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文檔簡介

一、引言自1873年推導(dǎo)出衍射極限以來,光學(xué)顯微鏡的分辨率在接下來的一個多世紀(jì)中未能取得根本性突破。然而,對于高分辨率的追求從來就沒有停止。最終,經(jīng)過不懈努力,科學(xué)家在20世紀(jì)90年代取得突破。由于衍射極限的存在,可見光波段范圍內(nèi)的顯微鏡分辨率一直被限制在250nm以內(nèi)。超分辨顯微術(shù)的出現(xiàn)使得人類終于打破這一桎梏。得益于過去20年超分辨顯微術(shù)的進(jìn)步,現(xiàn)階段已經(jīng)可以實現(xiàn)在xy平面和沿z軸將分辨率分別提升6~10倍。需要強調(diào)的是,超分辨顯微術(shù)并非特指某項技術(shù),而是若干種不同技術(shù)方案的總稱。但是,無論具體實現(xiàn)方式如何,這些技術(shù)在本質(zhì)上是相通的:各種技術(shù)都由光強調(diào)制,并且非線性地開關(guān)熒光染料分子以實現(xiàn)對熒光輻射的操控,繼而在時間上依次記錄整個觀察區(qū)域內(nèi)的細(xì)節(jié)。正是由于這些技術(shù)能夠提供突破衍射極限的分辨率,才使首次使用光學(xué)顯微鏡進(jìn)行許多生命科學(xué)研究成為可能。

由于大部分生物結(jié)構(gòu)都具備三維空間分布,因此,將超分辨率成像擴展至三維水平,可以清晰地顯示這些生物體結(jié)構(gòu)或記錄分子運動。將原有的二維超分辨顯微成像擴展至三維水平有多種技術(shù)實現(xiàn)路徑。對于單分子定位顯微術(shù)(SMLM),如光激活定位顯微術(shù)(PALM)、隨機光學(xué)重構(gòu)顯微術(shù)、熒光激活定位顯微術(shù)(fPALM)而言,可以采用雙焦面成像或者點擴散函數(shù)(PSF)操控的方法;對于以受激發(fā)射損耗顯微術(shù)(STED)、可逆飽和光學(xué)熒光躍遷顯微術(shù)為代表的目標(biāo)開關(guān)超分辨顯微術(shù)而言,最常用的策略則是同時使用兩個相位板,通過非相干疊加的方式來創(chuàng)造一個三維中空的STED/RESOLFT聚焦光斑。

通過以上兩種技術(shù)路徑都可以在理論上獲得無限小的分辨率。然而,在這些不受衍射極限限制的技術(shù)中,光的衍射現(xiàn)象實質(zhì)上仍然發(fā)揮作用。然而,無論使用哪種技術(shù),最終能達(dá)的分辨率仍然取決于顯微鏡聚焦光斑的銳利程度。這一事實導(dǎo)致的后果便是:相對而言,軸向分辨率的提高比橫向(焦平面內(nèi))分辨率的提高更加困難。因此,即使通過超分辨顯微術(shù)可以將橫向分辨率提升到20~40nm,但是同一架構(gòu)下達(dá)到的軸向分辨率仍然比橫向分辨率低(后者約是前者的2.5倍)。

相對而言,各向同性的三維分辨率受到更多青睞;因為各向同性的三維分辨率能夠提供更加自然的視野,并且基于這樣的圖像進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,得到的結(jié)果也更加精確。然而,由于使用單個透鏡只能覆蓋半個球面波波前,除非刻意犧牲橫向分辨率,否則要做到三維各向同性是非常困難的。另外,如果存在一個光學(xué)系統(tǒng),能夠收集焦面之后的另外半個球面波波前,由于對稱性的恢復(fù),系統(tǒng)PSF的形狀就可以(基本上)保持為一個球形?;谏鲜鏊枷耄?0世紀(jì)90年代早期,Hell等發(fā)明了基于兩個對置物鏡的4Pi顯微鏡。在實際應(yīng)用中,一個物鏡大約只可以覆蓋65°的半孔徑角,使用兩個物鏡則可以幾乎完整覆蓋整個4π的立體角(實際應(yīng)該為2.5π~3π)。如圖1所示,在4Pi顯微術(shù)中,逆向傳播的兩束相干照明光分別經(jīng)過兩個對置物鏡在共焦面上聚焦,并產(chǎn)生疊加干涉條紋的PSF。這種實現(xiàn)方式被稱為A型4Pi架構(gòu)。另一種實現(xiàn)方式,即B型4Pi架構(gòu),則通過對置物鏡反向收集熒光信號并讓它們在探測器上發(fā)生干涉。由于引入了共焦面附近的干涉,上述兩種方式都可以在軸向上顯著壓縮PSF的尺寸——這也是構(gòu)成掃描型4Pi顯微鏡的基礎(chǔ)。如果只保證激發(fā)光(A型4Pi架構(gòu))或熒光(B型4Pi架構(gòu))相干,則可以將軸向分辨率提高3~4倍。如果同時使激發(fā)光和熒光相干(C型4Pi架構(gòu)),則可以將軸向分辨率提高約7倍。除此之外,由于4Pi架構(gòu)可以從兩個方向收集熒光,可收集的熒光光子數(shù)可翻倍,最終可以提高圖像的信噪比(SNR)。與之類似,非相干干涉照明圖像干涉顯微術(shù)可以被理解為是4Pi顯微術(shù)基于相機的寬視場版本:包含兩個對置物鏡,在焦面附近采用駐波干涉作為照明,并以相干的方式收集熒光信號。因此,它的分辨率也與4Pi顯微鏡類似。

