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文檔簡(jiǎn)介
DNA復(fù)制
(replication)
——
由親代DNA合成兩個(gè)相同的子代DNA的過(guò)程(DNA指導(dǎo)的DNA生物合成)。
復(fù)制親代DNA子代DNA一、復(fù)制可能的幾種方式全保留式半保留式混合式DNA復(fù)制方式——密度梯度實(shí)驗(yàn)
含重氮-DNA的細(xì)菌培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液
第一代繼續(xù)培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液第二代梯度離心結(jié)果
-半保留復(fù)制
二、DNA半保留復(fù)制所需條件:模板(template):
解開(kāi)成單鏈的DNA母鏈;底物(substrate)
:
4種脫氧核苷三磷酸(dATP,dGTP,dCTP,dTTP);聚合酶(polymerase):
依賴DNA的DNA聚合酶(DDDP),簡(jiǎn)寫為DNA-pol;如何獲得單鏈DNA模板??多種蛋白質(zhì)參與(以大腸桿菌為例)解鏈酶(helicase);單鏈結(jié)合蛋白(single-strandDNAbindingprotein,SSB);DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNAtopoisomerase
)解鏈酶(helicase)
——
利用
ATP供能,作用于氫鍵,使DNA雙鏈解開(kāi)成為兩條單鏈。單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)
SSBDnaBDnaC解鏈方向拓?fù)洚悩?gòu)酶解除超螺旋DNA線性雙螺旋從中間解鏈上下都過(guò)度擰緊超螺旋進(jìn)一步解鏈就更加困難拓?fù)洚悩?gòu)酶I切開(kāi)超螺旋的單鏈,再連接成雙鏈。無(wú)需ATP。拓?fù)洚悩?gòu)酶II切開(kāi)超螺旋的雙鏈,解除超螺旋,再連接成雙鏈。參與復(fù)制全過(guò)程DNA聚合酶的分類1、原核生物的DNA聚合酶:DNA-polⅠDNA-polⅡDNA-polⅢDNA聚合酶——DNA生物合成
※大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ(E.ColiDNApolymeraseⅠ
)和Klenow片段
※大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ-復(fù)制中DNA鏈延伸
※大腸桿菌DNA聚合酶Ⅱ(一)DNA聚合酶Ⅰ和Klenow片段
大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ是單一多肽鏈的多功能酶,分子量為102kD,它具有3種酶活性:①5
→3
DNA聚合酶活性。②3
→5
核酸外切酶活性。③5
→3
核酸外切酶活性。(DNA合成)(校對(duì))(切除RNA引物和突變序列)
5
至3
的聚合活性
dTTP3'(dNMP)n+dNTP
(dNMP)
n+1+ppi3'
ATGCAATTGC5'||||5
TACGppi
TDNA聚合酶(DNAdependentDNApolymerase,DDDP)
聚合反應(yīng)的特點(diǎn):1、聚合反應(yīng)具有方向性:5
3
2、DNA聚合酶不能催化兩個(gè)游離的脫氧核苷酸聚合,只能在一段寡核苷酸的3-OH逐個(gè)添加脫氧核苷酸,使核苷酸鏈不斷延長(zhǎng)。5’AGCTTCAGGATA
3’
|||||||||||3’TCGAAGTCCTAGCGAC5’3
5
外切酶活性
5
3
外切酶活性?切除引物或突變的DNA片段辨認(rèn)錯(cuò)配的堿基對(duì),將其水解-校對(duì)
核酸外切酶活性
真核生物的DNA聚合酶DNA-pol
后隨鏈合成先導(dǎo)鏈合成DNA修復(fù)起校讀、修復(fù)和填補(bǔ)缺口的作用?線粒體DNA復(fù)制DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
復(fù)制的保真性(fidelity)
