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實(shí)驗(yàn)室規(guī)則
歡迎同學(xué)們到醫(yī)學(xué)分析與檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室來(lái)!同學(xué)們?cè)卺t(yī)學(xué)
分析與檢測(cè)實(shí)驗(yàn)方面要取得好成績(jī),在很大程度上,取決于
對(duì)這些專(zhuān)業(yè)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的熟練掌握和對(duì)實(shí)驗(yàn)原理的深入了解。
應(yīng)該做到:
1.遵守實(shí)驗(yàn)紀(jì)律,按時(shí)到達(dá)實(shí)驗(yàn)室,不得遲到或早退。
實(shí)驗(yàn)中途因故需外出時(shí)應(yīng)向任課教師請(qǐng)假。
2.進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室之前要換好白大衣及拖鞋。
3.保持實(shí)驗(yàn)室安靜,不許在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)大聲喧嘩及隨意走
動(dòng)。
4.必須嚴(yán)肅認(rèn)真地進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)期間不得進(jìn)行任何與
實(shí)驗(yàn)無(wú)關(guān)的活動(dòng)。
5.實(shí)驗(yàn)室內(nèi)各組儀器及器材由各組自已使用,不得互相
調(diào)換。要愛(ài)護(hù)儀器、標(biāo)本和設(shè)備。如遇儀器損壞或不靈,應(yīng)
及時(shí)報(bào)告任課教師,以便修理或更換,不要自行亂修。損壞
器材或設(shè)備者應(yīng)按有關(guān)規(guī)定進(jìn)行賠償。
6.注意節(jié)約實(shí)驗(yàn)材料、藥品和水、電等。
7.實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中凡遇產(chǎn)生煙霧或有毒性腐蝕性氣體
時(shí),應(yīng)放在通風(fēng)柜內(nèi)進(jìn)行。如果實(shí)驗(yàn)室內(nèi)無(wú)此種設(shè)施,則必
須注意及時(shí)打開(kāi)窗戶(hù)通風(fēng)。
8.以移液管取用試劑應(yīng)使用橡皮吸球。對(duì)于劇毒或有腐
蝕性試劑的取用更要注意安全,應(yīng)使移液管的尖湍固定在液
面下適當(dāng)?shù)奈恢?,以防試劑進(jìn)入吸球。如果不慎已吸入球內(nèi),
則應(yīng)隨時(shí)洗凈晾干。
9.乙醛、乙醇、丙酮、氯仿等易燃試劑應(yīng)放在遠(yuǎn)離火源
處,并不可直接放在火源上蒸煮,以防引起火災(zāi)。
10.在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,接觸苯酚、氯仿、溟乙錠等
有毒試劑時(shí)應(yīng)戴手套,以防止腐蝕,傷害皮膚。
11.保持實(shí)驗(yàn)室內(nèi)清潔整齊。實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,各組必須認(rèn)
真清理各自的實(shí)驗(yàn)臺(tái)面,將器材清洗后點(diǎn)清數(shù)目,然后擺放
整齊。班級(jí)值日生負(fù)責(zé)清掃室內(nèi)衛(wèi)生,關(guān)好水、電開(kāi)關(guān)和門(mén)、
窗等,經(jīng)教師允許后方可離開(kāi)實(shí)驗(yàn)室。
12.動(dòng)物尸體、紙片及實(shí)驗(yàn)廢物應(yīng)放到指定地點(diǎn),不得
隨意亂丟。
13.有不遵守上述要求者,任課老師將終止其實(shí)驗(yàn),并
取消其當(dāng)堂實(shí)驗(yàn)成績(jī)。
實(shí)驗(yàn)應(yīng)急處理(實(shí)驗(yàn)室意外事故的急救)
1.皮膚灼傷處理皮膚不慎被強(qiáng)酸、溟、氯等物質(zhì)灼傷
時(shí),應(yīng)即時(shí)用大量自來(lái)水沖洗,然后用5%碳酸氫鈉液洗滌。
2.強(qiáng)酸液進(jìn)入口內(nèi)的處理應(yīng)立即用清水或0.lmol/L
氫氧化鈉液漱口,再服用氧化鎂、鎂乳等和牛奶混合劑,但
不宜服重碳酸鈉液,以免因和酸作用而產(chǎn)生過(guò)量氣體加劇對(duì)
胃的刺激。
3.強(qiáng)堿溶液進(jìn)入口內(nèi)的處理,立即用大量清水或5%硼酸
液漱口,再服用適量5%醋酸。
4.酸、堿等化學(xué)試劑濺入眼內(nèi)的處理先用自來(lái)水或蒸
儲(chǔ)水沖洗眼部,如濺入酸類(lèi)物質(zhì)則可再用5%碳酸鈉仔細(xì)洗;
如系堿類(lèi)物質(zhì),可用2%硼酸沖洗。然后滴1—2滴油性物質(zhì),
使起滋潤(rùn)保護(hù)作用。
5.被電擊的處理實(shí)驗(yàn)室內(nèi)電器設(shè)備多,如某項(xiàng)設(shè)備漏電,
使用時(shí)則有觸電危險(xiǎn)。如有人不慎觸電,首先應(yīng)立即切斷電
源。在沒(méi)有斷開(kāi)電源時(shí)絕不可赤手去拉觸電者,宜迅速用干
木棒、塑料棒等絕緣物把導(dǎo)電物和觸電者分開(kāi)。然后對(duì)觸電
者進(jìn)行搶救。嚴(yán)重者應(yīng)立即送醫(yī)院。
6.酸、堿等化學(xué)試劑濺灑在衣物鞋襪上的處理強(qiáng)酸或強(qiáng)
堿類(lèi)物質(zhì)灑在衣服鞋襪上,應(yīng)立即脫下用自來(lái)水浸泡沖洗;
濺灑物如系苯酚類(lèi)物質(zhì),而衣服又是化纖織物,則可先用60
—70%酒精擦洗被濺處,然后再將衣物放清水中浸泡沖洗。
第一章:
第一章蛋白質(zhì)測(cè)定、分離、鑒定技術(shù)
實(shí)驗(yàn)一雙縮胭(Biuret)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量
【目的要求】
掌握雙縮胭法測(cè)定蛋白質(zhì)含量的原理和方法。
【實(shí)驗(yàn)原理】
蛋白質(zhì)分子中的肽鍵(-CO-NH-)在堿性溶液中與C/+形
成紫紅色絡(luò)合物,在540nm波長(zhǎng)有特定吸收峰,所產(chǎn)生的顏
色深淺與蛋白質(zhì)濃度成正比,依此原理可測(cè)蛋白質(zhì)含量。由
于此反應(yīng)和兩個(gè)尿素分子縮合后生成的雙縮胭
(H2N-OC-NH-CO-NH2)在堿性溶液中與銅離子作用生成紫紅色
的反應(yīng)相似,故稱(chēng)雙縮服(Biuret)反應(yīng)。
【試劑】
1.雙縮版試劑:取CuS04-5乩0(C.P.)1.5g和酒石酸鉀
鈉(NaKC^Oe?4H20)(C.P.)6.Og以少量蒸儲(chǔ)水溶解,再加
2.5mol/LNaOH溶液300mLKI1.0g,然后力口水至1000ml。
棕色瓶中避光保存。長(zhǎng)期放置后若有暗紅色沉淀出現(xiàn),即不
能使用。
2.蛋白標(biāo)準(zhǔn)液:取牛血清白蛋白,用生理鹽水稀釋至濃
度10g/L。
【器材】
1.試管:15X150mm試管7只
2.lml,5ml移液管
3.坐標(biāo)紙
4.722(721)分光光度計(jì)
【操作步驟】
一、標(biāo)準(zhǔn)曲線法
空白管12345溜定管
盤(pán)白標(biāo)準(zhǔn)液lOg/Uml)一0.10.20.30.40.5—
生理鹽水(ml)0.50.40.30.20.1一0.4
待測(cè)樣品(ml)——0.1
雙縮麻試劑(ml)3.03.03.03.03.03.03.0
相當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)(g/L)01020304050
混勻,37℃水浴20分鐘,冷卻至室溫,在分光光度計(jì)波長(zhǎng)
540nm處,用一空白管校正吸光度為零,讀取各管吸光度值。
1?5為標(biāo)準(zhǔn)曲線管,測(cè)得吸光度后,以吸光度為縱坐標(biāo),蛋
白質(zhì)濃度為橫坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。測(cè)得測(cè)定管的吸光度,對(duì)
照標(biāo)準(zhǔn)曲線求得蛋白質(zhì)濃度。
二、標(biāo)準(zhǔn)管法
取3支試管,按下表操作:
加入物(ml)空白管(B)標(biāo)準(zhǔn)管(S)測(cè)定管(U)
血清樣品——0.05
標(biāo)準(zhǔn)液—0.05—
蒸儲(chǔ)水0.05——
雙縮胭試劑(應(yīng)用3.03.03.0
試劑)
混勻,37℃恒溫水浴lOmin,540nm波長(zhǎng),以空白管調(diào)零,
測(cè)定各管吸光度。
計(jì)算:樣品中總蛋白含量(g/L)=&XCs
As
【參考值】60?80g/L
【注意事項(xiàng)】
1.雙縮胭試劑中,加入酒石酸鉀鈉,Ci?+形成穩(wěn)定的絡(luò)
合銅離子,以防止CUSOL5H2O不穩(wěn)定形成Cu(OH)2沉淀。酒
石酸鉀鈉與CuS04?5乩0之比不低于3:1,加入KI作為抗氧
化試劑。
2.雙縮服試劑要封閉貯存.防止吸收空氣中的二氧化碳。
3.本法各種蛋白質(zhì)的顯色程度基本相同,重復(fù)性好,幾
乎不受溫度影響,唯一缺點(diǎn)是靈敏度較低。
4.黃疸血清.嚴(yán)重溶血對(duì)本法有明顯干擾。
【問(wèn)答題】
1.雙縮胭法測(cè)定蛋白質(zhì)的原理是什么?其他還有什么方
法測(cè)定蛋白質(zhì)的含量?