圖1.4Pi顯微鏡的簡化架構(gòu)與原理示意圖。(a)簡化架構(gòu)示意圖。(b)在軸向平面(xz平面)內(nèi)的4Pi顯微鏡PSF。上下兩個物鏡的PSF相干疊加壓縮了整個PSF的軸向尺寸。(c)不同4Pi架構(gòu)的有效PSF。從左至右:A型架構(gòu),激發(fā)光相干;B型架構(gòu),發(fā)射光(熒光)相干;C型架構(gòu),兩者同時相干。APD:雪崩光電二極管;BS:50/50分光鏡;DM:二向色鏡;L:透鏡;M:反射鏡;SM:掃描鏡。

4Pi顯微術(shù)與超分辨顯微術(shù)的結(jié)合可以進(jìn)一步提高系統(tǒng)的三維分辨率,特別是軸向分辨率。與單物鏡版本的超分辨顯微術(shù)類似,4Pi超分辨顯微術(shù)也可以分為目標(biāo)開關(guān)型(isoSTED、4Pi-RESOLFT)和隨機開關(guān)型(iPALM、4Pi-SMS、4Pi-SMLM)兩類,如圖2(a)所示。在目標(biāo)開關(guān)型4Pi超分辨顯微術(shù)中,分別來自對置物鏡逆向傳播的兩個波前發(fā)生干涉相消,使得STED/RESOLFT聚焦光斑的中央光強極小值區(qū)域在軸向得到顯著壓縮[圖2(b)]。因此,熒光信號的發(fā)射被限制在焦點附近非常小的區(qū)域內(nèi)。而4Pi-RESOLFT和isoSTED技術(shù)的主要區(qū)別在于前者主要使用具有可逆開關(guān)效應(yīng)的熒光蛋白(RSFP)來提供超分辨顯微術(shù)所需要的亮態(tài)和暗態(tài)。對于隨機開關(guān)型的4Pi超分辨顯微術(shù),軸向分辨率的提高則主要利用算法提取隱藏在干涉條紋中的軸向(z方向)位置信息[圖2(b)]。為了求解位置信息,對于不同的設(shè)計可以同時記錄三幅(iPALM)或四幅(4Pi-SMS、4Pi-SMLM)干涉相位圖。

