,原核生物的mRNA是多順反子,真核mRNA是單順反子。
順反子:是由順反試驗(yàn)所規(guī)定的遺傳單位,相當(dāng)于一種蛋白質(zhì)的基因。1、
真核mRNA(單順反子)(1)、3’-端有一段約30-300核苷酸的polyA。
PolyA是轉(zhuǎn)錄后,經(jīng)polyA聚合酶添加上,polyA聚合酶對(duì)mRNA專一。
原核mRNA一般無polyA。polyA與mRNA半壽期有關(guān),新合成的mRNA,其polyA較長(zhǎng);而衰老的mRNA,其polyA較短。
polyA功能:
PolyA是mRNA由核進(jìn)入胞質(zhì)所必需的形式。
PolyA大大提高mRNA在胞質(zhì)中的穩(wěn)定性。
(2)、5’-帽子帽子
5’末端的鳥嘌呤N7被甲基化,鳥嘌呤核苷酸經(jīng)焦磷酸與相鄰的一個(gè)核苷酸相連,形成5’-5’-磷酸二酯鍵。
帽子的功能:
可抵抗5’核酸外切酶降解mRNA。
可為核糖體提供識(shí)別位點(diǎn),使mRNA很快與核糖體結(jié)合,促進(jìn)蛋白質(zhì)合成起始復(fù)合物的形成。
2、
原核mRNA(多順反子)原核mRNA由先導(dǎo)區(qū)、插入序列、翻譯區(qū)和末端序列組成。沒有5/帽子和3/polyA。
舉列:MS2病毒mRNA,3569b,有三個(gè)順反子,分別編碼A蛋白、外殼蛋白和復(fù)制酶三種蛋白質(zhì)。
5’端先導(dǎo)區(qū)中,有一段富含嘌呤的堿基序列,典型的為5’-AGGAGGU-3’,位于起始密碼子AUG前約10核苷酸處,此序列由Shine和Dalgarno發(fā)現(xiàn),稱SD序列。
SD序列和核糖體16S的rRNA的3’末端富含嘧啶堿基的序列互補(bǔ),這種互補(bǔ)序列與mRNA對(duì)核糖體的識(shí)別有關(guān)。
原核mRNA代謝很快,半壽期幾秒至十幾分鐘
5.6
rRNA的結(jié)構(gòu)
rRNA占總RNA的80%左右。
功能:rRNA是構(gòu)成核糖體的骨架,與核糖體結(jié)合蛋白一起構(gòu)成核糖體,為蛋白質(zhì)的合成提供場(chǎng)所。
大腸桿菌中有三類rRNA(原核)
5SrRNA、16SrRNA、23SrRNA
真核細(xì)胞有四類rRNA
5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA、28SrRNA
占細(xì)胞RNA總量的80%,與蛋白質(zhì)(40%)共同組成核糖體。原核生物
真核生物核糖體rRNA核糖體rRNA70S(30S、50S)16S、5S、23S80S(40S、60S)18S、5S、5.8S、28S
rRNA六核酸的性質(zhì)一般理化性質(zhì)核酸的紫外吸收性質(zhì)核酸結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性核酸的變性核酸的復(fù)性核酸的分子雜交6.1一般理化性質(zhì)1.為兩性電解質(zhì),通常表現(xiàn)為酸性。2.DNA為白色纖維狀固體,RNA為白色粉末,不溶于有機(jī)溶劑。3.DNA溶液的粘度極高,而RNA溶液要小得多。4.RNA能在室溫條件下被稀堿水解而DNA對(duì)堿穩(wěn)定。5.利用核糖和脫氧核糖不同的顯色反應(yīng)鑒定DNA與RNA。6.2核酸的紫外吸收性質(zhì)核酸的堿基具有
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