2.請(qǐng)用雙縮胭法,設(shè)計(jì)一個(gè)測(cè)定蛋白質(zhì)含量的定量方法
(除標(biāo)準(zhǔn)曲線法外)。
實(shí)驗(yàn)二蛋白質(zhì)紫外分光測(cè)定法
【原理】
由于蛋白分子中酪氨酸和色氨酸殘基的苯環(huán)含有共趣雙
鍵,因此蛋白質(zhì)具有吸收紫外線的性質(zhì),吸收高峰在280nm
波長(zhǎng)處。在此波長(zhǎng)范圍內(nèi),蛋白質(zhì)溶液的光吸收值(A280)
與其含量呈正比關(guān)系,可用作定量測(cè)定。
由于核酸在280波長(zhǎng)處也有光吸收,對(duì)蛋白質(zhì)的測(cè)定有
干擾作用,但核酸的最大吸收峰在260nm處,如同時(shí)測(cè)定260nm
的光吸收,通過(guò)計(jì)算可能消除其對(duì)蛋白質(zhì)測(cè)定的影響,因此
溶液中存在核酸時(shí)必須同時(shí)測(cè)定280nm及260nm之光密度,
方可通過(guò)計(jì)算測(cè)得溶液中的蛋白質(zhì)濃度。
利用紫外線吸收法測(cè)定蛋白質(zhì)含量的優(yōu)點(diǎn)是迅速、簡(jiǎn)便、
不消耗樣品,低濃度鹽類(lèi)不干擾測(cè)定。因此,在蛋白質(zhì)和酶
的生化制備中(特別是在柱色譜分離中)廣泛應(yīng)用。此法的
缺點(diǎn)是(D對(duì)于測(cè)定那些與標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸含
量差異較大的蛋白質(zhì),有一定的誤差;(2)若樣品中含有喋
吟、喀咤等吸收紫外線的物質(zhì),會(huì)出現(xiàn)較大的干擾。
不同蛋白質(zhì)和核酸的紫外吸收是不同的,即使經(jīng)過(guò)校正,
測(cè)定結(jié)果也還存在一定的誤差。但可作為初步定量的依據(jù)。
【操作】
一、標(biāo)準(zhǔn)曲線法
1.標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
2.樣品測(cè)定
取待測(cè)蛋白質(zhì)溶液1血,加入蒸餌水31nL搖勻,按上述方
法在280nm波長(zhǎng)處測(cè)定光吸收值,并從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出經(jīng)稀
釋的待測(cè)蛋白質(zhì)的濃度。
二、其他方法
(1)將待測(cè)蛋白質(zhì)溶液適當(dāng)稀釋?zhuān)诓ㄩL(zhǎng)260nm和280nm
處分別測(cè)出A值,然后利用280nm及260nm下的吸收差求出
蛋白質(zhì)濃度。
計(jì)算
蛋白質(zhì)濃度(mg/ml)=1.45A280-0.74A26O
式中Azso和A260分別是該溶液在280nm和260nm波長(zhǎng)下測(cè)得
的光吸收值。
實(shí)驗(yàn)三考馬斯亮藍(lán)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量
【基本原理】
考馬斯亮藍(lán)G-250在酸性溶液中的游離狀態(tài)呈紅褐色,與蛋
白質(zhì)結(jié)合呈藍(lán)色,且最大吸收波長(zhǎng)從465nm轉(zhuǎn)變?yōu)?95nll1。蛋
白質(zhì)溶液在一定濃度范圍內(nèi),與595nm的光密度值成正比,可
用于蛋白質(zhì)的比色定量。
【器材】
721分光光度計(jì)、試管、吸管。
【試劑】
1.蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)液(250ug/ml):小牛血清白蛋白251ng
加生理鹽水至100ml。
2.考馬斯亮藍(lán)G-250:考馬斯亮藍(lán)G-250100mg,加195%
乙醇501nL加185%(W/V)H3PoJOOml,加蒸儲(chǔ)水稀釋至1000ml,
置棕色瓶過(guò)夜,用二層濾紙過(guò)濾。
【操作步驟】
取三支試管,編號(hào),垓讀蝶作:
B(空白管)S(標(biāo)
準(zhǔn)管)U(樣品管)___________________________
生理鹽水(ml)0.10
蛋白標(biāo)準(zhǔn)液(250ug/ml)(ml)—
0.10—
待測(cè)樣品(ml)—
0.10—
考馬斯亮藍(lán)試劑(ml)5.00
5.005.00
充分混勻各管溶液。5分鐘后用595nin波長(zhǎng)比色,以空白
管調(diào)零,讀取標(biāo)準(zhǔn)管及樣品管的吸光度值(As、Au)o
【計(jì)算】
待測(cè)液蛋白濃度=—X蛋白標(biāo)準(zhǔn)液濃度X稀釋倍數(shù)
As
如用標(biāo)準(zhǔn)曲線法可用牛血清清蛋白配成0.1m中含蛋白質(zhì)
10Pg、20pg、40pg、60Rg、80iig的一系列標(biāo)準(zhǔn)液,上
述各管各加考馬斯亮藍(lán)試劑5.0mL5分鐘后,在595nm波長(zhǎng)比
色,讀取各管光密度值。以光密度值為縱坐標(biāo),以蛋白質(zhì)含
量為橫坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。根據(jù)同樣條件測(cè)得的待測(cè)液的
光密度值,可從標(biāo)準(zhǔn)曲線中查得蛋白質(zhì)含量,另外也可用蛋
白質(zhì)濃度已知的人血清用生理鹽水適當(dāng)稀釋成一系列標(biāo)準(zhǔn)液,
制備標(biāo)準(zhǔn)曲線。
【注】本法待測(cè)液0.1ml中含蛋白質(zhì)10~8011g為宜,如
果樣品蛋白質(zhì)濃度過(guò)高,可用生理鹽水適當(dāng)稀釋后再測(cè)。
【思考題】用標(biāo)準(zhǔn)曲線法及標(biāo)準(zhǔn)管法測(cè)定蛋白質(zhì)有何區(qū)
別與意義。
實(shí)驗(yàn)四血清Y-球蛋白的層析分離
【基本原理】
利用硫酸鍍分段鹽析將血清中的丫-球蛋白與清蛋白、a-
球蛋白、球蛋白等加以分離,再用凝膠過(guò)濾法除鹽即可
得到比較純的丫-球蛋白。
【器材】
玻璃層析柱(1.OX12cm)、圓形尼龍布(直徑1.5cm)、凹
孔白瓷板、試管、離心管、燒杯、滴管、螺旋夾等。
【試劑】
1.血清
2.磷酸鹽緩沖液-生理鹽水(PBS):用O.Olmol/L磷酸鹽
緩沖液配制的0.9%NaCl溶液。配制方法如下:
0.2mol/L}混勻后稀釋20倍
Na2HP0472ml
0.2mol/LNaH2P。428ml
3.pH7.2飽和硫酸鐵溶液:用氨水將飽和硫酸鍍?nèi)?/p>
液調(diào)到pH7.2
4.葡聚糖凝膠G-50(SephadexG-50)
5.納氏試劑(Nessler)sreagent):
⑴儲(chǔ)存液:于500ml錐形瓶?jī)?nèi)加碘化鉀(KI)150g,蒸
鐳水100ml,溶解劭口碘(&)110g,振搖至溶解后再加汞(Hg)
150g,連續(xù)振搖7~15分鐘。在此過(guò)程中,碘的顏色漸淺并發(fā)
熱,可在冷水浴中連續(xù)振搖到溶液由棕紅色(碘色)轉(zhuǎn)變成淺
黃綠色(碘化鉀汞色)為止。將上清液倒入2升量筒內(nèi),并用
蒸儲(chǔ)水洗錐形瓶?jī)?nèi)沉淀物數(shù)次,洗液全部倒入量筒內(nèi),再加水
至2升后混勻。
⑵應(yīng)用液:取儲(chǔ)存液150ml加10%Na0H溶液700ml.蒸
儲(chǔ)水150nli混勻,放棕色瓶?jī)?nèi)靜置數(shù)日后取上清液使用。此
液要求酸堿度適宜。即與1.ONHC1滴定時(shí)需此試劑H.0?