圖2.4Pi超分辨顯微術(shù)的簡化架構(gòu)和原理示意圖。(a)isoSTED/4Pi-RESOLFT(左)與4Pi-SMLM(右)顯微鏡的簡化架構(gòu)示意圖。兩種架構(gòu)在成像時都將樣品放置在物鏡共焦面上。圍繞光路的小圖標(biāo)顯示出在光路不同位置(由帶圈I?XI號標(biāo)出)光的偏振態(tài)。特別地,在位置VII、VIII和XI處,同一幅圖中的虛線箭頭相對于實線箭頭有π/2的相位延遲,該延遲是由系統(tǒng)中的石英楔造成的。左圖:在isoSTED/4Pi-RESOLFT顯微鏡中,兩束STED光,即STEDxy(橫向)和STEDz(軸向)互不相干并保持垂直的偏振態(tài)。兩束光通過一個偏振分光棱鏡(PBS)合束后,再經(jīng)過一組掃描鏡進(jìn)入4Pi干涉腔。合束后的光經(jīng)第二個PBS分束后,在物鏡的共焦點位置分別生成STEDxy(橫向)和STEDz(軸向)損耗光聚焦光斑[如圖(b)從左起第一和第二列所示]。兩個光斑的中央光強極小值(即焦點)位置互相重合,并通過受激發(fā)射對熒光發(fā)射現(xiàn)象產(chǎn)生各向同性的損耗作用[如圖(b)從左起第三列所示]。這種作用是通過迫使被STED光照射的熒光分子持續(xù)性地處于暗態(tài)的方式發(fā)揮效用的。同時,焦點附近的熒光信號被兩個物鏡反向收集。收集到的熒光光子在一片二向色鏡上發(fā)生反射,并最終進(jìn)入探測器。右圖:在4Pi-SMLM顯微鏡中,熒光光束被一組分束器反復(fù)分束和合束,以形成一系列具有不同干涉相位的光波波前。這些光波波前的相互干涉圖樣最終被位于干涉腔之后的相機同時接收。雖然在不同的設(shè)計中,具體的光路和探測器的數(shù)量不同,但所使用的單分子定位原理都是相通的,即經(jīng)過干涉條紋調(diào)制后的PSF相比原有的PSF含有更多的高頻信息,因此利用4Pi-PSF進(jìn)行定位計算,所得到的結(jié)果可以更加精確。(b)4Pi超分辨顯微鏡中的PSF軸向平面(xz平面)強度剖視圖。從左至右:isoSTED/4Pi-RESOLFT顯微鏡中的STEDxy、STEDz、合并后的STED(紅色),以及有效PSF(綠色);4Pi-SMLM顯微鏡中相對相位差?

=0、90°、270°、180°時的熒光干涉PSF。為了更準(zhǔn)確地描述isoSTED/4Pi-RESOLFT顯微鏡及4Pi-SMLM顯微鏡的各種PSF,在相應(yīng)圖片的右上角給出了在探測器(APD或相機)上測得的橫向平面(焦平面,即xy平面)內(nèi)的熒光強度分布。GW:玻璃窗口;HWP:半波片;Q:石英楔;VP:0~2π渦旋相位板;s/p:

s偏振光/p偏振光。

下面將詳細(xì)討論4Pi超分辨顯微術(shù)的兩種架構(gòu)和它們的具體應(yīng)用。需要強調(diào)的是,圖像干涉非相干結(jié)構(gòu)光照明干涉顯微術(shù)(imageinterferenceandincoherent-illumination-interferencestructuredilluminationmicroscopy,I5S)并不在本文的討論范疇。與I5M相比,I5S顯微術(shù)在橫向上利用結(jié)構(gòu)光照明,實現(xiàn)了對有效PSF的三維壓縮。但是,從原理上講,I5S顯微術(shù)并不依賴任何熒光的開關(guān)效應(yīng),即該技術(shù)既不需要目標(biāo)開關(guān)也不需要隨機開關(guān)。這使得I5S幾乎可與任何熒光分子兼容,因此在具體應(yīng)用上會擁有相當(dāng)?shù)膬?yōu)勢。然而,也正因為如此,在理論上,I5S相對于寬視場顯微術(shù)也僅能將分辨率提高兩倍。為了進(jìn)一步提高分辨率,則需要在顯微鏡中引入諸如熒光飽和的各種熒光非線性效應(yīng)。但是遺憾的是,基于熒光飽和的I5S(或稱為“I5SS”)至今仍未實現(xiàn)。

二、基于目標(biāo)開關(guān)的4Pi超分辨顯微術(shù)

STED超分辨顯微術(shù)是基于1994年提出的理論模型發(fā)展起來的。該技術(shù)首先于1999年被實現(xiàn)并被用于材料學(xué)研究,并隨即在2000年實現(xiàn)了在生命科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。自此,STED徹底改變了熒光成像的范式。STED是首個被實現(xiàn)的基于目標(biāo)開關(guān)原理的超分辨顯微術(shù)。其基本工作原理是:在某一確定位置,通過熒光發(fā)射損耗效應(yīng)將熒光發(fā)射限制在其周圍一個亞衍射極限的區(qū)域內(nèi)。當(dāng)工作時,一個光強最強點位于中心的激發(fā)光斑和一個環(huán)形的STED光斑相互嵌套并掃描樣品上的整個成像區(qū)域,在此期間,通過一個與焦點共軛的點探測器順次讀取信號并生成最終的圖像。為了提高STED顯微術(shù)的分辨率,STED光斑中心點之外的熒光發(fā)射都必須得到有效損耗。因此,一個高質(zhì)量、中央光強為零的環(huán)形光斑對于提升STED顯微鏡的表現(xiàn)顯得尤為重要。