DNA聚合酶對(duì)模板的依賴性,是子鏈與母鏈能準(zhǔn)確配對(duì)的保證。復(fù)制過(guò)程中,復(fù)制的保真性至少依賴三種機(jī)制:1、遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律2、聚合酶在復(fù)制延長(zhǎng)時(shí)對(duì)堿基的選擇功能3、復(fù)制出錯(cuò)時(shí)DNA-pol的及時(shí)校讀功能DNA復(fù)制中為何需RNA引物?DNA聚合酶沒(méi)有從頭催化2個(gè)游離的脫氧核苷三磷酸聚合的能力;只能在3’-OH端與按堿基配對(duì)的dNTP進(jìn)行反應(yīng),生成磷酸二酯鍵;引物提供游離的3’-OH末端;引物酶和引發(fā)體引物酶(
primase
)在模板的復(fù)制起始部位催化NTP的聚合,形成短片段的RNA。這一小段RNA作為復(fù)制的引物(primer),提供3
-OH末端,使DNA-pol能夠催化dNTP聚合。依賴DNA的RNA聚合酶引物酶與其他和復(fù)制有關(guān)的蛋白質(zhì)形成的復(fù)合物。引發(fā)體(primosome)DNA連接酶(DNAligase
)連接DNA鏈3
-OH末端和相鄰DNA鏈5
-P末端,使二者生成磷酸酯鍵,從而把兩段相鄰的DNA鏈連接成完整的鏈。ATPDNA連接酶在DNA修復(fù)、重組、剪接中也起連接缺口的作用。OHPDNA復(fù)制過(guò)程G1G2SM哺乳動(dòng)物的細(xì)胞周期DNA合成(synthesis)期人為分成:起始、延長(zhǎng)、終止三個(gè)階段一、復(fù)制的起始需要解決兩個(gè)問(wèn)題:1、DNA解開(kāi)成單鏈,提供模板2、生成引物,提供3-OH末端
相關(guān)的幾個(gè)概念:1、復(fù)制起始點(diǎn)(E.coli-oriC)GATTNTTTATTT···GATCTNTTNTATT···GATCCTTATTAG···11317293244···TGTGGATTA-‖-TTATTACACA-‖-TTTGGATAA-‖-TTATCCACA5866166174201209237245串聯(lián)重復(fù)序列反向重復(fù)序列5
3
5
3
復(fù)制時(shí)DNA雙鏈解開(kāi)分成二股單鏈?新鏈沿著張開(kāi)的二股單鏈生成,復(fù)制中形成的這種Y字形的結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉。2、復(fù)制叉(replicationfork)3
5
5
3
新鏈3
5
3
5
親代DNA復(fù)制方向原核生物例如E.coli,是從固定的復(fù)制起始點(diǎn)開(kāi)始,同時(shí)向兩個(gè)方向進(jìn)行復(fù)制
稱為雙向復(fù)制(bidirectionalreplication)
3、雙向復(fù)制DnaA蛋白辨認(rèn)起始點(diǎn),形成起始復(fù)合物DnaB蛋白解螺旋DnaC蛋白協(xié)助DnaB在多種蛋白質(zhì)參與下,DNA解開(kāi)成單鏈HU蛋白促進(jìn)起始SSB維持單鏈穩(wěn)定引物合成DnaADnaB、DnaCDNA拓?fù)洚悩?gòu)酶引物酶OHSSB3
5
3
5
真核生物的染色體龐大、復(fù)雜,有多個(gè)復(fù)制起始點(diǎn),同時(shí)進(jìn)行多個(gè)DNA片段的復(fù)制。兩個(gè)起始點(diǎn)之間的DNA片段,稱為一個(gè)復(fù)制子(replicon)。真核生物也是雙向復(fù)制。二、復(fù)制的延長(zhǎng)DNA聚合酶催化游離的脫氧核苷酸結(jié)合到新鏈3’末端,使其不斷延長(zhǎng)。5’3’5’DNA-polDNA-polDNA-polDNA-pol(一)復(fù)制延長(zhǎng)的過(guò)程dATPdGTPdTTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTP領(lǐng)頭鏈(leadingstrand
)
順著解鏈方向生成的子鏈,其復(fù)制是連續(xù)進(jìn)行的,所得到一條連續(xù)片段的子鏈。5’3’3
5
3
5
解鏈方向
(二)復(fù)制的半不連續(xù)性3
5
3
5
解鏈方向復(fù)制方向與解鏈方向相反,須等待解開(kāi)足夠長(zhǎng)度的模板鏈才能繼續(xù)復(fù)制,所得到一條由不連續(xù)片段組成的子鏈。隨從鏈
(
laggingstrand
)
岡崎片段(Okazakifragment)
3’5’3’3’5’三、復(fù)制的終止原核生物的復(fù)制終止1.多為環(huán)狀DNA分子,雙向復(fù)制的復(fù)制片段在復(fù)制的終止點(diǎn)(ter)處匯合。5`5`5`RNA酶OHP5`DNA聚合酶dNTP5`5`PATPADP+Pi5`5`DNA連接酶2.隨從鏈上不連續(xù)性片段的連接真核生物的復(fù)制終止1,染色體DNA呈線狀,復(fù)制在末端停止5`5`5`5`水解、聚合、連接5`5`5`5`