11.5ml使酚醐指示劑變色為宜,否則需加以糾正。
6、雙縮胭試劑:
CuS04-5H200.39g,酒石酸鉀鈉1.2g分別溶于50ml蒸
儲(chǔ)水中,力口2.5NNaOH60mLKI0.2g,混勻后力口水至200ml。
【操作步驟】
1.鹽析
⑴血清1ml放入離心管中,加入磷酸鹽緩沖液-生理鹽
水(PBS)1ml混勻逐滴加入pH7.2飽和硫酸鐵溶液1ml,邊加
邊搖勻。靜置30分鐘后,離心3000rpm10分鐘,傾上清液
(上清中主要含清蛋白)。
⑵將離心管中的沉淀用1mlPBS攪拌溶解,再逐滴加
入pH7.2飽和硫酸鍍?nèi)芤?.5mL邊加邊搖勻。靜置30分鐘
后,離心3000rpm10分鐘。傾上清液(上清中主要含a、p
球蛋白)。
2.脫鹽
⑴裝柱:稱(chēng)取葡聚糖凝膠G-501g,放入100ml燒杯中,
加蒸儲(chǔ)水50ml,微火煮沸1小時(shí)(注意需隨時(shí)補(bǔ)充蒸儲(chǔ)水以
免蒸干)。冷卻后傾棄上清液。再加入PBS10ml,用玻璃棒
輕輕攪拌,傾入有尼龍布堵住下口的玻璃層析柱內(nèi)。于柱下口
接一小段膠管,待全部凝膠傾入柱內(nèi)且液面接近凝膠上表面時(shí)
將出口膠管夾緊。為使凝膠表面平坦,可用手指輕輕彈動(dòng)層析
柱,然后小心放松調(diào)節(jié)夾,使液體緩緩流出8?10滴/分。同
時(shí)檢查流出液中是否有NH;存在,若有則需用PBS洗至流出液
中無(wú)NIV為止。當(dāng)液面恰好與凝膠表面重合時(shí),立即將出口膠
管夾緊,裝柱即結(jié)束(注意:液面不得低于凝膠表面,且柱內(nèi)
不得有氣泡)。
(2)脫鹽:向裝有丫-球蛋白的離心管內(nèi)加入PBS10滴,
用玻璃棒攪拌使之溶解。再用乳頭吸管吸出Y-球蛋白液,加
到層析柱內(nèi)凝膠表面。然后稍打開(kāi)流出口,使流速為8?10
滴/分。待丫-球蛋白液全部進(jìn)入凝膠柱內(nèi)時(shí),再用乳頭吸管小
心加入PBS約1cm高,待大部分液體進(jìn)入凝膠柱后,再繼續(xù)加
PBS直至洗脫完畢(加液時(shí)注意不要沖擊凝膠表面)。在整個(gè)
洗脫過(guò)程中不能讓液面降至凝膠面以下。
(3)收集:準(zhǔn)備12只小試管用于收集流出液。從加樣后開(kāi)
始,每管收集lmlo收集12管后繼續(xù)用PBS洗至無(wú)NH;時(shí),
停止洗脫。回收凝膠和尼龍布等。
(4)檢測(cè):準(zhǔn)備反應(yīng)板兩塊。將12管收集液各取1滴分別放
入反應(yīng)板的12個(gè)凹孔。一塊板的各孔內(nèi)加納氏試劑1滴,有
NH:者呈黃色至橙色??捎?、一號(hào)表示有無(wú)呈色或顏色深淺。
再向另一塊板的各孔內(nèi)加雙縮胭試劑1滴,有蛋白者呈藍(lán)紫
色。亦可用+、一號(hào)表示有無(wú)呈色或顏色深淺。將呈色最深
的一管收集液保留供實(shí)驗(yàn)3使用。利用實(shí)驗(yàn)3醋酸纖維素薄
膜電泳檢測(cè)本次實(shí)驗(yàn)所提Y-球蛋白的純度。
實(shí)驗(yàn)五醋酸纖維素薄膜電泳分離血清蛋白質(zhì)
【基本原理】
帶電粒子在電場(chǎng)中向著與其電性相反方向移動(dòng)的現(xiàn)象稱(chēng)為
電泳。蛋白質(zhì)為兩性電解質(zhì),在不同pH條件下,其帶電情況
不同。在等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)為兼性離子,其實(shí)效電荷為零,
在電場(chǎng)中不發(fā)生泳動(dòng);蛋白質(zhì)分子在pH小于其等電點(diǎn)的溶液
中,呈堿式解離,帶正電荷,在電場(chǎng)中向負(fù)極泳動(dòng);蛋白質(zhì)
分子在pH大于其等電點(diǎn)的溶液中,呈酸式解離,帶負(fù)電荷,
在電場(chǎng)中向正極泳動(dòng)。泳動(dòng)速度除與電場(chǎng)強(qiáng)度和溶液性質(zhì)有
關(guān)外,主要決定于分子顆粒的電荷量以及分子的大小與形狀。
電荷較多、分子較小的球狀蛋白質(zhì)泳動(dòng)較快。
醋酸纖維素薄膜電泳是利用醋酸纖維素薄膜做固體支持物
的電泳技術(shù)。與紙上電泳相似,是在其基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的。
該電泳技術(shù)具有比紙電泳電滲小、分離速度快、樣品用量小
(可少于10微升)、而分辨率高和分離清晰等優(yōu)點(diǎn)。因此,
從1956年Kohn首先應(yīng)用此法以來(lái),紙上電泳已逐漸被取代。
醋酸纖維素薄膜電泳的操作方法除比瓊脂電泳、淀粉膠電泳
和聚丙烯酰鍍凝膠電泳簡(jiǎn)便外,還有一個(gè)顯著優(yōu)點(diǎn),即染色
后的薄膜可用乙醇和冰醋酸溶液浸泡透明,透明后的薄膜便
于保存和定量分析。
醋酸纖維素薄膜可用于一般血清蛋白電泳、脂蛋白電泳、
同工酶電泳、甲胎球蛋白電泳(AFP)、血紅蛋白電泳以及免
疫電泳等。
本實(shí)驗(yàn)以醋酸纖維素薄膜作為支持物,于浸有緩沖液的薄
膜一端加微量血清,膜兩端連接于緩沖液。所用緩沖液的pH
為8.6,大于血清中各種蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(見(jiàn)注)。因此,各
種蛋白質(zhì)皆帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極方向泳動(dòng),因泳動(dòng)速
度不同而被分離。依次為清蛋白A、a1、a28和丫-球蛋
白,將蛋白質(zhì)染色后,可按染色區(qū)帶位置進(jìn)行定性觀察,也
可對(duì)各條色帶進(jìn)行定量測(cè)定。
【器材】
電泳儀、醋酸纖維素薄膜(2X8cm)、點(diǎn)樣板、鉛筆、尺
【試劑】
1.巴比妥緩沖液(pH8.6,離子強(qiáng)度0.06):巴比妥鈉
12.76g,巴比妥1.66g加蒸鐳水?dāng)?shù)百毫升,加熱溶解后再補(bǔ)加
蒸儲(chǔ)水至1000ml,混勻。
2.染色液:氨基黑10B0.5g,溶于甲醇50ml中,再加
冰醋酸10mL蒸饋水40ml混勻。
3.漂洗液:甲醇(或95%乙醇)45ml,冰醋酸5ml,
蒸儲(chǔ)水50ml混勻。
4.洗脫液:0.4NNaOH溶液
5.透明液:95%乙醇20mL冰醋酸5ml混勻。
【基本操作】
1.電泳槽內(nèi)放適量的緩沖液,于兩端的液槽間放一充滿(mǎn)