過去15年的技術(shù)進(jìn)步已經(jīng)使STED顯微術(shù)邁進(jìn)了三維成像的新紀(jì)元。在眾多具體的實現(xiàn)方法中,基于兩個對置物鏡的4Pi架構(gòu),由于可以在軸向生成非常銳利的STED聚焦暗斑而尤為引人注目。雖然其分辨率優(yōu)勢沒有得到充分的發(fā)揮,但是早期的所謂STED-4Pi顯微術(shù)已經(jīng)能夠在焦平面附近提供約33nm的軸向分辨率。而作為其改良版本的isoSTED顯微術(shù)則已能提供各向同性的三維高分辨率圖像[圖2(a)]。為了實現(xiàn)各向同性的三維熒光壓縮,isoSTED顯微術(shù)同時使用了兩個光強零點重合的STED聚焦光斑:其中一個用于橫向(STEDxy)壓縮,而另一個則用于軸向(STEDz)壓縮,如圖2(b)所示。通過對兩個聚焦光斑的光強分配進(jìn)行調(diào)節(jié),可以實現(xiàn)PSF大?。捶直媛剩┑木?xì)操控。其中,為了生成STEDz聚焦光斑,需要將分別來自于兩個對置物鏡、相向傳播的光波波前在焦平面上完美重合并形成干涉相消。由于單物鏡PSF中的光強和相位對于焦平面高度對稱,干涉相消除了在焦面中央產(chǎn)生一個光強零點外,在焦面上下都會產(chǎn)生一系列周期性分布的光強零點。這些次級光強零點會與激發(fā)光和探測光(熒光)PSF相重合。由于在這些次級光強零點附近,STED光沒有熒光發(fā)射損耗能力,進(jìn)而造成熒光信號泄漏,最終產(chǎn)生了有效PSF中的旁瓣,并造成使圖像質(zhì)量明顯惡化的軸向“鬼影”(ghostimages)現(xiàn)象。更為嚴(yán)重的是,當(dāng)使用這樣的有效PSF掃描整個樣品時,由于上下光路光程差的存在,PSF中的光強極大值點會在PSF的包絡(luò)下產(chǎn)生軸向飄移。因此,任何試圖使用一成不變的PSF進(jìn)行反卷積運算以消除旁瓣的努力都是徒勞的。理論上,基于可變PSF的反卷積運算可能會減輕“鬼影”現(xiàn)象,但是該方法僅適用于可以精確估計PSF并且圖像信噪比很高的場合(這在現(xiàn)實中都很難做到)。為了消除有效PSF中旁瓣的影響,一種有效的策略是加入離焦量,使兩個物鏡的聚焦光斑產(chǎn)生反向偏移,從而破壞STEDz聚焦光斑中的對稱性。這個策略可以通過使用相位板添加附加相位的方法實現(xiàn)。雖然類似的效果也可以通過直接調(diào)節(jié)兩個對置物鏡間的距離,從而破壞二者的共焦性的方式實現(xiàn),但是使用相位板不會造成熒光信號和橫向分辨率的損失。因而相比較而言,使用相位板的策略更加有優(yōu)勢。與STEDz聚焦光斑類似,STEDxy聚焦光斑也是通過分別來自于兩個對置物鏡、相向傳播的光波前干涉實現(xiàn)的,但需要利用干涉相加而非相消。值得注意的是,雖然與單物鏡系統(tǒng)相比,isoSTED顯微鏡中的STED聚焦光斑光強分布和所使用的總功率都比較接近,但是由于干涉的作用,其峰值光強是使用單物鏡STED顯微鏡的兩倍?;诟倪M(jìn)版的Abbe公式可知:在這種情況下分辨率大約可以提高倍。