2,連接不連續(xù)片段端粒(
telomere)真核生物染色體線性DNA分子末端的特殊結(jié)構(gòu)1、結(jié)構(gòu)特點(diǎn):1)由末端單鏈DNA序列和蛋白質(zhì)構(gòu)成2)末端DNA序列是多次重復(fù)的富含G、T堿基的短序列。2、功能1)維持染色體的穩(wěn)定性2)維持DNA復(fù)制的完整性TTTTGGGGTTTTGGGG…端粒酶(
telomerase)1一種RNA-蛋白質(zhì)的復(fù)合物
2一種特殊的逆轉(zhuǎn)錄酶,能依賴自身的RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄合成端粒DNA
特點(diǎn):功能:
復(fù)制終止時(shí),染色體線性DNA末端確有可能縮短,但通過(guò)端粒酶的作用,可以補(bǔ)償這種由除去引物引起的末端縮短。telomerase端粒酶與藥物hTR和hTERT核酶逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑3-疊氮胸苷(AZT)四、其他復(fù)制方式滾環(huán)復(fù)制rollingcirclereplicationDNA復(fù)制
概念:半保留復(fù)制,半不連續(xù)復(fù)制(前導(dǎo)鏈,后隨鏈),岡崎片段
DNA復(fù)制的酶學(xué)
DNA聚合酶(DDDP,多功能酶)
5’-3’聚合酶活性---依賴模板的新鏈延伸3’-5’外切酶活性---校讀5’-3’外切酶活性---切除引物與突變片段DNA復(fù)制的酶學(xué)
起始階段---獲得單鏈模板解螺旋酶,拓?fù)洚悩?gòu)酶,單鏈結(jié)合蛋白等端粒(telomere)與端粒酶(telomerase)端粒功能
1)維持染色體的穩(wěn)定性
2)維持DNA復(fù)制的完整性第四節(jié)反轉(zhuǎn)錄反轉(zhuǎn)錄
(reversetranscription)
以RNA為模板,合成與其互補(bǔ)的DNA的過(guò)程,也稱逆轉(zhuǎn)錄
。RNADNA反轉(zhuǎn)錄酶①RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性(RDDP)。②核糖核酸酶H活性(RNaseH)。③DNA聚合酶活性(DDDP)。反轉(zhuǎn)錄酶的作用-合成cDNA:反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)
是依賴RNA的DNA聚合酶,它以RNA為模板,4種dNTP為底物,催化合成DNA,此過(guò)程稱為反轉(zhuǎn)錄過(guò)程。反轉(zhuǎn)錄酶是多功能酶。5
3
3
5
RNA(用表示)RNA-DNA雜化分子3
5
RNase(核酸酶H活性)
DDDP(DNA聚合酶活性)
4種dNTP
RDDP(反轉(zhuǎn)錄酶)引物、4種dNTP病毒雙鏈DNA用表示)(cDNA第二鏈(complementaryDNA,cDNA)與病毒RNA互補(bǔ)的DNA(用表示)5
3
3
5
5
3
5
3
反轉(zhuǎn)錄酶的作用轉(zhuǎn)錄(
transcription
)生物體以DNA為模板合成RNA的過(guò)程轉(zhuǎn)錄RNADNA
轉(zhuǎn)
錄
的條件:原料
:
4種NTP(ATP,
UTP,
GTP,CTP)模板
:單鏈DNA
酶
:RNA聚合酶其他蛋白質(zhì)因子復(fù)制與轉(zhuǎn)錄的異同??相同點(diǎn)模板:DNA
原料:核苷三磷酸
合成方向:5′→3′方向依賴DNA的聚合酶遵守堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)律產(chǎn)物為多聚核苷酸鏈不同點(diǎn)
復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩股鏈均作為模板一條模板鏈原料dNTPNTP
聚合酶DNA聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代DNA雙鏈mRNA;tRNA;rRNA…
配對(duì)A-T;G-CA-U;T-A;G-C★
引物需RNA引物--------★方式半保留復(fù)制不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄
DNA模板
5
3
3
5
模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈(templatestrand)
codingstrand不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄
(asymmetrictranscription)*
在DNA分子雙鏈上某一區(qū)段,一股鏈可轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;*
模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一單鏈上。
轉(zhuǎn)錄的忠實(shí)性/進(jìn)行性
固定的起點(diǎn)和終點(diǎn)
嚴(yán)格遵守堿基互補(bǔ)
保真性低于復(fù)制104-106轉(zhuǎn)錄起始RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域;DNA雙鏈解開(kāi),使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板需解決兩個(gè)問(wèn)題:
模板和RNA聚合酶的辨認(rèn)、結(jié)合5
3
3
5
結(jié)構(gòu)基因調(diào)控序列RNA-pol——啟動(dòng)子(promoter)RNA聚合酶識(shí)別,結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的一段高度保守性DNA序列,稱為
36512決定哪些基因被轉(zhuǎn)錄
150618催化功能
155613結(jié)合DNA模板
70263辨認(rèn)起始點(diǎn)亞基分子量功能
原核生物的RNA聚合酶
核心酶
coreenzyme全酶
holoenzyme
保守序列(一致性序列)開(kāi)始轉(zhuǎn)錄TTGACAAACTGT-35
區(qū)(Pribnowbox)結(jié)合部位,影響啟動(dòng)子復(fù)合物形成;TATAATPuATATTAPy-10
區(qū)1-30-5010-10-40-205
3
3
5
識(shí)別部位,還決定啟動(dòng)子強(qiáng)度;原核生物啟動(dòng)子(Sextama框)間隔區(qū)
原核生物的轉(zhuǎn)錄起始2DNA雙鏈解開(kāi),形成轉(zhuǎn)錄空泡1RNA聚合酶全酶(2)與模板結(jié)合
3
在RNA聚合酶作用下發(fā)生第一次聚合反應(yīng)–
5’-pppGpN
–OH+ppiRNApol-DNA-pppGpN-OH
pppGNTPpppGpN-OHppi起始復(fù)合物:5’-pppG-OH+
NTP5
3
DNA原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的現(xiàn)象核糖體RNARNA聚合酶
轉(zhuǎn)錄終止------RNA聚合酶在DNA模板上停止前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來(lái)
原核生物的轉(zhuǎn)錄終止子(terminator)1、依賴ρ因子(Rho)
的轉(zhuǎn)錄終止2、不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止
DNA模板上靠近終止處,有些特殊的堿基序列,轉(zhuǎn)錄出RNA后,RNA產(chǎn)物形成特殊的結(jié)構(gòu)來(lái)終止轉(zhuǎn)錄。TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT
DNA或UUUU˙
˙
˙
˙
˙
˙CAAUCAA莖環(huán)結(jié)構(gòu)RNA5’pppG53
35莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止:1,使RNA聚合酶變構(gòu)2,使轉(zhuǎn)錄復(fù)合物趨于解離,RNA產(chǎn)物釋放RNA-pol
真核生物的RNA聚合酶
種類
Ⅰ
Ⅱ
Ⅲ
對(duì)鵝膏蕈堿的反應(yīng)45S-rRNA
前體hnRNA,snRNA
5S-rRNAtRNA、snRNA耐受
極敏感中度敏感轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物啟動(dòng)子一種多種下游啟動(dòng)子