緩沖液的連通管,經(jīng)過(guò)一定時(shí)間使兩側(cè)液面達(dá)到平衡后,取
下連通管。在電泳槽的兩側(cè)的支持板上分別用四層濾紙(或
紗布)搭橋,即使其一端搭到支持板上,另一端浸入緩沖液
中。在醋酸纖維薄膜(2X8cm)的無(wú)光澤面距一端2cm處,,
用鉛筆畫(huà)一橫線(與此端平行),作為準(zhǔn)備點(diǎn)樣的位置,稱(chēng)為
點(diǎn)樣線或者是起點(diǎn)線。把膜放進(jìn)PH8.6的巴比妥緩沖溶液中
浸泡數(shù)小時(shí)使膜完全浸透。
2.點(diǎn)樣
把浸透緩沖液的醋酸纖維素膜取出,夾到濾紙中,輕撫使
吸去多余的緩沖液,使膜的無(wú)光澤面向上,把微量樣品[血清、
丫-球蛋白提純液、A液、B液等(見(jiàn)實(shí)驗(yàn)二)]分別均勻地涂
另于蓋玻片的一端,把玻片豎直輕貼到膜的點(diǎn)樣線上,使樣
品吸入膜內(nèi)。注意應(yīng)使點(diǎn)樣線成為粗細(xì)一致的直線狀。
3.電泳
把膜放進(jìn)電泳槽內(nèi),注意要把膜的點(diǎn)樣面即無(wú)光澤面向下,
點(diǎn)樣端靠近陰極側(cè),把膜的兩端緊貼到內(nèi)側(cè)支持板上搭橋的
濾紙或沙布上,把膜擺平拉直,蓋好電泳槽蓋。
檢查電泳槽電極的連接正確無(wú)誤后通電,調(diào)節(jié)電流按總膜
寬計(jì)算,每cm寬給電流0.4-0.6mA,通電時(shí)間45?60分鐘。
4.染色
關(guān)閉電源后立即將膜取出,放入染色液中浸染3?5分鐘,
然后移放漂洗液中漂洗數(shù)次,至蛋白條帶清晰,本底無(wú)色為
止,取出薄膜用濾紙吸干。
5.定量
把漂洗干凈的膜夾在濾紙中吸干,剪下各蛋白區(qū)帶及一段
平均大小的空白區(qū),分別依次放入試管中,標(biāo)清管號(hào),向清
蛋白管加0.4NNaOH10ml,其余各管加0.4NNaOH5ml,輕
輕振搖,使著色完全洗脫于溶液中,用620nm波長(zhǎng)比色,記
取各管光密度值。然后計(jì)算各組分相對(duì)百分含量。計(jì)算方法
如下:
設(shè)測(cè)得各管光密度值為DA、Da】、Da2、6、DY,則光
密度值總和DT=2DA+Da1+Da2+DB+DY。
Da\
清蛋白%=奇蟲(chóng)。。,"蛋白%xlOO,其余類(lèi)推,可分
DT
別求出各蛋白所占總蛋白的百分?jǐn)?shù)。
【注】
1.血清蛋白各組分的等電點(diǎn)、分子量及其在正常血清中
的百分含量如下表:
等電點(diǎn)分子量
占總蛋白的%
清蛋白4.6469,000
57?72
a1球蛋白5.06200,000
2?5
a2球蛋白5.06300,000
4?9
B球蛋白5.1290,000—150,000
6.5?12
Y球蛋白6.85~7.3156,000—950,000
12?20
2.血清蛋白電泳有一定的臨床意義。例如肝硬化時(shí)清蛋
白明顯降底,而Y球蛋白可增高2倍;腎病綜合癥和慢性腎
小球腎炎可見(jiàn)到清蛋白降低,a和B球蛋白增高。從電泳譜
上亦可查出某些異常,例如多發(fā)性骨髓瘤病人血清,有時(shí)在
B與Y球蛋白之間出現(xiàn)巨球蛋白;原發(fā)性肝癌病人血清在清
蛋白與a?球蛋白之間可見(jiàn)到甲胎蛋白。
【思考題】
1.電泳后,泳動(dòng)在最前面的是何種蛋白質(zhì)?各譜帶為何
種成份?請(qǐng)分析原因。
2.電泳時(shí),點(diǎn)樣端置于電場(chǎng)的正極還是負(fù)極,為什么?
實(shí)驗(yàn)七聚丙烯酰胺凝膠圓盤(pán)電泳分離血清蛋白
【基本原理】
1.聚丙烯酰胺的合成和結(jié)構(gòu)
聚丙烯酰胺凝膠是由丙烯酰胺(Acrylamide簡(jiǎn)寫(xiě)為Acr)
和交聯(lián)劑甲叉雙丙烯酰胺(N,N1-methylene-bisacrylamide,
簡(jiǎn)寫(xiě)B(tài)is)在催化劑的作用下,聚合交聯(lián)成含有酰胺基側(cè)鏈的
脂肪族大分子化合物。
2.催化劑
過(guò)硫酸胺-四甲基乙二胺(N、N、N、N-Tetramethyl—
thylenediamine,簡(jiǎn)寫(xiě)TEMED)系統(tǒng),其中過(guò)硫酸錢(qián)是引發(fā)
劑。它在光照射下裂解成帶有自由基的硫酸錠,
通過(guò)自由基的傳遞,使丙烯酰胺成為自由基,發(fā)動(dòng)聚合反
應(yīng),TEMED是加速劑,加快引發(fā)劑釋放自由基的速度。
(NH4)裊&?(NH4)2SO4
聚丙烯酰胺凝膠具有三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),能起分子篩作用。用
它作電泳支持物,對(duì)樣品的分離不僅取決于各組分所帶電荷
的多少,也與分子大小有關(guān)。凝膠網(wǎng)孔的大小主要受成膠物
的總濃度及Acr和Bis的比例的影響。一般電泳采用成膠物
質(zhì)總濃度為7.5%,此濃度稱(chēng)為標(biāo)準(zhǔn)凝膠濃度。如果改變總膠
濃度,也應(yīng)相應(yīng)改變Acr和Bis的比例。
總膠濃度為5%以下時(shí),Acr:Bis在20左右。
總膠濃度為5?10%時(shí),Acr:Bis在40左右。
總膠濃度為5?20%時(shí),Acr:Bis在125?200左右。
實(shí)驗(yàn)中應(yīng)根據(jù)分子量大小,選擇合適的凝膠總濃度和Acr
和Bis的比例。
分子量與凝膠濃度的關(guān)系
分子量范圍凝膠濃度(%)
蛋白質(zhì)〈IO"20-30
1-4X10415-20
4X1O4-1X1O510-15
1?5X105
5-10
>5X9
2-5
核酸<及15-20
IO,?及5-10
l~2X1052-5
2.不連續(xù)聚丙烯酰胺凝膠圓盤(pán)電泳的三種效應(yīng)
(1)濃縮效應(yīng)。不連續(xù)園盤(pán)電泳一般是在小玻璃管內(nèi)進(jìn)
行的。把三種性質(zhì)不完全一樣的聚
丙烯酰胺凝膠重疊起來(lái)。如圖4-3樣品股
所示,上層為樣品膠,中間為濃縮《間隔般,蟲(chóng)抄UZ的、
膠,這兩層膠的凝膠濃度為3%是大
孔膠,應(yīng)用Tris-HCL緩沖液,其分離酸(電沫殷》
PH6.7o下層是分離膠,此層凝膠總
濃度為7.5%,是小孔膠,也用
Tris-HCL緩沖液,pH8.90上下電
極槽緩沖液是Tris-甘氨酸緩沖液,pH=8.3。通電后,向陽(yáng)極
泳動(dòng)的陰離子有三種,即C1,蛋白質(zhì)陰離子(Pr。和甘氨