與一般的共聚焦顯微鏡相比,isoSTED顯微鏡的熒光光斑大小大概只有前者的1/1500,意味著isoSTED顯微鏡的三維分辨率可以達(dá)到20~50nm。不斷增強的成像能力使得isoSTED顯微鏡成為專門針對透明樣品進(jìn)行納米級三維成像的強大平臺。迄今為止,isoSTED顯微術(shù)已在多個領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。在其發(fā)明后不久,一臺isoSTED顯微鏡就被用于材料科學(xué)領(lǐng)域?qū)ξ⒔Y(jié)構(gòu)的自組裝效應(yīng)進(jìn)行研究。這些結(jié)構(gòu)由嵌段共聚物系統(tǒng)[苯乙烯-嵌段-2-乙烯基吡啶,圖3(a)]形成,其中的乙烯基吡啶被Atto647N特異性標(biāo)記,以提供熒光對比度。當(dāng)共聚焦顯微鏡無法完全分辨時[圖3(b)],相關(guān)細(xì)節(jié)在isoSTED顯微鏡下得到完美呈現(xiàn)[圖3(c)]。特別是,除了表面信息外,isoSTED顯微鏡還提供了一種非侵入式的成像手段,用于展現(xiàn)樣品的內(nèi)部的三維形貌,而這種成像能力是之前電子顯微鏡所無法提供的。

圖3.isoSTED顯微鏡在材料科學(xué)中的應(yīng)用。(a)透射電鏡(TEM)下所展現(xiàn)的溶劑退火薄膜的層狀結(jié)構(gòu)。(b)相同樣品在共聚焦顯微鏡下的成像結(jié)果,未顯示任何細(xì)節(jié)。(c)在isoSTED顯微鏡下層狀結(jié)構(gòu)得到清晰展現(xiàn)。圖中標(biāo)尺:500nm。經(jīng)AmericanChemicalSociety許可,轉(zhuǎn)載自參考文獻(xiàn),?2009。

除了在材料科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用外,isoSTED顯微術(shù)的重要性在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域也得到體現(xiàn)。線粒體是一種在能量產(chǎn)生過程中起重要作用的細(xì)胞器,是isoSTED顯微鏡的第一個成像目標(biāo)。正如20世紀(jì)50年代電子顯微鏡(EM)所顯示的那樣[圖4(a)],在isoSTED顯微鏡下,線粒體也顯示由兩種不同的膜包圍,且其直徑為200~400nm。isoSTED顯微術(shù)的發(fā)展使科學(xué)家能夠分析納米級生物結(jié)構(gòu)。通過對整個線粒體中直徑約35nm的PSF掃描成像,isoSTED顯微鏡成功繪制出F1F0-三磷酸腺苷合酶(ATPase)[圖4(b)]和線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶20(TOMM20)[圖4(c)]的分布。在另一個應(yīng)用中,科學(xué)家專注于突觸小泡,突觸小泡是神經(jīng)元細(xì)胞中一種平均直徑為39.5nm的低電子密度泡狀結(jié)構(gòu)。這些突觸小泡位于神經(jīng)元突觸前末端,用于儲存神經(jīng)遞質(zhì),對于在神經(jīng)元之間傳播神經(jīng)沖動至關(guān)重要。受益于isoSTED顯微鏡的能力,科學(xué)家還成功對海馬體周圍活動區(qū)表面池的空間分布進(jìn)行成像。

圖4.isoSTED顯微鏡在細(xì)胞生物學(xué)中的應(yīng)用。(a)線粒體的直徑示意圖。野生型PtK2細(xì)胞中的F1F0-ATPase(b)和TOMM20(c)在isoSTED顯微鏡下的成像結(jié)果。本圖經(jīng)ACS許可,轉(zhuǎn)載自參考文獻(xiàn),?2009。

盡管isoSTED顯微術(shù)的軸向切片成像能力遠(yuǎn)強于常規(guī)STED顯微術(shù),但對于活體生物學(xué)應(yīng)用來說,其所需要的激光衰減功率仍然過高。為了實現(xiàn)活體樣本成像,科學(xué)家進(jìn)一步發(fā)明了4Pi-RESOLFT顯微術(shù)。作為isoSTED顯微術(shù)的衍生技術(shù),4Pi-RESOLFT顯微術(shù)與原版的最大不同在于,使用可開關(guān)熒光蛋白(RSFP)取代STED顯微術(shù)中常用的熒光染料對樣品進(jìn)行標(biāo)記。這種改進(jìn)使得RESOLFT顯微術(shù)尤其適用于活體細(xì)胞成像,原因是RESOLFT顯微鏡需要的激光衰減功率通常要比常規(guī)STED顯微術(shù)低兩個數(shù)量級,進(jìn)而實現(xiàn)對可開關(guān)熒光蛋白的操控。

三、基于隨機開關(guān)的4Pi超分辨顯微術(shù)