真核生物的轉(zhuǎn)錄起始
也需要RNA聚合酶辨認(rèn)、結(jié)合轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的順式作用元件,生成起始復(fù)合物。順式作用元件
------
真核生物結(jié)構(gòu)基因上游的調(diào)控區(qū)存在的相似或一致性的DNA序列。
-GCGC---CAAT---TATA轉(zhuǎn)錄起始
TATA盒(-30~-25)
CAAT盒(-75)
GC盒(-90)基因
增強(qiáng)子(enhancer)增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率順式作用元件RNA聚合酶II啟動(dòng)子DTATAABDNATATAFE反式作用因子
------
直接或間接辨認(rèn)、結(jié)合順式作用元件并影響其功能的蛋白質(zhì)。
RNA聚合酶與模板DNA的結(jié)合需一系列轉(zhuǎn)錄因子(TF)的參與。RNA聚合酶真核生物的轉(zhuǎn)錄終止——和轉(zhuǎn)錄后加工密切相關(guān)5’------AAUAAA-5’------AAUAAA--Poly(A)mRNA核酸酶-GUGUGUGAATAAAGTGTGTG轉(zhuǎn)錄終止的修飾點(diǎn)5’5’3’3’RNA-pol
蛋白質(zhì)的生物合成
——翻譯(p182)
翻譯(translation)是指以新生的mRNA為模板,把核苷酸的三聯(lián)體遺傳密碼翻譯成氨基酸序列,合成多肽鏈的過(guò)程,是基因表達(dá)的最終目的。
模板:mRNA
原料:20種編碼氨基酸氨基酸運(yùn)載體:tRNA
場(chǎng)所:核蛋白體酶:氨基酰-tRNA合成酶、轉(zhuǎn)肽酶蛋白質(zhì)因子:起始因子(initiationfactors,IF;eIF)延長(zhǎng)因子(elongationfactors,EF)釋放因子(releasefactors,RF)核蛋白體釋放因子(ribosomalreleasefactors,RRF)蛋白質(zhì)生物合成體系mRNA是翻譯的直接模板
開(kāi)放閱讀框架(openreadingframe,ORF)
mRNA從5’→3’方向,由起始密碼子到終止密碼子的序列,稱為一個(gè)開(kāi)放閱讀框架。
遺傳密碼(geneticcodon)
開(kāi)放閱讀框架內(nèi)每3個(gè)堿基組成的三聯(lián)體,決定一個(gè)氨基酸,稱為遺傳密碼。
遺傳密碼的特點(diǎn)(一)連續(xù)性(commaless)(二)方向性(sideness)(三)簡(jiǎn)并性(degeneracy)(三)擺動(dòng)性(wobble)(四)通用性(universal)(五)偏愛(ài)性(biasorpreference)AUGUGAUAAUAG密碼子反密碼子密碼的擺動(dòng)性
mRNA上的密碼子與tRNA上的反密碼子相互辨認(rèn),大多數(shù)情況下是遵從堿基配對(duì)規(guī)律的。但也可出現(xiàn)不嚴(yán)格的配對(duì),這種現(xiàn)象就是遺傳密碼的擺動(dòng)性。開(kāi)放閱讀框架OpenReadingFrame-GACUACAAGGUAUGCCCUUGCUUCACAUGUAAACGC-mRNA翻譯起始點(diǎn)5’非翻譯區(qū)3’非翻譯區(qū)起始密碼AUG終止密碼UAA、UAG、UGAmRNA上從翻譯起始點(diǎn)開(kāi)始,三個(gè)堿基編碼一個(gè)氨基酸。從起始AUG密碼到終止密碼(UAA)前的序列,代表整個(gè)一條多肽鏈的氨基酸信息,稱為“開(kāi)放閱讀框架”(ORF)。這些堿基的替換、插入、缺失,都可能造成密碼的混亂和氨基酸序列的改變,稱為“frameshift,或者框移”。核蛋白體是肽鏈合成的場(chǎng)所
核蛋白體由大、小亞基組成,每個(gè)亞基含有不同的蛋白質(zhì)和rRNA,原核生物和真核生物又各有不同。30S60S40S50S70S80S肽鏈合成的“裝配機(jī)”-核蛋白體大亞基
轉(zhuǎn)肽酶與GTP酶活性小亞基
mRNA與tRNA結(jié)合的識(shí)別SD序列(Shine-Dalgarno)