酸陰離子(Gly-)0在樣品膠及濃縮膠pH=6.7的環(huán)境下HC1
全部電離為Cr,甘氨酸僅極少部分電離為Gly一(甘氨酸等
電點(diǎn)pI=6.0),一般酸性蛋白質(zhì)也解離為陰離子。這樣,C1-
泳動(dòng)最快(稱(chēng)快離子),Gly-泳動(dòng)最慢(稱(chēng)慢離子),蛋白質(zhì)介
于其間。通電后,快離子很快超過(guò)蛋白質(zhì)離子和Gly,泳動(dòng)
到最前面。于是,快慢離子之間形成一個(gè)離子濃度低的區(qū)域,
即低電導(dǎo)區(qū)域,低電導(dǎo)區(qū)域有較高的電壓梯度。電壓梯度驅(qū)
動(dòng)慢離子加速泳動(dòng)。這樣,當(dāng)快慢離子移動(dòng)速度相等時(shí),就
建立一個(gè)不斷向陽(yáng)極移動(dòng)的界面。Pr一的泳動(dòng)速度恰好介于
快慢離子之間。因而被擠壓在快慢離子之間形成一條窄帶。
這種濃縮作用可使蛋白質(zhì)濃縮數(shù)百倍。血清蛋白在紙上電泳
和醋酸纖維素薄膜電泳上僅可分成5?7個(gè)組分。而在聚丙烯
酰胺凝膠電泳上則可以分為20-30個(gè)成分。
(2)電荷效應(yīng):蛋白質(zhì)樣品在界面處被濃縮成一狹窄的
高濃度蛋白質(zhì)區(qū),但由于每種蛋白質(zhì)分子所帶有效電荷不同,
因而泳動(dòng)率也不同,因此各種蛋白質(zhì)就按泳動(dòng)率快慢順序排
列成一個(gè)一個(gè)圓盤(pán)區(qū)帶。在進(jìn)入分離膠時(shí),電荷效應(yīng)仍起作
用。
(3)分子篩效應(yīng):當(dāng)被濃縮的蛋白質(zhì)樣品從濃縮膠進(jìn)入
分離膠時(shí),pH值和凝膠孔徑突然改變,選擇分離膠的pH值
8.9接近甘氨酸的Pka值(9.7?9.8),這樣慢離子的解離度
增大,因而它的有效泳動(dòng)率也增加。此時(shí)慢離子的有效泳動(dòng)
率超過(guò)了所有蛋白質(zhì)的有效泳動(dòng)率。這樣,高電勢(shì)梯度不存
在了,各種蛋白質(zhì)僅會(huì)由于其分子量或構(gòu)型的不同,在一個(gè)
均一的電勢(shì)梯度和pH條件下通過(guò)一定孔徑的分離膠時(shí)所受阻
滯的程度不同,表現(xiàn)的泳動(dòng)率的不同而被分開(kāi)。
【器材】
電泳儀、垂直板電泳槽、進(jìn)樣器、乳頭吸管、50ml小燒
杯
【試劑】
1.30%丙烯酰胺溶液:丙烯酰胺29.2g,甲叉雙丙烯酰胺
0.8g,加水至100mL棕色瓶4℃保存。
2.1.5mol/LTris-HCl分離膠緩沖液pH8.8(4x):取
18.15gTris,用1MHC1調(diào)pH至&8,加水至100ml,4℃保
存。
3.0.5mol/LTris-HCl濃縮膠緩沖液,pH6.8(4x):
取5.98gTris,用INHC1調(diào)至pH6.8,加水至100ml,4℃
保存。
4.電極緩沖液(pH8.3):取14.49g甘氨酸,3.02gTris,
加100ml10%SDS,加水至1升,4c保存。
5.10%過(guò)硫酸筱溶液(AP):臨用前現(xiàn)配。
6.染色液(0.25%考馬斯亮藍(lán)R-250、50%甲醇、7%乙酸):
考馬斯亮藍(lán)R-2502.5g、甲醇(可用無(wú)水乙醇代替)500ml>
70ml冰乙酸,溶解后補(bǔ)足水至總體積1000mlo
7.脫色液(30%甲醇、7%乙酸):甲醇(可用無(wú)水乙醇代
替)300ml,冰乙酸70mL補(bǔ)足水至1000mL
【操作步驟】
1.凝膠柱的制備
(1)取兩端已有金鋼砂磨平的10X0.6cm的玻璃管。在
距一端7cm和7.5cm處,各劃一條線。插入橡皮墊,垂直安
放于試管架中。
(2)按分離膠配制比例(見(jiàn)下表)加入各種試劑,混勻
后即成為分離膠溶液。迅速用乳頭吸管將分離膠加入玻璃管
內(nèi),至7cm劃線處。
(3)用細(xì)尖的乳頭吸管沿玻璃管壁加入蒸儲(chǔ)水約0.5cm,
加水時(shí)要緩慢,盡量減少凝膠表面的震動(dòng)與混合。靜置1小
時(shí)以上。
(4)按濃縮膠配制比例(見(jiàn)下表)加入各種試劑:
分離膠和濃縮膠溶液的配制
分離膠(ml)濃縮膠(ml)
H2O6.207.65
30%丙烯酰胺2.501.00
分離膠緩沖液1.25—
(pH8.8)
濃縮膠緩沖液—1.25
(pH6.8)
TEMED0.0050.005
10%過(guò)硫酸錢(qián)0.050.05
總體積10ml10ml
(5)用乳頭吸管吸去分離膠管上面的水層,加入少許濃
縮膠迅速吸出去(目的是洗出分離膠表面的水)。
(6)用乳頭吸管沿凝膠管壁加入濃縮膠溶液至7.5cm處,
并隨即沿管壁緩慢加入約0.5cm高度,靜置20分鐘。
2.樣品配制
正常入血清0.1ml,加入濃縮膠緩沖液1.5ml,加入蔗糖
200mg/ML0.1ml,及0.05%溟酚蘭水溶液0.1ml,,輕搖混勻。
3.電泳
(1)選擇無(wú)氣泡和裂縫、聚合均勻的凝膠去水并垂直安
放在上電極糟的橡皮塞孔中。
(2)加入電極緩沖液于上、下電泳槽中,使電極緩沖液
淹沒(méi)凝膠管中,用乳頭吸管排除凝膠管上下口中的氣泡。
(3)加樣:用微量注射器取樣品液加30ul,沿管壁加
在濃縮膠面上,注入時(shí)要慢。標(biāo)記各管的編號(hào)。
(4)電冰:將上層電極糟的電極接在電泳儀的負(fù)極、下
層電極糟的電極接在電泳議的正極、接好電源。調(diào)節(jié)電流為
l-2mA/管。待示蹤劑進(jìn)入分離膠時(shí),調(diào)節(jié)電流為2-4mA/管。
當(dāng)示蹤劑移出玻璃管下口約30分鐘,切斷電源。
4.剝膠
取下凝膠管,用帶有10cm長(zhǎng)局麻針頭注射器,盛滿(mǎn)蒸饋
水做潤(rùn)滑劑。將針頭插入膠與管壁之間,邊注入水邊旋轉(zhuǎn)玻
璃管。直至膠柱與管壁分開(kāi)。然后用吸耳球輕輕在膠管的一
端加壓,使凝膠從玻璃管中緩慢滑出,進(jìn)入到已編號(hào)的試管
內(nèi)。
5.染色、脫色、固定、保存
向裝有凝膠柱的試管中加入染色液,使凝膠柱全都浸泡在
染色液于60c水浴中染色30分鐘、傾去染色液,加入固定、
保存液,更換三次,次日觀察結(jié)果。
【注】Acr和Bis都是神經(jīng)性毒劑,對(duì)皮膚有刺激作用、但
在形成凝膠后則無(wú)毒,操作時(shí)應(yīng)盡量避免接觸皮膚,并注意
洗手。
【思考題】
1.配制樣品時(shí),為什么要加入蔗糖?
2.電泳時(shí),為什么要把上層電泳槽接在負(fù)極上?