SMLM的光學(xué)分辨率已經(jīng)達(dá)到幾個納米,因此能夠?qū){米生物結(jié)構(gòu)進(jìn)行光學(xué)分析。SMLM利用寬視場激發(fā)和探測來隨機激發(fā)和精確定位單個分子,從而實現(xiàn)超分辨能力。由于SMLM易于在傳統(tǒng)的寬視場顯微鏡中實現(xiàn),因此這種方法目前被廣泛使用。通常通過評估PSF的橫向信息和形狀來實現(xiàn)3D-SMLM?;蛘?,亦可以通過同時對多個焦平面成像來獲得單分子的軸向位置。取決于探測的不同光子,這種技術(shù)可以實現(xiàn)20~30nm的橫向分辨率,而獲得的軸向分辨率相對來說略低。

與傳統(tǒng)的單物鏡3D-SMLM系統(tǒng)相比,4Pi-SMLM通過利用由兩個對置物鏡所檢測的熒光信號的干涉來顯著提高軸向分辨率。兩個對置物鏡通過收集幾乎完整的球面波波前,使孔徑角增加并使探測到的光子數(shù)量加倍。此外,當(dāng)兩個軸向成像光路的光程長度在相干長度內(nèi)時,重疊兩個探測光路會導(dǎo)致單個光子的自干涉。隨后同時記錄單個分子的三個或四個不同干涉相位圖。由于干涉相位對熒光團的軸向位置高度敏感,利用4Pi-SMLM得到的軸向分辨率比使用單物鏡系統(tǒng)獲得的軸向分辨率高6~10倍,在某些情況下甚至超過了橫向分辨率。

單物鏡納米顯微鏡的軸向分辨率可達(dá)約60nm,但需要使用明亮的合成熒光染料。使用較暗的熒光蛋白(FP)獲得的表現(xiàn)通常較差。相比之下,理論上4Pi-SMLM通過在每個物鏡中收集單個熒光團的250個光子便可實現(xiàn)亞10nm的三維分辨率。因此,4Pi-SMLM適用于成像被更暗的光活化熒光蛋白(PA-FP)標(biāo)記的生物樣品。特別是在活體細(xì)胞成像中,內(nèi)源性表達(dá)的PA-FP相對于合成熒光染料有幾個關(guān)鍵優(yōu)勢:它們可以被更溫和地固定,并且細(xì)胞可以被重新置于生理性培養(yǎng)基中。與合成熒光染料相比,熒光蛋白不需要除氧成像緩沖液和可能引起干擾的清潔試劑或處理來控制單分子的光物理特性。

即使使用熒光信號更暗淡的PA-FP,4Pi-SMLM的三維分辨率仍可以達(dá)到小于20nm,從而使生物學(xué)家能夠在三維空間更清晰地觀察生物樣品的細(xì)節(jié)信息。細(xì)胞外基質(zhì)和肌動蛋白細(xì)胞骨架的細(xì)胞黏著斑(FA)的連接在形態(tài)建成、免疫和傷口愈合中至關(guān)重要。在細(xì)胞邊緣突出期間,F(xiàn)A形成小于250nm的簇狀整聯(lián)蛋白、FA激酶和樁蛋白。FA的多層蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)對于理解其功能至關(guān)重要。對于FA中不同蛋白質(zhì)復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)成像,最理想的方法是,將4Pi-SMLM與用PA-FP標(biāo)記的FA結(jié)合。利用4Pi-SMLM的三維各向同性的納米級分辨率能力,Kanchanawong等發(fā)現(xiàn)在不同大小和形狀的FA中,每個FA成分的軸向分布高度一致,表明蛋白質(zhì)在FA中的位置可調(diào)節(jié)其活性和功能。Case等則使用類似的策略調(diào)節(jié)黏著斑蛋白的激活和功能。

此外,對于許多不同生物系統(tǒng),特別是那些需要超高分辨率的生物系統(tǒng),4Pi-SMLM還提供了深刻的定量生物學(xué)闡釋。轉(zhuǎn)運所需的內(nèi)體分選復(fù)合物(ESCRT)的納米級結(jié)構(gòu)[被人類免疫缺陷病毒(HIV)劫持]已經(jīng)在病毒出芽點被4Pi-SMLM解析。ESCRT亞單位的空間結(jié)構(gòu)表明,HIV釋放的驅(qū)動力可能來源于病毒芽內(nèi)部ESCRT亞單位的初始支架。兩個離散的桶狀結(jié)構(gòu)(每個桶狀結(jié)構(gòu)由幾十個單獨的Nup188簇組成)也被4Pi-SMLM在細(xì)胞纖毛基底位置成功解析。這種結(jié)構(gòu)特征證明了Nup199將中心粒包裹在桶狀結(jié)構(gòu)中的假說。此外,三維的4Pi-SMLM圖像被用于量化分泌機制中蛋白質(zhì)的數(shù)量。Zhang等展示了分泌系統(tǒng)中PrgH蛋白在細(xì)菌細(xì)胞膜附近形成的各種大小的三維分子簇(圖5)。最近,4Pi-SMLM也已被成功用于解析異質(zhì)納米級交聯(lián)的三維組織,為微凝膠形成動力學(xué)提供了深刻的見解。