原核生物特有的、位于mRNA上起始密碼子上游的一段富含嘌呤(AGGA)堿基的短序列,是mRNA與核糖體小亞基結(jié)合位點(diǎn),直接影響翻譯效率,又稱為核蛋白體結(jié)合位點(diǎn)(ribosomalbindingsite,RBS)。密碼子反密碼子氨基酰-tRNA合成酶--氨基酰-tRNAThrTyr蛋白質(zhì)因子:起始因子(initiationfactors,IF;eIF)延長(zhǎng)因子(elongationfactors,EF)釋放因子(releasefactors,RF)小亞基大亞基mRNA5’3’氯霉素:作用于大亞基,阻斷延伸鏈霉素和卡那霉素:作用于小亞基,使構(gòu)象改變,引起讀碼錯(cuò)誤S四環(huán)素:抑制氨基酰tRNA與核蛋白體的結(jié)合IF2干擾素:誘導(dǎo)eIF2磷酸化。蛋白質(zhì)生物合成的阻斷劑
翻譯后加工翻譯后加工(post-translationalprocessing):肽鏈從核蛋白體釋放后,經(jīng)過(guò)細(xì)胞內(nèi)各種修飾處理,成為有活性的成熟蛋白質(zhì)的過(guò)程。
一級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾高級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾靶向輸送一級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾(一)去除N-甲?;騈-甲硫氨酸(二)個(gè)別氨基酸的修飾:糖基化,磷酸化等
(三)水解修飾高級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾(一)亞基聚合(二)輔基連接胰島素
圖14-14胰島素的基因、轉(zhuǎn)錄和翻譯產(chǎn)物斜線示內(nèi)含子;S:信號(hào)肽;A,B:胰島素的A鏈和B鏈;C:C肽;Pre:前導(dǎo)序列蛋白質(zhì)組(proteome)指在一個(gè)細(xì)胞、或某一特定的組織類型所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)的總和。蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)是系統(tǒng)研究蛋白質(zhì)組的組成、結(jié)構(gòu)與功能的學(xué)科。蛋白質(zhì)組研究的必要性
蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者,蛋白質(zhì)與基因之間在很大程度上是一種非線性的關(guān)系,蛋白質(zhì)在發(fā)揮功能的時(shí)候有其自身的特征和規(guī)律,這是在基因水平上難以預(yù)測(cè)的。①蛋白質(zhì)的數(shù)量比基因的數(shù)量多。
②基因組是靜態(tài)的,而蛋白質(zhì)組是動(dòng)態(tài)的。
③廣泛的修飾加工過(guò)程,這是蛋白質(zhì)功能發(fā)揮的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),也是蛋白質(zhì)高度多樣性的重要原因。藥物蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)對(duì)比健康狀態(tài)和疾病狀態(tài)細(xì)胞或組織的蛋白質(zhì)組表達(dá)差異,用于藥物研究、藥物受體研究或藥物治療前后蛋白質(zhì)表達(dá)狀態(tài)的總體分析,以評(píng)價(jià)藥物類似物的活性關(guān)系,尋找高活性藥物的一門學(xué)科。
第一節(jié)
概述
第二節(jié)
原核生物的基因表達(dá)調(diào)控
第三節(jié)真核生物的基因表達(dá)調(diào)控
第七章基因表達(dá)調(diào)控
(ControlofGeneExpression)
基因表達(dá)調(diào)控(controlofgeneexpression)基因表達(dá)的開(kāi)啟或關(guān)閉以及基因活性的增加或減弱等,受著調(diào)節(jié)和控制。
基因表達(dá)(geneexpression)--通過(guò)轉(zhuǎn)錄及翻譯產(chǎn)生蛋白質(zhì)產(chǎn)物,或轉(zhuǎn)錄后直接產(chǎn)生RNA產(chǎn)物的過(guò)程。第一節(jié)概述基因表達(dá)的時(shí)間性及空間性
時(shí)間特異性(temporalspecificity)
某一基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生。血紅蛋白(Hb)ζ2ε2→α2γ2→α2β2