實(shí)驗(yàn)七蛋白質(zhì)印跡免疫分析(WesternBlot
Anglysis)
【基本原理】
蛋白質(zhì)印跡免疫分析的過(guò)程包括蛋白質(zhì)經(jīng)凝膠電泳分離
后,在電場(chǎng)作用下將凝膠上的蛋白質(zhì)條帶轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素
膜上,經(jīng)封閉后再用抗待檢蛋白質(zhì)的抗體作為探針與之結(jié)合,
經(jīng)洗滌后,再將濾膜與二級(jí)試劑一放射性標(biāo)記的或辣根過(guò)氧
化物酶或堿性磷酸酶偶聯(lián)抗免疫球蛋白抗體結(jié)合,進(jìn)一步洗
滌后,通過(guò)放射自顯影或原位酶反應(yīng)來(lái)確定抗原一抗體一抗
抗體復(fù)合物在濾膜上的位置和豐度。
【器材】
轉(zhuǎn)移電泳儀,硝酸纖維素膜,濾紙,剪刀,手套,小尺
【試劑】
1.IgG標(biāo)準(zhǔn)品
2.羊抗人辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的IgG抗體
3.轉(zhuǎn)移buffer:Tris3.03g,Glyl4.4g,甲醇200ml,
加三蒸水至1000ml充分溶解,4℃冰箱貯存。
4.Trisbuffer(TBS):Tris2.42g,NaCl29.2g,溶于
600ml三蒸水,再用INHC1調(diào)至pH7.5,然后補(bǔ)加三蒸水至
1000mlo
5.漂洗液(TTBS):TBSM500ml,加Tween20250ulo
6.封閉液:5%脫脂奶粉。
7.抗體buffer:1.5gBSA溶于50mlTTBSo
8.顯色液DAB(3.3-diaminobenzidine,3.3-二氨基聯(lián)苯
胺)配制:5mgDAB溶于10ml檸檬酸buffer(0.Olmol/L檸
檬酸2.6ml,0.02mol/LNa2HP0417.39ml),力口30%H20210
ul(臨用時(shí)現(xiàn)配)。
9.脫色液:甲醇2501nL冰醋酸100mL加蒸儲(chǔ)水至1000mlo
10.氨基黑染色液(0.現(xiàn)氨基黑-10B):0.2g氨基黑-10B
溶于200nli脫色液中,充分?jǐn)嚢枞芙猓瑸V紙過(guò)濾。
【操作步驟】
一、樣品的SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳
L安裝制膠模具
2.根據(jù)所測(cè)蛋白質(zhì)選擇某一合適的分離膠濃度。按下表
所列的試劑用量配。
分離膠的配制
7.5%(m15%(ml)
1)10%(ml)
4.904.102.40
H2O
30%丙烯酰胺2.503.305.00
分離膠緩沖液2.502.502.50
(pH8.8)
10%SDS0.100.100.10
TEMED0.020.020.02
10%過(guò)硫酸鐵0.020.020.02
總體積10ml10ml10ml
將分離膠混勻后立即灌注于玻板間隙中,上層小心覆蓋
一層正丁醇。將膠板垂直放于室溫下,待分離膠聚合完全后,
傾去正丁醇并用濾紙吸干。
3.濃縮膠的制備
按下表配制濃縮膠,將濃縮膠混勻后直接灌注在已聚合
的分離膠上,立即插入梳子,將凝膠垂直放于室溫下聚合。
濃縮膠的配制
3%(ml)4%(ml)6%(ml)
H2O3.052.7
3.2
30%丙烯酰胺0.651.0
0.5
濃縮膠緩沖液1.251.25
(pH6.8)1.25
10%SDS0.050.05
0.05
TEMED0.050.05
0.05
10%過(guò)硫酸鉉0.050.05
0.05
總體積5ml5ml5ml
4.樣品預(yù)處理:取樣品液與等體積樣品緩沖液混合,100℃
加熱1?2分鐘。
5.待濃縮膠聚合完全后,小心移出梳子,然后將膠板固
定于電泳裝置上,上下槽各加入電極緩沖液。
6.加樣:用微量進(jìn)樣器加樣。每個(gè)樣品孔加入20ul樣
品。
7.電泳:在100?150V的電壓下電泳,直至溟酚藍(lán)達(dá)到
膠底部,關(guān)閉電源。
加樣時(shí),注意在同一塊膠上按順序做一份重復(fù)點(diǎn)樣,以備
電泳結(jié)束時(shí),一份用于免疫鑒定,一份用于蛋白染色顯帶,
以利相互對(duì)比,分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
二、轉(zhuǎn)移印跡
1.轉(zhuǎn)移前準(zhǔn)備:將濾紙,硝酸纖維素膜(NC)剪成與膠
同樣大小,NC膜浸入蒸儲(chǔ)水中10-20min后浸入轉(zhuǎn)移buffer
中平衡30min。
2.凝膠平衡:將電泳后的SDS膠板置于轉(zhuǎn)移buffer
中平衡30-60mino
3.按圖操作:逐層鋪平,各層之間勿留有氣泡和皺折。
4.開(kāi)始轉(zhuǎn)移,連接正負(fù)極,蓋好蓋子,接上電源,恒流
0.8mA/cm,室溫下轉(zhuǎn)移lh,轉(zhuǎn)移后的凝膠再用氨基黑10B染
色液染色20min,然后脫色檢測(cè)轉(zhuǎn)移效果。
三、免疫染色
1.轉(zhuǎn)移后的NC膜于5%脫脂奶粉中封閉,4℃過(guò)夜。
2.TBS洗膜1-2次,lOmin/次。
3.加HRP標(biāo)記的抗體,室溫lho
4.TBS洗3次,lOmin/次。
5.NC膜再轉(zhuǎn)入DAB顯色液中,置暗處反應(yīng),待顯色反應(yīng)
達(dá)到最佳程度時(shí),立即用三蒸水洗滌終止反應(yīng)。
負(fù)極
濾紙
轉(zhuǎn)移單位示意圖
正極
【思考題】
此實(shí)驗(yàn)的注意事項(xiàng)是什么?
實(shí)驗(yàn)八微機(jī)模擬蛋白質(zhì)純化實(shí)驗(yàn)
將計(jì)算機(jī)輔助教學(xué)手段(即CAI)用于高等學(xué)校的教學(xué)工
作,近年來(lái)已取得了很大發(fā)展,這是高校教學(xué)改革的重要方
向。而將CAI用于實(shí)驗(yàn)教學(xué),模擬動(dòng)態(tài)的實(shí)驗(yàn)過(guò)程,則難度
較大,目前成熟的實(shí)用軟件還不多見(jiàn)。在生物化學(xué)大實(shí)驗(yàn)中
使用計(jì)算機(jī)模擬純化生物大分子的實(shí)驗(yàn)軟件,意義就更為重
大,因?yàn)樯髮?shí)驗(yàn)的試劑十分昂貴,要用到各種離心機(jī)和
分光光度計(jì),以及自動(dòng)部份收集器、電泳儀等十幾種儀器設(shè)
備,對(duì)實(shí)驗(yàn)室的儀器裝備條件要求很高。此外,由于生物材
料的組成十分復(fù)雜,生物大分子的含量通常極微量,實(shí)驗(yàn)流
程又長(zhǎng),有的實(shí)驗(yàn)要連續(xù)做一、二周,因而實(shí)驗(yàn)難度較大,
如果能在生化大實(shí)驗(yàn)中使用CAI,則可以獲得比其他實(shí)驗(yàn)課更
顯著的教學(xué)效果。
清華大學(xué)生物系生化大實(shí)驗(yàn)教學(xué)組多年前就十分重視CAI
的工作,從1989年開(kāi)始就將計(jì)算機(jī)模擬蛋白質(zhì)純化的實(shí)驗(yàn)教
學(xué)軟件用于生化大實(shí)驗(yàn)的教學(xué),簡(jiǎn)稱(chēng)為“干實(shí)驗(yàn)”。
[]Windows界面下計(jì)算機(jī)模擬純化蛋白質(zhì)的實(shí)驗(yàn)軟件:
由于DOS系統(tǒng)下的實(shí)驗(yàn)軟件已使用多年,而且是八十年
代編制的,現(xiàn)已十分落后,分離純化實(shí)驗(yàn)條件的選擇太少,
產(chǎn)率的計(jì)算時(shí)常超過(guò)100%,同一種酶使用不同的分離純化實(shí)
驗(yàn)條件,有時(shí)會(huì)得到相同的結(jié)果,因此由1996年開(kāi)始編制新
的Windows界面下的實(shí)驗(yàn)軟件,軟件名稱(chēng)是“Protein”,該