圖5.使用4Pi-SMLM對不同生物樣品進(jìn)行超高分辨率三維成像。(a)由細(xì)菌細(xì)胞膜附近的分泌系統(tǒng)蛋白PrgH形成的分子簇的三維成像。(b)來自58個細(xì)菌細(xì)胞的PrgH簇的累積4Pi-SMLM圖像。本圖經(jīng)NationalAcademyofScience許可,轉(zhuǎn)載自參考文獻(xiàn),?2017。

除了在生物學(xué)和材料科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用,4Pi-SMLM在其他領(lǐng)域也得到不斷發(fā)展,目前也具備越來越高的成像能力。當(dāng)4Pi-SMLM概念被首次實現(xiàn)時,成像深度被限制在一個干涉周期內(nèi)(發(fā)射波長的一半,約250nm)。這是因為干涉光強是周期性的,屬于相鄰干涉條紋的光強峰值無法被區(qū)分。兩種方法可以解決上述問題:第一種方法是在4Pi-PSF中引入像散。因此,PSF的整體形狀可以用于展開不同周期中的干涉相位,從而將成像深度擴展到與基于散光的3D-SMLM方法所能提供的同樣深度(約1μm)。第二種方法基于發(fā)射的波前是球形的而非平面的概念,利用第零中心矩和第三中心矩的光強振蕩不同的特點,精確地定位不同周期中的z位置。最近,自適應(yīng)光學(xué)已經(jīng)被引入4Pi-SMLM,從而實現(xiàn)了全細(xì)胞成像(圖6)。此外,多色成像也被引入4Pi-SMLM。第一次雙色4Pi-SMLM成像的實現(xiàn)是通過發(fā)射光中的s偏振光與p偏振光的比率來判定熒光團顏色。最近,利用由激發(fā)二向色鏡反射的回收熒光實現(xiàn)了三色4Pi-SMLM成像。另一個令人興奮的進(jìn)展是4Pi-SMLM和電子顯微鏡的關(guān)聯(lián)成像。4Pi-SMLM的高分辨率和高分子特異性與電子顯微鏡結(jié)合大大縮小了熒光顯微鏡和電子顯微鏡之間的分辨率差距,實現(xiàn)了熒光信號與電子顯微鏡圖像更好的重疊。圖6.小鼠精母細(xì)胞聯(lián)會復(fù)合體的4Pi-SMLM成像。(a)利用21個光學(xué)切片重建的全細(xì)胞的整體圖像。精母細(xì)胞內(nèi)部頂部(b)和底部(c)位置的4Pi-SMLM圖像。(d)(a)圖中的x—z視圖。本圖經(jīng)Elsevier許可,轉(zhuǎn)載自參考文獻(xiàn),?2016。

用于單物鏡3D-SMLM的理論極限精度已經(jīng)可以通過基于熒光球的實驗PSF模型和極大似然估計來實現(xiàn),然而傳統(tǒng)的基于相對光強的4Pi-SMLM的數(shù)據(jù)分析方法并不能達(dá)到理論分辨率極限。這是因為基于相對光強的方法并沒有利用條紋狀干涉4Pi-PSF中的高頻信息來提升分辨率。三次樣條插值的相位恢復(fù)的4Pi-PSF模型的開發(fā),使得4Pi-SMLM可以達(dá)到理論分辨率極限。然而,由于4Pi-PSF本質(zhì)上是四維的(x、y、z和相位),簡單的多通道三維PSF模型不適合用于描述4Pi-PSF。Li等最近提出的4Pi-PSF模型將4Pi-PSF的三維位置和相位項進(jìn)行解耦。他們不直接使用四維4Pi-PSF模型,而是通過三個三維矩陣和一個簡單的相位項的結(jié)合來完整描述四維4Pi-PSF,使得四維4Pi-PSF的實驗校準(zhǔn)在實踐中易于實現(xiàn),從而發(fā)揮4Pi-SMLM的全部潛力。