空間特異性(spatialspecificity)在個(gè)體發(fā)育、生長(zhǎng)的全過(guò)程,一種基因產(chǎn)物在個(gè)體的不同組織或器官表達(dá),即在個(gè)體的不同空間出現(xiàn)。獨(dú)特的表型--生物不同種屬,同一種屬的不同個(gè)體,同一個(gè)體的不同類型細(xì)胞,同一細(xì)胞在不同發(fā)育階段或環(huán)境?;虮磉_(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義適應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和增殖維持個(gè)體發(fā)育與分化
人類基因組計(jì)劃研究結(jié)果,人類基因組據(jù)估計(jì)約有2-3萬(wàn)個(gè)基因,但表達(dá)產(chǎn)物有10多萬(wàn)種;某個(gè)時(shí)空階段,僅部分基因表達(dá)。順式作用元件(cis-actingelement)
-特異DNA序列
可調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的DNA片段。--非編碼序列;包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、終止子、沉默子等。反式作用因子(trans-actingfactor)-蛋白質(zhì)與順式作用元件直接或間接相互作用,能調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì)因子。
包括轉(zhuǎn)錄因子,RNA聚合酶等。反式作用因子(trans-actingfactor)
激活蛋白(activatorprotein)促進(jìn)轉(zhuǎn)錄;
阻遏蛋白(repressorprotein)
抑制轉(zhuǎn)錄;
RNA聚合酶
直接識(shí)別并結(jié)合啟動(dòng)子,解開(kāi)DNA雙螺旋,催化合成轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物;
第二節(jié)原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(diǎn)
σ因子決定RNA聚合酶識(shí)別特異性
操縱子模型的普遍性操縱子—一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位
阻遏蛋白與阻遏機(jī)制的普遍性誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)誘導(dǎo)(induction)--可誘導(dǎo)基因在特定環(huán)境信號(hào)刺激下表達(dá)增強(qiáng)的過(guò)程。DNA損傷→修復(fù)酶基因激活調(diào)節(jié)分解代謝,如乳糖操縱子阻遏(repression)--可阻遏基因表達(dá)產(chǎn)物水平降低的過(guò)程調(diào)節(jié)合成代謝,如色氨酸操縱子誘導(dǎo)和阻遏在生物界普遍存在,也是生物體適應(yīng)環(huán)境的基本途徑。
負(fù)調(diào)控和正調(diào)控負(fù)調(diào)控(negativecontrol)阻遏蛋白(阻遏物)封閉結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄,去除后開(kāi)啟轉(zhuǎn)錄。正調(diào)控(positivecontrol)激活蛋白(激活物)活化時(shí),結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。乳糖操縱子-細(xì)菌以葡萄糖為能量來(lái)源葡萄糖充分時(shí)(優(yōu)先利用):
與葡萄糖代謝有關(guān)的酶基因---表達(dá)
與其他糖代謝有關(guān)的酶基因---關(guān)閉葡萄糖耗盡時(shí),乳糖存在:
與乳糖代謝有關(guān)的酶基因
---表達(dá)
與葡萄糖代謝有關(guān)的酶基因---關(guān)閉操縱子(operon):
原核生物的一段DNA序列,由幾個(gè)串聯(lián)排列的功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因,加上調(diào)控序列組成的一個(gè)完整的連續(xù)的功能單位。乳糖操縱子
P:?jiǎn)?dòng)子O:操縱基因Z
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