軟件是用VisualBasic編寫(xiě)的Win3.1/Win95應(yīng)用程序,
界面簡(jiǎn)潔明了,可以用鼠標(biāo)很方便的操作,并有完整的幫助
文件,對(duì)操作方法和使用的各種生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)詳加說(shuō)明,使
用者短時(shí)間即可熟練操作。
“Protein”軟件有36個(gè)任務(wù),即36組待分離純化的蛋
白。任務(wù)要求利用軟件提供的幾種實(shí)驗(yàn)技術(shù),提純每一個(gè)目
的蛋白,最終達(dá)到單向電泳一條帶,雙向電泳一個(gè)點(diǎn),而且
使用的人時(shí)和經(jīng)費(fèi)(根據(jù)提取步驟計(jì)算得到)不得超過(guò)一個(gè)特
定值。在每個(gè)任務(wù)開(kāi)始時(shí),軟件給出目的蛋白的一些性質(zhì),
如熱穩(wěn)定的溫度范圍和pH穩(wěn)定范圍等,利用這些信息,可以
使實(shí)驗(yàn)少走彎路。
“Protein”提供的分離純化方法有七種:①熱變性;②
硫錢(qián)沉淀;③排阻層析(凝膠色譜);④離子交換層析;⑤吸
附層析;⑥聚焦層析;⑦制備電泳。
例如,在使用層析方法時(shí),可在Chromatography菜單下
點(diǎn)選上述四種層析方法,彈出相應(yīng)的參數(shù)對(duì)話框,此時(shí)要求
輸入柱長(zhǎng)、內(nèi)徑、柱填料類(lèi)型、緩沖液組分及pH值和洗脫速
度等。如果采用梯度洗脫,還要求輸入梯度洗脫的初始和終
末濃度及洗脫體積,在輸入?yún)?shù)之后,計(jì)算機(jī)模擬洗脫過(guò)程,
并且畫(huà)出A280洗脫曲線和酶活曲線,此時(shí),可以根據(jù)分離的
情況和酶活的峰位來(lái)收集組份,在收集之前還可以用電泳查
看洗脫曲線上某一部位的分離效果。在確認(rèn)收集之后,
“Protein”軟件記錄該步操作的條件,計(jì)算回收率、純化倍
數(shù)以及消耗的人時(shí)和經(jīng)費(fèi)等。
經(jīng)過(guò)反復(fù)多次的模擬實(shí)驗(yàn),初步純化了目的蛋白,在雙
向電泳圖上能夠確定該蛋白質(zhì)的分子量和等電點(diǎn)之后,還需
要重新對(duì)其各步驟的實(shí)驗(yàn)條件,尤其是離子交換層析、排阻
層析和制備電泳等實(shí)驗(yàn)步驟的實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行修改,以找到適
合該蛋白質(zhì)的最佳分離純化實(shí)驗(yàn)方案和實(shí)驗(yàn)條件。
在“Protein”所提供的各種分離純化方法中,熱變性法
和鹽析法是比較好的粗提方法,在提純的早期使用效果較好。
層析是各種方法中最強(qiáng)有力的方法,制備電泳雖然純化倍數(shù)
高,但是回收率低。在各種層析方法中,又以離子交換層析
最為有效和易于使用,并且耗費(fèi)的人時(shí)和經(jīng)費(fèi)也較少。排層
層析和聚焦層析耗費(fèi)較大,但在某些特定情況下,這兩種方
法是不可替代的。
“Protein”提供了四種電泳方法:即,SDS、PAGE、
等電聚焦電泳和雙向電泳。這些電泳方法不但可以用以檢測(cè)
樣品的純度,而且也給出了樣品的一些信息,如分子量、等
電點(diǎn)等,這些信息對(duì)于后續(xù)提純有重要的參考價(jià)值,等電聚
焦電泳和PAGE還可以用于制備。
“Protein”新軟件的投入使用,使生化大實(shí)驗(yàn)的CAI教
學(xué)水平上了一個(gè)新臺(tái)階,它的優(yōu)點(diǎn)是:在幾小時(shí)內(nèi)可以模擬
完成大量的生化實(shí)驗(yàn)分離純化過(guò)程,既經(jīng)濟(jì),效率又很高,
實(shí)現(xiàn)了學(xué)生們想設(shè)計(jì)生化大實(shí)驗(yàn)的要求,而在實(shí)驗(yàn)室里要想
實(shí)現(xiàn)這一過(guò)程是非常困難的。通過(guò)“干實(shí)驗(yàn)”的教學(xué),對(duì)生
化大實(shí)驗(yàn)中的各種實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行反復(fù)的比較和選用,對(duì)所用
的幾種主要生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)可以加深認(rèn)識(shí)和理解。
本實(shí)驗(yàn)要求完成Windows版實(shí)驗(yàn)軟件中四至五種酶的分
離純化,而且要挑選一種酶做出其鹽析曲線。
實(shí)驗(yàn)報(bào)告要求列表詳細(xì)寫(xiě)出分離純化的實(shí)驗(yàn)步驟、實(shí)驗(yàn)條
件和實(shí)驗(yàn)結(jié)果(包括分子量和等電點(diǎn)),并畫(huà)出洗脫曲線。
第二章核酸的化學(xué)
實(shí)驗(yàn)九真核生物基因組DNA的制備(苯酚法)
【原理】
DNA是儲(chǔ)存遺傳信息的物質(zhì),是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),它與生
命的正?;顒?dòng)如種的遺傳、生長(zhǎng)發(fā)育有密切關(guān)系。其結(jié)構(gòu)與
功能的研究是當(dāng)前分子生物學(xué)研究的主要內(nèi)容之一。
核酸廣泛存在于生物中,DNA含有生物體的全部遺傳信息,
在生物組織中以核蛋白(DNP)形式存在。真核生物中,DNA主
要存在于細(xì)胞核中,核外也有少量,如線粒體DNA,稱(chēng)為核外
基因。DNA的分子長(zhǎng)度一般隨生物由低級(jí)進(jìn)化到高級(jí)而增加。
9
人類(lèi)基因組含2.9X10bpo
無(wú)論是研究核酸的結(jié)構(gòu),還是它的功能,首先需要對(duì)核酸
進(jìn)行分離與提純。分離與提純核酸最基本的要求是保持核酸
的完整性及純度。
要從生物組織中提取DNA,因DNA是以核蛋白(DNP)形式
存在于細(xì)胞核中故首先必須粉碎組織,裂解細(xì)胞膜和核膜,
使DNP釋放出來(lái),再用苯酚提取蛋白。由于細(xì)胞中的核糖核
蛋白(RNP)和DNP往往一起被提取,故DNA沉淀中混有RNA。
需用核糖核酸酶(RNase)處理,去除RNA。并用蛋白酶將遺留
的少量蛋白質(zhì)水解除去,再經(jīng)苯酚處理,乙醇沉淀,最后可
得較為純凈的DNAo它的純度可以從260nm波長(zhǎng)處的光密度和
280nm波長(zhǎng)處的光密度之比值測(cè)知,一般以O(shè)D260nm/0D
280nin能達(dá)到1.8左右為標(biāo)準(zhǔn)。
分離與提純過(guò)程中保持DNA的完整性和純度存在許多困
難,主要原因有:
(D細(xì)胞內(nèi)存在很高的DNA酶活性,在分離與提純過(guò)程中
會(huì)造成核酸的降解。,
(2)DNA分子很大,分離過(guò)程中因化學(xué)因素或物理因素使
DNA降解,如強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、溫度過(guò)高或機(jī)械張力剪切等。DNA
的定量可采用化學(xué)的定磷法、定核酸法。目前多數(shù)實(shí)驗(yàn)室采
用紫外分光光度法測(cè)定核酸含量,以下公式可作為紫外定量
時(shí)參考:雙鏈DNA含量:OD260nmX樣品稀釋倍數(shù)X50ug/
ml=ug/ml樣品。
【器材】
1.塑料離心管:6
2.刻度離心管:1
3.滴管:長(zhǎng):1吸酚:氯仿混合液
中:1吸乙醇
短(鈍口):1吸DNA水溶液
4.細(xì)玻棒:1
5.移液管:1
6.微量取樣器1
7.手套:1副
8.離心機(jī)
9.紫外分光光度計(jì)
10.37℃水浴,50℃水浴
11.組織搗碎器