四、討論與展望利用熒光的特異性標(biāo)記能力,光學(xué)超分辨顯微術(shù)已被證明是一種用于在亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中探尋分子細(xì)節(jié)的有效方法。相關(guān)技術(shù)仍然在不斷發(fā)展,以期提供多色、三維、活體細(xì)胞成像的納米級顯微成像能力。針對本文之前的討論,圖7給出了4Pi顯微術(shù)的技術(shù)演進(jìn)路線。現(xiàn)階段,大多數(shù)超分辨顯微術(shù)已有能力提供50~100nm的空間分辨率。然而,如果空間分辨率能夠在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步提升一個數(shù)量級,那么生物學(xué)家就有望能直接觀察大型分子復(fù)合體內(nèi)的單個分子基團的三維圖像。如果這一夢想得以實現(xiàn),生物學(xué)家就可以對細(xì)胞內(nèi)的分子機制進(jìn)行原位成像,觀察其結(jié)構(gòu)和分子組成。這種能力對于許多的生物學(xué)研究至關(guān)重要,例如,在這樣的分辨率下可以對DNA構(gòu)象進(jìn)行三維觀察,以理解染色體DNA的包裝和基因調(diào)控。在現(xiàn)階段,為了具備這種能力,理論上可以通過在隨機開關(guān)納米顯微鏡中,將單個熒光發(fā)射器的光子數(shù)量增加兩階,或在靶向開關(guān)超分辨顯微鏡中將STED激光衰減功率提升兩個數(shù)量級。然而,如此高劑量地增加光子數(shù)或激光強度,通常不利于實際的生物實驗。相比之下,如果基于雙物鏡4Pi而非單物鏡架構(gòu),相同超分辨顯微術(shù)在軸向的分辨率幾乎可以提高3~10倍。在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步將分辨率提高一個數(shù)量級,而且不需要滿足熒光標(biāo)記的嚴(yán)格特性或苛刻的成像條件。

圖7.4Pi顯微術(shù)技術(shù)發(fā)展路線圖。

除了4Pi超分辨顯微術(shù)外,其他技術(shù)也可能將軸向分辨率提高到亞50nm的水平。例如,用于納米形貌的點累積成像(PAINT)技術(shù)及進(jìn)一步發(fā)展的DNA-PAINT技術(shù)便是其中之一。該技術(shù)在樣品制備過程中用熒光配體的隨機結(jié)合代替了永久結(jié)合的熒光團的隨機光活化。另一種通過樣品制備提升分辨率的方法是樣品膨脹顯微術(shù)(ExM)。通過使用可鼓脹的聚合物網(wǎng)絡(luò)放大樣品,ExM允許研究人員識別其中的微小結(jié)構(gòu)。除此之外,在儀器學(xué)發(fā)展方面,最小化熒光光子通量顯微術(shù)(MINFLUX)是迄今最先進(jìn)的用于精確定位熒光分子的方法。一般SMLM通過算法定位一幅圖像中稀疏分布的熒光光斑的質(zhì)心或最強點位置來實現(xiàn)單分子功能,而MINFLUX則通過激發(fā)光斑中央的暗斑來進(jìn)行定位的。除此之外,人工智能技術(shù)的發(fā)展也為將衍射受限的輸入圖像轉(zhuǎn)變?yōu)槌直鎴D像提供了另一種途徑,或者顯著降低了利用超分辨顯微術(shù)進(jìn)行活體細(xì)胞成像時的照明光劑量。

到目前為止,這些新興技術(shù)的使用效果僅在單物鏡架構(gòu)的顯微鏡中得到了驗證。值得注意的是,并不存在上述技術(shù)無法與4Pi架構(gòu)兼容的障礙。如果類似的結(jié)合一旦成功,人們一樣可以期待它們能夠提供更高的三維分辨率或更好的信噪比之類的技術(shù)優(yōu)勢,就跟目前在isoSTED和4Pi-SMLM顯微術(shù)中已經(jīng)實現(xiàn)的一樣。然而,主要挑戰(zhàn)來自于系統(tǒng)復(fù)雜性的增加:4Pi架構(gòu)除了需要針對這些新興概念進(jìn)行專門的額外系統(tǒng)優(yōu)化外,還需要對大量并行參數(shù)進(jìn)行細(xì)致的調(diào)整。如果處理不當(dāng),此

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