12.電泳儀及電泳槽
【試劑】
1.裂解緩沖液:
(l)50mmol/1Tris-HClpH7.4(2)20mmol/lEDTA
(3)0.5%SDS(4)100mmol/lNaCl
配法:
lmol/1Tris-HClpH7.450ml
20%SDS25ml
2mol/lNaCl50ml
0.5mol/lEDTA40ml
蒸儲(chǔ)水稀釋至1000ml
其中Tris-HclpH7.4維持PH恒定,防止DNA變性和水
解。EDTA能絡(luò)合二價(jià)金屬離子,當(dāng)Mg+,被絡(luò)合后,細(xì)胞內(nèi)
釋放出來(lái)的DNA酶的作用被抑制,以避免DNA的降解,同時(shí)
金屬離于絡(luò)合后,細(xì)胞膜的穩(wěn)定性下降,有利于膜的裂解;
SDS有使蛋白質(zhì)變性的作用,它能破壞膜蛋白的構(gòu)象,因此使
膜裂解,它又能使核蛋白中的核酸與蛋白質(zhì)解離,并且SDS
也具有抑制DNA酶的作用。
2.苯酚
重蒸苯酚加入抗氧化劑8-羥喳琳Img/mL用lmol/1
PH8.0Tris-HCl洗一次,再用0.lmol/ITris-HClPH8.0
洗二次,苯酚PH在7.6?7.8之間。
3.苯酚:氯仿混和液(1:1)
苯酚加上等體積氯仿并用水飽和,混和液分層,上層為
水相,下層為有機(jī)相且?guī)S色。苯酚和氯仿都是蛋白質(zhì)變性
劑,苯酚使蛋白質(zhì)變性的作用強(qiáng)于氯仿,但氯仿具有較好的
分層作用。
4.無(wú)水乙醇
DNA在PH7.4條件下分于帶負(fù)電,在NaCl存在條件下,
DNA鹽呈電中性,乙醇將DNA分子周?chē)乃謯Z去,DNA失水
形成白色絮狀沉淀。
5.TE緩沖液
50mmol/lTris-HClpH7.0
5mmol/lEDTA
配法:
Imol/1Tris-HClpH7.410ml
0.5mol/lEDTAEDTA
蒸儲(chǔ)水稀釋至1000ml
6.RNaselOmg/ml
配法:
稱(chēng)取RNase溶解在lOmmol/1Tris-HCl(PH7.5)和15mmol
/LTris-HC1(PH7.5)和15mmol/INacl落液中使之濃度為
10mg/mlo100C加溫15分鐘,使夾雜的少許DNase失活,
然后慢慢冷卻,分裝于小管中-20℃保存。
7.蛋白酶K(10mg/ml)-20℃保存。
蛋白酶K優(yōu)點(diǎn):水解能力很強(qiáng),作用廣泛,可與SDS
及EDTA合并使用。
8.20%SDS
9.0.5mol/LEDTA
10.12mol/L高氯酸
【操作】
1.取新鮮鼠肝用冰生理鹽水洗去血水,用濾紙吸干,
-70℃冰箱中保存,用時(shí)取出。
2.1克鼠肝加10ml裂解緩沖液,在組織勻漿器中勻漿約
1分鐘(2次,每次30秒)
3.取塑料離心管1支加入1/3支勻漿液(若勻漿液太稠,
則再加入hnlTE緩沖液),然后再加入等體積苯酚:氯仿混和
液抽提。每次抽提輕緩地來(lái)回?fù)u動(dòng)5分鐘,然后離心10000
轉(zhuǎn)/分鐘X5分鐘,水相吸入另一干凈的離心管中,重復(fù)抽提
二次。
注意:每次水相時(shí)不要將界面上的變性蛋白質(zhì)混入,抽提
r-]
本卷
爻性苑由藤
一貨機(jī)相
臧注■,
?心后的分■
二次后一般有機(jī)相和水相界面上的變性蛋白質(zhì)極少,肉眼基
本看不見(jiàn)。若界面上變性蛋白質(zhì)仍較多,可增加抽提次數(shù)
4.水相加入一刻度離心管中后,加入2.5倍體積的冰
無(wú)水乙醇(可用刻度離心管測(cè)量體積)。加5mol/LNaGI到終
濃度為0.lmol/L,在離心管中輕緩的混勻,此時(shí)可見(jiàn)白色絮
狀沉淀,此即DNA粗制品。
5.用玻棒撈起DNA沉淀,放入小燒杯中,用70%乙醇洗
滌沉淀一次,洗滌時(shí)動(dòng)作要輕,防止DNA被切斷。
6.沉淀取出放入一干凈的塑料離心管中,用ImlTE緩沖
液溶解。
7.在ImlDNA溶液中加入10mg/ml的RNA酶20P1,使
最終濃度達(dá)到200ug/血,37c保溫30分鐘。
8.加入20%SDS25U1,使最終濃度至0.5%加入0.5mol/l
EDTA30ul至20mmol/l;力口10mg/ml蛋白酶K20ul,使最終濃
度為200ug/ml,50E保溫30分鐘。
9.加等體積苯酚:氯仿混合液抽提,重復(fù)一次,去除蛋
白酶K及其它殘留的蛋白質(zhì),至界面無(wú)明顯的變性蛋白質(zhì)為
止。每次抽提輕緩地來(lái)回?fù)u動(dòng)5分鐘,離心10000轉(zhuǎn)/分鐘
X5分鐘。
10.吸取水相,水相吸至一干凈刻度離心管中量出積體,
再加入2.5倍體積的冰無(wú)水乙醇,加5moi/LNaCl至終濃度
為0.lmol/L,混勻后可得較純的DNA沉淀,再用70%乙醇
洗滌沉淀一次。
11.在一干凈的塑料離心管中用0.3—0.5ml緩沖液溶
解沉淀,得到提純的DNA原液。
12.吸取DNA原液lOOuL用TE緩沖液稀釋至3ml(1:30
稀釋),(若DNA原液太濃,取原液50uL太稀則取原液200ul)o
在紫外分光光度計(jì)中測(cè)定0.D260nm及0.D280nm的讀數(shù)。計(jì)
算:0.D260nm/0.D280nm比值,DNA濃度及DNA總量。剩余
原液寫(xiě)上自己的學(xué)號(hào),交給帶教老師保存,留作做PCR實(shí)驗(yàn),
【注意事項(xiàng)】.
1.為盡可能避免DNA大分子的斷裂,在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中必須
(1)勻漿時(shí)應(yīng)保持低溫,勻漿時(shí)間應(yīng)短,勿用玻璃勻漿器。
(2)實(shí)驗(yàn)中使用的吸取DNA水溶液的滴管管口需粗而短,
并燒成鈍口。
(3)酚抽提時(shí)勿劇烈振搖。
2.保持DNA活性,避免酸、堿或其它變性因素使DNA變
性。,
3.苯酚是一種強(qiáng)列的蛋白質(zhì)變性劑。實(shí)驗(yàn)時(shí),應(yīng)戴手套
操作,避免碰到皮膚,以免灼傷。苯酚蒸汽毒性較大,實(shí)驗(yàn)
中應(yīng)注意將盛酚的試劑瓶蓋好。
4.離心時(shí)要注意管于間的重量平衡。管于要對(duì)稱(chēng)放置,
當(dāng)離心達(dá)到所需速度后再開(kāi)始計(jì)時(shí)。
【思考題】
1.如樣晶中有蛋白質(zhì)存在,其紫外分析結(jié)果有何表現(xiàn)?
如何進(jìn)一步純化?
2.DNA的定量可采用那些方法?目前常用的是哪種?如何
測(cè)定DNA的含量?
3.從生物細(xì)胞中提取DNA的主要注意點(diǎn)是什么?應(yīng)如何
控制?
4.能引起DNA變性的因素有哪些?DNA降解和DNA變性有
何區(qū)別?如何鑒別?
實(shí)驗(yàn)十DNA與RNA含量測(cè)定
【基本原理】
核酸分子中含有堿基使核酸在260nm下有最大吸收。紫外
吸收是噂吟環(huán)和喀咤環(huán)的共飄雙鍵系統(tǒng)所具有的性質(zhì),含有
口票吟和喀咤的物質(zhì),不論是核昔、核昔酸或核酸都有吸收紫
外光的特性。
蛋白質(zhì)由于含芳香族氨基酸,因此也能吸收紫外光,通常
蛋白質(zhì)在280nm波長(zhǎng)有特異吸收。因此核酸在A海及A260>A%。
測(cè)定的比值(A260/A28。)可以反映樣品中核酸的含量及純度。
RNA在A26o/A28o的比值在2.0以上;DNA在A260/A280的比值為1.8
左右。當(dāng)樣品中蛋白質(zhì)含量較高時(shí)比值即下降。
DNA濃度計(jì)算公式:
小濃度(〃g/")=皿亞皿鯉
根據(jù)濃度計(jì)算DNA總量:
DNA總量(ug)=DNA濃度(ug/111)義體積(口1)
【器材】
紫外分光光度計(jì)、紫外燈或凝膠成像儀
【試劑】
1.雙蒸水
2.DNA樣品或RNA樣品
【操作步驟】
1.將樣品加適量水
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